Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4219
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4219, 941 aa
1>>>pF1KB4219 941 - 941 aa - 941 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.9077+/-0.000862; mu= 14.7272+/- 0.053
mean_var=104.0912+/-20.761, 0's: 0 Z-trim(109.0): 73 B-trim: 17 in 2/51
Lambda= 0.125709
statistics sampled from 10541 (10614) to 10541 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.669), E-opt: 0.2 (0.326), width: 16
Scan time: 3.460
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8216.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 941) 6310 1155.3 0
CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 932) 6134 1123.4 0
CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 934) 6132 1123.1 0
CCDS73345.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 ( 920) 5978 1095.1 0
CCDS42786.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 489) 1037 198.9 2e-50
CCDS46459.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 575) 1037 198.9 2.3e-50
CCDS42785.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 683) 1037 199.0 2.7e-50
CCDS33334.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 ( 933) 1037 199.0 3.5e-50
CCDS5289.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 779) 752 147.3 1.1e-34
CCDS47513.1 PDE10A gene_id:10846|Hs108|chr6 ( 789) 752 147.3 1.1e-34
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 526 106.2 1.4e-22
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 526 106.2 1.5e-22
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 526 106.2 1.5e-22
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 526 106.2 1.5e-22
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 526 106.2 1.6e-22
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 526 106.2 1.6e-22
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 526 106.2 1.6e-22
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 526 106.2 1.7e-22
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 526 106.2 1.7e-22
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 526 106.2 1.7e-22
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 526 106.3 1.8e-22
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 526 106.3 1.8e-22
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 526 106.3 1.9e-22
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 520 105.2 4e-22
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 520 105.2 4.5e-22
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 520 105.2 4.6e-22
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 514 104.1 7.4e-22
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 514 104.1 7.5e-22
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 514 104.1 9.4e-22
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 514 104.1 9.5e-22
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 514 104.1 9.6e-22
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 514 104.1 1e-21
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 514 104.1 1e-21
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 514 104.1 1.1e-21
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 506 102.7 2.5e-21
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 506 102.7 3.1e-21
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 506 102.7 3.2e-21
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 506 102.7 3.2e-21
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 506 102.7 3.3e-21
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 500 101.5 4.2e-21
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 500 101.5 4.7e-21
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 500 101.6 5.8e-21
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 500 101.6 5.9e-21
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 457 93.7 9.4e-19
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 457 93.7 9.7e-19
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 457 93.7 1e-18
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 457 93.7 1e-18
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 446 91.7 3.7e-18
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 446 91.7 3.9e-18
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 446 91.7 4e-18
>>CCDS8216.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 (941 aa)
initn: 6310 init1: 6310 opt: 6310 Z-score: 6182.7 bits: 1155.3 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6310; 100.0% identity (100.0% similar) in 941 aa overlap (1-941:1-941)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGQACGHSILCRSQQYPAARPAEPRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MGQACGHSILCRSQQYPAARPAEPRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DASSLQLKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 DASSLQLKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVV
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ARNLSNAEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ARNLSNAEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPD
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AYAHPLFYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AYAHPLFYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 ASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMH
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 AFSVSHFCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 AFSVSHFCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYS
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 SEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDL
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QKMAEVGYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 QKMAEVGYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 GNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSH
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940
pF1KB4 KFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 KFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
910 920 930 940
>>CCDS53678.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 (932 aa)
initn: 6134 init1: 6134 opt: 6134 Z-score: 6010.3 bits: 1123.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6134; 99.8% identity (99.9% similar) in 920 aa overlap (22-941:13-932)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGQACGHSILCRSQQYPAARPAEPRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
:. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MKKQRIQEGKSLAHRRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DASSLQLKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DASSLQLKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVV
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 EDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTD
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 EDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITE
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ARNLSNAEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ARNLSNAEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPD
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 AYAHPLFYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AYAHPLFYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 SIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNF
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 ASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 ASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMH
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 AFSVSHFCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 AFSVSHFCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYS
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 SEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDL
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QKMAEVGYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 QKMAEVGYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAM
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 GNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSH
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940
pF1KB4 KFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
900 910 920 930
>>CCDS44670.1 PDE2A gene_id:5138|Hs108|chr11 (934 aa)
initn: 6132 init1: 6132 opt: 6132 Z-score: 6008.3 bits: 1123.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6132; 100.0% identity (100.0% similar) in 917 aa overlap (25-941:18-934)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGQACGHSILCRSQQYPAARPAEPRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 MVLVLHHILIAVVQFLRRGQQVFLKPDEPPPPPQPCADSLQDALLSLGSVIDI
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SGLQRAVKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GLGFSDLPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EKHTLVALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 DASSLQLKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 EDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ARNLSNAEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AYAHPLFYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SIYCGISIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 ASFTYTPRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 AFSVSHFCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SEGSVMERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 QKMAEVGYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 GNRPMEMMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSH
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 KFTIRGLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
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CCDS73 VKEALSAVLPRVETVYTYLLDGESQLVCEDPPHELPQEGKVREAIISQKRLGCNGLGFSD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LPGKPLARLVAPLAPDTQVLVMPLADKEAGAVAAVILVHCGQLSDNEEWSLQAVEKHTLV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ALRRVQVLQQRGPREAPRAVQNPPEGTAEDQKGGAAYTDRDRKILQLCGELYDLDASSLQ
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 LKVLQYLQQETRASRCCLLLVSEDNLQLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVVEDKKSI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLCVPVISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTDEDEHVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITEARNLSN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 AEICSVFLLDQNELVAKVFDGGVVDDESYEIRIPADQGIAGHVATTGQILNIPDAYAHPL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FYRGVDDSTGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAFSIYCGI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 SIAHSLLYKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVAAIDSNFASFTYT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 PRSLPEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMHAFSVSH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 FCYLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYSSEGSVM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 ERHHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDLQKMAEV
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 GYDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEKAMGNRPME
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 MMDREKAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSHKFTIRG
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CCDS73 LPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
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...:: ::.:: .:: ::: : : .
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:. .::. :..:: :: : :...::::...:...: :. :. : :: :.::..: ..
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..: .:... .. .: ... :: : : :. .: :. :::. .: .:
CCDS42 IMYDQVKKSWAKQSVALDVLSYHATCSKAEVDKFKAANIPLVSELAIDDIHFDDF-----
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:: : : : :..........::: :: :. : :.:.:: :::: :::.: ..
CCDS42 SLDVDAMITAALRMFMELGMVQKFKIDYETLCRWLLTVRKNYRMVLYHNWRHAFNVCQLM
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pF1KB4 YLLYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYSSEGSVMER
. . . . . : ..::.:....:.:::::::::::.::. : :.:: ::.. .. .:.
CCDS42 FAMLTTAGFQDILTEVEILAVIVGCLCHDLDHRGTNNAFQAKSGSALAQLYGTSAT-LEH
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pF1KB4 HHFAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDLQKMAEVG-
::: .:. ::...: ::: ..: :.:. ...:... ::::::. ... .. ... :
CCDS42 HHFNHAVMILQSEGHNIFANLSSKEYSDLMQLLKQSILATDLTLYFERRTEFFELVSKGE
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pF1KB4 YDRNNKQHHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEK-AMGNRPME
:: : :.:. .. .:::.:::. :: :. .:..:::. .::: ::: :. . :
CCDS42 YDWNIKNHRDIFRSMLMTACDLGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSA
360 370 380 390 400 410
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pF1KB4 MMDRE-KAYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSHKFTIR
..::. : .:.::. ... : ::.:. : . : . . ::.:: .: .. .: .
CCDS42 IFDRNRKDELPRLQLEWIDSICMPLYQALVKVNVKLKPMLDSVATNRSKWEELHQKRLLA
420 430 440 450 460 470
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pF1KB4 GLPSNNSLDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
. :..
