Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4740
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4740, 870 aa
1>>>pF1KB4740 870 - 870 aa - 870 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5693+/-0.00121; mu= -3.2063+/- 0.072
mean_var=273.1433+/-55.458, 0's: 0 Z-trim(110.1): 66 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.077603
statistics sampled from 11297 (11359) to 11297 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.349), width: 16
Scan time: 3.890
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 870) 5965 682.1 1.2e-195
CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 754) 5232 600.0 5.3e-171
CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 ( 922) 3345 388.7 2.5e-107
CCDS13234.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 862) 3296 383.2 1e-105
CCDS58769.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 752) 3143 366.1 1.3e-100
CCDS58768.1 ITCH gene_id:83737|Hs108|chr20 ( 903) 3101 361.4 4.1e-99
CCDS58477.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 431) 2989 348.7 1.3e-95
CCDS58475.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 ( 335) 2216 262.1 1.2e-69
CCDS45265.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 ( 900) 1501 182.3 3.4e-45
CCDS10156.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1247) 1501 182.4 4.4e-45
CCDS61643.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1303) 1501 182.4 4.6e-45
CCDS61644.1 NEDD4 gene_id:4734|Hs108|chr15 (1319) 1501 182.4 4.7e-45
CCDS58632.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 911) 1481 180.1 1.6e-44
CCDS45876.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 834) 1477 179.6 2.1e-44
CCDS45875.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 854) 1477 179.6 2.1e-44
CCDS59323.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 947) 1477 179.6 2.3e-44
CCDS45873.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 955) 1477 179.6 2.3e-44
CCDS45874.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 967) 1477 179.6 2.3e-44
CCDS45872.1 NEDD4L gene_id:23327|Hs108|chr18 ( 975) 1477 179.6 2.3e-44
CCDS32707.1 SMURF2 gene_id:64750|Hs108|chr17 ( 748) 1384 169.1 2.6e-41
CCDS34689.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 731) 1378 168.5 4e-41
CCDS34690.1 SMURF1 gene_id:57154|Hs108|chr7 ( 757) 1375 168.1 5.2e-41
CCDS77499.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1216) 1227 151.7 7.5e-36
CCDS33354.1 HECW2 gene_id:57520|Hs108|chr2 (1572) 1227 151.8 9.2e-36
CCDS69286.1 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1572) 1214 150.3 2.5e-35
CCDS5469.2 HECW1 gene_id:23072|Hs108|chr7 (1606) 1214 150.3 2.6e-35
CCDS35301.1 HUWE1 gene_id:10075|Hs108|chrX (4374) 1067 134.1 5.3e-30
CCDS5050.1 HACE1 gene_id:57531|Hs108|chr6 ( 909) 939 119.4 3e-26
CCDS32177.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 852) 732 96.2 2.7e-19
CCDS45191.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 872) 732 96.2 2.7e-19
CCDS45192.1 UBE3A gene_id:7337|Hs108|chr15 ( 875) 732 96.2 2.8e-19
CCDS41971.1 AREL1 gene_id:9870|Hs108|chr14 ( 823) 685 90.9 1e-17
CCDS34789.1 UBE3C gene_id:9690|Hs108|chr7 (1083) 642 86.2 3.5e-16
CCDS7274.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1049) 623 84.0 1.5e-15
CCDS41533.1 HERC4 gene_id:26091|Hs108|chr10 (1057) 623 84.0 1.5e-15
CCDS34028.1 HERC3 gene_id:8916|Hs108|chr4 (1050) 607 82.2 5.2e-15
CCDS9129.1 UBE3B gene_id:89910|Hs108|chr12 (1068) 494 69.6 3.4e-11
CCDS7414.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 776) 489 68.9 3.9e-11
CCDS60591.1 HECTD2 gene_id:143279|Hs108|chr10 ( 780) 489 69.0 3.9e-11
>>CCDS10885.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 (870 aa)
initn: 5965 init1: 5965 opt: 5965 Z-score: 3626.1 bits: 682.1 E(32554): 1.2e-195
Smith-Waterman score: 5965; 100.0% identity (100.0% similar) in 870 aa overlap (1-870:1-870)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSYVEVAVDGLPSETKKTGKRI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSYVEVAVDGLPSETKKTGKRI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 GSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLT
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPENRHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPENRHQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQPVKNSGHSGLANGTVNDEPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQPVKNSGHSGLANGTVNDEPT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPATPAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPATPAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 ALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGRV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 YYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 SGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 RRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 HLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 HLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKE
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 NNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 NNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 TKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFW
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 QVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFN
790 800 810 820 830 840
850 860 870
