Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4920
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4920, 761 aa
1>>>pF1KB4920 761 - 761 aa - 761 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7933+/-0.00208; mu= 14.8828+/- 0.124
mean_var=292.7919+/-52.716, 0's: 0 Z-trim(104.9): 979 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.074954
statistics sampled from 7082 (8150) to 7082 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.571), E-opt: 0.2 (0.25), width: 16
Scan time: 3.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 ( 761) 5304 589.0 9e-168
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 2085 240.9 5.5e-63
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 2028 234.8 3.9e-61
CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 644) 2021 233.9 6.1e-61
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1976 229.0 1.7e-59
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1976 229.1 1.8e-59
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1976 229.1 1.8e-59
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1976 229.1 1.8e-59
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1962 227.6 5.2e-59
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1957 227.0 7.3e-59
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1943 225.5 2.2e-58
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1925 223.5 8e-58
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1921 223.0 1e-57
CCDS6437.1 ZNF16 gene_id:7564|Hs108|chr8 ( 682) 1912 222.2 2.2e-57
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1893 220.0 8.3e-57
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1887 219.4 1.4e-56
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1887 219.4 1.4e-56
CCDS82341.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 527) 1876 218.1 2.9e-56
CCDS12503.1 ZNF569 gene_id:148266|Hs108|chr19 ( 686) 1876 218.3 3.3e-56
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1872 217.8 4.5e-56
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1870 217.8 5.8e-56
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1870 217.8 5.8e-56
CCDS46166.1 ZNF534 gene_id:147658|Hs108|chr19 ( 661) 1860 216.5 1.1e-55
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CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1857 216.4 1.5e-55
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1856 216.2 1.6e-55
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1842 214.5 4e-55
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1839 214.4 6e-55
CCDS4439.1 ZNF354B gene_id:117608|Hs108|chr5 ( 612) 1833 213.5 7.9e-55
CCDS12854.1 ZNF83 gene_id:55769|Hs108|chr19 ( 516) 1826 212.7 1.2e-54
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1827 213.3 1.6e-54
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1827 213.3 1.7e-54
CCDS12497.1 ZNF345 gene_id:25850|Hs108|chr19 ( 488) 1818 211.8 2.2e-54
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1816 211.5 2.4e-54
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1818 212.0 2.6e-54
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1819 212.3 2.8e-54
CCDS65110.1 ZFP37 gene_id:7539|Hs108|chr9 ( 645) 1816 211.7 2.9e-54
CCDS33048.1 ZNF235 gene_id:9310|Hs108|chr19 ( 738) 1806 210.8 6.5e-54
CCDS4438.1 ZNF354A gene_id:6940|Hs108|chr5 ( 605) 1801 210.1 8.6e-54
CCDS14279.1 ZNF41 gene_id:7592|Hs108|chrX ( 779) 1800 210.2 1.1e-53
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1799 210.0 1.1e-53
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1791 209.0 1.9e-53
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1790 209.1 2.3e-53
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1790 209.2 2.4e-53
CCDS46101.1 ZNF234 gene_id:10780|Hs108|chr19 ( 700) 1788 208.8 2.5e-53
CCDS33096.1 ZNF816 gene_id:125893|Hs108|chr19 ( 651) 1787 208.6 2.6e-53
CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1789 209.2 2.8e-53
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1783 208.1 3.3e-53
