Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3903
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3903, 766 aa
1>>>pF1KB3903 766 - 766 aa - 766 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.4920+/-0.00106; mu= -1.9477+/- 0.064
mean_var=310.4970+/-65.594, 0's: 0 Z-trim(113.9): 621 B-trim: 48 in 1/52
Lambda= 0.072786
statistics sampled from 13841 (14530) to 13841 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.747), E-opt: 0.2 (0.446), width: 16
Scan time: 3.990
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 766) 5066 546.0 8.2e-155
CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 ( 783) 3009 330.0 8.8e-90
CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 740) 2552 282.0 2.4e-75
CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 729) 2485 275.0 3.1e-73
CCDS55895.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 433) 1762 198.9 1.5e-50
CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 ( 422) 1695 191.8 1.9e-48
CCDS14557.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 360) 1448 165.8 1.1e-40
CCDS14558.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 365) 1446 165.6 1.3e-40
CCDS83483.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX ( 366) 1446 165.6 1.3e-40
CCDS43064.1 DCLK3 gene_id:85443|Hs108|chr3 ( 648) 1043 123.5 1.1e-27
CCDS2582.1 CAMK1 gene_id:8536|Hs108|chr3 ( 370) 871 105.3 1.9e-22
CCDS35503.2 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 426) 836 101.6 2.7e-21
CCDS7091.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 385) 828 100.8 4.5e-21
CCDS7092.1 CAMK1D gene_id:57118|Hs108|chr10 ( 357) 824 100.3 5.7e-21
CCDS48189.1 PNCK gene_id:139728|Hs108|chrX ( 360) 823 100.2 6.1e-21
CCDS1486.1 CAMK1G gene_id:57172|Hs108|chr1 ( 476) 803 98.2 3.2e-20
CCDS4103.1 CAMK4 gene_id:814|Hs108|chr5 ( 473) 761 93.8 6.9e-19
CCDS43386.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 478) 752 92.9 1.3e-18
CCDS73153.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 539) 752 92.9 1.5e-18
CCDS7338.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 556) 752 92.9 1.5e-18
CCDS5485.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 518) 750 92.7 1.6e-18
CCDS7337.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 527) 750 92.7 1.7e-18
CCDS43387.1 CAMK2A gene_id:815|Hs108|chr5 ( 489) 745 92.1 2.3e-18
CCDS5484.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 542) 742 91.8 3e-18
CCDS7336.1 CAMK2G gene_id:818|Hs108|chr10 ( 495) 741 91.7 3.1e-18
CCDS5483.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 666) 742 91.9 3.6e-18
CCDS43573.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 517) 738 91.4 3.9e-18
CCDS82776.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 470) 735 91.1 4.5e-18
CCDS5489.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 449) 734 90.9 4.7e-18
CCDS5488.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 479) 734 91.0 5e-18
CCDS5487.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 492) 734 91.0 5.1e-18
CCDS5486.1 CAMK2B gene_id:816|Hs108|chr7 ( 503) 734 91.0 5.1e-18
CCDS82948.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 512) 734 91.0 5.2e-18
CCDS82949.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 533) 734 91.0 5.4e-18
CCDS43263.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 724 89.9 1e-17
CCDS3704.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 478) 724 89.9 1e-17
CCDS54797.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 489) 724 89.9 1e-17
CCDS47127.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 492) 724 89.9 1e-17
CCDS82950.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 498) 724 89.9 1.1e-17
CCDS3703.1 CAMK2D gene_id:817|Hs108|chr4 ( 499) 724 89.9 1.1e-17
CCDS33762.1 CAMKV gene_id:79012|Hs108|chr3 ( 501) 717 89.2 1.8e-17
CCDS6240.1 PSKH2 gene_id:85481|Hs108|chr8 ( 385) 696 86.9 6.7e-17
CCDS10851.1 PSKH1 gene_id:5681|Hs108|chr16 ( 424) 693 86.6 8.9e-17
CCDS14197.1 RPS6KA3 gene_id:6197|Hs108|chrX ( 740) 668 84.2 8.4e-16
CCDS14451.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 662 83.6 1.3e-15
CCDS83480.1 RPS6KA6 gene_id:27330|Hs108|chrX ( 745) 662 83.6 1.3e-15
CCDS54002.1 PHKG2 gene_id:5261|Hs108|chr16 ( 374) 650 82.1 1.9e-15
CCDS10690.1 PHKG2 gene_id:5261|Hs108|chr16 ( 406) 650 82.1 2e-15
CCDS83147.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 644) 651 82.3 2.6e-15
CCDS5294.1 RPS6KA2 gene_id:6196|Hs108|chr6 ( 733) 651 82.4 2.9e-15
>>CCDS34076.1 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 (766 aa)
initn: 5066 init1: 5066 opt: 5066 Z-score: 2892.8 bits: 546.0 E(32554): 8.2e-155
Smith-Waterman score: 5066; 99.9% identity (99.9% similar) in 766 aa overlap (1-766:1-766)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLDSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYSRSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYSRSSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VKYSGSKSPGPSRRSKSPASVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRGLKQISAHGRS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 VKYSGSKSPGPSRRSKSPASVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRGLKQISAHGRS
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAVVKECIDRSTGKEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 SSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAVVKECIDRSTGKEF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELFLVMELVKGGDLFDA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELFLVMELVKGGDLFDA
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 ITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEYPDGTKSLKLGDFGL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEYPDGTKSLKLGDFGL
