Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4430
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4430, 567 aa
1>>>pF1KB4430 567 - 567 aa - 567 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.9212+/-0.00152; mu= -4.2311+/- 0.086
mean_var=370.4959+/-87.794, 0's: 0 Z-trim(105.5): 151 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.066632
statistics sampled from 8336 (8450) to 8336 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.26), width: 16
Scan time: 3.250
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 567) 3879 388.3 1.3e-107
CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 ( 592) 3665 367.8 2.1e-101
CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 405) 935 105.1 1.7e-22
CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 ( 513) 935 105.3 1.9e-22
CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 ( 512) 919 103.7 5.6e-22
CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 507) 818 94.0 4.7e-19
CCDS6738.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 503) 808 93.0 9.1e-19
CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 453) 789 91.2 3e-18
CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 ( 426) 788 91.0 3.1e-18
CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 505) 789 91.2 3.2e-18
CCDS46434.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 443) 763 88.7 1.7e-17
CCDS2205.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 493) 763 88.7 1.8e-17
CCDS46433.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 413) 746 87.0 5e-17
CCDS3642.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 502) 728 85.4 1.9e-16
CCDS58919.1 BMPR1B gene_id:658|Hs108|chr4 ( 532) 728 85.4 1.9e-16
CCDS2206.1 ACVR1 gene_id:90|Hs108|chr2 ( 509) 727 85.3 2e-16
CCDS31804.1 ACVRL1 gene_id:94|Hs108|chr12 ( 503) 717 84.3 3.9e-16
CCDS7378.1 BMPR1A gene_id:657|Hs108|chr10 ( 532) 715 84.1 4.6e-16
CCDS33361.1 BMPR2 gene_id:659|Hs108|chr2 (1038) 622 75.5 3.5e-13
CCDS46432.1 ACVR1C gene_id:130399|Hs108|chr2 ( 336) 593 72.2 1.2e-12
CCDS44894.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 ( 546) 595 72.6 1.4e-12
>>CCDS2648.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 (567 aa)
initn: 3879 init1: 3879 opt: 3879 Z-score: 2045.3 bits: 388.3 E(32554): 1.3e-107
Smith-Waterman score: 3879; 100.0% identity (100.0% similar) in 567 aa overlap (1-567:1-567)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGRGLLRGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 MGRGLLRGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFST
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 CDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 CDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 CIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 CIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAI
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 SVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 LLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLK
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 HENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 LHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 TARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVRE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 HPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 HPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSE
490 500 510 520 530 540
550 560
pF1KB4 LEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
:::::::::::::::::::::::::::
CCDS26 LEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
550 560
>>CCDS33727.1 TGFBR2 gene_id:7048|Hs108|chr3 (592 aa)
initn: 3660 init1: 3660 opt: 3665 Z-score: 1933.9 bits: 367.8 E(32554): 2.1e-101
Smith-Waterman score: 3818; 95.6% identity (95.8% similar) in 592 aa overlap (1-567:1-592)
10 20 30
pF1KB4 MGRGLLRGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKS-------------------------VNND
::::::::::::::::::::::::::::::: .:::
CCDS33 MGRGLLRGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKSDVEMEAQKDEIICPSCNRTAHPLRHINND
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 MIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENI
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNT
130 140 150 160 170 180
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 SNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEFSEH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEFSEH
190 200 210 220 230 240
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 CAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVA
250 260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 VKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 VKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 YLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 YLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCL
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430 440 450
pF1KB4 CDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 CDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLW
430 440 450 460 470 480
460 470 480 490 500 510
pF1KB4 EMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 EMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCE
490 500 510 520 530 540
520 530 540 550 560
pF1KB4 TLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 TLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
550 560 570 580 590
>>CCDS63030.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 (405 aa)
initn: 893 init1: 352 opt: 935 Z-score: 517.5 bits: 105.1 E(32554): 1.7e-22
Smith-Waterman score: 935; 45.4% identity (75.2% similar) in 306 aa overlap (241-544:81-377)
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 EFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQ
: :..: . ..:::. :.::.: .
CCDS63 WVYRHHKMAYPPVLVPTQDPGPPPPSPLLGLKPLQLLEVKARGRFGCVWKAQLLN-----
60 70 80 90 100
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 FETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAK
: ::::::: .. ::..: ...: ..::::::::. ::.: : . . ::::::: :
CCDS63 -EYVAVKIFPIQDKQSWQNEYEVYSLPGMKHENILQFIGAEKRGTSVDVDLWLITAFHEK
110 120 130 140 150 160
340 350 360 370 380
pF1KB4 GNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPCGRPKMPIV-HRDLKSSNILVKN
:.:...: .:.::..: ... ..:::.:.:: : . : . :::.::.:.:.::
CCDS63 GSLSDFLKANVVSWNELCHIAETMARGLAYLHEDIPGLKDGHKPAISHRDIKSKNVLLKN
170 180 190 200 210 220
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 DLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYS
.:: :. ::::.:... :. : . ::::: :::::::::. .:.. ..: . :.:.
