Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3788
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3788, 714 aa
1>>>pF1KB3788 714 - 714 aa - 714 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 7.0906+/-0.00229; mu= 13.4653+/- 0.136
mean_var=290.2956+/-55.285, 0's: 0 Z-trim(103.4): 998 B-trim: 0 in 0/49
Lambda= 0.075276
statistics sampled from 6340 (7417) to 6340 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.526), E-opt: 0.2 (0.228), width: 16
Scan time: 2.630
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 ( 659) 2694 307.9 3.1e-83
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CCDS74736.1 ZNF334 gene_id:55713|Hs108|chr20 ( 679) 2172 251.2 3.7e-66
CCDS53850.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 672) 2110 244.5 3.9e-64
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CCDS46212.1 ZNF814 gene_id:730051|Hs108|chr19 ( 855) 1967 229.1 2.1e-59
CCDS42541.1 ZNF91 gene_id:7644|Hs108|chr19 (1191) 1957 228.3 5.3e-59
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CCDS54314.1 ZNF347 gene_id:84671|Hs108|chr19 ( 840) 1945 226.7 1.1e-58
CCDS45012.1 ZNF268 gene_id:10795|Hs108|chr12 ( 947) 1939 226.2 1.8e-58
CCDS12848.1 ZNF432 gene_id:9668|Hs108|chr19 ( 652) 1926 224.5 4e-58
CCDS74350.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1058) 1923 224.5 6.4e-58
CCDS59379.1 ZNF850 gene_id:342892|Hs108|chr19 (1090) 1923 224.5 6.5e-58
CCDS33090.1 ZNF616 gene_id:90317|Hs108|chr19 ( 781) 1920 224.0 6.8e-58
CCDS82388.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 808) 1919 223.9 7.5e-58
CCDS46161.1 ZNF841 gene_id:284371|Hs108|chr19 ( 924) 1919 224.0 8.1e-58
CCDS46162.1 ZNF836 gene_id:162962|Hs108|chr19 ( 936) 1890 220.8 7.2e-57
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CCDS75846.1 ZNF658 gene_id:26149|Hs108|chr9 (1059) 1876 219.4 2.2e-56
CCDS54240.1 ZNF208 gene_id:7757|Hs108|chr19 (1280) 1835 215.1 5.4e-55
CCDS42537.1 ZNF429 gene_id:353088|Hs108|chr19 ( 674) 1830 214.1 5.5e-55
CCDS31938.1 ZNF605 gene_id:100289635|Hs108|chr12 ( 641) 1827 213.7 6.8e-55
CCDS77773.1 ZNF717 gene_id:100131827|Hs108|chr3 ( 864) 1802 211.2 5.2e-54
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CCDS75605.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 852) 1783 209.2 2.2e-53
CCDS6755.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 584) 1766 207.1 6.3e-53
CCDS65096.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 612) 1766 207.1 6.5e-53
CCDS6754.1 ZNF189 gene_id:7743|Hs108|chr9 ( 626) 1766 207.1 6.6e-53
CCDS47357.2 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 867) 1765 207.2 8.5e-53
CCDS54955.1 ZFP62 gene_id:643836|Hs108|chr5 ( 900) 1765 207.2 8.6e-53
CCDS46167.1 ZNF808 gene_id:388558|Hs108|chr19 ( 903) 1763 207.0 1e-52
CCDS74388.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 748) 1759 206.5 1.2e-52
CCDS12636.1 ZNF227 gene_id:7770|Hs108|chr19 ( 799) 1759 206.5 1.3e-52
CCDS59368.1 ZNF729 gene_id:100287226|Hs108|chr19 (1252) 1754 206.3 2.4e-52
CCDS5527.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 783) 1750 205.5 2.5e-52
CCDS75606.1 ZNF107 gene_id:51427|Hs108|chr7 ( 820) 1750 205.5 2.5e-52
CCDS59372.1 ZNF726 gene_id:730087|Hs108|chr19 ( 616) 1728 203.0 1.1e-51
CCDS54260.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 577) 1727 202.8 1.2e-51
CCDS12508.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 607) 1727 202.8 1.2e-51
CCDS59381.1 ZNF573 gene_id:126231|Hs108|chr19 ( 665) 1727 202.9 1.3e-51
CCDS32983.1 ZNF254 gene_id:9534|Hs108|chr19 ( 659) 1715 201.6 3.1e-51
CCDS42241.1 ZNF594 gene_id:84622|Hs108|chr17 ( 807) 1715 201.7 3.5e-51
CCDS33046.1 ZNF224 gene_id:7767|Hs108|chr19 ( 707) 1688 198.7 2.5e-50
CCDS32973.1 ZNF93 gene_id:81931|Hs108|chr19 ( 620) 1687 198.5 2.5e-50
CCDS7198.1 ZNF33B gene_id:7582|Hs108|chr10 ( 778) 1677 197.6 6e-50
CCDS74387.1 ZNF283 gene_id:284349|Hs108|chr19 ( 540) 1666 196.1 1.1e-49
CCDS32918.1 ZNF443 gene_id:10224|Hs108|chr19 ( 671) 1666 196.3 1.3e-49
>>CCDS5337.1 RBAK gene_id:57786|Hs108|chr7 (714 aa)
initn: 5074 init1: 5074 opt: 5074 Z-score: 3004.3 bits: 566.4 E(32554): 5.1e-161
