Result of FASTA (omim) for
pF1KB4458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4458, 1210 aa
1>>>pF1KB4458 1210 - 1210 aa - 1210 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 12.2669+/-0.00089; mu= -9.4674+/- 0.053
mean_var=903.3463+/-203.452, 0's: 0 Z-trim(114.6): 929 B-trim: 1488 in 1/49
Lambda= 0.042672
statistics sampled from 23462 (24509) to 23462 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.633), E-opt: 0.2 (0.287), width: 16
Scan time: 15.330
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_005219 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal g (1210) 8383 534.4 1.7e-150
NP_958441 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal g ( 705) 4447 291.7 1.1e-77
NP_958439 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal g ( 628) 4443 291.4 1.2e-77
XP_005246434 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1282) 4241 279.5 9.9e-74
XP_005246433 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1298) 4219 278.1 2.5e-73
NP_001005862 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) r (1225) 3748 249.1 1.3e-64
NP_001276865 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) r (1240) 3748 249.1 1.3e-64
NP_004439 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) rece (1255) 3748 249.1 1.3e-64
XP_016859069 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1324) 3704 246.4 9e-64
NP_001276866 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) r (1055) 3698 245.9 1e-63
NP_001973 (OMIM: 190151,607598) receptor tyrosine- (1342) 3423 229.1 1.5e-58
NP_001036064 (OMIM: 600543,615515) receptor tyrosi (1292) 3184 214.4 3.8e-54
NP_005226 (OMIM: 600543,615515) receptor tyrosine- (1308) 3162 213.1 9.9e-54
NP_958440 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal g ( 405) 2815 190.9 1.4e-47
XP_016859070 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1318) 2669 182.7 1.4e-44
XP_016859067 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1334) 2647 181.4 3.5e-44
XP_016859068 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1333) 2100 147.7 4.8e-34
XP_006712427 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1323) 2078 146.3 1.2e-33
XP_016859066 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1349) 2078 146.3 1.2e-33
XP_016859071 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: rece (1116) 2075 146.0 1.3e-33
NP_001276867 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) r ( 603) 1721 123.8 3.3e-27
XP_011510623 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C ( 979) 739 63.7 6.8e-09
NP_005772 (OMIM: 606994) activated CDC42 kinase 1 (1038) 739 63.7 7e-09
NP_001294975 (OMIM: 606994) activated CDC42 kinase (1040) 739 63.7 7e-09
XP_005269327 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1055) 739 63.7 7.1e-09
XP_016860999 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1055) 739 63.7 7.1e-09
XP_011510622 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1055) 739 63.7 7.1e-09
XP_016860998 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1069) 739 63.7 7.1e-09
XP_016860997 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1072) 739 63.7 7.1e-09
XP_011510620 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1085) 739 63.8 7.2e-09
NP_001010938 (OMIM: 606994) activated CDC42 kinase (1086) 739 63.8 7.2e-09
XP_005269325 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1118) 739 63.8 7.3e-09
XP_011510619 (OMIM: 606994) PREDICTED: activated C (1219) 739 63.8 7.6e-09
XP_006715943 (OMIM: 179610) PREDICTED: ephrin type ( 861) 717 62.2 1.6e-08
XP_011510844 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type ( 394) 706 61.0 1.7e-08
NP_005223 (OMIM: 179610) ephrin type-A receptor 1 ( 976) 717 62.3 1.7e-08
NP_004432 (OMIM: 600600) ephrin type-B receptor 1 ( 984) 706 61.7 2.8e-08
XP_016861357 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1016) 706 61.7 2.8e-08
XP_016861356 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1032) 706 61.7 2.9e-08
XP_016861355 (OMIM: 600600) PREDICTED: ephrin type (1038) 706 61.7 2.9e-08
NP_001128524 (OMIM: 600085) tyrosine-protein kinas ( 612) 698 60.8 3.1e-08
NP_001167639 (OMIM: 600085) tyrosine-protein kinas ( 612) 698 60.8 3.1e-08
XP_011517248 (OMIM: 600085) PREDICTED: tyrosine-pr ( 635) 698 60.9 3.1e-08
NP_003168 (OMIM: 600085) tyrosine-protein kinase S ( 635) 698 60.9 3.1e-08
NP_001167638 (OMIM: 600085) tyrosine-protein kinas ( 635) 698 60.9 3.1e-08
XP_005252204 (OMIM: 600085) PREDICTED: tyrosine-pr ( 635) 698 60.9 3.1e-08
XP_005264773 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 918) 702 61.4 3.2e-08
XP_005264772 (OMIM: 179611) PREDICTED: ephrin type ( 982) 702 61.4 3.3e-08
NP_005224 (OMIM: 179611) ephrin type-A receptor 3 ( 983) 702 61.4 3.3e-08
XP_016863370 (OMIM: 600004) PREDICTED: ephrin type ( 817) 694 60.8 4.2e-08
>>NP_005219 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal growt (1210 aa)
initn: 8383 init1: 8383 opt: 8383 Z-score: 2823.1 bits: 534.4 E(85289): 1.7e-150
