Result of FASTA (ccds) for
pF1KB4096
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4096, 973 aa
1>>>pF1KB4096 973 - 973 aa - 973 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.1869+/-0.00112; mu= 17.2235+/- 0.067
mean_var=88.3334+/-17.213, 0's: 0 Z-trim(104.1): 55 B-trim: 26 in 1/50
Lambda= 0.136462
statistics sampled from 7696 (7746) to 7696 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.599), E-opt: 0.2 (0.238), width: 16
Scan time: 3.060
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX ( 973) 6504 1291.4 0
CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 977) 4171 832.1 0
CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 982) 4157 829.4 0
CCDS45038.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 893) 4119 821.9 0
CCDS45039.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 836) 3975 793.5 0
CCDS45036.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 828) 3525 704.9 1.6e-202
CCDS45035.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 ( 804) 2616 526.0 1.2e-148
CCDS58856.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 793) 2257 455.3 2.2e-127
CCDS3126.1 TRPC1 gene_id:7220|Hs108|chr3 ( 759) 1998 404.3 4.8e-112
CCDS3725.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 848) 786 165.7 3.5e-40
CCDS47130.1 TRPC3 gene_id:7222|Hs108|chr4 ( 921) 786 165.7 3.8e-40
CCDS54905.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 746) 493 108.0 7.4e-23
CCDS54906.1 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 801) 493 108.0 7.8e-23
CCDS47267.2 TRPC7 gene_id:57113|Hs108|chr5 ( 862) 493 108.0 8.3e-23
CCDS8311.1 TRPC6 gene_id:7225|Hs108|chr11 ( 931) 475 104.5 1e-21
>>CCDS14561.1 TRPC5 gene_id:7224|Hs108|chrX (973 aa)
initn: 6504 init1: 6504 opt: 6504 Z-score: 6917.8 bits: 1291.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6504; 100.0% identity (100.0% similar) in 973 aa overlap (1-973:1-973)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 YYETRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEFV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 YYETRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEFV
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 GATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 GATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPP
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 FNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 FNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNL
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 VKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 VKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQR
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 DDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 DDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKAESSSKRSFMGP
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB4 SLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQMEKGKAEACSQSEIN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 SLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQMEKGKAEACSQSEIN
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB4 LSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETWGEACDLLMHK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS14 LSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVFETWGEACDLLMHK
910 920 930 940 950 960
970
pF1KB4 WGDGQEEQVTTRL
:::::::::::::
CCDS14 WGDGQEEQVTTRL
970
>>CCDS9365.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (977 aa)
initn: 2656 init1: 1561 opt: 4171 Z-score: 4435.5 bits: 832.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4171; 69.8% identity (87.4% similar) in 916 aa overlap (1-903:1-904)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
:::.:::. .::::::::.:::::.::: :::.::::::::::.::..:.:::::..
CCDS93 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
.::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
CCDS93 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
:::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
CCDS93 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::.::::::::::.:
CCDS93 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
:::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::.: .. :. .:::.::.::::.:::
CCDS93 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
CCDS93 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
.::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
CCDS93 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
.:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::.. ::: :.::::::.:::
CCDS93 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
::: :... .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
CCDS93 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS93 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRN
:::.::::::. :: .:. . .: :. ::. ... .. .: ::.: ....::::.::
CCDS93 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKK---MRRKPESFGTIGRRAADNLRRHHQYQEVMRN
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 LVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRK----HPRSFSTSST
:::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . : . . : :.
CCDS93 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KB4 ELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKA-----
. .. :...:. :... :.:. : :.: : . : . ..:.. .
CCDS93 NSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDL---TTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPP
780 790 800 810 820
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 -ESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQME-
:.. : .:. ..:..::. . . . .: ... ....:. ...:. : :.:
CCDS93 REKQRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLES
830 840 850 860 870 880
890 900 910 920 930 940
pF1KB4 KGKAEACSQSEINLSEVELGEVQGAAQSSECPLACSSSLHCASSICSSNSKLLDSSEDVF
.: : . : .:::
CCDS93 RGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEK
890 900 910 920 930 940
>>CCDS45037.1 TRPC4 gene_id:7223|Hs108|chr13 (982 aa)
initn: 2627 init1: 1561 opt: 4157 Z-score: 4420.5 bits: 829.4 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4157; 69.6% identity (87.1% similar) in 919 aa overlap (1-903:1-909)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MAQLYYKKVNYSPYRDRIPLQIVRAETELSAEEKAFLNAVEKGDYATVKQALQEAEIYYN
:::.:::. .::::::::.:::::.::: :::.::::::::::.::..:.:::::..
