Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4334
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4334, 473 aa
1>>>pF1KB4334 473 - 473 aa - 473 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8945+/-0.00106; mu= 13.9429+/- 0.064
mean_var=64.5813+/-12.855, 0's: 0 Z-trim(102.4): 74 B-trim: 4 in 1/51
Lambda= 0.159596
statistics sampled from 6846 (6920) to 6846 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.568), E-opt: 0.2 (0.213), width: 16
Scan time: 2.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 3163 737.5 6.9e-213
CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 473) 2979 695.2 3.9e-200
CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 402) 2613 610.9 7.9e-175
CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 ( 388) 2582 603.8 1.1e-172
CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 474) 2552 596.9 1.5e-170
CCDS3474.1 GABRB1 gene_id:2560|Hs108|chr4 ( 474) 2461 575.9 3.1e-164
CCDS4355.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 ( 512) 2088 490.0 2.4e-138
CCDS14707.1 GABRQ gene_id:55879|Hs108|chrX ( 632) 1218 289.7 5.9e-78
CCDS36.1 GABRD gene_id:2563|Hs108|chr1 ( 452) 1077 257.2 2.5e-68
CCDS59029.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 462) 1039 248.5 1.1e-65
CCDS5019.2 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 479) 1039 248.5 1.2e-65
CCDS59028.1 GABRR1 gene_id:2569|Hs108|chr6 ( 392) 1028 245.9 5.5e-65
CCDS5020.3 GABRR2 gene_id:2570|Hs108|chr6 ( 465) 1028 246.0 6.5e-65
CCDS4375.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 440) 1009 241.6 1.3e-63
CCDS54617.1 GABRR3 gene_id:200959|Hs108|chr3 ( 467) 1000 239.5 5.7e-63
CCDS14160.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 959 230.1 3.8e-60
CCDS48085.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 452) 957 229.6 5.3e-60
CCDS43283.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 449) 940 225.7 7.9e-59
CCDS3822.1 GLRA3 gene_id:8001|Hs108|chr4 ( 464) 940 225.7 8.2e-59
CCDS4320.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 449) 935 224.5 1.8e-58
CCDS54942.1 GLRA1 gene_id:2741|Hs108|chr5 ( 457) 926 222.5 7.5e-58
CCDS43980.2 GLRA4 gene_id:441509|Hs108|chrX ( 417) 920 221.1 1.8e-57
CCDS4358.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 467) 920 221.1 2e-57
CCDS3796.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 497) 916 220.2 4e-57
CCDS4359.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 475) 915 219.9 4.5e-57
CCDS3470.1 GABRG1 gene_id:2565|Hs108|chr4 ( 465) 889 214.0 2.8e-55
CCDS45194.1 GABRA5 gene_id:2558|Hs108|chr15 ( 462) 877 211.2 1.9e-54
CCDS45195.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 467) 876 211.0 2.2e-54
CCDS3471.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 451) 872 210.0 4.1e-54
CCDS82921.1 GABRA2 gene_id:2555|Hs108|chr4 ( 511) 872 210.1 4.6e-54
CCDS14706.1 GABRA3 gene_id:2556|Hs108|chrX ( 492) 865 208.4 1.4e-53
CCDS3473.1 GABRA4 gene_id:2557|Hs108|chr4 ( 554) 852 205.5 1.2e-52
CCDS75368.1 GABRP gene_id:2568|Hs108|chr5 ( 289) 847 204.2 1.5e-52
CCDS4356.1 GABRA6 gene_id:2559|Hs108|chr5 ( 453) 844 203.6 3.6e-52
CCDS4357.1 GABRA1 gene_id:2554|Hs108|chr5 ( 456) 836 201.8 1.3e-51
CCDS55371.1 GLRA2 gene_id:2742|Hs108|chrX ( 363) 834 201.3 1.4e-51
CCDS14703.1 GABRE gene_id:2564|Hs108|chrX ( 506) 821 198.3 1.6e-50
CCDS54813.1 GLRB gene_id:2743|Hs108|chr4 ( 303) 660 161.2 1.4e-39
CCDS47333.1 GABRG2 gene_id:2566|Hs108|chr5 ( 515) 476 118.9 1.3e-26
CCDS59251.1 GABRG3 gene_id:2567|Hs108|chr15 ( 253) 465 116.3 3.9e-26
CCDS53710.1 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 463) 321 83.2 6.5e-16
CCDS8365.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 484) 321 83.2 6.8e-16
CCDS3459.1 CHRNA9 gene_id:55584|Hs108|chr4 ( 479) 318 82.5 1.1e-15
CCDS6135.1 CHRNA6 gene_id:8973|Hs108|chr8 ( 494) 318 82.5 1.1e-15
CCDS53964.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 489) 304 79.3 1e-14