Smith-Waterman score: 5074; 100.0% identity (100.0% similar) in 714 aa overlap (1-714:1-714)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 IYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGKTYHGEKMCEF
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 NQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGP
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 DFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYECNVCGKSFSQ
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310 320 330 340 350 360
pF1KB3 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 KGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSECGKTFCQKTHL
310 320 330 340 350 360
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pF1KB3 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 TLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSYYRKSTLITHQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 RTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTFNLNSAFIRHRKVHT
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pF1KB3 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 EEKSHECSECGKFSQLYLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNSAFDGHQPLPKGEKSYE
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pF1KB3 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 CNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFRHQRVHTGEKPYECYEC
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610 620 630 640 650 660
pF1KB3 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 GKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRSHSGEKPYECNECGKVF
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670 680 690 700 710
pF1KB3 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS53 SQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRGNMNVLDVENL
670 680 690 700 710
>>CCDS47538.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 (697 aa)
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Smith-Waterman score: 3350; 67.4% identity (80.8% similar) in 730 aa overlap (1-714:1-696)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
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pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::. :. .
CCDS47 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI--ETLIEERGNVPG
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pF1KB3 QIY-METSLVPSSIIAHN---CVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK-----
. . .::. ::: ::.. : :: : : :.:. ::::::::: : :::. :::
CCDS47 KTFDVETNPVPSRKIAYKNSLCDSCEKCLTSVSEYISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHI
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180 190 200 210 220
pF1KB3 ----TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRA
:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. :
CCDS47 KLEKTHPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNH---
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 YIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGE
. ::::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::
CCDS47 -MEEKPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGE
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 KPYECNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYE
:::::: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: ::::::::::
CCDS47 KPYECNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYE
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pF1KB3 CSECGKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNEC
:: :::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.::
CCDS47 CSYCGKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSEC
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 GKSYYRKSTLITHQRTHTGEKPYQCSECGKFFSRVSYLTIHYRSHLEEKPYECNECGKTF
:: . ::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: :::::::::::::
CCDS47 GKCFCRKSTLTTHLRTHTGEKPYECNECGKFFSRLSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKTF
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470 480 490 500 510 520
pF1KB3 NLNSAFIRHRKVHTEEKSHECSECGK-FSQL-YLTDHHTAHLEEKPYECNECGKTFLVNS
::::..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: ::
CCDS47 YLNSALMRHQRVHTGEKPYECNECGKLFSQLSYLTIHHRTHSGVKPYECSECGKTFYQNS
