Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3700
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3700, 640 aa
1>>>pF1KB3700 640 - 640 aa - 640 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.5608+/-0.000914; mu= 17.5499+/- 0.055
mean_var=66.8645+/-13.291, 0's: 0 Z-trim(105.1): 29 B-trim: 0 in 0/50
Lambda= 0.156847
statistics sampled from 8207 (8231) to 8207 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.63), E-opt: 0.2 (0.253), width: 16
Scan time: 3.380
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11 ( 640) 4451 1016.5 0
CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX ( 641) 2066 476.9 3.8e-134
CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 729) 895 211.9 2.5e-54
CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 ( 703) 838 199.0 1.8e-50
CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 ( 739) 825 196.1 1.5e-49
CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 ( 714) 823 195.6 1.9e-49
CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 700) 788 187.7 4.6e-47
CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 690) 746 178.2 3.3e-44
CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 664) 738 176.4 1.1e-43
CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 815) 692 166.0 1.8e-40
CCDS45245.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 ( 821) 692 166.0 1.8e-40
CCDS53478.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 ( 622) 659 158.5 2.6e-38
CCDS12519.1 CAPN12 gene_id:147968|Hs108|chr19 ( 719) 601 145.4 2.6e-34
CCDS46254.1 CAPN14 gene_id:440854|Hs108|chr2 ( 684) 538 131.1 4.8e-30
CCDS46252.1 CAPN13 gene_id:92291|Hs108|chr2 ( 669) 520 127.0 8e-29
CCDS33420.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 517) 490 120.2 7.1e-27
CCDS42838.1 CAPN10 gene_id:11132|Hs108|chr2 ( 672) 490 120.2 8.9e-27
CCDS81431.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 ( 627) 442 109.4 1.6e-23
CCDS10410.1 CAPN15 gene_id:6650|Hs108|chr16 (1086) 300 77.3 1.2e-13
>>CCDS8248.1 CAPN5 gene_id:726|Hs108|chr11 (640 aa)
initn: 4451 init1: 4451 opt: 4451 Z-score: 5438.6 bits: 1016.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4451; 99.8% identity (100.0% similar) in 640 aa overlap (1-640:1-640)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYYKGTPGPAVRWKRPKGICED
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYYKGTPGPAVRWKRPKGICED
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 PRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGI
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 FHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGG
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADM
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 EARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 EWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARLH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 EWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARLH
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 GAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEVKKPEDEVLICIQQRPKRSTRREGKGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEVKKPEDEVLICIQQRPKRSTRREGKGE
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 NLAIGFDIYKVEENRQYRMHSLQHKAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHT
:::::::::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 NLAIGFDIYKVEENRQYRMHSLQHKAASSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHT
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 GEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYV
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 IIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGIFYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLGQVHLKAD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 IIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGIFYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLGQVHLKAD
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640
pF1KB3 PDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTVAVHILSSTSLMAV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS82 PDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTVAVHILSSTSLMAV
610 620 630 640
>>CCDS14555.1 CAPN6 gene_id:827|Hs108|chrX (641 aa)
initn: 2007 init1: 1187 opt: 2066 Z-score: 2521.9 bits: 476.9 E(32554): 3.8e-134
Smith-Waterman score: 2066; 47.0% identity (74.8% similar) in 640 aa overlap (5-637:5-638)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYY-KGTPGPAVRWKRPKGICE
.: ...:.:. :...: . . :: :: : .:::.: . :: .: ::::. ::.
CCDS14 MGPPLKLFKNQKYQELKQECIKDSRLFCDPTFLPENDSLFYNRLLPGKVV-WKRPQDICD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 DPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAG
::.:.: .::.:.: ::..:. .:.: : :: .:: : :.::. :::::::.: . :::
CCDS14 DPHLIVGNISNHQLTQGRLGHKPMVSAFSCLAVQESHWTKTIPNHKEQEWDPQKTEKYAG
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 IFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDG
::::.::.::::..::::: :::.:..:.. :.: :::: ::.::::::: :::.::::
CCDS14 IFHFRFWHFGEWTEVVIDDLLPTINGDLVFSFSTSMNEFWNALLEKAYAKLLGCYEALDG
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 GNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAAD
. .: .::::: ..: .:. .: ... .. .:: .. :. ..:::: ::.. . .
