Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4458
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4458, 1210 aa
1>>>pF1KB4458 1210 - 1210 aa - 1210 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.7879+/-0.00184; mu= 7.9146+/- 0.108
mean_var=459.7766+/-102.695, 0's: 0 Z-trim(107.5): 526 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.059814
statistics sampled from 9002 (9608) to 9002 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.643), E-opt: 0.2 (0.295), width: 16
Scan time: 5.000
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210) 8383 740.4 6.2e-213
CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 705) 4447 400.4 8.2e-111
CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 628) 4443 400.0 9.9e-111
CCDS45667.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1225) 3748 340.4 1.6e-92
CCDS74052.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1240) 3748 340.5 1.6e-92
CCDS32642.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1255) 3748 340.5 1.6e-92
CCDS77016.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 (1055) 3698 336.0 2.9e-91
CCDS31833.1 ERBB3 gene_id:2065|Hs108|chr12 (1342) 3423 312.5 4.6e-84
CCDS42811.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1292) 3184 291.8 7.3e-78
CCDS2394.1 ERBB4 gene_id:2066|Hs108|chr2 (1308) 3162 289.9 2.7e-77
CCDS47587.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 ( 405) 2815 259.2 1.5e-68
CCDS77017.1 ERBB2 gene_id:2064|Hs108|chr17 ( 603) 1721 165.0 4.9e-40
CCDS33928.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1038) 739 80.7 2.1e-14
CCDS77875.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1040) 739 80.7 2.1e-14
CCDS33927.1 TNK2 gene_id:10188|Hs108|chr3 (1086) 739 80.7 2.2e-14
CCDS5884.1 EPHA1 gene_id:2041|Hs108|chr7 ( 976) 717 78.7 7.6e-14
CCDS46921.1 EPHB1 gene_id:2047|Hs108|chr3 ( 984) 706 77.8 1.5e-13
CCDS47992.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 612) 698 76.8 1.9e-13
CCDS2922.1 EPHA3 gene_id:2042|Hs108|chr3 ( 983) 702 77.4 1.9e-13
CCDS6688.1 SYK gene_id:6850|Hs108|chr9 ( 635) 698 76.8 1.9e-13
CCDS6381.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1052) 695 76.9 3e-13
CCDS56557.1 PTK2 gene_id:5747|Hs108|chr8 (1065) 695 76.9 3e-13
CCDS75132.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1004) 694 76.8 3.1e-13
CCDS3514.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1015) 694 76.8 3.1e-13
CCDS75131.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1016) 694 76.8 3.1e-13
CCDS3513.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1037) 694 76.8 3.1e-13
CCDS75133.1 EPHA5 gene_id:2044|Hs108|chr4 (1038) 694 76.8 3.1e-13
CCDS44283.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 ( 542) 688 75.8 3.2e-13
CCDS2447.1 EPHA4 gene_id:2043|Hs108|chr2 ( 986) 693 76.7 3.2e-13
CCDS169.1 EPHA2 gene_id:1969|Hs108|chr1 ( 976) 692 76.6 3.4e-13
CCDS53436.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1161) 691 76.6 4e-13
CCDS41441.2 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1167) 691 76.6 4e-13
CCDS30947.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1182) 691 76.6 4e-13
CCDS53435.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1043) 688 76.3 4.5e-13
CCDS53437.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1058) 688 76.3 4.5e-13
CCDS44282.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1064) 688 76.3 4.5e-13
CCDS53438.1 ABL2 gene_id:27|Hs108|chr1 (1079) 688 76.3 4.6e-13
CCDS229.2 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 986) 682 75.7 6.2e-13
CCDS230.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 ( 987) 682 75.7 6.2e-13
CCDS81279.1 EPHB2 gene_id:2048|Hs108|chr1 (1055) 682 75.8 6.5e-13
CCDS6058.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 ( 967) 677 75.3 8.3e-13
CCDS6057.1 PTK2B gene_id:2185|Hs108|chr8 (1009) 677 75.3 8.5e-13
CCDS33255.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 312) 666 73.6 8.9e-13
CCDS5706.1 EPHB4 gene_id:2050|Hs108|chr7 ( 987) 673 74.9 1.1e-12
CCDS33254.1 ZAP70 gene_id:7535|Hs108|chr2 ( 619) 666 74.0 1.3e-12
CCDS35166.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1130) 667 74.5 1.6e-12
CCDS35165.1 ABL1 gene_id:25|Hs108|chr9 (1149) 667 74.5 1.7e-12
CCDS5031.1 EPHA7 gene_id:2045|Hs108|chr6 ( 998) 663 74.1 2e-12