pF1KB4 RLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
850 860 870
>>CCDS58476.1 WWP2 gene_id:11060|Hs108|chr16 (754 aa)
initn: 5232 init1: 5232 opt: 5232 Z-score: 3183.5 bits: 600.0 E(32554): 5.3e-171
Smith-Waterman score: 5232; 100.0% identity (100.0% similar) in 754 aa overlap (117-870:1-754)
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 SCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTV
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MQLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTV
10 20 30
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 DLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPA
40 50 60 70 80 90
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 TGEQSPGARSRHRQPVKNSGHSGLANGTVNDEPTTATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGEQSPGARSRHRQPVKNSGHSGLANGTVNDEPTTATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPN
100 110 120 130 140 150
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 PNTTSLPAPATPAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PNTTSLPAPATPAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTT
160 170 180 190 200 210
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 TWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TWERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHF
220 230 240 250 260 270
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 SQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDNGRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPAL
280 290 300 310 320 330
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 PPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLC
340 350 360 370 380 390
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 HSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 HSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFL
400 410 420 430 440 450
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 LSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGF
460 470 480 490 500 510
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 TLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHE
520 530 540 550 560 570
690 700 710 720 730 740
pF1KB4 LKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELE
580 590 600 610 620 630
750 760 770 780 790 800
pF1KB4 LMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 LMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPV
640 650 660 670 680 690
810 820 830 840 850 860
pF1KB4 GGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEG
700 710 720 730 740 750
870
pF1KB4 FGQE
::::
CCDS58 FGQE
>>CCDS6242.1 WWP1 gene_id:11059|Hs108|chr8 (922 aa)
initn: 2834 init1: 2651 opt: 3345 Z-score: 2040.4 bits: 388.7 E(32554): 2.5e-107
Smith-Waterman score: 3576; 60.7% identity (79.1% similar) in 904 aa overlap (24-870:24-922)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSYVEVAVDGLPSETKKTGKRI
: ::: : .. :.::.::: : ::.:
CCDS62 MATASPRSDTSNNHSGRLQLQVTVSSAKLKRKKNWFGTAIYTEVVVDG---EITKTAKSS
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB4 GSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNE-LLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQL
.::. :.: . .::: :. :...::: .::. . ::: :...:...: .. :.: ..
CCDS62 SSSNPKWDEQLTVNVTPQTTLEFQVWSHRTLKADALLGKATIDLKQALLIHNRKLERVKE
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB4 TLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNV------P------NGSALTDGSQLPSRD
:.:. :::..... ::::. ::: ... :. : ::.:: .... .:
CCDS62 QLKLSLENKNGIAQTGELTVVLDGLVIEQENITNCSSSPTIEIQENGDALHENGEPSART
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 SSGTAVAPEN---RHQPPST---NCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQP
.. :: : : : :: : . . .. .: . : ...:. . .:
CCDS62 TARLAVEGTNGIDNHVPTSTLVQNSCCSYVVNGDNTPSSPSQVAARPKNTPAPKPLASEP
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270
pF1KB4 VKNS--GHSG----LANGTVNDEPTT----ATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTS
. .. :.:. :..:. :.. : .:. :.. : .::. . .: . :.
CCDS62 ADDTVNGESSSFAPTDNASVTGTPVVSEENALSPNCTSTT-VEDPPVQEI-LTSSENNEC
240 250 260 270 280 290
280 290 300
pF1KB4 LPAPATPAEGE-----EPSTSGTQQLPA--AAQA--PDA----------------LPAGW
.:. .. :.: ::.::.... : ::.. ::. ::.::
CCDS62 IPSTSAELESEARSILEPDTSNSRSSSAFEAAKSRQPDGCMDPVRQQSGNANTETLPSGW
300 310 320 330 340 350
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERP--LPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAE
:::. :.::.:::::::.::::::: ::::::.:.: : : :::::::::::::::: :
CCDS62 EQRKDPHGRTYYVDHNTRTTTWERPQPLPPGWERRVDDRRRVYYVDHNTRTTTWQRPTME
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSSSASTDHDPLGPLPPGWEKRQDN-GRVYYV
:::.:::::::::::::::.:.::.::..: ....:: :::::::::: :. :::.:
CCDS62 SVRNFEQWQSQRNQLQGAMQQFNQRYLYSASMLAAENDPYGPLPPGWEKRVDSTDRVYFV
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 NHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRTTTFKDPRPGFESGT
::::.:::::::::::. .: :: :::..:: :::::::::::::::::::: : : :
CCDS62 NHNTKTTQWEDPRTQGLQNEEPLPEGWEIRYTREGVRYFVDHNTRTTTFKDPRNGKSSVT
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 KQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYDLRRR
: : ::.:.:::: .::.::.::::::::::.::::::::::::::: .::::::::
CCDS62 KGGPQIAYERGFRWKLAHFRYLCQSNALPSHVKINVSRQTLFEDSFQQIMALKPYDLRRR
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSINPDHLT
::.:.::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::.
