Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4329
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4329, 937 aa
1>>>pF1KB4329 937 - 937 aa - 937 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.2560+/-0.00121; mu= 16.9681+/- 0.073
mean_var=88.3095+/-17.777, 0's: 0 Z-trim(102.4): 36 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.136480
statistics sampled from 6932 (6954) to 6932 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.57), E-opt: 0.2 (0.214), width: 16
Scan time: 3.350
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 937) 6097 1211.5 0
CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 939) 5195 1033.9 0
CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 ( 951) 4310 859.7 0
CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 919) 4003 799.2 0
CCDS13855.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 ( 949) 3896 778.2 0
CCDS865.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 739) 1031 214.0 8.6e-55
CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050) 633 135.7 4.5e-31
CCDS76192.1 AP4B1 gene_id:10717|Hs108|chr1 ( 571) 622 133.4 1.2e-30
CCDS45331.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1082) 551 119.6 3.4e-26
CCDS61737.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1101) 551 119.6 3.4e-26
CCDS64186.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1045) 526 114.6 9.9e-25
CCDS4041.1 AP3B1 gene_id:8546|Hs108|chr5 (1094) 526 114.6 1e-24
>>CCDS32622.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (937 aa)
initn: 6097 init1: 6097 opt: 6097 Z-score: 6486.5 bits: 1211.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6097; 100.0% identity (100.0% similar) in 937 aa overlap (1-937:1-937)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 DSLVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLPAVKA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 KGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 KGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPLMPNQ
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 SIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 SIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQVFLAT
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 WKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 WKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNGIWIL
850 860 870 880 890 900
910 920 930
pF1KB4 AELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 AELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
910 920 930
>>CCDS13856.2 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (939 aa)
initn: 5198 init1: 3615 opt: 5195 Z-score: 5526.6 bits: 1033.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5195; 84.1% identity (95.2% similar) in 941 aa overlap (1-937:1-939)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS13 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS13 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
CCDS13 VAALSEIAESHPSSNLLDLNPQSINKLLTALNECTEWGQIFILDCLANYMPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
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CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS13 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650
pF1KB4 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
610 620 630 640 650 660
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 GGLDSLVGQS-FIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYVAPKAVWLP
::::::.: . :. . :.. .:. : ..:::.:::.:..:.: :.::::::::::
CCDS13 GGLDSLIGGTNFV--APPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAVWLP
670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 AVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPL
:.::::::::::::.. : : :....:::::: :::::::::.::::. :..:: .:.::
CCDS13 AMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPL
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 MPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVEDGKMERQV
:::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::..::::::::.::.
CCDS13 SPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQM
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 FLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDMLYQSLKLTNG
::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.::::::::::::::::::::
CCDS13 FLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNG
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930
pF1KB4 IWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
::.:::::::::::. :::::::::::::..::.:..::::
CCDS13 IWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
900 910 920 930
>>CCDS32621.1 AP2B1 gene_id:163|Hs108|chr17 (951 aa)
initn: 4289 init1: 4289 opt: 4310 Z-score: 4584.7 bits: 859.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6059; 98.5% identity (98.5% similar) in 951 aa overlap (1-937:1-951)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLRDLIADSNPMVVANA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCLSNYNPKDDREAQSI
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YPNKYESIIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB4 DSL--------------VGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 DSLLGSDLGGGIGGSPAVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGG
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB4 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 YVAPKAVWLPAVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIP
730 740 750 760 770 780
770 780 790 800 810 820
pF1KB4 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 STPLAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLF
790 800 810 820 830 840
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 VEDGKMERQVFLATWKDIPNENELQFQIKECHLNADTVSSKLQNNNVYTIAKRNVEGQDM
850 860 870 880 890 900
890 900 910 920 930
pF1KB4 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS32 LYQSLKLTNGIWILAELRIQPGNPNYTLSLKCRAPEVSQYIYQVYDSILKN
910 920 930 940 950
>>CCDS54515.1 AP1B1 gene_id:162|Hs108|chr22 (919 aa)
initn: 5078 init1: 3615 opt: 4003 Z-score: 4258.3 bits: 799.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5039; 82.4% identity (93.2% similar) in 941 aa overlap (1-937:1-919)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKDVSSLFPDVVNCMQT
:::::::::.:::::::::::::..::::.:::::::::.::::::::.:::::::::::
CCDS54 MTDSKYFTTTKKGEIFELKAELNSDKKEKKKEAVKKVIASMTVGKDVSALFPDVVNCMQT
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
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:::::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::::.:.:::.::::::::::
CCDS54 YLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQLVEDQGFLDTLKDLISDSNPMVVANA
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:::::::.::::.:::::::::.:::::::::::::::::::::::.:: ::::::::::
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pF1KB4 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPKDSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGEPEVQY
::::::::::::::::::::::::::.:.: :: :::. ::::::::::::::.:::.::
CCDS54 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
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::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:::::
CCDS54 YATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIKDIFRK
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:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
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::.::::::::::::::::::::::.::.:::::::::.:::::..:. .: :: . .:.
