Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4662
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4662, 394 aa
1>>>pF1KB4662 394 - 394 aa - 394 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.4223+/-0.000985; mu= 15.7393+/- 0.059
mean_var=61.5955+/-12.247, 0's: 0 Z-trim(103.7): 39 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.163418
statistics sampled from 7481 (7520) to 7481 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.608), E-opt: 0.2 (0.231), width: 16
Scan time: 2.570
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 394) 2603 622.5 2e-178
CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 ( 399) 2583 617.8 5.3e-177
CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 ( 377) 1115 271.7 7.8e-73
CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7 ( 375) 1113 271.2 1.1e-72
CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 ( 375) 1110 270.5 1.8e-72
CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 ( 377) 1110 270.5 1.8e-72
CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 376) 1101 268.4 7.7e-72
CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 ( 377) 1101 268.4 7.7e-72
CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 ( 376) 1084 264.4 1.2e-70
CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075) 1089 265.8 1.4e-70
CCDS46414.1 POTEE gene_id:445582|Hs108|chr2 (1075) 1088 265.5 1.6e-70
CCDS46409.1 POTEF gene_id:728378|Hs108|chr2 (1075) 1073 262.0 1.9e-69
CCDS59432.1 POTEJ gene_id:653781|Hs108|chr2 (1038) 1065 260.1 6.8e-69
CCDS2033.1 ACTR1B gene_id:10120|Hs108|chr2 ( 376) 1012 247.4 1.6e-65
CCDS7536.1 ACTR1A gene_id:10121|Hs108|chr10 ( 376) 1001 244.8 9.6e-65
CCDS56124.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 ( 333) 837 206.1 3.8e-53
CCDS3206.1 ACTRT3 gene_id:84517|Hs108|chr3 ( 372) 837 206.2 4.1e-53
CCDS14611.1 ACTRT1 gene_id:139741|Hs108|chrX ( 376) 810 199.8 3.4e-51
CCDS45.1 ACTRT2 gene_id:140625|Hs108|chr1 ( 377) 806 198.9 6.6e-51
CCDS6772.1 ACTL7A gene_id:10881|Hs108|chr9 ( 435) 742 183.8 2.6e-46
CCDS6771.1 ACTL7B gene_id:10880|Hs108|chr9 ( 415) 707 175.5 7.7e-44
CCDS12207.1 ACTL9 gene_id:284382|Hs108|chr19 ( 416) 656 163.5 3.2e-40
CCDS5934.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 418) 615 153.8 2.6e-37
CCDS33277.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 418) 592 148.4 1.1e-35
CCDS183.1 ACTL8 gene_id:81569|Hs108|chr1 ( 366) 589 147.7 1.6e-35
CCDS63000.1 ACTR3 gene_id:10096|Hs108|chr2 ( 367) 588 147.5 1.9e-35
CCDS34782.1 ACTR3B gene_id:57180|Hs108|chr7 ( 348) 524 132.4 6.4e-31
CCDS47744.1 ACTR3C gene_id:653857|Hs108|chr7 ( 210) 379 98.1 8e-21
CCDS33463.1 ACTL10 gene_id:170487|Hs108|chr20 ( 245) 377 97.6 1.3e-20
CCDS9074.1 ACTR6 gene_id:64431|Hs108|chr12 ( 396) 322 84.8 1.6e-16
CCDS3231.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 429) 300 79.6 6.1e-15
CCDS5702.1 ACTL6B gene_id:51412|Hs108|chr7 ( 426) 295 78.4 1.4e-14
CCDS43174.1 ACTL6A gene_id:86|Hs108|chr3 ( 387) 259 69.9 4.5e-12
>>CCDS1881.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 (394 aa)
initn: 2603 init1: 2603 opt: 2603 Z-score: 3316.7 bits: 622.5 E(32554): 2e-178
Smith-Waterman score: 2603; 100.0% identity (100.0% similar) in 394 aa overlap (1-394:1-394)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
310 320 330 340 350 360
370 380 390
pF1KB4 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS18 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
370 380 390
>>CCDS46307.1 ACTR2 gene_id:10097|Hs108|chr2 (399 aa)
initn: 2247 init1: 2247 opt: 2583 Z-score: 3291.2 bits: 617.8 E(32554): 5.3e-177
Smith-Waterman score: 2583; 98.7% identity (98.7% similar) in 399 aa overlap (1-394:1-399)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIK-----DL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::
CCDS46 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKNNKKMDL
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 MVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMN
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSL
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 PHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 PHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLAL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRS
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 EFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 EFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVF
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390
pF1KB4 LGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
370 380 390
>>CCDS10041.1 ACTC1 gene_id:70|Hs108|chr15 (377 aa)
initn: 1187 init1: 819 opt: 1115 Z-score: 1421.1 bits: 271.7 E(32554): 7.8e-73
Smith-Waterman score: 1213; 46.8% identity (75.5% similar) in 387 aa overlap (2-388:3-374)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGD
:.. ..:::::.:.:: :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .:::
CCDS10 MCDDEETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 EASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKN
::. :..: ..::.:.::. :::::...: .:: : : . .. :::: :.:: :
CCDS10 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNE-LRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 REKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLT
:::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS10 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 RRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTV
:::.::::.: ::.:.: :::.: .:. : :: ::::::::. ..:.:. : ..