CCDS14 LTITDIIVDFTGTLAETVDMQKGRYTELVEEKYKLFGELYKTFTKGGLICCSIESPNQEE
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 MEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTS
.:.. ::.:::.:..::.::.:::. :. :..::. :.::::: :..::.::::. :
CCDS14 QEVETDWGLLKGHTYTMTDIRKIRLGERLVEVFSAEKVYMVRLRNPLGRQEWSGPWSEIS
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 EEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIHKTWEEARL
::::... :.:...:....:::::::..:: :: : . :: .:. : : .
CCDS14 EEWQQLTASDRKNLGLVMSDDGEFWMSLEDFCRNFHKLNVCRNVNNP---IFGRKELESV
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 HGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEVKKPED--EVLICIQQRPKRSTRREG
: ::. .:: .::.::: :..:::.::::::: : ::: .:.. .::. :. :: :
CCDS14 LGCWTVDDDPLMNRSGGCYNNRDTFLQNPQYIFTV--PEDGHKVIMSLQQKDLRTYRRMG
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSL--QHKAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTF
. .: :::...::: ::..:.: : :..:. : ::..:.::: .: ::..:: :
CCDS14 RPDNYIIGFELFKVEMNRKFRLHHLYIQERAGTSTYIDTRTVFLSKYLKKGNYVLVPTMF
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 EPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGL--KDSP
. :.:.:::::.:..:: . ::: :: : .::. :::..:::. : .: : : .
CCDS14 QHGRTSEFLLRIFSEVPVQLRELTLDMPKMSCWNLARGYPKVVTQITVHSAEDLEKKYAN
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 TGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVKGIFYRKKLSQPITVQVWNHRVLKDEFLG
.: :..::: ..::: :::.: .....::::. . :: ::::: : . :.:::
CCDS14 ETVNPYLVIKCGKEEVRSPVQKNTVHAIFDTQAIFYRRTTDIPIIVQVWNSRKFCDQFLG
540 550 560 570 580 590
600 610 620 630 640
pF1KB3 QVHLKADPDNLQALHTLHLRDRNSRQPSNLPGTVAVHILSSTSLMAV
:: : :::.. . :..:.:: ... . : .. ...:: .:
CCDS14 QVTLDADPSDCRDLKSLYLRKKGGPTAKVKQGHISFKVISSDDLTEL
600 610 620 630 640
>>CCDS10085.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 (729 aa)
initn: 1315 init1: 422 opt: 895 Z-score: 1089.0 bits: 211.9 E(32554): 2.5e-54
Smith-Waterman score: 1306; 42.2% identity (65.6% similar) in 500 aa overlap (9-490:57-528)
10 20 30
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDS
..... :.. : ..:::. :: :: . :
CCDS10 AQSKATEAGGGNPSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LYYKGTPGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQ
:.:. :::: :::.::...:: . :. ::..:.:::.:: . :. . :
CCDS10 LFYSQKFPIQFVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQHLLF
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 KVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEF
.::: : . :::::::.:::.:::::::::: ::: ::::.. .:: ::::
CCDS10 RVIPH------DQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 WCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERM
: ::.::::::: : :.:: ::::..:. ::::::.: ... : .: ... :
CCDS10 WSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIR--DAPSD------MYKIM
210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLD
:. ::.:.. :: .. ...:.:.:::::.::::.:: . .: ::.::.
CCDS10 KKAIERGSLMGCSIDTIIPVQYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVP--------FKGEKVK
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 MIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDII
..:::::::. :::: ::: ..:. :.:.:. .. : .::::::..:: .:: .