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....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
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::::::.: . :. . :.. .:. : ..:::.:::.:..:.: :.:::::::
CCDS54 GGLDSLIGGTNFV--APPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVAPKAV---
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pF1KB4 AVKAKGLEISGTFTHRQGHIYMEMNFTNKALQHMTDFAIQFNKNSFGVIPSTPLAIHTPL
: : :....:::::: :::::::::.::::. :..:: .:.::
CCDS54 -----------------GSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAPLQVHAPL
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:::....::::.:.: :::::::::::::::::::::::: : ::..::::::::.::.
CCDS54 SPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVEDGKMDRQM
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::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.::::::::::::::::::::
CCDS54 FLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQSLKLTNG
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CCDS54 IWVLAELRIQPGNPSCTLSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
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CCDS13 DNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNTFVKDCEDPNPLIRALAVRTMGCIRVDKITE
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CCDS13 CERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFMEMLSKDLDYYGTLLKKLAPPLVTLLSAEPELQY
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CCDS13 VALRNINLIVQKRPEILKHEMKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKE
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:::::::.::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YPNKYESVIATLCENLDSLDEPEARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEGFHDESTQV
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pF1KB4 QLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVTAKEV
:: :::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::
CCDS13 QLQLLTAIVKLFLKKPTETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVAAKEV
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pF1KB4 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
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CCDS13 VLAEKPLISEETDLIEPTLLDELICYIGTLASVYHKPPSAFVEGGRGVVHKSLPPRTASS
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pF1KB4 DAGDSP-VGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQV--SSMQMGAVDLLG
....:: .. : : :::.:::.:::::::::::::::::. : . ::.:::::::::
CCDS13 ESAESPETAPTGAPPGEQPDVIPAQGDLLGDLLNLDLGPPVSGPPLATSSVQMGAVDLLG
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::::::.:. : .. .: :. :: :: ..:::.:::.:..:.: :.:::
CCDS13 GGLDSLMGDE--PEGIGGTNFVAPPTAAVPANLGAPIGSGLSDLFDLTSGVGTLSGSYVA
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CCDS13 PKAVWLPAMKAKGLEISGTFTRQVGSISMDLQLTNKALQVMTDFAIQFNRNSFGLAPAAP
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pF1KB4 LAIHTPLMPNQSIDVSLPLNTLGPVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSCLIPLNVLFVED
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CCDS13 LQVHAPLSPNQTVEISLPLSTVGSVMKMEPLNNLQVAVKNNIDVFYFSTLYPLHILFVED
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:::.::.::::::::::::: ::::..: :::...:::::..:..:.:::::::::::::
CCDS13 GKMDRQMFLATWKDIPNENEAQFQIRDCPLNAEAASSKLQSSNIFTVAKRNVEGQDMLYQ
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CCDS13 SLKLTNGIWVLAELRIQPGNPSCTDLELSLKCRAPEVSQHVYQAYETILKN
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. ::. .:. . :.:. :::..:.. ::.:..... : .... : .:. :..:.:
CCDS86 GVQEYIQQPILNGLRDKASYVRRVAVLGCAKMHNLHGDSEVDGALVNELYSLLRDQDPIV
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:.: . .: :: ... . . .: ..::. ... .::: .:. : :.:....:
CCDS86 VVNCLRSLEEILKQEGG---VVINKPIAHHLLNRMSKLDQWGQAEVLNFLLRYQPRSEEE
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pF1KB4 AQSICERVTPRLSHANSAVVLSAVKVLMKFLELLPK-DSDYYNMLLKKLAPPLVTLLSGE
.: . . :. .. .::..:.:... . ...:. ..: .: .. ::.. :.:
CCDS86 LFDILNLLDSFLKSSSPGVVMGATKLFLILAKMFPHVQTD----VLVRVKGPLLAACSSE
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pF1KB4 P-EVQYVALRNINLIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQV
:. .::: .. :... : .... : :: .:..: :.::.:.... .:... :. ::
CCDS86 SRELCFVALCHVRQILHSLPGHFSSHYKKFFCSYSEPHYIKLQKVEVLCELVNDENVQQV
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pF1KB4 LAELKEYATEVDVDFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVI
: ::. : :.:..::.. :. ::: : . ...::. : .:. . .... .. ..
