Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4614
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4614, 596 aa
1>>>pF1KB4614 596 - 596 aa - 596 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.2956+/-0.00109; mu= -9.2260+/- 0.065
mean_var=281.3271+/-57.137, 0's: 0 Z-trim(111.8): 133 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.076466
statistics sampled from 12555 (12688) to 12555 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.717), E-opt: 0.2 (0.39), width: 16
Scan time: 3.800
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 596) 4047 460.1 3.5e-129
CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 487) 2715 313.2 5.1e-85
CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 483) 2618 302.5 8.4e-82
CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 625) 2053 240.2 6.1e-63
CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 271) 1929 226.3 3.9e-59
CCDS7377.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 727) 1126 137.9 4.2e-32
CCDS41544.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 617) 1109 136.0 1.3e-31
CCDS53550.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 732) 1109 136.1 1.6e-31
CCDS4423.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 423) 890 111.8 1.8e-24
CCDS4422.1 PDLIM7 gene_id:9260|Hs108|chr5 ( 457) 890 111.8 1.9e-24
CCDS47104.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 214) 644 84.5 1.5e-16
CCDS47103.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 ( 234) 644 84.5 1.6e-16
CCDS10713.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 444) 609 80.8 4.1e-15
CCDS42156.1 TGFB1I1 gene_id:7041|Hs108|chr16 ( 461) 609 80.8 4.2e-15
CCDS44450.1 LDB3 gene_id:11155|Hs108|chr10 ( 330) 560 75.3 1.3e-13
CCDS76407.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 366) 557 75.0 1.8e-13
CCDS7969.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 386) 557 75.0 1.9e-13
CCDS53635.1 LPXN gene_id:9404|Hs108|chr11 ( 391) 557 75.0 1.9e-13
CCDS44996.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 557) 520 71.0 4.5e-12
CCDS44998.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 424) 513 70.2 6e-12
CCDS44997.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 591) 513 70.3 8e-12
CCDS58281.1 PXN gene_id:5829|Hs108|chr12 ( 605) 513 70.3 8.2e-12
CCDS54394.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2 ( 336) 476 66.1 8.3e-11
CCDS54395.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2 ( 341) 476 66.1 8.4e-11
CCDS54396.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2 ( 363) 476 66.1 8.9e-11
CCDS2147.1 LIMS2 gene_id:55679|Hs108|chr2 ( 365) 476 66.1 9e-11
>>CCDS3641.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (596 aa)
initn: 4047 init1: 4047 opt: 4047 Z-score: 2432.6 bits: 460.1 E(32554): 3.5e-129
Smith-Waterman score: 4047; 99.5% identity (100.0% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-596)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS36 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 PSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 RCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590
pF1KB4 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS36 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
550 560 570 580 590
>>CCDS47102.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (487 aa)
initn: 2709 init1: 2709 opt: 2715 Z-score: 1639.9 bits: 313.2 E(32554): 5.1e-85
Smith-Waterman score: 3122; 81.2% identity (81.7% similar) in 596 aa overlap (1-596:1-487)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
CCDS47 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPR
100 110 120 130
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 KHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEA
140 150 160 170 180 190
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGSTGVIKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::
CCDS47 DNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGSTGVIKS
200 210 220 230 240 250
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 PSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMC
260 270 280 290 300 310
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 AHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFFAPECG
320 330 340 350 360 370
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 RCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
:::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHG
380 390 400 410 420 430
550 560 570 580 590
pF1KB4 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
440 450 460 470 480
>>CCDS58917.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (483 aa)
initn: 3058 init1: 2428 opt: 2618 Z-score: 1582.1 bits: 302.5 E(32554): 8.4e-82
Smith-Waterman score: 3025; 80.1% identity (80.6% similar) in 592 aa overlap (1-586:1-483)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
CCDS58 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNG---
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGKIP
100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ---PPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKRPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
140 150 160 170 180 190
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::
CCDS58 LKESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGS
200 210 220 230 240 250
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 TGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAG
::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAG
260 270 280 290 300 310
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 KRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 KRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKF
320 330 340 350 360 370
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 FAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALF
:::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 FAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALF
380 390 400 410 420 430
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 GTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPL
440 450 460 470 480
pF1KB4 NF
>>CCDS58916.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (625 aa)
initn: 2683 init1: 2053 opt: 2053 Z-score: 1243.5 bits: 240.2 E(32554): 6.1e-63
Smith-Waterman score: 2820; 65.8% identity (66.3% similar) in 734 aa overlap (1-596:1-625)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MSNYSVSLVGPAPWGFRLQGGKDFNMPLTISSLKDGGKAAQANVRIGDVVLSIDGINAQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVSKVTST
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQK-----------------------
70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 NNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASGLH
CCDS58 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230
pF1KB4 ANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNG---
:::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 --------------------------PTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGKIP
100 110 120 130
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 ---PPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 PKRPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEH
140 150 160 170 180 190
300
pF1KB4 LKESEADNTKKA------------------------------------------------
::::::::::::
CCDS58 LKESEADNTKKAKFDSALEDLPKSGPHPPATPQVLTIGSQVATLSKVATTYSSLSSSTGN
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 ------------------------------------------------------------
CCDS58 VEDSFEGFRNFSTFSSPARYSAAVLSSAAATVSAVIATKTRLYTPERYHSLLDALCISPV
260 270 280 290 300 310
310 320 330 340
pF1KB4 ------------------------NNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTS
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 SKPLAFSYLQSSRKSTGSIHVKKTSNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTS
320 330 340 350 360 370
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 LTTAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQD
::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::
CCDS58 LTAAAAFKPVGSTGVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQD
380 390 400 410 420 430
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 TLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 TLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEK
440 450 460 470 480 490
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 GALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDG
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 GALYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDG
500 510 520 530 540 550
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 EPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS58 EPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKK
560 570 580 590 600 610
590
pF1KB4 DKPLCKKHAHSVNF
::::::::::::::
CCDS58 DKPLCKKHAHSVNF
620
>>CCDS75166.1 PDLIM5 gene_id:10611|Hs108|chr4 (271 aa)
initn: 1929 init1: 1929 opt: 1929 Z-score: 1175.2 bits: 226.3 E(32554): 3.9e-59
Smith-Waterman score: 1929; 98.9% identity (100.0% similar) in 271 aa overlap (326-596:1-271)
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 KESEADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMPESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGST
:::::::::::::::::::.::::::::::
CCDS75 MPESLDSPTSGRPGVTSLTAAAAFKPVGST
10 20 30
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGK
:::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 GVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSATYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGK
40 50 60 70 80 90
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 RTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFF
100 110 120 130 140 150
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 APECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFG
::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 APECGRCQRKILGEVISALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS75 TICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVN
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pF1KB4 F
:
CCDS75 F
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.:..:. : ..: ... : : ::
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. : . . .. : .. ..: .: ::: . : ::.: . : ....:..
CCDS73 -LYSAETLREMAQMYQMSLRGKASGVGLPGGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPED-
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: . ..:. ... : ...... . . .:. .: ::
CCDS73 --------EADEWARRSSNLQ-SRSFRILAQMTGTEF--MQDPDEEALRRSSTPIEHAPV
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:.:: : :.. : :. :: . : : .:..::. ..... .: .
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. .: . . .. : : :.: .: : : :.. : . :: .. :
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. :... : . : . . ::: : : : . : .:. .
CCDS73 STYSPSPGANY---SPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYN
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:. . ... .:.. . . :... :: ::... :. :: . :
CCDS73 PAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQKFAPGKSTTSISKQTLPRGG--PAYTPAGPQV
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pF1KB4 PSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIG
: :::::..::..:::.:.:::.:::::::::.:.:::::::.::.::...: .
CCDS73 PPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVC
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::::.. .::: :::.:::: :..:. ::.:::..::.::::..::::.:: ::. :..:
CCDS73 FVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIMGEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLF
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:.:::::::: :: ::.: ::::.::.:::: :.::::.:::::::.:.:: .::::
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CCDS73 FYSKKDRPLCKKHAHTINL
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.:::.:.::.::::::::::::::::::: . :.::::... ::.:..:::.:..
