Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3671
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3671, 376 aa
1>>>pF1KB3671 376 - 376 aa - 376 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.8084+/-0.00104; mu= 14.0441+/- 0.062
mean_var=71.1395+/-14.421, 0's: 0 Z-trim(103.1): 54 B-trim: 9 in 1/49
Lambda= 0.152061
statistics sampled from 7210 (7261) to 7210 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.595), E-opt: 0.2 (0.223), width: 16
Scan time: 2.730
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 ( 376) 2458 548.7 3.1e-156
CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 376) 1569 353.7 1.6e-97
CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 380) 1569 353.7 1.6e-97
CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 ( 395) 1569 353.7 1.6e-97
CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 374) 1561 351.9 5.3e-97
CCDS4477.1 SERPINB1 gene_id:1992|Hs108|chr6 ( 379) 1246 282.8 3.4e-76
CCDS42442.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 242) 1006 230.1 1.6e-60
CCDS11990.1 SERPINB10 gene_id:5273|Hs108|chr18 ( 397) 996 228.0 1.1e-59
CCDS11989.1 SERPINB2 gene_id:5055|Hs108|chr18 ( 415) 996 228.0 1.2e-59
CCDS11986.1 SERPINB4 gene_id:6318|Hs108|chr18 ( 390) 967 221.6 9.3e-58
CCDS11987.1 SERPINB3 gene_id:6317|Hs108|chr18 ( 390) 943 216.3 3.6e-56
CCDS77195.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 400) 918 210.9 1.6e-54
CCDS11985.1 SERPINB13 gene_id:5275|Hs108|chr18 ( 391) 915 210.2 2.5e-54
CCDS77194.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 425) 906 208.2 1.1e-53
CCDS11984.1 SERPINB12 gene_id:89777|Hs108|chr18 ( 405) 892 205.2 8.6e-53
CCDS32839.1 SERPINB5 gene_id:5268|Hs108|chr18 ( 375) 890 204.7 1.1e-52
CCDS11988.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 380) 800 185.0 9.7e-47
CCDS1313.1 SERPINC1 gene_id:462|Hs108|chr1 ( 464) 781 180.8 2.1e-45
CCDS62460.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 ( 192) 767 177.6 8e-45
CCDS58633.1 SERPINB7 gene_id:8710|Hs108|chr18 ( 363) 712 165.7 6e-41
CCDS3203.1 SERPINI1 gene_id:5274|Hs108|chr3 ( 410) 673 157.1 2.5e-38
CCDS9925.1 SERPINA1 gene_id:5265|Hs108|chr14 ( 418) 669 156.3 4.7e-38
CCDS3200.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 405) 663 154.9 1.1e-37
CCDS75047.1 SERPINI2 gene_id:5276|Hs108|chr3 ( 415) 663 154.9 1.2e-37
CCDS9928.1 SERPINA5 gene_id:5104|Hs108|chr14 ( 406) 661 154.5 1.5e-37
CCDS41982.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 435) 661 154.5 1.6e-37
CCDS9924.1 SERPINA6 gene_id:866|Hs108|chr14 ( 405) 656 153.4 3.3e-37
CCDS32150.1 SERPINA3 gene_id:12|Hs108|chr14 ( 423) 639 149.7 4.6e-36
CCDS9926.1 SERPINA12 gene_id:145264|Hs108|chr14 ( 414) 624 146.4 4.4e-35
CCDS8239.1 SERPINH1 gene_id:871|Hs108|chr11 ( 418) 610 143.3 3.7e-34
CCDS46526.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 397) 598 140.7 2.2e-33
CCDS46525.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 409) 598 140.7 2.3e-33
CCDS9927.1 SERPINA4 gene_id:5267|Hs108|chr14 ( 427) 596 140.2 3.2e-33
CCDS5711.1 SERPINE1 gene_id:5054|Hs108|chr7 ( 402) 591 139.1 6.4e-33
CCDS2460.1 SERPINE2 gene_id:5270|Hs108|chr2 ( 398) 588 138.5 1e-32
CCDS13783.1 SERPIND1 gene_id:3053|Hs108|chr22 ( 499) 587 138.3 1.4e-32
CCDS32149.1 SERPINA11 gene_id:256394|Hs108|chr14 ( 422) 583 137.4 2.3e-32
CCDS77196.1 SERPINB11 gene_id:89778|Hs108|chr18 ( 305) 579 136.5 3.1e-32
CCDS9923.1 SERPINA10 gene_id:51156|Hs108|chr14 ( 444) 570 134.5 1.7e-31
CCDS14518.1 SERPINA7 gene_id:6906|Hs108|chrX ( 415) 551 130.4 2.9e-30
CCDS61542.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 286) 481 114.9 8.8e-26
CCDS41983.1 SERPINA9 gene_id:327657|Hs108|chr14 ( 335) 458 109.9 3.3e-24
CCDS53870.1 SERPINE3 gene_id:647174|Hs108|chr13 ( 424) 454 109.1 7.5e-24
CCDS11011.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 491) 450 108.2 1.6e-23