CCDS10 LVRLRNPWGQVEWNGSWSDRWKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLE
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 KCRVINTSHLSIH-KTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQY----IFE
: . . : . .:: . .: :. : .::: : :::. :::: . :
CCDS10 ICNLTADALQSDKLQTWTVSVNEGRWV-----RGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEE
370 380 390 400 410
400 410 420 430 440
pF1KB3 VKKPEDEVLIC-----IQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSLQH----
:.: .:: ..:. .:. :. : . ..::: ::.: .. . . ::.
CCDS10 DDDPDDSEVICSFLVALMQKNRRKDRKLGASL-FTIGFAIYEVPKEMHGNKQHLQKDFFL
420 430 440 450 460 470
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 ----KAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRL
:: .. ::: : : : : ..:::.:.:.:: . :::.::::..
CCDS10 YNASKARSKTYINMREVSQRFRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVEN
480 490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 DEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTP
CCDS10 TISVDRPVPQPGSSDQESEEQQQFRNIFKQIAGDDMEICADELKKVLNTVVNKHKDLKTH
540 550 560 570 580 590
>>CCDS73038.1 CAPN8 gene_id:388743|Hs108|chr1 (703 aa)
initn: 1073 init1: 417 opt: 838 Z-score: 1019.5 bits: 199.0 E(32554): 1.8e-50
Smith-Waterman score: 1210; 40.8% identity (65.1% similar) in 519 aa overlap (8-498:27-514)
10 20 30 40
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYY
: :....::..: :::.:: ::: ..: :
CCDS73 MAAQAAGVSRQRAATQGLGSNQNALKYLGQDFKTLRQQCLDSGVLFKDPEFPACPSALGY
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB3 K----GTPGP-AVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESL
: :.: .. :::: .: .:...: : . :. :: .:.::..:: .::. : :
CCDS73 KDLGPGSPQTQGIIWKRPTELCPSPQFIVGGATRTDICQGGLGDCWLLAAIASLTLNEEL
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 WQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRN
.:.: ..:... . :::::::.::..::::.::::::::: :.::.. ::.. :
CCDS73 LYRVVP--RDQDFQEN----YAGIFHFQFWQYGEWVEVVIDDRLPTKNGQLLFLHSEQGN
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 EFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFE
::: ::.::::::: :::.:: ::.:.... :::::.:: :: . :: :..
CCDS73 EFWSALLEKAYAKLNGCYEALAGGSTVEGFEDFTGGISEFYDLKKPP-AN-------LYQ
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 RMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRL-GHGLLAFFKSE
. :. :.:.. :: . .::. :: . :::.:::.:: :..: . :: :
CCDS73 IIRKALCAGSLLGCSIDVSSAAEAEAITSQKLVKSHAYSVTGVEEVNFQGH-------PE
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 KLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFT
:: ::::::::: ::.: ::: . ::.... ..:.. :.: :::::.. : : :.
CCDS73 KL--IRLRNPWGEVEWSGAWSDDAPEWNHIDPRRKEELDKKVED-GEFWMSLSDFVRQFS
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 DIIKCRVINTSHLS--IHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIF-
. : . : : .:: :. . ..: :: : . .::: :. :.. :::. .
CCDS73 RLEICNLSPDSLSSEEVHK-WNLVLFNGHWT-----RGSTAGGCQNYPATYWTNPQFKIR
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB3 --EVKKPEDE--------VLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKV--EENRQYRMH
:: . ..: ::. ..:. .: .: :.: :.::. .:.: : . . :
CCDS73 LDEVDEDQEESIGEPCCTVLLGLMQKNRRWRKRIGQGM-LSIGYAVYQVPKELESHTDAH
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KB3 -------SLQHKAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPS
. : .: : :.: : : :. : :.:...:.:::: . ::: ::::.. .
CCDS73 LGRDFFLAYQPSARTSTYVNLREVSGRARLPPGEYLVVPSTFEPFKDGEFCLRVFSEKKA
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 NCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAV
. :.
