Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4360
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4360, 795 aa
1>>>pF1KB4360 795 - 795 aa - 795 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5101+/-0.000963; mu= 19.1636+/- 0.058
mean_var=69.1813+/-13.953, 0's: 0 Z-trim(104.7): 193 B-trim: 5 in 2/50
Lambda= 0.154198
statistics sampled from 7823 (8022) to 7823 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.602), E-opt: 0.2 (0.246), width: 16
Scan time: 3.660
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 ( 795) 5163 1158.2 0
CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 ( 795) 4035 907.3 0
CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 794) 4033 906.9 0
CCDS4257.1 PCDHB15 gene_id:56121|Hs108|chr5 ( 787) 3952 888.8 0
CCDS4245.1 PCDHB3 gene_id:56132|Hs108|chr5 ( 796) 3927 883.3 0
CCDS4251.1 PCDHB16 gene_id:57717|Hs108|chr5 ( 776) 3923 882.4 0
CCDS4256.1 PCDHB14 gene_id:56122|Hs108|chr5 ( 798) 3909 879.3 0
CCDS4244.1 PCDHB2 gene_id:56133|Hs108|chr5 ( 798) 3876 871.9 0
CCDS4254.1 PCDHB12 gene_id:56124|Hs108|chr5 ( 795) 3854 867.0 0
CCDS4253.1 PCDHB11 gene_id:56125|Hs108|chr5 ( 797) 3848 865.7 0
CCDS4250.1 PCDHB8 gene_id:56128|Hs108|chr5 ( 801) 3826 860.8 0
CCDS4249.1 PCDHB7 gene_id:56129|Hs108|chr5 ( 793) 3814 858.1 0
CCDS4255.1 PCDHB13 gene_id:56123|Hs108|chr5 ( 798) 3771 848.6 0
CCDS75328.1 PCDHB9 gene_id:56127|Hs108|chr5 ( 797) 3730 839.5 0
CCDS4252.1 PCDHB10 gene_id:56126|Hs108|chr5 ( 800) 3717 836.6 0
CCDS78067.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 ( 658) 3466 780.7 0
CCDS4243.1 PCDHB1 gene_id:29930|Hs108|chr5 ( 818) 2589 585.6 1.1e-166
CCDS54922.1 PCDHGA1 gene_id:56114|Hs108|chr5 ( 931) 2175 493.6 6.4e-139
CCDS75346.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 820) 2161 490.4 5e-138
CCDS4260.1 PCDHGA12 gene_id:26025|Hs108|chr5 ( 932) 2161 490.4 5.5e-138
CCDS75341.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 828) 2144 486.6 6.9e-137
CCDS58981.1 PCDHGA9 gene_id:56107|Hs108|chr5 ( 932) 2144 486.7 7.6e-137
CCDS75343.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 850) 2138 485.3 1.8e-136
CCDS47292.1 PCDHGA10 gene_id:56106|Hs108|chr5 ( 936) 2138 485.3 1.9e-136
CCDS47289.1 PCDHGA2 gene_id:56113|Hs108|chr5 ( 932) 2134 484.4 3.6e-136
CCDS75332.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 811) 2132 484.0 4.3e-136
CCDS54924.1 PCDHGB2 gene_id:56103|Hs108|chr5 ( 931) 2132 484.0 4.8e-136
CCDS75340.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 818) 2130 483.5 5.9e-136
CCDS75339.1 PCDHGB5 gene_id:56101|Hs108|chr5 ( 923) 2130 483.5 6.5e-136
CCDS75337.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 803) 2105 478.0 2.7e-134
CCDS54928.1 PCDHGB4 gene_id:8641|Hs108|chr5 ( 923) 2105 478.0 3.1e-134
CCDS75333.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 813) 2104 477.7 3.2e-134
CCDS54925.1 PCDHGA5 gene_id:56110|Hs108|chr5 ( 931) 2104 477.8 3.6e-134
CCDS75336.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 817) 2095 475.7 1.3e-133
CCDS54927.1 PCDHGA7 gene_id:56108|Hs108|chr5 ( 932) 2095 475.8 1.5e-133
CCDS75335.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 818) 2091 474.8 2.4e-133
CCDS54926.1 PCDHGA6 gene_id:56109|Hs108|chr5 ( 932) 2091 474.9 2.7e-133
CCDS75345.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 837) 2081 472.6 1.2e-132
CCDS47294.1 PCDHGA11 gene_id:56105|Hs108|chr5 ( 935) 2081 472.7 1.3e-132
CCDS75342.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 820) 2080 472.4 1.3e-132
CCDS54929.1 PCDHGB6 gene_id:56100|Hs108|chr5 ( 930) 2080 472.4 1.5e-132
CCDS75330.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 810) 2074 471.1 3.3e-132
CCDS54923.1 PCDHGB1 gene_id:56104|Hs108|chr5 ( 927) 2074 471.1 3.7e-132
CCDS75334.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 814) 2066 469.3 1.1e-131
CCDS58980.1 PCDHGB3 gene_id:56102|Hs108|chr5 ( 929) 2066 469.3 1.3e-131
CCDS75338.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 820) 2063 468.6 1.8e-131
