Result of FASTA (omim) for
pF1KB3788
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3788, 714 aa
1>>>pF1KB3788 714 - 714 aa - 714 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.0907+/-0.000915; mu= 19.8651+/- 0.057
mean_var=331.6612+/-67.167, 0's: 0 Z-trim(110.3): 2129 B-trim: 92 in 1/49
Lambda= 0.070425
statistics sampled from 16220 (18602) to 16220 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.518), E-opt: 0.2 (0.218), width: 16
Scan time: 7.280
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_066986 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zinc f ( 714) 5074 531.4 4.6e-150
NP_001191385 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zin ( 714) 5074 531.4 4.6e-150
NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 697) 3256 346.7 1.8e-94
NP_008887 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 is ( 659) 2694 289.6 2.7e-77
NP_001305822 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 675) 2106 229.8 2.7e-59
XP_011513163 (OMIM: 602277) PREDICTED: zinc finger ( 675) 2106 229.8 2.7e-59
NP_001305820 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 2095 228.8 6.1e-59
NP_009080 (OMIM: 602277) zinc finger protein 184 i ( 751) 2095 228.8 6.1e-59
NP_001305821 (OMIM: 602277) zinc finger protein 18 ( 751) 2095 228.8 6.1e-59
NP_003421 (OMIM: 603971) zinc finger protein 91 is (1191) 1957 215.2 1.2e-54
NP_001159354 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 864) 1939 213.1 3.8e-54
NP_001159353 (OMIM: 604753) zinc finger protein 26 ( 947) 1939 213.1 4e-54
NP_003406 (OMIM: 604753) zinc finger protein 268 i ( 947) 1939 213.1 4e-54
NP_149350 (OMIM: 616290) zinc finger protein 658 [ (1059) 1876 206.8 3.5e-52
XP_005272572 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1876 206.8 3.5e-52
XP_016870103 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1876 206.8 3.5e-52
NP_001304845 (OMIM: 616290) zinc finger protein 65 (1059) 1876 206.8 3.5e-52
XP_011543981 (OMIM: 616290) PREDICTED: zinc finger (1059) 1876 206.8 3.5e-52
XP_016882746 (OMIM: 603977) PREDICTED: zinc finger (1168) 1835 202.7 6.6e-51
NP_009084 (OMIM: 603977) zinc finger protein 208 i (1280) 1835 202.8 6.8e-51
NP_001269288 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 852) 1783 197.2 2.2e-49
XP_011517301 (OMIM: 603132) PREDICTED: zinc finger ( 575) 1766 195.2 6.3e-49
XP_006717344 (OMIM: 603132) PREDICTED: zinc finger ( 584) 1766 195.2 6.3e-49
XP_011517300 (OMIM: 603132) PREDICTED: zinc finger ( 584) 1766 195.2 6.3e-49
XP_006717343 (OMIM: 603132) PREDICTED: zinc finger ( 584) 1766 195.2 6.3e-49
XP_016870610 (OMIM: 603132) PREDICTED: zinc finger ( 584) 1766 195.2 6.3e-49
NP_932094 (OMIM: 603132) zinc finger protein 189 i ( 584) 1766 195.2 6.3e-49
NP_001265161 (OMIM: 603132) zinc finger protein 18 ( 611) 1766 195.2 6.4e-49
NP_001265160 (OMIM: 603132) zinc finger protein 18 ( 612) 1766 195.2 6.4e-49
NP_003443 (OMIM: 603132) zinc finger protein 189 i ( 626) 1766 195.2 6.5e-49
XP_016865204 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
XP_016865199 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
XP_016865203 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
XP_016865201 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
NP_689496 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ho ( 867) 1765 195.4 8e-49
XP_016865200 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
XP_016865202 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 867) 1765 195.4 8e-49
NP_001166109 (OMIM: 610281) zinc finger protein 62 ( 900) 1765 195.4 8.1e-49
XP_016865206 (OMIM: 610281) PREDICTED: zinc finger ( 900) 1765 195.4 8.1e-49
NP_057304 (OMIM: 603989) zinc finger protein 107 i ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
XP_016867773 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
XP_016867774 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
NP_001013768 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
XP_016867772 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
XP_016867775 (OMIM: 603989) PREDICTED: zinc finger ( 783) 1750 193.8 2.2e-48
NP_001269289 (OMIM: 603989) zinc finger protein 10 ( 820) 1750 193.8 2.3e-48
NP_975011 (OMIM: 604768) zinc finger protein 254 i ( 659) 1715 190.1 2.4e-47
NP_001308574 (OMIM: 194555) zinc finger protein 22 ( 707) 1688 187.4 1.7e-46
XP_016882750 (OMIM: 194555) PREDICTED: zinc finger ( 707) 1688 187.4 1.7e-46
NP_037530 (OMIM: 194555) zinc finger protein 224 [ ( 707) 1688 187.4 1.7e-46
>>NP_066986 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zinc finge (714 aa)
initn: 5074 init1: 5074 opt: 5074 Z-score: 2815.1 bits: 531.4 E(85289): 4.6e-150
Smith-Waterman score: 5074; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_066 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
670 680 690 700 710
>>NP_001191385 (OMIM: 608191) RB-associated KRAB zinc fi (714 aa)
initn: 5074 init1: 5074 opt: 5074 Z-score: 2815.1 bits: 531.4 E(85289): 4.6e-150
Smith-Waterman score: 5074; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710
pF1KB3 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
670 680 690 700 710
>>NP_057349 (OMIM: 194536) zinc finger protein 12 isofor (697 aa)
initn: 4465 init1: 1520 opt: 3256 Z-score: 1816.9 bits: 346.7 E(85289): 1.8e-94
Smith-Waterman score: 3350; 67.4% identity (80.8% similar) in 730 aa overlap (1-714:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
NP_057 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::. :. .
NP_057 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI--ETLIEERGNVPG
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 QIY-METSLVPSSIIAHN---CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK-----