CCDS73 QALEIGDVVAGNPYEPHPSEVDQEDDQFRRLFEKLAGKDSEITANALKILLNEAFSKRTD
510 520 530 540 550 560
>>CCDS47436.1 CAPN11 gene_id:11131|Hs108|chr6 (739 aa)
initn: 1053 init1: 390 opt: 825 Z-score: 1003.3 bits: 196.1 E(32554): 1.5e-49
Smith-Waterman score: 1149; 38.2% identity (65.5% similar) in 519 aa overlap (8-498:61-549)
10 20 30
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDD
. .:.. :: : :. ::::::::: .
CCDS47 PTFTDTGMVAHINNSRLKAKGVGQHDNAQNFGNQSFEELRAACLRKGELFEDPLFPAEPS
40 50 60 70 80 90
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 SLYYKGTPGPA------VRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLA
:: .: :: . :.::: : ..: ...:::: :. :: .:.::..:: .::.
CCDS47 SLGFKDL-GPNSKNVQNISWQRPKDIINNPLFIMDGISPTDICQGILGDCWLLAAIGSLT
100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCH
. .: .:.: . : . : : :::::::..:.::.::.::.:::::: :..:.. :
CCDS47 TCPKLLYRVVP--RGQSF---KKN-YAGIFHFQIWQFGQWVNVVVDDRLPTKNDKLVFVH
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 SNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKR
:. :.::: ::.:::::::.: :.::.::.: ..: ::::::.. ..: .
CCDS47 STERSEFWSALLEKAYAKLSGSYEALSGGSTMEGLEDFTGGVAQSFQL--------QRPP
210 220 230 240 250
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 NQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAF
..:.. . :. :..:.. ::.... ...:. ::.::::.:: .. :.
CCDS47 QNLLRLLRKAVERSSLMGCSIEVTSDSELESMTDKMLVRGHAYSVTGLQDVH--------
260 270 280 290 300
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVC
.... .::.:::::. :::: :::...::..:... . .. . .::::::...:
CCDS47 YRGKMETLIRVRNPWGRIEWNGAWSDSAREWEEVASDIQMQL-LHKTEDGEFWMSYQDFL
310 320 330 340 350 360
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 RYFTDIIKCRVINTSHLSIHKT-WEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQY
:: . : . . . .:. :. . .:.: : . .::: :: ::. :::.
CCDS47 NNFTLLEICNLTPDTLSGDYKSYWHTTFYEGSWR-----RGSSAGGCRNHPGTFWTNPQF
370 380 390 400 410 420
400 410 420 430
pF1KB3 ---IFEVKKPEDE----VLIC-----IQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEENRQ--
. : :::. :..: ..:. : .:..: .. .::: .: : .. :
CCDS47 KISLPEGDDPEDDAEGNVVVCTCLVALMQKNWRHARQQG-AQLQTIGFVLYAVPKEFQNI
430 440 450 460 470 480
440 450 460 470 480
pF1KB3 YRMH-------SLQHKAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFT
.: . : .. . :. ::: : . : :.:.:::.:::: . ..:::::::
CCDS47 QDVHLKKEFFTKYQDHGFSEIFTNSREVSSQLRLPPGEYIIIPSTFEPHRDADFLLRVFT
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKV
. :. ::
CCDS47 EKHSESWELDEVNYAEQLQEEKVSEDDMDQDFLHLFKIVAGEGKEIGVYELQRLLNRMAI
550 560 570 580 590 600
>>CCDS44644.1 CAPN1 gene_id:823|Hs108|chr11 (714 aa)
initn: 1076 init1: 375 opt: 823 Z-score: 1001.0 bits: 195.6 E(32554): 1.9e-49
Smith-Waterman score: 1155; 37.8% identity (63.1% similar) in 518 aa overlap (8-498:37-524)
10 20 30
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDD
: :.: :: : . .::.: :: . .
CCDS44 TPVYCTGVSAQVQKQRARELGLGRHENAIKYLGQDYEQLRVRCLQSGTLFRDEAFPPVPQ
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 SLYYKGTPGP------AVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLA
:: :: :: ...:::: . .:...::: . :. :: .:.::..:: .::.