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 AFDGHQPLPKGEKSYECNVCGKLFNELSYYTEHYRSHSEEKPYGCSECGKTFSHNSSLFR
:. :. . :::: ::: .:::.:...:: : :.: :: :::: :::::::: .::.: :
CCDS47 ALCRHRRIHKGEKPYECYICGKFFSQMSYLTIHHRIHSGEKPYECSECGKTFCQNSALNR
540 550 560 570 580 590
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 HQRVHTGEKPYECYECGKFFSQKSYLTIHHRIHSGEKPYECSKCGKVFSRMSNLTVHYRS
:::.::::: :::::::: ::: :::::::::::::::.::..:::.:::::
CCDS47 HQRTHTGEKAYECYECGKCFSQMSYLTIHHRIHSGEKPFECNECGKAFSRMS--------
600 610 620 630 640
650 660 670 680 690 700
pF1KB3 HSGEKPYECNECGKVFSQKSYLTVHYRTHSGEKPYECNECGKKFHHRSAFNSHQRIHRRG
:::::::::::::::::.::::::.:.:::::::::::::
CCDS47 --------------------YLTVHYRTHSGEKPYECTECGKKFYHKSAFNSHQRIHRRG
650 660 670 680
710
pF1KB3 NMNVLDVENL
::::.:: :
CCDS47 NMNVIDVGRLL
690
>>CCDS47539.1 ZNF12 gene_id:7559|Hs108|chr7 (659 aa)
initn: 4465 init1: 1520 opt: 2694 Z-score: 1607.8 bits: 307.9 E(32554): 3.1e-83
Smith-Waterman score: 3216; 65.8% identity (78.0% similar) in 726 aa overlap (1-714:1-658)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MNTLQGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPDEKITYRDVMLENYSHLVSVGYDTTKPNVIIKL
:: ::::::::::::::::::::::..:::::::::::::.:::::: ::.:: ::
CCDS47 MNKSLGPVSFKDVAVDFTQEEWQQLDPEQKITYRDVMLENYSNLVSVGYHIIKPDVISKL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB3 EQGEEPWIMGGEFPCQHSP-EAWRVDDLIERIQENEDKHSRQAACINSKTLTEEKENTFS
::::::::. ::: : : :.:..:::::::::.:.: :::.. : .:: ::.:
CCDS47 EQGEEPWIVEGEFLLQSYPDEVWQTDDLIERIQEEENKPSRQTVFI--ETLIEERE----
70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 QIYMETSLVPSSIIAHNCVSCGKNLESISQLISSDGSYARTKPDECNECGK---------
::::::::: : :::. :::
CCDS47 ------------------------------YISSDGSYARMKADECSGCGKSLLHIKLEK
120 130 140
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 TYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGE
:. :.. ::::::. :. :::.. ::: :::::::: ::..:.....::. : . :
CCDS47 THPGDQAYEFNQNGEPYTLNEESLYQKIRILEKPFEYIECQKAFQKDTVFVNH----MEE
150 160 170 180 190 200
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 KPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRSQMEMKPFECSECGKSFCKKSKFIIHQRAHTGEKPYE
:::.:: : :.:::.....: :.:::::.::::::::::::::::::::.::::::::
CCDS47 KPYKWNGSEIAFLQMSDLTVHQTSHMEMKPYECSECGKSFCKKSKFIIHQRTHTGEKPYE
210 220 230 240 250 260
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 CNVCGKSFSQKGTLTVHRRSHLEEKPYKCNECGKTFCQKLHLTQHLRTHSGEKPYECSEC
:: ::::: ::::::::.:.: ::::.::::::.: ::::: :: :::::::::::: :
CCDS47 CNQCGKSFCQKGTLTVHQRTHTGEKPYECNECGKNFYQKLHLIQHQRTHSGEKPYECSYC
270 280 290 300 310 320
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 GKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSY
::.:::::::: :::.::::::: :..:::.::.::::.:::. ::: :::::.:::: .
CCDS47 GKSFCQKTHLTQHQRTHSGERPYVCHDCGKTFSQKSALNDHQKIHTGVKLYKCSECGKCF
330 340 350 360 370 380
420 430 440 450 460 470
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::::: :: :::::::::.:.::::::::.::::.:::.: ::::::::::::: :::
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:..::..::: :: .::.:::: :::: ::: :: .: :::::.:::::: :::.
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:. . :::: ::: .:::.:...:: : :.: :: :::: :::::::: .::.: ::::.
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::::: :::::::: ::: :::::::::::::::.::..:::.:::::
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. :. :::. :. .. :. : :. :.:: :.:::.:. ..:.: .:::.::
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:..:::: :::: : :: .. :.: :.:::::::..::: : . : . :: : :.::::
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pF1KB3 VENL
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. . . . ::: . ..: :..:.. :..: . : : :: . :: .. :
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. :. :::. :. .. :. : :. :.:: :.:::.:. ..:.: .:::.:::
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CCDS74 ECNQCGKTYRRLWTLTEHQKIHTGEKPYECNKCEKTFRHKSNFLLHQKSHKE
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pF1KB3 ENL
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:: ..:::.: :. :. :.: .:. ...:.: : :.. . .: ..:.