CCDS10 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYK
: .:: ::::..: .:.:::. ::.:::: .:..:..:. : .:.:. ::: :...:
CCDS10 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 HIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGA
. :::::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::.
CCDS10 NNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGS
300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB4 VLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
.::. .. ...:...:::.: : ....
CCDS10 ILAS-LSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS5341.1 ACTB gene_id:60|Hs108|chr7 (375 aa)
initn: 1183 init1: 835 opt: 1113 Z-score: 1418.6 bits: 271.2 E(32554): 1.1e-72
Smith-Waterman score: 1212; 47.2% identity (75.5% similar) in 388 aa overlap (1-388:1-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
::.. .:: :::.:. : :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .::::
CCDS53 MDDDIAALVV-DNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
:. :..: ..::.:.::: :::::...: .:: : : . .. .:::: :.:: ::
CCDS53 AQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE-LRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS53 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
:::.::::.: ::.:.: :::.:. .:. : :: ::::::::. ..:::. : .. :
CCDS53 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
.:: ::::..: .:.:::. ::::::: ....:. :. : ::.:. :.: :...: .
CCDS53 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
:::::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::..
CCDS53 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSI
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB4 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
::. .. ...:...:::.:.: ....
CCDS53 LAS-LSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS11782.1 ACTG1 gene_id:71|Hs108|chr17 (375 aa)
initn: 1182 init1: 835 opt: 1110 Z-score: 1414.7 bits: 270.5 E(32554): 1.8e-72
Smith-Waterman score: 1209; 47.4% identity (75.8% similar) in 380 aa overlap (9-388:8-372)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
.: :::.:. : :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .::::
CCDS11 MEEEIAALVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
:. :..: ..::.:.::: :::::...: .:: : : . .. .:::: :.:: ::
CCDS11 AQSKRGILTLKYPIEHGIVTNWDDMEKIWHHTFYNE-LRVAPEEHPVLLTEAPLNPKANR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS11 EKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHTVPIYEGYALPHAIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
:::.::::.: ::.:.: :::.:. .:. : :: ::::::::. ..:::. : .. :
CCDS11 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFTTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFEQEMATAASSSSL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
.:: ::::..: .:.:::. ::::::: ....:. :. : ::.:. :.: :...: .
CCDS11 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPEALFQPSFLGMESCGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
:::::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::..
CCDS11 TVLSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSI
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB4 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
::. .. ...:...:::.:.: ....
CCDS11 LAS-LSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS1578.1 ACTA1 gene_id:58|Hs108|chr1 (377 aa)
initn: 1185 init1: 817 opt: 1110 Z-score: 1414.7 bits: 270.5 E(32554): 1.8e-72
Smith-Waterman score: 1211; 46.8% identity (75.2% similar) in 387 aa overlap (2-388:3-374)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGD
: . ..:::::.:.:: :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .:::
CCDS15 MCDEDETTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 EASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKN
::. :..: ..::.:.::. :::::...: .:: : : . .. :::: :.:: :
CCDS15 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHTFYNE-LRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 REKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLT
:::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS15 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 RRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTV
:::.::::.: ::.:.: :::.: .:. : :: ::::::::. ..:.:. : ..
