Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4582
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4582, 628 aa
1>>>pF1KB4582 628 - 628 aa - 628 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.4086+/-0.00121; mu= 15.6041+/- 0.073
mean_var=149.3945+/-29.221, 0's: 0 Z-trim(108.1): 89 B-trim: 0 in 0/48
Lambda= 0.104932
statistics sampled from 9893 (9977) to 9893 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.66), E-opt: 0.2 (0.306), width: 16
Scan time: 1.920
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12 ( 628) 4618 711.6 7.8e-205
CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786) 1284 207.4 1.4e-52
CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 ( 772) 1263 203.8 7e-52
CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761) 1263 204.2 1.2e-51
CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798) 1256 203.2 2.6e-51
CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1 (1172) 1007 165.3 4.3e-40
CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 ( 604) 804 134.2 4.9e-31
CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277) 811 136.1 7.3e-31
CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333) 811 136.1 7.4e-31
CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695) 803 134.9 1.8e-30
CCDS5138.1 LAMA2 gene_id:3908|Hs108|chr6 (3122) 613 106.1 7.5e-22
CCDS44180.1 NTNG1 gene_id:22854|Hs108|chr1 ( 539) 583 100.7 5.3e-21
CCDS10469.1 NTN3 gene_id:4917|Hs108|chr16 ( 580) 556 96.6 9.6e-20
CCDS1516.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (1546) 540 94.7 9.9e-19
CCDS31025.1 USH2A gene_id:7399|Hs108|chr1 (5202) 540 95.3 2.2e-18
CCDS33068.1 NTN5 gene_id:126147|Hs108|chr19 ( 489) 522 91.4 3e-18
CCDS6946.1 NTNG2 gene_id:84628|Hs108|chr9 ( 530) 499 88.0 3.6e-17
CCDS30785.1 NTNG1 gene_id:22854|Hs108|chr1 ( 438) 359 66.7 7.5e-11
>>CCDS9054.1 NTN4 gene_id:59277|Hs108|chr12 (628 aa)
initn: 4618 init1: 4618 opt: 4618 Z-score: 3790.9 bits: 711.6 E(32554): 7.8e-205
Smith-Waterman score: 4618; 100.0% identity (100.0% similar) in 628 aa overlap (1-628:1-628)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATEL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALGRKLWADTTCGQNATEL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 YCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 YCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHREKIQLD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVVKKGAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRND
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 CTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRND
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 LNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 GSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 GSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 DCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDC
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 PCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 VHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGT
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 HVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGKL
550 560 570 580 590 600
610 620
pF1KB4 IVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS90 IVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
610 620
>>CCDS5750.1 LAMB1 gene_id:3912|Hs108|chr7 (1786 aa)
initn: 1357 init1: 346 opt: 1284 Z-score: 1057.7 bits: 207.4 E(32554): 1.4e-52
Smith-Waterman score: 1313; 40.5% identity (63.2% similar) in 519 aa overlap (30-514:30-537)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRC-EKACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA
: : .: : :.: .:: :: . .::: .
CCDS57 MGLLQLLAFSFLALCRARVRAQEPEFSYGCAEGSCYPATGDLLIGRAQKLSVTSTCGLHK
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-P-SAMAD---SSFRFPRT--WWQSAE
: ::. :. . . :: ::. :. : : : . . ..: : :::: .
CCDS57 PEPYCIVSHLQE----DKKCFICNSQDPYHETLNPDSHLIENVVTTFAPNRLKIWWQSEN
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160
pF1KB4 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATF-G
:. :::::::::.:::::. ::. :::::...::.:::::: :.::: .: :.: :
CCDS57 GVENVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLIERSSDFGKTWGVYRYFAYDCEASFPG
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LEDDVVKK--GAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
. .:: :: :.::. : : :::::.::.: . :.::: ..:. :::::::..
