Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4461
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4461, 574 aa
1>>>pF1KB4461 574 - 574 aa - 574 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5277+/-0.00101; mu= 17.0797+/- 0.061
mean_var=62.5666+/-12.923, 0's: 0 Z-trim(103.2): 24 B-trim: 29 in 1/48
Lambda= 0.162145
statistics sampled from 7287 (7310) to 7287 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.225), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 574) 3674 868.5 0
CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 ( 565) 3619 855.7 0
CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 542) 1660 397.4 2.4e-110
CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 ( 524) 1646 394.1 2.2e-109
CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 496) 1513 363.0 4.9e-100
CCDS574.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 560) 1364 328.2 1.7e-89
CCDS54844.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 497) 1295 312.0 1.1e-84
CCDS12321.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 564) 1157 279.8 6.4e-75
CCDS72796.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 472) 1053 255.4 1.2e-67
CCDS78003.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 ( 430) 1008 244.9 1.6e-64
CCDS1879.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 532) 983 239.0 1.1e-62
CCDS46125.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 339) 908 221.4 1.4e-57
CCDS12692.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 541) 908 221.5 2.1e-57
CCDS46126.1 SLC1A5 gene_id:6510|Hs108|chr19 ( 313) 893 217.9 1.5e-56
CCDS72797.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 619) 631 156.7 7.7e-38
CCDS54362.1 SLC1A4 gene_id:6509|Hs108|chr2 ( 234) 563 140.7 2e-33
CCDS62578.1 SLC1A6 gene_id:6511|Hs108|chr19 ( 312) 459 116.4 5.4e-26
CCDS72798.1 SLC1A7 gene_id:6512|Hs108|chr1 ( 158) 364 94.1 1.4e-19
>>CCDS31459.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (574 aa)
initn: 3674 init1: 3674 opt: 3674 Z-score: 4640.5 bits: 868.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3674; 99.8% identity (100.0% similar) in 574 aa overlap (1-574:1-574)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASTEGANNMPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVC
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CCDS31 MASTEGANNMPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVC
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 GGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 MVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENL
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 NVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 IAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALG
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 TASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 DGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 VNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYA
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB4 AHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS31 AHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
550 560 570
>>CCDS55756.1 SLC1A2 gene_id:6506|Hs108|chr11 (565 aa)
initn: 3619 init1: 3619 opt: 3619 Z-score: 4571.0 bits: 855.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 3619; 99.8% identity (100.0% similar) in 565 aa overlap (10-574:1-565)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MASTEGANNMPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVC
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MPKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVC
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 GGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRA
:::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLILPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 MVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENL
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGM
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 NVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKI
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 IAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALG
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 TASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVL
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 DGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYA
480 490 500 510 520 530
550 560 570
pF1KB4 AHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
540 550 560
>>CCDS3919.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (542 aa)
initn: 1510 init1: 1149 opt: 1660 Z-score: 2094.7 bits: 397.4 E(32554): 2.4e-110
Smith-Waterman score: 1660; 53.8% identity (80.8% similar) in 500 aa overlap (41-534:45-538)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
: .: .. ::: .::.:.. : ::
CCDS39 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMS
20 30 40 50 60 70
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
. .: .. .:::..:::::.::..:::::::.::...::.::::..: ::.::::.::::
CCDS39 YREVKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
80 90 100 110 120 130
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
:.:.:.:.:. ::::. :... : .:.. :::::::::.:: :::.:::.:..:
CCDS39 AVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKT
140 150 160 170 180 190
200 210 220 230 240
pF1KB4 VTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNE---TVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIG
.: : . . . ..::.. ..: :.:.. :: .: : .:.:.:::.
CCDS39 NYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEE--LVPVPGS--VNGVNALGLVV
200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLE
: . ::...:.: .:.. . .::. ::: .:.:: .::::.:.:: :: :::. ..:.
