FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4406, 2214 aa
1>>>pF1KB4406 2214 - 2214 aa - 2214 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.2513+/-0.000759; mu= 9.5022+/- 0.046
mean_var=246.8163+/-52.002, 0's: 0 Z-trim(109.6): 479 B-trim: 347 in 2/52
Lambda= 0.081637
statistics sampled from 17280 (17859) to 17280 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.536), E-opt: 0.2 (0.209), width: 16
Scan time: 15.990
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003096 (OMIM: 104300,602005) sortilin-related r (2214) 15428 1833.8 0
XP_016873658 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2110) 14715 1749.8 0
XP_016873659 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2039) 14248 1694.8 0
XP_016873660 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (1769) 12368 1473.3 0
XP_011541267 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (1701) 11657 1389.5 0
XP_016873661 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (1334) 9426 1126.6 0
XP_011541269 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (1158) 8237 986.5 0
XP_011541265 (OMIM: 104300,602005) PREDICTED: sort (2176) 7921 949.6 0
XP_011509485 (OMIM: 222448,600073) PREDICTED: low- (4612) 1259 165.3 1.5e-38
XP_011509486 (OMIM: 222448,600073) PREDICTED: low- (3892) 1227 161.5 1.8e-37
NP_004516 (OMIM: 222448,600073) low-density lipopr (4655) 1227 161.6 2e-37
NP_002323 (OMIM: 107770) prolow-density lipoprotei (4544) 1073 143.4 5.7e-32
XP_016874792 (OMIM: 107770) PREDICTED: prolow-dens (4561) 1073 143.4 5.8e-32
NP_001278831 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1034) 821 113.0 1.8e-23
XP_016873224 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1072) 821 113.1 1.9e-23
XP_011543333 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1600) 821 113.3 2.4e-23
NP_002326 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60181 (1615) 821 113.3 2.5e-23
XP_011543332 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1624) 821 113.3 2.5e-23
XP_005274051 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1653) 821 113.3 2.5e-23
XP_011543331 (OMIM: 133780,144750,166710,259770,60 (1662) 821 113.3 2.5e-23
NP_001018064 (OMIM: 602600,608446) low-density lip ( 904) 814 112.2 2.9e-23
NP_004622 (OMIM: 602600,608446) low-density lipopr ( 963) 814 112.2 3.1e-23
XP_011540398 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 762) 812 111.8 3.1e-23
XP_016857755 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 842) 812 111.9 3.3e-23
XP_006710945 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 901) 812 111.9 3.5e-23
XP_006710944 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 917) 812 111.9 3.5e-23
XP_005271230 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 976) 812 112.0 3.7e-23
NP_001309155 (OMIM: 192977,224050) very low-densit ( 804) 810 111.6 3.8e-23
NP_001309154 (OMIM: 192977,224050) very low-densit ( 832) 810 111.6 3.9e-23
XP_011540396 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 934) 798 110.3 1.1e-22
XP_016857754 (OMIM: 602600,608446) PREDICTED: low- ( 921) 794 109.8 1.5e-22
XP_016874793 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1345) 762 106.2 2.7e-21
XP_011518973 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1462) 762 106.3 2.8e-21
NP_002327 (OMIM: 603507,610947,616724) low-density (1613) 762 106.3 3e-21
XP_006719141 (OMIM: 603507,610947,616724) PREDICTE (1613) 762 106.3 3e-21
XP_011518406 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1160) 726 101.9 4.6e-20
XP_011518405 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1637) 726 102.1 5.8e-20
XP_016873223 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) P (1809) 726 102.1 6.2e-20
NP_002325 (OMIM: 212780,604270,614305,616304) low- (1905) 726 102.1 6.4e-20
NP_065828 (OMIM: 606284) VPS10 domain-containing r (1159) 709 99.9 1.8e-19
XP_011511818 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1160) 709 99.9 1.8e-19
XP_016863970 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1166) 709 99.9 1.8e-19
XP_011511816 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1173) 709 99.9 1.9e-19
XP_011511817 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1173) 709 99.9 1.9e-19
XP_005248044 (OMIM: 606284) PREDICTED: VPS10 domai (1174) 709 99.9 1.9e-19
NP_001192157 (OMIM: 602458,613589) sortilin isofor ( 694) 697 98.3 3.5e-19
XP_005271158 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 697 98.3 3.5e-19
