Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4370
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4370, 1785 aa
1>>>pF1KB4370 1785 - 1785 aa - 1785 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0906+/-0.00122; mu= 19.9571+/- 0.073
mean_var=78.4940+/-15.342, 0's: 0 Z-trim(100.1): 38 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.144762
statistics sampled from 5946 (5976) to 5946 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.522), E-opt: 0.2 (0.184), width: 16
Scan time: 4.560
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs108|chr20 (1785) 11776 2470.6 0
CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs108|chr8 (1849) 6550 1379.2 0
CCDS32754.1 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 397) 639 144.4 7.9e-34
CCDS42392.2 CYTH1 gene_id:9267|Hs108|chr17 ( 398) 639 144.4 7.9e-34
CCDS5346.1 CYTH3 gene_id:9265|Hs108|chr7 ( 399) 613 139.0 3.4e-32
CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs108|chr19 ( 399) 588 133.7 1.3e-30
CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs108|chr22 ( 394) 569 129.8 2e-29
CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 ( 963) 515 118.6 1.1e-25
CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (1114) 515 118.7 1.2e-25
CCDS31725.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 ( 759) 509 117.3 2.1e-25
CCDS53728.1 IQSEC3 gene_id:440073|Hs108|chr12 (1182) 509 117.4 3.1e-25
CCDS7533.1 GBF1 gene_id:8729|Hs108|chr10 (1859) 505 116.7 8.2e-25
CCDS35298.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX ( 949) 493 114.0 2.6e-24
CCDS48130.1 IQSEC2 gene_id:23096|Hs108|chrX (1488) 493 114.1 3.8e-24
CCDS3820.1 FBXO8 gene_id:26269|Hs108|chr4 ( 319) 296 72.7 2.4e-12
CCDS34854.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 ( 513) 292 72.0 6.5e-12
CCDS33276.1 PSD4 gene_id:23550|Hs108|chr2 (1056) 296 72.9 6.9e-12
CCDS43720.1 PSD3 gene_id:23362|Hs108|chr8 (1047) 292 72.1 1.2e-11
CCDS4216.1 PSD2 gene_id:84249|Hs108|chr5 ( 771) 283 70.2 3.4e-11
CCDS61175.1 MON2 gene_id:23041|Hs108|chr12 (1688) 283 70.3 6.8e-11
>>CCDS13411.1 ARFGEF2 gene_id:10564|Hs108|chr20 (1785 aa)
initn: 11776 init1: 11776 opt: 11776 Z-score: 13280.9 bits: 2470.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 11776; 100.0% identity (100.0% similar) in 1785 aa overlap (1-1785:1-1785)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MQESQTKSMFVSRALEKILADKEVKRPQHSQLRRACQVALDEIKAEIEKQRLGTAAPPKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MQESQTKSMFVSRALEKILADKEVKRPQHSQLRRACQVALDEIKAEIEKQRLGTAAPPKA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 NFIEADKYFLPFELACQSKSPRVVSTSLDCLQKLIAYGHITGNAPDSGAPGKRLIDRIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NFIEADKYFLPFELACQSKSPRVVSTSLDCLQKLIAYGHITGNAPDSGAPGKRLIDRIVE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TICSCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSPHIEIHEGTILQTVRTCYNIYLASKNLINQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TICSCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSPHIEIHEGTILQTVRTCYNIYLASKNLINQT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 TAKATLTQMLNVIFTRMENQVLQEARELEKPIQSKPQSPVIQAAAVSPKFVRLKHSQAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TAKATLTQMLNVIFTRMENQVLQEARELEKPIQSKPQSPVIQAAAVSPKFVRLKHSQAQS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KPTTPEKTDLTNGEHARSDSGKVSTENGDAPRERGSSLSGTDDGAQEVVKDILEDVVTSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KPTTPEKTDLTNGEHARSDSGKVSTENGDAPRERGSSLSGTDDGAQEVVKDILEDVVTSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 IKEAAEKHGLTEPERVLGELECQECAIPPGVDENSQTNGIADDRQSLSSADNLESDAQGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IKEAAEKHGLTEPERVLGELECQECAIPPGVDENSQTNGIADDRQSLSSADNLESDAQGH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 QVAARFSHVLQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVAARFSHVLQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGP
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VFRTHEMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VFRTHEMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKE
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 IFLNILETSTSSFEHRWMVIQTLTRICADAQCVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFLNILETSTSSFEHRWMVIQTLTRICADAQCVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKI
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AQGRSGHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLTDQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AQGRSGHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLTDQE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 IGDGKGLDMARRCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IGDGKGLDMARRCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCEK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 EFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 TDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIATK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIATK
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 STKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 STKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTP
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 LLAAYSIGLQNCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFGMQLERDAYVQALARFSLLTASSSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LLAAYSIGLQNCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFGMQLERDAYVQALARFSLLTASSSI
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB4 TEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKTRYLSGSGRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKTRYLSGSGRE
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB4 REGSLKGHTLAGEEFMGLGLGNLVSGGVDKRQMASFQESVGETSSQSVVVAVDRIFTGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 REGSLKGHTLAGEEFMGLGLGNLVSGGVDKRQMASFQESVGETSSQSVVVAVDRIFTGST
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB4 RLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELASPHHPRMFSLQKIVEISYYNMNRIRLQWSRIWHVIGD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELASPHHPRMFSLQKIVEISYYNMNRIRLQWSRIWHVIGD
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170 1180 1190 1200
pF1KB4 HFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKKNRSPTIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 HFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKKNRSPTIR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
1210 1220 1230 1240 1250 1260
pF1KB4 DMAIRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFAVFHQAASDHDGNIVELAFQTTCHIVTTIFQHHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DMAIRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFAVFHQAASDHDGNIVELAFQTTCHIVTTIFQHHF
1210 1220 1230 1240 1250 1260
1270 1280 1290 1300 1310 1320
pF1KB4 PAAIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRFCGKYVSERPRVLQEYTSDDMNVAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 PAAIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRFCGKYVSERPRVLQEYTSDDMNVAP
1270 1280 1290 1300 1310 1320
1330 1340 1350 1360 1370 1380
pF1KB4 GDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKSYGHTFEKHWWQDLFRIVFR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 GDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKSYGHTFEKHWWQDLFRIVFR
1330 1340 1350 1360 1370 1380
1390 1400 1410 1420 1430 1440
pF1KB4 IFDNMKLPEQLSEKSEWMTTTCNHALYAICDVFTQFYEALNEVLLSDVFAQLQWCVKQDN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFDNMKLPEQLSEKSEWMTTTCNHALYAICDVFTQFYEALNEVLLSDVFAQLQWCVKQDN
1390 1400 1410 1420 1430 1440
1450 1460 1470 1480 1490 1500
pF1KB4 EQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPEVWDETCNCMLDIFKTTIPHVLLTWRPVGMEEDSSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EQLARSGTNCLENLVISNGEKFSPEVWDETCNCMLDIFKTTIPHVLLTWRPVGMEEDSSE
1450 1460 1470 1480 1490 1500
1510 1520 1530 1540 1550 1560
pF1KB4 KHLDVDLDRQSLSSIDKNPSERGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQKLFASLLIKCVVQLELI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 KHLDVDLDRQSLSSIDKNPSERGQSQLSNPTDDSWKGRPYANQKLFASLLIKCVVQLELI
1510 1520 1530 1540 1550 1560
1570 1580 1590 1600 1610 1620
pF1KB4 QTIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDADIHIETEDQGMYKYMSSQHLFKLLDCLQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QTIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDADIHIETEDQGMYKYMSSQHLFKLLDCLQE
1570 1580 1590 1600 1610 1620
1630 1640 1650 1660 1670 1680
pF1KB4 SHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCLRILFRMYVDENRRDSWE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCLRILFRMYVDENRRDSWE
1630 1640 1650 1660 1670 1680
1690 1700 1710 1720 1730 1740
pF1KB4 EIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKINDEKFKAHASMYYPYLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKINDEKFKAHASMYYPYLC
1690 1700 1710 1720 1730 1740
1750 1760 1770 1780
pF1KB4 EIMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWIPEEPSQVPAALSPVW
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 EIMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWIPEEPSQVPAALSPVW
1750 1760 1770 1780
>>CCDS6199.1 ARFGEF1 gene_id:10565|Hs108|chr8 (1849 aa)
initn: 7416 init1: 2745 opt: 6550 Z-score: 7382.0 bits: 1379.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 8786; 75.0% identity (87.8% similar) in 1829 aa overlap (21-1773:22-1841)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MQESQTKSMFVSRALEKILADKEVKRPQHSQLRRACQVALDEIKAEIEKQ-------RL
:::::. .:::::.::.:::.::::: ::: .
