Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4908
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4908, 644 aa
1>>>pF1KB4908 644 - 644 aa - 644 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.4905+/-0.00138; mu= 10.7009+/- 0.082
mean_var=257.3698+/-50.909, 0's: 0 Z-trim(109.6): 989 B-trim: 52 in 1/51
Lambda= 0.079946
statistics sampled from 9959 (11033) to 9959 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.688), E-opt: 0.2 (0.339), width: 16
Scan time: 3.520
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 ( 644) 4621 547.2 2.5e-155
CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 ( 569) 1714 211.9 2e-54
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CCDS34972.1 ZNF250 gene_id:58500|Hs108|chr8 ( 560) 1677 207.6 3.8e-53
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1667 206.5 9.1e-53
CCDS4441.1 ZNF454 gene_id:285676|Hs108|chr5 ( 522) 1648 204.2 3.7e-52
CCDS77297.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 810) 1635 202.9 1.4e-51
CCDS12548.1 ZNF546 gene_id:339327|Hs108|chr19 ( 836) 1635 203.0 1.4e-51
CCDS74355.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 592) 1627 201.8 2.2e-51
CCDS12504.1 ZNF570 gene_id:148268|Hs108|chr19 ( 536) 1619 200.9 3.9e-51
CCDS32977.1 ZNF85 gene_id:7639|Hs108|chr19 ( 595) 1618 200.8 4.4e-51
CCDS33091.1 ZNF528 gene_id:84436|Hs108|chr19 ( 628) 1610 199.9 8.7e-51
CCDS56092.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 ( 580) 1603 199.1 1.5e-50
CCDS43590.1 ZNF479 gene_id:90827|Hs108|chr7 ( 524) 1573 195.5 1.5e-49
CCDS47352.1 ZNF879 gene_id:345462|Hs108|chr5 ( 563) 1554 193.4 7.2e-49
CCDS74472.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 616) 1553 193.3 8.2e-49
CCDS74471.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 658) 1553 193.4 8.5e-49
CCDS12970.2 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 670) 1553 193.4 8.6e-49
CCDS54329.1 ZNF135 gene_id:7694|Hs108|chr19 ( 682) 1553 193.4 8.7e-49
CCDS46169.1 ZNF665 gene_id:79788|Hs108|chr19 ( 678) 1548 192.8 1.3e-48
CCDS54313.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 1542 192.0 1.9e-48
CCDS12860.1 ZNF415 gene_id:55786|Hs108|chr19 ( 555) 1540 191.8 2.2e-48
CCDS4440.1 ZFP2 gene_id:80108|Hs108|chr5 ( 461) 1535 191.1 2.9e-48
CCDS2719.1 ZNF502 gene_id:91392|Hs108|chr3 ( 544) 1532 190.8 4.1e-48
CCDS82391.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 782) 1524 190.1 9.6e-48
CCDS12859.1 ZNF160 gene_id:90338|Hs108|chr19 ( 818) 1524 190.1 9.9e-48
CCDS12947.1 ZNF71 gene_id:58491|Hs108|chr19 ( 489) 1510 188.2 2.2e-47
CCDS76895.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 585) 1506 187.9 3.4e-47
CCDS10900.1 ZNF23 gene_id:7571|Hs108|chr16 ( 643) 1506 187.9 3.6e-47
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1507 188.2 3.7e-47
CCDS46164.1 ZNF880 gene_id:400713|Hs108|chr19 ( 577) 1501 187.3 5e-47
CCDS12498.1 ZNF420 gene_id:147923|Hs108|chr19 ( 688) 1500 187.3 6.1e-47
CCDS54939.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 568) 1498 186.9 6.3e-47
CCDS4311.2 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 604) 1498 187.0 6.6e-47
CCDS54940.1 ZNF300 gene_id:91975|Hs108|chr5 ( 620) 1498 187.0 6.7e-47
CCDS33097.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 839) 1499 187.3 7.4e-47
CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1499 187.3 7.4e-47
CCDS33122.1 ZNF470 gene_id:388566|Hs108|chr19 ( 717) 1497 187.0 7.9e-47
CCDS31940.1 ZNF84 gene_id:7637|Hs108|chr12 ( 738) 1493 186.5 1.1e-46
CCDS56105.1 ZNF835 gene_id:90485|Hs108|chr19 ( 537) 1488 185.8 1.4e-46