XP_006710875 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 697 98.3 3.5e-19
XP_005271159 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 695) 697 98.3 3.5e-19
XP_005271157 (OMIM: 602458,613589) PREDICTED: sort ( 830) 697 98.3 3.9e-19
>>NP_003096 (OMIM: 104300,602005) sortilin-related recep (2214 aa)
initn: 15428 init1: 15428 opt: 15428 Z-score: 9835.9 bits: 1833.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 15428; 100.0% identity (100.0% similar) in 2214 aa overlap (1-2214:1-2214)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MATRSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTQRLHGGSAPLPQDRGFLVVQGDPRELRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MATRSSRRESRLPFLFTLVALLPPGALCEVWTQRLHGGSAPLPQDRGFLVVQGDPRELRL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 WARGDARGASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WARGDARGASRADEKPLRRKRSAALQPEPIKVYGQVSLNDSHNQMVVHWAGEKSNVIVAL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 ARDSLALARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKRYIFA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ARDSLALARPKSSDVYVSYDYGKSFKKISDKLNFGLGNRSEAVIAQFYHSPADNKRYIFA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 DAYAQYLWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DAYAQYLWITFDFCNTLQGFSIPFRAADLLLHSKASNLLLGFDRSHPNKQLWKSDDFGQT
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 WIMIQEHVKSFSWGIDPYDKPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSRENQEVILEEVRDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 WIMIQEHVKSFSWGIDPYDKPNTIYIERHEPSGYSTVFRSTDFFQSRENQEVILEEVRDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 QLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIADASEDQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLRDKYMFATKVVHLLGSEQQSSVQLWVSFGRKPMRAAQFVTRHPINEYYIADASEDQVF
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VCVSHSNNRTNLYISEAEGLKFSLSLENVLYYSPGGAGSDTLVRYFANEPFADFHRVEGL
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 QGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QGVYIATLINGSMNEENMRSVITFDKGGTWEFLQAPAFTGYGEKINCELSQGCSLHLAQR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSAGARWREALPGPHYY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LSQLLNLQLRRMPILSKESAPGLIIATGSVGKNLASKTNVYISSSAGARWREALPGPHYY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 TWGDHGGIITAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TWGDHGGIITAIAQGMETNELKYSTNEGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRTPHATC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRTPHATC
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 TYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYRYDLASGATE
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFE
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850 860 870 880 890 900
pF1KB4 PLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMFWTDWGDLKP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GIYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GIYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLECIERITFSGQQRSVILDNL
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 PHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNA
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 CVPRPCSLLCLPKANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEENTCLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CVPRPCSLLCLPKANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEENTCLR
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pF1KB4 NQYRCSNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 NQYRCSNGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDL
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 EDDCGDNSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EDDCGDNSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCE
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 ASNFQCRNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ASNFQCRNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 DCSDGSDEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DCSDGSDEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPE
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1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 FHKVCDEFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 FHKVCDEFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGH
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 CIPNRWKCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 CIPNRWKCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDG
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1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 YRDCADGSDEEACPLLANVTAASTPTQLGRCDRFEFECHQPKTCIPNWKRCDGHQDCQDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YRDCADGSDEEACPLLANVTAASTPTQLGRCDRFEFECHQPKTCIPNWKRCDGHQDCQDG
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1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB4 RDEANCPTHSTLTCMSREFQCEDGEACIVLSERCDGFLDCSDESDEKACSDELTVYKVQN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RDEANCPTHSTLTCMSREFQCEDGEACIVLSERCDGFLDCSDESDEKACSDELTVYKVQN
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB4 LQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSASCVYNVYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKVLKPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSASCVYNVYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKVLKPD
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB4 TTYQVKVQVQCLSKAHNTNDFVTLRTPEGLPDAPRNLQLSLPREAEGVIVGHWAPPIHTH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TTYQVKVQVQCLSKAHNTNDFVTLRTPEGLPDAPRNLQLSLPREAEGVIVGHWAPPIHTH
1630 1640 1650 1660 1670 1680
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pF1KB4 GLIREYIVEYSRSGSKMWASQRAASNFTEIKNLLVNTLYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GLIREYIVEYSRSGSKMWASQRAASNFTEIKNLLVNTLYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSI
1690 1700 1710 1720 1730 1740
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pF1KB4 TTIKGKVIPPPDIHIDSYGENYLSFTLTMESDIKVNGYVVNLFWAFDTHKQERRTLNFRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TTIKGKVIPPPDIHIDSYGENYLSFTLTMESDIKVNGYVVNLFWAFDTHKQERRTLNFRG
1750 1760 1770 1780 1790 1800
1810 1820 1830 1840 1850 1860
pF1KB4 SILSHKVGNLTAHTSYEISAWAKTDLGDSPLAFEHVMTRGVRPPAPSLKAKAINQTAVEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SILSHKVGNLTAHTSYEISAWAKTDLGDSPLAFEHVMTRGVRPPAPSLKAKAINQTAVEC
1810 1820 1830 1840 1850 1860
1870 1880 1890 1900 1910 1920
pF1KB4 TWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSLTTSLHNKTVIVSKDEQYLFLVRVVVPYQGPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 TWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSLTTSLHNKTVIVSKDEQYLFLVRVVVPYQGPSS
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XP_016 EGETWKTFIFSEKPVFVYGLLTEPGEKSTVFTIFGSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCT
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XP_016 ENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVFKRRTPHATCFNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDF
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pF1KB4 GFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYSPPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB4 LALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFR
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XP_016 LALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGLETVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFR
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XP_016 SKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFYKGKNTGSNACVPRPCSLLCLPKANNSRSCRCPEDV
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XP_016 SSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_016 LQWTADFSGDVTLTWMRPKKMPSASCVYNVYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKVLKPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 TTYQVKVQVQCLSKAHNTNDFVTLRTPEGLPDAPRNLQLSLPREAEGVIVGHWAPPIHTH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GLIREYIVEYSRSGSKMWASQRAASNFTEIKNLLVNTLYTVRVAAVTSRGIGNWSDSKSI
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pF1KB4 TTIKGKVIPPPDIHIDSYGENYLSFTLTMESDIKVNGYVVNLFWAFDTHKQERRTLNFRG
:::::::
XP_016 TTIKGKVCFKTLTTHTKKGCWKSNQIHVP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EKSTVFTIFGSNKENVHSWLILQVNATDALGVPCTENDYKLWSPSDERGNECLLGHKTVF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KRRTPHATCFNGEDFDRPVVVSNCSCTREDYECDFGFKMSEDLSLEVCVPDPEFSGKSYS
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pF1KB4 PPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PPVPCPVGSTYRRTRGYRKISGDTCSGGDVEARLEGELVPCPLAEENEFILYAVRKSIYR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 YDLASGATEQLPLTGLRAAVALDFDYEHNCLYWSDLALDVIQRLCLNGSTGQEVIINSGL
260 270 280 290 300 310
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pF1KB4 ETVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ETVEALAFEPLSQLLYWVDAGFKKIEVANPDGDFRLTIVNSSVLDRPRALVLVPQEGVMF
320 330 340 350 360 370