CCDS62 LYVIFRGEEGLDYGGLAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASTINPDHLS
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610 620 630 640 650 660
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:: ::::::::::.:::::::::.::::::::.:. :.::::::: :::::..::..::.
CCDS62 YFCFIGRFIAMALFHGKFIDTGFSLPFYKRMLSKKLTIKDLESIDTEFYNSLIWIRDNNI
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670 680 690 700 710 720
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::::::.:: :::::::::.:.:: :: .: ::::::.::: :.:.:::.:::.:::::
CCDS62 EECGLEMYFSVDMEILGKVTSHDLKLGGSNILVTEENKDEYIGLMTEWRFSRGVQEQTKA
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730 740 750 760 770 780
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::::::::.::.::.::::::::.:::::::.:..:::..:.:::::.::::: :::: :
CCDS62 FLDGFNEVVPLQWLQYFDEKELEVMLCGMQEVDLADWQRNTVYRHYTRNSKQIIWFWQFV
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790 800 810 820 830 840
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:: ::: :.:::::::::::::.::::::.::::::::::.::::.::::::::::::::
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850 860 870
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CCDS62 LPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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... :.. . . :: :.: ..::: .::... :::::.... ..::.:. :.:..
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.::.: . : . . :.:.: ::: .. : :: : :. :....:. :.:
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. ... .: ....: :: .. . : . : :: .: . . ..::
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:::::...: ::::::..:. :::::::::.:::::::::::::::::::::::::.:::
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::::::..:.::::.::: ::.:: : ::::.. .:.:: .: .: :::::::::: ..
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CCDS13 ENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEKLLFAIEETEGFGQE
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CCDS58 GLDYGGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFI
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CCDS58 SVDKEILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEIL
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pF1KB4 PLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRI
: ..:.::: ::::..::::::::..:::. .:::::...::::.:::: :::.:::::.
CCDS58 PQQYLQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYARTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRM
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CCDS58 RLLQFVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQ
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pF1KB4 LREKLLYAIEETEGFGQE
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CCDS58 LKEKLLFAIEETEGFGQE
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10 20 30 40 50
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pF1KB4 RIGSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNE-LLGTASVNLSNVLKNNGGKMENM
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CCDS58 CNNTNSPKWKQPLTVIVTPVSKLHFRVWSHQTLKSDVLLGTAALDIYETLKSNNMKLEEV
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 QLTLNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNVPNGSALT--DGSQL--PSRDSSGTAV
.::.: . : . . :.:.: ::: .. : :: . .: .: : . ...
