Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3657
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3657, 360 aa
1>>>pF1KB3657 360 - 360 aa - 360 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.0533+/-0.00147; mu= 1.5889+/- 0.083
mean_var=270.6007+/-63.609, 0's: 0 Z-trim(105.1): 670 B-trim: 138 in 1/48
Lambda= 0.077967
statistics sampled from 7475 (8258) to 7475 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.619), E-opt: 0.2 (0.254), width: 16
Scan time: 2.620
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 2419 286.4 2.6e-77
CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 360) 2322 275.5 5e-74
CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 ( 364) 1821 219.1 4.7e-57
CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 ( 307) 1618 196.2 3.1e-50
CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 367) 1597 193.9 1.8e-49
CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 ( 365) 1487 181.6 9.5e-46
CCDS13795.1 MAPK1 gene_id:5594|Hs108|chr22 ( 360) 1081 135.9 5.3e-32
CCDS10672.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 379) 1071 134.8 1.2e-31
CCDS11206.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 816) 1019 129.3 1.1e-29
CCDS42149.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 357) 1012 128.1 1.1e-29
CCDS77688.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 ( 357) 958 122.0 7.7e-28
CCDS43410.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 938 119.8 3.8e-27
CCDS43409.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 382) 938 119.8 3.8e-27
CCDS4454.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 938 119.9 4.1e-27
CCDS4453.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 424) 938 119.9 4.1e-27
CCDS7226.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 928 118.7 8.3e-27
CCDS7223.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 928 118.8 8.9e-27
CCDS43247.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 422) 907 116.4 4.5e-26
CCDS3612.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 426) 907 116.4 4.6e-26
CCDS34026.1 MAPK10 gene_id:5602|Hs108|chr4 ( 464) 907 116.4 4.8e-26
CCDS7225.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 384) 905 116.1 5e-26
CCDS7224.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 427) 905 116.2 5.3e-26
CCDS47356.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 242) 843 108.9 4.7e-24
CCDS42148.1 MAPK3 gene_id:5595|Hs108|chr16 ( 335) 792 103.3 3.1e-22
CCDS11224.2 NLK gene_id:51701|Hs108|chr17 ( 527) 785 102.8 7.1e-22
CCDS11207.1 MAPK7 gene_id:5598|Hs108|chr17 ( 677) 767 100.9 3.4e-21
CCDS10147.1 MAPK6 gene_id:5597|Hs108|chr15 ( 721) 743 98.2 2.3e-20
CCDS78103.1 MAPK9 gene_id:5601|Hs108|chr5 ( 214) 730 96.1 2.9e-20
CCDS60527.1 MAPK8 gene_id:5599|Hs108|chr10 ( 308) 721 95.3 7.4e-20
CCDS6409.2 MAPK15 gene_id:225689|Hs108|chr8 ( 544) 715 94.9 1.7e-19
CCDS11736.1 CDK3 gene_id:1018|Hs108|chr17 ( 305) 626 84.6 1.2e-16
CCDS8898.1 CDK2 gene_id:1017|Hs108|chr12 ( 298) 619 83.8 2.1e-16
CCDS3999.1 CDK7 gene_id:1022|Hs108|chr5 ( 346) 582 79.7 4e-15
CCDS35060.1 CDK20 gene_id:23552|Hs108|chr9 ( 346) 580 79.5 4.7e-15
CCDS75398.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 583) 584 80.2 4.8e-15
CCDS4516.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 623) 584 80.3 5e-15
CCDS75399.1 MAK gene_id:4117|Hs108|chr6 ( 648) 584 80.3 5.1e-15
CCDS4949.1 ICK gene_id:22858|Hs108|chr6 ( 632) 582 80.1 5.9e-15
CCDS47748.1 CDK5 gene_id:1020|Hs108|chr7 ( 292) 573 78.6 7.3e-15
CCDS33184.1 CDKL4 gene_id:344387|Hs108|chr2 ( 315) 568 78.1 1.1e-14
CCDS3570.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 493) 568 78.3 1.5e-14
CCDS82933.1 CDKL2 gene_id:8999|Hs108|chr4 ( 570) 568 78.4 1.7e-14
CCDS47265.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 455) 557 77.1 3.4e-14
CCDS9699.1 CDKL1 gene_id:8814|Hs108|chr14 ( 358) 554 76.6 3.7e-14
CCDS44408.1 CDK1 gene_id:983|Hs108|chr10 ( 297) 552 76.3 3.8e-14
CCDS47264.1 CDKL3 gene_id:51265|Hs108|chr5 ( 592) 557 77.2 4e-14