CCDS42441.1 HMSD gene_id:284293|Hs108|chr18 ( 139) 402 97.5 7.6e-21
CCDS54064.1 SERPINF2 gene_id:5345|Hs108|chr17 ( 427) 395 96.1 6e-20
CCDS11012.1 SERPINF1 gene_id:5176|Hs108|chr17 ( 418) 381 93.1 4.9e-19
CCDS7962.1 SERPING1 gene_id:710|Hs108|chr11 ( 500) 353 87.0 4.1e-17
>>CCDS4478.1 SERPINB9 gene_id:5272|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 2458 init1: 2458 opt: 2458 Z-score: 2918.5 bits: 548.7 E(32554): 3.1e-156
Smith-Waterman score: 2458; 100.0% identity (100.0% similar) in 376 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NTEEDIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 NTEEDIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 FIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 REMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 REMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELS
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 TVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADL
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLFFIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS44 SAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLFFIR
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB3 HNRANSILFCGRFSSP
::::::::::::::::
CCDS44 HNRANSILFCGRFSSP
370
>>CCDS4479.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (376 aa)
initn: 1435 init1: 1033 opt: 1569 Z-score: 1864.4 bits: 353.7 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1569; 62.8% identity (86.3% similar) in 379 aa overlap (1-376:1-376)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSL
:..:..:.::::. ::: : .:: :.::: ::.:.: ::::: .:::::::.:::: ::.
CCDS44 MDVLAEANGTFALNLLKTLGKDN-SKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQILSF
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110
pF1KB3 NTEE---DIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELK
: :::..::::::::::.::::::: ::::::::.:.:::.:..:: .::.::..
CCDS44 NKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQAEME
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 ELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDE
::.:: :.:.:::::::::..:::::: ::: .:.: ::::::::.::.:.:.: ::.
CCDS44 ELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDEQFDK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 TYTREMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGV
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CCDS44 ENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLPDETT
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 ELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGK
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CCDS44 DLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAFELGK
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 ADLSAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADHPFLF
::.:.:: . :: ::: ::::::::::::::::::.. ... .: . :::::::::::
CCDS44 ADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCA-RFVPRFCADHPFLF
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB3 FIRHNRANSILFCGRFSSP
::.:...:.::::::::::
CCDS44 FIQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370
>>CCDS75386.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (380 aa)
initn: 1435 init1: 1033 opt: 1569 Z-score: 1864.4 bits: 353.7 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1569; 62.8% identity (86.3% similar) in 379 aa overlap (1-376:5-380)
10 20 30 40 50
pF1KB3 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQ
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CCDS75 MSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGKDN-SKNVFFSPMSMSCALAMVYMGAKGNTAAQMAQ
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 ALSLNTEE---DIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYH
::.: :::..::::::::::.::::::: ::::::::.:.:::.:..:: .::.
