FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4774, 730 aa
1>>>pF1KB4774 730 - 730 aa - 730 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5917+/-0.000888; mu= 13.5957+/- 0.053
mean_var=109.4427+/-22.003, 0's: 0 Z-trim(109.0): 149 B-trim: 8 in 1/50
Lambda= 0.122597
statistics sampled from 10417 (10600) to 10417 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.679), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 ( 730) 5150 922.3 0
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CCDS3811.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 (1013) 3603 648.7 1.2e-185
CCDS56342.1 TLL1 gene_id:7092|Hs108|chr4 ( 392) 1523 280.6 3.2e-75
CCDS8421.1 MFRP gene_id:83552|Hs108|chr11 ( 579) 542 107.2 7.5e-23
CCDS7113.1 CUBN gene_id:8029|Hs108|chr10 (3623) 507 101.5 2.4e-20
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CCDS45846.1 MEP1B gene_id:4225|Hs108|chr18 ( 701) 434 88.1 4.9e-17
CCDS31735.1 C1S gene_id:716|Hs108|chr12 ( 688) 400 82.1 3.1e-15
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CCDS31179.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 609) 358 74.7 4.9e-13
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CCDS81448.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 906) 358 74.8 6.7e-13
CCDS7177.1 NRP1 gene_id:8829|Hs108|chr10 ( 923) 358 74.8 6.8e-13
CCDS46499.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 555) 348 72.9 1.5e-12
CCDS46498.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 901) 348 73.0 2.3e-12
CCDS2365.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 906) 348 73.0 2.3e-12
CCDS46497.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 909) 348 73.0 2.3e-12
CCDS46496.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 926) 348 73.0 2.3e-12
CCDS2364.1 NRP2 gene_id:8828|Hs108|chr2 ( 931) 348 73.0 2.3e-12
CCDS2193.1 TNFAIP6 gene_id:7130|Hs108|chr2 ( 277) 329 69.3 9e-12
CCDS3127.1 PCOLCE2 gene_id:26577|Hs108|chr3 ( 415) 318 67.5 4.8e-11
CCDS81658.1 C1R gene_id:715|Hs108|chr12 ( 705) 320 68.0 5.8e-11
>>CCDS34856.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (730 aa)
initn: 5150 init1: 5150 opt: 5150 Z-score: 4927.0 bits: 922.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5150; 99.9% identity (100.0% similar) in 730 aa overlap (1-730:1-730)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
10 20 30 40 50 60
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:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
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490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISLQFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
670 680 690 700 710 720
730
pF1KB4 RVQKRNRTPQ
::::::::::
CCDS34 RVQKRNRTPQ
730
>>CCDS6026.1 BMP1 gene_id:649|Hs108|chr8 (986 aa)
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Smith-Waterman score: 4956; 99.7% identity (100.0% similar) in 704 aa overlap (1-704:1-704)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 MPGVARLPLLLGLLLLPRPGRPLDLADYTYDLAEEDDSEPLNYKDPCKAAAFLGDIALDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EDLRALQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EDLRAFQVQQAVDLRRHTARKSSIKAAVPGNTSTPSCQSTNGQPQRGACGRWRGRSRSRR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVFRQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTY
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 RPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIVVHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVREN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 IQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMHYARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 QRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKI
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pF1KB4 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 ILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSS
370 380 390 400 410 420
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pF1KB4 NWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNYPDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSF
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pF1KB4 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 EIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGF
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pF1KB4 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS60 AVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNG
550 560 570 580 590 600
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS60 LHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTVSKKGFKAHFFSDKDECSKDNGGCQQDCVN
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730
pF1KB4 RVQKRNRTPQ
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>--
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290 300 310 320 330 340
pF1KB4 PKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTGNFSSPEYPNGYSAHMH
: .: . . ...:...::..:. : .. .
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pF1KB4 CVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAPLRGRFCGSKLPEPIVS
:.: :: :::... :.: .:. . : ::..:: :: :::. ::::::: :::...