CCDS75331.1 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 851) 2063 468.6 1.9e-131
CCDS47291.1 PCDHGA8 gene_id:9708|Hs108|chr5 ( 932) 2063 468.6 2e-131
CCDS58979.2 PCDHGA4 gene_id:56111|Hs108|chr5 ( 962) 2063 468.7 2.1e-131
CCDS75344.1 PCDHGB7 gene_id:56099|Hs108|chr5 ( 808) 2057 467.3 4.5e-131
>>CCDS4247.1 PCDHB5 gene_id:26167|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 5163 init1: 5163 opt: 5163 Z-score: 6201.0 bits: 1158.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5163; 100.0% identity (100.0% similar) in 795 aa overlap (1-795:1-795)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
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CCDS42 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDEVTQPFVIDEKTAEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDEVTQPFVIDEKTAEI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 RLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 RLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENAP
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNITI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNITI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 TVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDSG
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 TNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPAL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 SSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNAW
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHVL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAAP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 VGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 VGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAGE
730 740 750 760 770 780
790
pF1KB4 EIGKTAAFRNSFGLN
:::::::::::::::
CCDS42 EIGKTAAFRNSFGLN
790
>>CCDS4246.1 PCDHB4 gene_id:56131|Hs108|chr5 (795 aa)
initn: 4035 init1: 2871 opt: 4035 Z-score: 4844.8 bits: 907.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4035; 77.8% identity (90.9% similar) in 789 aa overlap (5-792:4-792)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
:.. .:::. . ....: .. : .:::. :::::: ::.::::::::.::::
CCDS42 MKKLGRIHPNRQVLAFILMVFLSQVRLEPIRYSVLEETESGSFVAHLAKDLGLGIGELA
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
.:.::. .:. :::: .::.::: :::::: .:: :::.::::..:: :::::: .
CCDS42 SRSARVLSDDDKQRLQLDRQTGDLLLREKLDREELCGPIEPCVLHFQVFLEMPVQFFQGE
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFHV
: . :::::.: :::.:.:::: :..::::.::: ::.:.:.::: .:.::::::::::.
CCDS42 LLIQDINDHSPIFPEREVLLKILENSQPGTLFPLLIAEDLDVGSNGLQKYTISPNSHFHI
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
:.:...:.:::.:: :: :::::.::.::::.:::::.::::::. .::...: :::::
CCDS42 LTRNHSEGKKYPDLVQDKPLDREEQPEFSLTLVALDGGSPPRSGTVMVRILIMDINDNAP
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290
pF1KB4 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQG-DEVTQPFVIDEKTAE
::... : ::: :::::.: .: : :::.::: .:::.:.:::. ::. : : :.: :.:
CCDS42 EFVHTPYGVQVLENSPLDSPIVRVLARDIDAGNFGSVSYGLFQASDEIKQTFSINEVTGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
: ::. :::: :.::: :::::::::: ::.::::::::: ::: .:.:.: ::::
CCDS42 ILLKKKLDFEKIKSYHVEIEATDGGGLSGKGTVVIEVVDVNDNPPELIISSLTSSIPENA
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
:::::..: . : :::.::.::::: ..:::.:::::::::::::.: ::::..::::::
CCDS42 PETVVSIFRIRDRDSGENGKMICSIPDNLPFILKPTLKNFYTLVTERPLDRETSAEYNIT
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:.:::.:::::::..:::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IAVTDLGTPRLKTQQNITVQVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
::::::::::::::.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGASDRGSPA
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
:::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDTNDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::.:::::::::.:::: : .:
CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGDSGTGEFKFLKPIFPNLLVQDTG
720 730 740 750 760 770
780 790
pF1KB4 EEIGKTAAFRNSFGLN
.:. .. ::::.
