Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3619
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3619, 902 aa
1>>>pF1KB3619 902 - 902 aa - 902 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 6.6927+/-0.000971; mu= 14.2423+/- 0.058
mean_var=90.7453+/-18.416, 0's: 0 Z-trim(107.2): 90 B-trim: 183 in 1/50
Lambda= 0.134636
statistics sampled from 9343 (9444) to 9343 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.642), E-opt: 0.2 (0.29), width: 16
Scan time: 4.380
The best scores are: opt bits E(32554)
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CCDS54484.1 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1526) 626 132.3 6.6e-30
CCDS33539.2 SYNJ1 gene_id:8867|Hs108|chr21 (1612) 626 132.3 7e-30
CCDS8213.1 INPPL1 gene_id:3636|Hs108|chr11 (1258) 563 120.0 2.7e-26
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CCDS63454.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22 ( 939) 549 117.3 1.4e-25
CCDS63453.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22 (1006) 549 117.3 1.5e-25
CCDS46687.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22 ( 638) 541 115.7 2.8e-25
CCDS74847.1 INPP5J gene_id:27124|Hs108|chr22 ( 571) 517 111.0 6.5e-24
CCDS11004.1 INPP5K gene_id:51763|Hs108|chr17 ( 448) 482 104.2 5.8e-22
CCDS77543.1 INPP5D gene_id:3635|Hs108|chr2 (1188) 483 104.5 1.2e-21
CCDS74672.1 INPP5D gene_id:3635|Hs108|chr2 (1189) 483 104.5 1.2e-21
CCDS11005.1 INPP5K gene_id:51763|Hs108|chr17 ( 372) 427 93.5 8.1e-19
CCDS7000.1 INPP5E gene_id:56623|Hs108|chr9 ( 644) 400 88.3 5e-17
>>CCDS35393.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX (901 aa)
initn: 6099 init1: 6020 opt: 6101 Z-score: 6401.5 bits: 1195.7 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6101; 99.9% identity (99.9% similar) in 902 aa overlap (1-902:1-901)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPPLPVGAQPLAHTVEGMEMKGPLREPCALTLAQRNGQYELIIQLHEKEQHVQDIIPIN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SHFRCVQEAEETLLIDIASNSGCKIRVQGDWIRERRFEIPDEEHCLKFLSAVLAAQKAQS
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PPFSVNKMLPREKEASNKEQPKVTNTMRKLFVPNTQSGQREGLIKHILAKREKEYVNIQT
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250 260 270 280 290 300
pF1KB3 FRFFVGTWNVNGQSPDSGLEPWLNCDPNPPDIYCIGFQELDLSTEAFFYFESVKEQEWSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 FRFFVGTWNVNGQSPDSGLEPWLNCDPNPPDIYCIGFQELDLSTEAFFYFESVKEQEWSM
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 AVERGLHSKAKYKKVQLVRLVGMMLLIFARKDQCRYIRDIATETVGTGIMGKMGNKGGVA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 AVERGLHSKAKYKKVQLVRLVGMMLLIFARKDQCRYIRDIATETVGTGIMGKMGNKGGVA
300 310 320 330 340 350
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 VRFVFHNTTFCIVNSHLAAHVEDFERRNQDYKDICARMSFVVPNQTLPQLNIMKHEVVIW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 VRFVFHNTTFCIVNSHLAAHVEDFERRNQDYKDICARMSFVVPNQTLPQLNIMKHEVVIW
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 LGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIKFIPTYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIKFIPTYKY
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DSKTDRWDSSGKCRVPAWCDRILWRGTNVNQLNYRSHMELKTSDHKPVSALFHIGVKVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 DSKTDRWDSSGKCRVPAWCDRILWRGTNVNQLNYRSHMELKTSDHKPVSALFHIGVKVVD
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pF1KB3 ERRYRKVFEDSVRIMDRMENDFLPSLELSRREFVFENVKFRQLQKEKFQISNNGQVPCHF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 ERRYRKVFEDSVRIMDRMENDFLPSLELSRREFVFENVKFRQLQKEKFQISNNGQVPCHF
540 550 560 570 580 590
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pF1KB3 SFIPKLNDSQYCKPWLRAEPFEGYLEPNETVDISLDVYVSKDSVTILNSGEDKIEDILVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SFIPKLNDSQYCKPWLRAEPFEGYLEPNETVDISLDVYVSKDSVTILNSGEDKIEDILVL
600 610 620 630 640 650
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pF1KB3 HLDRGKDYFLTISGNYLPSCFGTSLEALCRMKRPIREVPVTKLIDLEEDSFLEKEKSLLQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 HLDRGKDYFLTISGNYLPSCFGTSLEALCRMKRPIREVPVTKLIDLEEDSFLEKEKSLLQ