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:::::::::::. . .:..:::... .:.:.. : : :.:. :.:
CCDS41 MTHLEAQNKIKSASYNLSLTLQKSK-----RPIPISTTAPP-VQTPLPVIPHQKVVVNSP
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: :.. :.:. :. .. .:. . .::
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..:.. : :.: .. ... .. :: . .::.. . . : .
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:. . :.. .:. . . .....: :... ::::::::::.:::: ... .
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. ... ... :: .:.: :..: :. : :
CCDS41 EALRRSRPQASSYSPAVAASSAPATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPSVYQPVPAST
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::. : : . . : :. : . . :: :. . .:: . : :.
CCDS41 YSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYTPSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSV
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::::. : :: . : :
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:::::..::..:::.:.:::.:::::::::.:.:::::::.::.::...: . ::::..
CCDS41 VQRAERFPASSRTPLCGHCNNVIRGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNN
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pF1KB4 LYCELCYEKFFAPECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEP
.::: :::.:::: :..:. ::.:::..::.::::..::::.:: ::. :..::.:::::
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::: :: ::.: ::::.::.:::: :.::::.:::::::.:.:: .:::: :.::::.
CCDS41 YCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEAGDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDR
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pF1KB4 PLCKKHAHSVNF
::::::::..:.
CCDS41 PLCKKHAHTINL
610
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pF1KB4 TSTNNMAYNKAPRP----FGSVSSPK-VTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTP-
.. ...: . : : . . .::. . .. .:.. :. . .. .: . ..
CCDS53 SAFSSLAEASDPGPPRASLRAKTSPEGARDLLGPKA--LPGSSQPRQYNNPIGLYSAETL
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180 190 200
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.. : :: ..:. . .::::. .:: : ...
CCDS53 REMAQMYQMSLRGKASGVGLPGGADYQERFNPSALKDSALSTHKPIEVKGLGGKATIIHA
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210 220 230 240 250 260
pF1KB4 PRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGPPRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKR
. .. ... .. :: . .::.. . . : . :. . :.. .:. . .
CCDS53 QYNTPISMYSQDAIMDAIAGQAQ-AQGSDFSGSLPIKDLAVDSASPVYQAVIKSQNKPE-
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270 280 290 300 310
pF1KB4 LIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKESEADNTKKAN-NSQEPSPQLASS---
.....: :... ::::::::::.:::: ... . . ... ... :: .:.:
CCDS53 --DEADEWARRSSNLQSRSFRILAQMTGTEFMQDPDEEALRRSRPQASSYSPAVAASSAP
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320 330 340 350
pF1KB4 ------------------VASTRSM--------PESLDSPTSG---RPGVTSLTTAAAFK
:..: :. : : ::. : : . . : :.
CCDS53 ATHTSYSEGPAAPAPKPRVVTTASIRPSVYQPVPASTYSPSPGANYSPTPYTPSPAPAYT
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: . . :: :. . .:: . : :.::::. :
CCDS53 PSPAPAYTPSPVPTYTPSPAPAYTPSPAPNYNPAPSVAYSGGPAEPASRPPWVTDDSFSQ
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390 400 410 420
pF1KB4 --------------------PANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGKRTPMCAHCNQVI
:: . : : :::::..::..:::.:.:::.::
CCDS53 KFAPGKSTTSISKQTLPRGGPAYTPAGPQVPPLARGTVQRAERFPASSRTPLCGHCNNVI
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:::::::.:.:::::::.::.::...: . ::::.. .::: :::.:::: :..:. ::.
CCDS53 RGPFLVAMGRSWHPEEFTCAYCKTSLADVCFVEEQNNVYCERCYEQFFAPLCAKCNTKIM
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pF1KB4 GEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGTICHGCEFPIEA
:::..::.::::..::::.:: ::. :..::.:::::::: :: ::.: ::::.::.::
CCDS53 GEVMHALRQTWHTTCFVCAACKKPFGNSLFHMEDGEPYCEKDYINLFSTKCHGCDFPVEA
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:: :.::::.:::::::.:.:: .:::: :.::::.::::::::..:.
