FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4173, 952 aa
1>>>pF1KB4173 952 - 952 aa - 952 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5064+/-0.000348; mu= 15.9302+/- 0.022
mean_var=95.5837+/-19.320, 0's: 0 Z-trim(117.4): 55 B-trim: 181 in 1/49
Lambda= 0.131184
statistics sampled from 29391 (29446) to 29391 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.684), E-opt: 0.2 (0.345), width: 16
Scan time: 10.520
The best scores are: opt bits E(85289)
XP_005257250 (OMIM: 232300,606800) PREDICTED: lyso ( 952) 6548 1250.0 0
XP_005257251 (OMIM: 232300,606800) PREDICTED: lyso ( 952) 6548 1250.0 0
NP_001073271 (OMIM: 232300,606800) lysosomal alpha ( 952) 6548 1250.0 0
NP_000143 (OMIM: 232300,606800) lysosomal alpha-gl ( 952) 6548 1250.0 0
NP_001073272 (OMIM: 232300,606800) lysosomal alpha ( 952) 6548 1250.0 0
XP_011514976 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (1453) 2283 442.9 5.7e-123
NP_004659 (OMIM: 154360) maltase-glucoamylase, int (1857) 941 188.9 2e-46
XP_011514973 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_011514975 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_011514974 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_006716231 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_016868261 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_011514972 (OMIM: 154360) PREDICTED: maltase-glu (2753) 940 188.8 3.2e-46
XP_011511380 (OMIM: 222900,609845) PREDICTED: sucr (1794) 892 179.6 1.2e-43
NP_001032 (OMIM: 222900,609845) sucrase-isomaltase (1827) 892 179.7 1.2e-43
NP_001265122 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 830) 653 134.3 2.6e-30
NP_001316151 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 847) 653 134.3 2.6e-30
NP_001316152 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 847) 653 134.3 2.6e-30
NP_001265123 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 847) 653 134.3 2.6e-30
XP_016872901 (OMIM: 104160,600666) PREDICTED: neut ( 847) 653 134.3 2.6e-30
NP_001265121 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 852) 653 134.3 2.7e-30
NP_938148 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-gluc ( 944) 653 134.3 2.9e-30
NP_938149 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-gluc ( 966) 653 134.3 3e-30
NP_001316154 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 703) 638 131.4 1.6e-29
NP_001316153 (OMIM: 104160,600666) neutral alpha-g ( 703) 638 131.4 1.6e-29
NP_937784 (OMIM: 104180) neutral alpha-glucosidase ( 914) 605 125.2 1.5e-27
>>XP_005257250 (OMIM: 232300,606800) PREDICTED: lysosoma (952 aa)
initn: 6548 init1: 6548 opt: 6548 Z-score: 6693.9 bits: 1250.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6548; 99.7% identity (100.0% similar) in 952 aa overlap (1-952:1-952)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FTIKDPANRRYEVPLETPRVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVHRQLDGRVLLNTTVAPLF
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_005 FTIKDPANRRYEVPLETPHVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVRRQLDGRVLLNTTVAPLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
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XP_005 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
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310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRRGVFITNETGQPLIGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRRGVFITNETGQPLIGKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 PPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGLTEAIASHRALVKARGTRPFVISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGLTEAIASHRALVKARGTRPFVISR
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 STFAGHGRYAGHWTGDVWSSWEQLASSVPEILQFNLLGVPLVGADVCGFLGNTSEELCVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STFAGHGRYAGHWTGDVWSSWEQLASSVPEILQFNLLGVPLVGADVCGFLGNTSEELCVR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 WTQLGAFYPFMRNHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMRKALTLRYALLPHLYTLFHQAHVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WTQLGAFYPFMRNHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMRKALTLRYALLPHLYTLFHQAHVAG
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ETVARPLFLEFPKDSSTWTVDHQLLWGEALLITPVLQAGKAEVTGYFPLGTWYDLQTVPI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_005 ETVARPLFLEFPKDSSTWTVDHQLLWGEALLITPVLQAGKAEVTGYFPLGTWYDLQTVPV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 EALGSLPPPPAAPREPAIHSEGQWVTLPAPLDTINVHLRAGYIIPLQGPGLTTTESRQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EALGSLPPPPAAPREPAIHSEGQWVTLPAPLDTINVHLRAGYIIPLQGPGLTTTESRQQP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 MALAVALTKGGEARGELFWDDGESLEVLERGAYTQVIFLARNNTIVNELVRVTSEGAGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MALAVALTKGGEARGELFWDDGESLEVLERGAYTQVIFLARNNTIVNELVRVTSEGAGLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KB4 LQKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKVLDICVSLLMGEQFLVSWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKVLDICVSLLMGEQFLVSWC
910 920 930 940 950
>>XP_005257251 (OMIM: 232300,606800) PREDICTED: lysosoma (952 aa)