Smith-Waterman score: 8383; 99.9% identity (100.0% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1210)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_005 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 CLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 CLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 RNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 RNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSY
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 GVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 FRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 FRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 QGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 QGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTED
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 SIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 SIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 TVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_005 TVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KB4 APQSSEFIGA
::::::::::
NP_005 APQSSEFIGA
1210
>>NP_958441 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal growt (705 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4447 Z-score: 1515.7 bits: 291.7 E(85289): 1.1e-77
Smith-Waterman score: 4447; 99.2% identity (99.4% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-631)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_958 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
:::::::::::::::::::::::::: ::: :
NP_958 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTY---GPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQ
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
NP_958 SGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
660 670 680 690 700
>>NP_958439 (OMIM: 131550,211980,616069) epidermal growt (628 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 1514.8 bits: 291.4 E(85289): 1.2e-77
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
NP_958 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_958 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
:::::::::::::::::::::::::::
NP_958 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
610 620
>>XP_005246434 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: receptor (1282 aa)
initn: 2712 init1: 1893 opt: 4241 Z-score: 1444.7 bits: 279.5 E(85289): 9.9e-74
Smith-Waterman score: 4338; 51.3% identity (75.5% similar) in 1243 aa overlap (1-1176:1-1236)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
XP_005 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
XP_005 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
XP_005 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
XP_005 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
XP_005 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
XP_005 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
XP_005 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
XP_005 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
XP_005 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNI-TCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPA
::: .:: ::: ..: :..: :.: . .. :: : ::::: .:.:. :::.::. ::
XP_005 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 GVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLL
:..: : ....:::: . :: :::::: :: : ..: : . : ::.:..:.:..:
XP_005 GLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCIGSSIEDCIGLMDRTPLIAAGVIGGLFIL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 LVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKV
..:.: .....::. : .::.:::.: : :::::::::: ::::: ::::::::.:..::
XP_005 VIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRL
::::::::::::.:.:::: :::::::: : :.:.:::: :..::: .:::.:.::. ::
XP_005 LGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRD
::.::. :.::.::::: ::::.::.::::::::: :::::::::::: :::.:::::::
XP_005 LGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 LAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDV
:::::::::.:.::::::::::.:: ..::::.:.:::.:::::::: : .: .::::::
XP_005 LAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDV
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 WSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADS
::::::.:::::::.:::::::. :: ..:::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_005 WSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADS
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 RPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYL
::::.:: :::.::::::::::::::.::.::::.::.:.. :.::::..:..::.:::
XP_005 RPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040
pF1KB4 IPQ-------------------------QGFFSSPSTSRTPLLSSLSA-----TSNNSTV
.:: .: :.. . .: . :. .....:.
XP_005 VPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1050 1060 1070 1080 1090
pF1KB4 ACIDR---NGLQSCPI----KEDSFLQRYSSDPT---------GALTEDSIDDTFLPVP-
.: :: :. .::: ::::.::: : : :.. . :
XP_005 EIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPK
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1100 1110 1120 1130
pF1KB4 -EYINQS-----VPKRPAGSVQ---NPVYHNQPLNPAPSRD-----PHYQDPHSTAVGNP
::.: : .: :..: :: ::: .: ..: : : . ....:.
