Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4524
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4524, 1272 aa
1>>>pF1KB4524 1272 - 1272 aa - 1272 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 15.2870+/-0.00147; mu= -16.8785+/- 0.090
mean_var=863.3940+/-176.803, 0's: 0 Z-trim(115.4): 185 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.043649
statistics sampled from 15797 (15947) to 15797 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.74), E-opt: 0.2 (0.49), width: 16
Scan time: 5.450
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS43374.1 DIAPH1 gene_id:1729|Hs108|chr5 (1272) 8450 548.8 3.3e-155
CCDS43373.1 DIAPH1 gene_id:1729|Hs108|chr5 (1263) 8118 527.9 6.5e-149
CCDS14468.1 DIAPH2 gene_id:1730|Hs108|chrX (1096) 2352 164.7 1.2e-39
CCDS14467.1 DIAPH2 gene_id:1730|Hs108|chrX (1101) 2349 164.5 1.4e-39
CCDS73580.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 ( 849) 2081 147.5 1.4e-34
CCDS58297.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 (1112) 2081 147.6 1.6e-34
CCDS58294.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 (1123) 2081 147.7 1.7e-34
CCDS58295.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 (1147) 2081 147.7 1.7e-34
CCDS58296.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 (1182) 2081 147.7 1.7e-34
CCDS41898.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 (1193) 2081 147.7 1.7e-34
CCDS73579.1 DIAPH3 gene_id:81624|Hs108|chr13 ( 691) 1436 106.8 2e-22
CCDS9737.1 DAAM1 gene_id:23002|Hs108|chr14 (1078) 1045 82.4 7e-15
CCDS45173.1 INF2 gene_id:64423|Hs108|chr14 (1240) 884 72.3 8.7e-12
CCDS9989.2 INF2 gene_id:64423|Hs108|chr14 (1249) 884 72.3 8.7e-12
CCDS31069.2 FMN2 gene_id:56776|Hs108|chr1 (1722) 863 71.2 2.7e-11
>>CCDS43374.1 DIAPH1 gene_id:1729|Hs108|chr5 (1272 aa)
initn: 8450 init1: 8450 opt: 8450 Z-score: 2899.9 bits: 548.8 E(32554): 3.3e-155
Smith-Waterman score: 8450; 100.0% identity (100.0% similar) in 1272 aa overlap (1-1272:1-1272)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEPPGGSLGPGRGTRDKKKGRSPDELPSAGGDGGKSKKFTLKRLMADELERFTSMRIKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 MEPPGGSLGPGRGTRDKKKGRSPDELPSAGGDGGKSKKFTLKRLMADELERFTSMRIKKE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIII
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 KREMVSQYLYTSKAGMSQKESSKSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KREMVSQYLYTSKAGMSQKESSKSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLD
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 GLKSGTTIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLKSGTTIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 RNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIEIEGLIDQMIDKTKVEKSEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIEIEGLIDQMIDKTKVEKSEAK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AAELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPPSVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPPSVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPP
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 APGDSTTPPPPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLPGGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 APGDSTTPPPPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLPGGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEG
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 VGIPSPSSLPGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGIPSPSSLPGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPL
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pF1KB4 PGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKLYKPEVQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKLYKPEVQLR
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790 800 810 820 830 840
pF1KB4 RPNWSKLVAEDLSQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPNWSKLVAEDLSQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKS
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPE
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910 920 930 940 950 960
pF1KB4 PEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSV
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 TAACEELRKSESFSNLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKSTDQKMTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TAACEELRKSESFSNLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKSTDQKMTLL
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 HFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAAT
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 DEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKLSVEEFFMDLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKLSVEEFFMDLHN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 FRNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMD
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 SLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTI
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270
pF1KB4 LEEAKELVGRAS
::::::::::::
CCDS43 LEEAKELVGRAS
1270
>>CCDS43373.1 DIAPH1 gene_id:1729|Hs108|chr5 (1263 aa)
initn: 8118 init1: 8118 opt: 8118 Z-score: 2786.9 bits: 527.9 E(32554): 6.5e-149
Smith-Waterman score: 8368; 99.3% identity (99.3% similar) in 1272 aa overlap (1-1272:1-1263)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MEPPGGSLGPGRGTRDKKKGRSPDELPSAGGDGGKSKKFTLKRLMADELERFTSMRIKKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::
CCDS43 MEPPGGSLGPGRGTRDKKKGRSPDELPSAGGDGGKSKKF---------LERFTSMRIKKE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 KEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVLFEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIII
60 70 80 90 100 110
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pF1KB4 KREMVSQYLYTSKAGMSQKESSKSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 KREMVSQYLYTSKAGMSQKESSKSAMMYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 ILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLD
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pF1KB4 GLKSGTTIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 GLKSGTTIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRV
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pF1KB4 QLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 QLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLV
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pF1KB4 RNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCRHLQIEIEGLIDQMIDKTKVEKSEAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 AAELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAE
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pF1KB4 VSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPPSVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPPSVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPP
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pF1KB4 APGDSTTPPPPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLPGGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 APGDSTTPPPPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLPGGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEG
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pF1KB4 VGIPSPSSLPGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VGIPSPSSLPGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPL
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730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKLYKPEVQLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PGGPGIPPPPPFPGGPGIPPPPPGMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKLYKPEVQLR
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790 800 810 820 830 840
pF1KB4 RPNWSKLVAEDLSQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 RPNWSKLVAEDLSQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKS
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850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 VQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPE
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pF1KB4 PEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 PEQLKMLSELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSV
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970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 TAACEELRKSESFSNLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKSTDQKMTLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TAACEELRKSESFSNLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKSTDQKMTLL
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 HFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 HFLAELCENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAAT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 DEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKLSVEEFFMDLHN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 DEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKLSVEEFFMDLHN
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 FRNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 FRNMFLQAVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMD
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 SLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 SLLEALQSGAAFRRKRGPRQANRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTI
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1270
pF1KB4 LEEAKELVGRAS
::::::::::::
CCDS43 LEEAKELVGRAS
1260
>>CCDS14468.1 DIAPH2 gene_id:1730|Hs108|chrX (1096 aa)
initn: 3422 init1: 1743 opt: 2352 Z-score: 825.3 bits: 164.7 E(32554): 1.2e-39
Smith-Waterman score: 3715; 50.5% identity (72.5% similar) in 1252 aa overlap (1-1228:1-1087)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MEPPGGSL-GPGRGTRDKKKGRSPDELPSAGGDGG-----KSK-KFTLK-RLMADEL-ER
:: ::.. : : :... ::: . :::. .. :.: :.... . .::.. .:
CCDS14 MEQPGAAASGAGGGSEEPGGGRSNKR--SAGNRAANEEETKNKPKLNIQIKTLADDVRDR
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100
pF1KB4 FTSMRIKK-EKEKPNSAHR-NSSASYGDDPTAQSLQD-----VSDEQVLVLFEQMLLDMN
.::.: . .:::: : .:...... :.:: : : .:...:: :::.:. :::
CCDS14 ITSFRKSTVKKEKPLIQHPIDSQVAMSEFPAAQPLYDERSLNLSEKEVLDLFEKMMEDMN
60 70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 LNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLY-TSKAG---MSQKESSKSAMMYIQELRSGLRDMP
:::::. :::.::. ::::: ::. :.:.: :..: . :.. :..:::::. :
CCDS14 LNEEKKAPLRNKDFTTKREMVVQYISATAKSGGLKNSKHECTLSSQEYVHELRSGISDEK
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 LLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRC
::.:::::::::..::::::..:: :::. ::: :..: :.:.. . :..:....:.:
CCDS14 LLNCLESLRVSLTSNPVSWVNNFGHEGLGLLLDELEKLLDKKQQE--NIDKKNQYKLIQC
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVL
::::::::::.. .: :...:::.::.:: :::: . .:.:::.::. . :.. ...:
CCDS14 LKAFMNNKFGLQRILGDERSLLLLARAIDPKQPNMMTEIVKILSAICIVGE-ENILDKLL
240 250 260 270 280 290
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CCDS14 T
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CCDS73 QFVVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVL
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CCDS73 PKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHGNKPYL
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10 20 30
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10 20 30 40 50
40 50 60 70 80
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:: : . : : :..:.:.:: :::. :: .: .:. : . ... . .
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60 70 80 90 100 110
90 100 110 120 130 140
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:....: :::.:. ::::::.:. ::::::. ::.::: ::. : ::.: .. . : .
CCDS58 SENELLELFEKMMEDMNLNEDKKAPLREKDFSIKKEMVMQYINTASKTGSLKRSRQISPQ
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150 160 170 180 190 200
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210 220 230 240 250 260
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. ..:.:..:.::::.::...:.. .. :... ::..:.:: :::: :..:::::.
CCDS58 -KVVKKNQHKVIQCLKALMNTQYGLERIMSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAV
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270 280 290 300 310 320
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330 340 350 360 370 380
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450 460 470 480 490 500
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: :::: :. :.... ..: ::..:.:. : ::.:: ::...:.: ..: :.:..:
CCDS58 GMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKK
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:. :...::.: :.. :.:...