initn: 6548 init1: 6548 opt: 6548 Z-score: 6693.9 bits: 1250.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6548; 99.7% identity (100.0% similar) in 952 aa overlap (1-952:1-952)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 FTIKDPANRRYEVPLETPRVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVHRQLDGRVLLNTTVAPLF
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
XP_005 FTIKDPANRRYEVPLETPHVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVRRQLDGRVLLNTTVAPLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
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310 320 330 340 350 360
pF1KB4 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 FRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRRGVFITNETGQPLIGKV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 FRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRRGVFITNETGQPLIGKV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
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pF1KB4 PPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGLTEAIASHRALVKARGTRPFVISR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 PPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGLTEAIASHRALVKARGTRPFVISR
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610 620 630 640 650 660
pF1KB4 STFAGHGRYAGHWTGDVWSSWEQLASSVPEILQFNLLGVPLVGADVCGFLGNTSEELCVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 STFAGHGRYAGHWTGDVWSSWEQLASSVPEILQFNLLGVPLVGADVCGFLGNTSEELCVR
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670 680 690 700 710 720
pF1KB4 WTQLGAFYPFMRNHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMRKALTLRYALLPHLYTLFHQAHVAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 WTQLGAFYPFMRNHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMRKALTLRYALLPHLYTLFHQAHVAG
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730 740 750 760 770 780
pF1KB4 ETVARPLFLEFPKDSSTWTVDHQLLWGEALLITPVLQAGKAEVTGYFPLGTWYDLQTVPI
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.
XP_005 ETVARPLFLEFPKDSSTWTVDHQLLWGEALLITPVLQAGKAEVTGYFPLGTWYDLQTVPV
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pF1KB4 EALGSLPPPPAAPREPAIHSEGQWVTLPAPLDTINVHLRAGYIIPLQGPGLTTTESRQQP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EALGSLPPPPAAPREPAIHSEGQWVTLPAPLDTINVHLRAGYIIPLQGPGLTTTESRQQP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 MALAVALTKGGEARGELFWDDGESLEVLERGAYTQVIFLARNNTIVNELVRVTSEGAGLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MALAVALTKGGEARGELFWDDGESLEVLERGAYTQVIFLARNNTIVNELVRVTSEGAGLQ
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950
pF1KB4 LQKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKVLDICVSLLMGEQFLVSWC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LQKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKVLDICVSLLMGEQFLVSWC
910 920 930 940 950
>>NP_001073271 (OMIM: 232300,606800) lysosomal alpha-glu (952 aa)
initn: 6548 init1: 6548 opt: 6548 Z-score: 6693.9 bits: 1250.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 6548; 99.7% identity (100.0% similar) in 952 aa overlap (1-952:1-952)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MGVRHPPCSHRLLAVCALVSLATAALLGHILLHDFLLVPRELSGSSPVLEETHPAHQQGA
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDKAITQEQCEARGCCYIPAKQGLQGA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QMGQPWCFFPPSYPSYKLENLSSSEMGYTATLTRTTPTFFPKDILTLRLDVMMETENRLH
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pF1KB4 FTIKDPANRRYEVPLETPRVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVHRQLDGRVLLNTTVAPLF
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::
NP_001 FTIKDPANRRYEVPLETPHVHSRAPSPLYSVEFSEEPFGVIVRRQLDGRVLLNTTVAPLF
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FADQFLQLSTSLPSQYITGLAEHLSPLMLSTSWTRITLWNRDLAPTPGANLYGSHPFYLA
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pF1KB4 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LEDGGSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDVYIFLGPEPKSVVQQYLDVVGY
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pF1KB4 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLDVQWNDLDYMDSRRDFTFNKDG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 FRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISSSGPAGSYRPYDEGLRRGVFITNETGQPLIGKV
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pF1KB4 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWIDMNEPSNFIRGSEDGCPNNELEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGLTEAIASHRALVKARGTRPFVISR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STFAGHGRYAGHWTGDVWSSWEQLASSVPEILQFNLLGVPLVGADVCGFLGNTSEELCVR
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WTQLGAFYPFMRNHNSLLSLPQEPYSFSEPAQQAMRKALTLRYALLPHLYTLFHQAHVAG
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NP_001 LQKVTVLGVATAPQQVLSNGVPVSNFTYSPDTKVLDICVSLLMGEQFLVSWC
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pF1KB4 PAHQQG---ASRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNS---RFDCAPDKAITQEQCEARG
: : :: : :: ..:.. . : . :..: ::. :. :. ::
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pF1KB4 CCYIPAKQGLQGAQMGQPWCFFPPSYPSYKLE-NLSSSEMGYTATLTRTTPT--FFPKDI
::. : ::: .. :::.. .. ::..: :: ... :.:: : .. :. : ...
