Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4523
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4523, 505 aa
1>>>pF1KB4523 505 - 505 aa - 505 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.7273+/-0.00161; mu= -9.0938+/- 0.090
mean_var=515.2275+/-121.006, 0's: 0 Z-trim(107.3): 144 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.056503
statistics sampled from 9438 (9519) to 9438 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.645), E-opt: 0.2 (0.292), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 505) 3453 297.3 2.6e-80
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 453) 3098 268.3 1.2e-71
CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 507) 2327 205.6 1.1e-52
CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 503) 2314 204.5 2.3e-52
CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 493) 2157 191.7 1.6e-48
CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 443) 2056 183.4 4.5e-46
CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 426) 1907 171.2 2e-42
CCDS44894.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 546) 1866 168.0 2.4e-41
CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 413) 1764 159.5 6.4e-39
CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 502) 1616 147.6 3.1e-35
CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 532) 1616 147.6 3.2e-35
CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 ( 532) 1564 143.4 6e-34
CCDS2206.1 ACVR1 gene_id:90|Hs108|chr2 ( 509) 1519 139.7 7.4e-33
CCDS31804.1 ACVRL1 gene_id:94|Hs108|chr12 ( 503) 1437 133.0 7.6e-31
CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 336) 1289 120.7 2.5e-27
CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 567) 789 80.2 6.5e-15
CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 592) 789 80.3 6.7e-15
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 405) 763 77.9 2.3e-14
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 513) 763 78.1 2.7e-14
CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 ( 512) 740 76.2 9.7e-14
>>CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (505 aa)
initn: 3453 init1: 3453 opt: 3453 Z-score: 1555.4 bits: 297.3 E(32554): 2.6e-80
Smith-Waterman score: 3453; 100.0% identity (100.0% similar) in 505 aa overlap (1-505:1-505)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVT
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 IEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 DAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYAN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYAN
430 440 450 460 470 480
490 500
pF1KB4 GAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::::::::::::::::::::::::
CCDS88 GAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
490 500
>>CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (453 aa)
initn: 3098 init1: 3098 opt: 3098 Z-score: 1399.5 bits: 268.3 E(32554): 1.2e-71
Smith-Waterman score: 3098; 100.0% identity (100.0% similar) in 453 aa overlap (53-505:1-453)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 GSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPF
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPF
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 YCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLII
40 50 60 70 80 90
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 IIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRT
100 110 120 130 140 150
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 VARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENIL
160 170 180 190 200 210
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 GFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEI
220 230 240 250 260 270
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 VGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 VGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMA
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 PEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 PEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEE
340 350 360 370 380 390
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 MRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQED
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 VKI
:::
CCDS44 VKI
>>CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (507 aa)
initn: 2247 init1: 2130 opt: 2327 Z-score: 1059.3 bits: 205.6 E(32554): 1.1e-52
Smith-Waterman score: 2327; 69.3% identity (84.3% similar) in 511 aa overlap (3-505:2-507)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPR---GVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIF
:.: :. :..:.::...... :. :: : : : . :.:: ::: :.::.
CCDS78 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 NLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSE---DLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLK
. : :: ...:.: .:: : : .. .:.:: :.::.:.: . .: ..
CCDS78 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIELPT-TGPFS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 EPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQR-VYHNRQRLDMEDPSCEM-C
:.. :::::...::::: :. : ....: :.: : :.: . :::: .
CCDS78 VKSSPGL-GPVELAAVIAGPVC--FVCISLMLMVYICHNRTVIHHRVP-NEEDPSLDRPF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 LSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVA
.:. ::.::.::..::::::::::.::::.:::::::: ::::::::::::.::: .::
CCDS78 ISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 VKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS78 VKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIA
::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::: : ::
CCDS78 YLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 DLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWE
:::::::::..:::::::::.::::::::::::::..::::::.::: :::::.:::.::
CCDS78 DLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 IARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKM
:::::. ::.::.::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::: ::::::.:.
CCDS78 IARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKI
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB4 MRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::::::::::::::::::::::::: :: .:.