CCDS75 ILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSCDFLSSFRDSCQKFYQ
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 AELKELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNE
::..::.:: :.:.:::::::::..:::::: ::: .:.: ::::::::.::.:.:.:
CCDS75 AEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTRLVLVNAVYFRGNWDE
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 PFDETYTREMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLP
::. :.: ::....:..:::::....::: ...::. .:.: :::. :::.....::
CCDS75 QFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILVLPYVGKELNMIIMLP
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 DDGVELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAF
:. ..: :::: ::.::.. ::. : : :::: ::.:::.:.::::::::.::..:::
CCDS75 DETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESYDMESVLRNLGMTDAF
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 QQGKADLSAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVVAECCMESGPRFCADH
. ::::.:.:: . :: ::: ::::::::::::::::::.. ... .: . :::::::
CCDS75 ELGKADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMMMRCA-RFVPRFCADH
300 310 320 330 340 350
360 370
pF1KB3 PFLFFIRHNRANSILFCGRFSSP
::::::.:...:.::::::::::
CCDS75 PFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370 380
>>CCDS75387.1 SERPINB6 gene_id:5269|Hs108|chr6 (395 aa)
initn: 1435 init1: 1033 opt: 1569 Z-score: 1864.1 bits: 353.7 E(32554): 1.6e-97
Smith-Waterman score: 1569; 62.8% identity (86.3% similar) in 379 aa overlap (1-376:20-395)
10 20 30 40
pF1KB3 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAM
:..:..:.::::. ::: : .:: :.::: ::.:.: ::::
CCDS75 MSSRQRGNFNYKLAFKSAIMDVLAEANGTFALNLLKTLGKDN-SKNVFFSPMSMSCALAM
10 20 30 40 50
50 60 70 80 90
pF1KB3 VLLGAKGNTATQMAQALSLNTEE---DIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTC
: .:::::::.:::: ::.: :::..::::::::::.::::::: ::::::::.:
CCDS75 VYMGAKGNTAAQMAQILSFNKSGGGGDIHQGFQSLLTEVNKTGTQYLLRMANRLFGEKSC
60 70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 QFLSTFKESCLQFYHAELKELSFIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETR
.:::.:..:: .::.::..::.:: :.:.:::::::::..:::::: ::: .:.: ::
CCDS75 DFLSSFRDSCQKFYQAEMEELDFISAVEKSRKHINTWVAEKTEGKIAELLSPGSVDPLTR
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 LVLVNAIYFKGKWNEPFDETYTREMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLE
::::::.::.:.:.: ::. :.: ::....:..:::::....::: ...::. .:.:
CCDS75 LVLVNAVYFRGNWDEQFDKENTEERLFKVSKNEEKPVQMMFKQSTFKKTYIGEIFTQILV
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LPYARKELSLLVLLPDDGVELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDY
:::. :::.....:::. ..: :::: ::.::.. ::. : : :::: ::.:::.:.:
CCDS75 LPYVGKELNMIIMLPDETTDLRTVEKELTYEKFVEWTRLDMMDEEEVEVSLPRFKLEESY
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 DMESVLRHLGIVDAFQQGKADLSAMSAERDLCLSKFVHKSFVEVNEEGTEAAAASSCFVV
:::::::.::..:::. ::::.:.:: . :: ::: ::::::::::::::::::.. ...