CCDS44 SLGYKDL-GPNSSKTYGIKWKRPTELLSNPQFIVDGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLT
70 80 90 100 110 120
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 SRESLWQKVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCH
..: ..:.: . . :.:::::::..:.::::::::.:: :: ...:.. :
CCDS44 LNDTLLHRVVPHGQSFQ------NGYAGIFHFQLWQFGEWVDVVVDDLLPIKDGKLVFVH
130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 SNSRNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKR
: :::: ::.::::::. : :.::.::.:.... ::::::.: .: ..
CCDS44 SAEGNEFWSALLEKAYAKVNGSYEALSGGSTSEGFEDFTGGVTEWYELRKAP--------
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 NQLFERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAF
..:.. .::. ::.:.. :: .. :::: :::::::.:: ...:
CCDS44 SDLYQIILKALERGSLLGCSIDISSVLDMEAITFKKLVKGHAYSVTGAKQVN--------
240 250 260 270 280
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 FKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVC
.... ...::.:::::: ::.: :::.: ::..:. ::... : ..: :::::.:.:
CCDS44 YRGQVVSLIRMRNPWGEVEWTGAWSDSSSEWNNVDPYERDQLRVKMED-GEFWMSFRDFM
290 300 310 320 330 340
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 RYFTDIIKCRVINTSHLS-IHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQY
: :: . : . . : . :. . .:.: : . .::: :. ::. :::.
CCDS44 REFTRLEICNLTPDALKSRTIRKWNTTLYEGTWR-----RGSTAGGCRNYPATFWVNPQF
350 360 370 380 390
400 410 420 430
pF1KB3 IF---EVKKPED--------EVLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKV--EENRQY
. :. :.: .. ..:. .: :: :. . .::: .:.: : :
CCDS44 KIRLDETDDPDDYGDRESGCSFVLALMQKHRRRERRFGR-DMETIGFAVYEVPPELVGQP
400 410 420 430 440 450
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 RMH-------SLQHKAAGSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTD
.: . .: . .:: : : : : :.::..:.::::.. :.:.:: :..
CCDS44 AVHLKRDFFLANASRARSEQFINLREVSTRFRLPPGEYVVVPSTFEPNKEGDFVLRFFSE
460 470 480 490 500 510
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 VPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVR
.. ::
CCDS44 KSAGTVELDDQIQANLPDEQVLSEEEIDENFKALFRQLAGEDMEISVKELRTILNRIISK
520 530 540 550 560 570
>>CCDS31035.1 CAPN2 gene_id:824|Hs108|chr1 (700 aa)
initn: 1018 init1: 381 opt: 788 Z-score: 958.4 bits: 187.7 E(32554): 4.6e-47
Smith-Waterman score: 1190; 38.9% identity (65.4% similar) in 509 aa overlap (8-490:27-504)
10 20 30 40
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYY
: .:.: ::: .: . .::.:: ::: ..: .
CCDS31 MAGIAAKLAKDREAAEGLGSHDRAIKYLNQDYEALRNECLEAGTLFQDPSFPAIPSALGF
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90
pF1KB3 KGTPGP------AVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRES
: :: ...:::: :: ::.... : . :. :: .:.::..:: .::. :
CCDS31 KEL-GPYSSKTRGIEWKRPTEICADPQFIIGGATRTDICQGALGDCWLLAAIASLTLNEE
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 LWQKVIP-DWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNS
. .:.: . . :: :::::::.::..::::.::.:::::: ...:.. ::
CCDS31 ILARVVPLNQSFQE-------NYAGIFHFQFWQYGEWVEVVVDDRLPTKDGELLFVHSAE
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 RNEFWCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQL
.::: ::.::::::. :::.::.:: :.... :::::..: .: . .:
CCDS31 GSEFWSALLEKAYAKINGCYEALSGGATTEGFEDFTGGIAEWYELKKPP--------PNL
180 190 200 210 220
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 FERMLKVHSRGGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKS
:. . :. ..:.:.. :: ..::: :: :::::::.:: ...:. ..: :
CCDS31 FKIIQKALQKGSLLGCSIDITSAADSEAITFQKLVKGHAYSVTGAEEVE-SNGSL-----
230 240 250 260 270
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 EKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYF
.:: ::.:::::: ::.: :.:. :. .. :::.. . ..::::::.: : :..