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRSENNLQED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 ATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCGFPPFRSENNLQED
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 LFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQILSHPWVSDDASQENN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 LFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQILSHPWVSDDASQENN
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 MQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKHCQDSGRPGMEPISP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS34 MQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKHCQDSGRPGMEPISP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760
pF1KB3 VPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRRHRD
::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::
CCDS34 VPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHPPPAAPGGERAGTWRRHRD
730 740 750 760
>>CCDS47142.2 DCLK2 gene_id:166614|Hs108|chr4 (783 aa)
initn: 2990 init1: 2990 opt: 3009 Z-score: 1725.3 bits: 330.0 E(32554): 8.8e-90
Smith-Waterman score: 5022; 97.7% identity (97.7% similar) in 783 aa overlap (1-766:1-783)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAAA
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 SSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLDSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIKLDSG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYSRSSA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 VVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYSRSSA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340
pF1KB3 VKYSGSKSPGPSRRSKSPASV-----------------NGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPT
::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::::::::
CCDS47 VKYSGSKSPGPSRRSKSPASVKRGGHYSSAYSTAKSPVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPT
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 SPGSFRGLKQISAHGRSSSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 SPGSFRGLKQISAHGRSSSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDG
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 NFAVVKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 NFAVVKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETAT
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 ELFLVMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 ELFLVMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLV
490 500 510 520 530 540
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 CEYPDGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 CEYPDGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYI
550 560 570 580 590 600
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 LLCGFPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 LLCGFPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAG
610 620 630 640 650 660
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 QILSHPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS47 QILSHPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFC
670 680 690 700 710 720
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 SKHCQDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRR
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :::::::::::::::
CCDS47 SKHCQDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHPPPAAPGGERAGTWRR
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 HRD
:::
CCDS47 HRD
>>CCDS81762.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (740 aa)
initn: 2255 init1: 1497 opt: 2552 Z-score: 1466.3 bits: 282.0 E(32554): 2.4e-75
Smith-Waterman score: 3261; 67.9% identity (84.7% similar) in 757 aa overlap (1-741:1-739)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
:. :..:::::.:::: : : : . ::: :::.:::::::::::
CCDS81 MSFGRDMELEHFDERDKAQR--------------YSRGSRVNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
:::.:::::::::.::::::::::::.:.::: ::::::.::: .:::.:::::::::::
CCDS81 TLQTLSSEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGT-SRA---
:::::::: .:..:::.:.:::::::.: :::.:..::::.:::::::.: . :::
CCDS81 RTIYTIDGLKKISSLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LAAASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
::.:.. :::.:.::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS81 LATAKGSPSEVRENKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIK
170 180 190 200 210 220
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKS-SY
::::::::: ::::::: ::::::::::.::::::::::: ::::.::.:::::.:: ::
CCDS81 LDSGVVKRLYTLDGKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVKSTSY
230 240 250 260 270 280
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SR-SSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPAS---VNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRGL
.. .:. . : .:::::::::::::: :::::.::::::.: :: : :::::::.:
CCDS81 TKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQ
290 300 310 320 330 340
360 370 380 390 400
pF1KB3 KQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAV
.. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.::.:..::::::::
CCDS81 RS-SQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 VKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELFL
::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::..:.:::.. :::.:
CCDS81 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 VMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEYP
::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.::::::::::::: :.