CCDS15 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYK
: .:: ::::..: .:.:::. ::.:::: .:..:..:. : .:.:. ::: :...:
CCDS15 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 HIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGA
. :.:::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::.
CCDS15 NNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGS
300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB4 VLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
.::. .. ...:.:.:::.: : ....
CCDS15 ILAS-LSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS1930.1 ACTG2 gene_id:72|Hs108|chr2 (376 aa)
initn: 1178 init1: 819 opt: 1101 Z-score: 1403.3 bits: 268.4 E(32554): 7.7e-72
Smith-Waterman score: 1191; 46.6% identity (75.3% similar) in 380 aa overlap (9-388:9-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
.:::::.:. : :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .::::
CCDS19 MCEEETTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
:. :..: ..::.:.::. :::::...: ..: : : . .. :::: :.:: ::
CCDS19 AQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNE-LRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS19 EKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIM
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
:::.::::.: ::.:.: :::.: .:. : :: ::::::::. ..:.:. : .. :
CCDS19 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
.:: ::::..: .:.:::. ::.:::: .:..:..:. : .:.:. ::: :...: .
CCDS19 EKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYAN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
:::::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::..
CCDS19 NVLSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSI
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB4 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
::. .. ...:... ::.: : ....
CCDS19 LAS-LSTFQQMWISKPEYDEAGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS7392.1 ACTA2 gene_id:59|Hs108|chr10 (377 aa)
initn: 1178 init1: 819 opt: 1101 Z-score: 1403.2 bits: 268.4 E(32554): 7.7e-72
Smith-Waterman score: 1199; 46.8% identity (75.5% similar) in 380 aa overlap (9-388:10-374)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGD
.:::::.:. : :.::.. :. .::..:::: : . .. :: .:::
CCDS73 MCEEEDSTALVCDNGSGLCKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRP--RHQGVMVGMGQKDSYVGD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 EASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKN
::. :..: ..::.:.::. :::::...: ..: : : . .. :::: :.:: :
CCDS73 EAQSKRGILTLKYPIEHGIITNWDDMEKIWHHSFYNE-LRVAPEEHPTLLTEAPLNPKAN
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 REKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLT
:::....::::.. ..::::::::.:::.: ::.:.:::::::: :.:::..:::
CCDS73 REKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 RRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTV
:::.::::.: ::.:.: :::.: .:. : :: ::::::::. ..:.:. : ..
CCDS73 MRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYK
: .:: ::::..: .:.:::. ::.:::: .:..:..:. : .:.:. ::: :...:
CCDS73 LEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYA
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 HIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGA
. :::::.:::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::.
CCDS73 NNVLSGGTTMYPGIADRMQKEITAL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGS
300 310 320 330 340
360 370 380 390
pF1KB4 VLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
.::. .. ...:...:::.: : ....
CCDS73 ILAS-LSTFQQMWISKQEYDEAGPSIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS34163.1 ACTBL2 gene_id:345651|Hs108|chr5 (376 aa)
initn: 1162 init1: 822 opt: 1084 Z-score: 1381.6 bits: 264.4 E(32554): 1.2e-70
Smith-Waterman score: 1180; 46.3% identity (75.0% similar) in 380 aa overlap (9-388:9-373)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEHIFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDE
.: :::.:. : :..:.. :. .::...::: : . .. :: .::::
CCDS34 MTDNELSALVVDNGSGMCKAGFGGDDAPRAVFPSMIGRP--RHQGVMVGMGQKDCYVGDE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWDYTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNR
:. :..: ..::.:.:.: :::::...: .:: : : . . ::::: :.:: ::
CCDS34 AQSKRGVLTLKYPIEHGVVTNWDDMEKIWYHTFYNE-LRVAPDEHPILLTEAPLNPKINR
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQGLLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTR
::....:::... ..::::::::.:::.: ::.:.::::::::: :.:::..:::
CCDS34 EKMTQIMFEAFNTPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVMDSGDGVTHIVPIYEGYALPHAIL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 RLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADFETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVL
:::.::::.: ::.:.: ::: :. .:. : :: .:::::::. ..:::. : ..
