Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3674
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3674, 515 aa
1>>>pF1KB3674 515 - 515 aa - 515 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 10.5092+/-0.00111; mu= -4.4172+/- 0.065
mean_var=462.5823+/-101.667, 0's: 0 Z-trim(113.6): 464 B-trim: 0 in 0/54
Lambda= 0.059632
statistics sampled from 13639 (14251) to 13639 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.751), E-opt: 0.2 (0.438), width: 16
Scan time: 3.220
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 3544 319.7 5.2e-87
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 948 96.6 1.2e-19
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 865 89.0 9.8e-18
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 847 87.4 2.8e-17
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 847 87.5 2.9e-17
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 821 85.2 1.4e-16
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 810 84.3 2.6e-16
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 785 82.1 1.2e-15
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 758 79.8 5.8e-15
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 755 79.8 8.9e-15
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 743 78.5 1.4e-14
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 725 76.9 3.7e-14
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 721 76.7 5.8e-14
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 721 76.7 5.8e-14
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 721 76.7 6.1e-14
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 717 76.3 6.9e-14
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 717 76.4 7.4e-14
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 711 75.7 9.1e-14
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 710 75.7 1e-13
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 710 75.8 1.1e-13
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 699 74.8 2e-13
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 699 74.8 2.2e-13
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 693 74.2 2.9e-13
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 693 74.3 3.1e-13
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 684 73.8 7.1e-13
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 665 72.2 2.3e-12
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 628 68.5 1.2e-11
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 624 68.2 1.5e-11
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 629 69.0 1.7e-11
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 606 66.6 4.4e-11
>>CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 (527 aa)
initn: 3544 init1: 3544 opt: 3544 Z-score: 1675.7 bits: 319.7 E(32554): 5.2e-87
Smith-Waterman score: 3544; 100.0% identity (100.0% similar) in 515 aa overlap (1-515:13-527)
10 20 30 40
pF1KB3 MAAYNGGTSAAAAGHHHHHHHHLPHLPPPHLHHHHHPQHHLHPGSAAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 MSLCGARANAKMMAAYNGGTSAAAAGHHHHHHHHLPHLPPPHLHHHHHPQHHLHPGSAAA
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 VHPVQQHTSSAAAAAAAAAAAAAMLNPGQQQPYFPSPAPGQAPGPAAAAPAQVQAAAAAT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VHPVQQHTSSAAAAAAAAAAAAAMLNPGQQQPYFPSPAPGQAPGPAAAAPAQVQAAAAAT
70 80 90 100 110 120
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 VKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRPIGYGAFGVVWSVTDPRDGKRVALKKMPNVFQNLVSCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRPIGYGAFGVVWSVTDPRDGKRVALKKMPNVFQNLVSCK
130 140 150 160 170 180
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 RVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVTELMQSDLHKIIVSPQPLSSDH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 RVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVTELMQSDLHKIIVSPQPLSSDH
190 200 210 220 230 240
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 VKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLKICDFGLARVEELDESRHMTQE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLKICDFGLARVEELDESRHMTQE
250 260 270 280 290 300
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGRRILFQAQSPIQQLDLITDLLGTP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 VVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGRRILFQAQSPIQQLDLITDLLGTP
310 320 330 340 350 360
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 SLEAMRTACEGAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQATHEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 SLEAMRTACEGAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQATHEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKD
370 380 390 400 410 420
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 ALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFEPVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 ALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFEPVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEI
430 440 450 460 470 480
470 480 490 500 510
pF1KB3 IHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQPSEMPPSPLVWE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS11 IHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQPSEMPPSPLVWE
490 500 510 520
>>CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 (816 aa)
initn: 928 init1: 361 opt: 948 Z-score: 466.5 bits: 96.6 E(32554): 1.2e-19
Smith-Waterman score: 968; 41.7% identity (66.4% similar) in 434 aa overlap (89-510:16-426)
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 AAAAAAAAAAAAAMLNPGQQQPYFPSPAPGQAPGPAAAAPAQVQAAAAATVKAHHHQHSH
. :::. : ::.. :..:: : . .:
CCDS11 MAEPLKEEDGEDGSAEPPGPVKAEPAHTAASVAAKNLALLKARSF
10 20 30 40
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 HPQQQLDIEPD--RPIGYGAFGVVWSVTDPRDGKRVALKKMPNVFQNLVSCKRVFRELKM
.. : . . :: ::.::: :. :..::.::.::.:. ... ::..::::.