CCDS63 NLTACIADFGLALKFEAGKSAGD--THGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMYA
230 240 250 260 270 280
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 MALVLWEMTSRCNAV-GEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQ
:.:::::..:::.:. : : .: :: .. .:: .:.:.. :.. . :: . ..: .:
CCDS63 MGLVLWELASRCTAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEDMQEVVVHKKKRPVLRDYWQKHA
290 300 310 320 330 340
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 GIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
:. :.:::. :::::: ::::.: ::.::......:
CCDS63 GMAMLCETIEECWDHDAEARLSAGCVGERITQMQRLTNIITTEDIVTVVTMVTNVDFPPK
350 360 370 380 390 400
CCDS63 ESSL
>>CCDS33301.1 ACVR2A gene_id:92|Hs108|chr2 (513 aa)
initn: 866 init1: 352 opt: 935 Z-score: 516.3 bits: 105.3 E(32554): 1.9e-22
Smith-Waterman score: 975; 34.7% identity (62.9% similar) in 518 aa overlap (37-544:13-485)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 RGLWPLHIVLWTRIASTIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAV---KFPQLCKFCDVRFSTCDN
... ..::. . : : : .. . .
CCDS33 MGAAAKLAFAVFLISCSSGAILGRSETQECLFFNANWEKDRT
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 QKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIM
... . : . .: .. : :.:.. . .: : : . : :. : .. :.
CCDS33 NQTGVEPCYGDK--DKRRH-CFATWKNISGSI--EIVKQGCWLD--DINCYDRTD--CV-
50 60 70 80 90
130 140 150 160 170
pF1KB4 KEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVI-----FQVTGISLLPPLGV
::: :..: : : .. ::... . :.....: : ... ::.: . .
CCDS33 -EKKDSPEVYF-CCCEGNMCNEKFSYFPEMEVTQPTSNPVTPKPPYYNILLYSLVPLMLI
100 110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 AISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHN
: :: :. :: .. : . . .: : .
CCDS33 AGIVICAFWVYRHHK----------------MAYPP-VLVPTQDPGPPPPSPLLG-----
160 170 180
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 TELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDIN
: :..: . ..:::. :.::.: . : ::::::: .. ::..: ...: .
CCDS33 --LKPLQLLEVKARGRFGCVWKAQLLN------EYVAVKIFPIQDKQSWQNEYEVYSLPG
190 200 210 220 230 240
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 LKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGI
.::::::::. ::.: : . . ::::::: ::.:...: .:.::..: ... ..:::.
CCDS33 MKHENILQFIGAEKRGTSVDVDLWLITAFHEKGSLSDFLKANVVSWNELCHIAETMARGL
250 260 270 280 290 300
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 AHLHSDHTPCGRPKMPIV-HRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSG
:.:: : . : . :::.::.:.:.::.:: :. ::::.:... :. : . :
CCDS33 AYLHEDIPGLKDGHKPAISHRDIKSKNVLLKNNLTACIADFGLALKFEAGKSAGD--THG
310 320 330 340 350
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAV-GEVKDYEPPFGS
:::: :::::::::. .:.. ..: . :.:.:.:::::..:::.:. : : .: ::
CCDS33 QVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMYAMGLVLWELASRCTAADGPVDEYMLPFEE
360 370 380 390 400 410
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 KVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAE
.. .:: .:.:.. :.. . :: . ..: .: :. :.:::. :::::: ::::.: ::.:
CCDS33 EIGQHPSLEDMQEVVVHKKKRPVLRDYWQKHAGMAMLCETIEECWDHDAEARLSAGCVGE
420 430 440 450 460 470
540 550 560
pF1KB4 RFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
:......:
CCDS33 RITQMQRLTNIITTEDIVTVVTMVTNVDFPPKESSL
480 490 500 510
>>CCDS2679.1 ACVR2B gene_id:93|Hs108|chr3 (512 aa)
initn: 837 init1: 584 opt: 919 Z-score: 508.0 bits: 103.7 E(32554): 5.6e-22
Smith-Waterman score: 973; 37.6% identity (62.7% similar) in 482 aa overlap (69-539:41-479)
40 50 60 70 80 90
pF1KB4 TDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEV---CVAVWRKNDENI
.: : :: :. : : ::...