CCDS60 CTWAISSTPGHRVKLTFMEMDIESQPECAYDHLEVFDGRDAKAPVLGRFCGSKKPEPVLA
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pF1KB4 TDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKD------YGHIQSPNYPDDYRPSKV-
: ::....: :... ::: : . . :::.:. : :.: : . :. :. :
CCDS60 TGSRMFLRFYSDNSVQRKGFQASHATECGGQVRADVKTKDLYSHAQ---FGDNNYPGGVD
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pF1KB4 CIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCGYEKPDDIKS
: : : . ::. : :.::.::.:.. .:.:::.:. ::.. .. .::::: :... :
CCDS60 CEWVIVAEEGYGVELVFQTFEVEEETDCGYDYMELFDGYDSTAPRLGRYCGSGPPEEVYS
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pF1KB4 TSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYKCSCDPGYEL
... . .:: :: .:.: :: . .
CCDS60 AGDSVLVKFHSDDTITKKGFHLRYTSTKFQDTLHSRK
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>>CCDS7449.1 TLL2 gene_id:7093|Hs108|chr10 (1015 aa)
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10 20 30 40 50
pF1KB4 MPGVARLPLLLGLLLL-PRP-G------RPLDLADYTYDLAEEDDSEPL-NYKDPCKAAA
:: .. : :..:::: : : : :: :::. .:: . : .:.::::::.
CCDS74 MPRATALGALVSLLLLLPLPRGAGGLGERPDATADYSELDGEEGTEQQLEHYHDPCKAAV
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 FLGDIALDEEDLRALQVQQAVDLRRHTAR---KSSIKAAVPGNTSTPSCQSTN-GQPQRG
: :::::::.::. .....: : ..:. .:. .. :.:. . . : . :
CCDS74 FWGDIALDEDDLKLFHIDKARDWTKQTVGATGHSTGGLEEQASESSPDTTAMDTGTKEAG
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150
pF1KB4 ACGRWRGR----------------SRSRRAATSRPERVWPDGVIPFVIGGNFTGSQRAVF
:: : :::.::: ::.:: ::::.::::::::::::.:
CCDS74 KDGRENTTLLHSPGTLHAAAKTFSPRVRRATTSRTERIWPGGVIPYVIGGNFTGSQRAIF
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 RQAMRHWEKHTCVTFLERTDEDSYIVFTYRPCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
.::::::::::::::.:::::.:.:::.:: :::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 KQAMRHWEKHTCVTFIERTDEESFIVFSYRTCGCCSYVGRRGGGPQAISIGKNCDKFGIV
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 VHELGHVVGFWHEHTRPDRDRHVSIVRENIQPGQEYNFLKMEPQEVESLGETYDFDSIMH
.:::::::::::::::::::.::.:.:::::::::::::::: :: :::::::::::::
CCDS74 AHELGHVVGFWHEHTRPDRDQHVTIIRENIQPGQEYNFLKMEAGEVSSLGETYDFDSIMH
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 YARNTFSRGIFLDTIVPKYEVNGVKPPIGQRTRLSKGDIAQARKLYKCPACGETLQDSTG
:::::::::.:::::.:. . :::.: ::::.:::.:::::::::::::::::::::.::
CCDS74 YARNTFSRGVFLDTILPRQDDNGVRPTIGQRVRLSQGDIAQARKLYKCPACGETLQDTTG
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 NFSSPEYPNGYSAHMHCVWRISVTPGEKIILNFTSLDLYRSRLCWYDYVEVRDGFWRKAP
:::.: .:::: .. ::::::::::::::.:::::.::..::::::::::::::.:::::
CCDS74 NFSAPGFPNGYPSYSHCVWRISVTPGEKIVLNFTSMDLFKSRLCWYDYVEVRDGYWRKAP
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 LRGRFCGSKLPEPIVSTDSRLWVEFRSSSNWVGKGFFAVYEAICGGDVKKDYGHIQSPNY