CCDS42437.1 MAPK4 gene_id:5596|Hs108|chr18 ( 587) 555 77.0 4.6e-14
CCDS9061.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 554 76.8 4.7e-14
CCDS53819.1 CDK17 gene_id:5128|Hs108|chr12 ( 523) 554 76.8 4.7e-14
CCDS5628.1 CDK6 gene_id:1021|Hs108|chr7 ( 326) 548 75.9 5.5e-14
>>CCDS4815.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 2419 init1: 2419 opt: 2419 Z-score: 1501.4 bits: 286.4 E(32554): 2.6e-77
Smith-Waterman score: 2419; 100.0% identity (100.0% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
310 320 330 340 350 360
>>CCDS4816.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (360 aa)
initn: 2322 init1: 2322 opt: 2322 Z-score: 1442.5 bits: 275.5 E(32554): 5e-74
Smith-Waterman score: 2322; 96.1% identity (98.6% similar) in 360 aa overlap (1-360:1-360)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::. :.::.:
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
:: : :.... :. ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 TPGAELLKKISSESARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
310 320 330 340 350 360
>>CCDS14090.1 MAPK11 gene_id:5600|Hs108|chr22 (364 aa)
initn: 1821 init1: 1821 opt: 1821 Z-score: 1137.9 bits: 219.1 E(32554): 4.7e-57
Smith-Waterman score: 1821; 73.2% identity (91.5% similar) in 351 aa overlap (1-351:1-351)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
:: : :::::::::.::::.: :.: :::::::::::.:.:.. .:::::::::::
CCDS14 MSGPRAGFYRQELNKTVWEVPQRLQGLRPVGSGAYGSVCSAYDARLRQKVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
:.:::.:::::::::::.::::::::::::::: :.:.:..::::: :::::::::::::
CCDS14 SLIHARRTYRELRLLKHLKHENVIGLLDVFTPATSIEDFSEVYLVTTLMGADLNNIVKCQ
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pF1KB3 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
:.:.:::::.::.:::::::::: ::::::::::.::::::::.::::::::..:.:::
CCDS14 ALSDEHVQFLVYQLLRGLKYIHSAGIIHRDLKPSNVAVNEDCELRILDFGLARQADEEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::: :..::::.:.:.::..::...:
CCDS14 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLQGKALFPGSDYIDQLKRIMEVVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
:: .. .. :..::.::::: ::. .....: ::::::.::: .:::::::.:..::
CCDS14 TPSPEVLAKISSEHARTYIQSLPPMPQKDLSSIFRGANPLAIDLLGRMLVLDSDQRVSAA
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 QALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
.:::::::.:::::.::: :.:::.: :... ..::: :::.::.:: ::
CCDS14 EALAHAYFSQYHDPEDEPEAEPYDESVEAKERTLEEWKELTYQEVLSFKPPEPPKPPGSL
310 320 330 340 350 360
CCDS14 EIEQ
>>CCDS4817.1 MAPK14 gene_id:1432|Hs108|chr6 (307 aa)
initn: 1618 init1: 1618 opt: 1618 Z-score: 1015.3 bits: 196.2 E(32554): 3.1e-50
Smith-Waterman score: 1618; 95.2% identity (98.4% similar) in 252 aa overlap (1-252:1-252)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPFQ
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 SIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKCQ
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS48 KLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEMT
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLTG
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::. :.::.:
CCDS48 GYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHIDQLKLILRLVG
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 TPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITAA
:: : :.... :
CCDS48 TPGAELLKKISSESLSTCWRRCLYWTQIRELQRPKPLHMPTLLSTTILMMNQWPILMISP
250 260 270 280 290 300
>>CCDS14089.1 MAPK12 gene_id:6300|Hs108|chr22 (367 aa)
initn: 1597 init1: 1597 opt: 1597 Z-score: 1001.6 bits: 193.9 E(32554): 1.8e-49
Smith-Waterman score: 1597; 64.3% identity (88.8% similar) in 347 aa overlap (5-351:8-354)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSR
: :::::..:: ::: :..:.::::::::.::.: : .:: .::.::: :
CCDS14 MSSPPPARSGFYRQEVTKTAWEVRAVYRDLQPVGSGAYGAVCSAVDGRTGAKVAIKKLYR
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 PFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIV
:::: . :::.::::::::::.::::::::::::: ..:..:.: ::: .::.::....