CCDS35235.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 620) 1487 185.7 1.6e-46
CCDS35236.1 ZNF182 gene_id:7569|Hs108|chrX ( 639) 1487 185.7 1.6e-46
CCDS54238.1 ZNF737 gene_id:100129842|Hs108|chr19 ( 536) 1485 185.4 1.7e-46
CCDS46045.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 623) 1484 185.4 2.1e-46
CCDS46044.1 ZNF30 gene_id:90075|Hs108|chr19 ( 624) 1484 185.4 2.1e-46
CCDS4624.1 ZNF184 gene_id:7738|Hs108|chr6 ( 751) 1483 185.4 2.5e-46
CCDS11180.1 ZNF624 gene_id:57547|Hs108|chr17 ( 865) 1484 185.6 2.5e-46
CCDS2715.1 ZKSCAN7 gene_id:55888|Hs108|chr3 ( 754) 1481 185.1 2.9e-46
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1476 184.5 4.1e-46
>>CCDS42982.1 ZNF74 gene_id:7625|Hs108|chr22 (644 aa)
initn: 4621 init1: 4621 opt: 4621 Z-score: 2902.0 bits: 547.2 E(32554): 2.5e-155
Smith-Waterman score: 4621; 100.0% identity (100.0% similar) in 644 aa overlap (1-644:1-644)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VPSQQQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQAWGRQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 CEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 HCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB4 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SLLGAGDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
610 620 630 640
>>CCDS12943.1 ZNF583 gene_id:147949|Hs108|chr19 (569 aa)
initn: 2717 init1: 1381 opt: 1714 Z-score: 1090.5 bits: 211.9 E(32554): 2e-54
Smith-Waterman score: 1714; 45.2% identity (72.4% similar) in 544 aa overlap (39-579:2-543)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 EKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQLDSPQRALY
::. :.: ::::.:.:::: :. :: ::
CCDS12 MSKDLVTFGDVAVNFSQEEWEWLNPAQRNLY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKAVPSQQQGI
: ::::::..:..:: . :::::: ::.:.::: ...: :::::.:: : ....
CCDS12 RKVMLENYRSLVSLGVSVSKPDVISLLEQGKEPWMVKKEGTRGPCPDWEY--VFKNSEFS
40 50 60 70 80
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CKEEPAQEPIMERPLGGAQ-AWGRQAGALQRS-QAAPWAPAPAMVWDVPVEEFPL-RCPL
:.: .: .:. . ... . .:... :. : .: . .. . . .
CCDS12 SKQETYEESSKVVTVGARHLSYSLDYPSLREDCQSEDWYKNQLGSQEVHLSQLIITHKEI
90 100 110 120 130 140
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRGAGAGE
. . . : . .: .. . . . :.. : .. . .: ..: . . .
CCDS12 LPEVQNKEYNKSWQTFHQDTIFDIQQSFPTKEKAHKHEPQKKSYRKKSVEMKHRKVYVEK
150 160 170 180 190 200
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 GEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWHSREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTGEKPFF
. :..: :.: ::::::::.: :. :: : : ::::.:. :.:: .:.::::::::.
CCDS12 KLLKCNDCEKVFNQSSSLTLHQRIHTGEKPYACVECGKTFSQSANLAQHKRIHTGEKPYE
210 220 230 240 250 260
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 CGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGERPYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPYRCGEC
: :: :::: .. : :::.::::.::.:. :.:::: . :..: ::::::.:..: ::
CCDS12 CKECRKAFSQNAHLAQHQRVHTGEKPYQCKECKKAFSQIAHLTQHQRVHTGERPFECIEC
270 280 290 300 310 320
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQCGSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSDCEKAF
::::.. . :..:.::::::::: :. :::::. .. : ::..::.:..:..:..:.:::
CCDS12 GKAFSNGSFLAQHQRIHTGEKPYVCNVCGKAFSHRGYLIVHQRIHTGERPYECKECRKAF
330 340 350 360 370 380
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCGKGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHA
.. ..:. :::.::::::..: : :.:: ::: :.:.:.::::..: :::::::. .
