Result of FASTA (omim) for
pF1KB4088
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4088, 760 aa
1>>>pF1KB4088 760 - 760 aa - 760 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1568+/-0.00043; mu= 21.4117+/- 0.027
mean_var=73.9418+/-15.057, 0's: 0 Z-trim(109.5): 74 B-trim: 803 in 1/56
Lambda= 0.149152
statistics sampled from 17585 (17659) to 17585 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.207), width: 16
Scan time: 10.140
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001121620 (OMIM: 190010,616740) transferrin rec ( 760) 5024 1091.3 0
NP_003225 (OMIM: 190010,616740) transferrin recept ( 760) 5024 1091.3 0
NP_001300894 (OMIM: 190010,616740) transferrin rec ( 679) 4492 976.8 0
NP_001300895 (OMIM: 190010,616740) transferrin rec ( 478) 3185 695.5 1.4e-199
NP_001193784 (OMIM: 604250,604720) transferrin rec ( 630) 834 189.7 3.3e-47
XP_005250610 (OMIM: 604250,604720) PREDICTED: tran ( 801) 834 189.8 3.9e-47
XP_016868062 (OMIM: 604250,604720) PREDICTED: tran ( 801) 834 189.8 3.9e-47
NP_003218 (OMIM: 604250,604720) transferrin recept ( 801) 834 189.8 3.9e-47
XP_016861572 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 602) 448 106.6 3.2e-22
XP_011510918 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 622) 448 106.6 3.3e-22
XP_016861563 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861569 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861560 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_006713623 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861566 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861559 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861564 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861562 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861568 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861567 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861565 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_016861561 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 778) 448 106.7 3.9e-22
XP_011510915 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 788) 448 106.7 3.9e-22
NP_996898 (OMIM: 608806) inactive N-acetylated-alp ( 795) 448 106.7 3.9e-22
XP_011510914 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 805) 448 106.7 4e-22
XP_011510919 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 612) 444 105.7 5.8e-22
XP_016872534 (OMIM: 611636) PREDICTED: N-acetylate ( 686) 444 105.8 6.4e-22
NP_005458 (OMIM: 611636) N-acetylated-alpha-linked ( 740) 444 105.8 6.8e-22
XP_016872532 (OMIM: 611636) PREDICTED: N-acetylate ( 775) 444 105.8 7e-22
NP_001287859 (OMIM: 611636) N-acetylated-alpha-lin ( 707) 435 103.9 2.5e-21
XP_016872533 (OMIM: 611636) PREDICTED: N-acetylate ( 742) 435 103.9 2.6e-21
XP_016872928 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 662) 427 102.1 7.8e-21
XP_016872930 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 662) 427 102.1 7.8e-21
XP_016872927 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 662) 427 102.1 7.8e-21
XP_016872929 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 662) 427 102.1 7.8e-21
XP_016872926 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 693) 427 102.1 8.1e-21
XP_016872931 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 693) 427 102.1 8.1e-21
XP_016872932 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 693) 427 102.1 8.1e-21
XP_016872925 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 693) 427 102.1 8.1e-21
XP_016872924 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 704) 427 102.1 8.2e-21
NP_001180401 (OMIM: 600934) glutamate carboxypepti ( 704) 427 102.1 8.2e-21
NP_001014986 (OMIM: 600934) glutamate carboxypepti ( 719) 427 102.1 8.3e-21
XP_016872923 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 735) 427 102.1 8.5e-21
NP_001180400 (OMIM: 600934) glutamate carboxypepti ( 735) 427 102.1 8.5e-21
NP_004467 (OMIM: 600934) glutamate carboxypeptidas ( 750) 427 102.2 8.6e-21
XP_016861570 (OMIM: 608806) PREDICTED: inactive N- ( 756) 427 102.2 8.7e-21
XP_016872922 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 774) 427 102.2 8.8e-21
XP_016872921 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 805) 427 102.2 9.1e-21
XP_016872808 (OMIM: 609020) PREDICTED: putative N- ( 693) 425 101.7 1.1e-20
XP_011518260 (OMIM: 600934) PREDICTED: glutamate c ( 543) 402 96.7 2.8e-19
>>NP_001121620 (OMIM: 190010,616740) transferrin recepto (760 aa)
initn: 5024 init1: 5024 opt: 5024 Z-score: 5840.2 bits: 1091.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5024; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB4 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
730 740 750 760
>>NP_003225 (OMIM: 190010,616740) transferrin receptor p (760 aa)