CCDS31 QKL--IRIRNPWGEVEWTGRWNDNCPSWNTIDPEERERL-TRRHEDGEFWMSFSDFLRHY
280 290 300 310 320 330
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 TDIIKCRVINTSHLS-IHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFE
. . : . . : .: :. ... : : : . .::: :. .::..::::...
CCDS31 SRLEICNLTPDTLTSDTYKKWKLTKMDGNWR-----RGSTAGGCRNYPNTFWMNPQYLIK
340 350 360 370 380 390
400 410 420 430 440
pF1KB3 VKKP-EDE--------VLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEE--NRQYRMHS-
... ::: :. . :. .: :. :. . .::: ::.: : . : .:
CCDS31 LEEEDEDEEDGESGCTFLVGLIQKHRRRQRKMGEDMH-TIGFGIYEVPEELSGQTNIHLS
400 410 420 430 440
450 460 470 480 490
pF1KB3 ----LQHKAA--GSIYINSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNC
: ..: .. .:: : :. : : :.:...:.::::.. :.: .:::..
CCDS31 KNFFLTNRARERSDTFINLREVLNRFKLPPGEYILVPSTFEPNKDGDFCIRVFSEKKADY
450 460 470 480 490 500
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 RELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQK
CCDS31 QAVDDEIEANLEEFDISEDDIDDGFRRLFAQLAGEDAEISAFELQTILRRVLAKRQDIKS
510 520 530 540 550 560
>>CCDS1586.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 (690 aa)
initn: 1170 init1: 377 opt: 746 Z-score: 907.1 bits: 178.2 E(32554): 3.3e-44
Smith-Waterman score: 1241; 39.2% identity (66.9% similar) in 513 aa overlap (11-504:27-508)
10 20 30 40
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYYKGT
:.. .:..: .: .:::: :::...::.:.
CCDS15 MPYLYRAPGPQAHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYSER
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 PGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDW
: :::: : ..:.... : . :. ::..:.::..:: .::. .. .:::
CCDS15 PQIPFVWKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIP--
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 KEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVE
..: . : .:::::::.::. .::.:::::::::: ..:.. :: ..:::: ::.:
CCDS15 QDQSFGP----GYAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 KAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSR
:::::: : :.:: ::.. .:. ::::::.: : . :. .: ..: . :. .:
CCDS15 KAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAE-------TFQTKEAPEN-FYEILEKALKR
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRN
:.:.. : . .::. ::: ::.:::::.:: . .: :.......::.::
CCDS15 GSLLGCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVS--------FRGQRIELIRIRN
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 PWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVIN
:::. :::: :::.: ::..:. .:.... :. :::::::.:.: .: . : .
CCDS15 PWGQVEWNGSWSDSSPEWRSVGPAEQKRLCHTALDDGEFWMAFKDFKAHFDKVEICNLTP
280 290 300 310 320 330
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 TS--HLSIHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEV-KKPEDE-
. . .::: :: . .:.:. : . .::: : :::. ::: . . .: : .
CCDS15 DALEEDAIHK-WEVTVHQGSWV-----RGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQE
340 350 360 370 380 390
410 420 430 440 450
pF1KB3 ---VLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEE-----NRQY-RMHSLQHKAAGSIY
:. ..:. .:. .: : .. :.::. ::. . :... :.:. .: .. .
CCDS15 ECSFLVALMQKDRRKLKRFG-ANVLTIGYAIYECPDKDEHLNKDFFRYHA--SRARSKTF
400 410 420 430 440
460 470 480 490 500
pF1KB3 INSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELR------LDEPPH
:: : : : : :.:..::.:::: . ..: ::.:.. . :.. : :::
CCDS15 INLREVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPK
450 460 470 480 490 500
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 TCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVK
CCDS15 PTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKNI
510 520 530 540 550 560
>>CCDS31053.1 CAPN9 gene_id:10753|Hs108|chr1 (664 aa)
initn: 1038 init1: 377 opt: 738 Z-score: 897.6 bits: 176.4 E(32554): 1.1e-43
Smith-Waterman score: 1082; 36.8% identity (62.6% similar) in 513 aa overlap (11-504:27-482)
10 20 30 40
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDSLYYKGT
:.. .:..: .: .:::: :::...::.:.
