Result of FASTA (omim) for
pF1KB4184
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4184, 499 aa
1>>>pF1KB4184 499 - 499 aa - 499 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1896+/-0.000375; mu= 18.8725+/- 0.023
mean_var=71.7057+/-15.988, 0's: 0 Z-trim(113.3): 187 B-trim: 2755 in 2/50
Lambda= 0.151460
statistics sampled from 22399 (22620) to 22399 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.613), E-opt: 0.2 (0.265), width: 16
Scan time: 10.350
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001020110 (OMIM: 610367) solute carrier family ( 499) 3301 730.8 2.1e-210
NP_001020109 (OMIM: 610367) solute carrier family ( 496) 3248 719.2 6.6e-207
NP_110434 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, ( 503) 3245 718.6 1e-206
NP_001269793 (OMIM: 610367) solute carrier family ( 535) 2097 467.7 3.6e-131
XP_016857625 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_005263548 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857627 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857629 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857626 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857630 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
NP_001315548 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857623 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857622 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
NP_003030 (OMIM: 138230) solute carrier family 2, ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
XP_016857624 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 501) 1319 297.7 5.1e-80
NP_001001290 (OMIM: 606142,612076) solute carrier ( 511) 1313 296.4 1.3e-79
XP_011512162 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 537) 1313 296.4 1.3e-79
XP_011512161 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 538) 1313 296.4 1.3e-79
NP_064425 (OMIM: 606142,612076) solute carrier fam ( 540) 1313 296.4 1.3e-79
XP_006714031 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 563) 1313 296.4 1.4e-79
XP_016863946 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 609) 1313 296.5 1.5e-79
NP_997303 (OMIM: 610371) solute carrier family 2, ( 512) 1273 287.7 5.5e-77
XP_016863947 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 487) 1193 270.2 9.6e-72
XP_011512163 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 486) 1191 269.7 1.3e-71
XP_011512159 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 586) 1191 269.8 1.5e-71
XP_011512160 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 586) 1191 269.8 1.5e-71
XP_011512158 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 615) 1191 269.8 1.6e-71
NP_001315549 (OMIM: 138230) solute carrier family ( 457) 1184 268.2 3.6e-71
XP_011539126 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 517) 1143 259.3 2e-68
NP_006507 (OMIM: 138140,143090,608885) solute carr ( 492) 1083 246.1 1.7e-64
XP_006714032 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 423) 1071 243.5 9.1e-64
XP_011512168 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 445) 1071 243.5 9.5e-64
XP_011512167 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 452) 1071 243.5 9.6e-64
XP_016863949 (OMIM: 606142,612076) PREDICTED: solu ( 408) 1063 241.7 3e-63
NP_001033 (OMIM: 138190) solute carrier family 2, ( 509) 1044 237.6 6.3e-62
XP_016857631 (OMIM: 138230) PREDICTED: solute carr ( 442) 1035 235.6 2.2e-61
NP_008862 (OMIM: 138170) solute carrier family 2, ( 496) 996 227.1 8.9e-59
XP_011539127 (OMIM: 610371) PREDICTED: solute carr ( 383) 977 222.9 1.3e-57
XP_005253374 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
XP_016874335 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
XP_005253372 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
XP_011518865 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
NP_001273164 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 968 221.0 6.2e-57
XP_016874336 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
NP_001273163 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 497) 968 221.0 6.2e-57
XP_011518864 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 497) 968 221.0 6.2e-57
NP_001273162 (OMIM: 611039) solute carrier family ( 520) 968 221.0 6.4e-57
NP_703150 (OMIM: 611039) solute carrier family 2, ( 520) 968 221.0 6.4e-57
XP_016874334 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 968 221.0 6.4e-57
XP_016874332 (OMIM: 611039) PREDICTED: solute carr ( 521) 968 221.0 6.4e-57
>>NP_001020110 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, f (499 aa)
initn: 3301 init1: 3301 opt: 3301 Z-score: 3898.2 bits: 730.8 E(85289): 2.1e-210
Smith-Waterman score: 3301; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB4 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::
NP_001 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
490
>>NP_001020109 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, f (496 aa)
initn: 3248 init1: 3248 opt: 3248 Z-score: 3835.7 bits: 719.2 E(85289): 6.6e-207
Smith-Waterman score: 3248; 99.8% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (9-499:6-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MRALRRLIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
420 430 440 450 460 470
490
pF1KB4 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::
NP_001 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
480 490
>>NP_110434 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, faci (503 aa)
initn: 3238 init1: 3238 opt: 3245 Z-score: 3832.0 bits: 718.6 E(85289): 1e-206
Smith-Waterman score: 3245; 98.8% identity (99.2% similar) in 499 aa overlap (2-499:5-503)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLHALLRSR-MIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
:. :: : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_110 LMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHR
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KB4 LNFPRRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::::::
NP_110 LNFPRRAQGPTWRSLEVIQSTEL
490 500
>>NP_001269793 (OMIM: 610367) solute carrier family 2, f (535 aa)
initn: 2580 init1: 2089 opt: 2097 Z-score: 2476.0 bits: 467.7 E(85289): 3.6e-131
Smith-Waterman score: 2540; 90.7% identity (93.6% similar) in 440 aa overlap (2-440:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLHALLRSR-MIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
:. :: : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::: . ... :..... :
NP_001 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSVAGVDE---------GWGVQAGLTS
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TSPPPRPRQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
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