Result of FASTA (omim) for
pF1KB4018
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB4018, 894 aa
1>>>pF1KB4018 894 - 894 aa - 894 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 11.6544+/-0.000514; mu= -6.1320+/- 0.032
mean_var=568.8723+/-123.138, 0's: 0 Z-trim(120.6): 1757 B-trim: 0 in 0/57
Lambda= 0.053773
statistics sampled from 33723 (35962) to 33723 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.727), E-opt: 0.2 (0.422), width: 16
Scan time: 10.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein ( 894) 6143 492.6 3.6e-138
NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated prot ( 873) 3619 296.8 3.1e-79
XP_011534682 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 557) 2117 180.0 2.8e-44
XP_011534681 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 710) 2117 180.1 3.2e-44
XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 845) 1902 163.5 3.8e-39
NP_006566 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1902 163.5 3.8e-39
XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 846) 1902 163.5 3.8e-39
NP_942089 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 1902 163.5 3.8e-39
XP_016873585 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 584) 1638 142.9 4.4e-33
XP_011543505 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 797) 1638 143.0 5.3e-33
NP_004570 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein ( 820) 1638 143.0 5.4e-33
NP_001294919 (OMIM: 603166) mitogen-activated prot ( 812) 1631 142.5 7.9e-33
XP_011534680 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 779) 1570 137.7 2e-31
XP_011524706 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 861) 1504 132.7 7.5e-30
XP_011524705 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 873) 1504 132.7 7.6e-30
XP_016873583 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 643) 1433 127.0 2.9e-28
XP_011543506 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 776) 1433 127.1 3.2e-28
XP_016873582 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 768) 1432 127.0 3.4e-28
NP_001036065 (OMIM: 601983) mitogen-activated prot ( 821) 1427 126.7 4.6e-28
NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein ( 833) 1427 126.7 4.6e-28
XP_016881720 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 860) 1400 124.6 2e-27
XP_016873584 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 620) 951 89.6 5e-17
XP_011508798 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 334) 911 86.2 2.9e-16
XP_016858657 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 911 86.2 3.1e-16
XP_016858658 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 365) 911 86.2 3.1e-16
XP_011508795 (OMIM: 602255) PREDICTED: serine/thre ( 376) 911 86.2 3.2e-16
NP_001258907 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 911 86.3 3.4e-16
NP_001258906 (OMIM: 602255) serine/threonine-prote ( 426) 911 86.3 3.4e-16
NP_006365 (OMIM: 602255) serine/threonine-protein ( 426) 911 86.3 3.4e-16
XP_016883522 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 388) 902 85.5 5.2e-16
XP_011527322 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 404) 902 85.6 5.4e-16
XP_005260590 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 462) 902 85.6 5.8e-16
XP_005260588 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 478) 902 85.7 6e-16
NP_006273 (OMIM: 604965,614868) serine/threonine-p ( 487) 902 85.7 6e-16
XP_005260587 (OMIM: 604965,614868) PREDICTED: seri ( 503) 902 85.7 6.2e-16
XP_016860864 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1155) 910 86.8 6.8e-16
XP_016860863 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1158) 910 86.8 6.8e-16
XP_016860862 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1163) 910 86.8 6.8e-16
NP_004825 (OMIM: 604666) mitogen-activated protein (1165) 910 86.8 6.8e-16
XP_016860861 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1166) 910 86.8 6.8e-16
XP_005264128 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1185) 910 86.8 6.9e-16
XP_016860860 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1186) 910 86.8 6.9e-16
XP_016860859 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1188) 910 86.8 6.9e-16
XP_006712932 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1189) 910 86.8 6.9e-16
XP_016860858 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1196) 910 86.8 6.9e-16
XP_005264126 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1209) 910 86.8 7e-16
XP_016860857 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1211) 910 86.8 7e-16
NP_663720 (OMIM: 604666) mitogen-activated protein (1212) 910 86.8 7e-16
XP_006712931 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1222) 910 86.8 7e-16
XP_005264125 (OMIM: 604666) PREDICTED: mitogen-act (1227) 910 86.8 7e-16
>>NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein kin (894 aa)
initn: 6143 init1: 6143 opt: 6143 Z-score: 2601.7 bits: 492.6 E(85289): 3.6e-138
Smith-Waterman score: 6143; 100.0% identity (100.0% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-894)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPYWMAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 LQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPYWMAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPDSDGFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPDSDGFLD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDD
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 ESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPP
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 PRLPPHKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PRLPPHKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 KVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 KVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLF
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PRRCTWLYVMNNCLLSISGKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PRRCTWLYVMNNCLLSISGKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 SVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPC
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTESDTPQTNVTHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 PLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTESDTPQTNVTHVT
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 QLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQG
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890
pF1KB4 RSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_003 RSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
850 860 870 880 890
>>NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein (873 aa)
initn: 3619 init1: 3619 opt: 3619 Z-score: 1543.5 bits: 296.8 E(85289): 3.1e-79
Smith-Waterman score: 5954; 97.7% identity (97.7% similar) in 894 aa overlap (1-894:1-873)
10 20 30 40 50 60
pF1KB4 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFAVVQQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB4 EIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYVSRET
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB4 LQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPYWMAP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPYWMAP
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB4 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB4 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB4 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPDSDGFLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHEL--------
310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB4 SSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDD
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 -------------DLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDD
360 370 380 390
430 440 450 460 470 480
pF1KB4 ESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPP
400 410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB4 PRLPPHKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRLPPHKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTP
460 470 480 490 500 510
550 560 570 580 590 600
pF1KB4 KVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLF
520 530 540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB4 PRRCTWLYVMNNCLLSISGKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PRRCTWLYVMNNCLLSISGKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKF
580 590 600 610 620 630
670 680 690 700 710 720
pF1KB4 SVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPC
640 650 660 670 680 690
730 740 750 760 770 780
pF1KB4 PLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTESDTPQTNVTHVT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTESDTPQTNVTHVT
700 710 720 730 740 750
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 QLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 QLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQG
760 770 780 790 800 810
850 860 870 880 890
pF1KB4 RSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
820 830 840 850 860 870
>>XP_011534682 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-activat (557 aa)
initn: 2024 init1: 1219 opt: 2117 Z-score: 916.0 bits: 180.0 E(85289): 2.8e-44
Smith-Waterman score: 2117; 64.7% identity (83.2% similar) in 481 aa overlap (418-894:86-557)
390 400 410 420 430 440
pF1KB4 FLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLEDDEGDDDESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQE
: .. .:: : :::::::::. :..
XP_011 EPPLRKETEARDEMGLSSDPNFMLQWNPFVDGANTGKSTSKRAIPPPLPPKPRISSYPED
60 70 80 90 100 110
450 460 470 480 490 500
pF1KB4 MHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQVPPRPPPPRLPP-HKPVALGNGMSSFQLNGERDG
. ..:. .:::.:: : .. :. : : : . ..::: . .: .:
XP_011 -NFPDEEKASTIKHCP--DSESRAPQILRRQSSPSCGPVAETSSIGNGDGISKLMSENTE
120 130 140 150 160 170
510 520 530 540 550 560
pF1KB4 SLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPISNGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWI
. : . : .:.:.: ::: ::::::::: :::::::::.::::::.::.:::
XP_011 GSAQAPQLPR-----KKDKRDFPKPAINGLPPTPKVLMGACFSKVFDGCPLKINCATSWI
180 190 200 210 220
570 580 590 600 610 620
pF1KB4 NPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHETSMEQLFPRRCTWLYVMNNCLLSIS-GKASQLY
.:::.:::.:::.:.::::::::::::..:::::::.::::::.:: :.:.: ::. :::
XP_011 HPDTKDQYIIFGTEDGIYTLNLNELHEATMEQLFPRKCTWLYVINNTLMSLSEGKTFQLY
230 240 250 260 270 280
630 640 650 660 670 680
pF1KB4 SHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLPDRILPRKFSVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGH
:::: .::..:.. : . : .:..:::::::::....:::.:: :.:::.::::::::
XP_011 SHNLIALFEHAKK-PGLAAHIQTHRFPDRILPRKFALTTKIPDTKGCHKCCIVRNPYTGH
290 300 310 320 330 340
690 700 710 720 730 740
pF1KB4 KYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRG
::::::::..::::.: :::::::::::.:::.: :: .:::::.::::::.:::..:.:
XP_011 KYLCGALQSGIVLLQWYEPMQKFMLIKHFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKG
350 360 370 380 390 400
750 760 770 780 790 800
pF1KB4 RDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTE--SDTPQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGR
. ::::.:::.: ::.:::::: . . : . :::::::::.::::: .:::::::.