CCDS58 VVTLQLGGD-KEPTETIGDLSICLDGLQLESEVVTNGETTCSENGVSLCLPRLECNSAIS
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pF1KB4 APENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGAS-----ARTTPAT-----GEQSP---GARSRHRQ
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CCDS58 AHCNLCLPGLSDSPISASRVAGFTGASQNDDGSRSKDETRVSTNGSDDPEDAGAGENRR-
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 PVKNSGHSGLANGTVN-DEPTTATDPEEPSV---VGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPA
:.... .:.:: . ..: . : :. ..:.. :.: : . . .: :::
CCDS58 -VSGNNSPSLSNGGFKPSRPPRPSRPPPPTPRRPASVNGSPSAT-SESDGSSTGSLPPTN
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pF1KB4 TPAEGEEPSTSGT------------QQLPAAAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTK
: .. : .::: . : ..::: :: ::::: .:::::::: :
CCDS58 TNTNTSEGATSGLIIPLTISGGSGPRPLNPVTQAP--LPPGWEQRVDQHGRVYYVDHVEK
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CCDS58 AKVQYFRFWCQQLAMPQHIKITVTRKTLFEDSFQQIMSFSPQDLRRRLWVIFPGEEGLDY
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CCDS58 GGVAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKDNYCLQINPASYINPDHLKYFRFIGRFIAMAL
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pF1KB4 YHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDM
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CCDS58 FHGKFIDTGFSLPFYKRILNKPVGLKDLESIDPEFYNSLIWVKENNIEECDLEMYFSVDK
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pF1KB4 EILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEW
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CCDS58 EILGEIKSHDLKPNGGNILVTEENKEEYIRMVAEWRLSRGVEEQTQAFFEGFNEILPQQY
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pF1KB4 LRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHYTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQ
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CCDS58 LQYFDAKELEVLLCGMQEIDLNDWQRHAIYRHYARTSKQIMWFWQFVKEIDNEKRMRLLQ
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pF1KB4 FVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREK
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CCDS58 FVTGTCRLPVGGFADLMGSNGPQKFCIEKVGKENWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLKEK
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pF1KB4 LLYAIEETEGFGQE
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CCDS58 LLFAIEETEGFGQE
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pF1KB4 GWEKRQDNGRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQGMIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRT
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CCDS58 MIQEPALPPGWEMKYTSEGVRYFVDHNTRT
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pF1KB4 TTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TTFKDPRPGFESGTKQGSPGAYDRSFRWKYHQFRFLCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSF
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pF1KB4 QQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 QQIMNMKPYDLRRRLYIIMRGEEGLDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCL
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CCDS58 QINPASSINPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EFYNSIVWIKENNLEECGLELYFIQDMEILGKVTTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 DWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRHY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKRIRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKE
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CCDS58 TWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYEQLREKLLYAIEETEGFGQE
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CCDS58 MASASSSRAGVALPFEKSQLTLKVVSAKPKVHNRQPRINSYVEVAVDGLPSETKKTGKRI
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CCDS58 GSSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNVLKNNGGKMENMQLT
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CCDS58 LNLQTENKGSVVSGGELTIFLDGPTVDLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGTAVAPENRHQ
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CCDS58 PPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGEQSPGARSRHRQPVKNSGHSGLANGTVNDEPT
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CCDS58 TATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSLPAPATPAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPD
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 ALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPG
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CCDS45 PKWNEEILFRVHPQQHRLLFEVFDENRLTRDDFLGQVDVPLYP-LPTENPRLERPYTFKD
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..: .. ...:: ...: . :. : : . :... . .
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: :: : . . .: . :.. .: . . : .:. :. : . .
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pF1KB4 RQ------PVKNSGHSGLANGTVNDEPTTATDPEEPSVVGVTSPPAAPLSVTPNPNTTSL
:: : : : . .:: : .. :: ::.. :.: :. . :
CCDS45 RQISEETESVDNRESSENWEIIREDEATMYSNQAFPS-----PPPSSNLDV-PTHLAEEL
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280 290 300 310 320
pF1KB4 PAPAT----PAEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTW
: : : .. :.:. .. .. :: :: :: : :..
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pF1KB4 ERPLPPGWEKRTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQ
::::::.. : ::: ::::::.::::: .::.. . . : :.... : ... :
CCDS45 ---LPPGWEEKQDERGRSYYVDHNSRTTTWTKPTVQATVETSQLTSSQSS-AGPQSQAST
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:. . .. . : :: ::: :. ::: ....:::.:: ::::: . :
CCDS45 SDSGQQVTQPSEIEQ-GFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKT
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450 460 470 480 490
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. . :::::: . ..: ....:: . : ..::: .:. . : :.:..
CCDS45 SLDTSNDLGPLPPGWEERTHTDGRIFYINHNIKRTQWEDPR--LENVAITGPAVPYSRDY
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pF1KB4 RWKYHQFRF-LCHSNALPSHVKISVSRQTLFEDSFQQIMNMKPYD-LRRRLYIIMRGEEG
. ::. :: : ..: .:.. .... : :..:::...::..: : :. ::.: . ::.:
CCDS45 KRKYEFFRRKLKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKG
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pF1KB4 LDYGGIAREWFFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSI-NPDHLTYFRFIGRFI
:::::.:::::::.:.:..::.: ::::.. .:: ::::: :.. : :::.::.::::
CCDS45 LDYGGVAREWFFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVA
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pF1KB4 AMALYHGKFIDTGFTLPFYKRMLNKRPTLKDLESIDPEFYNSIVWIKENNLEECGLELYF
.::.::::..: : :::: ::.: ::.:.::.: :.:::. :: ::. : :.: :
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: : :..:.. ::::.:: : ::..::.:::.:. .:::. ...: :: .:: :.