CCDS39 FSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGT
:.. ::.:: ::::.::.::. : :::.::.::::::. :..:..:: ::::::.::..:
CCDS39 VIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSAT
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVT
::.::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::.:::::::.:. :. :::.:
CCDS39 LPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIIT
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDS
.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..::::.:::.::..::.:::
CCDS39 ISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWFLDRLRTTTNVLGDS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGAGIVYHLSKSELDTIDSQ--HRVHEDIEMTKT-QSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNS
.::::: :::. :: . : . . : :. :: : : : .: .... .:
CCDS39 LGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
490 500 510 520 530 540
550 560 570
pF1KB4 VIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
>>CCDS6452.1 SLC1A1 gene_id:6505|Hs108|chr9 (524 aa)
initn: 1640 init1: 869 opt: 1646 Z-score: 2077.2 bits: 394.1 E(32554): 2.2e-109
Smith-Waterman score: 1646; 55.1% identity (81.6% similar) in 472 aa overlap (41-511:15-480)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
: .: .: :: .:.:: . : :.: : .
CCDS64 MGKPARKGCEWKRFLKNNWVLLSTVAAVVLGITTGVLVREHSNL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB4 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
. .::::.:::::::..:.::::::.:::...::...::..: ::.:::. ::.:
CCDS64 STLEKFYFAFPGEILMRMLKLIILPLIISSMITGVAALDSNVSGKIGLRAVVYYFCTTLI
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
pF1KB4 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
:..::..::..:.:: . ... .. :::..::.::::::.:::::::::::: .
CCDS64 AVILGIVLVVSIKPGVTQKVGEIARTGSTPEVSTVDAMLDLIRNMFPENLVQACFQQYK-
110 120 130 140 150 160
200 210 220 230 240
pF1KB4 VTKKVLVAPPPDEEANATS-AVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGFF
::. : :: : : : : . ..... .... ..:: :. ..::.:::::: :
CCDS64 -TKREEVKPPSDPEMNMTEESFTAVMTTAISK--NKTKEYKIVGM-YSDGINVLGLIVFC
170 180 190 200 210
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 IAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLEVV
..::...::::......::::: :.. .::.: .:: : :::: :: :::: ..: :.
CCDS64 LVFGLVIGKMGEKGQILVDFFNALSDATMKIVQIIMCYMPLGILFLIAGKIIEVEDWEIF
220 230 240 250 260 270
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 ARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGTLP
:.::.::.::. :: ::. ..::::::.:.::::: : :. :: .::: .::..:::
CCDS64 -RKLGLYMATVLTGLAIHSIVILPLIYFIVVRKNPFRFAMGMAQALLTALMISSSSATLP
280 290 300 310 320 330
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVTVS
::::: ::: .:::.::::::::::::::::::::::::.::::.: . : :::.:.:
CCDS64 VTFRCAEENNQVDKRITRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAVFIAQLNDLDLGIGQIITIS
340 350 360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 LTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDSFG
.::: ::.:::..:.::::::...:.:::::.::..:..::::::::.:: :::.::.::
CCDS64 ITATSASIGAAGVPQAGLVTMVIVLSAVGLPAEDVTLIIAVDWLLDRFRTMVNVLGDAFG
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDE
.::: .:::.::. .: . .:.