CCDS43636.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1390) 661 74.1 2.6e-12
CCDS47689.1 MET gene_id:4233|Hs108|chr7 (1408) 661 74.2 2.6e-12
>>CCDS5514.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (1210 aa)
initn: 8383 init1: 8383 opt: 8383 Z-score: 3936.3 bits: 740.4 E(32554): 6.2e-213
Smith-Waterman score: 8383; 99.9% identity (100.0% similar) in 1210 aa overlap (1-1210:1-1210)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEAYVMASVDNPHVCRLLGI
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 CLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 CLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAKGMNYLEDRRLVHRDLAA
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 RNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 RNVLVKTPQHVKITDFGLAKLLGAEEKEYHAEGGKVPIKWMALESILHRIYTHQSDVWSY
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910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GVTVWELMTFGSKPYDGIPASEISSILEKGERLPQPPICTIDVYMIMVKCWMIDADSRPK
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 FRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDDVVDADEYLIPQ
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 QGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QGFFSSPSTSRTPLLSSLSATSNNSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTED
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 SIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SIDDTFLPVPEYINQSVPKRPAGSVQNPVYHNQPLNPAPSRDPHYQDPHSTAVGNPEYLN
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 TVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGSTAENAEYLRV
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210
pF1KB4 APQSSEFIGA
::::::::::
CCDS55 APQSSEFIGA
1210
>>CCDS5515.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (705 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4447 Z-score: 2102.9 bits: 400.4 E(32554): 8.2e-111
Smith-Waterman score: 4447; 99.2% identity (99.4% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-631)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNVSRGRECVDKCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIPSIATGMVGALLLLLVV
:::::::::::::::::::::::::: ::: :
CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTY---GPGNESLKAMLFCLFKLSSCNQSNDGSVSHQ
610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 ALGIGLFMRRRHIVRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQALLRILKETEFKKIKVLGS
CCDS55 SGSPAAQESCLGWIPSLLPSEFQLGWGGCSHLHAWPSASVIITASSCH
660 670 680 690 700
>>CCDS5516.1 EGFR gene_id:1956|Hs108|chr7 (628 aa)
initn: 4443 init1: 4443 opt: 4443 Z-score: 2101.5 bits: 400.0 E(32554): 9.9e-111
Smith-Waterman score: 4443; 99.8% identity (100.0% similar) in 627 aa overlap (1-627:1-627)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MRPSGTAGAALLALLAALCPASRALEEKKVCQGTSNKLTQLGTFEDHFLSLQRMFNNCEV
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VLSNYDANKTGLKELPMRNLQEILHGAVRFSNNPALCNVESIQWRDIVSSDFLSNMSMDF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QNHLGSCQKCDPSCPNGSCWGAGEENCQKLTKIICAQQCSGRCRGKSPSDCCHNQCAAGC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TGPRESDCLVCRKFRDEATCKDTCPPLMLYNPTTYQMDVNPEGKYSFGATCVKKCPRNYV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VTDHGSCVRACGADSYEMEEDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSLSINATNIKHFK
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 NCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQAWPENRTDLHAF
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNLCYANTINWKKL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::
CCDS55 FGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPRDCVSCRNVSRGRECVDKCN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGPHCVKTCPAGVM
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CCDS55 GENNTLVWKYADAGHVCHLCHPNCTYGS
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.. :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.::::.::
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:::::::..::::.: .: . :. :: :. :: :.. ::::.:.:::.:: ::
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::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. .... .....:
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:..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:::..
