FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3867, 354 aa
1>>>pF1KB3867 354 - 354 aa - 354 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.1403+/-0.0011; mu= 16.9603+/- 0.066
mean_var=69.3559+/-13.575, 0's: 0 Z-trim(102.5): 54 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.154004
statistics sampled from 6933 (6984) to 6933 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.567), E-opt: 0.2 (0.215), width: 16
Scan time: 2.540
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 2331 527.4 6.9e-150
CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 ( 354) 2203 499.0 2.5e-141
CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 354) 1691 385.2 4.4e-107
CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 ( 354) 1667 379.9 1.8e-105
CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 355) 1646 375.2 4.5e-104
CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 ( 354) 1470 336.1 2.7e-92
CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 318) 1468 335.6 3.3e-92
CCDS63642.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 339) 1468 335.7 3.5e-92
CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 ( 354) 1454 332.6 3.1e-91
CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 ( 350) 1445 330.6 1.2e-90
CCDS59061.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 ( 302) 1430 327.2 1.1e-89
CCDS63644.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 ( 303) 1389 318.1 6.2e-87
CCDS13804.1 GNAZ gene_id:2781|Hs108|chr22 ( 355) 1389 318.1 7e-87
CCDS6657.1 GNA14 gene_id:9630|Hs108|chr9 ( 355) 1142 263.2 2.3e-70
CCDS6658.1 GNAQ gene_id:2776|Hs108|chr9 ( 359) 1116 257.5 1.3e-68
CCDS12103.1 GNA11 gene_id:2767|Hs108|chr19 ( 359) 1101 254.1 1.3e-67
CCDS11661.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 377) 947 219.9 2.7e-57
CCDS5335.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 381) 933 216.8 2.3e-56
CCDS12104.1 GNA15 gene_id:2769|Hs108|chr19 ( 374) 843 196.8 2.4e-50
CCDS11852.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 381) 837 195.5 6.2e-50
CCDS46624.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 380) 834 194.8 9.8e-50
CCDS42892.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 379) 832 194.4 1.3e-49
CCDS11851.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 458) 826 193.1 3.9e-49
CCDS64584.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 322) 763 179.0 4.8e-45
CCDS62302.1 GNA13 gene_id:10672|Hs108|chr17 ( 282) 722 169.9 2.4e-42
CCDS13472.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 394) 659 156.0 5.1e-38
CCDS46622.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 (1037) 659 156.3 1.1e-37
CCDS46623.1 GNAS gene_id:2778|Hs108|chr20 ( 395) 652 154.4 1.5e-37
CCDS64583.1 GNA12 gene_id:2768|Hs108|chr7 ( 305) 648 153.4 2.3e-37
CCDS58614.1 GNAL gene_id:2774|Hs108|chr18 ( 174) 369 91.3 6.6e-19
>>CCDS10756.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 2331 init1: 2331 opt: 2331 Z-score: 2804.4 bits: 527.4 E(32554): 6.9e-150
Smith-Waterman score: 2331; 100.0% identity (100.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
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CCDS10 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
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CCDS10 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB3 AAYIQAQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 AAYIQAQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
310 320 330 340 350
>>CCDS10757.1 GNAO1 gene_id:2775|Hs108|chr16 (354 aa)
initn: 2203 init1: 2203 opt: 2203 Z-score: 2650.7 bits: 499.0 E(32554): 2.5e-141
Smith-Waterman score: 2203; 94.4% identity (98.0% similar) in 354 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS10 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
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CCDS10 TNRMHESLKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDIFEEKIKKSPLTICFPEYTGPSAFTEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB3 AAYIQAQFESKNRSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
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CCDS10 VAYIQAQYESKNKSAHKEIYTHVTCATDTNNIQFVFDAVTDVIIAKNLRGCGLY
310 320 330 340 350
>>CCDS5595.1 GNAI1 gene_id:2770|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1520 init1: 1037 opt: 1691 Z-score: 2035.9 bits: 385.2 E(32554): 4.4e-107
Smith-Waterman score: 1691; 72.8% identity (86.8% similar) in 356 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
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CCDS55 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEAG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
.: :. :::: :::::::::. ::.::: : :..::. : ::... ... : : :
CCDS55 YSEEECKQYKAVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGDSARADDARQLFVLAGAAE--EGF
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 -SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTR
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CCDS55 MTAELAGVIKRLWKDSGVQACFNRSREYQLNDSAAYYLNDLDRIAQPNYIPTQQDVLRTR
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 VKTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDE
::::::::::::::.:::..:::::::::::::::::: ::::::::::: :: :: :::
CCDS55 VKTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 TTNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYED
::::::. :::::::::.: :::::::::::::: :::::::::::.:::.: ::::.