CCDS26 LWGSLCAGSGRGEAETRECIYYNANWELERTNQSGLERCEGEQDKRLHCYASWRNSSG--
20 30 40 50 60
100 110 120 130 140 150
pF1KB4 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECNDNIIF-----S
:.: : . : :: : .:. :.. : ...: : : .. ::. . .
CCDS26 TIELVKKGCWLD--DFNCYD--RQECVATEEN-P-QVYF-CCCEGNFCNERFTHLPEAGG
70 80 90 100 110 120
160 170 180 190 200 210
pF1KB4 EEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLM
: . : ... : . :::: :... :.. :. :: .:. .
CCDS26 PEVTYEPPPTAPTLLTVLAYSLLPIGGLSLIVLLAFWMYR-HRKPPYG------------
130 140 150 160
220 230 240 250 260 270
pF1KB4 EFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQ
: : :: : .. : :..: . ..:::. :.::.: ..
CCDS26 ----HVDI-HEDPGPPPPSPLVG-------LKPLQLLEIKARGRFGCVWKAQLMNDF---
170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 FETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHAK
::::::: .. ::..:..::: ..::::.:::..::.: ..: . ::::::: :
CCDS26 ---VAVKIFPLQDKQSWQSEREIFSTPGMKHENLLQFIAAEKRGSNLEVELWLITAFHDK
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380
pF1KB4 GNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC-GRPKMP-IVHRDLKSSNILVK
:.: .:: ..:.:..: ... ...::...:: : : :. . : :.:::.::.:.:.:
CCDS26 GSLTDYLKGNIITWNELCHVAETMSRGLSYLHEDVPWCRGEGHKPSIAHRDFKSKNVLLK
280 290 300 310 320 330
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 NDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVESFKQTDVY
.::: : ::::..:..: : . ::::: :::::::::. .:.. ..: . :.:
CCDS26 SDLTAVLADFGLAVRFEPGKPPGD--THGQVGTRRYMAPEVLEGAINFQR-DAFLRIDMY
340 350 360 370 380
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 SMALVLWEMTSRCNAV-GEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNH
.:.:::::..:::.:. : : .: :: .. .:: .: ... :.. . :: : . ::.:
CCDS26 AMGLVLWELVSRCKAADGPVDEYMLPFEEEIGQHPSLEELQEVVVHKKMRPTIKDHWLKH
390 400 410 420 430 440
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 QGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
:. ..: :. :::::: ::::.: :: :: :
CCDS26 PGLAQLCVTIEECWDHDAEARLSAGCVEERVSLIRRSVNGTTSDCLVSLVTSVTNVDLPP
450 460 470 480 490 500
CCDS26 KESSI
510
>>CCDS78413.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (507 aa)
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20 30 40 50 60 70
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::. . .:..: : :: .:
CCDS78 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLC-----TKDN-----FTCV
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..: :.: . .:. . ...: . :.: .: : .: . :
CCDS78 TDGLC------FVSVTETTDK-VIHNSMC----IAEIDLIPRD--RPFVCAPSSKTGSVT
50 60 70 80 90
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.: :..:.:: .. . ... :.: : : ..... : : ::.... : :.
CCDS78 TTYC-CNQDHCNKIELPTTGPFSVKSSPGLGPV--ELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICH
100 110 120 130 140 150
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:. .... . . . : .. . .. : .. :.. . . : : :.
CCDS78 NRTVIHHRVPNEEDPSLDRPFISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQE
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pF1KB4 LVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFL
.:::::.::...: . : :::::: .: :: : .:.. . :.::::: :.
CCDS78 SIGKGRFGEVWRGKWRG------EEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFI
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.:... . : ::.. .: .:.: .::.:.... : . ::. : : :.:::: . .