CCDS42 STASSSPASVMVAKEDRN
480
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pF1KB4 ISRATDQVVALACAFNKLEGDLFTDEDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLKCECQA
.: . . . ..... : .: . .:
CCDS46 MQMYLPFCGIAISNAQLFAASRKEYERSRA
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pF1KB4 LLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITEARNLSNAEICSVFLLDQNE--LV--AKVF------
::.:...:: . :. ....:. .:..: . : :::.::.. : .: .: :
CCDS46 LLEVVNDLFEEQTDLEKIVKKIMHRAQTLLKCERCSVLLLEDIESPVVKFTKSFELMSPK
40 50 60 70 80 90
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pF1KB4 ---DGGVVDDESYEIRIPAD----QGIAGHVATTGQILNIPDAYAHPLFYRGVDDSTGFR
:. ::.: .: ..:: ::.:: .:: ::: : : .:. .::.
CCDS46 CSADAENSFKESMEKSSYSDWLINNSIAELVASTGLPVNISDAYQDPRFDAEADQISGFH
100 110 120 130 140 150
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pF1KB4 TRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAFSIYCGISIAHSLLYKKVN
:..:: :: : :...::::...:...: :. :. : :: :.::..: ....: .:.
CCDS46 IRSVLCVPIWNSNHQIIGVAQVLNRLDGKPFDDADQRLFEAFVIFCGLGINNTIMYDQVK
160 170 180 190 200 210
560 570 580 590 600 610
pF1KB4 EAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVA--AIDS-NFASFTYTPRSLPEDDT
.. .. .: ... :: : : :. .: :. :::. .: .: :: :
CCDS46 KSWAKQSVALDVLSYHATCSKAEVDKFKAANIPLVSELAIDDIHFDDF-----SLDVDAM
220 230 240 250 260
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pF1KB4 SMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMHAFSVSHFCYLLYKNL
: : :..........::: :: :. : :.:.:: :::: :::.: .. . . .
CCDS46 ITAALRMFMELGMVQKFKIDYETLCRWLLTVRKNYRMVLYHNWRHAFNVCQLMFAMLTTA
270 280 290 300 310 320
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pF1KB4 ELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYSSEGSVMERHHFAQAI
. . : ..::.:....:.:::::::::::.::. : :.:: ::.. ....:.::: .:.
CCDS46 GFQDILTEVEILAVIVGCLCHDLDHRGTNNAFQAKSGSALAQLYGT-SATLEHHHFNHAV
330 340 350 360 370 380
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pF1KB4 AILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDLQKMAEVG-YDRNNKQ
::...: ::: ..: :.:. ...:... ::::::. ... .. ... : :: : :.
CCDS46 MILQSEGHNIFANLSSKEYSDLMQLLKQSILATDLTLYFERRTEFFELVSKGEYDWNIKN
390 400 410 420 430 440
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pF1KB4 HHRLLLCLLMTSCDLSDQTKGWKTTRKIAELIYKEFFSQGDLEK-AMGNRPMEMMDRE-K
:. .. .:::.:::. :: :. .:..:::. .::: ::: :. . : ..::. :
CCDS46 HRDIFRSMLMTACDLGAVTKPWEISRQVAELVTSEFFEQGDRERLELKLTPSAIFDRNRK
450 460 470 480 490 500
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pF1KB4 AYIPELQISFMEHIAMPIYKLLQDLFPKAAELYERVASNREHWTKVSHKFTIRGLPSNNS
.:.::. ... : ::.:. : . : . . ::.:: .: .. .: . . :..