CCDS45 MAQFYYKRNVNAPYRDRIPLRIVRAESELSPSEKAYLNAVEKGDYASVKKSLEEAEIYFK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 VNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHSVYVGDALLYAIRKEVVGAVELLLSYRR
.::::.:::::.::::::::::::..::::. .::::::::.::::::::::::::....
CCDS45 ININCIDPLGRTALLIAIENENLELIELLLSFNVYVGDALLHAIRKEVVGAVELLLNHKK
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 PSGEKQVPTLMMDTQFSEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLLVQKRVTIPRPHQIRCNCVE
:::::::: ...: ::::::::::::.::::::::::::::::: :..::::..::::::
CCDS45 PSGEKQVPPILLDKQFSEFTPDITPIILAAHTNNYEIIKLLVQKGVSVPRPHEVRCNCVE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 CVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAFRLGWELKELSKVENEFKAE
:::::.::::::::::::::::::::::::::::::.::::.:.:::.::::::::::.:
CCDS45 CVSSSDVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPFLTAFQLSWELQELSKVENEFKSE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 YEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDPQKYHDLAKLKVAIKYHQKE
:::::.::: ::::::::.:::::::::::.:::.: .. :. .:::.::.::::.:::
CCDS45 YEELSRQCKQFAKDLLDQTRSSRELEIILNYRDDNSL-IEEQSGNDLARLKLAIKYRQKE
250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 FVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFLFPMLSIAYLISPRSNLGLFI
::::::::::::. ::: ::::::.::.::..::. ::.:::..:. :::.:.: :::::
CCDS45 FVAQPNCQQLLASRWYDEFPGWRRRHWAVKMVTCFIIGLLFPVFSVCYLIAPKSPLGLFI
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 KKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQHIVRTDLHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIK
.::::::::::::::::::.:::::::: :.::. ::::::.::::::::::::::::::
CCDS45 RKPFIKFICHTASYLTFLFLLLLASQHIDRSDLNRQGPPPTIVEWMILPWVLGFIWGEIK
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 EMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKYNGSRPREEWEMWHPTLIAEA
.:::::. .:::::::::::.:::::::::::::::.:::.. ::: :.::::::.:::
CCDS45 QMWDGGLQDYIHDWWNLMDFVMNSLYLATISLKIVAFVKYSALNPRESWDMWHPTLVAEA
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 LFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
::::.::.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS45 LFAIANIFSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLYF
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590
pF1KB4 YYE-TRAIDEPNNCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSVFGLLNLYVTNVKARHEFTEF
::: :... .::::::::::::::::::::::::::.:::.:::::::::.::::::
CCDS45 YYEETKGL----TCKGIRCEKQNNAFSTLFETLQSLFWSIFGLINLYVTNVKAQHEFTEF
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640 650
pF1KB4 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::::::
CCDS45 VGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHADIEWKFARTKLWMSYFEEGGTLPT
600 610 620 630 640 650
660 670 680 690 700 710
pF1KB4 PFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPK---RDPDGRRRRRNLRSFTERNADSLIQNQHYQEV
:::.::::::. :: .:. . .: : : :.. ..:. .: ::.: ....::::
CCDS45 PFNVIPSPKSLWYLIKWIWTHLCKKKMRRKPESFGTI-GVRTQHRRAADNLRRHHQYQEV
660 670 680 690 700 710
720 730 740 750 760 770
pF1KB4 IRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYEVLDLLGNRK----HPRSFST
.:::::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . : . . :
CCDS45 MRNLVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASK
720 730 740 750 760 770
780 790 800 810 820
pF1KB4 SSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKA--
:.. .. :...:. :... :.:. : :.: : . : . ..:.. .
CCDS45 ESSNSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDL---TTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQ
780 790 800 810 820 830
830 840 850 860 870 880
pF1KB4 ----ESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQ
:.. : .:. ..:..::. . . . .: ... ....:. ...:. : :
CCDS45 EPPREKQRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQ
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:::::::::::..::.:::::::::::::::::::.::: :: . : . . : :.
CCDS45 LVKRYVAAMIRDAKTEEGLTEENFKELKQDISSFRFEVLGLLRGSKLSTIQSANASKESS
540 550 560 570 580 590
780 790 800 810 820
pF1KB4 ELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVS-FNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGAQGKSKA-----
. .. :...:. :... :.:. : :.: : . : . ..:.. .