CCDS78 AADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGT
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 -GRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAP
:.: :.::::::.:::::.. :::. :.::..: : . .. :.: . .::: :::::
CCDS78 QGKPA--IAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAP
330 340 350 360 370 380
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pF1KB4 EVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESM
:::.. .:... ::::..:.:.:.::.::.. ::. : .::. :. . : : :: :
CCDS78 EVLDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEM
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. : ... ::.::. : . ...... . . ::: . ::::: . . .:.:
CCDS78 RKVVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGI
450 460 470 480 490 500
550 560
pF1KB4 SGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
CCDS78 KM
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Smith-Waterman score: 827; 32.5% identity (61.2% similar) in 502 aa overlap (43-541:30-495)
20 30 40 50 60 70
pF1KB4 HIVLWTRIASTIPPHVQKSVNNDMIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCS
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CCDS67 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLC-----TKDN-----FTCV
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pF1KB4 ITSICEKPQEVCVAVWRKNDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGET
..: :.: . .:. . ...: . :.: .: : .: . :
CCDS67 TDGLC------FVSVTETTDK-VIHNSMC----IAEIDLIPRD--RPFVCAPSSKTGSVT
50 60 70 80 90
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pF1KB4 FFMCSCSSDECNDNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFY-CY-R
.: :..:.:: : :.: : : ..... : : ::.... : :. :
CCDS67 TTYC-CNQDHCNK--IELPTTVKSSPGLGPV--ELAAVIAGPVCFVCISLMLMVYICHNR
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. .... . . . : .. . .. : .. :.. . . : : :. .
CCDS67 TVIHHRVPNEEDPSLDRPFISEGTTLKDLIYDMTTSGSGSGLPLLVQRTIARTIVLQESI
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pF1KB4 GKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTA
:::::.::...: . : :::::: .: :: : .:.. . :.::::: :..:
CCDS67 GKGRFGEVWRGKWRG------EEVAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAA
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pF1KB4 EERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC-G
... . : ::.. .: .:.: .::.:.... : . ::. : : :.:::: . . :
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.: :.::::::.:::::.. :::. :.::..: : . .. :.: . .::: :::::::
CCDS67 KPA--IAHRDLKSKNILVKKNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEV
330 340 350 360 370 380
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pF1KB4 LESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKD
:.. .:... ::::..:.:.:.::.::.. ::. : .::. :. . : : :: :.
CCDS67 LDDSINMKHFESFKRADIYAMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRK
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pF1KB4 NVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSG
: ... ::.::. : . ...... . . ::: . ::::: . . .:.:
CCDS67 VVCEQKLRPNIPNRWQSCEALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
450 460 470 480 490 500
550 560
pF1KB4 RSCSEEKIPEDGSLNTTK
>>CCDS44893.2 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (453 aa)
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pF1KB4 NDENITLETVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMC----------SCSS
:: : . :. :.: : .
CCDS44 MVSIFNLDGMEHHVRTCIPKVELVPAGKPFYCLSSEDLRNTHCCYT
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pF1KB4 DECN--DNIIFSEEYNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLS
: :: : . : . . . . ...:: : . . . .::.: .: .:..
CCDS44 DYCNRIDLRVPSGHLKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLV--INYHQRVY
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pF1KB4 STWETGKTRKLMEFSEHCAIILEDDRS------DISSTCANN----INHNTELLPIELDT
. . : :: . : . : :.. :.:.. ... . . : : :.
CCDS44 HN----RQRLDME-DPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQE
110 120 130 140 150
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pF1KB4 LVGKGRFAEVYKAKLKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFL
..:::::.::.... . . :::::: .: :: : .:.. . :.::::: :.
CCDS44 IIGKGRFGEVWRGRWRGGD------VAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFI
160 170 180 190 200 210
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TAEERKTELGKQYWLITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC
.:... . : ::.. .: .:.: .::.:.... : . ::. : : :.:::: . .
CCDS44 AADNKDNGTWTQLWLVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGT
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 -GRPKMPIVHRDLKSSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAP
:.: :.::::::.:::::.. : . :.::..: : . .. :.: . .::: :::::
CCDS44 QGKPG--IAHRDLKSKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAP
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 EVLESRMNLENVESFKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESM
:::. .:... .::: .:.:...:: ::.. :::. : ..:. :. . : : .: :
CCDS44 EVLDETINMKHFDSFKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEM
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pF1KB4 KDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRL
. : .. ::.::..: ........ . . ::: . ::::: . . .:.:
CCDS44 RKVVCDQKLRPNIPNWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDV
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pF1KB4 SGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
CCDS44 KI
>>CCDS47998.1 TGFBR1 gene_id:7046|Hs108|chr9 (426 aa)
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pF1KB4 TVCHDPKLPYHDFILEDAASPKCIMKEKKKPGETFFMCSC---SSDE--C-NDNIIFSEE
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CCDS47 MEAAVAAPRPRLLLLVLAAAAAAAAALLPGATALQCFCHLCTKDNFTCVTDGLCFVSV
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pF1KB4 YNTSNPDLLLVIFQVTGISLLP---PLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKL
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CCDS47 TETTDK-VIHNSMCIAEIDLIPRDRP----------FVCAPSSKTGSVTTTYCCNQ----
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pF1KB4 MEFSEHCAIILEDDRSDISSTCANNINHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAKLKQNTSE
.:: .. .. .: . . : : :. .:::::.::...: .