CCDS61 MYEGKKTKNMFLTRALEKILADKEVKKAHHSQLRKACEVALEEIKAETEKQSPPHGEAKA
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100
pF1KB4 GTAA-PP---KANFIEADKYFLPFELACQSKSPRVVSTSLDCLQKLIAYGHITGNAPDSG
:... :: :.::::::::::::::::::: ::.::::::::::::::::.:::::::
CCDS61 GSSTLPPVKSKTNFIEADKYFLPFELACQSKCPRIVSTSLDCLQKLIAYGHLTGNAPDST
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 APGKRLIDRIVETICSCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSPHIEIHEGTILQTVRTCYN
.:::.:::::.::::.::::::::::::::::::::::::: ::::::::.::.::::::
CCDS61 TPGKKLIDRIIETICGCFQGPQTDEGVQLQIIKALLTAVTSQHIEIHEGTVLQAVRTCYN
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFTRMENQVLQEARELEKPIQSKP----QSPVIQAA
::::::::::::::::::::::::::.:::::.::::...:: . . :::: .
CCDS61 IYLASKNLINQTTAKATLTQMLNVIFARMENQALQEAKQMEKERHRQHHHLLQSPVSHHE
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260
pF1KB4 AVSPKFVRLK-----------------HSQAQSKP----TTPEK-TDLTNGEHARSDSGK
::.. : :.. .: : ::. .:....:. .... .
CCDS61 PESPQLRYLPPQTVDHISQEHEGDLDLHTNDVDKSLQDDTEPENGSDISSAENEQTEADQ
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB4 VSTENGDAPRERGSSLSGTD--DGAQEVVKDILEDVVTSAIKEAAEKHGLTEPERVLGEL
... . . : . . : . :..:..:.:..:. .. . .: : : . :..
CCDS61 ATAAETLSKNEVLYDGENHDCEEKPQDIVQNIVEEMVNIVVGDMGE--GTTINASADGNI
310 320 330 340 350
330 340 350 360
pF1KB4 ECQECAIPPGVD-ENSQTNGIA-------------DDRQSLSSADNLES-DAQGHQVAAR
.: : : :: :.::: ::: :.:: :. :: ...: . .:.
CCDS61 G----TIEDGSDSENIQANGIPGTPISVAYTPSLPDDRLSVSSNDTQESGNSSGPSPGAK
360 370 380 390 400 410
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 FSHVLQKDAFLVFRSLCKLSMKPLGEGPPDPKSHELRSKVVSLQLLLSVLQNAGPVFRTH
:::.::::::::::::::::::::..:::::::::::::..:::::::.::::::.:::.
CCDS61 FSHILQKDAFLVFRSLCKLSMKPLSDGPPDPKSHELRSKILSLQLLLSILQNAGPIFRTN
420 430 440 450 460 470
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 EMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPDVFELSLAIFLTLLSNFKMHLKMQIEVFFKEIFLNI
::::::::::::::::::::::::.::::::.:::::::::: ::::::::::::::: :
CCDS61 EMFINAIKQYLCVALSKNGVSSVPEVFELSLSIFLTLLSNFKTHLKMQIEVFFKEIFLYI
480 490 500 510 520 530
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LETSTSSFEHRWMVIQTLTRICADAQCVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRS
::::::::.:.::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::.