XP_005 QEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTLGKA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 EYL-NTV--QPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAE
::: :.. .: ....::.: .: .. . .:..::: :..
XP_005 EYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVA
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1200 1210
pF1KB4 NAEYLRVAPQSSEFIGA
XP_005 ENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
1260 1270 1280
>>XP_005246433 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: receptor (1298 aa)
initn: 2712 init1: 1893 opt: 4219 Z-score: 1437.3 bits: 278.1 E(85289): 2.5e-73
Smith-Waterman score: 4274; 51.3% identity (74.4% similar) in 1240 aa overlap (1-1157:1-1233)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
XP_005 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
XP_005 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
XP_005 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAA
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::. .::.::.::: : ::::: .::.
XP_005 VSTNGSSGCGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTRTVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAG
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 GCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRN
::.::...::..: .: : ..: :: ..:::::.:.. : ..::..:: ::::::.:
XP_005 GCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNPTTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHN
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKH
.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: : : :.:.::: : . .. .....:: .
XP_005 FVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDICPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDK
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLH
: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:....::.:::::: ::.:: : ::.
XP_005 FINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKLNVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFS
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 AFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWK
.: :: : ::. : : . . .:::: ..:::::: :.. :. :.:::: .::::
XP_005 VFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQSLKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWT
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 KLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDK
::.: .:. : .:: ..: : :.::. ::: .::::: : .:.::: :::: :...
XP_005 TLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSSDGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIES
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 CNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNI-TCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPA
::: .:: ::: ..: :..: :.: . .. :: : ::::: .:.:. :::.::. ::
XP_005 CNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTCHGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPD
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 GVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLL
:..: : ....:::: . :: :::::: :: : ..: : . : ::.:..:.:..:
XP_005 GLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCIGSSIEDCIGLMDRTPLIAAGVIGGLFIL
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 LVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKV
..:.: .....::. : .::.:::.: : :::::::::: ::::: ::::::::.:..::
XP_005 VIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFL-ETELVEPLTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRL
::::::::::::.:.:::: :::::::: : :.:.:::: :..::: .:::.:.::. ::
XP_005 LGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETTGPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 LGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRD
::.::. :.::.::::: ::::.::.::::::::: :::::::::::: :::.:::::::
XP_005 LGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGSQLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRD
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 LAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDV
:::::::::.:.::::::::::.:: ..::::.:.:::.:::::::: : .: .::::::
XP_005 LAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNADGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDV
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 WSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADS
::::::.:::::::.:::::::. :: ..:::::::::::::::::::.:::::::::::
XP_005 WSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADS
900 910 920 930 940 950
960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 RPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYL
::::.:: :::.::::::::::::::.::.::::.::.:.. :.::::..:..::.:::
XP_005 RPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPSPNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYL
960 970 980 990 1000 1010
1020 1030 1040 1050
pF1KB4 IPQQGFFSSP-STSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQ--------------------
.:: . : :::. . :. : ... : .: :
XP_005 VPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYTPMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060 1070
pF1KB4 ---------------------SC-------PI----KEDSFLQRYSSDPT---------G
:: :. .::: ::::.::: :
XP_005 PTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAPHVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1080 1090 1100 1110 1120
pF1KB4 ALTEDSIDDTFLPVP--EYINQS-----VPKRPAGSVQ---NPVYHNQPLNPAPSRD---
: :.. . : ::.: : .: :..: :: ::: .: ..:
XP_005 ELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKNGDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYV
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1130 1140 1150 1160 1170
pF1KB4 --PHYQDPHSTAVGNPEYL-NTV--QPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFF
: : . ....:. ::: :.. .: ....::.: .:
XP_005 NEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAFDNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYS
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1180 1190 1200 1210
pF1KB4 PKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRVAPQSSEFIGA
XP_005 TKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLPPPPYRHRNTVV
1260 1270 1280 1290
>>NP_001005862 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) recep (1225 aa)
initn: 3258 init1: 1784 opt: 3748 Z-score: 1280.9 bits: 249.1 E(85289): 1.3e-64
Smith-Waterman score: 4092; 50.5% identity (72.5% similar) in 1231 aa overlap (37-1198:2-1219)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 AGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEVVLGNLE
:: .. : :. :......:.:: ::::
NP_001 MKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQVVQGNLE
10 20 30
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALAVLSNYD
.::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::::.: :
NP_001 LTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALAVLDNGD
40 50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB4 ----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNM
:. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .. .