CCDS42 REVKENPKFRNSLVFS
780 790
>>CCDS4248.1 PCDHB6 gene_id:56130|Hs108|chr5 (794 aa)
initn: 4028 init1: 4028 opt: 4033 Z-score: 4842.4 bits: 906.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4033; 78.7% identity (91.7% similar) in 784 aa overlap (10-792:9-791)
10 20 30 40 50
pF1KB4 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLW-EAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGEL
.:::: :. :::.:: :.:::...::. :::::: ::::.::::: ::::
CCDS42 MMQTKVQNKKRQVAFF-ILLMLWGEVGSESIQYSVLEETESGTFVANLTKDLGLRVGEL
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 ATRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQT
:.::::. .:::.. ::.: .: .::: :::::: .::.::::.: ::.:::::.::::.
CCDS42 ASRGARVVFKGNRQHLQFDPQTHDLLLNEKLDREELCGSTEPCVLPFQVLLENPLQFFQA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 DLQLTDINDHAPEFPEKEMLLKIPESTQPGTVFPLKIAQDFDIGSNTVQNYTISPNSHFH
.:.. :::::::::: .:::::: : :.:: .::::.:.:.: ::: .: :::: : :::
CCDS42 SLRVRDINDHAPEFPAREMLLKISEITMPGKIFPLKMAHDLDTGSNGLQRYTISSNPHFH
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNA
: :.::..:::.::::::: :::::.:.: ::: :::::.::::::. :.: ::: :::.
CCDS42 VLTRNRSEGRKFPELVLDKPLDREEQPQLRLTLIALDGGSPPRSGTSEIQIQVLDINDNV
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 PEFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDEVTQPFVIDEKTAE
::: : .::.:::::.::.:::..:::::::::..:.:.::::: :.:.::: :. :.:
CCDS42 PEFAQELYEAQVPENNPLGSLVITVSARDLDAGSFGKVSYALFQVDDVNQPFEINAITGE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
:::..::::: :.:.. :::::::::::.....:.:::::::::::: . : :::
CCDS42 IRLRKALDFEEIQSYDVDVEATDGGGLSGKCSLVVRVLDVNDNAPELTMSFFISLIPENL
300 310 320 330 340 350
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CCDS42 REMEETPTSRNSFPFS
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CCDS42 RKSEFLE
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CCDS42 EFAQPLYEVAVLENTPVNSVIVTVSASDLDTGSFGTISYAFFHASEEIRKTFQLNPITGD
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CCDS42 MQLVKYLNFEAINSYEVDIEAKDGGGLSGKSTVIVQVVDVNDNPPELTLSSVNSPIPENS
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CCDS42 ERVSEANPSFRKSFEFS
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CCDS42 TRKARIISQGNKQHLQLKAQTGDLLINEKLDREELCGPTEPCILHFQVLMENPLEIFQAE
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CCDS42 EFEQPIYKVQIPENSPLGSLVATVSARDLDGGANGKISYTLFQPSEDISKTLEVNPMTGE
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pF1KB4 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
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CCDS42 VRLRKQVDFEMVTSYEVRIKATDGGGLSGKCTLLLQVVDVNDNPPQVTMSALTSPIPENS
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pF1KB4 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
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CCDS42 PEIVVAVFSVSDPDSGNNGKTISSIQEDLPFLLKPSVKNFYTLVTERALDREARAEYNIT
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CCDS42 LTVTDMGTPRLKTEHNITVQISDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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CCDS42 GTNAQVTYSLLPPQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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CCDS42 LSREALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 LLVDGFSQPFLPLPEAAPGQTQANSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 SVGRCSMPEGPFPGRLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETSEFKFLKPIIPNFSP
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pF1KB4 EEIGKTAAFRNSFGLN
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CCDS42 MEIRGALDLRKRQVLIFLVLLGLSRAGTESAHYSVAEETEIGSFVANLARDLGLGVEELS
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CCDS42 SREARVVSDDNKKYLHLDLLTGNLLLNEKLDRDELCGSTEPCVLHFQVVLENPLQFFRFE
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CCDS42 LCVKDINDHSPTFLDKEILIKISEGTTVGATFLMESAQDLDVGSNSLQNYTISPNSHFYI
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CCDS42 KIPDSSDRKIYPELVLDRALDYEQEAELRLTLTAVDGGSPPKSGTTLVLIKVLDINDNAP