CCDS55 EMNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKIKKSPLTICYPEYAGSNTYEE
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 AAAYIQAQFESKN-RSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
:::::: :::. : :. .:::: :.::::::.:.: :::::::.:: :::. :::.
CCDS55 AAAYIQCQFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS802.1 GNAI3 gene_id:2773|Hs108|chr1 (354 aa)
initn: 1014 init1: 1014 opt: 1667 Z-score: 2007.1 bits: 379.9 E(32554): 1.8e-105
Smith-Waterman score: 1667; 71.3% identity (87.0% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
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CCDS80 MGCTLSAEDKAAVERSKMIDRNLREDGEKAAKEVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
.: .. :::: :::::::::. ::.::: : :..:. : ::... ... :. .
CCDS80 YSEDECKQYKVVVYSNTIQSIIAIIRAMGRLKIDFGEAARADDARQLFVLAGSAEEGV-M
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
. :: ... ::: :.:.: ::.:::::::::::.:::..::::. ..: ::.::.:::::
CCDS80 TPELAGVIKRLWRDGGVQACFSRSREYQLNDSASYYLNDLDRISQSNYIPTQQDVLRTRV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
:::::::::::::.:.:..:::::::::::::::::: ::::::::::: :: :: :::
CCDS80 KTTGIVETHFTFKDLYFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSDYDLVLAEDEE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
::::::. :::::::::.: .::::::::::::: ::::.::::::.::::: ::::.:
CCDS80 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTETSIILFLNKKDLFEEKIKRSPLTICYPEYTGSNTYEEA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB3 AAYIQAQFESKNRSPN-KEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
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CCDS80 AAYIQCQFEDLNRRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKECGLY
300 310 320 330 340 350
>>CCDS2813.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (355 aa)
initn: 1641 init1: 1455 opt: 1646 Z-score: 1981.9 bits: 375.2 E(32554): 4.5e-104
Smith-Waterman score: 1646; 69.6% identity (86.2% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-355)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
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CCDS28 MGCTVSAEDKAAAERSKMIDKNLREDGEKAAREVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
.: :. .::. :::::::::. :::.:: .: :...: : ::... . :. .
CCDS28 YSEEECRQYRAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
.: ... :::.: :.: ::.::::::::::: :::..:.::. .:: ::.::.:::::
CCDS28 PDDLSGVIRRLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRV
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
:::::::::::::.:::..:::::::::::::::::: :::::::::::.:: :: :::
CCDS28 KTTGIVETHFTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEE
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
::::::. :::::::::.: :::::::::::::: ::: .:::::::::::: : :..:
CCDS28 MNRMHESMKLFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350
pF1KB3 AAYIQAQFESKN-RSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
:.:::..::. : :. .:::: :.::::::.:.: :::::::.:: :::. :::.
CCDS28 ASYIQSKFEDLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
310 320 330 340 350
>>CCDS47625.1 GNAT3 gene_id:346562|Hs108|chr7 (354 aa)
initn: 1289 init1: 919 opt: 1470 Z-score: 1770.5 bits: 336.1 E(32554): 2.7e-92
Smith-Waterman score: 1470; 62.0% identity (82.8% similar) in 355 aa overlap (1-354:1-354)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MGCTLSAEERAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDG
:: .:.: . . .::: .::.:.::. :. ::::::::::::::::::::::::..:
CCDS47 MGSGISSESKESAKRSKELEKKLQEDAERDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHKNG
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 FSGEDVKQYKPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPF
.: .. ..: :.::::.::. :::.:: ::::.: . . : ... ... .:: .