CCDS57 ISTGPMKKVDDIICDSRYSDIEPSTEGEVIFRALDPAFKIEDPYSPRIQNLLKITNLRIK
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFH
..: .. . : : .. .::.::..:.:.::: :::..: :: :: .. :
CCDS57 FVKLHTLGDNLLDSRMEIREKYYYAVYDMVVRGNCFCYGHASECAPVDGFNE-EVEG---
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 MVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV
::::.:::.::: : .:. : .:.: ::. :.:... : :. :.:: :. .::::. :
CCDS57 MVHGHCMCRHNTKGLNCELCMDFYHDLPWRPAEGRNS--NACKKCNCNEHSISCHFDMAV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 WEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPA
. :.:: :::::::::::: :. :..::: .:. .: . :. :. :.: :.::
CCDS57 YLATGNVSGGVCDDCQHNTMGRNCEQCKPFYYQHPERDIRDPNFCERCTCDPAGSQNEGI
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450
pF1KB4 NSVTFCDPSNG----DCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGD---YGCRPCDCA--GS----
. .. : :.: .: :: .: :..:: : :.. ... .::. : : :.
CCDS57 CD-SYTDFSTGLIAGQCRCKLNVEGEHCDVCKEGFYDLSSEDPFGCKSCACNPLGTIPGG
420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB4 --CDPITGDCISSHTDIDWYHE--VPDFRPVHNKSEPAWEWE-DAQGF---SALLHSGKC
:: :: : .. . . .:. . : . . : : : . .::.:
CCDS57 NPCDSETGHCYCKRLVTGQHCDQCLPEHWGLSNDLDGCRPCDCDLGGALNNSCFAESGQC
470 480 490 500 510 520
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 ECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTL
:. . .:
CCDS57 SCRPHMIGRQCNEVEPGYYFATLDHYLYEAEEANLGPGVSIVERQYIQDRIPSWTGAGFV
530 540 550 560 570 580
>>CCDS83218.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (772 aa)
initn: 1165 init1: 382 opt: 1263 Z-score: 1044.9 bits: 203.8 E(32554): 7e-52
Smith-Waterman score: 1280; 41.8% identity (67.6% similar) in 466 aa overlap (30-463:23-476)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK-ACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA
:.. ::.: :.: .:: .: :..::: .
CCDS83 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH-LPSAMADS----SFRFPRT--WWQSAE
.. ::. : : .: :: :.. .:. . :.. . ::. : :::: .
CCDS83 AQKYCILSY---LEGEQ-KCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSEN
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGL
. . .:.::::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...:
CCDS83 GLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB4 EDDVVKKGA---ICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
. .:. .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::..
CCDS83 ITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LLKRQSC--PCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRP--VKAP
. : .. :. ... .::.:..::.:::::::::..: :.. .: . :
CCDS83 FTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKY-YYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCH
: ::::.:.:.::: : .:..: ...: ::. ::: . : ::.:.::.:.. ::
CCDS83 G---MVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQD---NACRSCSCNSHSSRCH
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 FDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGS
::.... :::. :::::.:::::::::.:.::.: :::: . .: : :: :: : : :.
CCDS83 FDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB4 AVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG---DYGCRPCDCA--G
. . :. ::. :.: :: .: : .::.: ...:.. ::.:::: :
CCDS83 -ISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLG
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB4 S-----CDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCEC
: :: ::.:.
CCDS83 SLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPK
470 480 490 500 510 520
>>CCDS34732.1 LAMB4 gene_id:22798|Hs108|chr7 (1761 aa)
initn: 1292 init1: 382 opt: 1263 Z-score: 1040.6 bits: 204.2 E(32554): 1.2e-51
Smith-Waterman score: 1280; 41.8% identity (67.6% similar) in 466 aa overlap (30-463:23-476)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK-ACNPRMGNLALGR--KLWADTTCGQNA
:.. ::.: :.: .:: .: :..::: .
CCDS34 MQFQLTLFLHLGWLSYSKAQDDCNRGACHPTTGDLLVGRNTQLMASSTCGLSR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH-LPSAMADS----SFRFPRT--WWQSAE
.. ::. : : .: :: :.. .:. . :.. . ::. : :::: .
