Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4184
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4184, 499 aa
1>>>pF1KB4184 499 - 499 aa - 499 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5100+/-0.000881; mu= 16.9970+/- 0.053
mean_var=69.9965+/-14.602, 0's: 0 Z-trim(106.7): 63 B-trim: 582 in 1/50
Lambda= 0.153298
statistics sampled from 9101 (9164) to 9101 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.282), width: 16
Scan time: 3.360
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 499) 3301 739.3 2.3e-213
CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 496) 3248 727.6 7.6e-210
CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 503) 3245 726.9 1.2e-209
CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 ( 535) 2097 473.0 3.4e-133
CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 501) 1319 301.0 2e-81
CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 511) 1313 299.6 5.2e-81
CCDS3407.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 ( 540) 1313 299.7 5.4e-81
CCDS98.2 SLC2A7 gene_id:155184|Hs108|chr1 ( 512) 1273 290.8 2.4e-78
CCDS477.1 SLC2A1 gene_id:6513|Hs108|chr1 ( 492) 1083 248.8 1e-65
CCDS11097.1 SLC2A4 gene_id:6517|Hs108|chr17 ( 509) 1044 240.2 4.2e-63
CCDS8586.1 SLC2A3 gene_id:6515|Hs108|chr12 ( 496) 996 229.5 6.5e-60
CCDS66301.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 497) 968 223.3 4.7e-58
CCDS8585.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 520) 968 223.4 4.9e-58
CCDS66302.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 535) 968 223.4 5e-58
CCDS3215.1 SLC2A2 gene_id:6514|Hs108|chr3 ( 524) 836 194.2 3e-49
CCDS66300.1 SLC2A14 gene_id:144195|Hs108|chr12 ( 411) 776 180.8 2.4e-45
CCDS44054.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 ( 244) 600 141.8 8.2e-34
CCDS6870.1 SLC2A8 gene_id:29988|Hs108|chr9 ( 477) 330 82.2 1.4e-15
CCDS8736.2 SLC2A13 gene_id:114134|Hs108|chr12 ( 648) 322 80.5 6e-15
CCDS5169.1 SLC2A12 gene_id:154091|Hs108|chr6 ( 617) 307 77.2 5.8e-14
CCDS48052.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 ( 445) 260 66.7 5.9e-11
CCDS6975.1 SLC2A6 gene_id:11182|Hs108|chr9 ( 507) 260 66.8 6.6e-11
>>CCDS33616.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (499 aa)
initn: 3301 init1: 3301 opt: 3301 Z-score: 3944.2 bits: 739.3 E(32554): 2.3e-213
Smith-Waterman score: 3301; 100.0% identity (100.0% similar) in 499 aa overlap (1-499:1-499)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS33 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
430 440 450 460 470 480
490
pF1KB4 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::
CCDS33 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
490
>>CCDS46673.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (496 aa)
initn: 3248 init1: 3248 opt: 3248 Z-score: 3880.9 bits: 727.6 E(32554): 7.6e-210
Smith-Waterman score: 3248; 99.8% identity (100.0% similar) in 491 aa overlap (9-499:6-496)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MLHALLRSRMIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MRALRRLIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQARTGEP
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGFSRK
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 AGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQVVG
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 LRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLRGSG
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 DLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYAYAS
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 SVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGSIFTV
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 ALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGALMWI
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS46 MLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHRLNFP
420 430 440 450 460 470
490
pF1KB4 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::
CCDS46 RRAQGPTWRSLEVIQSTEL
480 490
>>CCDS13818.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (503 aa)
