FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4953, 1149 aa
1>>>pF1KB4953 1149 - 1149 aa - 1149 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2260+/-0.00151; mu= 16.6323+/- 0.090
mean_var=68.8730+/-14.135, 0's: 0 Z-trim(97.8): 73 B-trim: 41 in 1/47
Lambda= 0.154543
statistics sampled from 5104 (5166) to 5104 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.481), E-opt: 0.2 (0.159), width: 16
Scan time: 4.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS47049.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1149) 7526 1688.3 0
CCDS3466.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1164) 4699 1058.0 0
CCDS41873.1 ATP8A2 gene_id:51761|Hs108|chr13 (1188) 3300 746.1 1.1e-214
CCDS33896.1 ATP11B gene_id:23200|Hs108|chr3 (1177) 1396 321.6 6.9e-87
CCDS33489.1 ATP9A gene_id:10079|Hs108|chr20 (1047) 1321 304.9 6.6e-82
CCDS77202.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1136) 1089 253.1 2.7e-66
CCDS12014.1 ATP9B gene_id:374868|Hs108|chr18 (1147) 1089 253.1 2.7e-66
CCDS32238.1 ATP8B4 gene_id:79895|Hs108|chr15 (1192) 1023 238.4 7.5e-62
CCDS1066.1 ATP8B2 gene_id:57198|Hs108|chr1 (1223) 977 228.2 9.5e-59
CCDS41405.1 ATP8B2 gene_id:57198|Hs108|chr1 ( 387) 916 214.5 3.9e-55
CCDS11965.1 ATP8B1 gene_id:5205|Hs108|chr18 (1251) 909 213.0 3.5e-54
CCDS32178.1 ATP10A gene_id:57194|Hs108|chr15 (1499) 902 211.5 1.2e-53
CCDS43394.1 ATP10B gene_id:23120|Hs108|chr5 (1461) 861 202.3 6.9e-51
CCDS3476.1 ATP10D gene_id:57205|Hs108|chr4 (1426) 860 202.1 7.8e-51
CCDS32011.1 ATP11A gene_id:23250|Hs108|chr13 (1134) 846 199.0 5.5e-50
CCDS54196.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1263) 832 195.8 5.3e-49
CCDS35410.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1119) 778 183.8 2e-45
CCDS14668.1 ATP11C gene_id:286410|Hs108|chrX (1132) 777 183.6 2.3e-45
CCDS45901.1 ATP8B3 gene_id:148229|Hs108|chr19 (1300) 740 175.3 8.1e-43
>>CCDS47049.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1149 aa)
initn: 7526 init1: 7526 opt: 7526 Z-score: 9060.0 bits: 1688.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7526; 99.9% identity (99.9% similar) in 1149 aa overlap (1-1149:1-1149)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPTMRRTVSEIRSRAEGYEKTDDVSEKTSLADQEEVRTIFINQPQLTKFCNNHVSTAKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MPTMRRTVSEIRSRAEGYEKTDDVSEKTSLADQEEVRTIFINQPQLTKFCNNHVSTAKYN
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLLFILAVAAIKEIIED
70 80 90 100 110 120
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IKRHKADNAVNKKQTQVLRNGAWEIVHWEKVNVGDIVIIKGKEYIPADTVLLSSSEPQAM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CYIETSNLDGETNLKIRQGLPATSDIKDVDSLMRISGRIECESPNRHLYDFVGNIRLDGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNSTSPPLKLSNVERITNVQILI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FKKCTIAGVAYGQNSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEFLTMMAVCHTAVPERE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 FKKCTIAGVAYGQNSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEFLTMMAVCHTAVPERE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RDKIIYQAASPDEGALVRAAKQLNFVFTGRTPDSVIIDSLGQEERYELLNVLEFTSARKR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 GDKIIYQAASPDEGALVRAAKQLNFVFTGRTPDSVIIDSLGQEERYELLNVLEFTSARKR
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pF1KB4 MSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEIS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFATEGLRTLCFAVAEIS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDKLQDQVPETIETLM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIEDKLQDQVPETIETLM
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pF1KB4 KADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSRHCTTLGDALR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTRETLSRHCTTLGDALR
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 KENDFALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KENDFALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQKSEVVEMVKKQVKVV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 TLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMIHGAWNYNRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYLKNLLMIHGAWNYNRV
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 SKCILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SKCILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMFTAMPPLTLGIFERSC
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 RKENMLKYPELYKTSQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGTAFGNGKTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RKENMLKYPELYKTSQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPLKALQYGTAFGNGKTS
910 920 930 940 950 960
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pF1KB4 DYLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSSLWPAIPMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 DYLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVVFFGIYSSLWPAIPMA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 PDMSGEAAMLFSSGVFWMGLLFIPVASLLLDVVYKVIKRTAFKTLVDEVQELEAKSQDPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PDMSGEAAMLFSSGVFWMGLLFIPVASLLLDVVYKVIKRTAFKTLVDEVQELEAKSQDPG