CCDS78 MRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
>>CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (503 aa)
initn: 2285 init1: 1991 opt: 2314 Z-score: 1053.6 bits: 204.5 E(32554): 2.3e-52
Smith-Waterman score: 2314; 69.5% identity (84.1% similar) in 511 aa overlap (3-505:2-503)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPR---GVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIF
:.: :. :..:.::...... :. :: : : : . :.:: ::: :.::.
CCDS67 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 NLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSE---DLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLK
. : :: ...:.: .:: : : .. .:.:: :.::.:.: :. .:
CCDS67 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIEL--PTT-VK
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 EPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQR-VYHNRQRLDMEDPSCEM-C
:.. :::::...::::: :. : ....: :.: : :.: . :::: .
CCDS67 S--SPGL-GPVELAAVIAGPVC--FVCISLMLMVYICHNRTVIHHRVP-NEEDPSLDRPF
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 LSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVA
.:. ::.::.::..::::::::::.::::.:::::::: ::::::::::::.::: .::
CCDS67 ISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 VKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS67 VKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFD
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIA
::::::::.:::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::: : ::
CCDS67 YLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 DLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWE
:::::::::..:::::::::.::::::::::::::..::::::.::: :::::.:::.::
CCDS67 DLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWE
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 IARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKM
:::::. ::.::.::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::: ::::::.:.
CCDS67 IARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKI
420 430 440 450 460 470
480 490 500
pF1KB4 MRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::::::::::::::::::::::::: :: .:.
CCDS67 MRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
480 490 500
>>CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (493 aa)
initn: 2108 init1: 1847 opt: 2157 Z-score: 984.6 bits: 191.7 E(32554): 1.6e-48
Smith-Waterman score: 2165; 65.8% identity (84.7% similar) in 491 aa overlap (15-504:13-492)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
.::::... .: .: :.: : ..:.::.:.::: .:.. .
CCDS22 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSP----GLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
: :. ...:. :: . .: ::... .:.::.::.:: : :..:.. :. :.
CCDS22 GKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTAS---PNAPK
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB4 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCL-SKDKTL
. ::.::. ::. :: :: . ... . . .: :....: ..:.: : : . :::
CCDS22 L-GPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWACQGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTL
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSR
.::.::...:::::::::.::::.:::::::::.:::::::::.::: : ::::::::::
CCDS22 KDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSR
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 EERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTV
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::: :
CCDS22 DERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIV
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVR
:. :::::::: ::::::::::::::::::.:::::.::::::::: ::::::::::.
CCDS22 TVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVK
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 HDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNS
::.. .:::: : .::::::::::.::.:.:.. :.::: ::::..:::::::::::.
CCDS22 HDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSV
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 GGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYA
::. :::::::::.::::::::::::::::::.::.::: ::: :::::::..:::::::
CCDS22 GGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYA
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KB4 NGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
::::::::::::::.::: :.:: :
CCDS22 NGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
470 480 490
>>CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (443 aa)
initn: 1980 init1: 1847 opt: 2056 Z-score: 940.6 bits: 183.4 E(32554): 4.5e-46
Smith-Waterman score: 2056; 68.6% identity (86.1% similar) in 446 aa overlap (60-504:4-442)
30 40 50 60 70 80
pF1KB4 QALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSED
.: :. ...:. :: . .: ::..
CCDS46 MLTNGKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSNN
10 20 30
90 100 110 120 130 140
pF1KB4 LRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVI
. .:.::.::.:: : :..:.. :. :.. ::.::. ::. :: :: . ... .
CCDS46 VTKTECCFTDFCNNITLHLPTA---SPNAPKL-GPMELAIIITVPVCLLSIAAMLTVWAC
40 50 60 70 80
150 160 170 180 190 200
pF1KB4 NYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCL-SKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIV
. .: :....: ..:.: : : . :::.::.::...:::::::::.::::.:::::
CCDS46 QGRQCSYRKKKRPNVEEPLSECNLVNAGKTLKDLIYDVTASGSGSGLPLLVQRTIARTIV
90 100 110 120 130 140
210 220 230 240 250 260
pF1KB4 LQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAAD
::::.:::::::::.::: : ::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRDERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAAD
150 160 170 180 190 200
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 NKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGK
::::::::::::::.:::.:::.::::: ::. :::::::: :::::::::::::::::
CCDS46 NKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVTVAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGK
210 220 230 240 250 260
330 340 350 360 370 380
pF1KB4 PGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDE
:.:::::.::::::::: ::::::::::.::.. .:::: : .::::::::::.::.