XP_011 TESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAGSQQLDSIHVTQLERDTVLVCLDKFVKIVNLQGK
410 420 430 440 450 460
810 820 830 840 850 860
pF1KB4 LKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLG
::::.::.:::.:::.:::.:::::::::::::::::.::.:.:::::::: ::.:::::
XP_011 LKSSKKLASELSFDFRIESVVCLQDSVLAFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLG
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870 880 890
pF1KB4 SDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHENSY
::::::::::::.::::.:::::::::::::
XP_011 SDRVVVLESRPTENPTAHSNLYILAGHENSY
530 540 550
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Smith-Waterman score: 3163; 63.7% identity (79.9% similar) in 768 aa overlap (133-894:1-710)
110 120 130 140 150 160
pF1KB4 HVTGPLSELQIAYVSRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQIT
::::::::::::::.: ::::::::.:.::
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pF1KB4 ATIAKRKSFIGTPYWMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRA
::::::::::::::::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::
XP_011 ATIAKRKSFIGTPYWMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRA
40 50 60 70 80 90
230 240 250 260 270 280
pF1KB4 LFLMTKSNFQPPKLKDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQH-LTRSL
::::.:::::::::::: :::..::.:::.:::::::::::::.:: : ::.: :.:.:
XP_011 LFLMSKSNFQPPKLKDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRAL
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pF1KB4 AIELLDKVNNPD-HSTYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDP
:.:::::::::: :. : . :::: :: . . : :.::.::.: :.: :::.: ...:.:
XP_011 AVELLDKVNNPDNHAHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEP
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350 360 370 380 390 400
pF1KB4 PLRKETEPHHELPDSDGFLDSSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVE
::::::: . :. :. ::. :. :: . . :::
XP_011 PLRKETEARDEM----GL--SSDP-------NFMLQ-------WNPFVDGAN--------
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. .:: : :::::::::. :.. . ..:. .:::
XP_011 ---------------------TGKSTSKRAIPPPLPPKPRISSYPED-NFPDEEKASTIK
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.:: : .. :. : : : . ..::: . .: .: . : . :
XP_011 HCP--DSESRAPQILRRQSSPSCGPVAETSSIGNGDGISKLMSENTEGSAQAPQLPR---
290 300 310 320 330
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pF1KB4 LSRKEKKDVPKPISNGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGA
.:.:.: ::: ::::::::: :::::::::.::::::.::.:::.:::.:::.:::.
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:.::::::::::::..:::::::.::::::.:: :.:.: ::. ::::::: .::..:..
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pF1KB4 MQKLPVAIPAHKLPDRILPRKFSVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVL
: . : .:..:::::::::....:::.:: :.:::.::::::::::::::::..:::
XP_011 -PGLAAHIQTHRFPDRILPRKFALTTKIPDTKGCHKCCIVRNPYTGHKYLCGALQSGIVL
460 470 480 490 500 510
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pF1KB4 LEWVEPMQKFMLIKHIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVN
:.: :::::::::::.:::.: :: .:::::.::::::.:::..:.: . ::::.:::.:
XP_011 LQWYEPMQKFMLIKHFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFETIN
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pF1KB4 PNSTSSWFTE--SDTPQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTF
::.:::::: . . : . :::::::::.::::: .:::::::.::::.::.:::.:
XP_011 LNSASSWFTEIGAGSQQLDSIHVTQLERDTVLVCLDKFVKIVNLQGKLKSSKKLASELSF
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pF1KB4 DFQIESIVCLQDSVLAFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTD
::.:::.:::::::::::::::::.::.:.:::::::: ::.:::::::::::::::::.
XP_011 DFRIESVVCLQDSVLAFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTE
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880 890
pF1KB4 NPTANSNLYILAGHENSY
::::.:::::::::::::
XP_011 NPTAHSNLYILAGHENSY
700 710
>>XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-activat (845 aa)
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pF1KB4 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFA
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pF1KB4 VVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
..::::.:.:.::: :::::::::: :.:::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_011 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
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pF1KB4 SRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPY
::::::: :::.:::::::::::::::::.: ::::::::.:.::::::::::::::::
XP_011 CRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGTPY
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pF1KB4 WMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKL
::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
XP_011 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
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240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQH-LTRSLAIELLDKVNNPD-H
::: :::..::.:::.:::::::::::::.:: : ::.: :.:.::.:::::::::: :
XP_011 KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVNNPDNH
250 260 270 280 290 300
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pF1KB4 STYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPD
. : . :::: :: . . : :.::.::.: :.: :::.: ...:.:::::::: . :.
XP_011 AHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEARDEM--
310 320 330 340 350
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pF1KB4 SDGFLDSSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLED
:. ::. :. :: . . :::
XP_011 --GL--SSDP-------NFMLQ-------WNPFVDGAN----------------------
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pF1KB4 DEGDDDESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQV
. .:: : :::::::::. :.. . ..:. .:::.:: : .. :.