CCDS34 AQKYCILSY---LEGEQ-KCFICDSRFPYDPYDQPNSHTIENVIVSFEPDREKKWWQSEN
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGL
. . .:.::::: : :.:::. ::. :::::...:: :.:..:: .:::: .:...:
CCDS34 GLDHVSIRLDLEALFRFSHLILTFKTFRPAAMLVERSTDYGHNWKVFKYFAKDCATSFPN
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB4 EDDVVKKGA---ICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
. .:. .: ::::. : :::::..:.:.: .. ::::: .:. . .::::..
CCDS34 ITSGQAQGVGDIVCDSKYSDIEPSTGGEVVLKVLDPSFEIENPYSPYIQDLVTLTNLRIN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LLKRQSC--PCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRP--VKAP
. : .. :. ... .::.:..::.:::::::::..: :.. .: . :
CCDS34 FTKLHTLGDALLGRRQNDSLDKY-YYALYEMIVRGSCFCNGHASECRPMQKMRGDVFSPP
230 240 250 260 270 280
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 GTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE-AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCH
: ::::.:.:.::: : .:..: ...: ::. ::: . : ::.:.::.:.. ::
CCDS34 G---MVHGQCVCQHNTDGPNCERCKDFFQDAPWRPAADLQD---NACRSCSCNSHSSRCH
290 300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 FDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGS
::.... :::. :::::.:::::::::.:.::.: :::: . .: : :: :: : : :.
CCDS34 FDMTTYLASGGLSGGVCEDCQHNTEGQHCDRCRPLFYRDPLKTISDPYACIPCECDPDGT
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450
pF1KB4 AVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG---DYGCRPCDCA--G
. . :. ::. :.: :: .: : .::.: ...:.. ::.:::: :
CCDS34 -ISGGICVSHSDPALGSVAGQCLCKENVEGAKCDQCKPNHYGLSATDPLGCQPCDCNPLG
410 420 430 440 450 460
460 470 480 490 500
pF1KB4 S-----CDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCEC
: :: ::.:.
CCDS34 SLPFLTCDVDTGQCLCLSYVTGAHCEECTVGYWGLGNHLHGCSPCDCDIGGAYSNVCSPK
470 480 490 500 510 520
>>CCDS2789.1 LAMB2 gene_id:3913|Hs108|chr3 (1798 aa)
initn: 1428 init1: 366 opt: 1256 Z-score: 1034.8 bits: 203.2 E(32554): 2.6e-51
Smith-Waterman score: 1293; 39.4% identity (61.3% similar) in 553 aa overlap (7-514:23-549)
10 20 30 40
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNLALG
:: . . :.. : : : : . .: : :.: .:
CCDS27 MELTSRERGRGQPLPWELRLGLLLSVLAATLAQAPAPDVPGCS---RGSCYPATGDLLVG
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB4 R--KLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHL-PSAM----ADS
: .: :..::: :. . ::. :. : . :: :.. : :. : . . .
CCDS27 RADRLTASSTCGLNGPQPYCIVSHLQD----EKKCFLCDSRRPFSARDNPHSHRIQNVVT
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 SFRFPR--TWWQSAEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWK
:: : .:::: . . :::::::::.:::::. ::. :::::...:: :::.::.
CCDS27 SFAPQRRAAWWQSENGIPAVTIQLDLEAEFHFTHLIMTFKTFRPAAMLVERSADFGRTWH
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200
pF1KB4 PYKYFATNCSATF-GLE-------DDVVKKGAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALSPPYDT
:.::. .:.: : :. :::: : :.:: : : ::::...:.:
CCDS27 VYRYFSYDCGADFPGVPLAPPRHWDDVV-----CESRYSEIEPSTEGEVIYRVLDPAIPI
180 190 200 210 220
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 ENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGH
.:::...:. ::::::::.: . .. . : .: .. .::.:...:.:.::: ::
CCDS27 PDPYSSRIQNLLKITNLRVNLTRLHTLGDNLLDPRREIREKYYYALYELVVRGNCFCYGH
230 240 250 260 270 280
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 ADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAA-DGKTGAP
:..: :. : :..: : :::: :.::::: : .:..: .: : ::. : ::.. :
CCDS27 ASECAPAPG-APAHAEG---MVHGACICKHNTRGLNCEQCQDFYRDLPWRPAEDGHSHA-
290 300 310 320 330 340
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 NECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPF
:: :.:.::. .::::. :. :::: :::::: ::::: :..:. :.: :::: . .