CCDS64 TGIVEKLSKKELEQMDVSSEVNIVNPFALESTILDNEDSDTKKSYVNGGFAVDKSDTISF
460 470 480 490 500 510
>>CCDS78004.1 SLC1A3 gene_id:6507|Hs108|chr5 (496 aa)
initn: 1350 init1: 1149 opt: 1513 Z-score: 1909.5 bits: 363.0 E(32554): 4.9e-100
Smith-Waterman score: 1513; 52.8% identity (80.6% similar) in 458 aa overlap (83-534:40-492)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GVILGAVCGGLLRLASPIHPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKA
:. ... . : ....:.:...::.::
CCDS78 KMGGRMERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGMAALDSKA
10 20 30 40 50 60
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SGRLGTRAMVYYMSTTIIAAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLI
::..: ::.::::.:::::.:.:.:.:. ::::. :... : .:.. :::::::
CCDS78 SGKMGMRAVVYYMTTTIIAVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLI
70 80 90 100 110 120
180 190 200 210 220
pF1KB4 RNLFPENLVQACFQQIQTVTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNE---TVTEVPEETKMV
::.:: :::.:::.:..: .: : . . . ..::.. ..: :.:.. :: .:
CCDS78 RNMFPPNLVEACFKQFKTNYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEE--LV
130 140 150 160 170 180
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 IKKGLEFKDGMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSP
: .:.:.:::. : . ::...:.: .:.. . .::. ::: .:.:: .::::.:
CCDS78 PVPGSV--NGVNALGLVVFSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAP
190 200 210 220 230 240
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 LGIACLICGKIIAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFA
.:: :: :::. ..:. :.. ::.:: ::::.::.::. : :::.::.::::::. :..
CCDS78 VGILFLIAGKIVEMEDMGVIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIG
250 260 270 280 290 300
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 GIFQAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAA
:..:: ::::::.::..:::.::.::::: :.:::::::::::::::::::::::::.::
CCDS78 GLLQALITALGTSSSSATLPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAA
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 IFIAQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVA
:::::.:. :. :::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:
CCDS78 IFIAQVNNFELNFGQIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIA
370 380 390 400 410 420
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 VDWLLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQ--HRVHEDIEMTKT-QSIYDDM
:::.:::.::..::.:::.::::: :::. :: . : . . : :. :: : : : .:
CCDS78 VDWFLDRLRTTTNVLGDSLGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDN
430 440 450 460 470 480
530 540 550 560 570
pF1KB4 KNHRESNSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
.... .:
CCDS78 ETEKPIDSETKM
490
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20 30 40 50 60 70
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.: :: :.:..::.: . : .:: . . :
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pF1KB4 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
. . . :::..:::::::.:.::..:::..::..::::.:.:::. ...::. ::..:.
CCDS57 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVSSLMSGLASLDAKTSSRLGVLTVAYYLWTTFMAV
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pF1KB4 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
..:...: ::::. :. . : .:: ::.::::::.:: :::.: :.: .: :
CCDS57 IVGIFMVSIIHPGSAAQKETTEQSGK-PIMSSADALLDLIRNMFPANLVEATFKQYRTKT
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:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
CCDS57 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
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pF1KB4 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
CCDS57 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
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pF1KB4 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
CCDS57 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
290 300 310 320 330 340
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pF1KB4 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG
:..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: :
CCDS57 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG
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pF1KB4 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV
::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .::
CCDS57 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV
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pF1KB4 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN
.::...:::. :. ....
CCDS57 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTEKLLPCETKPVSLQEIVAAQQNGCVKSVAEASELTL
470 480 490 500 510 520
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20 30 40 50 60 70
pF1KB4 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
: .: .. ::: .::.:.. : ::
CCDS54 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMS
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. .: .. .:::..:::::.::..:::::::.::...::.::::..: ::.::::.::::
CCDS54 YREVKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
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pF1KB4 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
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CCDS54 AVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIRNMFPPNLVEACFKQFKT
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.: : . . . ..::.. ..: :.:.. :: .: : .:.:.:::.
CCDS54 NYEKRSFKVPIQANETLVGAVINNVSEAMETLTRITEE--LVPVPGS--VNGVNALGLVV
200 210 220 230 240
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pF1KB4 FFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAIKDLE
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CCDS54 FSMCFGFVIGNMKEQGQALREFFDSLNEAIMRLVAVIMWYAPVGILFLIAGKIVEMEDMG
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pF1KB4 VVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTASSAGT
:.. ::.:: ::::.::.::. : :::.::.::::::. :..:..:: ::::::.::..:
CCDS54 VIGGQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSAT
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pF1KB4 LPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGGQIVT
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CCDS54 LPITFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIIT
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pF1KB4 VSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNVVGDS
. ::.::..::.:::
CCDS54 IR---------------------------------------------DRLRTTTNVLGDS
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.::::: :::. :: . : . . : :. :: : : : .: .... .:
CCDS54 LGAGIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
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pF1KB4 VIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
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pF1KB4 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
: .: .. ::: .:..:. . :: .