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::: ::: : ...::::::: : ::
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.:::::: :::::::: :: .:: .::::: : :: . ::
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:.::::: ::: .:::...:: :: :. ......::: ::.:
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...:: .:. :: :: : .: ....: :::::. :::.:::: :::: :::::::
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pF1KB4 LGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKMLSELKDEYDDLAESEQF
:.:::.::.::. .::::.:. :.:::::::::..:. :::. ::..:.::..: : :::
CCDS58 LSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQF
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pF1KB4 GVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSVTAACEELRKSESFSNLLEITLLV
:::..: ::::::.:::::::: :::.::::.:..:..::::..::.:::.:::..::.
CCDS58 VVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLM
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CCDS58 GNYMNAGSRNAQTFGFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEICEEKYPDILNFVDDLEP
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pF1KB4 VEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAATDEKDKFVEKMTSFVKDAQEQYNK
..:::.::.:.:.::: :: .:....:.....:: : .:::: ::. :: .:.:::.
CCDS58 LDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEKELETFPPPEDLHDKFVTKMSRFVISAKEQYET
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CCDS58 LSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKKREAEEKEK
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CCDS58 RVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRTPMPK
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pF1KB4 NRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTILEEAKELVGRAS
CCDS58 DVRQSLSPMSQRPVLKVCNHGNKPYL
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CCDS58 ESKMPRRKGPQHPPPPSGPEEPGEKRPKFEDMNLNEDKKAPLREKDFSIKKEMVMQYINT
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CCDS58 ASKTGSLKRSRQISPQEFIHELKMGSADERLVTCLESLRVSLTSNPVSWVESFGHEGLGL
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pF1KB4 LLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDP
:::::..: . : . . ..:.:..:.::::.::...:.. .. :... ::..:.::
CCDS58 LLDILEKLISGKIQE--KVVKKNQHKVIQCLKALMNTQYGLERIMSEERSLSLLAKAVDP
160 170 180 190 200
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pF1KB4 AVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDMNERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTTIAL
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CCDS58 RHPNMMTDVVKLLSAVCIVGE-ESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNS-VQL
210 220 230 240 250 260
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pF1KB4 KVGCLQLINALITPAEELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRVQLNVFDEQGE
.:.:.::::::.: ..::::.:::.:.:: ::...: .:. :.:. . .::.::::. :
CCDS58 QVACMQLINALVTSPDDLDFRLHIRNEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKE
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 EDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLVRNDYEARPQY
:: ..:. ::.::: :.:. .:.... .:::...:: .:.::::::::.:::: : ::
CCDS58 EDLFELSHRLEDIRAELDEAYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQY
330 340 350 360 370 380
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CCDS58 FKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFE
390 400 410 420 430 440
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pF1KB4 SELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQDLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAEVSQLTGEVA
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CCDS58 KEFTDHQETQAELQKKEA----KINELQAE-----------------LQAFKSQFGA---
450 460 470 480
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pF1KB4 KLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPPSVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPPAPGDSTTPP
::.: .
CCDS58 --------------------------------------LPADCNI---------------
490
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pF1KB4 PPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLPGGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEGVGIPSPSSL
::: :: ::: : ...::::::: :
CCDS58 ----------PLP--------PSKEGGT---------GHSALPPPPPLPSG---------
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pF1KB4 PGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPLPGGPGIPPP
:: .:::::: :::::::: :: .:: .:::
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:: : :: . :: :.::::: ::: .:::...:: :: :.
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pF1KB4 VAEDLSQDCFWTKVKEDRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKSVQKKKVK
......::: ::.:...:: .:. :: :: : .: ....: :::::. :::.:
CCDS58 RPHEMTENCFWIKVNENKYENVDLLCKLENTFCCQ---QKERREEEDIEEKKSI-KKKIK
590 600 610 620 630 640
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pF1KB4 ELKVLDSKTAQNLSIFLGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKML
::: :::: ::::::::.:::.::.::. .::::.:. :.:::::::::..:. :::. :
CCDS58 ELKFLDSKIAQNLSIFLSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSL
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pF1KB4 SELKDEYDDLAESEQFGVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSVTAACEEL
:..:.::..: : ::: :::..: ::::::.:::::::: :::.::::.:..:..::::.