NP_001 PLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHKNNQLAL
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 SMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQC
.. :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.::::.::
NP_001 TLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTDCCHEQC
160 170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 AAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCP
:::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.:: ::
NP_001 AAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGASCVTACP
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 RNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATN
::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. .... .....:
NP_001 YNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVRAVTSAN
280 290 300 310 320 330
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRT
:..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:::..
NP_001 IQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISAWPDSLP
340 350 360 370 380 390
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 DLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTI
:: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .::...:.
NP_001 DLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHLCFVHTV
400 410 420 430 440 450
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 NWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGREC
: .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: . ::.::
NP_001 PWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQFLRGQEC
460 470 480 490 500 510
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 VDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTC
:..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : : :: :
NP_001 VEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPPFCVARC
520 530 540 550 560 570
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 PAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIP--SIATGMVG
:.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : :: ...::
NP_001 PSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSIISAVVG
580 590 600 610 620 630
660 670 680 690 700
pF1KB4 ALLLLLVVALGI--GLFMRRRHI-VRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKE
.::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: :::: .:::::
NP_001 ---ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQMRILKE
640 650 660 670 680
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 TEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASV
::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::::::.:
NP_001 TELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEAYVMAGV
690 700 710 720 730 740
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 DNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLE
.:.: :::::::::::::.:::::.:::::.:::.. .::: :::::.::::::.:::
NP_001 GSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAKGMSYLE
750 760 770 780 790 800
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 DRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHR
: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::::::.:
NP_001 DVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMALESILRR
810 820 830 840 850 860
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 IYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVK
.::::::::::::::::::::.:::::::: :: ..:::::::::::::::::::::::
NP_001 RFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDVYMIMVK
870 880 890 900 910 920
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 CWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDD
:::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:....:: :
NP_001 CWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGD
930 940 950 960 970 980
1010 1020 1030
pF1KB4 VVDADEYLIPQQGFF-----------------SSPSTS-----------------RTPLL
.:::.:::.:::::: :: . : :.::
NP_001 LVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEAPRSPLA
990 1000 1010 1020 1030 1040
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 SSLSATSN--NSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTEDS----IDDTFLPV
: .: :. .. .. .:::: : .. : ::::: ::: : .. : :
NP_001 PSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQ
1050 1060 1070 1080 1090 1100
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 PEYINQ-SVPKRPAGSVQNPVYHNQPLN-----P---APSRDPHYQD--PHSTAVGNPEY
:::.:: .: .: . ..:. .: . : .:... .: . :: ::::
NP_001 PEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEY
1110 1120 1130 1140 1150 1160
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 LNTVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGS-TAENAEY
: : : . . :: . ..:: : .. :... : . :::. :::: ::
NP_001 L-TPQGGAAPQPHPPPAF-------SPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEY
1170 1180 1190 1200 1210
1200 1210
pF1KB4 LRVAPQSSEFIGA
:
NP_001 LGLDVPV
1220
>>NP_001276865 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) recep (1240 aa)
initn: 3288 init1: 1784 opt: 3748 Z-score: 1280.8 bits: 249.1 E(85289): 1.3e-64
Smith-Waterman score: 4123; 50.4% identity (72.4% similar) in 1245 aa overlap (23-1198:3-1234)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:. . .:: ::. :: .. : :. :......:.:
NP_001 MPRGSWKPQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQV
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
: ::::.::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::
NP_001 VQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALA
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNYD----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSS
::.: : :. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .
NP_001 VLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHK
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DFLSNMSMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSD
. ... :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.:
NP_001 NNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTD
170 180 190 200 210
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 CCHNQCAAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGAT
:::.:::::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.
NP_001 CCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGAS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
pF1KB4 CVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSL
:: :: ::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. ....
NP_001 CVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVR
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 SINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQA
.....::..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:
NP_001 AVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISA
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 WPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNL
::.. :: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .:
NP_001 WPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHL
400 410 420 430 440 450
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 CYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNV
:...:. : .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: .
NP_001 CFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQF
460 470 480 490 500 510
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 SRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGP
::.:::..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : :
NP_001 LRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
520 530 540 550 560 570
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 HCVKTCPAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIP--SI
:: ::.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : ::
NP_001 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSI
580 590 600 610 620 630
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 ATGMVGALLLLLVVALGI--GLFMRRRHI-VRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQAL
...:: .::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: ::::
NP_001 ISAVVG---ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQ
640 650 660 670 680 690
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 LRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEA
.:::::::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::
NP_001 MRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEA
700 710 720 730 740 750
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 YVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAK
::::.: .:.: :::::::::::::.:::::.:::::.:::.. .::: :::::.::::
NP_001 YVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAK
760 770 780 790 800 810
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 GMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMAL
::.:::: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::
NP_001 GMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMAL
820 830 840 850 860 870
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 ESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDV
::::.: .::::::::::::::::::::.:::::::: :: ..:::::::::::::::::
NP_001 ESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDV
880 890 900 910 920 930
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 YMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMD
:::::::::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:..
NP_001 YMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLE
940 950 960 970 980 990
1010 1020 1030
pF1KB4 EEDMDDVVDADEYLIPQQGFF-----------------SSPSTS----------------
..:: :.:::.:::.:::::: :: . :
NP_001 DDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEA
1000 1010 1020 1030 1040 1050
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 -RTPLLSSLSATSN--NSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTEDS----ID
:.:: : .: :. .. .. .:::: : .. : ::::: ::: : ..
NP_001 PRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAP
1060 1070 1080 1090 1100 1110
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 DTFLPVPEYINQ-SVPKRPAGSVQNPVYHNQPLN-----P---APSRDPHYQD--PHSTA
: : :::.:: .: .: . ..:. .: . : .:... .: . :
NP_001 LTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGA
1120 1130 1140 1150 1160 1170
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 VGNPEYLNTVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGS-T
: ::::: : : . . :: . ..:: : .. :... : . :::. :
NP_001 VENPEYL-TPQGGAAPQPHPPPAF-------SPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPT
1180 1190 1200 1210 1220
1200 1210
pF1KB4 AENAEYLRVAPQSSEFIGA
::: :::
NP_001 AENPEYLGLDVPV
1230 1240
>>NP_004439 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) receptor (1255 aa)
initn: 3288 init1: 1784 opt: 3748 Z-score: 1280.8 bits: 249.1 E(85289): 1.3e-64
Smith-Waterman score: 4134; 50.4% identity (72.2% similar) in 1254 aa overlap (14-1198:11-1249)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:: :: : . : .:: ::. :: .. : :. :......:.:
NP_004 MELAALCRWGLLLALLPPGAA--STQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
: ::::.::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::
NP_004 VQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNYD----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSS
::.: : :. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .
NP_004 VLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DFLSNMSMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSD
. ... :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.:
NP_004 NNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 CCHNQCAAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGAT
:::.:::::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.
NP_004 CCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGAS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB4 CVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSL
:: :: ::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. ....
NP_004 CVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 SINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQA
.....::..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:
NP_004 AVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 WPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNL
::.. :: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .:
NP_004 WPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 CYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNV
:...:. : .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: .