CCDS86 LEELRGYCTDVSADFAQAAIFAIGGIA---RTYTDQCVQILTELLGLRQEHITTVVVQTF
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pF1KB4 RDIFRKYPNKYESIIATL--CENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDNADELLESFLEG
::. :. :.. .: :: ..... ... :.::..: ..::: :: .::.:.:.
CCDS86 RDLVWLCPQCTEAVCQALPGCE--ENIQDSEGKQALIWLLGVHGERIPNAPYVLEDFVEN
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pF1KB4 FHDES-TQVQLTLLTAIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLS
..:. :.. ::::...:::..:.: :... ..: .. . .:::: .:.:::
CCDS86 VKSETFPAVKMELLTALLRLFLSRPAECQDMLGRLLYYCIEEEKDMAVRDRGLFYYRLLL
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pF1KB4 TDPVTAKEVVLSEK--PLISEETDLIE-PTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGI
. .:... : : : .. : : : .. ...:. :: : : . .:
CCDS86 VGIDEVKRILCSPKSDPTLGLLEDPAERP--VNSWASDFNTLVPVYGKAHWATISKCQGA
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pF1KB4 HRKHLPIHHGSTDAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSM
.: . . :. :...:. : :. : .:..: :.
CCDS86 ERCDPELPKTSSFAASGPL--IPEENKERVQELPDSGALMLVPNRQLTADYFEKTWLSLK
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pF1KB4 QMGAVDLLGGGLDSLVGQSFIPSSVPATFAPSPTPAVVSSGLNDLFELSTGIGMAPGGYV
CCDS86 VAHQQVLPWRGEFHPDTLQMALQVVNIQTIAMSRAGSRPWKAYLSAQDDTGCLFLTELLL
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>>CCDS61736.1 AP3B2 gene_id:8120|Hs108|chr15 (1050 aa)
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10 20 30 40
pF1KB4 MTDSKYFTTNKKGEIFELKAELNNEKKEKRKEAVKKVIAAMTVGKD
.:: :...: . ::.:...: .. ::.
CCDS61 KGGSAGPGEPEYGHDPASGGIFSSDYKRHDDLKEMLDTNKDSLKLEAMKRIVAMIARGKN
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50 60 70 80 90 100
pF1KB4 VSSLFPDVVNCMQTDNLELKKLVYLYLMNYAKSQPDMAIMAVNSFVKDCEDPNPLIRALA
.:.::: ::. : :. :::: :::: :
CCDS61 ASDLFPAVVK--------------------------------NVACKNIEDPNQLIRASA
80 90
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pF1KB4 VRTMGCIRVDKITEYLCEPLRKCLKDEDPYVRKTAAVCVAKLHDINAQMVEDQGFLDSLR
.:... ::: :. . ... .: .:::::::: . ::....... .:: ... ..
CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
100 110 120 130 140 150
170 180 190 200 210 220
pF1KB4 DLIADSNPMVVANAVAALSEISESHPNSNLLDLNPQNINKLLTALNECTEWGQIFILDCL
:.::.. .:....: :. :. :. .:: .: :: . : . ::::. :.. :
CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
160 170 180 190 200 210
230 240 250
pF1KB4 SNY------NP-----------------KDDREAQSICERVT---------PRLSHANSA
. : .: ... ::.. . : : . .
CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
220 230 240 250 260 270
260 270 280 290 300
pF1KB4 VVLSAVKVLMKFLE---LLPKDSDYYNMLLKK----LAPPLVTLLSGEPEVQYVALRNIN
..: .: :.. .. . :... : .: :: :: .. :::::.:.:.