CCDS58 SQFKSEYSNLCEPEQFVVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEI
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pF1KB4 RKSESFSNLLEITLLVGNYMNAGSRNAGAFGFNISFLCKLRDTKSTDQKMTLLHFLAELC
.::.:::.:::..::.::::::::::: .::::.: ::::.::::.::: ::::::.:.:
CCDS58 KKSKSFSKLLELVLLMGNYMNAGSRNAQTFGFNLSSLCKLKDTKSADQKTTLLHFLVEIC
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pF1KB4 ENDYPDVLKFPDELAHVEKASRVSAENLQKNLDQMKKQISDVERDVQNFPAATDEKDKFV
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CCDS58 EEKYPDILNFVDDLEPLDKASKVSVETLEKNLRQMGRQLQQLEKELETFPPPEDLHDKFV
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pF1KB4 EKMTSFVKDAQEQYNKLRMMHSNMETLYKELGEYFLFDPKKLSVEEFFMDLHNFRNMFLQ
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CCDS58 TKMSRFVISAKEQYETLSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQ
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pF1KB4 AVKENQKRRETEEKMRRAKLAKEKAEKERLEKQQKREQLIDMNAEGDETGVMDSLLEALQ
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CCDS58 AIKENIKKREAEEKEKRVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQ
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pF1KB4 SGAAFR--RKRGPRQANRKAGCAVTSLLASELTKDDAMAAVPAKVSKNSETFPTILEEAK
:::::: ::: :
CCDS58 SGAAFRDRRKRTPMPKDVRQSLSPMSQRPVLKVCNHENQKVQLTEGSRSHYNINCNSTRT
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pF1KB4 MEPPGGSLGPGRGTRDKKKGR--SPDELPSAGGD---GGKS
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CCDS58 MERHQPRLHHPAQGSAAGTPYPSSASL---RGCRESKMPRRKGPQHPPPPSGPEEPGEKR
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pF1KB4 KKFTLKRLMADELERFTSMRIK-KEKEKPNSAHRNSSASYGDDPTAQSLQDVSDEQVLVL
:: :..:.:.:: ..::.: . ... . .: .:
CCDS58 PKF---------LDKFASIRIPGSKKERPPLPNLKTAFASSDCSAAP-------------
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pF1KB4 FEQMLLDMNLNEEKQQPLREKDIIIKREMVSQYLYTSKAGMSQKESSKSAMMYIQELRSG
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CCDS58 -----LEMMENFPK--PLSENELL--------ELFEKMMGSLKRSRQISPQEFIHELKMG
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pF1KB4 LRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETAGSYDSRNKH
: :..:::::::::..::::::..:: :::. :::::..: . : . . ..:.:
CCDS58 SADERLVTCLESLRVSLTSNPVSWVESFGHEGLGLLLDILEKLISGKIQE--KVVKKNQH
150 160 170 180 190
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pF1KB4 EIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSALCILPQPEDM
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CCDS58 KVIQCLKALMNTQYGLERIMSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAVCIVGE-ESI
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pF1KB4 NERVLEAMTERAEMDEVERFQPLLDGLKSGTTIALKVGCLQLINALITPAEELDFRVHIR
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CCDS58 LEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNS-VQLQVACMQLINALVTSPDDLDFRLHIR
260 270 280 290 300 310
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pF1KB4 SELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRMEMDDFNEVFQ
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CCDS58 NEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAELDEAYDVYN
320 330 340 350 360 370
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pF1KB4 ILLNTVKDSKAEPHFLSILQHLLLVRNDYEARPQYYKLIEECISQIVLHKNGADPDFKCR
.. .:::...:: .:.::::::::.:::: : ::.:::.::.::::::..: :::: :
CCDS58 MVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRDGMDPDFTYR
380 390 400 410 420 430
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pF1KB4 H-LQIEIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAAELEKKLDSELTARHELQVEMKKMESDFEQKLQ
. :.... ..: ::..:.:. : ::.:: ::...:.: ..: :.:..: :. :..
CCDS58 KRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKKEA----KIN
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pF1KB4 DLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASLSAAAITVPP
.::.: :.. :.:...
