Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3683
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3683, 1174 aa
1>>>pF1KB3683 1174 - 1174 aa - 1174 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8091+/-0.00117; mu= 19.3292+/- 0.070
mean_var=66.1258+/-13.693, 0's: 0 Z-trim(101.4): 25 B-trim: 348 in 2/47
Lambda= 0.157721
statistics sampled from 6487 (6497) to 6487 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.545), E-opt: 0.2 (0.2), width: 16
Scan time: 3.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS3511.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1174) 7858 1797.8 0
CCDS77915.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1167) 7808 1786.5 0
CCDS77916.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1099) 7299 1670.6 0
CCDS53824.1 POLR3B gene_id:55703|Hs108|chr12 (1075) 1625 379.6 2.3e-104
CCDS9105.1 POLR3B gene_id:55703|Hs108|chr12 (1133) 1625 379.6 2.4e-104
CCDS62990.1 POLR1B gene_id:84172|Hs108|chr2 ( 924) 416 104.4 1.3e-21
CCDS62989.1 POLR1B gene_id:84172|Hs108|chr2 ( 952) 416 104.4 1.3e-21
CCDS46395.1 POLR1B gene_id:84172|Hs108|chr2 (1079) 416 104.5 1.5e-21
CCDS2097.1 POLR1B gene_id:84172|Hs108|chr2 (1135) 416 104.5 1.5e-21
CCDS62988.1 POLR1B gene_id:84172|Hs108|chr2 (1173) 416 104.5 1.6e-21
>>CCDS3511.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1174 aa)
initn: 7858 init1: 7858 opt: 7858 Z-score: 9651.6 bits: 1797.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7858; 100.0% identity (100.0% similar) in 1174 aa overlap (1-1174:1-1174)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTY
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLD
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSML
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEM
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 KFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLS
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSP
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 VSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASG
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 VVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSP
670 680 690 700 710 720
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 RNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIV
730 740 750 760 770 780
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 AIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGM
790 800 810 820 830 840
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 RHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSE
850 860 870 880 890 900
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 TGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 TGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEG
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 ITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGY
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 HLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSR
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 DGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGC
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KB3 RNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 RNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
1150 1160 1170
>>CCDS77915.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1167 aa)
initn: 7808 init1: 7808 opt: 7808 Z-score: 9590.2 bits: 1786.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7808; 100.0% identity (100.0% similar) in 1167 aa overlap (8-1174:1-1167)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MYDADEDMQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MQYDEDDDEITPDLWQEACWIVISSYFDEKGLVRQQLDSFDEFIQMSVQRIVE
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPNEARLRNLTY
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLD
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 PGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSML
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 PGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRPTSTIWVSML
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 ARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYDFEDPEMMEM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 VKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHVGVSDFCETK
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNLLKEVRIYAQ
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 KFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 KFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLNRLTFASTLS
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAYISVGSQPSP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLRRQMDIIVSE
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 VSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASG
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 VVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 VVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASIIPFPDHNQSP
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 RNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIV
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 AIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 AIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSVFYRSYKEQESKKGFDQEEVFEKPTRETCQGM
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 RHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVIIGKTVTLPENEDELESTNRRYTKRDCSTFLRTSE
840 850 860 870 880 890
910 920 930 940 950 960
pF1KB3 TGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TGIVDQVMVTLNQEGYKFCKIRVRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEG
900 910 920 930 940 950