CCDS27 --CRKCECHGHTHSCHFDMAVYLASGNVSGGVCDGCQHNTAGRHCELCRPFFYRDPTKDL
350 360 370 380 390 400
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 SAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPS----NGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFG
: .:. :.: :.:: . . ::. .:.: :: :.: ::..: :..:..
CCDS27 RDPAVCRSCDCDPMGSQD-GGRCDSHDDPALGLVSGQCRCKEHVVGTRCQQCRDGFFGLS
410 420 430 440 450 460
450 460 470
pF1KB4 --DY-GCRPCDCA------GS--CDPITGDC----ISSHTDID------W--YHEVPDFR
: ::: :.: :: ::: .:.: . . : : :.. :
CCDS27 ISDRLGCRRCQCNARGTVPGSTPCDPNSGSCYCKRLVTGRGCDRCLPGHWGLSHDLLGCR
470 480 490 500 510 520
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 PVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKG
: : . . .: .:.:.:... .:
CCDS27 PCDCDVGGALDPQCDEG------TGQCHCRQHMVGRRCEQVQPGYFRPFLDHLIWEAEDT
530 540 550 560 570
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 THVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIRTGK
CCDS27 RGQVLDVVERLVTPGETPSWTGSGFVRLQEGQTLEFLVASVPKAMDYDLLLRLEPQVPEQ
580 590 600 610 620 630
>>CCDS1487.1 LAMB3 gene_id:3914|Hs108|chr1 (1172 aa)
initn: 1040 init1: 296 opt: 1007 Z-score: 833.3 bits: 165.3 E(32554): 4.3e-40
Smith-Waterman score: 1138; 37.0% identity (60.7% similar) in 522 aa overlap (20-510:11-504)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK-ACNPRMGNLALGRK--LWADTTCGQNA
: :. ... : . :: : .:.: .:: : :..::: .
CCDS14 MRPFFLLCFALPGLLHAQQACSRGACYPPVGDLLVGRTRFLRASSTCGLTK
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPH--LAHLPSAMADSSFRFPRTWWQSAEDVHRE
: :: :. : :: ::.. :: .: .:.:: : :::: .::.
CCDS14 PETYC-----TQYGEWQMKCCKCDSRQPHNYYSHRVENVASSS--GPMRWWQSQNDVNPV
60 70 80 90 100
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 KIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYFATNCSATFGLEDDVV
..::::. .: . .... :..: ::.:...::.::::::. :.:.:..:..:: :
CCDS14 SLQLDLDRRFQLQEVMMEFQGPMPAGMLIERSSDFGKTWRVYQYLAADCTSTF----PRV
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220
pF1KB4 KKG-------AICTSKYSSPFP-CTGGEVIFKALSPPYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQ
..: . : : . : .::.: .. .. : :.:: .::::::.
CCDS14 RQGRPQSWQDVRCQSLPQRPNARLNGGKVQLNLMDLVSGIPATQSQKIQEVGEITNLRVN
170 180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFH
. . : ::. . :. . ::. .. ..:::::.::::.: : : .:.:
CCDS14 FTRLAPVP-QRG--YHPPSAY--YAVSQLRLQGSCFCHGHADRCAPKPG--ASAGPSTAV
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 MVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV
.:: :.:.::::: .:..:::.::.:::. :.:. . .::. : ::::..::::: :
CCDS14 QVHDVCVCQHNTAGPNCERCAPFYNNRPWRPAEGQDA--HECQRCDCNGHSETCHFDPAV
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 WEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRP-FSAPDACKPCSCHPVGSAVLP
. :: . :::::.:. .:::. :.::. ..:. ::: : ..: : : : :. .:
CCDS14 FAASQGAYGGVCDNCRDHTEGKNCERCQLHYFRN-RRPGASIQETCISCECDPDGA--VP
340 350 360 370 380
410 420 430 440 450
pF1KB4 ANSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGF---GDYGCRPCDCA--GS-----CD
. ::: .:.: :: : :.::: : :. :. . ::. ::: :: ::
CCDS14 GAP---CDPVTGQCVCKEHVQGERCDLCKPGFTGLTYANPQGCHRCDCNILGSRRDMPCD
390 400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KB4 PITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNK------SEP-AWEWEDAQGFSALLHSGKCECK
.: :. . . . . : : : :: : . ... . . .:.: :.
