Result of FASTA (omim) for
pF1KB4582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4582, 628 aa
1>>>pF1KB4582 628 - 628 aa - 628 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.7690+/-0.00048; mu= 13.1704+/- 0.030
mean_var=155.2734+/-30.472, 0's: 0 Z-trim(114.7): 220 B-trim: 30 in 2/48
Lambda= 0.102926
statistics sampled from 24470 (24719) to 24470 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.641), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 7.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_067052 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 1 precur ( 628) 4618 698.5 1.8e-200
NP_001316630 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 4359 660.0 6.5e-189
NP_001316631 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Ho ( 591) 4359 660.0 6.5e-189
NP_001316629 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 2 pre ( 605) 3765 571.8 2.4e-162
XP_016867691 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1212) 1284 203.7 3e-51
NP_002282 (OMIM: 150240,615191) laminin subunit be (1786) 1284 203.9 4e-51
XP_016867690 (OMIM: 150240,615191) PREDICTED: lami (1810) 1284 203.9 4e-51
NP_001304977 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 ( 772) 1263 200.4 1.9e-50
NP_001304976 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1101) 1263 200.6 2.5e-50
XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1564) 1263 200.7 3.2e-50
XP_016867369 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1567) 1263 200.7 3.2e-50
XP_011514281 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1703) 1263 200.8 3.4e-50
XP_011514280 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1723) 1263 200.8 3.4e-50
XP_016867368 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1753) 1263 200.8 3.4e-50
NP_001304975 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 (1761) 1263 200.8 3.4e-50
NP_031382 (OMIM: 616380) laminin subunit beta-4 is (1761) 1263 200.8 3.4e-50
XP_011514277 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin sub (1772) 1263 200.8 3.5e-50
XP_005265184 (OMIM: 150325,609049,614199) PREDICTE (1798) 1256 199.7 7.2e-50
NP_002283 (OMIM: 150325,609049,614199) laminin sub (1798) 1256 199.7 7.2e-50
NP_001017402 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1007 162.6 7.2e-39
XP_005273181 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1172) 1007 162.6 7.2e-39
NP_001121113 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) l (1172) 1007 162.6 7.2e-39
NP_000219 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) lami (1172) 1007 162.6 7.2e-39
NP_004813 (OMIM: 601614) netrin-1 precursor [Homo ( 604) 804 132.1 5.4e-30
XP_006721658 (OMIM: 601614) PREDICTED: netrin-1 is ( 604) 804 132.1 5.4e-30
XP_011524284 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3243) 811 133.9 8.4e-30
NP_001121189 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l (3277) 811 133.9 8.5e-30
NP_937762 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) lami (3333) 811 133.9 8.6e-30
XP_011524282 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3336) 811 133.9 8.6e-30
XP_011524281 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3339) 811 133.9 8.6e-30
XP_011524280 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3342) 811 133.9 8.6e-30
XP_006723861 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (2300) 803 132.6 1.5e-29
XP_011527121 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3609) 803 132.8 2.1e-29
XP_011527120 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3654) 803 132.8 2.1e-29
NP_005551 (OMIM: 601033) laminin subunit alpha-5 p (3695) 803 132.8 2.1e-29
XP_006723859 (OMIM: 601033) PREDICTED: laminin sub (3700) 803 132.8 2.1e-29
XP_016856761 (OMIM: 104530,150310,226650,226700) P (1108) 734 122.0 1.1e-26
XP_011524283 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) P (3298) 699 117.3 8.6e-25
NP_001289925 (OMIM: 226650,226700,245660,600805) l ( 488) 644 108.3 6.6e-23
XP_016866342 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (1916) 613 104.3 4.1e-21
NP_001073291 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit (3118) 613 104.5 5.8e-21
NP_000417 (OMIM: 156225,607855) laminin subunit al (3122) 613 104.5 5.8e-21
XP_005267039 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3206) 613 104.5 5.9e-21
XP_011534122 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3208) 613 104.5 5.9e-21
XP_005267038 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3210) 613 104.5 5.9e-21
XP_016866340 (OMIM: 156225,607855) PREDICTED: lami (3212) 613 104.5 5.9e-21
XP_016856170 (OMIM: 608818) PREDICTED: netrin-G1 i ( 539) 583 99.3 3.7e-20
XP_011539323 (OMIM: 608818) PREDICTED: netrin-G1 i ( 539) 583 99.3 3.7e-20
XP_016856169 (OMIM: 608818) PREDICTED: netrin-G1 i ( 539) 583 99.3 3.7e-20
NP_001106697 (OMIM: 608818) netrin-G1 isoform G1a ( 539) 583 99.3 3.7e-20
>>NP_067052 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 1 precursor (628 aa)
initn: 4618 init1: 4618 opt: 4618 Z-score: 3720.1 bits: 698.5 E(85289): 1.8e-200
Smith-Waterman score: 4618; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 YCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 LEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 CTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 LNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 GSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 GSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 DCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 PCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 VHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 HVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB4 IVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