CCDS14 PFQSELFAKRAYRELRLLKHMRHENVIGLLDVFTPDETLDDFTDFYLVMPFMGTDLGKLM
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KCQKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDD
: .:: .:..:::.::.:.::.:::.: ::::::::.:::::::::::::::::::..:.
CCDS14 KHEKLGEDRIQFLVYQMLKGLRYIHAAGIIHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARQADS
130 140 150 160 170 180
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 EMTGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMR
::::::.::::::::..::::.:.::::::::::::::..::.::: :.::..::..::.
CCDS14 EMTGYVVTRWYRAPEVILNWMRYTQTVDIWSVGCIMAEMITGKTLFKGSDHLDQLKEIMK
190 200 210 220 230 240
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 LTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRI
.:::::: ...:. : ::.::...: .. : .::... .:.::::.:::::::::...:.
CCDS14 VTGTPPAEFVQRLQSDEAKNYMKGLPELEKKDFASILTNASPLAVNLLEKMLVLDAEQRV
250 260 270 280 290 300
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 TAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVADPYDQSFESRDLLIDEWKSLTYDEVISFVPPPLDQEE
::..:::: :: . :: .::: .. ::.::.. : .:::: .:: ::.:: ::
CCDS14 TAGEALAHPYFESLHDTEDEPQVQKYDDSFDDVDRTLDEWKRVTYKEVLSFKPPRQLGAR
310 320 330 340 350 360
360
pF1KB3 MES
CCDS14 VSKETPL
>>CCDS4818.1 MAPK13 gene_id:5603|Hs108|chr6 (365 aa)
initn: 1379 init1: 893 opt: 1487 Z-score: 934.8 bits: 181.6 E(32554): 9.5e-46
Smith-Waterman score: 1487; 61.3% identity (86.0% similar) in 344 aa overlap (8-350:9-351)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MSQERPTFYRQELNKTIWEVPERYQNLSPVGSGAYGSVCAAFDTKTGLRVAVKKLSRPF
::.:..::: ::.:. : . . ::::::::::.:.: ..: .::.:::::::
CCDS48 MSLIRKKGFYKQDVNKTAWELPKTYVSPTHVGSGAYGSVCSAIDKRSGEKVAIKKLSRPF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 QSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTHLMGADLNNIVKC
:: : :::.:::: :::::.:::::::::::::: ::..: : ::: .: .::..:.