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1783 208.2 3.4e-53
CCDS73089.1 ZNF33A gene_id:7581|Hs108|chr10 ( 699) 1783 208.2 3.6e-53
>>CCDS11179.2 ZNF287 gene_id:57336|Hs108|chr17 (761 aa)
initn: 5304 init1: 5304 opt: 5304 Z-score: 3125.5 bits: 589.0 E(32554): 9e-168
Smith-Waterman score: 5304; 100.0% identity (100.0% similar) in 761 aa overlap (1-761:1-761)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLASSKRMNSSSRSQILLRWKSDKAQSGPYNVEKEILTSRFLRDTETCRQNFRNFPYPDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MLASSKRMNSSSRSQILLRWKSDKAQSGPYNVEKEILTSRFLRDTETCRQNFRNFPYPDL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGPRKALSQLRELCLKWLRPEIHSKEQILELLVLEQFLTILPGEVRTWVKSQYPESSEEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 AGPRKALSQLRELCLKWLRPEIHSKEQILELLVLEQFLTILPGEVRTWVKSQYPESSEEA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VTLVEDLTQILEEEAPQNSTLSQDTPEEDPRGKHAFQTGWLNDLVTKESMTFKDVAVDIT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VTLVEDLTQILEEEAPQNSTLSQDTPEEDPRGKHAFQTGWLNDLVTKESMTFKDVAVDIT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QEDWELMRPVQKELYKTVTLQNYWNMVSLGLTVYRPTVIPILEEPWMVIKEILEGPSPEW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QEDWELMRPVQKELYKTVTLQNYWNMVSLGLTVYRPTVIPILEEPWMVIKEILEGPSPEW
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ETKAQACTPVEDMSKLTKEETHTIKLEDSYDYDDRLERRGKGGFWKIHTDERGFSLKSVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ETKAQACTPVEDMSKLTKEETHTIKLEDSYDYDDRLERRGKGGFWKIHTDERGFSLKSVL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SQEYDPTEECLSKYDIYRNNFEKHSNLIVQFDTQLDNKTSVYNEGRATFNHVSYGIVHRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SQEYDPTEECLSKYDIYRNNFEKHSNLIVQFDTQLDNKTSVYNEGRATFNHVSYGIVHRK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ILPGEKPYKCNVCGKKFRKYPSLLKHQSTHAKEKSYECEECGKEFRHISSLIAHQRMHTG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 EKPYECHQCGKAFSQRAHLTIHQRIHTGEKPYKCDDCGKDFSQRAHLTIHQRTHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 EKPYECHQCGKAFSQRAHLTIHQRIHTGEKPYKCDDCGKDFSQRAHLTIHQRTHTGEKPY
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 KCLECGKTFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 KCLECGKTFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 CWKVFSQSTYLIRHQRIHSGEKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 CWKVFSQSTYLIRHQRIHSGEKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKA
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 FSQSANLTQHHRTHTGEKPYKCSVCGKAFSQSVHLTQHQRIHNGEKPFKCNICGKAYRQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 FSQSANLTQHHRTHTGEKPYKCSVCGKAFSQSVHLTQHQRIHNGEKPFKCNICGKAYRQG
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ANLTQHQRIHTGEKPYKCNECGKAFIYSSSLNQHQRTHTGERPYKCNECDKDFSQRTCLI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ANLTQHQRIHTGEKPYKCNECGKAFIYSSSLNQHQRTHTGERPYKCNECDKDFSQRTCLI
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730 740 750 760
pF1KB4 QHQRIHTGEKPYACRICGKTFTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 QHQRIHTGEKPYACRICGKTFTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
730 740 750 760
>>CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 (751 aa)
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Smith-Waterman score: 2098; 51.3% identity (71.9% similar) in 608 aa overlap (167-758:25-612)
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 QNSTLSQDTPEEDPRGKHAFQTGWLNDLVTKESMTFKDVAVDITQEDWELMRPVQKELYK
.:..::::: ::.:::.:. . : :..:..
CCDS46 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFR
10 20 30 40 50
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TVTLQNYWNMVSLGLTVYRPTVIPILE---EPWMVIKEILEGPSPEWETKAQ--ACTPVE
:::.:: ..::.:: : .: :: :: :::.. : : .:::. . . .:
CCDS46 DVTLENYTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCADWETRLENSVSAPEP
60 70 80 90 100 110
260 270 280 290 300
pF1KB4 DMSK--LTKE---ETH------TIKLEDSYDYDDRLERRGKGGFWKIHTDERGFSLKSVL
:.:. :. : : : . .: .:..:. :::. . . : . :..
