FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4596, 917 aa
1>>>pF1KB4596 917 - 917 aa - 917 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1982+/-0.00128; mu= 21.2888+/- 0.077
mean_var=60.0850+/-12.130, 0's: 0 Z-trim(98.7): 34 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.165459
statistics sampled from 5466 (5477) to 5466 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.495), E-opt: 0.2 (0.168), width: 16
Scan time: 3.930
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 917) 6027 1448.2 0
CCDS7289.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 921) 5898 1417.4 0
CCDS7290.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 905) 5897 1417.2 0
CCDS7291.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 ( 916) 5897 1417.2 0
CCDS1956.1 HK2 gene_id:3099|Hs108|chr2 ( 917) 4668 1123.8 0
CCDS7288.1 HKDC1 gene_id:80201|Hs108|chr10 ( 917) 4505 1084.9 0
CCDS4407.1 HK3 gene_id:3101|Hs108|chr5 ( 923) 3202 773.9 0
CCDS5481.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 464) 1709 417.4 3.2e-116
CCDS5479.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 465) 1705 416.4 6.2e-116
CCDS5480.1 GCK gene_id:2645|Hs108|chr7 ( 466) 1696 414.3 2.8e-115
>>CCDS7292.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (917 aa)
initn: 6027 init1: 6027 opt: 6027 Z-score: 7766.0 bits: 1448.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6027; 100.0% identity (100.0% similar) in 917 aa overlap (1-917:1-917)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTH
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 KDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 TFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDD
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 IFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKG
850 860 870 880 890 900
910
pF1KB4 AALITAVGVRLRTEASS
:::::::::::::::::
CCDS72 AALITAVGVRLRTEASS
910
>>CCDS7289.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (921 aa)
initn: 5898 init1: 5898 opt: 5898 Z-score: 7599.6 bits: 1417.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5898; 99.9% identity (100.0% similar) in 897 aa overlap (21-917:25-921)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFN
.:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MGQICQRESATAAEKPKLHLLAESEIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFN
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 PTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PTATVKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPE
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 NIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NIVHGSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFK
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 ASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ASGVEGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNA
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 CYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CYMEELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKM
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 VSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VSGMYLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEIL
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 TRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TRLGVEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSL
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 YKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YKTHPQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAH
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 FHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 FHLTKDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGT
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 NFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 NFRVLLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRM
550 560 570 580 590 600
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 PLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PLGFTFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVN
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 DTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 DTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNG
670 680 690 700 710 720
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 CLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 CLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETL
730 740 750 760 770 780
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 KTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KTRGIFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGA
790 800 810 820 830 840
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 GMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GMAAVVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDG
850 860 870 880 890 900
900 910
pF1KB4 SGKGAALITAVGVRLRTEASS
:::::::::::::::::::::
CCDS72 SGKGAALITAVGVRLRTEASS
910 920
>>CCDS7290.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (905 aa)
initn: 5897 init1: 5897 opt: 5897 Z-score: 7598.4 bits: 1417.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5897; 100.0% identity (100.0% similar) in 896 aa overlap (22-917:10-905)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MAKRALHDFIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 YLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 YLGELVRLILVKMAKEGLLFEGRITPELLTRGKFNTSDVSAIEKNKEGLHNAKEILTRLG
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VEPSDDDCVSVQHVCTIVSFRSANLVAATLGAILNRLRDNKGTPRLRTTVGVDGSLYKTH
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 PQYSRRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLT
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 KDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 KDMLLEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRV
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 LLVKIRSGKKRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGF
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 TFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TFSFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVG
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 TMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 TMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDD
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFLFRGQISETLKTRG
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 IFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 IFETKFLSQIESDRLALLQVRAILQQLGLNSTCDDSILVKTVCGVVSRRAAQLCGAGMAA
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VVDKIRENRGLDRLNVTVGVDGTLYKLHPHFSRIMHQTVKELSPKCNVSFLLSEDGSGKG
830 840 850 860 870 880
910
pF1KB4 AALITAVGVRLRTEASS
:::::::::::::::::
CCDS72 AALITAVGVRLRTEASS
890 900
>>CCDS7291.1 HK1 gene_id:3098|Hs108|chr10 (916 aa)
initn: 5897 init1: 5897 opt: 5897 Z-score: 7598.3 bits: 1417.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5897; 100.0% identity (100.0% similar) in 896 aa overlap (22-917:21-916)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MIAAQLLAYYFTELKDDQVKKIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 MDCEHSLSLPCRGAEAWEIGIDKYLYAMRLSDETLIDIMTRFRKEMKNGLSRDFNPTAT
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 VKMLPTFVRSIPDGSEKGDFIALDLGGSSFRILRVQVNHEKNQNVHMESEVYDTPENIVH
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 GSGSQLFDHVAECLGDFMEKRKIKDKKLPVGFTFSFPCQQSKIDEAILITWTKRFKASGV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS72 EGADVVKLLNKAIKKRGDYDANIVAVVNDTVGTMMTCGYDDQHCEVGLIIGTGTNACYME
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ELRHIDLVEGDEGRMCINTEWGAFGDDGSLEDIRTEFDREIDRGSLNPGKQLFEKMVSGM
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CCDS19 AALITAVACRIREAGQR
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CCDS72 PQYPKRLHKVVRKLVPSCDVRFLLSESGSTKGAAMVTAVASRVQAQRKQIDRVLALFQLT
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CCDS72 REQLVDVQAKMRAELEYGLKKKSHGLATVRMLPTYVCGLPDGTEKGKFLALDLGGTNFRV
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CCDS44 ALRGQASPAPAVRMLPTYVGSTPHGTEQGDFVVLELGATGASLRVLWVTLTGIEGHRVEP
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CCDS44 RSQEFVIPQEVMLGAGQQLFDFAAHCLSEFLDAQPVNKQGLQLGFSFSFPCHQTGLDRST
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CCDS44 LISWTKGFRCSGVEGQDVVQLLRDAIRRQGAYNIDVVAVVNDTVGTMMGCEPGVRPCEVG
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CCDS44 LVVDTGTNACYMEEARHVAVLDEDRGRVCVSVEWGSFSDDGALGPVLTTFDHTLDHESLN
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CCDS44 VAVATGGRVCERHPRFCSVLQGTVMLLAPECDVSLIPSVDGGGRGVAMVTAVAARLAAHR
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CCDS44 RLLEETLAPFRLNHDQLAAVQAQMRKAMAKGLRGEASS---LRMLPTFVRATPDGSERGD
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CCDS44 FLALDLGGTNFRVLLVRVTTG----VQITSEIYSIPETVAQGSGQQLFDHIVDCIVDFQQ
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CCDS44 KQGLSGQSLPLGFTFSFPCRQLGLDQGILLNWTKGFKASDCEGQDVVSLLREAITRRQAV
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pF1KB4 DLDVVAVVNDTVGTMMTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINM
.:.:::.:::::::::.:.::.: ::.:::::::.:::::::..:: : ::.:.:::::
CCDS44 ELNVVAIVNDTVGTMMSCGYEDPRCEIGLIVGTGTNACYMEELRNVAGVPGDSGRMCINM
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pF1KB4 EWGAFGDNGCLDDIRTHYDRLVDEYSLNAGKQRYEKMISGMYLGEIVRNILIDFTKKGFL
:::::::.: : . :..: ::. :.: ::::.::::::::::::::.::. .:. : :
CCDS44 EWGAFGDDGSLAMLSTRFDASVDQASINPGKQRFEKMISGMYLGEIVRHILLHLTSLGVL
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:::: . :.:: ::.:::::.:::: ::: ::::::..::: : ::...: :: .::
CCDS44 FRGQQIQRLQTRDIFKTKFLSEIESDSLALRQVRAILEDLGLPLTSDDALMVLEVCQAVS
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.:::::::::.::::.::::::::..: :.::::::::::::.:: .. ::.::.:.:
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CCDS44 VTFLQSEDGSGKGAALVTAVACRLAQLTRV
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. .:. ....:.:: . : ::.: :::.: ::::::: .: ..::::::::: ..
CCDS54 QWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHE
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.::: :. ::. ::: . : .:. .: :: :::..:.::.:.:....::.:
CCDS54 VESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVINRMRESR
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CCDS54 SEDVMRITVGVDGSVYKLHPSFKERFHASVRRLTPSCEITFIESEEGSGRGAALVSAVAC
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910
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.
CCDS54 KKACMLGQ
460
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pF1KB4 RRFHKTLRRLVPDSDVRFLLSESGSGKGAAMVTAVAYRLAEQHRQIEETLAHFHLTKDML
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pF1KB4 LEVKKRMRAEMELGLRKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVK
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CCDS54 KKVMRRMQKEMDRGLRLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVK
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pF1KB4 IRSGK--KRTVEMHNKIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTF
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CCDS54 VGEGEEGQWSVKTKHQMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTF
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pF1KB4 SFPCQQTSLDAGILITWTKGFKATDCVGHDVVTLLRDAIKRREEFDLDVVAVVNDTVGTM
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CCDS54 SFPVRHEDIDKGILLNWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATM
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pF1KB4 MTCAYEEPTCEVGLIVGTGSNACYMEEMKNVEMVEGDQGQMCINMEWGAFGDNGCLDDIR
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CCDS54 ISCYYEDHQCEVGMIVGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFL
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CCDS54 LEYDRLVDESSANPGQQLYEKLIGGKYMGELVRLVLLRLVDENLLFHGEASEQLRTRGAF
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CCDS54 ETRFVSQVESDTGDRKQIYNILSTLGLRPSTTDCDIVRRACESVSTRAAHMCSAGLAGVI
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:..::. .
CCDS54 LVSAVACKKACMLGQ
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CCDS54 MAMDVTRSQAQTALTLVEQILAEFQLQEEDLKKVMRRMQKEMDRGL
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pF1KB4 RKQTHNNAVVKMLPSFVRRTPDGTENGDFLALDLGGTNFRVLLVKIRSGK--KRTVEMHN
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CCDS54 RLETHEEASVKMLPTYVRSTPEGSEVGDFLSLDLGGTNFRVMLVKVGEGEEGQWSVKTKH
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pF1KB4 KIYAIPIEIMQGTGEELFDHIVSCISDFLDYMGIKGPRMPLGFTFSFPCQQTSLDAGILI
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CCDS54 QMYSIPEDAMTGTAEMLFDYISECISDFLDKHQMKHKKLPLGFTFSFPVRHEDIDKGILL
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CCDS54 NWTKGFKASGAEGNNVVGLLRDAIKRRGDFEMDVVAMVNDTVATMISCYYEDHQCEVGMI
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CCDS54 VGTGCNACYMEEMQNVELVEGDEGRMCVNTEWGAFGDSGELDEFLLEYDRLVDESSANPG
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]