initn: 3238 init1: 3238 opt: 3245 Z-score: 3877.2 bits: 726.9 E(32554): 1.2e-209
Smith-Waterman score: 3245; 98.8% identity (99.2% similar) in 499 aa overlap (2-499:5-503)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLHALLRSR-MIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
:. :: : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHR
430 440 450 460 470 480
480 490
pF1KB4 LNFPRRAQGPTWRSLEVIQSTEL
:::::::::::::::::::::::
CCDS13 LNFPRRAQGPTWRSLEVIQSTEL
490 500
>>CCDS74828.1 SLC2A11 gene_id:66035|Hs108|chr22 (535 aa)
initn: 2580 init1: 2089 opt: 2097 Z-score: 2504.7 bits: 473.0 E(32554): 3.4e-133
Smith-Waterman score: 2540; 90.7% identity (93.6% similar) in 440 aa overlap (2-440:5-434)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLHALLRSR-MIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
:. :: : .::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 MEDELEPSLRPRTQIQGRILLLTICAAGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQAR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TGEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFG
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 FSRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMG
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 QVVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 RGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVY
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYSLMTCWGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::: . ... :..... :
CCDS74 AYASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSVAGVDE---------GWGVQAGLTS
310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 IFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS74 TSPPPRPRQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCGA
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 LMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELHR
::::::::::::::::: .:. ::
CCDS74 LMWIMLILVGLGFPFIM-VLGSFLIRRRPCPTSSMSLSLVSVSVGPSTLACSFLRPKARP
420 430 440 450 460 470
>>CCDS99.1 SLC2A5 gene_id:6518|Hs108|chr1 (501 aa)
initn: 1282 init1: 1282 opt: 1319 Z-score: 1575.2 bits: 301.0 E(32554): 2e-81
Smith-Waterman score: 1319; 43.0% identity (74.7% similar) in 474 aa overlap (10-478:8-479)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MLHALLRSRMIQGRILLLTICA---AGIGGTFQFGYNLSIINAPTLHIQEFTNETWQART
: .::. :. : :..:..::.:::.. .:.:.: .:.: :::. .::
CCDS99 MEQQDQSMKEGRLTLVLALATLIAAFGSSFQYGYNVAAVNSPALLMQQFYNETYYGRT
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 GEPLPDHLVLLMWSLIVSLYPLGGLFGALLAGPLAITLGRKKSLLVNNIFVVSAAILFGF
:: . : . :.::. ::..:.::..:.::.:::. .::: .:: :::: . :::.:
CCDS99 GEFMEDFPLTLLWSVTVSMFPFGGFIGSLLVGPLVNKFGRKGALLFNNIFSIVPAILMGC
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SRKAGSFEMIMLGRLLVGVNAGVSMNIQPMYLGESAPKELRGAVAMSSAIFTALGIVMGQ
:: : :::.:...:::::. :::: :. :::::: :::.::::... .: ..::...:
CCDS99 SRVATSFELIIISRLLVGICAGVSSNVVPMYLGELAPKNLRGALGVVPQLFITVGILVAQ
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 VVGLRELLGGPQAWPLLLASCLVPGALQLASLPLLPESPRYLLIDCGDTEACLAALRRLR
. :::.::.. ..::.::. ::.:::: ::..:::::::::. : : ::. ::
CCDS99 IFGLRNLLANVDGWPILLGLTGVPAALQLLLLPFFPESPRYLLIQKKDEAAAKKALQTLR
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 GSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLGSAMELCGNDSVYA
: .. :. :...: : .. .::. :.:: :. :..:: ....: : ...:
CCDS99 GWDSVDREVAEIRQEDEAEKAAGFISVLKLFRMRSLRWQLLSIIVLMGGQQLSGVNAIYY
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 YASSVFRKAGVPEAKIQYAIIGTGSCELLTAVVSCVVIERVGRRVLLIGGYS--LMTCWG
::.... .::::: ..::. :::. ... . . :.: .:::.::. :.: :..:
CCDS99 YADQIYLSAGVPEEHVQYVTAGTGAVNVVMTFCAVFVVELLGRRLLLLLGFSICLIAC--
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 SIFTVALCLQSSFPWTLYLAMACIFAFILSFGIGPAGVTGILATELFDQMARPAACMVCG
..:.:: ::.. : :....:....... ..::. . ..: ::.: : .::.: :: :
CCDS99 CVLTAALALQDTVSWMPYISIVCVISYVIGHALGPSPIPALLITEIFLQSSRPSAFMVGG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 ALMWIMLILVGLGFPFIMEALSHFLYVPFLGVCVCGAIYTGLFLPETKGKTFQEISKELH
.. :. . ::: ::::.:.:. . .. : .:. .:: :..::::.::: ::.. .