XP_011 CCWNP-----QGA-VSVPWCYYSKNH-SYHVEGNLVNTNAGFTARL-KNLPSSPVFGSNV
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pF1KB4 LTLRLDVMMETENRLHFTIKDPANRRYEVPLETPRVHS--RAPSPLYSVEFSEEPFGVIV
.. : . ..: ::.:: . : .: :.::: : . : : : :.::.:..::.. :
XP_011 DNVLLTAEYQTSNRFHFKLTDQTNNRFEVPHEHVQSFSGNAAASLTYQVEISRQPFSIKV
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:. ..:::......::.:::::::::: ::: . ::.::. . . .: ..::
XP_011 TRRSNNRVLFDSSIGPLLFADQFLQLSTRLPSTNVYGLGEHVHQQYRHDMNWKTWPIFNR
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pF1KB4 DLAPTP-GANLYGSHPFYLALEDG-GSAHGVFLLNSNAMDVVLQPSPALSWRSTGGILDV
: .:. :.::::.. :.: :::. : . ::::.:::::.:::::.::...:. :::::
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pF1KB4 YIFLGPEPKSVVQQYLDVVGYPFMPPYWGLGFHLCRWGYSSTAITRQVVENMTRAHFPLD
:.::: :..:::.::...: : .: ::.::::: :. :.. :.::: :..: :
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pF1KB4 VQWNDLDYMDSRRDFTFNKDGFRDFPAMVQELHQGGRRYMMIVDPAISS-SGPAGSYRPY
:: :.:::: :::::... :. :: .:.:::..:.. ..:::::::. :. . : ::
XP_011 VQHADIDYMDERRDFTYDSVDFKGFPEFVNELHNNGQKLVIIVDPAISNNSSSSKPYGPY
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pF1KB4 DEGLRRGVFITNETG-QPLIGKVWPGSTAFPDFTNPTALAWWEDMVAEFHDQVPFDGMWI
:.: ..... : ::::.::::.:.:::.:::. .:: ::.:: :::.::
XP_011 DRGSDMKIWVNSSDGVTPLIGEVWPGQTVFPDYTNPNCAVWWTKEFELFHNQVEFDGIWI
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pF1KB4 DMNEPSNFIRGSEDGCPNNELENPPYVPGVVGGTLQAATICASSHQFLSTHYNLHNLYGL
:::: :::. :: .:: .:.:.:::..: .. : : :.: .. : . .:..:::::
XP_011 DMNEVSNFVDGSVSGCSTNNLNNPPFTPRILDGYLFCKTLCMDAVQHWGKQYDIHNLYGY
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. :.:. .: . . : :...:::::: :..:.:: :: ..:..: :.: .:.:::
XP_011 SMAVATAEAAKTVFPNKRSFILTRSTFAGSGKFAAHWLGDNTATWDDLRWSIPGVLEFNL
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.:.:.:: :.::: .: :::: :: :::::::: ::::. :.: ::. . ..
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:. :..::.:::.::::: .:: :.::::::. :: .:.::: : .:.::: .:::::
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::. : .: .: : ..::: .: :: .. . : : . : : :
XP_011 VLDEGAEKVMAYVPDAVWYDYET------GS-----------QVRWRKQKVEMELPGDKI
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pF1KB4 NVHLRAGYIIPLQGPGLTTTESRQQPMALAVALTKGGEARGELFWDDGESLEVLERGAYT
..:::.:::.: : :. :: ::..:..: .:: .. ::.::::::.::. ... .:
XP_011 GLHLRGGYIFPTQQPNTTTLASRKNPLGLIIALDENKEAKGELFWDNGETKDTVANKVYL
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pF1KB4 QVIFLARNNTI-VNELVRVTSEGAGLQLQKVTVLGVATAPQQVL--SNGVPVSN---FTY
: . .: . :: . .. .: .... .::. :..: :::: .. ::
XP_011 LCEFSVTQNRLEVNISQSTYKDPNNLAFNEIKILGTEE-PSNVTVKHNGVPSQTSPTVTY
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pF1KB4 SPDTKVLDIC-VSLLMGEQFLVSWC
. . :: : ..::.:: . : :
XP_011 DSNLKVAIITDIDLLLGEAYTVEWSIKIRDEEKIDCYPDENGASAENCTARGCIWEASNS
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>--
initn: 1081 init1: 555 opt: 1023 Z-score: 1039.9 bits: 204.4 E(85289): 3.5e-51
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pF1KB4 GASRPGPRDAQAHPGRPRAVPTQCDVPPNSRFDCAPDK-AITQEQCEARGCCYIPAKQGL
..:: ::. . . :.: :::: . ....
XP_011 NLKVAIITDIDLLLGEAYTVEWSIKIRDEEKIDCYPDENGASAENCTARGCIWEASNSS-
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: :.:.: . :.. ... . : :: .. . .. ::. . ::::: .
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]