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.:. . ..: .. .:.: . :.:. .:. .. : : :: :. : :.:
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pF1KB3 YHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENILQKISILEKP-FEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGE
. : :.:. . : ::: : : . . :: . ..... .. :.:.. ::
CCDS53 HGGIKYCDCSTC--RKSSNEEPWLTANHITHTGVYLCMECGRFFNKKSQLVIHQRTHTGE
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:::. .. : : : : ....::.. :: :::: :.: .:: .:.::: :::::::
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pF1KB3 GKTFCQKTHLTLHQRNHSGERPYPCNECGKSFSRKSALSDHQRTHTGEKLYKCNECGKSY
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CCDS53 GKAFFWKSQLITHQRTHTGKKPYGCGECQKAFSRNSLLIRHQRIHTGEKPYECNECGEAF
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:: :: :: :::::: :.::.: . : . : : : . :: :::: : .:::::
CCDS53 IRKPQLIKHQITHTGEKNYRCSDCEEAFFKKSELIRHQKIHLGEKPYGCIQCGKTF----
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CCDS53 -F------------------GK-SQL-LT-HHRTHTGEKPYECSECGKAFTQKSSLISHQ
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CCDS53 RTHTGEKPYECSECRKTFSEKSSLIHHQRTHTGEKPFECSECRKAFAWKPQLLRHQRIHT
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CCDS53 GEKPYECSECGKAFVQKVQLIKHQRNHTGEKTYGCSDCAKAFFEKAQLIIHQRIHTGERP
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CCDS53 YKCGECGKSFTRKSHLMRHQRIHTGDKYYGCNECGTTFNRKSQLMIHQRNHII
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pF1KB3 VENL
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CCDS46 MEDLSSPDSTLLQGGHNLLSSASFQEAVTFKDVIVDFTQEEWKQLDPGQRDLFRDVTLEN
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pF1KB3 YSHLVSVGYDTTKPNVIIKLEQGEEPWIMGGEFPCQHSPEAW--RVDDLIER----IQEN
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CCDS46 YTHLVSIGLQVSKPDVISQLEQGTEPWIMEPSIPVGTCAD-WETRLENSVSAPEPDISEE
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pF1KB3 E-------DKHSRQAACINSKTLTEEKENTFSQIYMETSLVPSSI-IAHNCVSC------
: .::.:. . .. . : :... . . . .:. : .... .
CCDS46 ELSPEVIVEKHKRDDSWSSNLLESWEYEGSLERQQANQQTLPKEIKVTEKTIPSWEKGPV
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pF1KB3 ----GKNLESISQLISSDGSYARTKPDEC-NECGKTYHGEKMCEFNQNGDTYSHNEENIL
::... :.:.... : .:. . .. .. . :: :. :. : ..:. :
CCDS46 NNEFGKSVNVSSNLVTQEPSPEETSTKRSIKQNSNPVKKEKSCKCNECGKAFSYCSALIR
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pF1KB3 -QKISILEKPFEYNECMEALDNEAVFIAHKRAYIGEKPYEWNDSGPDFIQMSNFNAYQRS
:. :::.. ::: .:.. .: :.: . :.:::. .. : ::. ... .::
CCDS46 HQRTHTGEKPYKCNECEKAFSRSENLINHQRIHTGDKPYKCDQCGKGFIEGPSLTQHQRI
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. ::..:.::::.: ...... ::: ::::::: :: :::.:::.: . :.. : :
CCDS46 HTGEKPYKCDECGKAFSQRTHLVQHQRIHTGEKPYTCNECGKAFSQRGHFMEHQKIHTGE
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CCDS46 KPFKCDECDKTFTRSTHLTQHQKIHTGEKTYKCNECGKAFNGPSTFIRHHMIHTGEKPYE
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CCDS46 CNECGKAFSQHSNLTQHQKTHTGEKPYDCAECGKSFSYWSSLAQHLKIHTGEKPYKCNEC
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CCDS46 GKAFSYCSSLTQHRRIHTREKPFECSECGKAFSYLSNLNQHQKTHTQEKAYECKECGKAF
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CCDS46 IRSSSLAKHERIHTGEKPYQCHECGKTFSYGSSLIQHRKIHTGERPYKCNECGRAFNQNI
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680 690 700 710
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CCDS46 CEKCGKLFNKKSHLLVHQSSHWRKAI
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CCDS42 LITYLEQGKEPWNMKQHEMVDEPTGICPHFPQDFWPEQSMEDSFQKVLLRKYEKCGHENL
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CCDS42 IIHTGEKPYKCEECGKAFISSSTLNGHKRIHTREKPYKCEECGKAFSQSSTLTRHKRLHT
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]