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 AVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQDENGIVSQSEVIRAYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQDENGIVSQSEVIRAYD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 TTKQRPDEW
:::::::::
CCDS47 TTKQRPDEW
>>CCDS3466.1 ATP8A1 gene_id:10396|Hs108|chr4 (1164 aa)
initn: 4699 init1: 4699 opt: 4699 Z-score: 5653.5 bits: 1058.0 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7416; 97.6% identity (98.1% similar) in 1164 aa overlap (1-1149:1-1164)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPTMRRTVSEIRSRAEGYEKTDDVSEKTSLADQEEVRTIFINQPQLTKFCNNHVSTAKYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPTMRRTVSEIRSRAEGYEKTDDVSEKTSLADQEEVRTIFINQPQLTKFCNNHVSTAKYN
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 IITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLLFILAVAAIKEIIED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLLFILAVAAIKEIIED
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 IKRHKADNAVNKKQTQVLRNGAWEIVHWEKVNVGDIVIIKGKEYIPADTVLLSSSEPQAM
::::::::::::::::::::::::::::::: ::.:: . . :..::: . :::::::::
CCDS34 IKRHKADNAVNKKQTQVLRNGAWEIVHWEKVAVGEIVKVTNGEHLPADLISLSSSEPQAM
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190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CYIETSNLDGETNLKIRQGLPATSDIKDVDSLMRISGRIECESPNRHLYDFVGNIRLDGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 CYIETSNLDGETNLKIRQGLPATSDIKDVDSLMRISGRIECESPNRHLYDFVGNIRLDGH
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNSTSPPLKLSNVERITNVQILI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 GTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNSTSPPLKLSNVERITNVQILI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNFGLNFLTFIILFNNLIPISLL
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 VTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEELGQVKYIFSDKTGTLTCNVMQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460
pF1KB4 FKKCTIAGVAYG---------------QNSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEF
:::::::::::: :::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FKKCTIAGVAYGHVPEPEDYGCSPDEWQNSQFGDEKTFSDSSLLENLQNNHPTAPIICEF
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::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 YELLNVLEFTSARKRMSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 YELLNVLEFTSARKRMSVIVRTPSGKLRLYCKGADTVIYDRLAETSKYKEITLKHLEQFA
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pF1KB4 TEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TEGLRTLCFAVAEISESDFQEWRAVYQRASTSVQNRLLKLEESYELIEKNLQLLGATAIE
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pF1KB4 DKLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 DKLQDQVPETIETLMKADIKIWILTGDKQETAINIGHSCKLLKKNMGMIVINEGSLDGTR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ETLSRHCTTLGDALRKENDFALIIDGKTLKYALTFGVRQYFLDLALSCKAVICCRVSPLQ
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pF1KB4 KSEVVEMVKKQVKVVTLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KSEVVEMVKKQVKVVTLAIGDGANDVSMIQTAHVGVGISGNEGLQAANSSDYSIAQFKYL
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pF1KB4 KNLLMIHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KNLLMIHGAWNYNRVSKCILYCFYKNIVLYIIEIWFAFVNGFSGQILFERWCIGLYNVMF
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pF1KB4 TAMPPLTLGIFERSCRKENMLKYPELYKTSQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TAMPPLTLGIFERSCRKENMLKYPELYKTSQNALDFNTKVFWVHCLNGLFHSVILFWFPL
910 920 930 940 950 960
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 KALQYGTAFGNGKTSDYLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KALQYGTAFGNGKTSDYLLLGNFVYTFVVITVCLKAGLETSYWTWFSHIAIWGSIALWVV
970 980 990 1000 1010 1020
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 FFGIYSSLWPAIPMAPDMSGEAAMLFSSGVFWMGLLFIPVASLLLDVVYKVIKRTAFKTL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 FFGIYSSLWPAIPMAPDMSGEAAMLFSSGVFWMGLLFIPVASLLLDVVYKVIKRTAFKTL
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1070 1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB4 VDEVQELEAKSQDPGAVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VDEVQELEAKSQDPGAVVLGKSLTERAQLLKNVFKKNHVNLYRSESLQQNLLHGYAFSQD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1130 1140
pF1KB4 ENGIVSQSEVIRAYDTTKQRPDEW
::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ENGIVSQSEVIRAYDTTKQRPDEW
1150 1160
>>CCDS41873.1 ATP8A2 gene_id:51761|Hs108|chr13 (1188 aa)
initn: 5229 init1: 3075 opt: 3300 Z-score: 3967.6 bits: 746.1 E(32554): 1.1e-214
Smith-Waterman score: 5262; 67.0% identity (88.0% similar) in 1165 aa overlap (4-1145:21-1184)
10 20 30 40
pF1KB4 MPTMRRTVSEIRSRAEGYEKTDD-VSEKTSLADQEEV--RTIF
.: .:. .:: . ::.:..: .:. ::..:: :. :::.