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XP_011 WTDWGDLKPGIYRSNMDGSAAYHLVSEDVKWPNGISVDDQWIYWTDAYLECIERITFSGQ
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XP_011 QRSVILDNLPHPYAIAVFKNEIYWDDWSQLSIFRASKYSGSQMEILANQLTGLMDMKIFY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 GNWSDSKSITTIKGKVIPPPDIHIDSYGENYLSFTLTMESDIKVNGYVVNLFWAFDTHKQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSFLDLYRNPKSLTTSLHNKTVIVSKDEQYLFLVRV
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XP_011 VVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHLHVVHTGKTSVVIKWESPYDSPDQDLLYAVAVKD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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XP_011 IITENDHVLLFWKSLALKEKHFNESRGYEIHMFDSAMNITAYLGNTTDNFFKISNLKMGH
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XP_011 GVGFAILYTKHRRLQSSFTAFANSHYSSRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPM
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XP_011 VIA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SAWAKTDLGDSPLAFEHVMTRGVRPPAPSLKAKAINQTAVECTWTGPRNVVYGIFYATSF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LDLYRNPKSLTTSLHNKTVIVSKDEQYLFLVRVVVPYQGPSSDYVVVKMIPDSRLPPRHL
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::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 HVVHTGKTSVVIKWESPYDSPDQDLLYAVAVKDLIRKTDRSYKVKSRNSTVEYTLNKLEP
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pF1KB4 GGKYHIIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHVLLFWKSLALKEKHFNESRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 GGKYHIIVQLGNMSKDSSIKITTVSLSAPDALKIITENDHVLLFWKSLALKEKHFNESRG
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pF1KB4 YEIHMFDSAMNITAYLGNTTDNFFKISNLKMGHNYTFTVQARCLFGNQICGEPAILLYDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 YEIHMFDSAMNITAYLGNTTDNFFKISNLKMGHNYTFTVQARCLFGNQICGEPAILLYDE
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pF1KB4 LGSGADASATQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYTKHRRLQSSFTAFANSHYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 LGSGADASATQAARSTDVAAVVVPILFLILLSLGVGFAILYTKHRRLQSSFTAFANSHYS
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pF1KB4 SRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 SRLGSAIFSSGDDLGEDDEDAPMITGFSDDVPMVIA
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pF1KB4 SLLCLPKANNSRSCRCPEDVSSSVLPSGDLMCDCPQGYQLKNNTCVKEENTCLRNQYRCS
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pF1KB4 NGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDLEDDCGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NGNCINSIWWCDFDNDCGDMSDERNCPTTICDLDTQFRCQESGTCIPLSYKCDLEDDCGD
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 NSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCEASNFQC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 NSDESHCEMHQCRSDEYNCSSGMCIRSSWVCDGDNDCRDWSDEANCTAIYHTCEASNFQC
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pF1KB4 RNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLRDCSDGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RNGHCIPQRWACDGDTDCQDGSDEDPVNCEKKCNGFRCPNGTCIPSSKHCDGLRDCSDGS
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pF1KB4 DEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPEFHKVCD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 DEQHCEPLCTHFMDFVCKNRQQCLFHSMVCDGIIQCRDGSDEDAAFAGCSQDPEFHKVCD
220 230 240 250 260 270
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pF1KB4 EFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGHCIPNRW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 EFGFQCQNGVCISLIWKCDGMDDCGDYSDEANCENPTEAPNCSRYFQFRCENGHCIPNRW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 KCDRENDCGDWSDEKDCGDSHILPFSTPGPSTCLPNYYRCSSGTCVMDTWVCDGYRDCAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 GSDEEACPLLANVTAASTPTQLGRCDRFEFECHQPKTCIPNWKRCDGHQDCQDGRDEANC
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 PTHSTLTCMSREFQCEDGEACIVLSERCDGFLDCSDESDEKACSDELTVYKVQNLQWTAD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSGDVTLTWMRPKKMPSASCVYNVYYRVVGESIWKTLETHSNKTNTVLKVLKPDTTYQVK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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.: .:..... .. :: : :: ::: : .... .:.::.: . : :
XP_011 VNTTHRPFDIHVYHPYRQPIVSNPCGTNNGGCSHLCLIKPGGKGFTCECPDDFRTLQL-S
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:. .: :. : .:. :.:.. :: ::: :: ..::.: :::
XP_011 GSTYC-MPM---------------CSSTQFLCANNEKCI-PIWWKCDGQKDCSDGSDELA
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