Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4846
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4846, 480 aa
1>>>pF1KB4846 480 - 480 aa - 480 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.4687+/-0.000901; mu= -0.6367+/- 0.054
mean_var=218.6336+/-44.547, 0's: 0 Z-trim(113.6): 16 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.086739
statistics sampled from 14253 (14263) to 14253 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.757), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 2.790
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13639.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 480) 3253 419.7 3.5e-117
CCDS42922.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 453) 3020 390.5 2e-108
CCDS64443.1 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 485) 1913 252.0 1.1e-66
CCDS43468.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 499) 1913 252.0 1.1e-66
CCDS46646.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 ( 250) 1577 209.8 2.8e-54
CCDS43467.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 ( 521) 1232 166.8 5e-41
CCDS30633.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 ( 429) 1087 148.6 1.2e-35
CCDS257.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 ( 415) 1083 148.1 1.7e-35
>>CCDS13639.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (480 aa)
initn: 3253 init1: 3253 opt: 3253 Z-score: 2217.3 bits: 419.7 E(32554): 3.5e-117
Smith-Waterman score: 3253; 99.8% identity (99.8% similar) in 480 aa overlap (1-480:1-480)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPLGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::
CCDS13 MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 PDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PDAGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 TNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 HHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPAT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PISPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PISPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TSGIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TSGIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GERSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GERSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
430 440 450 460 470 480
>>CCDS42922.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (453 aa)
initn: 3020 init1: 3020 opt: 3020 Z-score: 2060.1 bits: 390.5 E(32554): 2e-108
Smith-Waterman score: 3020; 99.8% identity (99.8% similar) in 448 aa overlap (33-480:6-453)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPLGAPD
::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS42 MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPATPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPATPI
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPVTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPVTS
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMVGGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 GIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMVGGE
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
400 410 420 430 440 450
>>CCDS64443.1 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (485 aa)
initn: 1554 init1: 880 opt: 1913 Z-score: 1311.0 bits: 252.0 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 1963; 62.9% identity (80.3% similar) in 493 aa overlap (33-480:6-485)
10 20 30 40 50
pF1KB4 SDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPL----
: ::::::.:::..:.:::::..::.
CCDS64 MRIPVDPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVAAQ
10 20 30
60 70 80
pF1KB4 -------------------------------GAPDAGAALAGKLRS--GDRSMVEVLADH
.: :.:: . .:: .:.:::..:::
CCDS64 QQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIADH
40 50 60 70 80 90
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 PGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELR
:.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::::
CCDS64 PAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAELR
100 110 120 130 140 150
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 NATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRR
::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS64 NASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREPRR
160 170 180 190 200 210
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 HRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQPQ
::::::: .:: :: ::.:::.: .. . .:::. .: ::: ::: . . :::: :
CCDS64 HRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGRIPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQGQ
220 230 240 250 260
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 SQMQDTRQIQPSPPWSYDQSY-QYLGSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRLST
::. : :: : :::::::::: .::....:::.: .::.: :..:. ... .. :.:
CCDS64 SQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAIT-DVPRRISG
270 280 290 300 310 320
330 340 350 360 370
pF1KB4 APDLTAFSDPRQFPALPSI-----SDPRMHYPGAFTYSPTPVTSGIGIGMSAMGSATRYH
: .: ::::::::.. :. :.::::::..:::.: :::::...:::: .:.::
CCDS64 ASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTP-PVTSGMSLGMSA---TTHYH
330 340 350 360 370 380
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 TYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMV-GGERSPPRILPPCTNAST
::::::::::::.:.::::.:: : ::::.:.::::: :: ::.::: :.:::::..:.
CCDS64 TYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPY-LYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSN
390 400 410 420 430 440
440 450 460 470 480
pF1KB4 GSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
::.::::.::::.: :.:.::::.::: . :.:..:.:::::
CCDS64 GSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
450 460 470 480
>>CCDS43468.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (499 aa)
initn: 1554 init1: 880 opt: 1913 Z-score: 1310.8 bits: 252.0 E(32554): 1.1e-66
Smith-Waterman score: 1965; 60.4% identity (77.5% similar) in 525 aa overlap (1-480:1-499)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPL--
:::.:.: . : :. : ::::::.:::..:.:::::..::.