CCDS12 SQYAHLAQHQRVHTGEKPYECKVCRKAFSQIAYLDQHQRVHTGEKPYECIECGKAFSNSS
390 400 410 420 430 440
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 YLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFSCHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNHCLIK
: :.: ::::::. :..: :.:: ...: :::::::::::.:. ::.::: . :
CCDS12 SLAQHQRSHTGEKPYMCKECRKTFSQNAGLAQHQRIHTGEKPYECNVCGKAFSYSGSLTL
450 460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVPGSLLGA
::.::.::. ..:. : . : .::..:.:.:.
CCDS12 HQRIHTGERPYECKDCRKSFRQRAHLAHHERIHTMESFLTLSSPSPSTSNQLPRPVGFIS
510 520 530 540 550 560
610 620 630 640
pF1KB4 GDAGLRDVDPIDALDVAKLLCVVPPRAGRNFSLGSKPRN
>>CCDS42558.1 ZNF568 gene_id:374900|Hs108|chr19 (644 aa)
initn: 4138 init1: 1437 opt: 1710 Z-score: 1087.5 bits: 211.5 E(32554): 3e-54
Smith-Waterman score: 1730; 45.9% identity (68.5% similar) in 591 aa overlap (9-583:23-585)
10 20 30 40
pF1KB4 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFK
:. : ::. ::: .: :: . : :.:.::
CCDS42 MTSQSSVISNSCVTMERLSHMMERKAWCSQESALSEEE--EDTT-------RPLETVTFK
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 DVAVDFTQEEWGQLDSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQR
:::::.::::: :. :: ::::::::::.::...: . ::::: .::. :::: :..
CCDS42 DVAVDLTQEEWEQMKPAQRNLYRDVMLENYSNLVTVGCQVTKPDVIFKLEQEEEPWVMEE
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150
pF1KB4 EVPRGPCPE-WEL-KAVPSQQQ-------GICKEEPAQEPIME-------RPLGGAQAWG
:. ::: ::. . . .::. .: :. .: ..: ::.. . .
CCDS42 EMFGRHCPEVWEVDEQIKKQQETLVRKVTSISKKILIKEKVIECKKVAKIFPLSSDIVTS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 RQAGALQRSQAAPWAPAPAMVWDVPVEEFPLRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGR
::. : .. .. . .. : . .: : :. . :
CCDS42 RQSFYDCDSLDK------GLEHNLDLLRYEKGC-VREKQSNEFGKPFYHCASYVV-----
180 190 200 210
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 TKAPARLCAGENASTPSEPEKFPQVRRQRGAGAGEGEFVCGECGKAFRQSSSLTLHRRWH
: : :.. : .:: .:..: ::: . : :::::: .. .: :.. :
CCDS42 TPFKCNQC-GQDFS-----HKFDLIRHER-IHAGEKPYECKECGKAFSRKENLITHQKIH
220 230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 SREKAYKCDECGKAFTWSTNLLEHRRIHTGEKPFFCGECGKAFSCHSSLNVHQRIHTGER
. :: :::.:::::: .::..:.::::::::. : .: :::: .:.: :.::::::.
