FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4108, 977 aa
1>>>pF1KB4108 977 - 977 aa - 977 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.5541+/-0.00127; mu= 14.8499+/- 0.076
mean_var=97.2253+/-18.891, 0's: 0 Z-trim(103.1): 47 B-trim: 62 in 1/50
Lambda= 0.130072
statistics sampled from 7209 (7252) to 7209 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.575), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 4.310
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 5192 985.9 0
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CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 4543 864.1 0
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 4171 794.3 0
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 4153 790.9 0
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CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 2019 390.4 7.1e-108
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 803 162.3 3.8e-39
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 803 162.3 4.1e-39
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 784 158.7 4.6e-38
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 778 157.6 1.1e-37
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 523 109.7 2.3e-23
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 523 109.7 2.4e-23
>>CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (977 aa)
initn: 6440 init1: 6440 opt: 6440 Z-score: 6532.1 bits: 1220.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6440; 100.0% identity (100.0% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-977)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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130 140 150 160 170 180
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
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430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
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550 560 570 580 590 600
pF1KB4 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
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610 620 630 640 650 660
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 MIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEK
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pF1KB4 SDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 SDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVT
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850 860 870 880 890 900
pF1KB4 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
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pF1KB4 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB4 LNLPDTVTHEDYVTTRL
:::::::::::::::::
CCDS93 LNLPDTVTHEDYVTTRL
970
>>CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (982 aa)
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Smith-Waterman score: 6420; 99.5% identity (99.5% similar) in 982 aa overlap (1-977:1-982)
10 20 30 40 50 60
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB4 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
430 440 450 460 470 480
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
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pF1KB4 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
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670 680 690 700 710
pF1KB4 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIG-----RRAADNLRRHHQYQEVMRNLVK
::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGVRTQHRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVK
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720 730 740 750 760 770
pF1KB4 RYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 RYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSA
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pF1KB4 DSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRK
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pF1KB4 VNFVTDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VNFVTDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRG
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pF1KB4 DLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDS
910 920 930 940 950 960
960 970
pF1KB4 SIDYDLNLPDTVTHEDYVTTRL
::::::::::::::::::::::
CCDS45 SIDYDLNLPDTVTHEDYVTTRL
970 980
>>CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (893 aa)
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Smith-Waterman score: 5724; 91.4% identity (91.4% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-893)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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pF1KB4 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
130 140 150 160 170 180
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pF1KB4 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
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pF1KB4 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
370 380 390 400 410 420
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pF1KB4 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
490 500 510 520 530 540
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pF1KB4 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAA
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 MIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEK
730 740 750 760 770 780
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pF1KB4 SDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVT
::::
CCDS45 SDSE--------------------------------------------------------
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ----------------------------EEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
790 800 810
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
820 830 840 850 860 870
970
pF1KB4 LNLPDTVTHEDYVTTRL
:::::::::::::::::
CCDS45 LNLPDTVTHEDYVTTRL
880 890
>>CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (836 aa)
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Smith-Waterman score: 5267; 85.6% identity (85.6% similar) in 977 aa overlap (1-977:1-836)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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:::::::::::::::::
CCDS45 LNLPDTVTHEDYVTTRL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
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CCDS45 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
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CCDS45 MIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 SDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREKQRKVNFVT
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pF1KB4 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 DIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
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CCDS45 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
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:::::::::::::::::
CCDS45 LNLPDTVTHEDYVTTRL
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pF1KB4 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
:::.:::. .::::::::.:::::.::: :::.::::::::::.::..:.:::::..
CCDS14 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
.::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
CCDS14 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
70 80 90 100 110 120
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pF1KB4 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
:::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
CCDS14 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::.::::::::::.:
CCDS14 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290
pF1KB4 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
:::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::.: .. :. .:::.::.::::.:::
CCDS14 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
CCDS14 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
310 320 330 340 350 360
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
.::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
CCDS14 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
370 380 390 400 410 420
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
.:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::.. ::: :.::::::.:::
CCDS14 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
430 440 450 460 470 480
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
490 500 510 520 530 540
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
::: :... .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
CCDS14 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
550 560 570 580 590
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pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS14 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
600 610 620 630 640 650
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pF1KB4 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKK---MRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRN
:::.::::::. :: .:. . .: :. ::. ... .. .: ::.: ....::::.::
CCDS14 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
:::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . : . . : :.
CCDS14 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRK----HPRSFSTSST
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820 830
pF1KB4 NSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPPREK
. .. :...:. :... :.:. : :.: . . . :.:. . :.
CCDS14 ELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQ---GKSKAES
780 790 800 810 820 830
840 850 860 870 880 890
pF1KB4 QRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLESRGL
. : .:. ..:..::. . . . .: ... ....:. ...:. : :.: .:
CCDS14 SSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQME-KGK
840 850 860 870 880 890
900 910 920 930 940 950
pF1KB4 ASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAK
: . : .:::
CCDS14 AEACSQSEINLSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETW
900 910 920 930 940 950
>>CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (828 aa)
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pF1KB4 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSLIEEQSGNDLARLKLAIKYRQKEF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 VAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFIR
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pF1KB4 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 KPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQ
370 380 390 400 410 420
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pF1KB4 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEAL
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pF1KB4 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYFY
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pF1KB4 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 YEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGATM
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVI
::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 FGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIA--------------------------------
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pF1KB4 PSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAA
:::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 MIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEK
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::::
CCDS45 SDSE--------------------------------------------------------
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::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 ----------------------------EEVARQQAAGPLERNIQLESRGLASRGDLSIP
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 GLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEKHAKEEDSSIDYD
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970
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:::::::::::::::::
CCDS45 LNLPDTVTHEDYVTTRL
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:.:.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .
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:.::: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::
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. .:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...
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::.:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .::
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pF1KB4 IVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYS
...... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :.
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. :..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. :::
CCDS58 DFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFL
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pF1KB4 FIYCLVLLAFANGLNQLYFY-YEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIFGL
.. :::..:. ::.::: : . : :: ::.: :..: ... : .::: ::.:
CCDS58 GMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSL
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pF1KB4 --INLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWK
. ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : :::
CCDS58 AHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWK
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640 650 660 670 680 690
pF1KB4 FARTKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFGTI
:::.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. ...
CCDS58 FARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----NSL
670 680 690 700 710
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pF1KB4 GRRAADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLG
. . .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :.
CCDS58 KEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRD
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760 770 780 790 800 810
pF1KB4 LL--RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAI
:: : :: . . :
CCDS58 LLGFRTSKYAMFYPRN
780 790
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: .:. ..: ..: : :..:.::::: :::::. .:... ::.:
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.:: : :.:. : ... ::::::: ::.::. ::::.:: :. :::.: ::.:: .:.:
CCDS31 KPHAVGCECTLCSAKNKKDSLRHSRFRLDIYRCLASPALIMLTEEDPILRAFELSADLKE
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pF1KB4 LSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYR------DDNSLIEEQSG
:: :: ::...::::.::::.:::::: :.:.:::::.:::. : .:.::.
CCDS31 LSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSSDEPLDKRGLLEER--
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pF1KB4 NDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVF
.:.:::::::: :::::.: ::::.: . :. .. :.::. :..: . .:...::.
CCDS31 MNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIFWPVL
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pF1KB4 SVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVE
:.:::::::: .: .:. ::.::: : :::.:::.:: : : ... : .:: ..
CCDS31 SLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPALERID
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pF1KB4 WMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALN
.... :..:.::..::..: ::.:.... : ..::::::::::..::.:: :. .
CCDS31 YLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKFHDFA
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pF1KB4 PRESWDMWHPTLVAEALFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIY
:..:: .:::::::.:::.::..: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. ::: ..
CCDS31 DRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKFLGMF
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pF1KB4 CLVLLAFANGLNQLYFY-YEETKGLTCKGIRCEKQ-NNAFSTLFETLQSLFWSIFGL--I
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CCDS31 LLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSKEQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWYIFSLAHV
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pF1KB4 NLYVTNVKAQHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFAR
..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: : ::::::
CCDS31 AIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHEDKEWKFAR
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pF1KB4 TKLWMSYFEEGGTLPTPFNVIPSPKSLWYLI----KWIWTHLCKKKMRRKPESFGTIGRR
.:::.:::.. ::: :::.:::::.. :.: ::: .: : :..:. ... .
CCDS31 AKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSKGKVKRQ----NSLKEW
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pF1KB4 AADNLRRHHQYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLL-
. .: ..::.:: ::.::...: . .. . : ::..::.::.:.:: :. ::
CCDS31 RNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNEIRDLLG
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pF1KB4 -RGSKLSTIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASE
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CCDS31 FRTSKYAMFYPRN
750
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pF1KB4 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAE
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CCDS37 SPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESK
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pF1KB4 IYFKININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFN--VYVGDALLHAIRKEVVGAVEL
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CCDS37 ---TLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
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pF1KB4 LLNHKKPSGEKQVP--PI---LLDKQF-------SEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLV
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CCDS37 ILNHPGFAASKRLTLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHMLL
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pF1KB4 QKGVSVPRPHEVRCNCVECVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQ
.::. . :::. :.: .:. .. ::. :::::.: ::.::::. ..:::::: :::..
CCDS37 MKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTALE
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230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LSWELQELSKVENEFKSEYEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILN--YRDDNSLIEE
:: :: .:...:.:::..:..:: :::.:. .:: :.:.:.: ::: .. . : .
CCDS37 LSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEVH
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pF1KB4 QSGNDLARLKLAIKYRQKEFVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLF
. .:.:.::::::. :.:::.::::: : . ::... : :.. :.: .. ....: .
CCDS37 RHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALGL
310 320 330 340 350 360
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pF1KB4 PVFSVCYLIAPKSPLGLFIRKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQ----------HIDRS
: ... : ::: : :: ..:.::.::. :.::.. :: ::.. .. .: .
CCDS37 PFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITVT
370 380 390 400 410 420
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pF1KB4 DLNRQ-----GPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIKQMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLY
: .: : .: .:. ::::..:.: :..: : ..:: . ::..:: : :..
CCDS37 DYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSIF
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pF1KB4 LATISLKIVAFVKYS------------------ALNP--------RESWDMWHPTLVAEA
.:... ...::.. . .: : :..: : ...:.
CCDS37 IAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISEG
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pF1KB4 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
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CCDS37 LYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILYS
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pF1KB4 YYEETKGLTCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEFVGAT
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CCDS37 LYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPPPFSL
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pF1KB4 IPSPKSLWYLIKWIWTH-LCKKKMRRKPESFGTIGRRAADNL---------RRHH-----
.:::::. :.: : . :... .: .: . .. :: . :
CCDS37 VPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSFNSIL
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pF1KB4 ----QYQEVMRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLS
.::..:. :.:::: : ...: ..: ..::.::::::.:.:.:
CCDS37 NQPTRYQQIMKRLIKRYVLKAQVDKENDE-VNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQATEE
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pF1KB4 TIQSANASKESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDLTTLIHPRSAAIASERHNISNG
CCDS37 LAILIHKLSEKLNPSMLRCE
830 840
977 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 14:24:32 2016 done: Thu Nov 3 14:24:33 2016
Total Scan time: 4.310 Total Display time: 0.390
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]