Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4477
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4477, 1149 aa
1>>>pF1KB4477 1149 - 1149 aa - 1149 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.6111+/-0.00131; mu= -8.1337+/- 0.079
mean_var=565.0201+/-119.451, 0's: 0 Z-trim(113.6): 595 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.053956
statistics sampled from 13547 (14190) to 13547 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.73), E-opt: 0.2 (0.436), width: 16
Scan time: 4.760
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 7665 612.7 1.5e-174
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 7343 587.7 5.2e-167
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 3426 282.8 3.3e-75
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 3371 278.5 6.4e-74
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 3371 278.5 6.4e-74
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 3206 265.6 4.4e-70
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 3151 261.3 8.5e-69
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 3151 261.3 8.6e-69
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 3151 261.3 8.7e-69
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 2950 245.4 2.8e-64
CCDS11824.1 YES1 gene_id:7525|Hs108|chr18 ( 543) 1264 114.1 9e-25
CCDS13294.1 SRC gene_id:6714|Hs108|chr20 ( 536) 1256 113.5 1.4e-24
CCDS5094.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 537) 1249 113.0 2e-24
CCDS305.1 FGR gene_id:2268|Hs108|chr1 ( 529) 1243 112.5 2.7e-24
CCDS5095.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 534) 1239 112.2 3.4e-24
CCDS54453.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 525) 1238 112.1 3.6e-24
CCDS33460.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 526) 1233 111.7 4.7e-24
CCDS54456.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 504) 1231 111.5 5.1e-24
CCDS359.1 LCK gene_id:3932|Hs108|chr1 ( 509) 1231 111.5 5.1e-24
CCDS54455.1 HCK gene_id:3055|Hs108|chr20 ( 505) 1226 111.1 6.6e-24
CCDS5103.1 FRK gene_id:2444|Hs108|chr6 ( 505) 1212 110.0 1.4e-23
CCDS6162.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 512) 1187 108.1 5.5e-23
CCDS47859.1 LYN gene_id:4067|Hs108|chr8 ( 491) 1183 107.8 6.6e-23
CCDS14482.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 659) 1171 107.0 1.5e-22
CCDS76003.1 BTK gene_id:695|Hs108|chrX ( 693) 1171 107.0 1.6e-22
CCDS5982.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 505) 1155 105.6 3.1e-22
CCDS3481.1 TEC gene_id:7006|Hs108|chr4 ( 631) 1149 105.2 4.9e-22
CCDS3480.1 TXK gene_id:7294|Hs108|chr4 ( 527) 1135 104.1 9.3e-22
CCDS83251.1 BLK gene_id:640|Hs108|chr8 ( 434) 1107 101.8 3.7e-21
CCDS10269.1 CSK gene_id:1445|Hs108|chr15 ( 450) 1080 99.7 1.6e-20
CCDS13525.1 SRMS gene_id:6725|Hs108|chr20 ( 488) 1050 97.4 8.6e-20
CCDS14168.1 BMX gene_id:660|Hs108|chrX ( 675) 1019 95.2 5.7e-19
CCDS13524.1 PTK6 gene_id:5753|Hs108|chr20 ( 451) 1006 94.0 8.8e-19
CCDS4336.1 ITK gene_id:3702|Hs108|chr5 ( 620) 989 92.8 2.7e-18
CCDS78044.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 453) 877 83.9 9.3e-16
CCDS4098.1 FER gene_id:2241|Hs108|chr5 ( 822) 877 84.2 1.4e-15
CCDS45351.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 694) 832 80.6 1.4e-14
CCDS45349.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 752) 832 80.6 1.5e-14
CCDS45350.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 764) 832 80.7 1.5e-14
CCDS10365.1 FES gene_id:2242|Hs108|chr15 ( 822) 832 80.7 1.6e-14
CCDS5096.1 FYN gene_id:2534|Hs108|chr6 ( 482) 795 77.6 8.1e-14
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 771 76.0 4.7e-13
CCDS42468.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 466) 749 74.0 9.4e-13
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 758 75.0 9.8e-13
CCDS12114.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 507) 749 74.0 1e-12
CCDS12113.1 MATK gene_id:4145|Hs108|chr19 ( 508) 749 74.0 1e-12
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 748 74.2 1.7e-12
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 746 74.1 1.9e-12
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 746 74.1 1.9e-12
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 727 72.6 5.2e-12
>>CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149 aa)
initn: 7665 init1: 7665 opt: 7665 Z-score: 3247.1 bits: 612.7 E(32554): 1.5e-174
Smith-Waterman score: 7665; 100.0% identity (100.0% similar) in 1149 aa overlap (1-1149:1-1149)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKKESSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVASDFEPQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKKESSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVASDFEPQG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRN
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVST
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPLDHEPAVSPLLPRKERGPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPLDHEPAVSPLLPRKERGPPE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GGLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GGLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDI
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SNGALAFTPLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNGALAFTPLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLATG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPA
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQ
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHS
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 SESPGRDKGKLSRLKPAPPPPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SESPGRDKGKLSRLKPAPPPPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAV
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 NSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGDQPSSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGDQPSSTA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 FIPLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FIPLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGK
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 NLYTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NLYTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSV
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 KEISDIVQR
:::::::::
CCDS35 KEISDIVQR
>>CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130 aa)
initn: 7340 init1: 7340 opt: 7343 Z-score: 3111.8 bits: 587.7 E(32554): 5.2e-167
Smith-Waterman score: 7343; 98.4% identity (98.9% similar) in 1127 aa overlap (23-1149:6-1130)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGKKESSRHGGPHCNVFVEHEALQRPVASDFEPQG
.: .: : :..: . .:::::::::::::::
CCDS35 MLEICLKLVGCK--SKKGLSSSSSCYLEEALQRPVASDFEPQG
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCE
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQR
110 120 130 140 150 160
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRN
170 180 190 200 210 220
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVE
230 240 250 260 270 280
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLL
290 300 310 320 330 340
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 YMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKF
350 360 370 380 390 400
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 PIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERP
410 420 430 440 450 460
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 EGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVST
470 480 490 500 510 520
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPLDHEPAVSPLLPRKERGPPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LLQAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPLDHEPAVSPLLPRKERGPPE
530 540 550 560 570 580
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GGLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 GGLNEDERLLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDI
590 600 610 620 630 640
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SNGALAFTPLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLATG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SNGALAFTPLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLATG
650 660 670 680 690 700
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 EEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPA
710 720 730 740 750 760
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 LPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LPRKRAGENRSDQVTRGTVTPPPRLVKKNEEAADEVFKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQ
770 780 790 800 810 820
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 VTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHS
830 840 850 860 870 880
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 SESPGRDKGKLSRLKPAPPPPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SESPGRDKGKLSRLKPAPPPPPAASAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAV
890 900 910 920 930 940
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 NSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGDQPSSTA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 NSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAPVPSTLPSASSALAGDQPSSTA
950 960 970 980 990 1000
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CCDS35 FIPLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGK
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CCDS35 NLYTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSV
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CCDS35 KEISDIVQR
1130
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CCDS53 HYPAPKCNKPTVYGVSPIHDKWEMERTDITMKHKLGGGQYGEVYVGVWKKYSLTVAVKTL
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CCDS53 KEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTLEPPFYIVTEYMPYGNLLDYLRECNRE
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CCDS53 EVTAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDTY
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CCDS53 TAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYDLLE
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CCDS53 ASSSSVVPYLPRLPILPSKTRTLKKQVENKENIEGAQDATENSASSLAPGFIRGAQASSG
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:: ::::.: ..: :: : . .:.: ..::...::.. ::::::::::::::..