CCDS81 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 DGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS81 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
530 540 550 560 570 580
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 FPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQILS
:::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..:: :.:. : .: :.:
CCDS81 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
590 600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 HPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKHC
::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..::::: .:::::: :.: ..
CCDS81 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVIATTALDKERQVFRRRRN
650 660 670 680 690 700
710 720 730 740 750 760
pF1KB3 QD-SGRPGMEPISPVPPSVEE--IPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRRH
:: .: .: : : : : .:.: .:. :
CCDS81 QDVRSRYKAQPAPPELNSESEDYSPSSSETVRSPNSPF
710 720 730 740
pF1KB3 RD
>>CCDS9354.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (729 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
:. :..:::::.:::: : : : . ::: :::.:::::::::::
CCDS93 MSFGRDMELEHFDERDKAQR--------------YSRGSRVNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
10 20 30 40
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
:::.:::::::::.::::::::::::.:.::: ::::::.::: .:::.:::::::::::
CCDS93 TLQTLSSEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAISPDRFRSFEALLADLTRTLSDNVNLPQGV
50 60 70 80 90 100
130 140 150 160 170
pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGT-SRA---
:::::::: .:..:::.:.:::::::.: :::.:..::::.:::::::.: . :::
CCDS93 RTIYTIDGLKKISSLDQLVEGESYVCGSIEPFKKLEYTKNVNPNWSVNVKTTSASRAVSS
110 120 130 140 150 160
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LAAASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
::.:.. :::.:.::::.:::::.:::::::::::::::::::::::::::::::.:::
CCDS93 LATAKGSPSEVRENKDFIRPKLVTIIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITDAIK
170 180 190 200 210 220
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pF1KB3 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKS-SY
::::::::: ::::::: ::::::::::.::::::::::: ::::.::.:::::.:: ::
CCDS93 LDSGVVKRLYTLDGKQVMCLQDFFGDDDIFIACGPEKFRY-QDDFLLDESECRVVKSTSY
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pF1KB3 SR-SSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPAS---VNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRGL
.. .:. . : .:::::::::::::: :::::.::::::.: :: : :::::::.:
CCDS93 TKIASSSRRSTTKSPGPSRRSKSPASTSSVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRKQ
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pF1KB3 KQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAV
.. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.::.:..::::::::
CCDS93 RS-SQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFAV
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 VKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELFL
::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::..:.:::.. :::.:
CCDS93 VKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELYL
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 VMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEYP
::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.::::::::::::: :.
CCDS93 VMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEHQ
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 DGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
::.::::::::::::.:.::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS93 DGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLCG
530 540 550 560 570 580
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pF1KB3 FPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQILS
:::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..:: :.:. : .: :.:
CCDS93 FPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVLE
590 600 610 620 630 640
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pF1KB3 HPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKHC
::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..::::: :::. : :
CCDS93 HPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVI---ALDHGFTIKRSGSL
650 660 670 680 690
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pF1KB3 QDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRRHRD
. .::: : :
CCDS93 DYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
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pF1KB3 LKSSYSRSSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPASVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRG
:::::.::::::.: :: : :::::::.:
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pF1KB3 LKQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFA
.. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.::.:..:::::::
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pF1KB3 VVKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELF
:::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::..:.:::.. :::.
CCDS55 VVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELY
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pF1KB3 LVMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEY
:::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.::::::::::::: :.