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 ITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ITPDIIINPHAIPSRMTIGHLIECLQGKVSANKGEIGDATPFNDAVNVQKISNLLSDYGY
960 970 980 990 1000 1010
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 HLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 HLRGNEVLYNGFTGRKITSQIFIGPTYYQRLKHMVDDKIHSRARGPIQILNRQPMEGRSR
1020 1030 1040 1050 1060 1070
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 DGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 DGGLRFGEMERDCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIMAIANTRTHTYECRGC
1080 1090 1100 1110 1120 1130
1150 1160 1170
pF1KB3 RNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RNKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
1140 1150 1160
>>CCDS77916.1 POLR2B gene_id:5431|Hs108|chr4 (1099 aa)
initn: 7299 init1: 7299 opt: 7299 Z-score: 8964.7 bits: 1670.6 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7299; 100.0% identity (100.0% similar) in 1093 aa overlap (82-1174:7-1099)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 QMSVQRIVEDAPPIDLQAEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPN
::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 MLDCNQPRYLLKFEQIYLSKPTHWERDGAPSPMMPN
10 20 30
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 EARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 EARLRNLTYSAPLYVDITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDL
40 50 60 70 80 90
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 CELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 CELNECPLDPGGYFIINGSEKVLIAQEKMATNTVYVFAKKDSKYAYTGECRSCLENSSRP
100 110 120 130 140 150
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 TSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 TSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQEVPIIIVFRALGFVSDRDILEHIIYD
160 170 180 190 200 210
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 FEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 FEDPEMMEMVKPSLDEAFVIQEQNVALNFIGSRGAKPGVTKEKRIKYAKEVLQKEMLPHV
220 230 240 250 260 270
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 GVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 GVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAFLFRGMFKNL
280 290 300 310 320 330
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 LKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 LKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGLKYSLATGNWGDQKKAHQARAGVSQVLN
340 350 360 370 380 390
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 RLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RLTFASTLSHLRRLNSPIGRDGKLAKPRQLHNTLWGMVCPAETPEGHAVGLVKNLALMAY
400 410 420 430 440 450
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 ISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 ISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVGIHKDPEQLMNTLRKLR
460 470 480 490 500 510
600 610 620 630 640 650
pF1KB3 RQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 RQMDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVEKQKLLLKKRHIDQLKEREYNNY
520 530 540 550 560 570
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 SWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASII
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS77 SWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAYCSTYTHCEIHPSMILGVCASII
580 590 600 610 620 630
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CCDS77 PFPDHNQSPRNTYQSAMGKQAMGVYITNFHVRMDTLAHVLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRE
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CCDS53 VTQIPLEGSNVPQQPQYKDVPITYKGATDSYIEKVMISSNAEDAFLIKMLLRQTRRPEIG
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CCDS53 LSKYNE
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... ::. :: : :: ::. .:: .: . .:...:. .: .. ::..
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: .. .: . . . ...::.. : : . :. .:..: :.:::::.:::::
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:. . .:. . . : .::. :.. . .:.::. . . :..::.:::.::::: ::.:.
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::::: .:.::: ::::::::::.::::::: :..::...: :::. .:: ..: ::.
CCDS91 RARGPRAVLTRQPTEGRSRDGGLRLGEMERDCLIGYGASMLLLERLMISSDAFEVDVCGQ
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CCDS91 CGLLG------YSGWCHYCKSSCHVSSLRIPYACKLLFQELQSMNIIPRLKLSKYNE
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CCDS62 EEHSAVNMNLHYLENGTVMLNFIYRKELFFLPLGFALKALVSFSDYQIFQELIKGKEDDS
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CCDS62 FLRNSVSQMLRIVMEEGCSTQKQ--VLNYLGECFRVKLNVPDWYPNEQAAEFLFNQC---
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. . .:.: :.: :...:. : :. :. : :... : :. .... ...
CCDS62 ICIHLKSNTEKFYMLCLMTRKLFALAKGECMEDNPDSLVNQEVLTPGQLFLMFLKEKLEG
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pF1KB3 LLKEVRIYAQKFIDRGKDFNLELAIKTRIISDGL------KYSLATGNWGDQKKAHQAR-
: ..: .: .. . ... ::.. :. .: .:::: .. .
CCDS62 WLVSIKIAFDKKAQK-TSVSMNTDNLMRIFTMGIDLTKPFEYLFATGNLRSKTGLGLLQD
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.:. : ..:.: :::.: .. : : .:. :.: ::..::..::.:.
CCDS62 SGLCVVADKLNFIRYLSHFRCVHR--GADFAKMRTTTVRRLLPESWGFLCPVHTPDGEPC
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pF1KB3 GLVKNL-ALMAYISVGSQPSPILEFLEEWSMENLEEISPAAIADATKIFVNGCWVG-IHK
::...: :. .. . : .: . .. .. . .. ....: :: . :
CCDS62 GLMNHLTAVCEVVTQFVYTASIPALLCNLGVTPIDGAPHRSYSECYPVLLDGVMVGWVDK
300 310 320 330 340 350
580 590 600 610 620
pF1KB3 D-PEQLMNTLRK---LRRQ-----MDIIVSEVSMIRDIREREIRIYTDAGRICRPLLIVE
: . ..::. ::.. :.... .. .. . ..: :. ::.
CCDS62 DLAPGIADSLRHFKVLREKRIPPWMEVVLIPMTGKPSLYPG-LFLFTTPCRLVRPV----
360 370 380 390 400 410
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 KQKLLLKKRHIDQLKEREYNNYSWQDLVASGVVEYIDTLEEETVMLAMTPDDLQEKEVAY
:.: : :. : : :.:. . .:. :.. .