CCDS53 SPALPRKQRDKSPSSLLEDAKETCFTRDRKGGFFSSFMKKRN--APTPPKRSSSFREMEN
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::... . .... ...::: . :: .:. : .:
CCDS53 QPHKKYELTGNFSSVASLQHADGFSFTPAQQEANLVPPKCYGGSFAQRNLCNDDGGGGGG
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. .:: .:: .:.: ::. : . :. .. ..:: : :: :.: . :
CCDS53 SGTAGGGWSGITGFFTPRLIKKTLGLRA-----GKPTASDDTSKPFPRSNSTSSMSSGLP
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. . ..::::. : . :.. .. . . :. . ::.: :. .: .
CCDS53 EQDRMAMTLPRNCQRSKLQLERTVSTSSQPEENVDRANDMLPKKSEESAAPSRERPKAKL
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CCDS53 LPRGATALPLR-TPSGDLAITE--KD----PPGVGVAGVAAAPKGKEKNGGARLGMAGVP
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CCDS53 EDGEQPGWPSPAKAAPVLPTTHNHKVPVLISPTLKHTPADVQLIGTDSQGNKFKLLSEHQ
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CCDS53 VTSSG-DKDRPRRVKPKCAPPPPPVMRLLQHPSICSDPTEEPTALTAGQST---------
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pF1KB4 LVDAVNSDAAKPSQPGEGLKKPVLPATPKPQSAKPSGTPISPAP-VPSTLPSASSALAGD
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CCDS53 ------------SETQEGGKKAALGAVPI--SGK-AGRPVMPPPQVP--LPT-SSISPAK
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pF1KB4 QPSSTAFIPLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSA
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CCDS53 MANGTA-----GTKVALRKTKQAAEKISADKISKEALLECADLLSSALT----EPVPNSQ
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CCDS53 LVDTGHQLLDYCSGYVDCIPQTRNKFAFREAVSKLELSLQELQVSSAAAGV-PGTNPVLN
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1140
pF1KB4 KLLSSVKEISDIVQR
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CCDS53 NLLSCVQEISDVVQR
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CCDS41 GATESDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNQNGEWSEVRSKNGQGWVPSNYI
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CCDS41 TPVNSLEKHSWYHGPVSRSAAEYLLSSLINGSFLVRESESSPGQLSISLRYEGRVYHYRI
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CCDS41 NTTADGKVYVTAESRFSTLAELVHHHSTVADGLVTTLHYPAPKCNKPTVYGVSPIHDKWE
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CCDS41 MERTDITMKHKLGGGQYGEVYVGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHP
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CCDS41 NLVQLLGVCTLEPPFYIVTEYMPYGNLLDYLRECNREEVTAVVLLYMATQISSAMEYLEK
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pF1KB4 KNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKF
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CCDS41 KNFIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTF
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pF1KB4 SIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACW
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CCDS41 SIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYDLLEKGYRMEQPEGCPPKVYELMRACW
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CCDS41 KWSPADRPSFAETHQAFETMFHDSSISEEVAEELGRAASSSSVVPYLPRLPILPSKTRTL
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CCDS41 KKQVENKENIEGAQDATENSASSLAPGFIRGAQASSGSPALPRKQRDKSPSSLLEDAKET
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pF1KB4 LLPKDKKTNLFSALIKKKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDISN----GA
. .:.: ..::...::. .::::::::::::::..::... . .... .
CCDS41 CFTRDRKGGFFSSFMKKR--NAPTPPKRSSSFREMENQPHKKYELTGNFSSVASLQHADG
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pF1KB4 LAFTPLDTADPAKSPKPSNGA-----------GVPNGALRESGG----SGFRSPHLWKKS
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CCDS41 FSFTPAQQEANLVPPKCYGGSFAQRNLCNDDGGGGGGSGTAGGGWSGITGFFTPRLIKKT
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pF1KB4 STLTSSRLATGEEEGGGSSSKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSS
: . :. .. ..:: : :: :.: . : . . ..::::. : . :.. .
CCDS41 LGLRA-----GKPTASDDTSKPFPRSNSTSSMSSGLPEQDRMAMTLPRNCQRSKLQLERT
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. . . :. . ::.: :. .: . . ::... : : . ... : :
CCDS41 VSTSSQPEENVDRANDMLPKKSEESAAPSRERPKAKLLPRGATALPLR-TPSGDLAITE-
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pF1KB4 FKDIMESSPGSSPPNLTPKPLRRQVTVAPASGLPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTS--
:: :: . ... : .. . . :. : :. . .:: : :: ::.