CCDS61 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
280 290 300 310 320 330
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pF1KB4 LIVQKRPEILKQEIKVFFVKYNDPIYVKLEKLDIMIRLASQANIAQVLAELKEYATEVDV
. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
340 350 360 370 380 390
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pF1KB4 DFVRKAVRAIGRCAIKVEQSAERCVSTLLDLIQTKVNYVVQEAIVVIRDIFRKYPNKYES
::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::. ... : ..
CCDS61 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
400 410 420 430 440 450
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pF1KB4 IIATLCENLDSLDEPDARAAMIWIVGEYAERIDN-ADELLESFLEGFHDESTQVQLTLLT
:: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.: ...
CCDS61 IIKHLAKLTDNIQVPMARASILWLIGEYCEHVPRIAPDVLRKMAKSFTAEEDIVKLQVIN
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pF1KB4 AIVKLFLKKPSETQELVQQVLSLATQDSDNPDLRDRGYIYWRLLSTDPVT------AKEV
.::.: . ..:. :.: ::::: :. : :.:::. . .:. . ::..
CCDS61 LAAKLYLTNSKQTKLLTQYVLSLAKYDQ-NYDIRDRARFTRQLIVPSEQGGALSRHAKKL
520 530 540 550 560 570
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pF1KB4 VLSEKPLISEETDLIEPTLLDELICHIGSLASVYHKPPNAFVEGSHGIHRKHLPIHHGST
:. :: . ..: .. :. ..:::. . . ... :
CCDS61 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
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pF1KB4 DAGDSPVGTTTATNLEQPQVIPSQGDLLGDLLNLDLGPPVNVPQVSSMQMGAVDLLGGGL
CCDS61 VPEWTKCSNREKRKEKEKPFYSDSEGESGPTESADSDPESESESDSKSSSESGSGESSSE
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.:. . : .:. . . ... .:::
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230 240 250 260 270
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.:. : :.:....: .: . . :. .. .::..:.:... . ...:. ..:
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.... .:... :. ::: ::. : :.:..::.. :. ::: : . ...::. : .:
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. . .... .. ..::. :. :.. .: :: ..... ... :.::..: ..
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. .:::: .:.::: . .:... : : : .. : : . . ...:. :
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: : : . .: .: . . :. :...:. : :. : .:..: :.
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260 270 280 290 300
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..: .: :.. .. . :... : .: :: :: .. :::::.:.:.
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. :: ... .: :... .:: .:. ::... ::...:: :: :.. : .:
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370 380 390 400 410 420
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::: ...:::::: .. . . :.. :..:.... . :: :..:::. ... : ..
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:: : . :... : :::...:..::: :.. : ..:... ..: : :.: ...
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50 60 70 80 90 100
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CCDS61 ASDLFPAVVKNVACKNIEVKKLVYVYLVRYAEEQQDLALLSISTFQRGLKDPNQLIRASA
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CCDS61 LRVLSSIRVPIIVPIMMLAIKEAASDMSPYVRKTAAHAIPKLYSLDSDQ-KDQ-LIEVIE
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CCDS61 KLLADKTTLVAGSVVMAFEEVC---PER--IDLIHKNYRKLCNLLIDVEEWGQVVIISML
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230 240 250
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CCDS61 TRYARTQFLSPTQNESLLEENAEKAFYGSEEDEAKGAGSEETAAAAAPSRKPYVMDPDHR
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260 270 280 290 300
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CCDS61 LLLRNTKPLLQSRSAAVVMAVAQLYFHLAPKAEVGVIAKALVRLLRSHSEVQYVVLQNVA
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CCDS61 TMSIKRRGMFEPYLKSFYIRSTDPTQIKILKLEVLTNLANETNIPTVLREFQTYIRSMDK
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370 380 390 400 410 420
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CCDS61 DFVAATIQAIGRCATNIGRVRDTCLNGLVQLLSNRDELVVAESVVVIKKLLQMQPAQHGE
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490 500 510 520 530 540
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550 560 570 580 590 600
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CCDS61 FLAPKP-----APVLESSFKDRDHFQLGSLSHLLNAKATGYQELPDWPEEAPDPSVRNVE
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18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Thu Nov 3 14:47:04 2016 done: Thu Nov 3 14:47:05 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]