CCDS45 NSADSDEKSDSEGNSKDKKKNFSLFDL---TTLIHPRSAAIASERHNISNGSALVVQEPP
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pF1KB4 -ESSSKRSFMGPSLKKLGLLFSKFNGHMSEPSSEPMYTISDGIVQQHCMWQDIRYSQME-
:.. : .:. ..:..::. . . . .: ... ....:. ...:. : :.:
CCDS45 REKQRKVNFV-TDIKNFGLFHRRSKQNAAEQNANQIFSVSEEVARQQAAGPLERNIQLES
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.: : . : .:::
CCDS45 RGLASRGDLSIPGLSEQCVLVDHRERNTDTLGLQVGKRVCPFKSEKVVVEDTVPIIPKEK
720 730 740 750 760 770
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... :..:.:: . :.:. : .... ::::::: ::.::. ::::.:: :. ::::: ::
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:...:.::. :::.:.:..: .:. ::.::: : :::.:::..: : : . ...:
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: ...... :..:.::..::..: :. ..... : ..:.::::::::..::.::.
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:.. :..:. .::::.::.:::..:.:: :::. ..:..: :::::::.:.:: :.
CCDS58 NKFHDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDF
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::: .. :::..:. ::.::: : .. : ..: :: ::.: :..: ... : .:
CCDS58 GKFLGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSK---EQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFAL
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pF1KB4 FWSVFGL--LNLYVTNVKARHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIAD
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CCDS58 FWYIFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIAN
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pF1KB4 HADIEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPPFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRR
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CCDS58 HEDKEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSK-GKVKR
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pF1KB4 RNLRSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSF
.: :. : . ....::.:. ::.::...: .. .. . : ::..::.::.:.:
CCDS58 QN--SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKF
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pF1KB4 RYEVLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPL
: :. :::: :
CCDS58 RNEIRDLLGFRTSKYAMFYPRN
780 790
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10 20 30 40
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CCDS31 -----GCQKLMERIQNP-------------EYST-TMDVAPVILAAHRNNYEILTMLLKQ
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CCDS31 ADLKELSLVEVEFRNDYEELARQCKMFAKDLLAQARNSRELEVILNHTSS-DEPLDKRGL
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pF1KB4 -QKYHDLAKLKVAIKYHQKEFVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFL
.. .:..::.::::.:::::.: ::::.: :.:. . :.::: :..: .:.:..
CCDS31 LEERMNLSRLKLAIKYNQKEFVSQSNCQQFLNTVWFGQMSGYRRKPTCKKIMTVLTVGIF
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.:.::. :::.:.:..: .:. ::.::: : :::.:::..: : : . ...::
CCDS31 WPVLSLCYLIAPKSQFGRIIHTPFMKFIIHGASYFTFLLLLNLYSLVYNEDKKNTMGPAL
330 340 350 360 370 380
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pF1KB4 TVVEWMILPWVLGFIWGEIKEMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSLYLATISLKIVAYVKY
...... :..:.::..::..: :. ..... : ..:.::::::::..::.::. :.
CCDS31 ERIDYLLILWIIGMIWSDIKRLWYEGLEDFLEESRNQLSFVMNSLYLATFALKVVAHNKF
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pF1KB4 NGSRPREEWEMWHPTLIAEALFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKF
. :..:. .::::.::.:::..:.:: :::. ..:..: :::::::.:.:: :. ::
CCDS31 HDFADRKDWDAFHPTLVAEGLFAFANVLSYLRLFFMYTTSSILGPLQISMGQMLQDFGKF
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: .. :::..:. ::.::: : .. : ..: :: ::.: :..: ... : .:::
CCDS31 LGMFLLVLFSFTIGLTQLYDKGYTSK---EQKDCVGIFCEQQSNDTFHSFIGTCFALFWY
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pF1KB4 VFGL--LNLYVTNVKARHEFTEFVGATMFGTYNVISLVVLLNMLIAMMNNSYQLIADHAD
.:.: . ..:: . .:. ::::.. :::::. ..:: ..:.::...:.::::.: :