CCDS45 IIDEELFGQTHQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELI
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740 750 760 770 780 790
pF1KB4 PLEWLRYFDEKELELMLCGMQEIDMSDWQKSTIYRH-YTKNSKQIQWFWQVVKEMDNEKR
: . .. :::.::::..::. ..:..::.. : :.. :. : . :::::..: ::.:::
CCDS45 PQDLIKIFDENELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKR
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pF1KB4 IRLLQFVTGTCRLPVGGFAELIGSNGPQKFCIDKVGKETWLPRSHTCFNRLDLPPYKSYE
:::::::::: :.:..::::: ::::::.: ... : :::.::::::::::::.:.:
CCDS45 IRLLQFVTGTSRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFE
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pF1KB4 QLREKLLYAIEETEGFGQE
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CCDS45 ELWDKLQMAIENTQGFDGVD
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pF1KB4 SSELLWNEIIILNVTAQSHLDLKVWSCHTLRNELLGTASVNLSNV--LKNNGGKMENMQL
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pF1KB4 TLNLQTENKGSVV-----SGGELTIFLDG---PTVDLGNVPNGSALTDGSQLPSRDSSGT
... . :.:.: :. . : :.. : . . :... . .: :: :
CCDS10 LIKFASGNEGKVDNLSRDSNRDCTNELSNSCKPGWVVLDQPDAACHLQQQQEPSPLPPGW
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pF1KB4 AVAPENRHQPPSTNCFGGRSRTHRHSGASARTTPATGE---QSPGARSRHRQ------PV
. . .: . :.. .: . . : .:. :. : . .:: :
CCDS10 EERQDILGRTYYVNHESRRTQWKRPTPQDNLTDAENGNIQLQAQRAFTTRRQISEETESV
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: : . .:: : .. :: ::.. :.: :. . : : :
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pF1KB4 AEGEEPSTSGTQQLPAAAQAPDALPAGWEQRELPNGRVYYVDHNTKTTTWERPLPPGWEK
: .. :.:. .. .. :: . :: :: : :.. ::::::.
CCDS10 AVSQPASSSNHSSRRGSLQAY----TFEEQPTLP------VLLPTSSG-----LPPGWEE
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pF1KB4 RTDPRGRFYYVDHNTRTTTWQRPTAEYVRNYEQWQSQRNQLQGAMQHFSQRFLYQSSSAS
. : ::: ::::::.::::: .::.. . . : :.... : ... : :. .
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pF1KB4 TDHDPLGPLPPGWEKRQ-DNGRVYYVNHNTRTTQWEDPRTQ------GMIQEPA------
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CCDS10 SEIEQ-GFLPKGWEVRHAPNGRPFFIDHNTKTTTWEDPRLKIPAHLRGKTSLDTSNDLGP
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CCDS10 LKKQNDIPNKFEMKLRRATVLEDSYRRIMGVKRADFLKARLWIEFDGEKGLDYGGVAREW
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pF1KB4 FFLLSHEVLNPMYCLFEYAGKNNYCLQINPASSI-NPDHLTYFRFIGRFIAMALYHGKFI
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CCDS10 FFLISKEMFNPYYGLFEYSATDNYTLQINPNSGLCNEDHLSYFKFIGRVAGMAVYHGKLL
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CCDS10 DGFFIRPFYKMMLHKPITLHDMESVDSEYYNSLRWILENDPTE--LDLRFIIDEELFGQT
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pF1KB4 TTHELKEGGESIRVTEENKEEYIMLLTDWRFTRGVEEQTKAFLDGFNEVAPLEWLRYFDE
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CCDS10 HQHELKNGGSEIVVTNKNKKEYIYLVIQWRFVNRIQKQMAAFKEGFFELIPQDLIKIFDE
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CCDS10 NELELLMCGLGDVDVNDWREHTKYKNGYSANHQVIQWFWKAVLMMDSEKRIRLLQFVTGT
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CCDS10 SRVPMNGFAELYGSNGPQSFTVEQWGTPEKLPRAHTCFNRLDLPPYESFEELWDKLQMAI
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CCDS10 ENTQGFDGVD
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]