CCDS41 MLNGAGLDKALKMSLPRRSRIRSSVGPVRS-SLGYKKAEDEMSRATSVGDQLEAPARTIY
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 INQPQLTKFCNNHVSTAKYNIITFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYT
.:::.:.:: .:..:::::...:::::::: :.:::::.:::::::::::::::::::::
CCDS41 LNQPHLNKFRDNQISTAKYSVLTFLPRFLYEQIRRAANAFFLFIALLQQIPDVSPTGRYT
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 TLVPLLFILAVAAIKEIIEDIKRHKADNAVNKKQTQVLRNGAWEIVHWEKVNVGDIVIIK
:::::..::..:.::::.::.::::::::::::.: ::::: :. . :..: ::::: .
CCDS41 TLVPLIIILTIAGIKEIVEDFKRHKADNAVNKKKTIVLRNGMWHTIMWKEVAVGDIVKVV
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 GKEYIPADTVLLSSSEPQAMCYIETSNLDGETNLKIRQGLPATSDIKDVDSLMRISGRIE
. .:.:::.:::::::::::::.::.:::::::::::::: :.:.. . ::..:: ::
CCDS41 NGQYLPADVVLLSSSEPQAMCYVETANLDGETNLKIRQGLSHTADMQTREVLMKLSGTIE
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 CESPNRHLYDFVGNIRLDGHGTVPLGADQILLRGAQLRNTQWVHGIVVYTGHDTKLMQNS
::.::::::::.::. :::.. : :: :::::::.:::::::: ::::::::::::::::
CCDS41 CEGPNRHLYDFTGNLNLDGKSLVALGPDQILLRGTQLRNTQWVFGIVVYTGHDTKLMQNS
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 TSPPLKLSNVERITNVQILILFCILIAMSLVCSVGSAIWNRRHSGKDWYLNLNYGGASNF
:. ::: ::::..::::::.:: ::..:.:: :.:. ::: :. :.::.. ..::
CCDS41 TKAPLKRSNVEKVTNVQILVLFGILLVMALVSSAGALYWNRSHGEKNWYIKKMDTTSDNF
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GLNFLTFIILFNNLIPISLLVTLEVVKFTQAYFINWDLDMHYEPTDTAAMARTSNLNEEL
: :.::::::.::::::::::::::::.::: ::::: ::.: .:: ::::::::::::
CCDS41 GYNLLTFIILYNNLIPISLLVTLEVVKYTQALFINWDTDMYYIGNDTPAMARTSNLNEEL
360 370 380 390 400 410
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CCDS33 SLEMEMELLCLTGVEDQLQADVRPTLETLRNAGIKVWMLTGDKLETATCTAKNAHLVTRN
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CCDS33 WLMTVAELLSLACYIASLVFLHEFIDVYFIATLSFLWKVSVITLVSCLPLYVLKYLRRRF
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CCDS77 LEWFVCDGWKFLCTSCCGWLINICRRKKELKARTVWLGCPEKCEEKHPRNSIKNQKYNVF
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pF1KB4 TFLPRFLYSQFRRAANSFFLFIALLQQIPDVSPTGRYTTLVPLLFILAVAAIKEIIEDIK
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