Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4886
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4886, 340 aa
1>>>pF1KB4886 340 - 340 aa - 340 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6468+/-0.0012; mu= 9.1105+/- 0.070
mean_var=124.5517+/-27.899, 0's: 0 Z-trim(105.4): 210 B-trim: 78 in 2/48
Lambda= 0.114921
statistics sampled from 8154 (8403) to 8154 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.62), E-opt: 0.2 (0.258), width: 16
Scan time: 2.490
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 ( 340) 2330 398.0 5.9e-111
CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 340) 2155 369.0 3.2e-102
CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 ( 340) 2151 368.3 5.1e-102
CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 340) 1970 338.3 5.5e-93
CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 ( 339) 1945 334.1 9.7e-92
CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 ( 240) 1536 266.2 1.9e-71
CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 353) 1250 218.9 4.9e-57
CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 ( 395) 1250 219.0 5.3e-57
CCDS59142.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 521) 418 81.1 2.2e-15
CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 ( 522) 418 81.1 2.2e-15
CCDS6981.1 WDR5 gene_id:11091|Hs108|chr9 ( 334) 397 77.5 1.7e-14
CCDS2470.1 DAW1 gene_id:164781|Hs108|chr2 ( 415) 394 77.1 2.9e-14
CCDS43876.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 314) 389 76.1 4.2e-14
CCDS75898.1 WDR38 gene_id:401551|Hs108|chr9 ( 315) 389 76.1 4.2e-14
CCDS3012.1 WDR5B gene_id:54554|Hs108|chr3 ( 330) 382 75.0 9.7e-14
CCDS7547.1 TAF5 gene_id:6877|Hs108|chr10 ( 800) 373 73.8 5.4e-13
CCDS76785.1 WDR61 gene_id:80349|Hs108|chr15 ( 212) 337 67.4 1.2e-11
CCDS10300.1 WDR61 gene_id:80349|Hs108|chr15 ( 305) 337 67.5 1.6e-11
CCDS54592.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 359) 336 67.4 2e-11
CCDS2846.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 407) 336 67.4 2.3e-11
CCDS54591.1 POC1A gene_id:25886|Hs108|chr3 ( 369) 334 67.1 2.6e-11
CCDS340.1 SNRNP40 gene_id:9410|Hs108|chr1 ( 357) 329 66.2 4.6e-11
>>CCDS5703.1 GNB2 gene_id:2783|Hs108|chr7 (340 aa)
initn: 2330 init1: 2330 opt: 2330 Z-score: 2105.4 bits: 398.0 E(32554): 5.9e-111
Smith-Waterman score: 2330; 100.0% identity (100.0% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS57 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS34.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 (340 aa)
initn: 2155 init1: 2155 opt: 2155 Z-score: 1948.6 bits: 369.0 E(32554): 3.2e-102
Smith-Waterman score: 2155; 90.3% identity (97.1% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::.:::::::::.::::::::::.:.::.::: ..:::::::::::::::::::::::
CCDS34 MSELDQLRQEAEQLKNQIRDARKACADATLSQITNNIDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS34 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
::::.:::::::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::. :
CCDS34 CSIYNLKTREGNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
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CCDS34 TGHTGDVMSLSLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
:.:::::::::::::::::::. :::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::.
CCDS34 FATGSDDATCRLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDAL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 KADRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS3230.1 GNB4 gene_id:59345|Hs108|chr3 (340 aa)
initn: 2151 init1: 2151 opt: 2151 Z-score: 1945.1 bits: 368.3 E(32554): 5.1e-102
Smith-Waterman score: 2151; 90.0% identity (97.9% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
::::::::::::::::::.::::::.:.::.:::...: :::::::::::::::::::::
CCDS32 MSELEQLRQEAEQLRNQIQDARKACNDATLVQITSNMDSVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
:::: ::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS32 MHWGYDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKMHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNYVACGGLDNI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
::::.:::::::::::::::::::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::. :
CCDS32 CSIYNLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDSQIVTSSGDTTCALWDIETAQQTTTF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
.:::::::::::.:: ::::::::::: ::::.::.::::.: :: ::::::.:::::::
CCDS32 TGHSGDVMSLSLSPDMRTFVSGACDASSKLWDIRDGMCRQSFTGHVSDINAVSFFPNGYA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
:.::::::::::::::::::::.::::::::::::::::.:::::::::::::::.::..