CCDS14 EESGRCLCLPNVVG--PKCDQCAPYHWKLASGQGCEPCACDPHNSLSPQCNQFTGQCPCR
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 EQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPE
:
CCDS14 EGFGGLMCSAAAIRQCPDRTYGDVATGCRACDCDFRGTEGPGCDKASGRCLCRPGLTGPR
510 520 530 540 550 560
>>CCDS11148.1 NTN1 gene_id:9423|Hs108|chr17 (604 aa)
initn: 744 init1: 351 opt: 804 Z-score: 670.7 bits: 134.2 E(32554): 4.9e-31
Smith-Waterman score: 1094; 31.3% identity (58.4% similar) in 652 aa overlap (1-628:9-598)
10 20 30 40
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSR---CE------KACNPRMGNLAL
... : . : : . . ::: :: ... : . : : . : :.
CCDS11 MMRAVWEALAALAAVACLVGAVRGGPGLSMFAGQAAQPDPCSDENGHPRRCIPDFVNAAF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 GRKLWADTTCGQNATELYCFYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAMADSSFRFPR
:. . ...:::. .. :: :: . : .: :::. :. :: :. ..: .
CCDS11 GKDVRVSSTCGRPPAR-YCVVSERGEERLR--SCHLCNASDPKKAHPPAFLTDLNNPHNL
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 TWWQSAEDV---HREKIQLDLEAEFYFTHLIVMFKSPRPAAMVLDRSQDFGKTWKPYKYF
: ::: . . : . :.: .: :.. ..: :::: .:.. .:.:.:.:: :....
CCDS11 TCWQSENYLQFPHNVTLTLSLGKKFEVTYVSLQFCSPRPESMAIYKSMDYGRTWVPFQFY
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210
pF1KB4 ATNCSATFGLED--DVVKKG---AICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALS--PP-YDTENPYS
.:.: .. ..:.. :.::..... : .:: . :..:. : .: .: :
CCDS11 STQCRKMYNRPHRAPITKQNEQEAVCTDSHTDMRPLSGGLIAFSTLDGRPSAHDFDN--S
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 AKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFTHYAIYDFIVKGSCFCNGHADQCI
.:. . :..:: . . .. . .: .: . ::. :. : : : ::::: .:.
CCDS11 PVLQDWVTATDIRVAFSRLHTFGDENEDDSELARDSYFYAVSDLQVGGRCKCNGHAARCV
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 PVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWEAADGKTGAPNECRTC
. : : :.::::: .:..: :.. ::::. : .. . ::: .:
CCDS11 RDRDDSLV------------CDCRHNTAGPECDRCKPFHYDRPWQRATAREA--NECVAC
300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 KCNGHADTCHFDVNVWEASGNRSGGVCDDCQHNTEGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDAC
.:: :: :.:...... :: .::::: .:.::: :..:. :: :.:::. .:.. ::
CCDS11 NCNLHARRCRFNMELYKLSGRKSGGVCLNCRHNTAGRHCHYCKEGYYRDMGKPITHRKAC
350 360 370 380 390 400
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 KPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGRRCDRCMVGYWGFGDYGCRPCDCA
: :.:::::.: :. ..:.:::: ::.: :.:: ::
CCDS11 KACDCHPVGAAG------KTCNQTTGQCPCKDGVTGITCNRCAKGYQQ------------
410 420 430 440
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 GSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQT
: .::. :: ..: : . . . : :: ... :. ..