CCDS46 PAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKHDSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDD
270 280 290 300 310 320
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 TINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVC
:.:.. :.::: ::::..:::::::::::. ::. :::::::::.:::::::::::::::
CCDS46 TMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVGGIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVC
330 340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 DQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::.::.::: ::: :::::::..:::::::::::::::::::::.::: :.:: :
CCDS46 DQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYANGAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
390 400 410 420 430 440
>>CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (426 aa)
initn: 2131 init1: 1907 opt: 1907 Z-score: 875.1 bits: 171.2 E(32554): 2e-42
Smith-Waterman score: 1981; 62.5% identity (73.3% similar) in 509 aa overlap (3-505:2-426)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPR---GVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIF
:.: :. :..:.::...... :. :: : : : . :.:: ::: :.::.
CCDS47 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSVT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 NLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSE---DLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLK
. : :: ...:.: .:: : : .. .:.:: :.::.:.: :.
CCDS47 ETTDKVIHNSMCIAEIDLIPRDRPFVCAPSSKTGSVTTTYCCNQDHCNKIEL--PT----
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 EPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLS
CCDS47 ------------------------------------------------------------
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 KDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVK
.::::.::::.:::::::: ::::::::::::.::: .::::
CCDS47 ------------------TGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRGEEVAVK
120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 IFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 IFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYL
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 NRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADL
::::::.:::::::::.::::::::::::::::::.::::::::::::::::: : ::::
CCDS47 NRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADL
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 GLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIA
:::::::..:::::::::.::::::::::::::..::::::.::: :::::.:::.::::
CCDS47 GLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIA
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 RRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMR
:::. ::.::.::::::::::::::.::::::::.::::::::: ::: ::::::.:.::
CCDS47 RRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMR
340 350 360 370 380 390
480 490 500
pF1KB4 ECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::::::::::::::::::::::: :: .:.
CCDS47 ECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
400 410 420
>>CCDS44894.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (546 aa)
initn: 1861 init1: 1861 opt: 1866 Z-score: 855.9 bits: 168.0 E(32554): 2.4e-41
Smith-Waterman score: 3303; 92.2% identity (92.4% similar) in 537 aa overlap (1-496:1-537)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQ
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSRE
190 200 210 220 230 240
250 260 270
pF1KB4 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNK------------------------------
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKADCSFLTLPWEVVMVSAAPKLRSLRLQYKG
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310
pF1KB4 -----------DNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLH
.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GRGRARFLFPLNNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLH
310 320 330 340 350 360
320 330 340 350 360 370
pF1KB4 MEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKR
370 380 390 400 410 420
380 390 400 410 420 430
pF1KB4 YMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 YMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPS
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480 490
pF1KB4 IEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 IEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSV
490 500 510 520 530 540
500
pF1KB4 QEDVKI
CCDS44 QEDVKI
>>CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 (413 aa)
initn: 1989 init1: 1762 opt: 1764 Z-score: 812.3 bits: 159.5 E(32554): 6.4e-39
Smith-Waterman score: 1836; 59.6% identity (73.1% similar) in 490 aa overlap (15-504:13-412)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLD
.::::... .: .: :.: : ..:.::.:.::: .:.. .
CCDS46 MTRALCSALRQALLLLAAAAELSP----GLKCVCLLCDSSNFTCQTEGACWASVMLTN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYTDYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPS
: :. ...:. :: . .: ::... .:.::.::.:: : :..:.:
CCDS46 GKEQVIKSCVSLPEL---NAQVFCHSSNNVTKTECCFTDFCNNITLHLPTG---------
60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEMCLSKDKTLQ
CCDS46 ------------------------------------------------------------
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDVAVKIFSSRE
:::.::::.:::::::::.:::::::::.::: : ::::::::::.