. . .::. ::: ::.. : :: : : :.:. ::::::::: : :::. :::
NP_057 KTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHI
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220
pF1KB3 ----TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRA
:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. :
NP_057 KLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNH---
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 YIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGE
. ::::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::
NP_057 -MEEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 KPYECNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYE
:::::: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: ::::::::::
NP_057 KPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYE
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 CSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNEC
:: :::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.::
NP_057 CSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSEC
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 GKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTF
:: . ::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: :::::::::::::
NP_057 GKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTF
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK-FSQL-YLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNS
::::..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: ::
NP_057 YLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNS
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:. :. . :::: ::: .:::.:...:: : :.: :: :::: :::::::: .::.: :
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:::.::::: :::::::: ::: :::::::::::::::.::..:::.:::::
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710
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::::.:: :
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690
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:: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: :::::::::::: :
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pF1KB3 CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQ
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XP_011 GEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGEKP
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pF1KB3 QLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELSYY
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pF1KB3 GEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
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XP_011 GEKPFGCNDCGKSFRYRSALNKHQRLHPGI
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NP_001 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
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pF1KB3 YSHLVSVGYDTTKPNVIIKLEQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAW--RVDDLIER----IQEN
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NP_001 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCAD-WETRLENSVSAPEPDISEE
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pF1KB3 E-------DKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQIYMETSLVPSSI-IAHNCVSC------
: .::.:. . .. . : :... . . . .:. : .... .
NP_001 ELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPV
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 ----GKNLESISQLISSDGSYARTKPDEC-NECGKTYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENIL
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NP_001 NNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIR
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200 210 220 230 240 250
pF1KB3 -QKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRS
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NP_001 HQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRI
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pF1KB3 QMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEE
. ::..:.::::.: ...... ::: ::::::: :: :::.:::.: . :.. : :
NP_001 HTGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGE
300 310 320 330 340 350
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 KPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYP
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NP_001 KPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYE
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 CNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSEC
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NP_001 CNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNEC
420 430 440 450 460 470
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 GKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK--
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NP_001 GKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAF
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pF1KB3 FSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELS
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NP_001 IRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNI
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pF1KB3 YYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTI
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NP_001 HLTQHKRIHTGAKPYECAECGKAFRHCSSLAQHQKTHTEEKPYQCNKCEKTFSQSSHLTQ
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pF1KB3 HHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVFSQKSYLTVHYRT
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NP_001 HQRIHTGEKPYKCNECDKAFSRSTHLTEHQNTHTGEKPYNCNECRKTFSQSTYLIQHQRI
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:12:33 2016 done: Thu Nov 3 21:12:34 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]