CCDS47 YSEQECMEFKAVIYSNTLQSILAIVKAMTTLGIDYVNPRSAEDQRQLYAMANTLEDG-GM
70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRV
. .: .. ::: : ::: ::.:. :::::::: :::..:::: :. : :.:::.:..::
CCDS47 TPQLAEVIKRLWRDPGIQACFERASEYQLNDSAAYYLNDLDRITASGYVPNEQDVLHSRV
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 KTTGIVETHFTFKNLHFRLFDVGGQRSERKKWIHCFEDVTAIIFCVALSGYDQVLHEDET
:::::.::.:.::.::::.:::::::::::::::::: :: ::::.:::.::.:: :::
CCDS47 KTTGIIETQFSFKDLHFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDEE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDA
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CCDS47 VNRMHESLHLFNSICNHKYFSTTSIVLFLNKKDIFQEKVTKVHLSICFPEYTGPNTFEDA
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350
pF1KB3 AAYIQAQFESKN-RSPNKEIYCHMTCATDTNNIQVVFDAVTDIIIANNLRGCGLY
. ::. :: . : .. .:::: ::::::::.:.. :::::::::: .::. :::.
CCDS47 GNYIKNQFLDLNLKKEDKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
300 310 320 330 340 350
>>CCDS54587.1 GNAI2 gene_id:2771|Hs108|chr3 (318 aa)
initn: 1463 init1: 1277 opt: 1468 Z-score: 1768.8 bits: 335.6 E(32554): 3.3e-92
Smith-Waterman score: 1468; 69.3% identity (85.4% similar) in 316 aa overlap (40-354:3-318)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 RAALERSKAIEKNLKEDGISAAKDVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGFSGEDVKQY
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CCDS54 MRGAGESGKSTIVKQMKIIHEDGYSEEECRQY
10 20 30
70 80 90 100 110 120
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pF1KB3 KPVVYSNTIQSLAAIVRAMDTLGIEYGDKERKADAKMVCDVVSRMEDTEPFSAELLSAMM
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CCDS63 RAVVYSNTIQSIMAIVKAMGNLQIDFADPSRADDARQLFALSCTAEEQGVLPDDLSGVIR
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pF1KB3 RLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTRVKTTGIVETH
:::.: :.: ::.::::::::::: :::..:.::. .:: ::.::.::::::::::::::
CCDS63 RLWADHGVQACFGRSREYQLNDSAAYYLNDLERIAQSDYIPTQQDVLRTRVKTTGIVETH
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CCDS63 FTFKDLHFKMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTAIIFCVALSAYDLVLAEDEEMNRMHESMK
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pF1KB3 LFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYEDAAAYIQAQFE
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CCDS63 LFDSICNNKWFTDTSIILFLNKKDLFEEKITHSPLTICFPEYTGANKYDEAASYIQSKFE
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CCDS63 DLNKRKDTKEIYTHFTCATDTKNVQFVFDAVTDVIIKNNLKDCGLF
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>>CCDS803.1 GNAT2 gene_id:2780|Hs108|chr1 (354 aa)
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CCDS80 YSPEECLEFKAIIYGNVLQSILAIIRAMTTLGIDYAEPSCADDGRQLNNLADSIEEGTMP
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pF1KB3 FSAELLSAMMRLWGDSGIQECFNRSREYQLNDSAKYYLDSLDRIGAADYQPTEQDILRTR
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CCDS80 VKTTGIIETKFSVKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFCAALSAYDMVLVEDD
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pF1KB3 TTNRMHESLMLFDSICNNKFFIDTSIILFLNKKDLFGEKIKKSPLTICFPEYTGPNTYED
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CCDS80 EVNRMHESLHLFNSICNHKFFAATSIVLFLNKKDLFEEKIKKVHLSICFPEYDGNNSYDD
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CCDS80 AGNYIKSQFLDLNMRKDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
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>>CCDS2812.1 GNAT1 gene_id:2779|Hs108|chr3 (350 aa)
initn: 1295 init1: 892 opt: 1445 Z-score: 1740.6 bits: 330.6 E(32554): 1.2e-90
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10 20 30 40 50 60
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CCDS28 MGAGASAEEK----HSRELEKKLKEDAEKDARTVKLLLLGAGESGKSTIVKQMKIIHQDG
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CCDS28 YSLEECLEFIAIIYGNTLQSILAIVRAMTTLNIQYGDSARQDDARKLMHMADTIEEGTMP
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CCDS28 --KEMSDIIQRLWKDSGIQACFERASEYQLNDSAGYYLSDLERLVTPGYVPTEQDVLRSR
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CCDS28 VKTTGIIETQFSFKDLNFRMFDVGGQRSERKKWIHCFEGVTCIIFIAALSAYDMVLVEDD
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CCDS28 AGNYIKVQFLELNMRRDVKEIYSHMTCATDTQNVKFVFDAVTDIIIKENLKDCGLF
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18511270 residues in 32554 library sequences
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]