CCDS11 -SRSPIA-PCI----------KIP-VAPPTTAASSVEEPEDCDSY--------CKASKGK
450 460 470 480
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 LG-NAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESW
: : : .: : .:...:.::.: : . .:.: .: :. .: :: ..:. .:
CCDS11 LKINMKKYC--KKDYAVQIHILKADKAGDWWKFTVNIISVYKQGTSRIRRGDQSLWIRS-
490 500 510 520 530
580 590 600 610 620
pF1KB4 TDRGCTCPILNPGLEYLVAGH-EDI--RTGKLIVNMKSFVQHWKPSLGRKVMDILKRECK
: .: :: ..: .::. :. :: ..: .... .:.: .:. . .:.. . .:: :
CCDS11 RDIACKCPKIKPLKKYLLLGNAEDSPDQSG-IVADKSSLVIQWRDTWARRLRKFQQREKK
540 550 560 570 580 590
CCDS11 GKCKKA
600
>>CCDS45838.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3277 aa)
initn: 729 init1: 214 opt: 811 Z-score: 667.5 bits: 136.1 E(32554): 7.3e-31
Smith-Waterman score: 885; 30.6% identity (56.2% similar) in 559 aa overlap (7-520:26-548)
10 20 30 40
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNL
: .: .: ..: ...::.: .: . ::
CCDS45 MAAAARPRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLS------LHPTYFNL
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KB4 ALGRKLWADTTCGQNAT-------ELYCFY-----SENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH
: . ..:: .:::. . :::: . .. : . :: ::. :. ::
CCDS45 AEAARIWATATCGERGPGEGRPQPELYCKLVGGPTAPGSGHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 LPSAMADSSFRFPRTWWQS-----AEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMF-KSPRPAAMV
. :.: : :::: . . .: .. ::: :. ..... : .:::: :
CCDS45 PVTNAIDGSER----WWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWV
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB4 LDRSQDFGKTWKPYKYFA---TNCSATFGLEDDVV---KKGAICTSKYSSPFPCTGGEVI
:.:: :::.:..:..::: ..: :: : ... ..:...:: : .:::.
CCDS45 LERSVDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVV
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 FKALSPPYDTEN-PYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFT---HYAI
. .. ..: .: ..: : ::.:...:. .. . . .. : .:.:
CCDS45 VSLINGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 YDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYND
:. . :.: :::::. : .. : . .: :.:.: : :..: ::.
CCDS45 KDISIGGQCVCNGHAEVC-------NINNPEKLF----RCECQHHTCGETCDRCCTGYNQ
300 310 320 330
320 330 340 350 360
pF1KB4 RPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV--WEASGNRSG-----GVCDDCQHNT
: :. : . . .::..:.:.:::..:..: .: .:: : .: ::: .:::::
CCDS45 RRWRPAAWEQS--HECEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNT
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGV
: :..: :.:: : .:::.: :::: : . . :. ..: : :::.
CCDS45 AGVNCEQCAKGYYRPYGVPVDAPDGCIPCSCDP--------EHADGCEQGSGRCHCKPNF
400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 AGRRCDRCMVGYWGFGDYGCR----PCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVH
: :..: .::..: . : : . .: ::..:: . : . .:.. .:
CCDS45 HGDNCEKCAIGYYNF-PFCLRIPIFPVSTPSSEDPVAGDI--KGCDCNLEGVLPEICDAH
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530
pF1KB4 NKS--EPAWEWE--DA--QGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAH
.. .:. : :. .:: .. : :. .::. . :
CCDS45 GRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWCS--ALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQ
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 DKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIR
CCDS45 RCDRCLSGAYDFPHCQGSSSACDPAGTINSNLGYCQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKEN
570 580 590 600 610 620
>>CCDS42419.1 LAMA3 gene_id:3909|Hs108|chr18 (3333 aa)
initn: 729 init1: 214 opt: 811 Z-score: 667.4 bits: 136.1 E(32554): 7.4e-31
Smith-Waterman score: 885; 30.6% identity (56.2% similar) in 559 aa overlap (7-520:26-548)
10 20 30 40
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEKACNPRMGNL
: .: .: ..: ...::.: .: . ::
CCDS42 MAAAARPRGRALGPVLPPTPLLLLVLRVLPACGATARDPGAAAGLS------LHPTYFNL
10 20 30 40 50
50 60 70 80
pF1KB4 ALGRKLWADTTCGQNAT-------ELYCFY-----SENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAH
: . ..:: .:::. . :::: . .. : . :: ::. :. ::
CCDS42 AEAARIWATATCGERGPGEGRPQPELYCKLVGGPTAPGSGHTIQGQFCDYCNSEDPRKAH
60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 LPSAMADSSFRFPRTWWQS-----AEDVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMF-KSPRPAAMV
. :.: : :::: . . .: .. ::: :. ..... : .:::: :
CCDS42 PVTNAIDGSER----WWQSPPLSSGTQYNRVNLTLDLGQLFHVAYILIKFANSPRPDLWV
120 130 140 150 160 170
150 160 170 180 190
pF1KB4 LDRSQDFGKTWKPYKYFA---TNCSATFGLEDDVV---KKGAICTSKYSSPFPCTGGEVI
:.:: :::.:..:..::: ..: :: : ... ..:...:: : .:::.