CCDS41 -KD----PPGVGVAGVAAAPKGKEKNGGARLGMAGVPEDGEQPGWPSPAKAAPVLPTTHN
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:. .. ::. .:. . : :. : : :: . :.:: :::::
CCDS41 HKVPVLISPTLKHTPADVQLIGTDSQGNKFKLLSEHQVTSSG-DKDRPRRVKPKCAPPPP
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pF1KB4 PAA---SAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAVNSDAAKPSQPGEGLKKPV
:. . . . :.. :. .::... :. :: :: .
CCDS41 PVMRLLQHPSICSDPTEEPTALTAGQST---------------------SETQEGGKKAA
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pF1KB4 LPATPKPQSAKPSGTPISPAP-VPSTLPSASSALAGDQPSSTAFIPLISTRVSLRKTRQP
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CCDS41 LGAVPISGKA---GRPVMPPPQVP--LPT-SSISPAKMANGTA-----GTKVALRKTKQA
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pF1KB4 PERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNLYTFCVSYVDSIQQMR
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CCDS41 AEKISADKISKEALLECADLLSSALT----EPVPNSQLVDTGHQLLDYCSGYVDCIPQTR
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CCDS41 NKFAFREAVSKLELSLQELQVSSAAAGV-PGTNPVLNNLLSCVQEISDVVQR
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pF1KB4 MGQQPGKVLGDQRRPSLPALHFIKGAGK-KESSRHGGPH-------CNVFVEH-------
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CCDS30 MGQQVGRV-GEAPGLQQPQPRGIRGSSAARPSGRRRDPAGRTTETGFNIFTQHDHFASCV
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pF1KB4 --------------EALQRPVASDFEPQGLSEAARWNSKENLLAGPSENDPNLFVALYDF
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CCDS30 EDGFEGDKTGGSSPEALHRPYGCDVEPQALNEAIRWSSKENLL-GATESDPNLFVALYDF
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pF1KB4 VASGDNTLSITKGEKLRVLGYNHNGEWCEAQTKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPV
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CCDS30 VASGDNTLSITKGEKLRVLGYNQNGEWSEVRSKNGQGWVPSNYITPVNSLEKHSWYHGPV
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pF1KB4 SRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRINTASDGKLYVSSESRF
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CCDS30 SRSAAEYLLSSLINGSFLVRESESSPGQLSISLRYEGRVYHYRINTTADGKVYVTAESRF
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pF1KB4 NTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWEMERTDITMKHKLGGGQ
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CCDS30 STLAELVHHHSTVADGLVTTLHYPAPKCNKPTVYGVSPIHDKWEMERTDITMKHKLGGGQ
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pF1KB4 YGEVYEGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTREPPFY
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CCDS30 YGEVYVGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHPNLVQLLGVCTLEPPFY
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pF1KB4 IITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVG
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CCDS30 IVTEYMPYGNLLDYLRECNREEVTAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVG
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 ENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKFSIKSDVWAFGVLLWEI
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CCDS30 ENHVVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTFSIKSDVWAFGVLLWEI
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pF1KB4 ATYGMSPYPGIDLSQVYELLEKDYRMERPEGCPEKVYELMRACWQWNPSDRPSFAEIHQA
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CCDS30 ATYGMSPYPGIDLSQVYDLLEKGYRMEQPEGCPPKVYELMRACWKWSPADRPSFAETHQA
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pF1KB4 FETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVSTLL-QAPELPTKTRTSRRAAEHRDTTDVPEMP
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CCDS30 FETMFHDSSISEEVAEELGRAASSSSVVPYLPRLPILPSKTRTLKKQVENKENIEGAQDA
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pF1KB4 HSKGQGESDPL----DHEPAVSPLLPRKERGPPEGGLNED--ERLLPKDKKTNLFSALIK
.. . : . . :: ::::.: ..: :: : . .:.: ..::...:
CCDS30 TENSASSLAPGFIRGAQASSGSPALPRKQRDKSPSSLLEDAKETCFTRDRKGGFFSSFMK
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pF1KB4 KKKKTAPTPPKRSSSFREMDGQPERRGAGEEEGRDISN----GALAFTPLDTADPAKSPK
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CCDS30 KRN--APTPPKRSSSFREMENQPHKKYELTGNFSSVASLQHADGFSFTPAQQEANLVPPK
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.:. : .:. .:: .:: .:.: ::. : . :. ..
