Result of FASTA (omim) for
pF1KB3644
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3644, 379 aa
1>>>pF1KB3644 379 - 379 aa - 379 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 4.9905+/-0.000403; mu= 17.8083+/- 0.025
mean_var=59.7922+/-11.851, 0's: 0 Z-trim(110.5): 77 B-trim: 98 in 1/48
Lambda= 0.165864
statistics sampled from 18838 (18915) to 18838 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.592), E-opt: 0.2 (0.222), width: 16
Scan time: 8.020
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP- ( 379) 2452 595.5 6.6e-170
XP_011527863 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_011527862 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_733933 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263366 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883833 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_733932 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883832 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263365 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_002234 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rect ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_006724065 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_005261032 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
XP_016883834 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensiti ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263364 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263368 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_001263367 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward r ( 375) 1484 363.9 3.5e-100
NP_722448 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722451 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722450 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 372) 1181 291.4 2.3e-78
NP_722449 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 389) 1181 291.4 2.4e-78
NP_000211 (OMIM: 241200,600359) ATP-sensitive inwa ( 391) 1181 291.4 2.4e-78
XP_011522133 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433) 946 235.2 2.2e-61
NP_066292 (OMIM: 602323) ATP-sensitive inward rect ( 433) 946 235.2 2.2e-61
XP_005256682 (OMIM: 602323) PREDICTED: ATP-sensiti ( 433) 946 235.2 2.2e-61
NP_001181887 (OMIM: 613236,613239) inward rectifie ( 433) 938 233.3 8.4e-61
XP_005276976 (OMIM: 613236,613239) PREDICTED: inwa ( 535) 938 233.3 1e-60
NP_004974 (OMIM: 600932) G protein-activated inwar ( 393) 922 229.4 1.1e-59
XP_016856736 (OMIM: 600932) PREDICTED: G protein-a ( 450) 922 229.5 1.2e-59
NP_002230 (OMIM: 601534) G protein-activated inwar ( 501) 914 227.6 5.1e-59
NP_002231 (OMIM: 600877,614098) G protein-activate ( 423) 903 224.9 2.7e-58
NP_000882 (OMIM: 170390,600681,609622,613980) inwa ( 427) 901 224.4 3.8e-58
NP_000881 (OMIM: 600734,613485,613677) G protein-a ( 419) 896 223.2 8.7e-58
XP_011541111 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419) 896 223.2 8.7e-58
XP_011541112 (OMIM: 600734,613485,613677) PREDICTE ( 419) 896 223.2 8.7e-58
NP_037480 (OMIM: 603953) ATP-sensitive inward rect ( 436) 894 222.7 1.2e-57
NP_000516 (OMIM: 125853,600937,601820,606176,61058 ( 390) 888 221.3 3.1e-57
NP_002233 (OMIM: 193230,603208,614186) inward rect ( 360) 881 219.6 9.2e-57
XP_016874773 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424) 828 206.9 6.9e-53
NP_004973 (OMIM: 600935) ATP-sensitive inward rect ( 424) 828 206.9 6.9e-53
XP_016874772 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424) 828 206.9 6.9e-53
XP_005253415 (OMIM: 600935) PREDICTED: ATP-sensiti ( 424) 828 206.9 6.9e-53
XP_011523083 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418) 775 194.3 4.5e-49
NP_001257351 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 775 194.3 4.5e-49
NP_001278554 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 775 194.3 4.5e-49
NP_001278553 (OMIM: 605722) inward rectifier potas ( 418) 775 194.3 4.5e-49
XP_016880102 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 418) 775 194.3 4.5e-49
XP_006721949 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 775 194.3 4.8e-49
XP_005257394 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 775 194.3 4.8e-49
NP_733938 (OMIM: 605722) inward rectifier potassiu ( 453) 775 194.3 4.8e-49
XP_016880101 (OMIM: 605722) PREDICTED: inward rect ( 453) 775 194.3 4.8e-49
>>NP_002232 (OMIM: 274600,600791,602208,612780) ATP-sens (379 aa)
initn: 2452 init1: 2452 opt: 2452 Z-score: 3171.4 bits: 595.5 E(85289): 6.6e-170
Smith-Waterman score: 2452; 100.0% identity (100.0% similar) in 379 aa overlap (1-379:1-379)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLMGPGIRRRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKDLWTTFI
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHTLTGAFL
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKKRAETIR
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 FSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQVNVTFQV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 DTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDLPLRSGEGDFELVLILSGTVESTSATCQVRTSY
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPEKLKLEES
310 320 330 340 350 360
370
pF1KB3 LREQAEKEGSALSVRISNV
:::::::::::::::::::
NP_002 LREQAEKEGSALSVRISNV
370
>>XP_011527863 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i (375 aa)
initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484 Z-score: 1919.6 bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
: ::. : :.. : ::..:.:.::::.... .:::.:
XP_011 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
:::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .: :::: .: .:::::...: .