::::::::::::::::::::::::::::
NP_067 IVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
610 620
>>NP_001316630 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Homo s (591 aa)
initn: 4359 init1: 4359 opt: 4359 Z-score: 3512.6 bits: 660.0 E(85289): 6.5e-189
Smith-Waterman score: 4359; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (38-628:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATELYCFYSEN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGNLALGRKLWADTTCGQNATELYCFYSEN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 TDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAICTSKYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAICTSKYSS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHC
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVK
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 IKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKLIVNMKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKLIVNMKSF
520 530 540 550 560 570
610 620
pF1KB4 VQHWKPSLGRKVMDILKRECK
:::::::::::::::::::::
NP_001 VQHWKPSLGRKVMDILKRECK
580 590
>>NP_001316631 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 3 [Homo s (591 aa)
initn: 4359 init1: 4359 opt: 4359 Z-score: 3512.6 bits: 660.0 E(85289): 6.5e-189
Smith-Waterman score: 4359; 100.0% identity (100.0% similar) in 591 aa overlap (38-628:1-591)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATELYCFYSEN
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGNLALGRKLWADTTCGQNATELYCFYSEN
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 TDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYF
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 THLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAICTSKYSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 THLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAICTSKYSS
100 110 120 130 140 150
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQH
160 170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHC
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 APLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 APLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTE
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 GQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVA
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVK
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 IKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKLIVNMKSF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKLIVNMKSF
520 530 540 550 560 570
610 620
pF1KB4 VQHWKPSLGRKVMDILKRECK
:::::::::::::::::::::
NP_001 VQHWKPSLGRKVMDILKRECK
580 590
>>NP_001316629 (OMIM: 610401) netrin-4 isoform 2 precurs (605 aa)
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10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
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NP_001 IVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
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: ::. :. . . :: ::. :. : : : . . ..: : ::::
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. :. :::::::::.:::::. ::. :::::...::.:::::: :.::: .: :.:
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:. .:: :: :.::. : : :::::.::.: . :.::: ..:. :::::::.
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...: .. . : : .. .::.::..:.:.::: :::..: :: :: .. :
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::::.:::.::: : .:. : .:.: ::. :.:... : :. :.:: :. .::::.
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:. :.:: :::::::::::: :. :..::: .:. .: . :. :. :.: :.::
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. .. : :.: .: :: .: :..:: : :.. ... .::. : : :.
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460 470 480 490 500
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:: :: : .. . . .:. . : . . : : : . .::.
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: :. . .:
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: :. : :.: : ... . .:..: : :. : :. :. :
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.:::::: : . : : .:: : :. :.:: :.: : :. .. :
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:.:: : : : :. : : . :: . . : : :: : ::: : ::.: .. :
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:.::.: .. :: :: :.. ::.
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>--
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: ::: : :.: . ..:
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: : :: . : . : . . ... : : : :. :: :.:: :. .. ...
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.: ::.:. . : :. :. .:.: : :: .:: :..:. .:: : ::
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. . . : ::. . :: :.:
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pF1KB4 ECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTL
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:. :::::::::.:::::. ::. :::::...::.:::::: :.::: .: :.: :
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pF1KB4 LEDDVVKK--GAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
. .:: :: :.::. : : :::::.::.: . :.::: ..:. :::::::..