CCDS34 RLDLAGRDLTDYLMKILTERGYNFTTTAEREIVRDVKEKLCYVALDFEQEMVRAAASSSP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 VESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHLINVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKH
.:: ::::..: .:.:::. :::.::: ....:. :. : ::.:. :.: :...: .
CCDS34 ERSYELPDGQVITIGNERFRCPEAIFQPSFLGIESSGIHETTFNSIMKCDVDIRKDLYAN
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVLKGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAV
:::::::::::. .:...:. : : .::.: ::.::. :..::..
CCDS34 TVLSGGSTMYPGIADRMQKEIITL-----------APSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSI
300 310 320 330 340
370 380 390
pF1KB4 LADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLGVTVR
::. .. ...:...:::.: : ....
CCDS34 LAS-LSTFQQMWISKQEYDEAGPPIVHRKCF
350 360 370
>>CCDS59431.1 POTEI gene_id:653269|Hs108|chr2 (1075 aa)
initn: 1161 init1: 806 opt: 1089 Z-score: 1380.7 bits: 265.8 E(32554): 1.4e-70
Smith-Waterman score: 1194; 46.4% identity (75.5% similar) in 388 aa overlap (1-388:701-1072)
10 20 30
pF1KB4 MDSQGRKVVVCDNGTGFVKCGYAGSNFPEH
::.. :.: :::.:. : :.::.. :.
CCDS59 LRKKKYLEDIESVKKKNDNLLKALQLNELTMDDD-TAVLVIDNGSGMCKAGFAGDDAPRA
680 690 700 710 720
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 IFPALVGRPIIRSTTKVGNIEIKDLMVGDEASELRSMLEVNYPMENGIVRNWDDMKHLWD
.::..:::: :. .:... :. .:: ::. :..: ..::::.::. :::::...:
CCDS59 VFPSIVGRP--RQQGMMGGMHQKESYVGKEAQSKRGILTLKYPMEHGIITNWDDMEKIWH
730 740 750 760 770 780
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 YTFGPEKLNIDTRNCKILLTEPPMNPTKNREKIVEVMFETYQFSGVYVAIQAVLTLYAQG
.:: : : . .. ::::: :.:: ::::....::::.. ..::::::.:.::..:
CCDS59 HTFYNE-LRVAPEEHPILLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNTPAMYVAIQAMLSLYTSG
790 800 810 820 830 840
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 LLTGVVVDSGDGVTHICPVYEGFSLPHLTRRLDIAGRDITRYLIKLLLLRGYAFNHSADF
::.:.:::::::: :.:.: .::: : :::.:::..: ::.:.: ::: :. :.
CCDS59 RTTGIVMDSGDGVTHTVPIYDGNALPHATLRLDLAGRELTDYLMKILTERGYRFTTMAER
850 860 870 880 890 900
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 ETVRMIKEKLCYVGYNIEQEQKLALETTVLVESYTLPDGRIIKVGGERFEAPEALFQPHL
: :: ::::::::. ..:::. .: .. : .:: ::::..: .:.: :. ::::::: .
CCDS59 EIVRDIKEKLCYVALDFEQEMAMAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNEWFRCPEALFQPCF
910 920 930 940 950 960
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 INVEGVGVAELLFNTIQAADIDTRSEFYKHIVLSGGSTMYPGLPSRLERELKQLYLERVL
...:. :. : ::.:. .:.: :...: . :::::.:::::. :...:. :
CCDS59 LGMESCGIHETTFNSIMKSDVDIRKDLYTNTVLSGGTTMYPGMAHRMQKEIAAL------
970 980 990 1000 1010 1020
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 KGDVEKLSKFKIRIEDPPRRKHMVFLGGAVLADIMKDKDNFWMTRQEYQEKGVRVLEKLG
: .:::: ::.::. :..::..::. .. ...:...:::.:.: ....
CCDS59 -----APSMLKIRIIAPPKRKYSVWVGGSILAS-LSTFQQMWISKQEYDESGPSIVHRKC
1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 VTVR
CCDS59 F
394 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 03:07:48 2016 done: Fri Nov 4 03:07:48 2016
Total Scan time: 2.570 Total Display time: 0.050
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]