CCDS46 DELPRLQLEWIDSICMPLYQALVKVNVKLKPMLDSVATNRSKWEELHQKRLLASTASSSP
510 520 530 540 550 560
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pF1KB4 LDFLDEEYEVPDLDGTRAPINGCCSLDAE
CCDS46 ASVMVAKEDRN
570
>>CCDS42785.1 PDE11A gene_id:50940|Hs108|chr2 (683 aa)
initn: 1050 init1: 460 opt: 1037 Z-score: 1016.5 bits: 199.0 E(32554): 2.7e-50
Smith-Waterman score: 1210; 34.1% identity (66.7% similar) in 634 aa overlap (303-911:48-671)
280 290 300 310 320 330
pF1KB4 QLSCKVIGDKVLGEEVSFPLTGCLGQVVEDKKSIQLKDLTSEDVQQLQSMLGCELQAMLC
... . :: .: ..... : . ...::
CCDS42 QWKKVKITRLVQISGASLAEKQEKHQDFLIQRQTKTKDRRFND--EIDKLTGYKTKSLLC
20 30 40 50 60 70
340 350 360 370 380 390
pF1KB4 VPVISRATD-QVVALACAFNKL-EGDLFTDEDEHVIQHCFHYTSTVLTSTLAFQKEQKLK
.:. :..: .....: :.::. :: ::..::.:.: . . . ..... : .:
CCDS42 MPI--RSSDGEIIGVAQAINKIPEGAPFTEDDEKVMQMYLPFCGIAISNAQLFAASRKEY
80 90 100 110 120 130
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pF1KB4 CECQALLQVAKNLFTHLDDVSVLLQEIITEARNLSNAEICSVFLLDQNEL----VAKVF-
. .:::.:...:: . :. ....:. .:..: . : :::.::.. : .: :
CCDS42 ERSRALLEVVNDLFEEQTDLEKIVKKIMHRAQTLLKCERCSVLLLEDIESPVVKFTKSFE
140 150 160 170 180 190
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pF1KB4 --------DGGVVDDESYEIRIPAD----QGIAGHVATTGQILNIPDAYAHPLFYRGVDD
:. ::.: .: ..:: ::.:: .:: ::: : : .:.
CCDS42 LMSPKCSADAENSFKESMEKSSYSDWLINNSIAELVASTGLPVNISDAYQDPRFDAEADQ
200 210 220 230 240 250
500 510 520 530 540 550
pF1KB4 STGFRTRNILCFPIKNENQEVIGVAELVNKINGPWFSKFDEDLATAFSIYCGISIAHSLL
.::. :..:: :: : :...::::...:...: :. :. : :: :.::..: ....
CCDS42 ISGFHIRSVLCVPIWNSNHQIIGVAQVLNRLDGKPFDDADQRLFEAFVIFCGLGINNTIM
260 270 280 290 300 310
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pF1KB4 YKKVNEAQYRSHLANEMMMYHMKVSDDEYTKLLHDGIQPVA--AIDS-NFASFTYTPRSL
: .:... .. .: ... :: : : :. .: :. :::. .: .: ::
CCDS42 YDQVKKSWAKQSVALDVLSYHATCSKAEVDKFKAANIPLVSELAIDDIHFDDF-----SL
320 330 340 350 360
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pF1KB4 PEDDTSMAILSMLQDMNFINNYKIDCPTLARFCLMVKKGYRDPPYHNWMHAFSVSHFCYL
: : : :..........::: :: :. : :.:.:: :::: :::.: .. .
CCDS42 DVDAMITAALRMFMELGMVQKFKIDYETLCRWLLTVRKNYRMVLYHNWRHAFNVCQLMFA
370 380 390 400 410 420
680 690 700 710 720 730
pF1KB4 LYKNLELTNYLEDIEIFALFISCMCHDLDHRGTNNSFQVASKSVLAALYSSEGSVMERHH
. . . . : ..::.:....:.:::::::::::.::. : :.:: ::.. ....:.::
CCDS42 MLTTAGFQDILTEVEILAVIVGCLCHDLDHRGTNNAFQAKSGSALAQLYGT-SATLEHHH
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 FAQAIAILNTHGCNIFDHFSRKDYQRMLDLMRDIILATDLAHHLRIFKDLQKMAEVG-YD
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CCDS47 QGQLGFYNAVAIPCYTTLTQILPPTEPLLKACRDNLSQWEKVIRGEETATWISSPSVAQK
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CCDS47 AAASED
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