CCDS61 LETSTSSFDHKWMVIQTLTRICADAQSVVDIYVNYDCDLNAANIFERLVNDLSKIAQGRG
540 550 560 570 580 590
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 GHELGMTPLQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDLYVNPNHQTSLGQERLTDQEIGDGK
..::::. .:::::::::::::::::::::::::: ::::: ::.::::. ..::... :
CCDS61 SQELGMSNVQELSLRKKGLECLVSILKCMVEWSKDQYVNPNSQTTLGQEKPSEQEMSEIK
600 610 620 630 640 650
610 620 630 640 650
pF1KB4 GLD-MARRCSVTSMESTVSSG-----TQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPK
. . : :..:.::: ::: :: . :.::::::.::::::::.::.:::::::
CCDS61 HPETINRYGSLNSLESTSSSGIGSYSTQMSGTDNPEQFEVLKQQKEIIEQGIDLFNKKPK
660 670 680 690 700 710
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 RGIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCE
::::.:::::::::. :::::::::::::::::::.::::. .:::::::::::: ::
CCDS61 RGIQYLQEQGMLGTTPEDIAQFLHQEERLDSTQVGEFLGDNDKFNKEVMYAYVDQHDFSG
720 730 740 750 760 770
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 KEFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIML
:.:::::: :::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::
CCDS61 KDFVSALRMFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYLECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIML
780 790 800 810 820 830
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 TTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIAT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:: ::::.::::::::: :
CCDS61 TTDLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSAIYNEIAGKKISMKETKELTIPT
840 850 860 870 880 890
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 KSTKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWT
::.::::::::::::::::::::::::::::::::::..:::::::::.::::::::.::
CCDS61 KSSKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHVQAPFTSATHLEHVRPMFKLAWT
900 910 920 930 940 950
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 PLLAAYSIGLQNCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFGMQLERDAYVQALARFSLLTASSS
:.:::.:.:::.::::::::::::::::::::::::..::::::::::::::.:::.::.
CCDS61 PFLAAFSVGLQDCDDTEVASLCLEGIRCAIRIACIFSIQLERDAYVQALARFTLLTVSSG
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960 970 980 990 1000 1010
pF1KB4 ITEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKTRYLSGSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::.::. :
CCDS61 ITEMKQKNIDTIKTLITVAHTDGNYLGNSWHEILKCISQLELAQLIGTGVKPRYISGTVR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1020 1030 1040 1050 1060 1070
pF1KB4 EREGSLKG-HTLAGEEFMGLGLGNLVSGGVDKRQMASFQESVGETSSQSVVVAVDRIFTG
::::: : . : .::.::: ::.:.:: .:.::.:::.::::::::::::::::::
CCDS61 GREGSLTGTKDQAPDEFVGLG---LVGGNVDWKQIASIQESIGETSSQSVVVAVDRIFTG
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1080 1090 1100 1110 1120 1130
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:::::::::::::::::::::::: : ::::::::::::::::::.::::::::::.::
CCDS61 STRLDGNAIVDFVRWLCAVSMDELLSTTHPRMFSLQKIVEISYYNMGRIRLQWSRIWEVI
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1140 1150 1160 1170 1180 1190
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS61 GDHFNKVGCNPNEDVAIFAVDSLRQLSMKFLEKGELANFRFQKDFLRPFEHIMKRNRSPT
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1200 1210 1220 1230 1240 1250
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::::..::::::::::::::::::::::.::: ::::.: .::::::::: :::: .:..
CCDS61 IRDMVVRCIAQMVNSQAANIRSGWKNIFSVFHLAASDQDESIVELAFQTTGHIVTLVFEK
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1260 1270 1280 1290 1300 1310
pF1KB4 HFPAAIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRFCGKYVSERPRVLQEYTSDDMNV
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::: :.::::.::....:::::::::
CCDS61 HFPATIDSFQDAVKCLSEFACNAAFPDTSMEAIRLIRHCAKYVSDRPQAFKEYTSDDMNV
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1320 1330 1340 1350 1360 1370
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:: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::.::::::::::::
CCDS61 APEDRVWVRGWFPILFELSCIINRCKLDVRTRGLTVMFEIMKTYGHTYEKHWWQDLFRIV
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:::::::::::: .::.::::::::::::::::::::. :.:..:::.:.:::: :::.:
CCDS61 FRIFDNMKLPEQQTEKAEWMTTTCNHALYAICDVFTQYLEVLSDVLLDDIFAQLYWCVQQ
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:::::::::::::::.:: :::::. :.::.:::: ::::::::::.:::::: . :
CCDS61 DNEQLARSGTNCLENVVILNGEKFTLEIWDKTCNCTLDIFKTTIPHALLTWRPNSGETAP
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1500 1510 1520 1530 1540
pF1KB4 ------SEKHLD------VDL-DRQSLSSIDKNPSER--GQSQLSNPTDDSWKGRPYANQ
::: :: ::. : . :.:. :. . : ... .. . . .:
CCDS61 PPPSPVSEKPLDTISQKSVDIHDSIQPRSVDNRPQAPLVSASAVNEEVSKIKSTAKFPEQ