CCDS42 TGEKPYKCNECGKAFIQMSNLIRHHRIHTGEKPYACKDCWKAFSQKSNLIEHERIHTGEK
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 PYKCSACEKAFSCSSLLSMHLRVHTGEKPYRCGECGKAFNQRTHLTRHHRIHTGEKPYQC
::.:. : :.:: .. : : ..::::::: :.:::.::.. . .: : : :::::::.:
CCDS42 PYECKECGKSFSQKQNLIEHEKIHTGEKPYACNECGRAFSRMSSVTLHMRSHTGEKPYKC
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400 410 420 430 440 450
pF1KB4 GSCGKAFTCHSSLTVHEKIHSGDKPFKCSDCEKAFNSRSRLTLHQRTHTGEKPFKCADCG
..:::::. : . .: . :.:.::. ::.: :::.. : ::.:.:.::.:::..: .::
CCDS42 NKCGKAFSQCSVFIIHMRSHTGEKPYVCSECGKAFSQSSSLTVHMRNHTAEKPYECKECG
400 410 420 430 440 450
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 KGFSCHAYLLVHRRIHSGEKPFKCNECGKAFSSHAYLIVHRRIHTGEKPFDCSQCWKAFS
:.:: . :..:..::.::::..:.:::::: . . :: :.::::::::. :. : ::::
CCDS42 KAFSRKENLITHQKIHTGEKPYECSECGKAFIQMSNLIRHQRIHTGEKPYACTVCGKAFS
460 470 480 490 500 510
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 CHSSLIVHQRIHTGEKPYKCSECGRAFSQNHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSH
.:.: :..::::::::.:..::.:::: . :..:.:::.::: :::..::. :. :
CCDS42 QKSNLTEHEKIHTGEKPYHCNQCGKAFSQRQNLLEHEKIHTGEKPFKCNECGKAFSRISS
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... ...:: .:: .::. ::::: ::: :. ::: :. :: :.:.:
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CCDS55 L
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CCDS32 GKAFVASSTLSKHEIIHTGKKPYKCEECGKAFNQSSSLTKHKKIHTGEKPYKCEECGKAF
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CCDS44 DVMLENYSNLVSLGLLGPKPDTFSQLEK-REVW-MPEDTPGGFCLDW--MTMPASKKSTV
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CCDS44 FKCNICEKAFVCRAHLTKHQNIHSGEKPYKCNECGKAFNQSTSFLQHQRIHTGEKPFECN
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CCDS44 ECGKAFRVNSSLTEHQRIHTGEKPYKCNECGKAFRDNSSFARHRKIHTGEKPYRCGLCEK
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CCDS44 AFRDQSALAQHQRIHTGEKPYTCNICEKAFSDHSALTQHKRIHTREKPYKCKICEKAFIR
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pF1KB4 NHCLIKHQKIHSGEKSFKCEKCGEMFNWSSHLTEHQRLHSEGKPLAIQFNKHLLSTYYVP
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CCDS44 STHLTQHQRIHTGEKPYKCNKCGKAFNQTANLIQHQRHHIGEK
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pF1KB4 MEIPAPEPEKTALSSQDPALSLKENLEDISGWGLPEARSKESVSFKDVAVDFTQEEWGQL
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CCDS77 MQPRFLWILCFSMEETQGELTSSCGSKTMANVSLAFRDVSIDLSQEEWECL
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pF1KB4 DSPQRALYRDVMLENYQNLLALGPPLHKPDVISHLERGEEPWSMQREVPRGPCPEWELKA
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CCDS77 DAVQRDLYKDVMLENYSNLVSLGYTIPKPDVITLLEQEKEPWIVMREGTRNWFTDLEYKY
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pF1KB4 VPSQ---QQGICKEEPAQEPIMERPLGGAQA-----WGRQAG-ALQRSQAAPWAPAPAMV
. .. ....:: .: :. . . : : ..:.. . . :.
CCDS77 ITKNLLSEKNVCKIYLSQLQTGEKSKNTIHEDTIFRNGLQCKHEFERQERHQMGCVSQML
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pF1KB4 WDVPVEEFPLRCPLFAQQRVPEGGPLLDTRKNVQATEGRTKAPARLCAGENASTPSEPEK
. . . ::. . :... : . :: . .. :. .:: : :
CCDS77 IQKQISH-PLHPKIHAREKSYECK---ECRKAFRQ-QSYLIQHLRIHTGERPYKCMECGK
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CCDS77 AFCRVGDLRVHHTIHAGERPYECKECGKAFRLHYHLTEHQRIHSGVKPYECKECGKAFSR
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CCDS77 SQHQKIHTGVKPYKCNECGKAFSHGSYLVQHQKIHTGEKPYECKECGKSFSFHAELARHR
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CCDS77 RIHTGEKPYECRECGKAFRLQTELTRHHRTHTGEKPYECKECGKAFICGYQLTLHLRTHT
410 420 430 440 450 460
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]