CCDS62 -QNLALGKE------------------------ELIGTMEQIFMNVAIFEDEV------F
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.. :: :. : .:.: :..::: :::::::: :: ::::.:: . ... : :. .
CCDS62 AGVTTHQELFPHSLLSVIANFIPFSDHNQSPRNMYQCQMGKQTMGFPLLTYQDRSDNKLY
450 460 470 480 490 500
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pF1KB3 VLYYPQKPLVTTRSMEYLRFRELPAGINSIVAIASYTGYNQEDSVIMNRSAVDRGFFRSV
: ::.::: ..: . . : : :.:::. :::::..::..:.:... .::: ..
CCDS62 RLQTPQSPLVRPSMYDYYDMDNYPIGTNAIVAVISYTGYDMEDAMIVNKASWERGFAHGS
510 520 530 540 550 560
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pF1KB3 FYRS--YKEQESKKGFDQEEVFE-KPTRETCQGMRHAIYDKLDDDGLIAPGVRVSGDDVI
:.: .:. : :. :: :: . .::::::: :.... :
CCDS62 VYKSEFIDLSEKIKQGDSSLVFGIKPGDPR-------VLQKLDDDGLPFIGAKLQYGDPY
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pF1KB3 IGKTVTLPENEDELESTNRRY-TKRDCSTFLRTSETGIVDQVMVTLNQEG---YKFCKIR
. : . :: : .:..: .::.. : :. : .: :
CCDS62 YSYL-----NLNTGESFVMYYKSKENC----------VVDNIKVCSNDTGSGKFKCVCIT
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pF1KB3 VRSVRIPQIGDKFASRHGQKGTCGIQYRQEDMPFTCEGITPDIIINPHAIPSRMTIGHLI
.: : : ::::::::::::: . . :::::: :..:::..:::..::::::: ::
CCDS62 MRVPRNPTIGDKFASRHGQKGILSRLWPAEDMPFTESGMVPDILFNPHGFPSRMTIGMLI
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pF1KB3 ECLQGKVSANKGEIGDATPF---NDAVNVQKISNLLSDYGYHLRGNEVLYNGFTGRKITS
: . :: .: .: ::::: .. .. ....:. ::.. :.: ::.:..: .. .
CCDS62 ESMAGKSAALHGLCHDATPFIFSEENSALEYFGEMLKAAGYNFYGTERLYSGISGLELEA
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.:::: .:::::.:::.::.. :. : . .. ::. ::. .::.:::::::: .:::.
CCDS62 DIFIGVVYYQRLRHMVSDKFQVRTTGARDRVTNQPIGGRNVQGGIRFGEMERDALLAHGT
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pF1KB3 AQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIM----------AIANTRTHTYECRGCRNKTQISLV
. .:..:::. :: .::: :: . . . :.. :.: : . :. :
CCDS62 SFLLHDRLFNCSDRSVAHVCVKCGSLLSPLLEKPPPSWSAMRNRKYNCTLCSRSDTIDTV
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pF1KB3 RMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
.::. . . :: .:.: ..
CCDS62 SVPYVFRYFVAELAAMNIKVKLDVV
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:.: : : : : :.:. . .:. :..
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. .. :: :. : .:.: :..::: :::::::: :: ::::.:: . ... :
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CCDS62 SDNKLYRLQTPQSPLVRPSMYDYYDMDNYPIGTNAIVAVISYTGYDMEDAMIVNKASWER
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CCDS62 GFAHGSVYKSEFIDLSEKIKQGDSSLVFGIKPGDPR-------VLQKLDDDGLPFIGAKL
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CCDS62 QYGDPYYSYL-----NLNTGESFVMYYKSKENC----------VVDNIKVCSNDTGSGKF
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: : .: : : ::::::::::::: . . :::::: :..:::..:::..::::
CCDS62 KCVCITMRVPRNPTIGDKFASRHGQKGILSRLWPAEDMPFTESGMVPDILFNPHGFPSRM
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::: ::: . :: .: .: ::::: .. .. ....:. ::.. :.: ::.:..
CCDS62 TIGMLIESMAGKSAALHGLCHDATPFIFSEENSALEYFGEMLKAAGYNFYGTERLYSGIS
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: .. ..:::: .:::::.:::.::.. :. : . .. ::. ::. .::.::::::::
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.:::.. .:..:::. :: .::: :: . . . :.. :.: : .
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pF1KB3 TQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
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CCDS62 DTIDTVSVPYVFRYFVAELAAMNIKVKLDVV
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CCDS46 EEAEEMGGYFIINGIEKVIRMLIMPRRNFPIAMIRPKWKTRGPGYTQYGVSMHCVREEHS
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pF1KB3 PTSTIWVSMLARGGQGAKKSAIGQRIVATLPYIKQE--VPIIIVFRALGFVSDRDILEHI
.. . . .: : .. .. : :. .:. ....:: :: .:....