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..: .. . : : .. .::.::..:.:.::: :::..: :: :: .. :
NP_002 FVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNE-EVEG---
240 250 260 270 280 290
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::::.:::.::: : .:. : .:.: ::. :.:... : :. :.:: :. .::::. :
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. :.:: :::::::::::: :. :..::: .:. .: . :. :. :.: :.::
NP_002 YLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGI
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. .. : :.: .: :: .: :..:: : :.. ... .::. : : :.
NP_002 CD-SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGG
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pF1KB4 --CDPITGDCISSHTDIDWYHE--VPDFRPVHNKSEPAWEWE-DAQGF---SALLHSGKC
:: :: : .. . . .:. . : . . : : : . .::.:
NP_002 NPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQC
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pF1KB4 ECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTL
:. . .:
NP_002 SCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFV
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>--
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: ::: : :.: . ..:
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: : :: . : . : . . ... : : : :. :: :.:: :. .. ...
NP_002 RKCVCN-YLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCL-CLPNVIGQNCDRCAPNTWQ-----LASG
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pF1KB4 DACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPC
.: ::.:. . : :. :. .:.: : :: .:: :..:. .:: : :: :
NP_002 TGCDPCNCNAAHS-FGPS-----CNEFTGQCQCMPGFGGRTCSECQELFWGDPDVECRAC
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pF1KB4 DC------AGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHS
:: . .:: ::.:.
NP_002 DCDPRGIETPQCDQSTGQCVCVEGVEGPRCDKCTRGYSGVFPDCTPCHQCFALWDVIIAE
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>--
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pF1KB4 KRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHA-----DQCIP-VHGFRPVKA-
:.: : .. ..: : . :: :
NP_002 FSISALLHQTGLACECDPQGSLSSVCDPNGGQCQCRPNVVGRTCNRCAPGTFGFGPSGCK
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pF1KB4 PGTFHM----------VHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTC
: :. : :.: : ... . .:..: : :. : :. :. :
NP_002 PCECHLQGSVNAFCNPVTGQCHCFQGVYARQCDRCLP-----------GHWGFPS-CQPC
820 830 840 850 860
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pF1KB4 KCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPF-SAPDA
.:::::: : . : : .:: : :. :.:: :.: : :. .. :
NP_002 QCNGHADDC-----------DPVTGECLNCQDYTMGHNCERCLAGYYGD---PIIGSGDH
870 880 890 900 910
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pF1KB4 CKPCSCHPVG--SAVLPANSVTFCDPSNGD--CPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGF-GDYG-
:.:: : : : :. : : . :: . . : : :: : ::: : ::.: .. :
NP_002 CRPCPC-PDGPDSGRQFARSC-YQDPVTLQLACVCDPGYIGSRCDDCASGYFGNPSEVGG
920 930 940 950 960 970
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pF1KB4 -CRPCDCAGS--------CDPITGDCISS--HTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDA
:.::.: .. :: :: :.. ::.
NP_002 SCQPCQCHNNIDTTDPEACDKETGRCLKCLYHTEGEHCQFCRFGYYGDALQQDCRKCVCN
980 990 1000 1010 1020 1030
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 QGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKS
NP_002 YLGTVQEHCNGSDCQCDKATGQCLCLPNVIGQNCDRCAPNTWQLASGTGCDPCNCNAAHS
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...: .. . : : .. .::.::..:.:.::: :::..: :: :: .. :
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. : .. :. ... .::.:..::.:::::::::..: :.. .: . :
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. . .:.::::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...:
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. .:. .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::..
NP_001 ITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRIN
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pF1KB4 DTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFC-
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NP_001 DFTIAIHYETQSAADWTVQIVVNPPGGSEHCIPKTLQSKPQSFALPAATRIMLLPTPICL
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. .. : :. .:... . : .: . . . :. . :.. :.:
NP_001 EPDVQYSIDVYFSQPLQGESHAHSHVLVDSLGLIPQINSLENFCSKQDLDEYQLHNCVEI
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NP_001 ASAMGPQVLPGACERLIISMSAKLHDGAVACKCHPQGSVG-SSCSRLGGQCQ-CKPLVVG
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. :.::. : : :: . .:.:: ::: :: . : :: .:.:::. :.:
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::::::..::.:: .:.:
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>>XP_011514282 (OMIM: 616380) PREDICTED: laminin subunit (1564 aa)
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