CCDS32 FATGSDDATCRLFDLRADQELLLYSHDNIICGITSVAFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDTL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS32 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLRIWN
310 320 330 340
>>CCDS8564.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 (340 aa)
initn: 1970 init1: 1970 opt: 1970 Z-score: 1782.9 bits: 338.3 E(32554): 5.5e-93
Smith-Waterman score: 1970; 80.9% identity (94.4% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-340)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
:.:.::::::::::..:: ::::::.: ::.....::. :::.:::::::::::::::::
CCDS85 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS85 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
::::.::.:::::.::::: .::::::::::::::.:.:::::::::::::::::: . :
CCDS85 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTTCALWDIETGQQKTVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
.::.:: :::...:: :.::::::: ::::::.. ::::: ::::::::. ::::: :
CCDS85 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
. ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.:::::::::.::.:
CCDS85 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
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CCDS85 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
310 320 330 340
>>CCDS73427.1 GNB3 gene_id:2784|Hs108|chr12 (339 aa)
initn: 1089 init1: 1006 opt: 1945 Z-score: 1760.5 bits: 334.1 E(32554): 9.7e-92
Smith-Waterman score: 1945; 80.6% identity (94.1% similar) in 340 aa overlap (1-340:1-339)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYA
:.:.::::::::::..:: ::::::.: ::.....::. :::.:::::::::::::::::
CCDS73 MGEMEQLRQEAEQLKKQIADARKACADVTLAELVSGLEVVGRVQMRTRRTLRGHLAKIYA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNI
:::.:::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS73 MHWATDSKLLVSASQDGKLIVWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNM
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CSIYSLKTREGNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGF
::::.::.:::::.::::: .::::::::::::::.:.::::::: :::::::::: . :
CCDS73 CSIYNLKSREGNVKVSRELSAHTGYLSCCRFLDDNNIVTSSGDTT-ALWDIETGQQKTVF
130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 AGHSGDVMSLSLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYA
.::.:: :::...:: :.::::::: ::::::.. ::::: ::::::::. ::::: :
CCDS73 VGHTGDCMSLAVSPDFNLFISGACDASAKLWDVREGTCRQTFTGHESDINAICFFPNGEA
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAM
. ::::::.::::::::::::. .::..::::::::::: :::::.:::::::::.::.:
CCDS73 ICTGSDDASCRLFDLRADQELICFSHESIICGITSVAFSLSGRLLFAGYDDFNCNVWDSM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340
pF1KB4 KGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
:..:.:.:.:::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS73 KSERVGILSGHDNRVSCLGVTADGMAVATGSWDSFLKIWN
300 310 320 330
>>CCDS72685.1 GNB1 gene_id:2782|Hs108|chr1 (240 aa)
initn: 1536 init1: 1536 opt: 1536 Z-score: 1396.1 bits: 266.2 E(32554): 1.9e-71
Smith-Waterman score: 1536; 89.6% identity (96.2% similar) in 240 aa overlap (101-340:1-240)
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 VSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFVACGGLDNICSIYSLKTRE
::::::::::.:::::::::::::.:::::
CCDS72 MTCAYAPSGNYVACGGLDNICSIYNLKTRE
10 20 30
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 GNVRVSRELPGHTGYLSCCRFLDDNQIITSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSL
::::::::: :::::::::::::::::.:::::::::::::::::::. :.::.::::::
CCDS72 GNVRVSRELAGHTGYLSCCRFLDDNQIVTSSGDTTCALWDIETGQQTTTFTGHTGDVMSL
40 50 60 70 80 90
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 SLAPDGRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATC
::::: : ::::::::: ::::::..:::::: ::::::::. ::::: ::.::::::::
CCDS72 SLAPDTRLFVSGACDASAKLWDVREGMCRQTFTGHESDINAICFFPNGNAFATGSDDATC
100 110 120 130 140 150
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 RLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAG
:::::::::::. :::::::::::::.::.:::::::::::::::.:::.:.::::::::
CCDS72 RLFDLRADQELMTYSHDNIICGITSVSFSKSGRLLLAGYDDFNCNVWDALKADRAGVLAG
160 170 180 190 200 210
320 330 340
pF1KB4 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 HDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
220 230 240
>>CCDS45261.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (353 aa)
initn: 1316 init1: 602 opt: 1250 Z-score: 1137.5 bits: 218.9 E(32554): 4.9e-57
Smith-Waterman score: 1250; 51.9% identity (78.3% similar) in 341 aa overlap (4-339:12-352)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MSELEQLRQEAEQLRNQIRDARKACGDSTLTQITAGLDPVGRIQMRTRRTLR
: .:..:::.:...... : : : :.. .. .:.. :.:::::.
CCDS45 MATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQVAERVEALGQFVMKTRRTLK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAIPLRSSWVMTCAYAPSGNFV
:: :. : : :.: .::.:::::.:.:::.:::: ::. . .:::.::::::: .