CCDS31 MPYLYRAPGPQAHPVPKDARITHSSGQSFEQMRQECLQRGTLFEDADFPASNSSLFYSER
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 PGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQKVIPDW
: :::: : ..:.... : . :. ::..:.::..:: .::. .. .:::
CCDS31 PQIPFVWKRPGEIVKNPEFILGGATRTDICQGELGDCWLLAAIASLTLNQKALARVIP--
70 80 90 100 110
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 KEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEFWCALVE
..: . : .:::::::.::. .::.:::::::::: ..:.. :: ..:::: ::.:
CCDS31 QDQSFGP----GYAGIFHFQFWQHSEWLDVVIDDRLPTFRDRLVFLHSADHNEFWSALLE
120 130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 KAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSEPIDLTEGDFANDETKRNQLFERMLKVHSR
:::::: : :.:: ::.. .:. ::::::.: : . :. .: ..: . :. .:
CCDS31 KAYAKLNGSYEALKGGSAIEAMEDFTGGVAE-------TFQTKEAPEN-FYEILEKALKR
180 190 200 210 220
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GGLISASIKAVTAADMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRN
:.:.. : . .::. ::: ::.:::::.:: . .: :.......::.::
CCDS31 GSLLGCFIDTRSAAESEARTPFGLIKGHAYSVTGIDQVS--------FRGQRIELIRIRN
230 240 250 260 270
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 PWGEREWNGPWSDTSEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVIN
:::. :::: ::: :.:.: .: . : .
CCDS31 PWGQVEWNGSWSDR--------------------------MAFKDFKAHFDKVEICNLTP
280 290 300 310
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 TS--HLSIHKTWEEARLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQYIFEV-KKPEDE-
. . .::: :: . .:.:. : . .::: : :::. ::: . . .: : .
CCDS31 DALEEDAIHK-WEVTVHQGSWV-----RGSTAGGCRNFLDTFWTNPQIKLSLTEKDEGQE
320 330 340 350 360
410 420 430 440 450
pF1KB3 ---VLICIQQRPKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEE-----NRQY-RMHSLQHKAAGSIY
:. ..:. .:. .: : .. :.::. ::. . :... :.:. .: .. .
CCDS31 ECSFLVALMQKDRRKLKRFG-ANVLTIGYAIYECPDKDEHLNKDFFRYHA--SRARSKTF
370 380 390 400 410 420
460 470 480 490 500
pF1KB3 INSRSVFLRTDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELR------LDEPPH
:: : : : : :.:..::.:::: . ..: ::.:.. . :.. : :::
CCDS31 INLREVSDRFKLPPGEYILIPSTFEPHQEADFCLRIFSEKKAITRDMDGNVDIDLPEPPK
430 440 450 460 470 480
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 TCWSSLCGYPQLVTQVHVLGAAGLKDSPTGANSYVIIKCEGDKVRSAVQKGTSTPEYNVK
CCDS31 PTPPDQETEEEQRFRALFEQVAGEDMEVTAEELEYVLNAVLQKKKDIKFKKLSLISCKNI
490 500 510 520 530 540
>>CCDS32207.1 CAPN3 gene_id:825|Hs108|chr15 (815 aa)
initn: 1267 init1: 422 opt: 692 Z-score: 839.9 bits: 166.0 E(32554): 1.8e-40
Smith-Waterman score: 1221; 39.1% identity (61.7% similar) in 540 aa overlap (9-490:57-576)
10 20 30
pF1KB3 MFSCVKPYEDQNYSALRRDCRRRKVLFEDPLFPATDDS
..... :.. : ..:::. :: :: . :
CCDS32 AQSKATEAGGGNPSGIYSAIISRNFPIIGVKEKTFEQLHKKCLEKKVLYVDPEFPPDETS
30 40 50 60 70 80
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 LYYKGTPGPAVRWKRPKGICEDPRLFVDGISSHDLHQGQVGNCWFVAACSSLASRESLWQ
:.:. :::: :::.::...:: . :. ::..:.:::.:: . :. . :
CCDS32 LFYSQKFPIQFVWKRPPEICENPRFIIDGANRTDICQGELGDCWFLAAIACLTLNQHLLF
90 100 110 120 130 140
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 KVIPDWKEQEWDPEKPNAYAGIFHFHFWRFGEWVDVVIDDRLPTVNNQLIYCHSNSRNEF
.::: : . :::::::.:::.:::::::::: ::: ::::.. .:: ::::
CCDS32 RVIPH------DQSFIENYAGIFHFQFWRYGEWVDVVIDDCLPTYNNQLVFTKSNHRNEF
150 160 170 180 190 200
160 170 180 190 200
pF1KB3 WCALVEKAYAKLAGCYQALDGGNTADALVDFTGGVSE-------PIDLTE----------
: ::.::::::: : :.:: ::::..:. ::::::.: : :. .