CCDS43 MASNSLFSTVTPCQQNFFW-------------DPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVA
10 20 30 40
60 70 80
pF1KB4 ---------------------------------GAPDAGAALAGKLRS--GDRSMVEVLA
.: :.:: . .:: .:.:::..:
CCDS43 AQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIA
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 DHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAE
:::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::
CCDS43 DHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAE
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 LRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREP
::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS43 LRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREP
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 RRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQ
::::::::: .:: :: ::.:::.: .. . .:::. .: ::: ::: . . ::::
CCDS43 RRHRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGRIPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQ
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSY-QYLGSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRL
:::. : :: : :::::::::: .::....:::.: .::.: :..:. ... .. :.
CCDS43 GQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAIT-DVPRRI
290 300 310 320 330
330 340 350 360 370
pF1KB4 STAPDLTAFSDPRQFPALPSI-----SDPRMHYPGAFTYSPTPVTSGIGIGMSAMGSATR
: : .: ::::::::.. :. :.::::::..:::.: :::::...:::: .:.
CCDS43 SGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFTYTP-PVTSGMSLGMSA---TTH
340 350 360 370 380 390
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 YHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSYQFSMV-GGERSPPRILPPCTNA
::::::::::::::.:.::::.:: : ::::.:.::::: :: ::.::: :.:::::..
CCDS43 YHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPY-LYYGTSSGSYQFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTT
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480
pF1KB4 STGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
:.::.::::.::::.: :.:.::::.::: . :.:..:.:::::
CCDS43 SNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMDESVWRPY
460 470 480 490
>>CCDS46646.1 RUNX1 gene_id:861|Hs108|chr21 (250 aa)
initn: 1568 init1: 1568 opt: 1577 Z-score: 1088.0 bits: 209.8 E(32554): 2.8e-54
Smith-Waterman score: 1577; 96.0% identity (97.2% similar) in 247 aa overlap (33-279:6-248)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 SDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPLGAPD
::::::::::::::::::::::: ::::::
CCDS46 MRIPVDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEALPLGAPD
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 AGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGAALAGKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALG
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 DVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTN
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 PAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSYQYLGSIASPSVHPATPI
::::::::::::::::::::::::::. . . ::
CCDS46 PAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQE----EDTAPWRC
220 230 240 250
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGAFTYSPTPVTS
>>CCDS43467.2 RUNX2 gene_id:860|Hs108|chr6 (521 aa)
initn: 1774 init1: 880 opt: 1232 Z-score: 850.0 bits: 166.8 E(32554): 5e-41
Smith-Waterman score: 1912; 58.0% identity (74.4% similar) in 547 aa overlap (1-480:1-521)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTALSPGKMSEASPL--
:::.:.: . : :. : ::::::.:::..:.:::::..::.
CCDS43 MASNSLFSTVTPCQQNFFW-------------DPSTSRRFSPPSSSLQPGKMSDVSPVVA
10 20 30 40
60 70 80
pF1KB4 ---------------------------------GAPDAGAALAGKLRS--GDRSMVEVLA
.: :.:: . .:: .:.:::..:
CCDS43 AQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQQEAAAAAAAAAAAAAAAAAVPRLRPPHDNRTMVEIIA
50 60 70 80 90 100
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 DHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAE
:::.::::::::::::::::.:::::::::.::::::::.:::::.::::::::::::::
CCDS43 DHPAELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPVAFKVVALGEVPDGTVVTVMAGNDENYSAE
110 120 130 140 150 160
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 LRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREP
::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS43 LRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLTITVFTNPPQVATYHRAIKVTVDGPREP
170 180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 RRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAMRVSPHHPAPTPNPRASLNHS-TAFNPQ
::::::::: .:: :: ::.:::.: .. . .:::. .: ::: ::: . . ::::
CCDS43 RRHRQKLDD-SKP-SL-FSDRLSDLGRIPHPSMRVG----VPPQNPRPSLNSAPSPFNPQ
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PQSQMQDTRQIQPSPPWSYDQSY-QYLGSIASPSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRL
:::. : :: : :::::::::: .::....:::.: .::.: :..:. ... .. :.
