Result of FASTA (omim) for
pF1KB4366
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4366, 923 aa
1>>>pF1KB4366 923 - 923 aa - 923 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9621+/-0.000382; mu= 14.8705+/- 0.024
mean_var=151.2191+/-31.472, 0's: 0 Z-trim(116.5): 187 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.104297
statistics sampled from 27421 (27655) to 27421 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.663), E-opt: 0.2 (0.324), width: 16
Scan time: 13.930
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001138548 (OMIM: 607442) echinoderm microtubule ( 923) 6235 950.9 0
NP_061936 (OMIM: 607442) echinoderm microtubule-as ( 981) 5558 849.1 0
XP_006712055 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm ( 913) 5222 798.5 0
XP_005264324 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm ( 992) 5222 798.5 0
XP_006712054 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm ( 934) 5219 798.1 0
XP_005264325 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm ( 762) 3647 561.5 5.8e-159
XP_005267457 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 802) 1552 246.2 4.7e-64
XP_016876563 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 771) 1538 244.1 2e-63
NP_004425 (OMIM: 600348,602033) echinoderm microtu ( 815) 1538 244.1 2.1e-63
XP_011534842 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 821) 1537 244.0 2.3e-63
NP_001008707 (OMIM: 600348,602033) echinoderm micr ( 834) 1321 211.5 1.4e-53
XP_011534844 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 796) 1307 209.4 5.9e-53
XP_011534843 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 803) 1307 209.4 5.9e-53
XP_005267455 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 821) 1307 209.4 6e-53
XP_005267454 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 834) 1307 209.4 6.1e-53
XP_005267456 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echi ( 840) 1307 209.4 6.1e-53
XP_011539102 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1062) 266 52.8 1e-05
XP_011539099 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1229) 266 52.9 1.1e-05
XP_011539098 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1239) 266 52.9 1.2e-05
XP_006710446 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1239) 266 52.9 1.2e-05
XP_005270577 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1250) 266 52.9 1.2e-05
XP_011539097 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1250) 266 52.9 1.2e-05
XP_011539096 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1250) 266 52.9 1.2e-05
XP_011539095 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1250) 266 52.9 1.2e-05
XP_016855911 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1283) 266 52.9 1.2e-05
NP_001182760 (OMIM: 614259) cilia- and flagella-as (1283) 266 52.9 1.2e-05
NP_689711 (OMIM: 614259) cilia- and flagella-assoc ( 698) 229 47.1 0.00036
NP_001161437 (OMIM: 614259) cilia- and flagella-as ( 698) 229 47.1 0.00036
XP_011520396 (OMIM: 609540) PREDICTED: WD repeat-c ( 305) 205 43.2 0.0024
NP_079510 (OMIM: 609540) WD repeat-containing prot ( 305) 205 43.2 0.0024
NP_001290176 (OMIM: 609540) WD repeat-containing p ( 305) 205 43.2 0.0024
XP_016878352 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 655) 206 43.6 0.0038
NP_005877 (OMIM: 602703,616212) katanin p80 WD40 r ( 655) 206 43.6 0.0038
XP_016878353 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 655) 206 43.6 0.0038
XP_006721186 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 658) 206 43.6 0.0038
XP_016878350 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 672) 206 43.6 0.0039
XP_005255829 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 672) 206 43.6 0.0039
XP_016878351 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 672) 206 43.6 0.0039
XP_006721185 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 675) 206 43.6 0.0039
XP_006721184 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 675) 206 43.6 0.0039
XP_016878349 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 675) 206 43.6 0.0039
XP_011521112 (OMIM: 602703,616212) PREDICTED: kata ( 675) 206 43.6 0.0039
XP_016855910 (OMIM: 614259) PREDICTED: cilia- and (1192) 205 43.7 0.0065
NP_005103 (OMIM: 604734) WD repeat-containing prot ( 466) 197 42.1 0.0076
NP_059830 (OMIM: 604734) WD repeat-containing prot ( 606) 197 42.2 0.0092
XP_016864369 (OMIM: 604734) PREDICTED: WD repeat-c ( 659) 197 42.3 0.0097
>>NP_001138548 (OMIM: 607442) echinoderm microtubule-ass (923 aa)
initn: 6235 init1: 6235 opt: 6235 Z-score: 5078.3 bits: 950.9 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6235; 99.9% identity (100.0% similar) in 923 aa overlap (1-923:1-923)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSIKRPSPA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSIKRPSPA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 EKSHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQEGEYIKMFMRGRPITM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EKSHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQEGEYIKMFMRGRPITM
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFNYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFNYE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 ERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQIIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQIIG
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQRKAKGAEIKTTNEVVLAVEFH
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::
NP_001 LGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQKKAKGAEIKTTNEVVLAVEFH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSGGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSGGV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILWDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILWDH
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 DLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELWGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELWGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 ATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGRWF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGRWF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 VLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGRCT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGRCT
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLGFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLGFQ
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 VFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSHVT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 NVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSNTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSNTP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 TPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEEPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEEPC
850 860 870 880 890 900
910 920
pF1KB4 NEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
:::::::::::::::::::::::
NP_001 NEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
910 920
>>NP_061936 (OMIM: 607442) echinoderm microtubule-associ (981 aa)
initn: 5558 init1: 5558 opt: 5558 Z-score: 4527.4 bits: 849.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5949; 93.8% identity (93.9% similar) in 955 aa overlap (27-923:27-981)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB4 SVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKS-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSGTEKKKE
70 80 90 100 110 120
120
pF1KB4 ---------------------------------------------------IKRPSPAEK
:::::::::
NP_061 KPQGQREKKEESHSNDQSPQIRASPSPQPSSQPLQIHRQTPESKNATPTKSIKRPSPAEK
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 SHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQEGEYIKMFMRGRPITMFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQEGEYIKMFMRGRPITMFI
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 PSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFNYEER
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFNYEER
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 TQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQIIGLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 TQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQIIGLG
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 TFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQRKAKGAEIKTTNEVVLAVEFHPT
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::
NP_061 TFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQKKAKGAEIKTTNEVVLAVEFHPT
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 DANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSGGVML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSGGVML
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 IWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILWDHDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 IWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILWDHDL
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 NPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELWGLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 NPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELWGLAT
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 HPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGRWFVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 HPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGRWFVL
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGRCTGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 DAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGRCTGH
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLGFQVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLGFQVF
730 740 750 760 770 780
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 GVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSHVTNV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 GVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSHVTNV
790 800 810 820 830 840
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 SFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSNTPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 SFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSNTPTP
850 860 870 880 890 900
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 PPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEEPCNE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_061 PPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEEPCNE
910 920 930 940 950 960
910 920
pF1KB4 ISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
:::::::::::::::::::::
NP_061 ISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
970 980
>>XP_006712055 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm micr (913 aa)
initn: 5405 init1: 5210 opt: 5222 Z-score: 4254.6 bits: 798.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5590; 92.1% identity (92.4% similar) in 913 aa overlap (80-923:1-913)
50 60 70 80 90 100
pF1KB4 RRLAISEDHVASVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSS
10 20 30
110
pF1KB4 AAKS--------------------------------------------------------
::::
XP_006 AAKSGTEKKKEKPQGQREKKEESHSNDQSPQIRASPSPQPSSQPLQIHRQTPESKNATPT
40 50 60 70 80 90
120 130 140 150 160
pF1KB4 --IKRPSPAEKSHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQ-------
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KSIKRPSPAEKSHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQAKMSTRE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 ----EGEYIKMFMRGRPITMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KNSQEGEYIKMFMRGRPITMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYL
160 170 180 190 200 210
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LPTGEIVYFIASVVVLFNYEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRP
::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 LPTGKIVYFIASVVVLFNYEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRP
220 230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.