CCDS99 SVHWLSNFTVGLIFPFIQEGLGPYSFIVFAVICLLTTIYIFLIVPETKAKTFIEINQIFT
420 430 440 450 460 470
480 490
pF1KB4 RLNFPRRAQGPTWRSLEVIQSTEL
..:
CCDS99 KMNKVSEVYPEKEELKELPPVTSEQ
480 490 500
>>CCDS3406.1 SLC2A9 gene_id:56606|Hs108|chr4 (511 aa)
initn: 1335 init1: 1310 opt: 1313 Z-score: 1567.9 bits: 299.6 E(32554): 5.2e-81
Smith-Waterman score: 1313; 42.9% identity (76.3% similar) in 464 aa overlap (16-478:27-489)
10 20 30 40
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CCDS34 NESWERRHGRPIDPDTLTLL-WSVTVSIFAIGGLVGTLIVKMIGKVLGRKHTLLANNGFA
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10 20 30 40
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pF1KB4 DTEACLAALRRLRGSGDLAGELEELEEERAACQGCRARRPWELFQHRALRRQVTSLVVLG
. . :.. . :..:.. :.::. : . .. : ::.. .: ::....:
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CCDS34 IGGFGLMGLFFGTLTITLTLQDHAPWVPYLSIVGILAIIASFCSGPGGIPFILTGEFFQQ
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CCDS34 RTYAEISQAFSKRNKAYPPEEKIDSAVTDGKINGRP
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..:. .:. .::.: .::.::: ::. ::: .::..:::::: ::. :: . ::
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CCDS98 RRLRGHTDMEAELEDMRAEARAERAEGHLSVLHLCALRSLRWQLLSIIVLMAGQQLSGIN
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..::.: .:. : ::.. :.::.: . .:::. : ... ::.: : .: :: ::
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CCDS98 DGAVHWLTNFIIGFLFPSIQEAIGAYSFIIFAGICLLTAIYIYVVIPETKGKTFVEINRI
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. .:...:.. .
CCDS98 FAKRNRVKLPEEKEETIDAGPPTASPAKETSF
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CCDS47 LGKSFEMLILGRFIIGVYCGLTTGFVPMYVGEVSPTALRGALGTLHQLGIVVGILIAQVF
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CCDS47 GLDSIMGNKDLWPLLLSIIFIPALLQCIVLPFCPESPRFLLINRNEENRAKSVLKKLRGT
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CCDS47 TSIFEKAGVQQPV--YATIGSGIVNTAFTVVSLFVVERAGRRTLHLIGLAGMAGC-AILM
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CCDS47 TIALALLEQLPWMSYLSIVAIFGFVAFFEVGPGPIPWFIVAELFSQGPRPAAIAVAGFSN
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CCDS47 WTSNFIVGMCFQYVEQLCGPYVFIIFTVLLVLFFIFTYFKVPETKGRTFDEIASGFRQGG
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CCDS47 ASQSDKTPEELFHPLGADSQV
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CCDS11 MPSGFQQIGSEDGEPPQQRVTGTLVLAVFSA-VLGSLQFGYNIGVINAPQKVIEQSYNET
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CCDS11 WLGRQGPEGPSSIPPGTLTTLWALSVAIFSVGGMISSFLIGIISQWLGRKRAMLVNNVLA
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CCDS11 VLGGSLMGLANAAASYEMLILGRFLIGAYSGLTSGLVPMYVGEIAPTHLRGALGTLNQLA
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CCDS11 IVIGILIAQVLGLESLLGTASLWPLLLGLTVLPALLQLVLLPFCPESPRYLYIIQNLEGP
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CCDS11 ARKSLKRLTGWADVSGVLAELKDEKRKLERERPLSLLQLLGSRTHRQPLIIAVVLQLSQQ
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CCDS11 LSGINAVFYYSTSIFETAGVGQP--AYATIGAGVVNTVFTLVSVLLVERAGRRTLHLLGL
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CCDS11 AGM-CGCAILMTVALLLLERVPAMSYVSIVAIFGFVAFFEIGPGPIPWFIVAELFSQGPR
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CCDS11 PAAMAVAGFSNWTSNFIIGMGFQYVAEAMGPYVFLLFAVLLLGFFIFTFLRVPETRGRTF
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CCDS11 DQISAAFHRT--------PSLLEQEVKPSTELEYLGPDEND
480 490 500
499 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Fri Nov 4 02:53:44 2016 done: Fri Nov 4 02:53:44 2016
Total Scan time: 3.360 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]