CCDS48 QSEIFAKRAYRELLLLKHMQHENVIGLLDVFTPASSLRNFYDFYLVMPFMQTDLQKIMG-
70 80 90 100 110
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pF1KB3 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDEM
........:.:.::.:.:::::::: ..::::::.::::::::::::::::::::.: ::
CCDS48 MEFSEEKIQYLVYQMLKGLKYIHSAGVVHRDLKPGNLAVNEDCELKILDFGLARHADAEM
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180 190 200 210 220 230
pF1KB3 TGYVATRWYRAPEIMLNWMHYNQTVDIWSVGCIMAELLTGRTLFPGTDHINQLQQIMRLT
::::.::::::::..:.:::::::::::::::::::.:::.::: : :...:: ::...:
CCDS48 TGYVVTRWYRAPEVILSWMHYNQTVDIWSVGCIMAEMLTGKTLFKGKDYLDQLTQILKVT
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pF1KB3 GTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLAVDLLEKMLVLDSDKRITA
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CCDS48 GVPGTEFVQKLNDKAAKSYIQSLPQTPRKDFTQLFPRASPQAADLLEKMLELDVDKRLTA
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CCDS48 AQALTHPFFEPFRDPEEETEAQQPFDDSLEHEKLTVDEWKQHIYKEIVNFSPIARKDSRR
300 310 320 330 340 350
360
pF1KB3 ES
CCDS48 RSGMKL
360
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10 20 30 40 50
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CCDS13 EHQTYCQRTLREIKILLRFRHENIIGINDIIR-APTIEQMKDVYIVQDLMETDLYKLLKT
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pF1KB3 QKLTDDHVQFLIYQILRGLKYIHSADIIHRDLKPSNLAVNEDCELKILDFGLARHTDDE-
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CCDS13 HILGILGSPSQEDLNCIINLKARNYLLSLPHKNKVPWNRLFPNADSKALDLLDKMLTFNP
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CCDS13 HKRIEVEQALAHPYLEQYYDPSDEPIAEAPFKFDMELDDLPKEKLKELIFEETARFQPGY
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360
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CCDS13 RS
360
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pF1KB3 LFPGTDHINQLQQIMRLTGTPPAYLINRMPSHEARNYIQSLTQMPKMNFANVFIGANPLA
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CCDS10 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
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290 300 310 320 330 340
pF1KB3 VDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEPVAD-PYDQSFESRDLLIDEWKSL
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CCDS10 LDLLDRMLTFNPNKRITVEEALAHPYLEQYYDPTDEPVAEEPFTFAMELDDLPKERLKEL
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350 360
pF1KB3 TYDEVISFVPPPLDQEEMES
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CCDS10 IFQETARFQPGVLEAP
370
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CCDS11 QQVAIKKIPNAFDVVTNAKRTLRELKILKHFKHDNIIAIKDILRPTVPYGEFKSVYVVLD
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CCDS11 LMESDLHQIIHSSQPLTLEHVRYFLYQLLRGLKYMHSAQVIHRDLKPSNLLVNENCELKI
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CCDS11 GDFGMARGLCTSPAEHQYFMTEYVATRWYRAPELMLSLHEYTQAIDLWSVGCIFGEMLAR
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CCDS11 RQLFPGKNYVHQLQLIMMVLGTPSPAVIQAVGAERVRAYIQSLPPRQPVPWETVYPGADR
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pF1KB3 LAVDLLEKMLVLDSDKRITAAQALAHAYFAQYHDPDDEP-VADPYDQSFESRDLLIDEWK
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CCDS11 QALSLLGRMLRFEPSARISAAAALRHPFLAKYHDPDDEPDCAPPFDFAFDREALTRERIK
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pF1KB3 SLTYDEVISFVPPPLDQEEMES
:. .:
CCDS11 EAIVAEIEDFHARREGIRQQIRFQPSLQPVASEPGCPDVEMPSPWAPSGDCAMESPPPAP
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CCDS42 AQGGGGGEPRRTEGVGPGVPGEVEMVKGQPFDVGPRYTQLQYIGEGAYGMVSSAYDHVRK
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pF1KB3 LRVAVKKLSRPFQSIIHAKRTYRELRLLKHMKHENVIGLLDVFTPARSLEEFNDVYLVTH
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CCDS42 TRVAIKKIS-PFEHQTYCQRTLREIQILLRFRHENVIGIRDILR-ASTLEAMRDVYIVQD
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CCDS42 LMETDLYKLLKSQQLSNDHICYFLYQILRGLKYIHSANVLHRDLKPSNLLINTTCDLKIC
130 140 150 160 170 180
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CCDS42 DFGLARIADPEHDHTGFLTEYVATRWYRAPEIMLNSKGYTKSIDIWSVGCILAEMLSNRP
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CCDS42 IFPGKHYLDQLNHILGILGSPSQEDLNCIINMKARNYLQSLPSKTKVAWAKLFPKSDSKA
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pF1KB3 YDEVISFVPPPLDQEEMES
360 residues in 1 query sequences
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Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]