CCDS43 GQSQITDPRQAQSSPPWSYDQSYPSYLSQMTSPSIHSTTPLSSTRGTGLPAIT-DVPRRI
290 300 310 320 330
330 340 350
pF1KB4 ST----------------------APDLTAFSDPRQFPALPSI-----SDPRMHYPGAFT
: : .: ::::::::.. :. :.::::::..::
CCDS43 SDDDTATSDFCLWPSTLSKKSQAGASELGPFSDPRQFPSISSLTESRFSNPRMHYPATFT
340 350 360 370 380 390
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 YSPTPVTSGIGIGMSAMGSATRYHTYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGASAGSY
:.: :::::...:::: .:.::::::::::::::.:.::::.:: : ::::.:.:::
CCDS43 YTP-PVTSGMSLGMSA---TTHYHTYLPPPYPGSSQSQSGPFQTSSTPY-LYYGTSSGSY
400 410 420 430 440 450
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QFSMV-GGERSPPRILPPCTNASTGSALLNPSLPNQSDVVEAEGSHSNSPTNMAPSARLE
:: :: ::.::: :.:::::..:.::.::::.::::.: :.:.::::.::: . :.:..
CCDS43 QFPMVPGGDRSPSRMLPPCTTTSNGSTLLNPNLPNQNDGVDADGSHSSSPTVLNSSGRMD
460 470 480 490 500 510
480
pF1KB4 EAVWRPY
:.:::::
CCDS43 ESVWRPY
520
>>CCDS30633.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 (429 aa)
initn: 1685 init1: 927 opt: 1087 Z-score: 753.2 bits: 148.6 E(32554): 1.2e-35
Smith-Waterman score: 1663; 56.9% identity (72.1% similar) in 501 aa overlap (1-480:1-429)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MASDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTAL----SPGKMSEAS
:::.:::.:::.: :.: : :::::::::: :. . :::.: :
CCDS30 MASNSIFDSFPTYSPTFIR-------------DPSTSRRFTPPSPAFPCGGGGGKMGENS
10 20 30 40
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 PLGAPDAGAALA--GKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPI
:: .: ::.. :. : ::::.::::: :::::::::::::::::.:::::::::.
CCDS30 --GALSAQAAVGPGGRARPEVRSMVDVLADHAGELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPV
50 60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 AFKVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFT
::::::::::::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::
CCDS30 AFKVVALGDVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFT
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 LTITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRT
::::::::: ::::::::::.:::::::::::::::.::::: : .:...::.::
CCDS30 LTITVFTNPTQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLEDQTKP----FPDRFGDLERLR--
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AMRVSPHHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQP-SPPWSYDQSYQYLGSIAS
:::.: ::.::.::. .. :. :::. .: : ...: : : ..:.:.