CCDS12 LQRLQESLQQRALRTRLRLQTMTLEHVLRFLRRNAFILLTVSAVVIGVSLAFALRPYQLT
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. .. .. .:::..:::::.::..:::.:::.::...:: ::.::.: :: :::: ::::
CCDS12 YRQIKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIVSSLVTGMASLDNKATGRMGMRAAVYYMVTTII
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pF1KB4 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
:. .:...: ::::. . :. : . . . . :::.:::::.:: :::.:::.:..:
CCDS12 AVFIGILMVTIIHPGKGS-KEGLHREGRIETIPTADAFMDLIRNMFPPNLVEACFKQFKT
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pF1KB4 -----VTKKVLV-----------APPPDEEANATSAVVSLLNE--TVTEVPEETKMVIKK
:. ...: ::: :.:: . .. :. :. . :
CCDS12 QYSTRVVTRTMVRTENGSEPGASMPPPFSVENGTSFLENVTRALGTLQEMLSFEETVPVP
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240 250 260 270 280 290
pF1KB4 GLEFKDGMNVLGLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGI
: .:.:.:::. : .:::...: : ..... :::. ::: .:.:: .:.::.:.::
CCDS12 GSA--NGINALGLVVFSVAFGLVIGGMKHKGRVLRDFFDSLNEAIMRLVGIIIWYAPVGI
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pF1KB4 ACLICGKIIAIKDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIF
:: :::. ..:. :.. ::::: .:::.::..:.:: ::::::.::..::: :..:..
CCDS12 LFLIAGKILEMEDMAVLGGQLGMYTLTVIVGLFLHAGIVLPLIYFLVTHRNPFPFIGGML
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360 370 380 390 400 410
pF1KB4 QAWITALGTASSAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFI
:: :::.::.::..:::.:::::::.::.:.:.::::::::::.::::::::::.:::::
CCDS12 QALITAMGTSSSSATLPITFRCLEEGLGVDRRITRFVLPVGATVNMDGTALYEALAAIFI
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420 430 440 450 460 470
pF1KB4 AQMNGVVLDGGQIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDW
::.:. :. :::.:.:.::: ::::::.::.::::::...::.::::::::.:..::::
CCDS12 AQVNNYELNLGQITTISITATAASVGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTEDITLIIAVDW
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pF1KB4 LLDRMRTSVNVVGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRES
.:::.:: .::.:::.::... :::. ::. ...
CCDS12 FLDRLRTMTNVLGDSIGAAVIEHLSQRELELQEAELTLPSLGKPYKSLMAQEKGASRGRG
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540 550 560 570
pF1KB4 NSNQCVYAAHNSVIVDECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
CCDS12 GNESAM
560
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pF1KB4 QVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPIHP
.: :: :.:..::.: . : .:: . . :
CCDS72 MVPHAILARGRDVCRRNGLLILSVLSVIVGCLLGFFLR-TRRLSP
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pF1KB4 DVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTIIAA
. . . :::..:::::::.:.::..:
CCDS72 QEISYFQFPGELLMRMLKMMILPLVVS---------------------------------
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pF1KB4 VLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQTVT
::.:: :::.: :.: .: :
CCDS72 ----------------------------------------RNMFPANLVEATFKQYRTKT
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:. .: :.: . .. .:. ..: . ..: :. .::::::
CCDS72 TPVVKSPKVAPEEAPPRRILIYGVQEENGSHVQNFALDLTPPPEVVYKSEPGTSDGMNVL
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pF1KB4 GLIGFFIAFGIAMGKMGDQAKLMVDFFNILNEIVMKLVIMIMWYSPLGIACLICGKIIAI
:.. : ..:: .:.:::.. .:.: . ::: :::.: . .:: :.::. :: :::. .