CCDS46 --------------LPLLVQRTIARTIVLQEIVGKGRFGEVWHGRWCGEDVAVKIFSSRD
110 120 130 140
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::.:::.::::: ::
CCDS46 ERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSEYHEQGSLYDYLNRNIVT
150 160 170 180 190 200
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRH
. :::::::: ::::::::::::::::::.:::::.::::::::: ::::::::::.:
CCDS46 VAGMIKLALSIASGLAHLHMEIVGTQGKPAIAHRDIKSKNILVKKCETCAIADLGLAVKH
210 220 230 240 250 260
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSG
:.. .:::: : .::::::::::.::.:.:.. :.::: ::::..:::::::::::. :
CCDS46 DSILNTIDIPQNPKVGTKRYMAPEMLDDTMNVNIFESFKRADIYSVGLVYWEIARRCSVG
270 280 290 300 310 320
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 GVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYAN
:. :::::::::.::::::::::::::::::.::.::: ::: :::::::..::::::::
CCDS46 GIVEEYQLPYYDMVPSDPSIEEMRKVVCDQKFRPSIPNQWQSCEALRVMGRIMRECWYAN
330 340 350 360 370 380
490 500
pF1KB4 GAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
:::::::::::::.::: :.:: :
CCDS46 GAARLTALRIKKTISQLCVKEDCKA
390 400 410
>>CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 (502 aa)
initn: 1517 init1: 1491 opt: 1616 Z-score: 746.1 bits: 147.6 E(32554): 3.1e-35
Smith-Waterman score: 1616; 52.1% identity (74.6% similar) in 489 aa overlap (26-505:25-502)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MAESAGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTS-CLQ--ANYTCETDGACMVSIF
:: ..: : : : . .: : ::: :.. :
CCDS36 MLLRSAGKLNVGTKKEDGESTAPTPRP-KVLRCKCHHHCPEDSVNNICSTDGYCFTMIE
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 NLD-GMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSS---EDLRNTHCCYT-DYCNRIDLRVPSGH
. : :. . :. .: :. : : .. .. :. .:: . ::. ::.
CCDS36 EDDSGLPVVTSGCLG-LE----GSDFQCRDTPIPHQRRSIECCTERNECNK-DLHPTLPP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LKEPEHPSMWGPVELVGI-IAGPVFLLFLIIIIVFLVINYHQRVYHNRQRLDMEDPSCEM
::. . . ::.. .. :. : :.:..::.: . :... . : . .:. :
CCDS36 LKNRDFVD--GPIHHRALLISVTVCSLLLVLIILFCYFRYKRQETRPRYSIGLEQD--ET
120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 CLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGRWRGGDV
. ..:.::. . ..:::::::::.::::.:. : . . :::::.:::: :.::: :
CCDS36 YIPPGESLRDLIEQSQSSGSGSGLPLLVQRTIAKQIQMVKQIGKGRYGEVWMGKWRGEKV
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLF
:::.: . :: :::::.::::::..:::::::::::: : .:.::::.:..::::.:::.
CCDS36 AVKVFFTTEEASWFRETEIYQTVLMRHENILGFIAADIKGTGSWTQLYLITDYHENGSLY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 DYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKPGIAHRDLKSKNILVKKNGMCAI
:::. :. ..:.::: :..::: ::: :: .:::::.::::::::::::::::: : :
CCDS36 DYLKSTTLDAKSMLKLAYSSVSGLCHLHTEIFSTQGKPAIAHRDLKSKNILVKKNGTCCI
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 ADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYW
:::::::. . :. .:: :: :::::::: ::::::..: .::.:. ::.:..::. :
CCDS36 ADLGLAVKFISDTNEVDIPPNTRVGTKRYMPPEVLDESLNRNHFQSYIMADMYSFGLILW
350 360 370 380 390 400
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 EIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGK
:.:::: :::. :::::::.:::::::: :.::..:: .::::..:: :.: : :: :::
CCDS36 EVARRCVSGGIVEEYQLPYHDLVPSDPSYEDMREIVCIKKLRPSFPNRWSSDECLRQMGK
410 420 430 440 450 460
480 490 500
pF1KB4 MMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
.: ::: : :.::::::.::::...: ..:.:.
CCDS36 LMTECWAHNPASRLTALRVKKTLAKMSESQDIKL
470 480 490 500
505 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:06:40 2016 done: Thu Nov 3 15:06:41 2016
Total Scan time: 3.220 Total Display time: 0.120
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]