CCDS32 WSALLEKAYAKLHGSYEALKGGNTTEAMEDFTGGVAEFFEIRDAPSDMYKIMKKAIERGS
210 220 230 240 250 260
210 220 230
pF1KB3 --GDFANDETKRN-----------QLFERMLKVHSRGGLISASI----------KAVTAA
: .: :. . .:. ::.. . . : .... ... .
CCDS32 LMGCSIDDGTNMTYGTSPSGLNMGELIARMVRNMDNSLLQDSDLDPRGSDERPTRTIIPV
270 280 290 300 310 320
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DMEARLACGLVKGHAYAVTDVRKVRLGHGLLAFFKSEKLDMIRLRNPWGEREWNGPWSDT
..:.:.:::::.::::.:: . .: ::.::. ..:::::::. :::: :::
CCDS32 QYETRMACGLVRGHAYSVTGLDEVP--------FKGEKVKLVRLRNPWGQVEWNGSWSDR
330 340 350 360 370
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 SEEWQKVSKSEREKMGVTVQDDGEFWMTFEDVCRYFTDIIKCRVINTSHLSIH-KTWEEA
..:. :.:.:. .. : .::::::..:: .:: . : . . : . .:: .
CCDS32 WKDWSFVDKDEKARLQHQVTEDGEFWMSYEDFIYHFTKLEICNLTADALQSDKLQTWTVS
380 390 400 410 420 430
360 370 380 390 400
pF1KB3 RLHGAWTLHEDPRQNRGGGCINHKDTFFQNPQY----IFEVKKPEDEVLIC-----IQQR
.: :. : .::: : :::. :::: . : :.: .:: ..:.
CCDS32 VNEGRWV-----RGCSAGGCRNFPDTFWTNPQYRLKLLEEDDDPDDSEVICSFLVALMQK
440 450 460 470 480
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 PKRSTRREGKGENLAIGFDIYKVEENRQYRMHSLQH--------KAAGSIYINSRSVFLR
.:. :. : . ..::: ::.: .. . . ::. :: .. ::: : : :
CCDS32 NRRKDRKLGASL-FTIGFAIYEVPKEMHGNKQHLQKDFFLYNASKARSKTYINMREVSQR
490 500 510 520 530 540
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 TDQPEGRYVIIPTTFEPGHTGEFLLRVFTDVPSNCRELRLDEPPHTCWSSLCGYPQLVTQ
: ..:::.:.:.:: . :::.::::..
CCDS32 FRLPPSEYVIVPSTYEPHQEGEFILRVFSEKRNLSEEVENTISVDRPVPIIFVSDRANSN
550 560 570 580 590 600
640 residues in 1 query sequences
18511270 residues in 32554 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 13:43:28 2016 done: Thu Nov 3 13:43:29 2016
Total Scan time: 3.380 Total Display time: 0.140
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]