CCDS53 GDKFIEALGHTWHDTCFICAVCHVNLEGQPFYSKKDRPLCKKHAHTINL
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.::.::::::..: :.. :.::. :::. :: . .:
CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQ--------PVQS-------KPQKVQTP--------
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CCDS44 -----DKQPLRPL-----------------------------------------------
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::
CCDS44 -----------------------VP-----------------------------------
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::::.::.:.::::::: :: :::::::::..:::: ... .
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.. :: .:: : . . ..:: . : . :::: : ... . : . : ..
CCDS44 EEHLKK--SSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTST
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:. : .: .: .: : : .:.: ..: : .
CCDS44 VLTRHS--QPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNG---------------------K
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::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: ... :: :::::..: ::. .:
CCDS44 TPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRYA
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pF1KB4 PECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFGT
: :..:..:: ::...:::.:::: ::.:.:: :::: .:..:.: :::: :: .:::
CCDS44 PSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFGT
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pF1KB4 ICHGCEFPIEAGDMFLEALGYTWHDTCFVCSVCCESLEGQTFFSKKDKPLCKKHAHSVNF
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CCDS44 KCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
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CCDS44 MDSFKVVLEGPAPWGFRLQGGKDFNVPLSISRLTPGGKAAQAGVAVGDWVLSIDGENAGS
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pF1KB4 MTHLEAQNKIKGCTGSLNMTLQRASAAPKPEPVPVQKGEPKEVVKPVPITSPAVS--KVT
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CCDS44 LTHIEAQNKIRACGERLSLGLSRAQ--------PVQS-------KPQKASAPAADPPRYT
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pF1KB4 STNNMAYNKAPRPFGSVSSPKVTSIPSPSSAFTPAHATTSSHASPSPVAAVTPPLFAASG
. ... ::. ::::. : ::
CCDS44 FAPSVSLNKTARPFGA---P--------------------------------PP------
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pF1KB4 LHANANLSADQSPSALSAGKTAVNVPRQPTVTSVCSETSQELAEGQRRGSQGDSKQQNGP
::..: ::::
CCDS44 --------ADSAP------------------------------------------QQNGQ
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pF1KB4 PRKHIVERYTEFYHVPTHSDASKKRLIEDTEDWRPRTGTTQSRSFRILAQITGTEHLKES
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CCDS44 PLRPLV---------P---DASKQRLMENTEDWRPRPGTGQSRSFRILAHLTGTEFMQDP
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pF1KB4 EADNTKKANNSQEPSPQLASSVASTRSMP---ESLDSPTSGRPGVTSLTTAAAFKPVGST
. .. :: .:: : . . ..:: . : . :::: : ... . : . : ..
CCDS44 DEEHLKK--SSQVPRTEAPAPASSTPQEPWPGPTAPSPTSRPPWAVDPAFAERYAPDKTS
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pF1KB4 GVIKSPSWQRPNQGVPSTGRISNSAAYSGSVAPANSALGQTQPSDQDTLVQRAEHIPAGK
:. : .: .: .: : : .:.: ..: :
CCDS44 TVLTRHS--QPATPTPLQSRTSIVQAAAGGVPGGGSNNG---------------------
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pF1KB4 RTPMCAHCNQVIRGPFLVALGKSWHPEEFNCAHCKNTMAYIGFVEEKGALYCELCYEKFF
.::.: .:..:::: .:::::...::::: :..: ... :: :::::..: ::. .
CCDS44 KTPVCHQCHKVIRGRYLVALGHAYHPEEFVCSQCGKVLEEGGFFEEKGAIFCPPCYDVRY
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 APECGRCQRKILGEVINALKQTWHVSCFVCVACGKPIRNNVFHLEDGEPYCETDYYALFG
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CCDS44 APSCAKCKKKITGEIMHALKMTWHVHCFTCAACKTPIRNRAFYMEEGVPYCERDYEKMFG
340 350 360 370 380 390
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CCDS44 TKCHGCDFKIDAGDRFLEALGFSWHDTCFVCAICQINLEGKTFYSKKDRPLCKSHAFSHV
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 F
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