CCDS45 GHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAVTMPCTWVMACAYAPSGCAI
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB4 ACGGLDNICSIYSLK-TREGNVRVSRE-LPGHTGYLSCCRFLD-DNQIITSSGDTTCALW
::::::: ::.: : .. :. .... . ::.::: : : . : ::.:.::: :::::
CCDS45 ACGGLDNKCSVYPLTFDKNENMAAKKKSVAMHTNYLSACSFTNSDMQILTASGDGTCALW
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPD--GRTFVSGACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHES
:.:.:: .: ::..::. :.:::. : :::::.:: . .::.:...: :.: :::
CCDS45 DVESGQLLQSFHGHGADVLCLDLAPSETGNTFVSGGCDKKAMVWDMRSGQCVQAFETHES
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 DINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQELLMYSHDNIICGITSVAFSRSGRLLLA
:::.: ..:.: ::..:::::::::.:::::.:. .::...:: : .:: :: :::::.:
CCDS45 DINSVRYYPSGDAFASGSDDATCRLYDLRADREVAIYSKESIIFGASSVDFSLSGRLLFA
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCLGVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
::.:.. :.::..::.:...: ::.:::: : :. :: : .:::: :..:
CCDS45 GYNDYTINVWDVLKGSRVSILFGHENRVSTLRVSPDGTAFCSGSWDHTLRVWA
310 320 330 340 350
>>CCDS10149.1 GNB5 gene_id:10681|Hs108|chr15 (395 aa)
initn: 1316 init1: 602 opt: 1250 Z-score: 1136.8 bits: 219.0 E(32554): 5.3e-57
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10 20 30
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CCDS10 RPVFKKSQQLSYCSTCAEIMATEGLHENETLASLKSEAESLKGKLEEERAKLHDVELHQV
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40 50 60 70 80 90
pF1KB4 TAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVHAI
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CCDS10 AERVEALGQFVMKTRRTLKGHGNKVLCMDWCKDKRRIVSSSQDGKVIVWDSFTTNKEHAV
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100 110 120 130 140 150
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160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
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270 280 290 300 310 320
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330 340
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CCDS10 SGSWDHTLRVWA
390
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.. ... : . .. :.. :...:.. :. ...:: . : . .. ::
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CCDS59 GGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLR--QRR
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pF1KB4 LMYS---HDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCL
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CCDS59 CVYTIPAHQNLVTGVKFEPIH--GNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGL
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pF1KB4 GVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
...::. .:: :.: .:.:
CCDS59 DISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
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>>CCDS6791.1 PRPF4 gene_id:9128|Hs108|chr9 (522 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KB4 QITAGLDPVGRIQMRTRRTLRGHLAKIYAMHWGTDSRLLVSASQDGKLIIWDSYTTNKVH
:.. .:..:..: .: .:. : .:
CCDS67 TSQMQELHKSLRSLNNFCSQIGDDRPISYCHFSPNSKMLATACWSGLCKLWSVPDCNLLH
210 220 230 240 250 260
100 110 120 130 140
pF1KB4 AIPLRSSWVMTCAYAPSG---------NFVACGGLDNICSIYSLKTREGNVRVSRELPGH
.. ... : . .. :.. :...:.. :. ...:: . : . .. ::
CCDS67 TLRGHNTNVGAIVFHPKSTVSLDPKDVNLASCAA-DGSVKLWSLDSDEPVA----DIEGH
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150 160 170 180 190 200
pF1KB4 TGYLSCCRFLDDNQII-TSSGDTTCALWDIETGQQTVGFAGHSGDVMSLSLAPDGRTFVS
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CCDS67 TVRVARVMWHPSGRFLGTTCYDRSWRLWDLEAQEEILHQEGHSMGVYDIAFHQDGSLAGT
330 340 350 360 370 380
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 GACDASIKLWDVRDSMCRQTFIGHESDINAVAFFPNGYAFTTGSDDATCRLFDLRADQEL
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CCDS67 GGLDAFGRVWDLRTGRCIMFLEGHLKEIYGINFSPNGYHIATGSGDNTCKVWDLR--QRR
390 400 410 420 430 440
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pF1KB4 LMYS---HDNIICGITSVAFSRSGRLLLAGYDDFNCNIWDAMKGDRAGVLAGHDNRVSCL
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CCDS67 CVYTIPAHQNLVTGVKFEPIH--GNFLLTGAYDNTAKIWTHPGWSPLKTLAGHEGKVMGL
450 460 470 480 490
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pF1KB4 GVTDDGMAVATGSWDSFLKIWN
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CCDS67 DISSDGQLIATCSYDRTFKLWMAE
500 510 520
340 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]