CCDS55 LVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEH
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530 540 550 560 570 580
pF1KB3 PDGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLC
::.::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLC
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pF1KB3 GFPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQIL
::::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..:: :.:. : .: :.:
CCDS55 GFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVL
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pF1KB3 SHPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKH
::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..::::: .:::::: :.: ..
CCDS55 EHPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVIATTALDKERQVFRRRR
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pF1KB3 CQD-SGRPGMEPISPVPPSVEE--IPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRR
:: .: .: : : : : .:.: .:. :
CCDS55 NQDVRSRYKAQPAPPELNSESEDYSPSSSETVRSPNSPF
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pF1KB3 HRD
>>CCDS73561.1 DCLK1 gene_id:9201|Hs108|chr13 (422 aa)
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pF1KB3 LKSSYSRSSAVKYSGSKSPGPSRRSKSPASVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFRG
:::::.::::::.: :: : :::::::.:
CCDS73 MLELIEVNGTPGSQLSTPRSGKSPSPSPTSPGSLRK
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360 370 380 390 400
pF1KB3 LKQISAHGRSSSNVNGGP---ELDRCISP-EGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFA
.. : :: ::... . .:. .: : :. . . .:. :.::.:..:::::::
CCDS73 QRS-SQHGGSSTSLASTKVCSSMDENDGPGEEVSEEGFQIPATITERYKVGRTIGDGNFA
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pF1KB3 VVKECIDRSTGKEFALKIIDKAKCCGKEHLIENEVSILRRVKHPNIIMLVEEMETATELF
:::::..:::..:.::::: :.:: ::::.:.::::::::::::::..:.:::.. :::.
CCDS73 VVKECVERSTAREYALKIIKKSKCRGKEHMIQNEVSILRRVKHPNIVLLIEEMDVPTELY
100 110 120 130 140 150
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 LVMELVKGGDLFDAITSSTKYTERDGSAMVYNLANALRYLHGLSIVHRDIKPENLLVCEY
:::::::::::::::::..::::::.:.:.::::.:..:::.:.::::::::::::: :.
CCDS73 LVMELVKGGDLFDAITSTNKYTERDASGMLYNLASAIKYLHSLNIVHRDIKPENLLVYEH
160 170 180 190 200 210
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 PDGTKSLKLGDFGLATVVEGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLC
::.::::::::::::.:.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS73 QDGSKSLKLGDFGLATIVDGPLYTVCGTPTYVAPEIIAETGYGLKVDIWAAGVITYILLC
220 230 240 250 260 270
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 GFPPFRSENNLQEDLFDQILAGKLEFPAPYWDNITDSAKELISQMLQVNVEARCTAGQIL
::::::. .. :: :::::: :...::.:::::..:::::::..:: :.:. : .: :.:
CCDS73 GFPPFRGSGDDQEVLFDQILMGQVDFPSPYWDNVSDSAKELITMMLLVDVDQRFSAVQVL
280 290 300 310 320 330
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 SHPWVSDDASQENNMQAEVTGKLKQHFNNALPKQNSTTTGVSVIMNTALDKEGQIFCSKH
::::.::. ::. : :.::.:.:::.. :: :::..::::: :::. : :
CCDS73 EHPWVNDDGLPENEHQLSVAGKIKKHFNTG-PKPNSTAAGVSVI---ALDHGFTIKRSGS
340 350 360 370 380 390
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pF1KB3 CQDSGRPGMEPISPVPPSVEEIPVPGEAVPAPTPPESPTPHCPPAAPGGERAGTWRRHRD
. .::: : :
CCDS73 LDYYQQPGMYWIRPPLLIRRGRFSDEDATRM
400 410 420
>>CCDS14557.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX (360 aa)
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pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
... ::.:::: : . ::. . ::: :::.:::::::::::
CCDS14 MELDFGHFDERDKTSR--NMRGS------------RMNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
10 20 30 40
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pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
::::::.::::::.::::::::::::.:.:.:::::::::::: .::::::::.::::::
CCDS14 TLQALSNEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGV
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pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAA-
: :::::::::. :.::: :::::::.:.. :.::.::::.:::::::.: :: . :
CCDS14 RYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVK--TSANMKAP
110 120 130 140 150
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 ---ASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
::: .....:.:::..:::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYS
:..::::.: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::: ::..::::.:.. :
CCDS14 LETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPS
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 RSSAVKYS------GSKSPGPSRRSKSPA-SVNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTSPGSFR
... : : ..::::: ::::::: :.::: ::::::::: .: :.::::::.:
CCDS14 ATAGPKASPTPQKTSAKSPGPMRRSKSPADSANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTSPGSLR
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 GLKQISAHGRSSSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGNFAVVK
:..