CCDS46 DISEEELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQAN--QQTLPKEIKVTEKTIP
120 130 140 150 160 170
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SQEYDPTEECLSKYDIYRNNFEKHSNLIVQFDTQLDNKTSVYNEGRATFNHVSYGIVHRK
: : :... ..: . . :::..: . ..::. . . : : .:
CCDS46 SWEKGPVNNEFGK------SVNVSSNLVTQEPS--PEETSTKRSIKQNSNPV------KK
180 190 200 210
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pF1KB4 ILPGEKPYKCNVCGKKFRKYPSLLKHQSTHAKEKSYECEECGKEFRHISSLIAHQRMHTG
:: ::: ::: : .:..:: ::. :: :.:.:: : : . .:: :::.:::
CCDS46 ----EKSCKCNECGKAFSYCSALIRHQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTG
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 EKPYECHQCGKAFSQRAHLTIHQRIHTGEKPYKCDDCGKDFSQRAHLTIHQRTHTGEKPY
.:::.: ::::.: . :: ::::::::::::::.::: ::::.::. ::: :::::::
CCDS46 DKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRIHTGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPY
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 KCLECGKTFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNE
: ::::.::. . ...::..::::::. :.:: :::..:::: ::::::::.: :::::
CCDS46 TCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNE
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 CWKVFSQSTYLIRHQRIHSGEKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKA
: :.:. . .:::. ::.::: :.::::::::.. :.: ::: :::::: : : :::.
CCDS46 CGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYECNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKS
400 410 420 430 440 450
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 FSQSANLTQHHRTHTGEKPYKCSVCGKAFSQSVHLTQHQRIHNGEKPFKCNICGKAYRQG
:: ..:.:: . :::::::::. :::::: ::::.:::. ::::.:. ::::.
CCDS46 FSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNECGKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYL
460 470 480 490 500 510
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ANLTQHQRIHTGEKPYKCNECGKAFIYSSSLNQHQRTHTGERPYKCNECDKDFSQRTCLI
.::.:::. :: :: :.:.::::::: :::: .:.: ::::.::.:.:: : :: . ::
CCDS46 SNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAFIRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLI
520 530 540 550 560 570
730 740 750 760
pF1KB4 QHQRIHTGEKPYACRICGKTFTQSTNLIQHQRVHTGAKHRN
::..:::::.:: : ::..:.:. .: ::.:.:::::
CCDS46 QHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQK
580 590 600 610 620 630
CCDS46 THTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTG
640 650 660 670 680 690
>--
initn: 3225 init1: 683 opt: 683 Z-score: 425.0 bits: 89.3 E(32554): 2.4e-17
Smith-Waterman score: 683; 65.0% identity (81.8% similar) in 137 aa overlap (396-532:614-750)
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KPYKCNVCGKKFRKYPSLLKHQSTHAKEKSYECEECGKEFRHISSLIAHQRMHTGEKPYE
::: :::: ::: ::: ::. :: ::::.
CCDS46 RPYKCNECGRAFNQNIHLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQ
590 600 610 620 630 640
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CHQCGKAFSQRAHLTIHQRIHTGEKPYKCDDCGKDFSQRAHLTIHQRTHTGEKPYKCLEC
:..: :.::: .::: :::::::::::::..: : ::. .::: :: ::::::::.: ::
CCDS46 CNKCEKTFSQSSHLTQHQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNEC
650 660 670 680 690 700
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 GKTFSHSSSLINHQRVHTGEKPYICNECGKTFSQSTHLLQHQKIHTGKKPYKCNECWKVF
::::.:. ::.:::.:.::::. ::.:::.: . : .::..: :
CCDS46 RKTFSQSTYLIQHQRIHSGEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
710 720 730 740 750
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SQSTYLIRHQRIHSGEKCYKCNECGKAFAHSSTLIQHQTTHTGEKSYICNICGKAFSQSA
>>CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 (738 aa)
initn: 8813 init1: 1817 opt: 2028 Z-score: 1211.1 bits: 234.8 E(32554): 3.9e-61
Smith-Waterman score: 2028; 49.6% identity (73.5% similar) in 601 aa overlap (167-758:5-597)
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 QNSTLSQDTPEEDPRGKHAFQTGWLNDLVTKESMTFKDVAVDITQEDWELMRPVQKELYK
.::..: :..::.::..:.:. : ::.:::
CCDS31 MTMLQESFSFDDLSVDFTQKEWQLLDPSQKNLYK
10 20 30
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 TVTLQNYWNMVSLGLTVYRPTVIPILE---EPWMVIKEILEGPSPE-WETKAQAC--TPV
: :.:: ..:::: :..: :: :: :::. :: . ::: :.. ..