CCDS31 IFSLAHVAIFVTRFSYGEELQSFVGAVIVGTYNVVVVIVLTKLLVAMLHKSFQLIANHED
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pF1KB4 IEWKFARTKLWMSYFDEGGTLPPPFNIIPSPKSFLYLGNWFNNTFCPKRDPDGRRRRRNL
::::::.:::.::::. :::::::::::::.. :. . ... .: . . :. .:.:
CCDS31 KEWKFARAKLWLSYFDDKCTLPPPFNIIPSPKTICYMISSLSKWICSHTSK-GKVKRQN-
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pF1KB4 RSFTERNADSLIQNQHYQEVIRNLVKRYVAAMIRNSKTHEGLTEENFKELKQDISSFRYE
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CCDS31 -SLKEWRNLKQKRDENYQKVMCCLVHRYLTSMRQKMQSTDQATVENLNELRQDLSKFRNE
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pF1KB4 VLDLLGNRKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRT
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CCDS31 IRDLLGFRTSKYAMFYPRN
750
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CCDS37 SPSLRRMTVMREKGRRQAVRGPAFMFNDRGTSLTAEEERFLDAAEYGNIPVVRKMLEESK
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pF1KB4 IYYNVNINCMDPLGRSALLIAIENENLEIMELLLNHS--VYVGDALLYAIRKEVVGAVEL
..:.::.: .:..:: .:. ::.::. ::::.. . .::::: :: : : ::
CCDS37 ---TLNVNCVDYMGQNALQLAVGNEHLEVTELLLKKENLARIGDALLLAISKGYVRIVEA
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pF1KB4 LLSYRRPSGEKQVPTL------MMDTQF-------SEFTPDITPIMLAAHTNNYEIIKLL
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CCDS37 ILNHPGFAASKRL-TLSPCEQELQDDDFYAYDEDGTRFSPDITPIILAAHCQKYEVVHML
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pF1KB4 VQKRVTIPRPHQIRCNCVECVSSSEVDSLRHSRSRLNIYKALASPSLIALSSEDPILTAF
..: . : :::. :.: .:. ... ::. :::::.: ::.::::. ..::::::.:::.
CCDS37 LMKGARIERPHDYFCKCGDCMEKQRHDSFSHSRSRINAYKGLASPAYLSLSSEDPVLTAL
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pF1KB4 RLGWELKELSKVENEFKAEYEELSQQCKLFAKDLLDQARSSRELEIILNHRDDHSEELDP
.:. :: .:...:.::: .:..::.::: :. .:: :.:.:.: ::: . .: :.
CCDS37 ELSNELAKLANIEKEFKNDYRKLSMQCKDFVVGVLDLCRDSEEVEAILNGDLESAEPLEV
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pF1KB4 QKYH-DLAKLKVAIKYHQKEFVAQPNCQQLLATLWYDGFPGWRRKHWVVKLLTCMTIGFL
.... .:...:.::::. :.:::.::::: : :.::... : :.. ..: :. .....
CCDS37 HRHKASLSRVKLAIKYEVKKFVAHPNCQQQLLTIWYENLSGLREQTIAIKCLVVLVVALG
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pF1KB4 FPMLSIAYLISPRSNLGLFIKKPFIKFICHTASYLTFLFMLLLASQ----------HIVR
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CCDS37 LPFLAIGYWIAPCSRLGKILRSPFMKFVAHAASFIIFLGLLVFNASDRFEGITTLPNITV
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pF1KB4 TD-----LHVQGPPPTVVEWMILPWVLGFIWGEIKEMWDGGFTEYIHDWWNLMDFAMNSL
:: ..:. : .: .:. ::::..:.: ::.: : ::: . ::..::.: :.
CCDS37 TDYPKQIFRVKTTQFTWTEMLIMVWVLGMMWSECKELWLEGPREYILQLWNVLDFGMLSI
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pF1KB4 YLATISLKIVAYVKYNGSR-----------------P---------REEWEMWHPTLIAE
..:... ...:... . .. : :..: : .:.:
CCDS37 FIAAFTARFLAFLQATKAQQYVDSYVQESDLSEVTLPPEIQYFTYARDKWLPSDPQIISE
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pF1KB4 ALFAISNILSSLRLISLFTANSHLGPLQISLGRMLLDILKFLFIYCLVLLAFANGLNQLY
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CCDS37 GLYAIAVVLSFSRIAYILPANESFGPLQISLGRTVKDIFKFMVLFIMVFFAFMIGMFILY
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CCDS37 IGYVLYGIYNVTMVVVLLNMLIAMINSSYQEIEDDSDVEWKFARSKLWLSYFDDGKTLPP
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CCDS37 PFSLVPSPKSFVYFIMRIVNFPKCRRRRLQKDIEMGMGNSKSRLNLFTQSNSRVFESHSF
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CCDS37 NSILNQPTRYQQIMKRLIKRYVLKA-QVDKENDEVNEGELKEIKQDISSLRYELLEDKSQ
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pF1KB4 RKHPRSFSTSSTELSQRDDNNDGSGGARAKSKSVSFNLGCKKKTCHGPPLIRTMPRSSGA
CCDS37 ATEELAILIHKLSEKLNPSMLRCE
830 840
973 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
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start: Tue Nov 8 16:55:59 2016 done: Tue Nov 8 16:55:59 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]