CCDS30 -MRVTPS----TPSPRGSLSTTSHFSSQPQTPIQGTSELNPFSDPRQFDRSF--------
220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 PSVHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGA-
: : .... : :: :::::::::
CCDS30 -------------------------------PTLPTLTESR-FP------DPRMHYPGAM
270 280
360 370 380 390 400
pF1KB4 ---FTYSPTPVTSGIG-IGMSAMGSATRYH-TYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYY
: :: :: ..:. .....: ...:.: :::::::::. : :.:::::. :::::
CCDS30 SAAFPYSATPSGTSISSLSVAGMPATSRFHHTYLPPPYPGAPQNQSGPFQANPSPYHLYY
290 300 310 320 330 340
410 420 430 440 450
pF1KB4 GASAGSYQFSMV-----GGERSPPRILPPCTNASTGSA---LLNPSLPNQSDVVEAEGSH
:.:.:::::::: ::.::: :.: ::..... : :.:::: .::: :::.:::
CCDS30 GTSSGSYQFSMVAGSSSGGDRSPTRMLASCTSSAASVAAGNLMNPSLGGQSDGVEADGSH
350 360 370 380 390 400
460 470 480
pF1KB4 SNSPTNMAPSARLEEAVWRPY
::::: .. .:..:::::::
CCDS30 SNSPTALSTPGRMDEAVWRPY
410 420
>>CCDS257.1 RUNX3 gene_id:864|Hs108|chr1 (415 aa)
initn: 1611 init1: 927 opt: 1083 Z-score: 750.7 bits: 148.1 E(32554): 1.7e-35
Smith-Waterman score: 1613; 58.2% identity (73.6% similar) in 469 aa overlap (33-480:6-415)
10 20 30 40 50
pF1KB4 SDSIFESFPSYPQCFMRECILGMNPSRDVHDASTSRRFTPPSTAL----SPGKMSEASPL
: :::::::::: :. . :::.: :
CCDS25 MRIPVDPSTSRRFTPPSPAFPCGGGGGKMGENS--
10 20 30
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GAPDAGAALA--GKLRSGDRSMVEVLADHPGELVRTDSPNFLCSVLPTHWRCNKTLPIAF
:: .: ::.. :. : ::::.::::: :::::::::::::::::.:::::::::.::
CCDS25 GALSAQAAVGPGGRARPEVRSMVDVLADHAGELVRTDSPNFLCSVLPSHWRCNKTLPVAF
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 KVVALGDVPDGTLVTVMAGNDENYSAELRNATAAMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLT
::::::::::::.::::::::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::
CCDS25 KVVALGDVPDGTVVTVMAGNDENYSAELRNASAVMKNQVARFNDLRFVGRSGRGKSFTLT
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ITVFTNPPQVATYHRAIKITVDGPREPRRHRQKLDDQTKPGSLSFSERLSELEQLRRTAM
::::::: ::::::::::.:::::::::::::::.::::: : .:...::.:: :
CCDS25 ITVFTNPTQVATYHRAIKVTVDGPREPRRHRQKLEDQTKP----FPDRFGDLERLR---M
160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RVSPHHPAPTPNPRASLNHSTAFNPQPQSQMQDTRQIQP-SPPWSYDQSYQYLGSIASPS
::.: ::.::.::. .. :. :::. .: : ...: : : ..:.:.
CCDS25 RVTPS----TPSPRGSLSTTSHFSSQPQTPIQGTSELNPFSDPRQFDRSF----------
210 220 230 240 250
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 VHPATPISPGRASGMTTLSAELSSRLSTAPDLTAFSDPRQFPALPSISDPRMHYPGA---
: : .... : :: :::::::::
CCDS25 -----------------------------PTLPTLTESR-FP------DPRMHYPGAMSA
260 270
360 370 380 390 400
pF1KB4 -FTYSPTPVTSGIG-IGMSAMGSATRYH-TYLPPPYPGSSQAQGGPFQASSPSYHLYYGA
: :: :: ..:. .....: ...:.: :::::::::. : :.:::::. ::::::.
CCDS25 AFPYSATPSGTSISSLSVAGMPATSRFHHTYLPPPYPGAPQNQSGPFQANPSPYHLYYGT
280 290 300 310 320 330
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 SAGSYQFSMV-----GGERSPPRILPPCTNASTGSA---LLNPSLPNQSDVVEAEGSHSN
:.:::::::: ::.::: :.: ::..... : :.:::: .::: :::.:::::
CCDS25 SSGSYQFSMVAGSSSGGDRSPTRMLASCTSSAASVAAGNLMNPSLGGQSDGVEADGSHSN
340 350 360 370 380 390
470 480
pF1KB4 SPTNMAPSARLEEAVWRPY
::: .. .:..:::::::
CCDS25 SPTALSTPGRMDEAVWRPY
400 410
480 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:46:47 2016 done: Thu Nov 3 21:46:47 2016
Total Scan time: 2.790 Total Display time: 0.060
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]