CCDS11 DVTFDVGDEYEIIETIGNGAYGVVSSARRRLTGQQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKI
50 60 70 80 90 100
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LCFFKHDNVLSALDILQPPHIDY--FEEIYVVTELMQSDLHKIIVSPQPLSSDHVKVFLY
: :::::... :::.: . : :. .::: .::.::::.:: : :::. .::. :::
CCDS11 LKHFKHDNIIAIKDILRPT-VPYGEFKSVYVVLDLMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLY
110 120 130 140 150 160
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 QILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLKICDFGLARVEELDESRH---MTQEVVT
:.::::::.::: ..:::.::.::::: :: ::: :::.:: . ..: ::. :.:
CCDS11 QLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKIGDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVAT
170 180 190 200 210 220
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 QYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGRRILFQAQSPIQQLDLITDLLGTPSLE
..:::::.... ..:..:::.:::::::.:.:.:: :: ... ..::.:: .:::::
CCDS11 RWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLARRQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPA
230 240 250 260 270 280
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 AMRTA-CEGAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQATHEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKDAL
..... : ..:.: : .:: .: :. : ..:. :: ::: :.:: :::: ::
CCDS11 VIQAVGAERVRAYIQSLPPRQP-VP-WETVYPGADRQALSLLGRMLRFEPSARISAAAAL
290 300 310 320 330 340
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 AHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFEPVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEIIH
::.: .:: : :: : :: .:... . ...:: :
CCDS11 RHPFLA----KYHD----------------PDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIKEAIV
350 360 370 380
480 490 500 510
pF1KB3 QFILE---QQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISST-VAQPSEMPPSPLVWE
: . ...: : . ..:. : . : .:: ::
CCDS11 AEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPAPPPCP
390 400 410 420 430 440
CCDS11 GPAPDTIDLTLQPPPPVSEPAPPKKDGAISDNTKAALKAALLKSLRSRLRDGPSAPLEAP
450 460 470 480 490 500
>>CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 (360 aa)
initn: 813 init1: 291 opt: 865 Z-score: 431.9 bits: 89.0 E(32554): 9.8e-18
Smith-Waterman score: 865; 45.2% identity (75.9% similar) in 303 aa overlap (122-417:17-315)
100 110 120 130 140
pF1KB3 GPAAAAPAQVQAAAAATVKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRP----IGYGAFGVVWSVTDPR
: .:. : :: ::.:.: :. :
CCDS13 MAAAAAAGAGPEMVRGQVFDVGPRYTNLSYIGEGAYGMVCSAYDNV
10 20 30 40
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 DGKRVALKKMPNVFQNLVSCKRVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVT
. :::.::. . :.. . :.:..::.:.: :.:.:... ::.. : :. ....:.:
CCDS13 NKVRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIRAPTIEQMKDVYIVQ
50 60 70 80 90 100
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 ELMQSDLHKIIVSPQPLSSDHVKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLK
.::..::.:.. . : ::.::. :::::::::::.:::..::::.::.:::.:..: ::
CCDS13 DLMETDLYKLL-KTQHLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLLNTTCDLK
110 120 130 140 150 160
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ICDFGLARVEELDESR--HMTQEVVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGR
::::::::: . :... .:. :.:..::::::...:. :...:::::::::.::.:.
CCDS13 ICDFGLARVADPDHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSN
170 180 190 200 210 220
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RILFQAQSPIQQLDLITDLLGTPSLEAMRTACE-GAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQA
: .: .. ..::. : .::.:: : . . :. ..: :::. ..: : .:
CCDS13 RPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKN-KVP-WNRLFPNA
230 240 250 260 270 280
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 THEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKDALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFE
.:. :: .::.:.: ::: ...:::::::..
CCDS13 DSKALDLLDKMLTFNPHKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEK
290 300 310 320 330 340
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 PVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEIIHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQP
CCDS13 LKELIFEETARFQPGYRS
350 360
>>CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (357 aa)
initn: 784 init1: 289 opt: 847 Z-score: 423.6 bits: 87.4 E(32554): 2.8e-17
Smith-Waterman score: 847; 44.2% identity (74.3% similar) in 303 aa overlap (122-417:34-332)
100 110 120 130 140
pF1KB3 GPAAAAPAQVQAAAAATVKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRP----IGYGAFGVVWSVTDPR
: .:. : :: ::.:.: :. :
CCDS42 AAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHV
10 20 30 40 50 60
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 DGKRVALKKMPNVFQNLVSCKRVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVT
:::.::. . :.. . :.:..::...: :.:.::.. :::. .. ....:.:
CCDS42 RKTRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYIVQ
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 ELMQSDLHKIIVSPQPLSSDHVKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLK
.::..::.:.. : : ::.::. :::::::::::.:::..::::.::.:::.:..: ::
CCDS42 DLMETDLYKLLKSQQ-LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLK
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ICDFGLARVE--ELDESRHMTQEVVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGR
::::::::. : :.. .:. :.:..::::::...:. :...:::::::::.::.:.
