Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3682
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3682, 752 aa
1>>>pF1KB3682 752 - 752 aa - 752 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.8710+/-0.00117; mu= 12.5864+/- 0.070
mean_var=105.3937+/-20.671, 0's: 0 Z-trim(104.5): 42 B-trim: 9 in 1/50
Lambda= 0.124930
statistics sampled from 7884 (7910) to 7884 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.607), E-opt: 0.2 (0.243), width: 16
Scan time: 3.110
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 750) 5010 914.5 0
CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 ( 712) 4762 869.8 0
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CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 770) 2643 487.9 2.6e-137
CCDS59288.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 ( 722) 2614 482.6 9.1e-136
CCDS2310.1 STAT4 gene_id:6775|Hs108|chr2 ( 748) 2569 474.5 2.6e-133
CCDS8917.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 851) 1849 344.8 3.4e-94
CCDS55836.1 STAT2 gene_id:6773|Hs108|chr12 ( 847) 1791 334.3 4.7e-91
CCDS11423.1 STAT5B gene_id:6777|Hs108|chr17 ( 787) 830 161.1 6.1e-39
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CCDS11424.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 794) 800 155.7 2.6e-37
CCDS53804.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 737) 550 110.6 8.9e-24
CCDS8931.1 STAT6 gene_id:6778|Hs108|chr12 ( 847) 550 110.7 1e-23
CCDS74066.1 STAT5A gene_id:6776|Hs108|chr17 ( 763) 394 82.5 2.7e-15
>>CCDS2309.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 (750 aa)
initn: 5010 init1: 5010 opt: 5010 Z-score: 4884.6 bits: 914.5 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 5010; 100.0% identity (100.0% similar) in 750 aa overlap (3-752:1-750)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
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pF1KB3 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
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310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
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730 740 750
pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS23 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
720 730 740 750
>>CCDS42793.1 STAT1 gene_id:6772|Hs108|chr2 (712 aa)
initn: 4762 init1: 4762 opt: 4762 Z-score: 4643.4 bits: 869.8 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 4762; 100.0% identity (100.0% similar) in 712 aa overlap (3-714:1-712)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 MSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AQRFNQAQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKTLQ
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 NREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALINDELVE
180 190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 WKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPITKNK
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 QVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQELNYNL
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pF1KB3 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 KVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQKNAGTR
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pF1KB3 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 TNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASILWYNMLV
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pF1KB3 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 AEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNASPDGLIP
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pF1KB3 WTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALLKDQQPGT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 FLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNYKVMAAEN
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pF1KB3 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEVHPSRLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS42 IPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSEV
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pF1KB3 TTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
>>CCDS32657.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (769 aa)
initn: 2088 init1: 911 opt: 2643 Z-score: 2578.8 bits: 487.9 E(32554): 2.6e-137
Smith-Waterman score: 2643; 53.2% identity (81.3% similar) in 739 aa overlap (3-734:1-731)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
:.:: .:::::...:::.::::.::::::.::.:: :.:.::: .::. : ::. ::
CCDS32 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
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CCDS32 NLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQT
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130 140 150 160 170
pF1KB3 AQRFNQ--AQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKT
: : .:... ..:. .::. :......:. .:. .:...: .:.:::..::. ::
CCDS32 AATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKT
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180 190 200 210 220 230
pF1KB3 L--QNREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALIND
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CCDS32 LKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 ELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPI
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CCDS32 ELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPI
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 TKNKQVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQEL
.... .: .: ::..:..:.:::::::::: ::.::::.:::::::.:.:::::. ::
CCDS32 VQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPEL
300 310 320 330 340 350
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pF1KB3 NYNLKVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQK-
::.::.:: .::: .. ...: ::::::::.:::::::::.::::.:::.:: :.::.
CCDS32 NYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRC
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 -NAGTRTNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASIL
:.: . .. :::::::: ..:::.. . :: ::::: :::::::::. :.:..:::::
CCDS32 GNGGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASIL
420 430 440 450 460 470
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pF1KB3 WYNMLVAEPRNLSFFLTPPCARWAQLSEVLSWQFSSVTKRGLNVDQLNMLGEKLLGPNAS
:::::. .:.:..:: :: . : :..:::::::::.:::::...::. :.::::::...