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380 390 400 410 420
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pF1KB4 PPRPPPPRLPP-HKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPIS
: : : . ..::: . .: .: . : . : .:.:.: :::
XP_011 LRRQSSPSCGPVAETSSIGNGDGISKLMSENTEGSAQAPQLPR-----KKDKRDFPKPAI
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 NGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHE
::::::::: :::::::::.::::::.::.:::.:::.:::.:::.:.::::::::::::
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..:::::::.::::::.:: :.:.:::. ::::::: .::..:.. : . : .:..::
XP_011 ATMEQLFPRKCTWLYVINNTLMSLSGKTFQLYSHNLIALFEHAKK-PGLAAHIQTHRFPD
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:::::::....:::.:: :.:::.::::::::::::::::..::::.: :::::::::::
XP_011 RILPRKFALTTKIPDTKGCHKCCIVRNPYTGHKYLCGALQSGIVLLQWYEPMQKFMLIKH
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 IDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTE--SDT
.:::.: :: .:::::.::::::.:::..:.: . ::::.:::.: ::.:::::: . .
XP_011 FDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAGS
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pF1KB4 PQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSVL
: . :::::::::.::::: .:::::::.::::.::.:::.:::.:::.::::::::
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pF1KB4 AFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGHE
:::::::::.::.:.:::::::: ::.:::::::::::::::::.::::.::::::::::
XP_011 AFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTENPTAHSNLYILAGHE
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pF1KB4 NSY
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XP_011 NSY
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Smith-Waterman score: 3918; 66.0% identity (82.1% similar) in 900 aa overlap (1-894:5-846)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFA
. :. :. :::::.:.::.::.::::::::::::::.::::::.:.::::::.::.
NP_006 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDDFS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 VVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
..::::.:.:.::: :::::::::: :.:::::::.::::::::::::::::::::::::
NP_006 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
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pF1KB4 SRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPY
::::::: :::.:::::::::::::::::.: ::::::::.:.::::::::::::::::
NP_006 CRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGTPY
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180 190 200 210 220 230
pF1KB4 WMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKL
::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
NP_006 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB4 KDKMKWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQH-LTRSLAIELLDKVNNPD-H
::: :::..::.:::.:::::::::::::.:: : ::.: :.:.::.:::::::::: :
NP_006 KDKTKWSSTFHNFVKIALTKNPKKRPTAERLLTHTFVAQPGLSRALAVELLDKVNNPDNH
250 260 270 280 290 300
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pF1KB4 STYHDFDDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPD
. : . :::: :: . . : :.::.::.: :.: :::.: ...:.:::::::: . :.
NP_006 AHYTEADDDDFEPHAIIRHTIRSTNRNARAERTASEINFDKLQFEPPLRKETEARDEM--
310 320 330 340 350
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pF1KB4 SDGFLDSSEEIYYTARSNLDLQLEYGQGHQGGYFLGANKSLLKSVEEELHQRGHVAHLED
:. ::. :. :: . . :::
NP_006 --GL--SSDP-------NFMLQ-------WNPFVDGAN----------------------
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pF1KB4 DEGDDDESKHSTLKAKIPPPLPPKPKSIFIPQEMHSTEDENQGTIKRCPMSGSPAKPSQV
. .:: : :::::::::. :.. . ..:. .:::.:: : .. :.
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pF1KB4 PPRPPPPRLPP-HKPVALGNGMSSFQLNGERDGSLCQQQNEHRGTNLSRKEKKDVPKPIS
: : : . ..::: . .: .: . : . : .:.:.: :::
NP_006 LRRQSSPSCGPVAETSSIGNGDGISKLMSENTEGSAQAPQLPR-----KKDKRDFPKPAI
430 440 450 460 470 480
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pF1KB4 NGLPPTPKVHMGACFSKVFNGCPLKIHCASSWINPDTRDQYLIFGAEEGIYTLNLNELHE
::::::::: :::::::::.::::::.::.:::.:::.:::.:::.:.::::::::::::
NP_006 NGLPPTPKVLMGACFSKVFDGCPLKINCATSWIHPDTKDQYIIFGTEDGIYTLNLNELHE
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pF1KB4 TSMEQLFPRRCTWLYVMNNCLLSIS-GKASQLYSHNLPGLFDYARQMQKLPVAIPAHKLP
..:::::::.::::::.:: :.:.: ::. ::::::: .::..:.. : . : .:..:
NP_006 ATMEQLFPRKCTWLYVINNTLMSLSEGKTFQLYSHNLIALFEHAKK-PGLAAHIQTHRFP
550 560 570 580 590 600
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pF1KB4 DRILPRKFSVSAKIPETKWCQKCCVVRNPYTGHKYLCGALQTSIVLLEWVEPMQKFMLIK
::::::::....:::.:: :.:::.::::::::::::::::..::::.: ::::::::::
NP_006 DRILPRKFALTTKIPDTKGCHKCCIVRNPYTGHKYLCGALQSGIVLLQWYEPMQKFMLIK
610 620 630 640 650 660
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pF1KB4 HIDFPIPCPLRMFEMLVVPEQEYPLVCVGVSRGRDFNQVVRFETVNPNSTSSWFTE--SD
:.:::.: :: .:::::.::::::.:::..:.: . ::::.:::.: ::.:::::: .