CCDS14 KHKDLYLPLSLDDSDSLGDSM
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pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
... ::.:::: : . ::. . ::: :::.:::::::::::
CCDS14 MELDFGHFDERDKTSR--NMRGS------------RMNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
10 20 30 40
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pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
::::::.::::::.::::::::::::.:.:.:::::::::::: .::::::::.::::::
CCDS14 TLQALSNEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGV
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pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAA-
: :::::::::. :.::: :::::::.:.. :.::.::::.:::::::.: :: . :
CCDS14 RYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVK--TSANMKAP
110 120 130 140 150
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pF1KB3 ---ASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
::: .....:.:::..:::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS14 QSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYS
:..::::.: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::: ::..::::.:.. :
CCDS14 LETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPS
220 230 240 250 260 270
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pF1KB3 RSSAVKYS------GSKSPGPSRRSKSPAS------VNGTPSSQLSTPKSTKSSSSSPTS
... : : ..::::: :::::::. .::: ::::::::: .: :.:::
CCDS14 ATAGPKASPTPQKTSAKSPGPMRRSKSPADSGNDQDANGTSSSQLSTPKSKQSPISTPTS
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 PGSFRGLKQISAHGRSSSNVNGGPELDRCISPEGVNGNRCSESSTLLEKYKIGKVIGDGN
:::.: :..
CCDS14 PGSLRKHKDLYLPLSLDDSDSLGDSM
340 350 360
>>CCDS83483.1 DCX gene_id:1641|Hs108|chrX (366 aa)
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pF1KB3 MASTRSIELEHFEERDKRPRPGSRRGAPSSSGGSSSSGPKGNGLIPSPAHSAHCSFYRTR
... ::.:::: : . ::. . ::: :::.:::::::::::
CCDS83 MELDFGHFDERDKTSR--NMRGS------------RMNGL-PSPTHSAHCSFYRTR
10 20 30 40
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pF1KB3 TLQALSSEKKAKKARFYRNGDRYFKGLVFAISSDRFRSFDALLIELTRSLSDNVNLPQGV
::::::.::::::.::::::::::::.:.:.:::::::::::: .::::::::.::::::
CCDS83 TLQALSNEKKAKKVRFYRNGDRYFKGIVYAVSSDRFRSFDALLADLTRSLSDNINLPQGV
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pF1KB3 RTIYTIDGSRKVTSLDELLEGESYVCASNEPFRKVDYTKNINPNWSVNIKGGTSRALAA-
: :::::::::. :.::: :::::::.:.. :.::.::::.:::::::.: :: . :
CCDS83 RYIYTIDGSRKIGSMDELEEGESYVCSSDNFFKKVEYTKNVNPNWSVNVK--TSANMKAP
110 120 130 140 150
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pF1KB3 ---ASSVKSEVKESKDFIKPKLVTVIRSGVKPRKAVRILLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
::: .....:.:::..:::::.::::::::::::.::::::::::::::::::::::
CCDS83 QSLASSNSAQARENKDFVRPKLVTIIRSGVKPRKAVRVLLNKKTAHSFEQVLTDITEAIK
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 LDSGVVKRLCTLDGKQVTCLQDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFVLDHSECRVLKSSYS
:..::::.: ::::::::::.:::::::::::::::::::::::: ::..::::.:.. :
CCDS83 LETGVVKKLYTLDGKQVTCLHDFFGDDDVFIACGPEKFRYAQDDFSLDENECRVMKGNPS
220 230 240 250 260 270
300 310 320 330 340
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