CCDS42 LERSVDFGSTYSPWQYFAHSKVDCLKEFGREANMAVTRDDDVLCVTEYSRIVPLENGEVV
180 190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB4 FKALSPPYDTEN-PYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFT---HYAI
. .. ..: .: ..: : ::.:...:. .. . . .. : .:.:
CCDS42 VSLINGRPGAKNFTFSHTLREFTKATNIRLRFLRTNTLLGHLISKAQRDPTVTRRYYYSI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 YDFIVKGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAPGTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYND
:. . :.: :::::. : .. : . .: :.:.: : :..: ::.
CCDS42 KDISIGGQCVCNGHAEVC-------NINNPEKLF----RCECQHHTCGETCDRCCTGYNQ
300 310 320 330
320 330 340 350 360
pF1KB4 RPWEAADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNV--WEASGNRSG-----GVCDDCQHNT
: :. : . . .::..:.:.:::..:..: .: .:: : .: ::: .:::::
CCDS42 RRWRPAAWEQS--HECEACNCHGHASNCYYDPDVERQQASLNTQGIYAGGGVCINCQHNT
340 350 360 370 380 390
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EGQYCQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGV
: :..: :.:: : .:::.: :::: : . . :. ..: : :::.
CCDS42 AGVNCEQCAKGYYRPYGVPVDAPDGCIPCSCDP--------EHADGCEQGSGRCHCKPNF
400 410 420 430 440
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 AGRRCDRCMVGYWGFGDYGCR----PCDCAGSCDPITGDCISSHTDIDWYHEVPDFRPVH
: :..: .::..: . : : . .: ::..:: . : . .:.. .:
CCDS42 HGDNCEKCAIGYYNF-PFCLRIPIFPVSTPSSEDPVAGDI--KGCDCNLEGVLPEICDAH
450 460 470 480 490 500
490 500 510 520 530
pF1KB4 NKS--EPAWEWE--DA--QGFSALLHSGKCECKEQTLGNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAH
.. .:. : :. .:: .. : :. .::. . :
CCDS42 GRCLCRPGVEGPRCDTCRSGFYSFPICQACWCS--ALGSYQMPCSSVTGQCECRPGVTGQ
510 520 530 540 550 560
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 DKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTDRGCTCPILNPGLEYLVAGHEDIR
CCDS42 RCDRCLSGAYDFPHCQGSSSACDPAGTINSNLGYCQCKLHVEGPTCSRCKLLYWNLDKEN
570 580 590 600 610 620
>>CCDS33502.1 LAMA5 gene_id:3911|Hs108|chr20 (3695 aa)
initn: 660 init1: 206 opt: 803 Z-score: 660.4 bits: 134.9 E(32554): 1.8e-30
Smith-Waterman score: 869; 30.5% identity (54.1% similar) in 586 aa overlap (19-524:26-578)
10 20 30 40
pF1KB4 MGSCARLLLLWGCTVVAAGLSGVAGVSSRCEK----ACNPRMGNLALGRKLWA
::. .... .: : . .: . ::: : .. :
CCDS33 MAKRLCAGSALCVRGPRGPAPLLLVGLALLGAARAREEAGGGFSLHPPYFNLAEGARIAA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB4 DTTCGQNA--------TE-LYC------FYSENTDLTCRQPKCDKCNAAYPHLAHLPSAM
..:::..: :: ::: . . . : : :: :.:: . :: :
CCDS33 SATCGEEAPARGSPRPTEDLYCKLVGGPVAGGDPNQTIRGQYCDICTAANSNKAHPASNA
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140
pF1KB4 ADSSFRFPRTWWQSAE-----DVHREKIQLDLEAEFYFTHLIVMF-KSPRPAAMVLDRSQ
:.. : :::: . .. .. ::: :. ..... : .:::: ::.::.