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:: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .::...:.
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: .:: . : .:: :. : . : .:: ::. :::: : .::.: . ::.::
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:..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : : :: :
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:.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : :: ...::
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.::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: :::: .:::::
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::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::::::.:
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: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::::::.:
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.::::::::::::::::::::.:::::::: :: ..:::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 CWMIDADSRPKFRELIIEFSKMARDPQRYLVIQGDERMHLPSPTDSNFYRALMDEEDMDD
:::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:....:: :
CCDS45 CWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLEDDDMGD
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pF1KB4 VVDADEYLIPQQGFF-----------------SSPSTS-----------------RTPLL
.:::.:::.:::::: :: . : :.::
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: .: :. .. .. .:::: : .. : ::::: ::: : .. : :
CCDS45 PSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAPLTCSPQ
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pF1KB4 PEYINQ-SVPKRPAGSVQNPVYHNQPLN-----P---APSRDPHYQD--PHSTAVGNPEY
:::.:: .: .: . ..:. .: . : .:... .: . :: ::::
CCDS45 PEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGAVENPEY
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CCDS45 L-TPQGGAAPQPHPPPAF-------SPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPTAENPEY
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1200 1210
pF1KB4 LRVAPQSSEFIGA
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CCDS45 LGLDVPV
1220
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::.: : :. ::.:: .:.: :::.:.: .. :: :: ..: :.:: .
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. ... :. .:. :.: : .. ::: . :.::.::. .:: :. ::.: :.:
CCDS74 NNQLALTLIDTNRSRACHPCSPMCKGSRCWGESSEDCQSLTRTVCAGGCA-RCKGPLPTD
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CCDS74 CCHEQCAAGCTGPKHSDCLACLHFNHSGICELHCPALVTYNTDTFESMPNPEGRYTFGAS
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pF1KB4 CVKKCPRNYVVTDHGSCVRACGADSYEME-EDGVRKCKKCEGPCRKVCNGIGIGEFKDSL
:: :: ::. :: :::. .: . :. :::...:.:: :: .:: :.:. ....
CCDS74 CVTACPYNYLSTDVGSCTLVCPLHNQEVTAEDGTQRCEKCSKPCARVCYGLGMEHLREVR
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pF1KB4 SINATNIKHFKNCTSISGDLHILPVAFRGDSFTHTPPLDPQELDILKTVKEITGFLLIQA
.....::..: .: .: :.: .:: .: :: ..: ::.:..:....:..::::.: :.:
CCDS74 AVTSANIQEFAGCKKIFGSLAFLPESFDGDPASNTAPLQPEQLQVFETLEEITGYLYISA
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pF1KB4 WPENRTDLHAFENLEIIRGRTKQHGQFSLAVVSLNITSLGLRSLKEISDGDVIISGNKNL
::.. :: .:.::..:::: ..: .::.. .:.:. ::::::.:...: ..: : .:
CCDS74 WPDSLPDLSVFQNLQVIRGRILHNGAYSLTLQGLGISWLGLRSLRELGSGLALIHHNTHL
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pF1KB4 CYANTINWKKLFGTSGQKTKIISNRGENSCKATGQVCHALCSPEGCWGPEPKDCVSCRNV