CCDS32 WYNMLTNNPKNVNFFTKPPIGTWDQVAEVLSWQFSSTTKRGLSIEQLTTLAEKLLGPGVN
480 490 500 510 520 530
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pF1KB3 PDGL-IPWTRFCKENINDKNFPFWLWIESILELIKKHLLPLWNDGCIMGFISKERERALL
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CCDS32 YSGCQITWAKFCKENMAGKGFSFWVWLDNIIDLVKKYILALWNEGYIMGFISKERERAIL
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 KDQQPGTFLLRFSESSREGAITFTWVERSQNGGEPDFHAVEPYTKKELSAVTFPDIIRNY
. . ::::::::::::.::..::::::.. .: . ....::::::..:. ..: .:: .:
CCDS32 STKPPGTFLLRFSESSKEGGVTFTWVEKDISG-KTQIQSVEPYTKQQLNNMSFAEIIMGY
600 610 620 630 640 650
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pF1KB3 KVMAAENIPENPLKYLYPNIDKDHAFGKYYSRPKEAPEPMELDGPKGTGYIKTELISVSE
:.: : :: .:: ::::.: :..::::: ::. .: : : : .. :.::..: :.
CCDS32 KIMDATNILVSPLVYLYPDIPKEEAFGKY-CRPESQEHP-EAD-PGAAPYLKTKFICVT-
660 670 680 690 700 710
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pF1KB3 VHPSRLQTTDNLLPMSPEEFDEVSRIVGSVEFDSMMNTV
:. ..: .: ::::. .:
CCDS32 --PTTCSNTIDL-PMSPRTLDSLMQFGNNGEGAEPSAGGQFESLTFDMELTSECATSPM
720 730 740 750 760
>>CCDS32656.1 STAT3 gene_id:6774|Hs108|chr17 (770 aa)
initn: 1957 init1: 916 opt: 2643 Z-score: 2578.8 bits: 487.9 E(32554): 2.6e-137
Smith-Waterman score: 2643; 53.0% identity (81.3% similar) in 739 aa overlap (3-734:1-732)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MWMSQWYELQQLDSKFLEQVHQLYDDSFPMEIRQYLAQWLEKQDWEHAANDVSFATIRFH
:.:: .:::::...:::.::::.::::::.::.:: :.:.::: .::. : ::. ::
CCDS32 MAQWNQLQQLDTRYLEQLHQLYSDSFPMELRQFLAPWIESQDWAYAASKESHATLVFH
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DLLSQLDDQYSRFSLENNFLLQHNIRKSKRNLQDNFQEDPIQMSMIIYSCLKEERKILEN
.::...:.::::: :.: : :::.:. :. ::. . : :.... :. :: :: ..:..
CCDS32 NLLGEIDQQYSRFLQESNVLYQHNLRRIKQFLQSRYLEKPMEIARIVARCLWEESRLLQT
60 70 80 90 100 110
130 140 150 160 170
pF1KB3 AQRFNQ--AQSGNIQSTVMLDKQKELDSKVRNVKDKVMCIEHEIKSLEDLQDEYDFKCKT
: : .:... ..:. .::. :......:. .:. .:...: .:.:::..::. ::
CCDS32 AATAAQQGGQANHPTAAVVTEKQQMLEQHLQDVRKRVQDLEQKMKVVENLQDDFDFNYKT
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 L--QNREHETNGVAKSDQKQEQLLLKKMYLMLDNKRKEVVHKIIELLNVTELTQNALIND
: :. .. :: .: .:.. :..: ::. :. .: .. ::.. : .:..: ..
CCDS32 LKSQGDMQDLNGNNQSVTRQKMQQLEQMLTALDQMRRSIVSELAGLLSAMEYVQKTLTDE
180 190 200 210 220 230
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pF1KB3 ELVEWKRRQQSACIGGPPNACLDQLQNWFTIVAESLQQVRQQLKKLEELEQKYTYEHDPI
::..:::::: :::::::: :::.:.::.: .::: :.:::.::::::.:: .:. :::
CCDS32 ELADWKRRQQIACIGGPPNICLDRLENWITSLAESQLQTRQQIKKLEELQQKVSYKGDPI
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 TKNKQVLWDRTFSLFQQLIQSSFVVERQPCMPTHPQRPLVLKTGVQFTVKLRLLVKLQEL
.... .: .: ::..:..:.:::::::::: ::.::::.:::::::.:.:::::. ::
CCDS32 VQHRPMLEERIVELFRNLMKSAFVVERQPCMPMHPDRPLVIKTGVQFTTKVRLLVKFPEL
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 NYNLKVKVLFDKDVNERNTVKGFRKFNILGTHTKVMNMEESTNGSLAAEFRHLQLKEQK-
::.::.:: .::: .. ...: ::::::::.:::::::::.::::.:::.:: :.::.
CCDS32 NYQLKIKVCIDKDSGDVAALRGSRKFNILGTNTKVMNMEESNNGSLSAEFKHLTLREQRC
360 370 380 390 400 410
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pF1KB3 -NAGTRTNEGPLIVTEELHSLSFETQLCQPGLVIDLETTSLPVVVISNVSQLPSGWASIL
:.: . .. :::::::: ..:::.. . :: ::::: :::::::::. :.:..:::::
CCDS32 GNGGRANCDASLIVTEELHLITFETEVYHQGLKIDLETHSLPVVVISNICQMPNAWASIL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]