XP_006 LQPHVRVWDSVTLSTLQIIGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCIIDDSNEHMLTVWDWQK
280 290 300 310 320 330
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 KAKGAEIKTTNEVVLAVEFHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKF
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450 460
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VQCLAFLGNGDVLTGDSGGVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 RNGMLLTGGGKDRKIILWDHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRG
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pF1KB4 TFNDGFQIEVQGHTDELWGLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TFNDGFQIEVQGHTDELWGLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHC
520 530 540 550 560 570
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 ADFHPSGTVVAIGTHSGRWFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IYLYVVSENGRKYSRYGRCTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 NRSDCKDIDWTTYTCVLGFQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQY
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pF1KB4 PCSKAKAPSHKYSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 PCSKAKAPSHKYSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVAD
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pF1KB4 TTLTKAPVSSTESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TTLTKAPVSSTESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHS
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pF1KB4 EEESEEGSGDLGEPLYEEPCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 EEESEEGSGDLGEPLYEEPCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
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>>XP_005264324 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm micr (992 aa)
initn: 5886 init1: 5210 opt: 5222 Z-score: 4254.1 bits: 798.5 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5842; 92.5% identity (92.8% similar) in 955 aa overlap (38-923:38-992)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 SKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKS--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSGTEKKKEKPQGQRE
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120
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::::::::::::::::
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130 140 150 160 170
pF1KB4 SDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQ-----------EGEYIKMFMRGRPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_005 SDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQAKMSTREKNSQEGEYIKMFMRGRPI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 TMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGKIVYFIASVVVLFN
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240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQI
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:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELW
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLG
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pF1KB4 FQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSH
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pF1KB4 VTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVSSTESVIQSN
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pF1KB4 TPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDLGEPLYEE
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pF1KB4 PCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
:::::::::::::::::::::::::
XP_005 PCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
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initn: 5210 init1: 5210 opt: 5219 Z-score: 4252.1 bits: 798.1 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6197; 98.5% identity (98.8% similar) in 934 aa overlap (1-923:1-934)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 SVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSIKRPSPA
70 80 90 100 110 120
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::
XP_006 EKSHNSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQAKMSTREKNSQEGEYI
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
XP_006 KMFMRGRPITMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGKIVYF
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 IASVVVLFNYEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 IASVVVLFNYEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWD
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB4 SVTLSTLQIIGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQRKAKGAEIKT
::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.:::::::::
XP_006 SVTLSTLQIIGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCIIDDSNEHMLTVWDWQKKAKGAEIKT
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pF1KB4 TNEVVLAVEFHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 TNEVVLAVEFHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGN
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB4 GDVLTGDSGGVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GDVLTGDSGGVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGG
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pF1KB4 GKDRKIILWDHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GKDRKIILWDHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIE
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pF1KB4 VQGHTDELWGLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VQGHTDELWGLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTV
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pF1KB4 VAIGTHSGRWFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 VAIGTHSGRWFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSEN
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650 660 670 680 690 700
pF1KB4 GRKYSRYGRCTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDID
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 GRKYSRYGRCTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDID
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pF1KB4 WTTYTCVLGFQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 WTTYTCVLGFQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPS
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 HKYSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 HKYSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETVADTTLTKAPVS
790 800 810 820 830 840
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pF1KB4 STESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 STESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSG
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920
pF1KB4 DLGEPLYEEPCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_006 DLGEPLYEEPCNEISKEQAKATLLEDQQDPSPSS
910 920 930
>>XP_005264325 (OMIM: 607442) PREDICTED: echinoderm micr (762 aa)
initn: 4311 init1: 3635 opt: 3647 Z-score: 2974.9 bits: 561.5 E(85289): 5.8e-159
Smith-Waterman score: 4267; 90.0% identity (90.4% similar) in 721 aa overlap (38-689:38-758)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 LDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVS
::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVS
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 SKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKS--------------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAGKETLSSAAKSGTEKKKEKPQGQRE
70 80 90 100 110 120
120
pF1KB4 --------------------------------------------IKRPSPAEKSHNSWEN
::::::::::::::::
XP_005 KKEESHSNDQSPQIRASPSPQPSSQPLQIHRQTPESKNATPTKSIKRPSPAEKSHNSWEN
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170
pF1KB4 SDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQ-----------EGEYIKMFMRGRPI
::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
XP_005 SDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVIINQAKMSTREKNSQEGEYIKMFMRGRPI
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pF1KB4 TMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::
XP_005 TMFIPSDVDNYDDIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKDCRANVYLLPTGKIVYFIASVVVLFN
250 260 270 280 290 300
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 YEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 YEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAGVDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQI
310 320 330 340 350 360
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 IGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHMLTVWDWQRKAKGAEIKTTNEVVLAVE
:::::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::.::::::::::::::::::
XP_005 IGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCIIDDSNEHMLTVWDWQKKAKGAEIKTTNEVVLAVE
370 380 390 400 410 420
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 FHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFGKYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSG
430 440 450 460 470 480
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 GVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIKAHDGSVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILW
490 500 510 520 530 540
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 DHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 DHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGTSRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELW
550 560 570 580 590 600
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 GLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 GLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTRLVDEPGHCADFHPSGTVVAIGTHSGR
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 WFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHDNFIYLYVVSENGRKYSRYGR
670 680 690 700 710 720
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 CTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKLIRNRSDCKDIDWTTYTCVLG
:::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 CTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYLYGL
730 740 750 760
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 FQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLFQYPCSKAKAPSHKYSAHSSH
>>XP_005267457 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echinode (802 aa)