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CCDS74 CFVHTVPWDQLFRNPHQALLHTANRPEDECVGEGLACHQLCARGHCWGPGPTQCVNCSQF
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pF1KB4 SRGRECVDKCNLLEGEPREFVENSECIQCHPECLPQAMNITCTGRGPDNCIQCAHYIDGP
::.:::..: .:.: :::.:. .:. ::::: :: ..:: : :.:. :::: : :
CCDS74 LRGQECVEECRVLQGLPREYVNARHCLPCHPECQPQNGSVTCFGPEADQCVACAHYKDPP
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pF1KB4 HCVKTCPAGVMGENNTL-VWKYADAGHVCHLCHPNCTYGCTGPGLEGCPTNGPKIP--SI
:: ::.:: . . . .::. : .:. : :::..:. .:::.. : ::
CCDS74 FCVARCPSGVKPDLSYMPIWKFPDEEGACQPCPINCTHSCVDLDDKGCPAEQRASPLTSI
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pF1KB4 ATGMVGALLLLLVVALGI--GLFMRRRHI-VRKRTLRRLLQERELVEPLTPSGEAPNQAL
...:: .::::.::. :....::. .:: :.:::::: :::::::::: ::::
CCDS74 ISAVVG---ILLVVVLGVVFGILIKRRQQKIRKYTMRRLLQETELVEPLTPSGAMPNQAQ
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pF1KB4 LRILKETEFKKIKVLGSGAFGTVYKGLWIPEGEKVKIPVAIKELREATSPKANKEILDEA
.:::::::..:.::::::::::::::.:::.::.:::::::: ::: :::::::::::::
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pF1KB4 YVMASVDNPHVCRLLGICLTSTVQLITQLMPFGCLLDYVREHKDNIGSQYLLNWCVQIAK
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CCDS74 YVMAGVGSPYVSRLLGICLTSTVQLVTQLMPYGCLLDHVRENRGRLGSQDLLNWCMQIAK
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::.:::: :::::::::::::::.:.::::::::::.:: .: ::::.:::::::::::
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CCDS74 ESILRRRFTHQSDVWSYGVTVWELMTFGAKPYDGIPAREIPDLLEKGERLPQPPICTIDV
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:::::::::::.. ::.::::. :::.:::::::..::: .: . :: ::.:::.:..
CCDS74 YMIMVKCWMIDSECRPRFRELVSEFSRMARDPQRFVVIQ-NEDLGPASPLDSTFYRSLLE
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pF1KB4 EEDMDDVVDADEYLIPQQGFF-----------------SSPSTS----------------
..:: :.:::.:::.:::::: :: . :
CCDS74 DDDMGDLVDAEEYLVPQQGFFCPDPAPGAGGMVHHRHRSSSTRSGGGDLTLGLEPSEEEA
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1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 -RTPLLSSLSATSN--NSTVACIDRNGLQSCPIKEDSFLQRYSSDPTGALTEDS----ID
:.:: : .: :. .. .. .:::: : .. : ::::: ::: : ..
CCDS74 PRSPLAPSEGAGSDVFDGDLGMGAAKGLQSLPTHDPSPLQRYSEDPTVPLPSETDGYVAP
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pF1KB4 DTFLPVPEYINQ-SVPKRPAGSVQNPVYHNQPLN-----P---APSRDPHYQD--PHSTA
: : :::.:: .: .: . ..:. .: . : .:... .: . :
CCDS74 LTCSPQPEYVNQPDVRPQPPSPREGPLPAARPAGATLERPKTLSPGKNGVVKDVFAFGGA
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1140 1150 1160 1170 1180 1190
pF1KB4 VGNPEYLNTVQPTCVNSTFDSPAHWAQKGSHQISLDNPDYQQDFFPKEAKPNGIFKGS-T
: ::::: : : . . :: . ..:: : .. :... : . :::. :
CCDS74 VENPEYL-TPQGGAAPQPHPPPAF-------SPAFDNLYYWDQDPPERGAPPSTFKGTPT
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1200 1210
pF1KB4 AENAEYLRVAPQSSEFIGA
::: :::
CCDS74 AENPEYLGLDVPV
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pF1KB4 VLGNLEITYVQRNYDLSFLKTIQEVAGYVLIALNTVERIPLENLQIIRGNMYYENSYALA
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CCDS32 VQGNLELTYLPTNASLSFLQDIQEVQGYVLIAHNQVRQVPLQRLRIVRGTQLFEDNYALA
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18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sun Nov 6 23:40:51 2016 done: Sun Nov 6 23:40:52 2016
Total Scan time: 5.000 Total Display time: 0.610
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]