CCDS10305.1 CHRNA3 gene_id:1136|Hs108|chr15 ( 505) 304 79.3 1.1e-14
CCDS6059.1 CHRNA2 gene_id:1135|Hs108|chr8 ( 529) 293 76.7 6.5e-14
CCDS6134.1 CHRNB3 gene_id:1142|Hs108|chr8 ( 458) 289 75.8 1.1e-13
CCDS13517.1 CHRNA4 gene_id:1137|Hs108|chr20 ( 627) 285 74.9 2.7e-13
CCDS8366.2 HTR3A gene_id:3359|Hs108|chr11 ( 516) 283 74.4 3.1e-13
>>CCDS10019.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (473 aa)
initn: 3163 init1: 3163 opt: 3163 Z-score: 3935.5 bits: 737.5 E(32554): 6.9e-213
Smith-Waterman score: 3163; 100.0% identity (100.0% similar) in 473 aa overlap (1-473:1-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB4 LPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
430 440 450 460 470
>>CCDS10018.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (473 aa)
initn: 2979 init1: 2979 opt: 2979 Z-score: 3706.5 bits: 695.2 E(32554): 3.9e-200
Smith-Waterman score: 2979; 99.8% identity (100.0% similar) in 448 aa overlap (26-473:26-473)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPP
.::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MCSGLLELLLPIWLSWTLGTRGSEPRSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPD
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 SYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 PYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 PYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSKSESNR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 VDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 VDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRFLGDRS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470
pF1KB4 LPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 LPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
430 440 450 460 470
>>CCDS53921.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (402 aa)
initn: 2613 init1: 2613 opt: 2613 Z-score: 3252.3 bits: 610.9 E(32554): 7.9e-175
Smith-Waterman score: 2613; 100.0% identity (100.0% similar) in 393 aa overlap (81-473:10-402)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 RLRPDFGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MWATYQTEEDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDN
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 RVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RVADQLWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 DEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DEQNCTLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAY
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 PRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 PRLSLSFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTIN
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 THLRETLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAK
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NDRSKSESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPRE
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 GHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLY
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 YVN
:::
CCDS53 YVN
400
>>CCDS53920.1 GABRB3 gene_id:2562|Hs108|chr15 (388 aa)
initn: 2582 init1: 2582 opt: 2582 Z-score: 3213.9 bits: 603.8 E(32554): 1.1e-172
Smith-Waterman score: 2582; 100.0% identity (100.0% similar) in 388 aa overlap (86-473:1-388)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 FGGPPVCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQ
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQ
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 LWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LWVPDTYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNC
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 TLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLEIESYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSL
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 SFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SFRLKRNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRE
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 TLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLPKIPYVKAIDMYLMGCFVFVFLALLEYAFVNYIFFGRGPQRQKKLAEKTAKAKNDRSK
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 SESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SESNRVDAHGNILLTSLEVHNEMNEVSGGIGDTRNSAISFDNSGIQYRKQSMPREGHGRF
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LGDRSLPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 LGDRSLPHKKTHLRRRSSQLKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSLFNLVYWLYYVN
340 350 360 370 380
>>CCDS4354.1 GABRB2 gene_id:2561|Hs108|chr5 (474 aa)
initn: 2120 init1: 2120 opt: 2552 Z-score: 3175.1 bits: 596.9 E(32554): 1.5e-170
Smith-Waterman score: 2552; 79.8% identity (92.4% similar) in 475 aa overlap (1-473:1-474)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MWGLAGGRLFGIFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLKGYDIRLRPDFGGPP
:: . :::.: :...:.:: :::::::.:::.::::::.:::::::::::::::::
CCDS43 MWRVRKRGYFGIWSFPLIIAAVC-AQSVNDPSNMSLVKETVDRLLKGYDIRLRPDFGGPP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VCVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQYWRDKRLAYSGIPLNLTLDNRVADQLWVPD
: :::::::::::::::::::::::::::: ::::::.:. :::::::::::::::::::
CCDS43 VAVGMNIDIASIDMVSEVNMDYTLTMYFQQAWRDKRLSYNVIPLNLTLDNRVADQLWVPD
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS43 TYFLNDKKSFVHGVTVKNRMIRLHPDGTVLYGLRITTTAACMMDLRRYPLDEQNCTLEIE
120 130 140 150 160 170
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CCDS34 DRHGVP-SKGRIRRRASQLKVKIPDLTDVNSIDKWSRMFFPITFSLFNVVYWLYYVH
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pF1KB4 SYGYTTDDIEFYWRGGDKAVTGVERIELPQFSIVEHRLVSRNVVFATGAYPRLSLSFRLK
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CCDS43 SYGYTTDDIEFYWRGDDNAVTGVTKIELPQFSIVDYKLITKKVVFSTGSYPRLSLSFKLK
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CCDS43 RNIGYFILQTYMPSILITILSWVSFWINYDASAARVALGITTVLTMTTINTHLRETLPKI
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CCDS43 DLTDVNAIDRWSRIFFPVVFSFFNIVYWLYYVN
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CCDS14 KFPMDKQACNLVVESYGYTVEDIILFWDDNGNAIHMTEELHIPQFTFLGRTITSKEVYFY
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CCDS14 TTIDSHLRDKLPNISCIKAIDIYILVCLFFVFLSLLEYVYINYLFYSRGPRRQPRRHRRP
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CCDS36 YPMDEQECMLDLESYGYSSEDIVYYWSESQEHIHGLDKLQLAQFTITSYRFTTELMNFKS
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CCDS36 AKVKVSRPRAE---MDVRNAIVLFSL----------SAAGVTQELAIS-------RRQRR
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pF1KB4 MPRE--GHGRFLGDRSLPHKKTHLRRRSSQ--LKIKIPDLTDVNAIDRWSRIVFPFTFSL
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CCDS36 VPGNLMGSYRSVGVETGETKKEGAARSGGQGGIRARLRPI-DADTIDIYARAVFPAAFAA
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:..:: :
CCDS36 VNVIYWAAYAM
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pF1KB4 IFSAPVLVAVVCCAQSVNDPGNMSFVKETVDKLLK--GYDIRLRPDFGGPPVCVGMNIDI
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CCDS59 PGREVHEMSKKGSPILRRSPDITKSPLTKSEQLLRIDDHDFSMRPGFGGPAIPVGVDVQV
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CCDS59 ESLDSISEVDMDFTMTLYLRHYWKDERLSFPSTNNLSMTFDGRLVKKIWVPDMFFVHSKR
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CCDS59 SFIHDTTTDNVMLRVQPDGKVLYSLRVTVTAMCNMDFSRFPLDTQTCSLEIESYAYTEDD
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CCDS59 IYLWVSFVFVFLSVLEYAAVNYLTTVQ-ERKEQKLREKLP-CTSGLPPPRTAMLD--GNY
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CCDS59 ------SDGEVNDLDNYMPENGEKP---DRMMVQLTLAS-----------ERSSPQRKSQ
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CCDS59 ---RSSYVSMRI----DTHAIDKYSRIIFPAAYILFNLIYWSIFS
430 440 450 460
473 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Sat Nov 5 05:48:23 2016 done: Sat Nov 5 05:48:24 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]