CCDS75 DMESVLRNLGMTDAFELGKADFSGMS-QTDLSLSKVVHKSFVEVNEEGTEAAAATAAIMM
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370
pF1KB3 AECCMESGPRFCADHPFLFFIRHNRANSILFCGRFSSP
.: . :::::::::::::.:...:.::::::::::
CCDS75 MRCA-RFVPRFCADHPFLFFIQHSKTNGILFCGRFSSP
360 370 380 390
>>CCDS11991.1 SERPINB8 gene_id:5271|Hs108|chr18 (374 aa)
initn: 1372 init1: 828 opt: 1561 Z-score: 1855.0 bits: 351.9 E(32554): 5.3e-97
Smith-Waterman score: 1561; 62.6% identity (87.0% similar) in 377 aa overlap (1-376:1-374)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 METLSNASGTFAIRLLKILCQDNPSHNVFCSPVSISSALAMVLLGAKGNTATQMAQALSL
:. : .:.::::: :.::: ... :.::: ::.:::::::::..::::.::.::.::: :
CCDS11 MDDLCEANGTFAISLFKILGEEDNSRNVFFSPMSISSALAMVFMGAKGSTAAQMSQALCL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 NTEEDIHRAFQSLLTEVNKAGTQYLLRTANRLFGEKTCQFLSTFKESCLQFYHAELKELS
. ::::.:::::.:::..::::::::::::::::::.:: ::: : .::.:::.:::
CCDS11 YKDGDIHRGFQSLLSEVNRTGTQYLLRTANRLFGEKTCDFLPDFKEYCQKFYQAELEELS
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FIRAAEESRKHINTWVSKKTEGKIEELLPGSSIDAETRLVLVNAIYFKGKWNEPFDETYT
: . .:: ::::: ::..:::::: :.: ....: :.::::::::::::::: ::. ::
CCDS11 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 REMPFKINQEEQRPVQMMYQEATFKLAHVGEVRAQLLELPYARKELSLLVLLPDDGVELS
: : :: : ::.. ::::..:: ::.... ::..:.:::::...:::...:::::...:.
CCDS11 RGMLFKTN-EEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLA
190 200 210 220 230
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVLRHLGIVDAFQQGKADL
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360 370
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360 370
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CCDS44 FFIRHNSSGSILFLGRFSSP
360 370
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CCDS42 FAEDTEECRKHINDWVAEKTEGKISEVLDAGTVDPLTKLVLVNAIYFKGKWNEQFDRKYT
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CCDS42 RGMLFKTN-EEKKTVQMMFKEAKFKMGYADEVHTQVLELPYVEEELSMVILLPDDNTDLA
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. :
CCDS42 VKE
240
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CCDS11 NRDQGVKCDPESEKKRKMEFNLSNSEEIHSDFQTLISEILKPNDDYLLKTANAIYGEKTY
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CCDS11 AFHNKYLEDMKTYFGAEPQPVNFVEASDQIRKDINSWVERQTEGKIQNLLPDDSVDSTTR
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CCDS11 MILVNALYFKGIWEHQFLVQNTTEKPFRINETTSKPVQMMFMKKKLHIFHIEKPKAVGLQ
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CCDS11 LYYKSRDLSLLILLPEDINGLEQLEKAITYEKLNEWTSADMMELYEVQLHLPKFKLEDSY
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CCDS11 DLKSTLSSMGMSDAFSQSKADFSGMSSARNLFLSNVFHKAFVEINEQGTEAAAGSGSEID
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CCDS11 IRIRVPS-IEFNANHPFLFFIRHNKTNTILFYGRLCSP
370 380 390
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CCDS11 NEVGANAVTPMTPENFTSCGFMQQIQKGSYPDAILQAQAADKIHSSFRSLSSAINASTGN
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CCDS11 YLLESVNKLFGEKSASFREEYIRLCQKYYSSEPQAVDFLECAEEARKKINSWVKTQTKGK
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CCDS11 LNIGYIEDLKAQILELPYA-GDVSMFLLLPDEIADVSTGLELLESEITYDKLNKWTSKDK
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CCDS11 MAEDEVEVYIPQFKLEEHYELRSILRSMGMEDAFNKGRANFSGMSERNDLFLSEVFHQAM
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CCDS11 VDVNEEGTEAAAGTGGVMTGRTG-HGGPQFVADHPFLFLIMHKITNCILFFGRFSSP
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CCDS11 MNSLSEANTKFMFDLFQQF-RKSKENNIFYSPISITSALGMVLLGAKDNTAQQISKVLHF
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CCDS11 DQVTENTTEKAATYHVDRSGNVHHQFQKLLTEFNKSTDAYELKIANKLFGEKTYQFLQEY
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CCDS11 IYFKGQWENKFKKENTKEEKFWPNKNTYKSVQMMRQYNSFNFALLEDVQAKVLEIPYKGK
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pF1KB3 ELSLLVLLPDDGVELSTVEKSLTFEKLTAWTKPDCMKSTEVEVLLPKFKLQEDYDMESVL
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]