CCDS30 CYGGSFAQRNLCNDDGGGGGGSGTAGGGWSGITGFFTPRLIKKTLGLRA-----GKPTAS
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730 740 750 760 770 780
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..:: : :: :.: . : . . ..::::. : . :.. .. . . :. .
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790 800 810 820 830
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::.: :. .: . . ::... : : . ... : : :: :: . ..
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840 850 860 870 880
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. : .. . . :. : :. . .:: : :: ::. :. .. ::
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890 900 910 920 930
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. .:. . : :. : : :: . :.:: ::::::. . . . :.
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. :. .::... :. :: :: .: :.: :.: .: :
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. : : :: ::. :: . . ..:: .:.:.::::.: :.:.. :.: ..:.
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.. : :.. . . .: ....:..: .: .::: : : :::::::::..::: .:
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1120 1130 1140
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::::::: :::::::::::::::::..:::.::..::::.::::::::::::::::.:::
CCDS53 SESSPGQLSISLRYEGRVYHYRINTTADGKVYVTAESRFSTLAELVHHHSTVADGLVTTL
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CCDS53 EVTAVVLLYMATQISSAMEYLEKKNFIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDTY
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::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS53 TAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTFSIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYDLLE
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:: ::::.: ..: :: : . .:.: ..::...::.. ::::::::::::::..
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CCDS53 -EENVDRANDMLPKKSEESAAPSRERP----KAKLLPRGATALPLRTPS--GDLAITEKD
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CCDS53 MERTDITMKHKLGGGQYGEVYVGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHP
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:::::::::: ::::::.::.: :::::::::::::.::.::::::::::::::::::::
CCDS53 NLVQLLGVCTLEPPFYIVTEYMPYGNLLDYLRECNREEVTAVVLLYMATQISSAMEYLEK
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pF1KB4 KNFIHRDLAARNCLVGENHLVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNKF
:::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :
CCDS53 KNFIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTF
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:::::::::::::::::::::::::::::::::.:::: ::::.::::: ::::::::::
CCDS53 SIKSDVWAFGVLLWEIATYGMSPYPGIDLSQVYDLLEKGYRMEQPEGCPPKVYELMRACW
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pF1KB4 QWNPSDRPSFAEIHQAFETMFQESSISDEVEKELGKQGVRGAVSTLL-QAPELPTKTRTS
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CCDS53 KWSPADRPSFAETHQAFETMFHDSSISEEVAEELGRAASSSSVVPYLPRLPILPSKTRTL
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pF1KB4 RRAAEHRDTTDVPEMPHSKGQGESDPL----DHEPAVSPLLPRKERGPPEGGLNED--ER
.. .:.... . . .. . : . . :: ::::.: ..: :: :
CCDS53 KKQVENKENIEGAQDATENSASSLAPGFIRGAQASSGSPALPRKQRDKSPSSLLEDAKET
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. .:.: ..::...::. .::::::::::::::..::... .:
CCDS53 CFTRDRKGGFFSSFMKKR--NAPTPPKRSSSFREMENQPHKK--------------YELT
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pF1KB4 PLDTADPAKSPKPSNGAGVPNGALRESGGSGFRSPHLWKKSSTLTSSRLATGEEEGGGSS
: : : : : . :. .: ... ... : ::... :
CCDS53 GLPEQDRMAMTLPRNCQRSKLQLERTVSTSS--QP---EENVDRANDMLPKKSEESAAPS
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pF1KB4 SKRFLRSCSASCVPHGAKDTEWRSVTLPRDLQSTGRQFDSSTFGGHKSEKPALPRKRAGE
.: .:. .:.:: :. . :: : .. . .: : :. :.