CCDS31 DVMLENYSSLVSLGYEVMKPDVIFKLEQGEEPWVGDGEIPSSDSPEVWKVDGNMMWHQDN
40 50 60 70 80 90
260 270 280 290 300
pF1KB4 EDMSKLTKEETHTIKLEDSYDYDDRLERRGKGGFWKIHTDERGFSLK---SVLSQEYDPT
.: :. :. . . ... . . :.. . : :. :: ..: . :
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CCDS12 RPKVKLSVLKQGISEEISNSVILVERFLWDGLWYCRGEDTEGHWEWSCESLESLAVPVAF
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:.: .::. : .:. :: ::: ::::::::: .:::.:: :. .. :.: :::::::.:.
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.::: : : ::: : : :::::::.: ::::.::::::: .:::.::::::: :.::::
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.:.: : :.:::. :::.:::.:.:: :.::::: : .:.:::.::: : ::::::.:.:
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::.: ::. :::::: : :. ::::: ::..::::.: :::::::.:. ::::::.: :
CCDS12 SSSLSQHERTHTGEKPYECSQCGKAFRQSTHLTQHQRIHTGEKPYECNDCGKAFSHSSSL
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760
pF1KB4 GAKHRN
: :
CCDS12 GEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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:: :.: .::. : .:. :: ::: ::::::::: .:::.:: :. .. :.: :::::::
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.:..::: : : ::: : : :::::::.: ::::.::::::: .:::.::::::: :.:
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:.:::.: ::. :::::: : :. ::::: ::..::::.: :::::::.:. ::::::.:
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::.:::::.::::..:: ::.:. : : : ::::::::::::.::.::.:: :: :
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.::: :: :.:: :::: :.::. . : ::.: ::::::: :. :::.: :::.: ::.:
CCDS54 EHQRIHTKEKPYGCNECGKSFSHSSSLSQHERTHTGEKPYECHDCGKSFRQSTHLTQHRR
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760
pF1KB4 VHTGAKHRN
.::: :
CCDS54 IHTGEKPYACRDCGKAFTHSSSLTKHQRTHTG
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CCDS42 RHKKIHTGEEPYKFEKCGRVFTCSSTLTQDKKIHTGEKPYNCEECGKVFTYSSTLTRHKR
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CCDS59 MGLLTFRDVAIEFSLEEWQCLDTAQKNLYRNVM
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CCDS59 LENYRNLAFLGIAVSKPDLIICLEKEKEPWNMKRDEMVDEPPGICPHFAQDIWPEQGVED
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CCDS59 -----SFQKVILRRFEKCGHENLQLRKGCKSVDECKVHKEGY---NGLNQCFTTTQGKAS
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CCDS59 QCGKYLKVFYKFINLNRYKIRHTRKKPFKCKNCVKSFCMFSHKTQHKSIYTTEKSYKCKE
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CCDS59 CGKTFNWSSTLTNHKKTHTEEKPYKCEEYGKAFNQSSNYTTHKVTHTGEKPYKCEECGKA
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CCDS59 STLTRHKRLHSGEKPYKCEECAKAFSQFGHLTTHRIIHTGEKPYKCEECGKAFIWPSTLT
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CCDS59 KCEECGKAFNRSSNLSTHKIIHTGEKPYKCDECGKSFIWSSTLFKHKRIHT
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761 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 22:08:01 2016 done: Thu Nov 3 22:08:02 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]