NP_004 CFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQF
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 SRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGP
::.:::..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : :
NP_004 LRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 HCVKTCPAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIP--SI
:: ::.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : ::
NP_004 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSI
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 ATGMVGALLLLLVVALGI--GLFMRRRHI-VRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQAL
...:: .::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: ::::
NP_004 ISAVVG---ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 LRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEA
.:::::::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::
NP_004 MRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 YVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAK
::::.: .:.: :::::::::::::.:::::.:::::.:::.. .::: :::::.::::
NP_004 YVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAK
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 GMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMAL
::.:::: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::
NP_004 GMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMAL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 ESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDV
::::.: .::::::::::::::::::::.:::::::: :: ..:::::::::::::::::
NP_004 ESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDV
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 YMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMD
:::::::::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:..
NP_004 YMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLE
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030
pF1KB4 EEDMDDVVDADEYLIPQQGFF-----------------SSPSTS----------------
..:: :.:::.:::.:::::: :: . :
NP_004 DDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEA
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 -RTPLLSSLSATSN--NSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTEDS----ID
:.:: : .: :. .. .. .:::: : .. : ::::: ::: : ..
NP_004 PRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1090 1100 1110 1120 1130
pF1KB4 DTFLPVPEYINQ-SVPKRPAGSVQNPVYHNQPLN-----P---APSRDPHYQD--PHSTA
: : :::.:: .: .: . ..:. .: . : .:... .: . :
NP_004 LTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGA
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 VGNPEYLNTVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGS-T
: ::::: : : . . :: . ..:: : .. :... : . :::. :
NP_004 VENPEYL-TPQGGAAPQPHPPPAF-------SPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPT
1200 1210 1220 1230 1240
1200 1210
pF1KB4 AENAEYLRVAPQSSEFIGA
::: :::
NP_004 AENPEYLGLDVPV
1250
>>XP_016859069 (OMIM: 600543,615515) PREDICTED: receptor (1324 aa)
initn: 2929 init1: 1893 opt: 3704 Z-score: 1265.9 bits: 246.4 E(85289): 9e-64
Smith-Waterman score: 4212; 50.2% identity (72.9% similar) in 1266 aa overlap (1-1157:1-1259)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:.:. :. . ..::.: . . . ..:: :: :::..:. .:... .:.....::::
XP_016 MKPA-TGLWVWVSLLVA-AGTVQPSDSQSVCAGTENKLSSLSDLEQQYRALRKYYENCEV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
:.:::::: ...: :::::....::.::::.::: . .:::::.::::. ::. ::::
XP_016 VMGNLEITSIEHNRDLSFLRSVREVTGYVLVALNQFRYLPLENLRIIRGTKLYEDRYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNY--DANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSM
.. :: :.: ::.:: ..:: :::.:.: ..: :: ...:.:.::: . . ::...
XP_016 IFLNYRKDGN-FGLQELGLKNLTEILNGGVYVDQNKFLCYADTIHWQDIVRNPWPSNLTL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210
pF1KB4 DFQNHLGSCQ--------------------------KCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTK
: ..: .: :: .: ::: :..:: ::.
XP_016 VSTNGSSGCLAHQDTEKNNPQLLQSLQPFSLITPGGRCHKSC-TGRCWGPTENHCQTLTR
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 IICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNP
.::.::.::: : ::::: .::.::.::...::..: .: : ..: :: ..:::
XP_016 TVCAEQCDGRCYGPYVSDCCHRECAGGCSGPKDTDCFACMNFNDSGACVTQCPQTFVYNP
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 TTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGP
::.:.. : ..::..:: ::::::.:.:: : .:::::: ....:.::.:.. :: :
XP_016 TTFQLEHNFNAKYTYGAFCVKKCPHNFVV-DSSSCVRACPSSKMEVEENGIKMCKPCTDI
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 CRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQEL
: :.:.::: : . .. .....:: .: :::.:.:.: .: ....:: .. .::..:
XP_016 CPKACDGIGTGSLMSAQTVDSSNIDKFINCTKINGNLIFLVTGIHGDPYNAIEAIDPEKL
360 370 380 390 400 410
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 DILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRS
....::.:::::: ::.:: : ::. .: :: : ::. : : . . .:::: ..:
XP_016 NVFRTVREITGFLNIQSWPPNMTDFSVFSNLVTIGGRVLYSGLSLLILKQQGITSLQFQS
420 430 440 450 460 470
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 LKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSP
::::: :.. :. :.:::: .:::: ::.: .:. : .:: ..: : :.::. :::
XP_016 LKEISAGNIYITDNSNLCYYHTINWTTLFSTINQRIVIRDNRKAENCTAEGMVCNHLCSS
480 490 500 510 520 530
520 530 540 550 560 570
pF1KB4 EGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNI-TC
.::::: : .:.::: :::: :...::: .:: ::: ..: :..: :.: . .. ::
XP_016 DGCWGPGPDQCLSCRRFSRGRICIESCNLYDGEFREFENGSICVECDPQCEKMEDGLLTC
540 550 560 570 580 590
580 590 600 610 620 630
pF1KB4 TGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVMGENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGP
: ::::: .:.:. :::.::. :: :..: : ....:::: . :: :::::: :: :
XP_016 HGPGPDNCTKCSHFKDGPNCVEKCPDGLQGAN-SFIFKYADPDRECHPCHPNCTQGCIGS
600 610 620 630 640 650
640 650 660 670 680 690
pF1KB4 GLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVVALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEP
..: : . : ::.:..:.:..:..:.: .....::. : .::.:::.: : :::::
XP_016 SIEDCIGLMDRTPLIAAGVIGGLFILVIVGLTFAVYVRRKSIKKKRALRRFL-ETELVEP
660 670 680 690 700 710
700 710 720 730 740 750
pF1KB4 LTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREAT
::::: ::::: ::::::::.:..::::::::::::::.:.:::: :::::::: : :.:
XP_016 LTPSGTAPNQAQLRILKETELKRVKVLGSGAFGTVYKGIWVPEGETVKIPVAIKILNETT
720 730 740 750 760 770
760 770 780 790 800 810
pF1KB4 SPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGS
.:::: :..::: .:::.:.::. ::::.::. :.::.::::: ::::.::.::::::::
XP_016 GPKANVEFMDEALIMASMDHPHLVRLLGVCLSPTIQLVTQLMPHGCLLEYVHEHKDNIGS
780 790 800 810 820 830
820 830 840 850 860 870
pF1KB4 QYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHA
: :::::::::::: :::.::::::::::::::::.:.::::::::::.:: ..::::.:
XP_016 QLLLNWCVQIAKGMMYLEERRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLEGDEKEYNA
840 850 860 870 880 890
880 890 900 910 920 930
pF1KB4 EGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGE
.:::.:::::::: : .: .::::::::::::.:::::::.:::::::. :: ..:::::
XP_016 DGGKMPIKWMALECIHYRKFTHQSDVWSYGVTIWELMTFGGKPYDGIPTREIPDLLEKGE
900 910 920 930 940 950
940 950 960 970 980 990
pF1KB4 RLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPS
::::::::::::::.:::::::::::::::.:: :::.::::::::::::::.::.:::
XP_016 RLPQPPICTIDVYMVMVKCWMIDADSRPKFKELAAEFSRMARDPQRYLVIQGDDRMKLPS
960 970 980 990 1000 1010
1000 1010 1020 1030 1040 1050
pF1KB4 PTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQQGFFSSP-STSRTPLLSSLSATSNNSTVACI
:.::.:.. :.::::..:..::.:::.:: . : :::. . :. : ... :
XP_016 PNDSKFFQNLLDEEDLEDMMDAEEYLVPQAFNIPPPIYTSRARIDSNRSEIGHSPPPAYT
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1060
pF1KB4 DRNGLQ-----------------------------------------SC-------PI--
.: : :: :.