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pF1KB4 KLFASLLIKCVVQLELIQTIDNIVFYPATSKKEDAEHMVAAQQDTLDADIHIETEDQGMY
::::.::::::::::::::::::::.::::::::::...:::.:..: :....:.:::::
CCDS61 KLFAALLIKCVVQLELIQTIDNIVFFPATSKKEDAENLAAAQRDAVDFDVRVDTQDQGMY
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pF1KB4 KYMSSQHLFKLLDCLQESHSFSKAFNSNYEQRTVLWRAGFKGKSKPNLLKQETSSLACCL
....::.:::::::: ::: :.:::::: ::::.::.::::::::::::::::::::: :
CCDS61 RFLTSQQLFKLLDCLLESHRFAKAFNSNNEQRTALWKAGFKGKSKPNLLKQETSSLACGL
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pF1KB4 RILFRMYVDENRRDSWEEIQQRLLTVCSEALAYFITVNSESHREAWTSLLLLLLTKTLKI
:::::::.::.: ..:::.:::::.::::::.::.:..:::::::::.::::.:::.:::
CCDS61 RILFRMYMDESRVSAWEEVQQRLLNVCSEALSYFLTLTSESHREAWTNLLLLFLTKVLKI
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pF1KB4 NDEKFKAHASMYYPYLCEIMQFDLIPELRAVLRKFFLRIGVVYKIWIPEEPSQVPAALSP
.:..::::::.::: ::::::::::::::::::.::::::::..: : :
CCDS61 SDNRFKAHASFYYPLLCEIMQFDLIPELRAVLRRFFLRIGVVFQISQPPEQELGINKQ
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pF1KB4 VW
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pF1KB4 RCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKRGIQFLQEQGML
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CCDS42 KNTCEDIAQFLYKGEGLNKTAIGDYLGERDEFNIQVLHAFVELHEFTDLNLVQALRQFLW
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pF1KB4 GFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNK
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CCDS42 SFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCQCNNG--VFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNPNVKDK
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CCDS42 KLGGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDSKKPNCFELYI
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CCDS53 QSSPEDVAQFLYKGEGLNKTVIGDYLGERDEFNIKVLQAFVELHEFADLNLVQALRQFLW
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pF1KB4 GFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNK
.::::::::::::.:: ::.:: :: : .: :.:: :::...::::.:.::. .:..:
CCDS53 SFRLPGEAQKIDRMMEAFASRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFAIIMLNTSLHNHNVRDK
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pF1KB4 MTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIATKSTKQNVASEKQ
: :..: ::::::.. ::::: : ..:: :... . . :
CCDS53 PTAERFIAMNRGINEGGDLPEELLRNLYESIKNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLL
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pF1KB4 RRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTPLLAAYSIGLQN
CCDS53 KLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVEDPRKPNCFELYNP
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>>CCDS12722.1 CYTH2 gene_id:9266|Hs108|chr19 (399 aa)
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pF1KB4 RCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKRGIQFLQEQGML
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CCDS12 LVEIQRLREELSEAMSEVEGLEANEGSKTLQRNRKMAMGRKKFNMDPKKGIQFLVENELL
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pF1KB4 GTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCEKEFVSALRTFLE
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CCDS12 QNTPEEIARFLYKGEGLNKTAIGDYLGEREELNLAVLHAFVDLHEFTDLNLVQALRQFLW
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pF1KB4 GFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTTDLHSPQVKNK
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CCDS12 SFRLPGEAQKIDRMMEAFAQRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFAVIMLNTSLHNPNVRDK
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pF1KB4 MTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIATKSTKQNVASEKQ
:... ::::::.. ::::: : ..:. :... . . :
CCDS12 PGLERFVAMNRGINEGGDLPEELLRNLYDSIRNEPFKIPEDDGNDLTHTFFNPDREGWLL
210 220 230 240 250 260
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pF1KB4 RRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTPLLAAYSIGLQN
CCDS12 KLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEYTTDKEPRGIIPLENLSIREVDDPRKPNCFELYIP
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>>CCDS13946.1 CYTH4 gene_id:27128|Hs108|chr22 (394 aa)
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pF1KB4 GDGKGLDMARRCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPEQFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKRG
.. :. .. ...::. : . :: : .:
CCDS13 RIKWHRKQLLEDIQKLKDEIADVFAQIDCFESAEESRMAQKEKELCI-GRKKFNMDPAKG
30 40 50 60 70
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pF1KB4 IQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSARFNKEVMYAYVDQLDFCEKE
::.. :. .: .:.:::.::.. : :..: .: .::. .: .:. :.:: .: . .