initn: 5024 init1: 5024 opt: 5024 Z-score: 5840.2 bits: 1091.3 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 5024; 100.0% identity (100.0% similar) in 760 aa overlap (1-760:1-760)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MMDQARSAFSNLFGGEPLSYTRFSLARQVDGDNSHVEMKLAVDEEENADNNTKANVTKPK
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREEPGEDFPAAR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVENQFREFKLSK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTK
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIVNAELSFFGH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEGDCPSDWKTD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 STCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSG
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 VGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 YINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASKVEKLTLDNA
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 AFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAAEVAGQFVIK
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 GNAEKTDRFVMKKLNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRK
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB4 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QNNGAFNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
730 740 750 760
>>NP_001300894 (OMIM: 190010,616740) transferrin recepto (679 aa)
initn: 4492 init1: 4492 opt: 4492 Z-score: 5222.2 bits: 976.8 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4492; 100.0% identity (100.0% similar) in 679 aa overlap (82-760:1-679)
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 TKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREE
::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MIGYLGYCKGVEPKTECERLAGTESPVREE
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 PGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PGEDFPAARRLYWDDLKRKLSEKLDSTDFTGTIKLLNENSYVPREAGSQKDENLALYVEN
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 QFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQNSVIIVDKNGRLVYLVENPGGYVAYSKAATVTGK
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 LVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LVHANFGTKKDFEDLYTPVNGSIVIVRAGKITFAEKVANAESLNAIGVLIYMDQTKFPIV
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB4 NAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPSRSSGLPNIPVQTISRAAAEKLFGNMEG
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB4 DCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DCPSDWKTDSTCRMVTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDA
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB4 WGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 WGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYL
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB4 SSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLLYTLIEKTMQNVKHPVTGQFLYQDSNWASK
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB4 VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 VEKLTLDNAAFPFLAYSGIPAVSFCFCEDTDYPYLGTTMDTYKELIERIPELNKVARAAA
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NP_001 EVAGQFVIKLTHDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFR
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pF1KB4 NGRLVYLV--ENPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYT----PVNGSIVIVRA
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: :.::.::.::....: ::::: . . : : .... . .::.::::::::::::
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::::.::::: :::::.::.: :: : .:. ...: :..:. . . .
NP_001 PSFNQTQFPPVASSGLPSIPAQPISADIASRLLRKLKGPVAPQEWQGSLLGSPYHLGPGP
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..:.:.: : :::: :.: :::::::.::::::::::::::.::::.::.:..
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pF1KB4 MFSDMVLKDGFQPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGT
::.:: ..::.: ::..: ::..:::::::.::::::::: ::::: .:..::.::::
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..:....:::: .:::.....: : .:: ::. . .: ..: . : .:..:. :
NP_001 DKFHAKTSPLLTSLIESVLKQVDSPNHSGQTLYEQVVFTNPSWDAEVIRPLPMDSSAYSF
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pF1KB4 LAYSGIPAVSFCFCEDTD-YPYLGTTMDTYKELIERIP-ELNKVARAAAEVAGQFVIKLT
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NP_001 TAFVGVPAVEFSFMEDDQAYPFLHTKEDTYENLHKVLQGRLPAVAQAVAQLAGQLLIRLS
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pF1KB4 HDVELNLDYERYNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGN
:: : ::. ::.. .: . .::.. .:.: ::.:::.::::::..::. .: .. .
NP_001 HDRLLPLDFGRYGDVVLRHIGNLNEFSGDLKARGLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRQEIYS
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.:. :. . . : :.::::..::: :::: .:::::.: : :.::: :::..:.: ..:
NP_001 SEERDERLTRMYNVRIMRVEFYFLSQYVSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSN
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pF1KB4 N----GA-----FNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
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NP_001 SSGTPGATSSTGFQESRFRRQLALLTWTLQGAANALSGDVWNIDNNF
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:: :. .. . . ::..:: : :.: .: : :. :.. ::. :.. . :
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pF1KB4 YTLIEKTMQNVKHPV-TGQFLYQ-----DSNWASKVEK-LTLDNAAFPFLAYSGIPAVSF
.:::.....: : .:: ::. . .: ..: . : .:..:. : :. :.::: :
XP_005 TSLIESVLKQVDSPNHSGQTLYEQVVFTNPSWDAEVIRPLPMDSSAYSFTAFVGVPAVEF
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pF1KB4 CFCEDTD-YPYLGTTMDTYKELIERIP-ELNKVARAAAEVAGQFVIKLTHDVELNLDYER
: :: . ::.: : :::..: . . .: ::.:.:..:::..:.:.:: : ::. :
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pF1KB4 YNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKK
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680 690 700 710 720
pF1KB4 LNDRVMRVEYHFLSPYVSPKESPFRHVFWGSGSHTLPALLENLKLRKQNN----GA----
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XP_005 YNVRIMRVEFYFLSQYVSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSNSSGTPGATSST
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730 740 750 760
pF1KB4 -FNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
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XP_005 GFQESRFRRQLALLTWTLQGAANALSGDVWNIDNNF
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pF1KB4 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVYLV--E
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pF1KB4 NPGGYVAYSKAATVTGKLVHANFGTKKDFEDLYT----PVNGSIVIVRAGKITFAEKVAN
.: : :: ..:::.::.:..: .:..:: . :: : ...::.: :.::.::.:
XP_016 DPDVYCPYSAIGNVTGELVYAHYGRPEDLQDLRARGVDPV-GRLLLVRVGVISFAQKVTN
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pF1KB4 AESLNAIGVLIYMDQTKF------PIVNAELSFFGHAHLGTGDPYTPGFPSFNHTQFPPS
:....: ::::: . . : : .... . .::.::::::::::::::::.:::::
XP_016 AQDFGAQGVLIYPEPADFSQDPPKPSLSSQQAVYGHVHLGTGDPYTPGFPSFNQTQFPPV
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pF1KB4 EIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRDAWGPGAAKSGVGTALLLKLAQMFSDMVLKDGF
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XP_016 STPINNIFGCIEGRSEPDHYVVIGAQRDAWGPGAAKSAVGTAILLELVRTFSSMV-SNGF
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pF1KB4 QPSRSIIFASWSAGDFGSVGATEWLEGYLSSLHLKAFTYINLDKAVLGTSNFKVSASPLL
.: ::..: ::..:::::::.::::::::: ::::: .:..::.:::: ..:....::::
XP_016 RPRRSLLFISWDGGDFGSVGSTEWLEGYLSVLHLKAVVYVSLDNAVLGDDKFHAKTSPLL
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pF1KB4 YTLIEKTMQNVKHPV-TGQFLYQ-----DSNWASKVEK-LTLDNAAFPFLAYSGIPAVSF
.:::.....: : .:: ::. . .: ..: . : .:..:. : :. :.::: :
XP_016 TSLIESVLKQVDSPNHSGQTLYEQVVFTNPSWDAEVIRPLPMDSSAYSFTAFVGVPAVEF
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XP_016 SFMEDDQAYPFLHTKEDTYENLHKVLQGRLPAVAQAVAQLAGQLLIRLSHDRLLPLDFGR
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pF1KB4 YNSQLLSFVRDLNQYRADIKEMGLSLQWLYSARGDFFRATSRLTTDFGNAEKTDRFVMKK
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XP_016 YGDVVLRHIGNLNEFSGDLKARGLTLQWVYSARGDYIRAAEKLRQEIYSSEERDERLTRM
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XP_016 YNVRIMRVEFYFLSQYVSPADSPFRHIFMGRGDHTLGALLDHLRLLRSNSSGTPGATSST
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730 740 750 760
pF1KB4 -FNETLFRNQLALATWTIQGAANALSGDVWDIDNEF
:.:. :: :::: :::.::::::::::::.:::.:
XP_016 GFQESRFRRQLALLTWTLQGAANALSGDVWNIDNNF
770 780 790 800
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pF1KB4 MKLAVDEEENADNNTKANVTKPKRCSGSICYGTIAVIVFFLIGFMIGYLGYCKGVEPKTE
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NP_003 MELRGPEPLGSRPRQPNLIPWAAAGRRAAPYLVLTALLIFTGAFLLGYVAF-RGSCQACG
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NP_003 DSVLVVSED-VNYEPDLDFHQGR-LYWSDLQAMFLQFLGEGRLEDTIR---QTSLRERVA
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pF1KB4 GSQKDENLALYVENQFREFKLSKVWRDQHFVKIQVKDSAQ-NSVIIVDKNGRLVYLV--E
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NP_003 GSAGMAALTQDIRAALSRQKLDHVWTDTHYVGLQFPDPAHPNTLHWVDEAGKVGEQLPLE
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:....: ::::: . . : : .... . .::.::::::::::::::::.:::::
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XP_011 GDPSTPGYPSVDES-FRQSRSN-LTSLLVQPISAPLVAKLISSPKARTKNE--ACSSLEL
180 190 200 210 220 230
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pF1KB4 VTSESKNVKLTVSNVLKEIKILNIFGVIKGFVEPDHYVVVGAQRD-AWGPGAAKSGVGTA
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XP_011 PNNEIRVVSMQVQTVTKLKTVTNVVGFVMGLTSPDRYIIVGSHHHTAHSYNGQEWASSTA
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60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:24:03 2016 done: Thu Nov 3 21:24:04 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]