XP_016 PMSGNQFVYRDGGFAAEQGVSVPYRAPTSTIPEAPVAQGATAEIFDDSCCNGTLRKPVAP
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1070 1080 1090 1100
pF1KB4 --KEDSFLQRYSSDPT---------GALTEDSIDDTFLPVP--EYINQS-----VPKRPA
.::: ::::.::: : : :.. . : ::.: : .:
XP_016 HVQEDSSTQRYSADPTVFAPERSPRGELDEEGYMTPMRDKPKQEYLNPVEENPFVSRRKN
1140 1150 1160 1170 1180 1190
1110 1120 1130 1140 1150
pF1KB4 GSVQ---NPVYHNQPLNPAPSRD-----PHYQDPHSTAVGNPEYL-NTV--QPTCVNSTF
:..: :: ::: .: ..: : : . ....:. ::: :.. .: ....:
XP_016 GDLQALDNPEYHNASNGPPKAEDEYVNEPLYLNTFANTLGKAEYLKNNILSMPEKAKKAF
1200 1210 1220 1230 1240 1250
1160 1170 1180 1190 1200 1210
pF1KB4 DSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRVAPQSSEFIGA
:.: .:
XP_016 DNPDYWNHSLPPRSTLQHPDYLQEYSTKYFYKQNGRIRPIVAENPEYLSEFSLKPGTVLP
1260 1270 1280 1290 1300 1310
>>NP_001276866 (OMIM: 137800,164870,211980,613659) recep (1055 aa)
initn: 3476 init1: 1779 opt: 3698 Z-score: 1264.8 bits: 245.9 E(85289): 1e-63
Smith-Waterman score: 4001; 55.3% identity (78.0% similar) in 1028 aa overlap (14-1024:11-1031)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
:: :: : . : .:: ::. :: .. : :. :......:.:
NP_001 MELAALCRWGLLLALLPPGAA--STQVCTGTDMKLRLPASPETHLDMLRHLYQGCQV
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
: ::::.::. : .::::. :::: :::::: : :...::. :.:.::.. .:..::::
NP_001 VQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALA
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB4 VLSNYD----------ANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSS
::.: : :. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .
NP_001 VLDNGDPLNNTTPVTGASPGGLRELQLRSLTEILKGGVLIQRNPQLCYQDTILWKDIFHK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DFLSNMSMDFQNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSD
. ... :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.:
NP_001 NNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTD
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 CCHNQCAAGCTGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGAT
:::.:::::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.
NP_001 CCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGAS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340
pF1KB4 CVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSL
:: :: ::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. ....
NP_001 CVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVR
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB4 SINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQA
.....::..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:
NP_001 AVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISA
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 WPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNL
::.. :: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .:
NP_001 WPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHL
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB4 CYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNV
:...:. : .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: .
NP_001 CFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQF
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB4 SRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGP
::.:::..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : :
NP_001 LRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB4 HCVKTCPAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIP--SI
:: ::.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : ::
NP_001 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSI
600 610 620 630 640 650
650 660 670 680 690 700
pF1KB4 ATGMVGALLLLLVVALGI--GLFMRRRHI-VRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQAL
...:: .::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: ::::
NP_001 ISAVVG---ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQ
660 670 680 690 700 710
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 LRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEA
.:::::::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::
NP_001 MRILKETELRKVKVLGSGAFGTVYKGIWIPDGENVKIPVAIKVLRENTSPKANKEILDEA
720 730 740 750 760 770
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 YVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAK
::::.: .:.: :::::::::::::.:::::.:::::.:::.. .::: :::::.::::
NP_001 YVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAK
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 GMNYLEDRRLVHRDLAARNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMAL
::.:::: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::
NP_001 GMSYLEDVRLVHRDLAARNVLVKSPNHVKITDFGLARLLDIDETEYHADGGKVPIKWMAL
840 850 860 870 880 890
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 ESILHRIYTHQSDVWSYGVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDV
::::.: .::::::::::::::::::::.:::::::: :: ..:::::::::::::::::
NP_001 ESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDV
900 910 920 930 940 950
950 960 970 980 990 1000
pF1KB4 YMIMVKCWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMD
:::::::::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:..
NP_001 YMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLE
960 970 980 990 1000 1010
1010 1020 1030 1040 1050 1060
pF1KB4 EEDMDDVVDADEYLIPQQGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKED
..:: :.:::.:::.::::::
NP_001 DDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRNM
1020 1030 1040 1050
1210 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:40:52 2016 done: Sun Nov 6 23:40:54 2016
Total Scan time: 15.330 Total Display time: 0.580
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]