CCDS47 ----DHC------NKIELPTTGLPLLVQRTIARTIVLQESIGKGRFGEVWRGKWRG----
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pF1KB4 QFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYWLITAFHA
: :::::: .: :: : .:.. . :.::::: :..:... . : ::.. .:
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CCDS47 HGSLFDYLNRYTVTVEGMIKLALSTASGLAHLHMEIVGTQGKPA--IAHRDLKSKNILVK
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.. :::. :.::..: : . .. :.: . .::: ::::::::.. .:... ::::..:.:
CCDS47 KNGTCCIADLGLAVRHDSATDTIDIAPNHRVGTKRYMAPEVLDDSINMKHFESFKRADIY
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pF1KB4 SMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIPSFWLNHQ
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CCDS47 AMGLVFWEIARRCSIGGIHEDYQLPYYDLVPSDPSVEEMRKVVCEQKLRPNIPNRWQSCE
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pF1KB4 GIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDGSLNTTK
..... . . ::: . ::::: . . .:.:
CCDS47 ALRVMAKIMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSQQEGIKM
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>>CCDS8816.1 ACVR1B gene_id:91|Hs108|chr12 (505 aa)
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40 50 60 70 80 90
pF1KB4 MIVTDNNGAVKFPQLCKFCDVRFSTCDNQKSCMSNCSITSICEKPQEVCVAVWRKNDENI
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CCDS88 AGASSFFPLVVLLLAGSGGSGPRGVQALLCACTSCLQANYTCETDGACMVSIFNLDGMEH
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pF1KB4 TLETVCHDPKLPYHDFILEDAASP-KCIMKEKKKPGETFFMCSCSSDECN--DNIIFSEE
..: : ::. : :..: :. .: . . : : .: :: : . : .
CCDS88 HVRT-CI-PKVE-----LVPAGKPFYCLSSEDLRNTH----C-CYTDYCNRIDLRVPSGH
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pF1KB4 YNTSNPDLLLVIFQVTGISLLPPLGVAISVIIIFYCYRVNRQQKLSSTWETGKTRKLMEF
. . . ...:: : . . . .::.: .: .:.. . . : ::
CCDS88 LKEPEHPSMWGPVELVGIIAGPVFLLFLIIIIVFLV--INYHQRVYHN----RQRLDME-
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pF1KB4 SEHCAIILEDDRS------DISSTCANN----INHNTELLPIELDTLVGKGRFAEVYKAK
. : . : :.. :.:.. ... . . : : :. ..:::::.::....
CCDS88 DPSCEMCLSKDKTLQDLVYDLSTSGSGSGLPLFVQRTVARTIVLQEIIGKGRFGEVWRGR
170 180 190 200 210 220
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pF1KB4 LKQNTSEQFETVAVKIFPYEEYASWKTEKDIFSDINLKHENILQFLTAEERKTELGKQYW
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CCDS88 WRGGD------VAVKIFSSREERSWFREAEIYQTVMLRHENILGFIAADNKDNGTWTQLW
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pF1KB4 LITAFHAKGNLQEYLTRHVISWEDLRKLGSSLARGIAHLHSDHTPC-GRPKMPIVHRDLK
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CCDS88 LVSDYHEHGSLFDYLNRYTVTIEGMIKLALSAASGLAHLHMEIVGTQGKP--GIAHRDLK
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pF1KB4 SSNILVKNDLTCCLCDFGLSLRLDPTLSVDDLANSGQVGTARYMAPEVLESRMNLENVES
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CCDS88 SKNILVKKNGMCAIADLGLAVRHDAVTDTIDIAPNQRVGTKRYMAPEVLDETINMKHFDS
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pF1KB4 FKQTDVYSMALVLWEMTSRCNAVGEVKDYEPPFGSKVREHPCVESMKDNVLRDRGRPEIP
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CCDS88 FKCADIYALGLVYWEIARRCNSGGVHEEYQLPYYDLVPSDPSIEEMRKVVCDQKLRPNIP
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pF1KB4 SFWLNHQGIQMVCETLTECWDHDPEARLTAQCVAERFSELEHLDRLSGRSCSEEKIPEDG
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CCDS88 NWWQSYEALRVMGKMMRECWYANGAARLTALRIKKTLSQLSVQEDVKI
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pF1KB4 SLNTTK
567 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 15:00:38 2016 done: Thu Nov 3 15:00:39 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]