XP_011 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
:::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
XP_011 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
:::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
XP_011 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
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XP_011 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
:: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. : :: : : .: :
XP_011 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
: .:::. :. : :.: .: .. :::
XP_011 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
350 360 370
>>XP_011527862 (OMIM: 602106) PREDICTED: ATP-sensitive i (375 aa)
initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484 Z-score: 1919.6 bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
: ::. : :.. : ::..:.:.::::.... .:::.:
XP_011 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
:::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .: :::: .: .:::::...: .
XP_011 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
:::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
XP_011 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
:::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
XP_011 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
.: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: : : .::::..:..:::::::.
XP_011 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
:: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. : :: : : .: :
XP_011 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
: .:::. :. : :.: .: .. :::
XP_011 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
350 360 370
>>NP_733933 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward rectifie (375 aa)
initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484 Z-score: 1919.6 bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
: ::. : :.. : ::..:.:.::::.... .:::.:
NP_733 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
:::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .: :::: .: .:::::...: .
NP_733 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
:::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
NP_733 LTGAFLFSLESQTTIGYGVRSITEECPHAIFLLVAQLVITTLIEIFITGTFLAKIARPKK
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 RAETIRFSQHAVVASHNGKPCLMIRVANMRKSLLIGCQVTGKLLQTHQTKEGENIRLNQV
:::::.::. ::....::: ::.:.:::::::::: ::..::::::: ::::: : :::.
NP_733 RAETIKFSHCAVITKQNGKLCLVIQVANMRKSLLIQCQLSGKLLQTHVTKEGERILLNQA
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NVTFQVDTASDSPFLILPLTFYHVVDETSPLKDL-PLRSGEGDFELVLILSGTVESTSAT
.: :.::..:.:::::::.:::::.::::::.:: : : .::::..:..:::::::.
NP_733 TVKFHVDSSSESPFLILPMTFYHVLDETSPLRDLTPQNLKEKEFELVVLLNATVESTSAV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 CQVRTSYLPEEILWGYEFTPAISLSASGKYIADFSLFDQVVKVASPSGLRDSTVRYGDPE
:: ::::.:::: ::.::.:..::: .:::.:::: :.:. : :: : : .: :
NP_733 CQSRTSYIPEEIYWGFEFVPVVSLSKNGKYVADFSQFEQIRK--SP----DCTFYCADSE
300 310 320 330 340
360 370
pF1KB3 KLKLEESLRE--QAEKEGSALSVRISNV
: .:::. :. : :.: .: .. :::
NP_733 KQQLEEKYRQEDQRERELRTLLLQQSNV
350 360 370
>>NP_001263366 (OMIM: 602106) ATP-sensitive inward recti (375 aa)
initn: 1453 init1: 1143 opt: 1484 Z-score: 1919.6 bits: 363.9 E(85289): 3.5e-100
Smith-Waterman score: 1484; 62.9% identity (82.3% similar) in 372 aa overlap (17-379:10-375)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTSVAKVYYSQTTQTESRPLM----GPGIR--RRRVLTKDGRSNVRMEHIADKRFLYLKD
: ::. : :.. : ::..:.:.::::.... .:::.:
NP_001 MDAIHIGMSSTPLVKHTAGAGLKANRPRVMSKSGHSNVRIDKVDGIYLLYLQD
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 LWTTFIDMQWRYKLLLFSATFAGTWFLFGVVWYLVAVAHGDLLELDPPANHTPCVVQVHT
:::: :::.::::: ::.:::. :::::::..: .: :::: .: .:::::...: .
NP_001 LWTTVIDMKWRYKLTLFAATFVMTWFLFGVIYYAIAFIHGDLEPGEPISNHTPCIMKVDS
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 LTGAFLFSLESQTTIGYGFRYISEECPLAIVLLIAQLVLTTILEIFITGTFLAKIARPKK
:::::::::::::::::: : :.:::: :: ::.::::.::..:::::::::::::::::
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379 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
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start: Thu Nov 3 13:33:10 2016 done: Thu Nov 3 13:33:12 2016
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Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]