CCDS46 AVN-MNLHYLENG-----------TVMLNFIYRKELFFLPLGFALKALVSFSDYQIFQEL
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: :: .. .:.. ..:. :.: .::..: .: .: . : :
CCDS46 IKGKEDDSFLRNSVSQMLRIVMEEGCSTQKQ--VLNYLGECFRVKLNVPDWYPNEQAAEF
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pF1KB3 LQKEMLPHVGVSDFCETKKAYFLGYMVHRLLLAALGRRELDDRDHYGNKRLDLAGPLLAF
: .. . . .:.: :.: :...:. : :. :. : :... : :. .
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. .:. : ..:.: :::.: .. : : .:. :.: ::..::.
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:: . :: . ..::. ::.. :.... .. .. . ..: :.
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. . .. :: :. : .:.: :..::: :::::::: :: ::::.:: . ...
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CCDS46 KFKCVCITMRVPRNPTIGDKFASRHGQKGILSRLWPAEDMPFTESGMVPDILFNPHGFPS
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::::: ::: . :: .: .: ::::: .. .. ....:. ::.. :.: ::.:
CCDS46 RMTIGMLIESMAGKSAALHGLCHDATPFIFSEENSALEYFGEMLKAAGYNFYGTERLYSG
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CCDS46 ISGLELEADIFIGVVYYQRLRHMVSDKFQVRTTGARDRVTNQPIGGRNVQGGIRFGEMER
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pF1KB3 DCQIAHGAAQFLRERLFEASDPYQVHVCNLCGIM----------AIANTRTHTYECRGCR
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CCDS46 DALLAHGTSFLLHDRLFNCSDRSVAHVCVKCGSLLSPLLEKPPPSWSAMRNRKYNCTLCS
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pF1KB3 NKTQISLVRMPYACKLLFQELMSMSIAPRMMSV
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CCDS46 RSDTIDTVSVPYVFRYFVAELAAMNIKVKLDVV
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CCDS20 RNLPSGPSLKHLTDPSYGIPREQQKAALQELTRAHVESFNYAVHEGLGLAVQAIPPFEFA
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pF1KB3 AEAQHASGEVEEPPRYLLKFEQIYLSKPTHWERD-GAPSPMMPNEARLRNLTYSAPLYVD
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CCDS20 FKDERISFTILD----------AVISPPTVPKGTICKEANVYPAECRGRRSTYRGKLTAD
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pF1KB3 ITKTVIKEGEEQLQTQHQKTFIGKIPIMLRSTYCLLNGLTDRDLCELNECPLDPGGYFII
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CCDS20 INWAV--NG---ISKGIIKQFLGYVPIMVKSKLCNLRNLPPQALIEHHEEAEEMGGYFII
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:: ::: .. . . ... : .. :. : :... .. . . .:
CCDS20 NGIEKVIRMLIMPRRNFPIAMIRPKWKTRGPGYTQYGVSMHCVREEHSAVN-MNLHYLEN
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: .. .. : :. .:. ....:: :: .:....: :: ..
CCDS20 G-----------TVMLNFIYRKELFFLPLGFALKALVSFSDYQIFQELIKGKEDDSFLRN
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.:.. ..:. :.: .::..: .: .: . : : : .. . .
CCDS20 SVSQMLRIVMEEGCSTQKQ--VLNYLGECFRVKLNVPDWYPNEQAAEFLFNQC---ICIH
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CCDS20 LKSNTEKFYMLCLMTRKLFALAKGECMEDNPDSLVNQEVLTPGQLFLMFLKEKLEGWLVS
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CCDS20 IKIAFDKKAQK-TSVSMNTDNLMRIFTMGIDLTKPFEYLFATGNLRSKTGLGLLQDSGLC
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CCDS20 VVADKLNFIRYLSHFRCVHR--GADFAKMRTTTVRRLLPESWGFLCPVHTPDGEPCGLMN
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CCDS20 GIADSLRHFKVLREKRIPPWMEVVLIPMTGKPSLYPG-LFLFTTPCRLVRPV-----QNL
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: :. : : :.:. . .:. :.. . ..
CCDS20 ALGKE------------------------ELIGTMEQIFMNVAIFEDEV------FAGVT
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CCDS20 THQELFPHSLLSVIANFIPFSDHNQSPRNMYQCQMGKQTMGFPLLTYQDRSDNKLYRLQT
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