CCDS53 RERP----KAKLLPRGATALPLRTPS--GDLAITEKDPPGVGVAG----VAAAPK---GK
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CCDS53 EKNGGARLGMAGVP----EDGEQPG--------WPSPAKAAPVL-PTTHNHKVPVLISPT
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pF1KB4 LPHKEEAGKGSALGTPAAAEPVTPTSKAGSGAPGGTSKGPAEESRVRRHKHSSESPGRDK
: : ::: .. . :. . :. : .: :. : : ::
CCDS53 LKH-----------TPADVQLI------GTDSQGNKFKLLSE--------HQVTSSG-DK
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pF1KB4 GKLSRLKP--APPPPPAA---SAGKAGGKPSQSPSQEAAGEAVLGAKTKATSLVDAVNSD
. :.:: ::::::. . . . :.. :. .::...
CCDS53 DRPRRVKPKCAPPPPPVMRLLQHPSICSDPTEEPTALTAGQST-----------------
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CCDS53 ----SETQEGGKKAALGAVPISGKA---GRPVMPPPQVP--LPT-SSISPAKMANGTA--
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pF1KB4 PLISTRVSLRKTRQPPERIASGAITKGVVLDSTEALCLAISRNSEQMASHSAVLEAGKNL
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CCDS53 ---GTKVALRKTKQAAEKISADKISKEALLECADLLSSALT----EPVPNSQLVDTGHQL
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pF1KB4 YTFCVSYVDSIQQMRNKFAFREAINKLENNLRELQICPATAGSGPAATQDFSKLLSSVKE
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CCDS53 LDYCSGYVDCIPQTRNKFAFREAVSKLELSLQELQVSSAAAGV-PGTNPVLNNLLSCVQE
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pF1KB4 ISDIVQR
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CCDS53 ISDVVQR
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CCDS44 SESALPDLTDHFASCVEDGFEGDKTGGSSPEALHRPYGCDVEPQALNEAIRWSSKENLL-
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CCDS44 GATESDPNLFVALYDFVASGDNTLSITKGEKLRVLGYNQNGEWSEVRSKNGQGWVPSNYI
90 100 110 120 130 140
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pF1KB4 TPVNSLEKHSWYHGPVSRNAAEYLLSSGINGSFLVRESESSPGQRSISLRYEGRVYHYRI
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CCDS44 TPVNSLEKHSWYHGPVSRSAAEYLLSSLINGSFLVRESESSPGQLSISLRYEGRVYHYRI
150 160 170 180 190 200
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pF1KB4 NTASDGKLYVSSESRFNTLAELVHHHSTVADGLITTLHYPAPKRNKPTVYGVSPNYDKWE
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CCDS44 NTTADGKVYVTAESRFSTLAELVHHHSTVADGLVTTLHYPAPKCNKPTVYGVSPIHDKWE
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CCDS44 MERTDITMKHKLGGGQYGEVYVGVWKKYSLTVAVKTLKEDTMEVEEFLKEAAVMKEIKHP
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pF1KB4 NLVQLLGVCTREPPFYIITEFMTYGNLLDYLRECNRQEVNAVVLLYMATQISSAMEYLEK
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CCDS44 NLVQLLGVCTLEPPFYIVTEYMPYGNLLDYLRECNREEVTAVVLLYMATQISSAMEYLEK
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CCDS44 KNFIHRDLAARNCLVGENHVVKVADFGLSRLMTGDTYTAHAGAKFPIKWTAPESLAYNTF
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.. .:.... . . .. . : . . :: ::::.: ..: :: :
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. .:.: ..::...::. .::::::::::::::..::... .:
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.: .:. .:.:: :. . :: : .. . .: : :. :.
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]