CCDS42 ICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSN
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RILFQAQSPIQQLDLITDLLGTPSLEAMRTACE-GAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQA
: .: .. ..::. : .::.:: : . . :. .. : : . . : ..
CCDS42 RPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSK--TKVAWAKLFPKS
250 260 270 280 290
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pF1KB3 THEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKDALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFE
.:. :: :::.:.:.:::....:::::::..
CCDS42 DSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEVGQSPAAVGLGAGEQGGT
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 PVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEIIHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQP
>>CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 (379 aa)
initn: 784 init1: 289 opt: 847 Z-score: 423.3 bits: 87.5 E(32554): 2.9e-17
Smith-Waterman score: 847; 44.2% identity (74.3% similar) in 303 aa overlap (122-417:34-332)
100 110 120 130 140
pF1KB3 GPAAAAPAQVQAAAAATVKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRP----IGYGAFGVVWSVTDPR
: .:. : :: ::.:.: :. :
CCDS10 AAAQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHV
10 20 30 40 50 60
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 DGKRVALKKMPNVFQNLVSCKRVFRELKMLCFFKHDNVLSALDILQPPHIDYFEEIYVVT
:::.::. . :.. . :.:..::...: :.:.::.. :::. .. ....:.:
CCDS10 RKTRVAIKKI-SPFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILRASTLEAMRDVYIVQ
70 80 90 100 110 120
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 ELMQSDLHKIIVSPQPLSSDHVKVFLYQILRGLKYLHSAGILHRDIKPGNLLVNSNCVLK
.::..::.:.. : : ::.::. :::::::::::.:::..::::.::.:::.:..: ::
CCDS10 DLMETDLYKLLKSQQ-LSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLK
130 140 150 160 170 180
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 ICDFGLARVE--ELDESRHMTQEVVTQYYRAPEILMGSRHYSNAIDIWSVGCIFAELLGR
::::::::. : :.. .:. :.:..::::::...:. :...:::::::::.::.:.
CCDS10 ICDFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSN
190 200 210 220 230 240
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RILFQAQSPIQQLDLITDLLGTPSLEAMRTACE-GAKAHILRGPHKQPSLPVLYTLSSQA
: .: .. ..::. : .::.:: : . . :. .. : : . . : ..
CCDS10 RPIFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSK--TKVAWAKLFPKS
250 260 270 280 290
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 THEAVHLLCRMLVFDPSKRISAKDALAHPYLDEGRLRYHTCMCKCCFSTSTGRVYTSDFE
.:. :: :::.:.:.:::....:::::::..
CCDS10 DSKALDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKER
300 310 320 330 340 350
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 PVTNPKFDDTFEKNLSSVRQVKEIIHQFILEQQKGNRVPLCINPQSAAFKSFISSTVAQP
CCDS10 LKELIFQETARFQPGVLEAP
360 370
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 728 init1: 428 opt: 821 Z-score: 411.4 bits: 85.2 E(32554): 1.4e-16
Smith-Waterman score: 831; 42.1% identity (69.9% similar) in 349 aa overlap (130-474:28-346)
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 QVQAAAAATVKAHHHQHSHHPQQQLDIEPDRPIGYGAFGVVWSVTDPRDGKRVALKKMPN
::.: ::.: : :. : : ..::.::.
CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSR
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CCDS14 VDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGARVSKETPL
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CCDS64 MCTVVDPRIVRRYLLRRQLGQGAYGIVWKAVDRRTGEVVAIKKIFD
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CCDS64 AFRDKTDAQRTFREITLLQEFGDHPNIISLLDVIRAEN-D--RDIYLVFEFMDTDLNAVI
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CCDS64 DLPEGPEDQAVTEYVATRWYRAPEVLLSSHRYTLGVDMWSLGCILGEMLRGRPLFPGTST
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: :
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]