CCDS72 GIVFFSATMGIMLGRMGDSGAPLVSFCQCLNESVMKIVAVAVWYFPFGIVFLIAGKILEM
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310 320 330 340 350 360
pF1KB4 KDLEVVARQLGMYMVTVIIGLIIHGGIFLPLIYFVVTRKNPFSFFAGIFQAWITALGTAS
: ..:...::.: :::. ::..:: ..:::.:: .:.:::. :. ::.:: . ::.:.:
CCDS72 DDPRAVGKKLGFYSVTVVCGLVLHGLFILPLLYFFITKKNPIVFIRGILQALLIALATSS
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pF1KB4 SAGTLPVTFRCLEENLGIDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQMNGVVLDGG
:..:::.::.:: :: ::.:..::::::::::::::::::::::::::::.:. :: :
CCDS72 SSATLPITFKCLLENNHIDRRIARFVLPVGATINMDGTALYEAVAAIFIAQVNNYELDFG
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pF1KB4 QIVTVSLTATLASVGAASIPSAGLVTMLLILTAVGLPTEDISLLVAVDWLLDRMRTSVNV
::.:.:.::: ::.:::.::.::::::...::.:::::.::.:..:::: :::.:: .::
CCDS72 QIITISITATAASIGAAGIPQAGLVTMVIVLTSVGLPTDDITLIIAVDWALDRFRTMINV
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 VGDSFGAGIVYHLSKSELDTIDSQHRVHEDIEMTKTQSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHN
.::...:::. :. ....
CCDS72 LGDALAAGIMAHICRKDFARDTGTETCFPSPETAALRDQASEPPGDRGSPAEWLCEECSR
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pF1KB4 PKQVEVRMHDSHLGSEEPKHRHLGLRLCDKLGKNLLLTLTVFGVILGAVCGGLLRLASPI
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CCDS78 MERFQQGVRKRTLLAKKKVQNITKEDVKSYLFRNAFVLLTVTAVIVGTILGFTLRPYRMS
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pF1KB4 HPDVVMLIAFPGDILMRMLKMLIFPLIISSLITGLSGLDAKASGRLGTRAMVYYMSTTII
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CCDS78 YREVKYF-SFPGELLMRMLQMLVLPLIISSLVTGMAALDSKASGKMGMRAVVYYMTTTII
80 90 100 110 120 130
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pF1KB4 AAVLGVILVLAIHPGNPKLKKQLGPGKKNDEVSSLDAFLDLIRNLFPENLVQACFQQIQT
:.:.:.:.:. ::::. :... : .:.. ::::::::
CCDS78 AVVIGIIIVIIIHPGKGT-KENMHREGKIVRVTAADAFLDLIR-----------------
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pF1KB4 VTKKVLVAPPPDEEANATSAVVSLLNETVTEVPEETKMVIKKGLEFKDGMNVLGLIGFFI
CCDS78 ------------------------------------------------------------
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:.:.:: :: :::. ..:. :..
CCDS78 ------------------------------------YAPVGILFLIAGKIVEMEDMGVIG
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CCDS78 GQLAMYTVTVIVGLLIHAVIVLPLLYFLVTRKNPWVFIGGLLQALITALGTSSSSATLPI
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CCDS78 TFKCLEENNGVDKRVTRFVLPVGATINMDGTALYEALAAIFIAQVNNFELNFGQIITISI
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pF1KB4 GIVYHLSKSELDTIDSQ--HRVHEDIEMTKT-QSIYDDMKNHRESNSNQCVYAAHNSVIV
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CCDS78 GIVEHLSRHELKNRDVEMGNSVIEENEMKKPYQLIAQDNETEKPIDSETKM
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pF1KB4 DECKVTLAANGKSADCSVEEEPWKREK
574 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 22:51:30 2016 done: Fri Nov 4 22:51:30 2016
Total Scan time: 3.380 Total Display time: 0.110
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]