CCDS33 IDGTER----WWQSPPLSRGLEYNEVNVTLDLGQVFHVAYVLIKFANSPRPDLWVLERSM
130 140 150 160 170
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 DFGKTWKPYKYFAT---NCSATFG---LEDDVVKKGAICTSKYSSPFPCTGGEVIFKALS
:::.:..:...::. .: :: :: . .::::..:: : .::.. . ..
CCDS33 DFGRTYQPWQFFASSKRDCLERFGPQTLERITRDDAAICTTEYSRIVPLENGEIVVSLVN
180 190 200 210 220 230
210 220 230 240 250
pF1KB4 P-PYDTENPYSAKVQEQLKITNLRVQLLKRQSCPCQRNDLNEEPQHFT---HYAIYDFIV
: . :: ..: : ::.:...:. .. . . : .:.: :. .
CCDS33 GRPGAMNFSYSPLLREFTKATNVRLRFLRTNTLLGHLMGKALRDPTVTRRYYYSIKDISI
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB4 KGSCFCNGHADQCIPVHGFRPVKAP-GTFHMVHGKCMCKHNTAGSHCQHCAPLYNDRPWE
: : :.:::: : .: : :.. .: :.::: :. :..: : .:..::.
CCDS33 GGRCVCHGHADAC-------DAKDPTDPFRL---QCTCQHNTCGGTCDRCCPGFNQQPWK
300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 AADGKTGAPNECRTCKCNGHADTCHFDVNVWEASGNRS-------GGVCDDCQHNTEGQY
: .... :::..:.: ::: :..: .: . ...: :::: ::::.: :
CCDS33 PATANSA--NECQSCNCYGHATDCYYDPEVDRRRASQSLDGTYQGGGVCIDCQHHTTGVN
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 CQRCKPGFYRDLRRPFSAPDACKPCSCHPVGSAVLPANSVTFCDPSNGDCPCKPGVAGRR
:.:: :::::. .:...: .:. :.:. : .. :. .: : :.:. .:.:
CCDS33 CERCLPGFYRSPNHPLDSPHVCRRCNCE---SDFTDGT----CEDLTGRCYCRPNFSGER
410 420 430 440 450
440 450 460
pF1KB4 CDRCMVGYWGFGDYGCRP--------------------CDC--AGS----C--DPITGDC
:: : :. :: .: : ::: ::. : :: .: :
CCDS33 CDVCAEGFTGFP--SCYPTPSSSNDTREQVLPAGQIVNCDCSAAGTQGNACRKDPRVGRC
460 470 480 490 500 510
470 480 490 500 510
pF1KB4 I------SSHTDI---DWYHEVPDFRPVHNKSEPAWEWEDAQGFSALLHSGKCECKEQTL
. ..: .. .: : .: . .: :. . . .:.:.:.
CCDS33 LCKPNFQGTHCELCAPGFYG--PGCQPCQCSS-PGVADDRCDP-----DTGQCRCRVGFE
520 530 540 550 560
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 GNAKAFCGMKYSYVLKIKILSAHDKGTHVEVNVKIKKVLKSTKLKIFRGKRTLYPESWTD
: . :. :
CCDS33 GATCDRCAPGYFHFPLCQLCGCSPAGTLPEGCDEAGRCLCQPEFAGPHCDRCRPGYHGFP
570 580 590 600 610 620
628 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:36:26 2016 done: Thu Nov 3 21:36:26 2016
Total Scan time: 1.920 Total Display time: 0.070
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]