initn: 3141 init1: 1150 opt: 1552 Z-score: 1270.9 bits: 246.2 E(85289): 4.7e-64
Smith-Waterman score: 3178; 55.2% identity (82.1% similar) in 814 aa overlap (2-807:3-802)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALADVLRRLAISEDHV
:: . : ::: ::::. .: ::...::.:::.:::.: .::.:::::.::: :.:..
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pF1KB4 ESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSEDHSEEESEEGSGDL
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pF1KB4 ADTTLTKAPVSSTESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSED
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10 20 30 40
pF1KB4 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITVLKAALA
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NP_004 MEDGFSSYSSLYDTSSLLQFCNDDSASAASSMEVTDRIASLEQRVQMQEDDIQLLKSALA
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pF1KB4 DVLRRLAISEDHVASVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVSIAG--K
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NP_004 DVVRRLNITEEQQAVLNRKGPTKARPLMQTLPLRTTVNNGTVLPKKPTG-SLPSPSGVRK
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pF1KB4 ETLSSAAKS-IKRPSPAEKSH--NSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTADKHKDVI
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NP_004 ETAVPATKSNIKRTSSSERVSPGGRRESNGDSRGNRNRTGSTSSSSSGKKNSESKPKEPV
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NP_004 FSAEEGYVKMFLRGRPVTMYMPKDQVDSYSLEAKVELPTKRLKLEWVYGYRGRDCRNNLY
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pF1KB4 HCADFHPSGTVVAIGTHSGRWFVLDAETRDLVSIHTDGNEQLSVMRYSIDGTFLAVGSHD
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NP_004 QSSGFHPSGSVVAVGTLTGRWFVFDTETKDLVTVHTDGNEQLSVMRYSPDGNFLAIGSHD
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pF1KB4 NFIYLYVVSENGRKYSRYGRCTGHSSYITHLDWSPDNKYIMSNSGDYEILYWDIPNGCKL
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NP_004 NCIYIYGVSDNGRKYTRVGKCSGHSSFITHLDWSVNSQFLVSNSGDYEILYW-VPSACKQ
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pF1KB4 IRNRSDCKDIDWTTYTCVLGFQVFGVWPEGSDGTDINALVRSHNRKVIAVADDFCKVHLF
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NP_004 VVSVETTRDIEWATYTCTLGFHVFGVWPEGSDGTDINAVCRAHEKKLLSTGDDFGKVHLF
710 720 730 740 750 760
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pF1KB4 QYPCSKAKAPSHKYSAHSSHVTNVSFTHNDSHLISTGGKDMSIIQWKLVEKLSLPQNETV
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NP_004 SYPCSQFRAPSHIYGGHSSHVTNVDFLCEDSHLISTGGKDTSIMQWRVI
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pF1KB4 ADTTLTKAPVSSTESVIQSNTPTPPPSQPLNETAEEESRISSSPTLLENSLEQTVEPSED
>>XP_011534842 (OMIM: 600348,602033) PREDICTED: echinode (821 aa)
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10 20 30 40
pF1KB4 MDGFAGSLDDSISAASTSDVQDRLSALESRVQQQEDEITV
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XP_011 MMYNEIGEAKKITERFIDPDKELEIMILNDSASAASSMEVTDRIASLEQRVQMQEDDIQL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 LKAALADVLRRLAISEDHVASVKKSVSSKGQPSPRAVIPMSCITNGSGANRKPSHTSAVS
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XP_011 LKSALADVVRRLNITEEQQAVLNRKGPTKARPLMQTLPLRTTVNNGTVLPKKPTG-SLPS
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pF1KB4 IAG--KETLSSAAKS-IKRPSPAEKSH--NSWENSDDSRNKLSKIPSTPKLIPKVTKTAD
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XP_011 PSGVRKETAVPATKSNIKRTSSSERVSPGGRRESNGDSRGNRNRTGSTSSSSSGKKNSES
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pF1KB4 KHKDVIINQEGEYIKMFMRGRPITMFIPSD-VDNYD-DIRTELPPEKLKLEWAYGYRGKD
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XP_011 KPKEPVFSAEEGYVKMFLRGRPVTMYMPKDQVDSYSLEAKVELPTKRLKLEWVYGYRGRD
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pF1KB4 CRANVYLLPTGEIVYFIASVVVLFNYEERTQRHYLGHTDCVKCLAIHPDKIRIATGQIAG
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XP_011 CRNNLYLLPTGETVYFIASVVVLYNVEEQLQRHYAGHNDDVKCLAVHPDRITIATGQVAG
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pF1KB4 VDKDGRPLQPHVRVWDSVTLSTLQIIGLGTFERGVGCLDFSKADSGVHLCVIDDSNEHML
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XP_011 TSKDGKQLPPHVRIWDSVTLNTLHVIGIGFFDRAVTCIAFSKSNGGTNLCAVDDSNDHVL
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pF1KB4 TVWDWQRKAKGAEIKTTNEVVLAVEFHPTDANTIITCGKSHIFFWTWSGNSLTRKQGIFG
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XP_011 SVWDWQKEEKLADVKCSNEAVFAADFHPTDTNIIVTCGKSHLYFWTLEGSSLNKKQGLFE
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pF1KB4 KYEKPKFVQCLAFLGNGDVLTGDSGGVMLIWSKTTVEPTPGKGPKGVYQISKQIK-AHDG
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XP_011 KQEKPKFVLCVTFSENGDTITGDSSGNILVWGK------------GTNRISYAVQGAHEG
420 430 440 450 460
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pF1KB4 SVFTLCQMRNGMLLTGGGKDRKIILWDHDLNPEREIEVPDQYGTIRAVAEGKADQFLVGT
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XP_011 GIFALCMLRDGTLVSGGGKDRKLISWSGNYQKLRKTEIPEQFGPIRTVAEGKGDVILIGT
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pF1KB4 SRNFILRGTFNDGFQIEVQGHTDELWGLATHPFKDLLLTCAQDRQVCLWNSMEHRLEWTR
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