CCDS13 IQYFIEHKLLTPDVQDIARFLYKGEGLNKTAIGTYLGERDPINLQVLQAFVDCHEFANLN
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pF1KB4 FVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQTLFASADTAYVLAYSIIMLTT
.:.::: :: .::::::::::::.:: ::.:: :: : .: :.:: :::..:::::.:
CCDS13 LVQALRQFLWSFRLPGEAQKIDRMMEAFATRYCLCNPG--VFQSTDTCYVLSFSIIMLNT
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pF1KB4 DLHSPQVKNKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELTIATKS
.::.:.:... :....::::::...::::. : .... :... ... :
CCDS13 SLHNPNVRDRPPFERFVSMNRGINNGSDLPEDQLRNLFDSIKSEPFSIPEDDGNDLTHTF
200 210 220 230 240 250
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pF1KB4 TKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKLVWTPL
CCDS13 FNPDREGWLLKLGGRVKTWKRRWFILTDNCLYYFEFTTDKEPRGIIPLENLSVQKVDDPK
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>>CCDS33703.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (963 aa)
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Smith-Waterman score: 515; 41.0% identity (73.2% similar) in 205 aa overlap (632-831:514-716)
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pF1KB4 GDGKGLDMARRCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPE-QFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKR
:.: . .::.... : :..::::::..
CCDS33 NCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRI--GLNLFNKKPEK
490 500 510 520 530 540
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pF1KB4 GIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSAR-FNKEVMYAYVDQLDFCE
:.:.: :.:.. . .:.:: :.. :. ..:.:::. . ::..:. ::..::
CCDS33 GVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFST
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 KEFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQT-LFASADTAYVLAYSIIM
:. ::: : .:. :::::..::.: :. :: :: : . : . :: ..::..::.
CCDS33 MELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIIL
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pF1KB4 LTTDLHSPQVK--NKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELT
:.::..::.:: :: :..:: ::..:..:.:.:.: .:::.:. ... .:
CCDS33 LNTDMYSPNVKPERKMKLEDFIKNLRGVDDGEDIPREMLMGIYERIRKRELKTNEDHVSQ
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 IATKSTKQNVASEKQRRLLYNLEMEQMAKTAKALMEAVSHAKAPFTSATHLDHVRPMFKL
CCDS33 VQKVEKLIVGKKPIGSLHPGLGCVLSLPHRRLVCYCRLFEVPDPNKPQKLGLHQREIFLF
730 740 750 760 770 780
>>CCDS74902.1 IQSEC1 gene_id:9922|Hs108|chr3 (1114 aa)
initn: 503 init1: 182 opt: 515 Z-score: 573.7 bits: 118.7 E(32554): 1.2e-25
Smith-Waterman score: 515; 41.0% identity (73.2% similar) in 205 aa overlap (632-831:500-702)
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GDGKGLDMARRCSVTSMESTVSSGTQTTVQDDPE-QFEVIKQQKEIIEHGIELFNKKPKR
:.: . .::.... : :..::::::..
CCDS74 NCSSESSSRDSLREQTLSKQTYHKEARNSWDSPAFSNDVIRKRHYRI--GLNLFNKKPEK
470 480 490 500 510 520
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pF1KB4 GIQFLQEQGMLGTSVEDIAQFLHQEERLDSTQVGDFLGDSAR-FNKEVMYAYVDQLDFCE
:.:.: :.:.. . .:.:: :.. :. ..:.:::. . ::..:. ::..::
CCDS74 GVQYLIERGFVPDTPVGVAHFLLQRKGLSRQMIGEFLGNRQKQFNRDVLDCVVDEMDFST
530 540 550 560 570 580
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pF1KB4 KEFVSALRTFLEGFRLPGEAQKIDRLMEKFAARYIECNQGQT-LFASADTAYVLAYSIIM
:. ::: : .:. :::::..::.: :. :: :: : . : . :: ..::..::.
CCDS74 MELDEALRKFQAHIRVQGEAQKVERLIEAFSQRYCICNPGVVRQFRNPDTIFILAFAIIL
590 600 610 620 630 640
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pF1KB4 LTTDLHSPQVK--NKMTKEQYIKMNRGINDSKDLPEEYLSSIYEEIEGKKIAMKETKELT
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