NP_006 HFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAG
670 680 690 700 710 720
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pF1KB4 TPQTNVTHVTQLERDTILVCLDCCIKIVNLQGRLKSSRKLSSELTFDFQIESIVCLQDSV
. : . :::::::::.::::: .:::::::.::::.::.:::.:::.:::.:::::::
NP_006 SQQLDSIHVTQLERDTVLVCLDKFVKIVNLQGKLKSSKKLASELSFDFRIESVVCLQDSV
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pF1KB4 LAFWKHGMQGRSFRSNEVTQEISDSTRIFRLLGSDRVVVLESRPTDNPTANSNLYILAGH
::::::::::.::.:.:::::::: ::.:::::::::::::::::.::::.:::::::::
NP_006 LAFWKHGMQGKSFKSDEVTQEISDETRVFRLLGSDRVVVLESRPTENPTAHSNLYILAGH
790 800 810 820 830 840
pF1KB4 ENSY
::::
NP_006 ENSY
>>XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-activat (846 aa)
initn: 3870 init1: 1620 opt: 1902 Z-score: 823.8 bits: 163.5 E(85289): 3.8e-39
Smith-Waterman score: 3918; 66.0% identity (82.1% similar) in 900 aa overlap (1-894:5-846)
10 20 30 40 50
pF1KB4 MNPGFDLSRRNPQEDFELIQRIGSGTYGDVYKARNVNTGELAAIKVIKLEPGEDFA
. :. :. :::::.:.::.::.::::::::::::::.::::::.:.::::::.::.
XP_006 MEAPLRPAADILRRNPQQDYELVQRVGSGTYGDVYKARNVHTGELAAVKIIKLEPGDDFS
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB4 VVQQEIIMMKDCKHPNIVAYFGSYLRRDKLWICMEFCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
..::::.:.:.::: :::::::::: :.:::::::.::::::::::::::::::::::::
XP_006 LIQQEIFMVKECKHCNIVAYFGSYLSREKLWICMEYCGGGSLQDIYHVTGPLSELQIAYV
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB4 SRETLQGLYYLHSKGKMHRDIKGANILLTDNGHVKLADFGVSAQITATIAKRKSFIGTPY
::::::: :::.:::::::::::::::::.: ::::::::.:.::::::::::::::::
XP_006 CRETLQGLAYLHTKGKMHRDIKGANILLTDHGDVKLADFGVAAKITATIAKRKSFIGTPY
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB4 WMAPEVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKL
::::::::::..::::::::.::::::::::.::::::::::::::::::.:::::::::
XP_006 WMAPEVAAVEKNGGYNQLCDIWAVGITAIELGELQPPMFDLHPMRALFLMSKSNFQPPKL
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
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XP_006 ENSY
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NP_942 HFDFPLPSPLNVFEMLVIPEQEYPMVCVAISKGTESNQVVQFETINLNSASSWFTEIGAG
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pF1KB4 ENSY
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NP_942 ENSY
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pF1KB4 EVAAVERKGGYNQLCDLWAVGITAIELAELQPPMFDLHPMRALFLMTKSNFQPPKLKDKM
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XP_011 EVAAVERKGGYNELCDVWALGITAIELGELQPPLFHLHPMRALMLMSKSSFQPPKLRDKT
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pF1KB4 KWSNSFHHFVKMALTKNPKKRPTAEKLLQHPFVTQHLTRSLAIELLDKVNNPDHSTYHDF
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XP_011 RWTQNFHHFLKLALTKNPKKRPTAEKLLQHPFTTQQLPRALLTQLLDKASDP-HLGTPSP
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pF1KB4 DDDDPEPLVAVPHRIHSTSRNVREEKTRSEITFGQVKFDPPLRKETEPHHELPDSDGFLD
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XP_011 EDCELETYDMFPDTIHSRGQHGPAERTPSEIQFHQVKFGAPRRKETDPLNEPWEEEWTLL
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XP_011 SHGMQGRSLDTNEVTQEITDETRIFRVLGAHRDIILESIPTDNPEAHSNLYILTGHQSTY
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]