CCDS58 ELQAE---LQAFKSQFGA------------------------------------------
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pF1KB4 SVPSRAPVPPAPPLPGDSGTIIPPPPAPGDSTTPPPPPPPPPPPPPLPGGVCISSPPSLP
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CCDS58 -------------LPADCNI-------------------------PL--------PPSKE
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pF1KB4 GGTAISPPPPLSGDATIPPPPPLPEGVGIPSPSSLPGGTAIPPPPPLPGSARIPPPPPPL
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CCDS58 GGT---------GHSALPPPPPLPSG----------GG--------------VPPPPPP-
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:::::::: :: .:: .::::: : :: . ::
CCDS58 -------PPPPPLPGMR-MPF------SGP-VPPPPPLGFLGGQNSPP------------
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::. .::::.:. :.:::::::::..:. :::. ::..:.::..: : ::: :::..: :
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40 50 60 70 80
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CCDS41 SENELLELFEKMMEDMNLNEDKKAPLREKDFSIKKEMVMQYINTASKTGSLKRSRQISPQ
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pF1KB4 MYIQELRSGLRDMPLLSCLESLRVSLNNNPVSWVQTFGAEGLASLLDILKRLHDEKEETA
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CCDS41 EFIHELKMGSADERLVTCLESLRVSLTSNPVSWVESFGHEGLGLLLDILEKLISGKIQE-
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pF1KB4 GSYDSRNKHEIIRCLKAFMNNKFGIKTMLETEEGILLLVRAMDPAVPNMMIDAAKLLSAL
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CCDS41 -KVVKKNQHKVIQCLKALMNTQYGLERIMSEERSLSLLAKAVDPRHPNMMTDVVKLLSAV
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CCDS41 CIVGE-ESILEEVLEALTSAGEEKKIDRFFCIVEGLRHNS-VQLQVACMQLINALVTSPD
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pF1KB4 ELDFRVHIRSELMRLGLHQVLQDLREIENEDMRVQLNVFDEQGEEDSYDLKGRLDDIRME
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CCDS41 DLDFRLHIRNEFMRCGLKEILPNLKCIKNDGLDIQLKVFDEHKEEDLFELSHRLEDIRAE
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CCDS41 LDEAYDVYNMVWSTVKETRAEGYFISILQHLLLIRNDYFIRQQYFKLIDECVSQIVLHRD
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pF1KB4 GADPDFKCRH-LQIEIEGLIDQMIDKTKVEKSEAKAAELEKKLDSELTARHELQVEMKKM
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CCDS41 GMDPDFTYRKRLDLDLTQFVDICIDQAKLEEFEEKASELYKKFEKEFTDHQETQAELQKK
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pF1KB4 ESDFEQKLQDLQGEKDALHSEKQQIATEKQDLEAEVSQLTGEVAKLTKELEDAKKEMASL
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CCDS41 EA----KINELQAE---LQAFKSQFGA---------------------------------
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CCDS41 ----PPSKEGGT---------GHSALPPPPPLPSG----------GG-------------
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pF1KB4 RIPPPPPPLPGSAGIPPPPPPLPGEAGMPPPPPPLPGGPGIPPPPP--FPGGPGIPPPPP
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CCDS41 -VPPPPPP--------PPPPPLPGMR-MPF------SGP-VPPPPPLGFLGGQNSPP---
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pF1KB4 GMGMPPPPPFGFGVPAAPVLPFGLTPKKLYKPEVQLRRPNWSKLVAEDLSQDCFWTKVKE
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CCDS41 ----------------LPILPFGLKPKKEFKPEISMRRLNWLKIRPHEMTENCFWIKVNE
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pF1KB4 DRFENNELFAKLTLTFSAQTKTSKAKKDQEGGEEKKSVQKKKVKELKVLDSKTAQNLSIF
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CCDS41 NKYENVDLLCKLENTFCCQ---QKERREEEDIEEKKSI-KKKIKELKFLDSKIAQNLSIF
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pF1KB4 LGSFRMPYQEIKNVILEVNEAVLTESMIQNLIKQMPEPEQLKMLSELKDEYDDLAESEQF
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CCDS41 LSSFRVPYEEIRMMILEVDETRLAESMIQNLIKHLPDQEQLNSLSQFKSEYSNLCEPEQF
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pF1KB4 GVVMGTVPRLRPRLNAILFKLQFSEQVENIKPEIVSVTAACEELRKSESFSNLLEITLLV
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CCDS41 VVVMSNVKRLRPRLSAILFKLQFEEQVNNIKPDIMAVSTACEEIKKSKSFSKLLELVLLM
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CCDS41 LSKLHENMEKLYQSIIGYYAIDVKKVSVEDFLTDLNNFRTTFMQAIKENIKKREAEEKEK
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CCDS41 RVRIAKELAERERLERQQKKKRLLEMKTEGDETGVMDNLLEALQSGAAFRDRRKRTPMPK
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CCDS41 DVRQSLSPMSQRPVLKVCNHENQKVQLTEGSRSHYNINCNSTRTPVAKELNYNLDTHTST
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1272 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]