: :::::.:.:::.:::::::::::::::: .::::::.::: ::::..:: :.::::::
CCDS74 LLGRFCGDKIPEPLVSTDSRLWVEFRSSSNILGKGFFAAYEATCGGDMNKDAGQIQSPNY
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 PDDYRPSKVCIWRIQVSEGFHVGLTFQSFEIERHDSCAYDYLEVRDGHSESSTLIGRYCG
:::::::: :.::: ::::::::::::.::::::::::::::::::: .: :.:::..::
CCDS74 PDDYRPSKECVWRITVSEGFHVGLTFQAFEIERHDSCAYDYLEVRDGPTEESALIGHFCG
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 YEKPDDIKSTSSRLWLKFVSDGSINKAGFAVNFFKEVDECSRPNRGGCEQRCLNTLGSYK
::::.:.::.:.:::.::::::::::::::.:::::::::: :..::::.::.:::::::
CCDS74 YEKPEDVKSSSNRLWMKFVSDGSINKAGFAANFFKEVDECSWPDHGGCEHRCVNTLGSYK
550 560 570 580 590 600
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 CSCDPGYELAPDKRRCEAACGGFLTKLNGSITSPGWPKEYPPNKNCIWQLVAPTQYRISL
:.:::::::: ::. ::.:::::.:::::.::::::::::: ::::.::.:::.::::::
CCDS74 CACDPGYELAADKKMCEVACGGFITKLNGTITSPGWPKEYPTNKNCVWQVVAPAQYRISL
610 620 630 640 650 660
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 QFDFFETEGNDVCKYDFVEVRSGLTADSKLHGKFCGSEKPEVITSQYNNMRVEFKSDNTV
::. :: :::::::::::::::::. :.::::.::::: ::::::: :::::::::::::
CCDS74 QFEVFELEGNDVCKYDFVEVRSGLSPDAKLHGRFCGSETPEVITSQSNNMRVEFKSDNTV
670 680 690 700 710 720
700 710 720 730
pF1KB4 SKKGFKAHFFSEKRPALQPPRGRPHQLKFRVQKRNRTPQ
::.::.:::::.: . : :.
CCDS74 SKRGFRAHFFSDKDECAKDNGGCQHECVNTFGSYLCRCRNGYWLHENGHDCKEAGCAHKI
730 740 750 760 770 780
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CCDS71 IHSPNYPSPYRSNTDCSWVIRVDRNHRVLLNFTDFDLEPQ--DSCIMAYDGLSSTMSRLA
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CCDS71 RTCGREQLANPIVSSGNSLFLRFQSGP-SRQNRGFRAQFRQ-----ACGGHILTSSFDTV
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CCDS71 VHGRILEMDIEEIQNCYYDKLRIYDGPSIHARLIGAYCGTQT-ESFSSTGNSLTFHFYSD
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CCDS71 SSISGKGFLLEWFAVDAPDGVLPTIAPGACGGFLRTGDAPVFLFSPGWPDSYSNRVDCTW
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CCDS71 GNSLMLVFVTDSDLAYEGFLINYEAISAATACLQDYTDDLGTFTSPNFPNNYPNNWECIY
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CCDS71 RITVRTGQLIAVHFTNFSLEEAIGNYYTDFLEIRDGGYEKSPLLGIFYGSNLPPTIISHS
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CCDS71 NKLWLKFKSDQIDTRSGFSAYWDGSSTGCGGNLTTSSGTFISPNYPMPYYHSSECYWWLK
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CCDS71 SSHGSAFELEFKDFHLEHHPNCTLDYLAVYDGPSSNSHLLTQLCGDEKPPLIRSSGDSMF
1200 1210 1220 1230 1240 1250
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CCDS71 IKLRTDEGQQGRGFKAEYRQTCENVVIVNQTYGILESIGYPNPYSENQHCNWTIRATTGN
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CCDS71 TVNYTFLAFDLEHHINCSTDYLELYDGPRQMGRYCGVDLPPPGSTTSSKLQVLLLTDGVG
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