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CCDS42 EFPQSLYEVQVPEDRPLGSWIATISAKDLDAGNYGKISYTFFHASEDIRKTFEINPISGE
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pF1KB4 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
. :. ::::. :...: ::::::::::::. ..:.:.::: ::.:.:.... ::::
CCDS42 VNLRSPLDFEVIQSYTINIQATDGGGLSGKCTLLVKVMDINDNPPEVTISSITKRIPENA
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
::.::.::. : :::::::::::::..:::.::::.:::.:::....::::::::::::
CCDS42 SETLVALFSILDQDSGDNGRMICSIQDNLPFFLKPTFKNFFTLVSEKALDRESQAEYNIT
370 380 390 400 410 420
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:::::.::::::::.:::::.::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEYNITVLLSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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480 490 500 510 520 530
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::::::.:::::::. :: :::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDRHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQEFEFRVGATDRGSPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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CCDS42 SVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFQVHDTG
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780 790
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CCDS42 RNMGEIENFRNSFGLNIQ
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CCDS42 LAVRGARVVSKGKKMHLQFDRQTGDLLLNEKLDREELCGPTEPCVLPFQVLLENPLQFFQ
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CCDS42 AELRIRDVNDHSPVFLDKEILLKIPESITPGTTFLIERAQDLDVGTNSLQNYTISPNFHF
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CCDS42 VPEFAKLLYEVQIPEDSPVGSQVAIVSARDLDIGTNGEISYAFSQASEDIRKTFRLSAKS
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CCDS42 GELLLRQKLDFESIQTYTVNIQATDGGGLSGTCVVFVQVMDLNDNPPELTMSTLINQIPE
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: .:..::::::::::::::::.::::.::::.:::...:::::: . .::::...:::
CCDS42 NLQDTLIAVFSVSDPDSGDNGRMVCSIQDDLPFFLKPSVENFYTLVISTALDRETRSEYN
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:::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITITVTDFGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDR
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::::::::::::::::.::: :::::::::::::::::.::::::::::::::::.::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 PALSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQ
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pF1KB4 NAWLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATL
:::::::::::::::::..::::::::::::: ::::::.::::::::::::::::::::
CCDS42 NAWLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLRERDAAKQRLVVLVKDNGEPPRSATATL
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660 670 680 690 700 710
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CCDS42 HVLLVDGFSQPYLLLPEAAPAQAQADLLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSR
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pF1KB4 AAPVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQG
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CCDS42 AASVGRCSVPEGPFPGQMVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSGTNEFKFLKPIIPNFVAQG
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CCDS42 A-ERVSEANPSFRKSFEFT
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pF1KB4 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
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CCDS42 SRGARVVSNDNKECLQLDTNTGDLLLREMLDREELCGSNEPCVLYFQVLMKNPTQFLQIE
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CCDS42 EFEQAFYEVKILENSILGSLVVTVSAWDLDSGTNSELSYTFSHASEDIRKTFEINQKSGD
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CCDS42 ITLTAPLDFEAIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVRIQVMDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
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CCDS42 PETVVMVFRIRDRDSGDNGKMVCSIPEDIPFVLKSSVNNYYTLETERPLDRESRAEYNIT
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CCDS42 ITVTDLGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYALFVRENNSPALHIGSISATDRDS
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::::::.::::: :.::: ::::::::::::::::::::::::::.:.:::::::.::::
CCDS42 GTNAQVNYSLLPSQDPHLPLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQGFQFRVGATDHGSPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
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CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
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pF1KB4 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
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CCDS42 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCVTGGSRSNKFKFLKPIIPNFLPQSTG
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pF1KB4 EEIGKTAAFRNSFGLN
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CCDS42 SEVEENPPFQNNLGF
790
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pF1KB4 METALAKTPQKRQVMFLAILLLLWEAGSEAVRYSIPEETESGYSVANLAKDLGLGVGELA
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CCDS42 MENQGTRTQQIRQVLLLFVLLGMSQAGSETWSFSVAEEMQSGSFVGNLAKDLGLKVRELS
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pF1KB4 TRGARMHYKGNKELLQLDIKTGNLLLYEKLDREVMCGATEPCILHFQLLLENPVQFFQTD
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CCDS42 SRGARVVSNDKKQRLQLDINTGDLLLSETLDREELCGSIEPCVLHLQVLMQNPTQFLQIE
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CCDS42 LQVRDINDHSPIFSEKQMLLEIPENSPVGAVFLLESAKDLDVGINAVKSYTISPNSHFHI
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pF1KB4 ATHNRGDGRKYPELVLDKALDREERPELSLTLTALDGGAPPRSGTTTIRIVVLDNNDNAP
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CCDS42 KMRVIPDNRKYPELVLDKALDYEELPELSFILSALDGGSPPRSGTALVRVVVVDINDNSP
190 200 210 220 230 240
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pF1KB4 EFLQSFYEVQVPENSPLNSLVVVVSARDLDAGAYGSVAYALFQGDE-VTQPFVIDEKTAE
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CCDS42 EFEQAFYEVKIRENSILGSLILIVSAWDLDSGTNGEICYTFSHASEDIRKTFEINQKSGE
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pF1KB4 IRLKRALDFEATPYYNVEIVATDGGGLSGKCTVAIEVVDVNDNAPELTMSTLSSPTPENA
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CCDS42 ITLRAPLDFETIESYSIIIQATDGGGLFGKSTVIIHVIDVNDNAPEITVSSITSPIPENT
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pF1KB4 PETVVAVFSVSDPDSGDNGRMICSIQNDLPFLLKPTLKNFYTLVTQRTLDRESQAEYNIT
::::: :::..: :::::::..::: .::::.:: ...:.::: :.: ::::: ::::::
CCDS42 PETVVMVFSIQDIDSGDNGRIVCSIPEDLPFVLKSSVENYYTLETERPLDRESTAEYNIT
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pF1KB4 ITVTDMGTPRLKTEHNITVLVSDVNDNAPAFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
:::::.: :::::::: ::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 ITVTDLGIPRLKTEHNTTVLVSDVNDNAPTFTQTSYTLFVRENNSPALHIGSVSATDRDS
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pF1KB4 GTNAQVTYSLLPPQNPHLRLASLVSINADNGHLFALRSLDYEALQAFEFRVGATDRGSPA
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CCDS42 GTNAQVNYSLLPPQDLHLPLASLVSINTDNGHLFALRSLDYEALQAFDFRVGATDRGSPA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LSSEALVRVLVLDANDNSPFVLYPLQNGSAPCTELVPRAAEPGYLVTKVVAVDGDSGQNA
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pF1KB4 WLSYQLLKATEPGLFSMWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLHV
:::::::::::::::..:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:
CCDS42 WLSYQLLKATEPGLFGVWAHNGEVRTARLLSERDAAKHRLVVLVKDNGEPPRSATATLQV
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 LLVDGFSQPYLPLPEAAPAQAQADSLTVYLVVALASVSSLFLFSVLLFVAVRLCRRSRAA
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 PVGRCSVPEGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYHYEVCLTGDSGAGEFKFLKPIIPNLLPQGAG
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CCDS42 SVGSCSVPKGPFPGHLVDVSGTGTLSQSYQYEVCLTGGSETNEFKFLKPVIPNIQAKGLG
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pF1KB4 EEIGKTAAFRNSFGLN
.. ....::::::.:
CCDS42 KNSEENSTFRNSFGFNF
790
795 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:33:46 2016 done: Thu Nov 3 21:33:46 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]