660 670 680 690 700 710
730 740 750 760 770 780
pF1KB3 MVPLDEGASERPLQVPKEIWLLVDHLFKYACHQEDLFQTPGMQEELQQIIDCLDTSIPET
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVPLDEGASERPLQVPKEIWLLVDHLFKYACHQEDLFQTPGMQEELQQIIDCLDTSIPET
720 730 740 750 760 770
790 800 810 820 830 840
pF1KB3 IPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVICYELYQRCLDSAYDPRICRQVISQLPRCHRNVFRYL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVICYELYQRCLDSAYDPRICRQVISQLPRCHRNVFRYL
780 790 800 810 820 830
850 860 870 880 890 900
pF1KB3 MAFLRELLKFSEYNSVNANMIATLFTSLLLRPPPNLMARQTPSDRQRAIQFLLGFLLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAFLRELLKFSEYNSVNANMIATLFTSLLLRPPPNLMARQTPSDRQRAIQFLLGFLLGSE
840 850 860 870 880 890
pF1KB3 ED
::
CCDS35 ED
900
>>CCDS35394.1 OCRL gene_id:4952|Hs108|chrX (893 aa)
initn: 4789 init1: 4710 opt: 6025 Z-score: 6321.7 bits: 1180.9 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 6025; 99.0% identity (99.0% similar) in 902 aa overlap (1-902:1-893)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MEPPLPVGAQPLAHTVEGMEMKGPLREPCALTLAQRNGQYELIIQLHEKEQHVQDIIPIN
::::::::::::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MEPPLPVGAQPLA-TVEGMEMKGPLREPCALTLAQRNGQYELIIQLHEKEQHVQDIIPIN
10 20 30 40 50
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 SHFRCVQEAEETLLIDIASNSGCKIRVQGDWIRERRFEIPDEEHCLKFLSAVLAAQKAQS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 SHFRCVQEAEETLLIDIASNSGCKIRVQGDWIRERRFEIPDEEHCLKFLSAVLAAQKAQS
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 QLLVPEQKDSSSWYQKLDTKDKPSVFSGLLGFEDNFSSMNLDKKINSQNQPTGIHREPPP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 PPFSVNKMLPREKEASNKEQPKVTNTMRKLFVPNTQSGQREGLIKHILAKREKEYVNIQT
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CCDS35 FRFFVGTWNVNGQSPDSGLEPWLNCDPNPPDIYCIGFQELDLSTEAFFYFESVKEQEWSM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 LGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIKFIPTYKY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 LGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIKFIPTYKY
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pF1KB3 SFIPKLNDSQYCKPWLRAEPFEGYLEPNETVDISLDVYVSKDSVTILNSGEDKIEDILVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MVPLDEGASERPLQVPKEIWLLVDHLFKYACHQEDLFQTPGMQEELQQIIDCLDTSIPET
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 IPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVICYELYQRCLDSAYDPRICRQVISQLPRCHRNVFRYL
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pF1KB3 MAFLRELLKFSEYNSVNANMIATLFTSLLLRPPPNLMARQTPSDRQRAIQFLLGFLLGSE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS35 MAFLRELLKFSEYNSVNANMIATLFTSLLLRPPPNLMARQTPSDRQRAIQFLLGFLLGSE
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pF1KB3 ED
::
CCDS35 ED
>>CCDS72760.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1 (749 aa)
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Smith-Waterman score: 2657; 51.1% identity (78.2% similar) in 751 aa overlap (147-896:16-745)
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KAQSQLLVPEQKDSSSWYQKLDTKDKPSVFSGLLGFEDNFSSMNLDKKINSQNQPTGIHR
:.. :.. : ... .:.. .:..: ...
CCDS72 MSAAAGSRERNTAGGSNFDGLRPNGKGVPMDQSSRGQDKPESLQP
10 20 30 40
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 EPPPPPFSVNKMLPREKEASNKEQPKVTNTMRKLFVPNTQSGQREGLIKHILAKREKEYV
. .. :. : . . ... .. .:.:. : :. ..: : ..:..:.
CCDS72 RQNKSKSEITDMV-RSSTITVSDKAHIL-SMQKF-------GLRDTIVKSHLLQKEEDYT
50 60 70 80 90
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pF1KB3 NIQTFRFFVGTWNVNGQSPDSGLEPWLNCDPNPPDIYCIGFQELDLSTEAFFYFESVKEQ
::.::::.::.::::::: :. ::. . ::.::.:::::::: ::::. .. ::.
CCDS72 YIQNFRFFAGTYNVNGQSPKECLRLWLSNGIQAPDVYCVGFQELDLSKEAFFFHDTPKEE
100 110 120 130 140 150
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pF1KB3 EWSMAVERGLHSKAKYKKVQLVRLVGMMLLIFARKDQCRYIRDIATETVGTGIMGKMGNK
:: :: .::: ::: ::.:.::::.:::....... :: .. .:::::::::.::::
CCDS72 EWFKAVSEGLHPDAKYAKVKLIRLVGIMLLLYVKQEHAAYISEVEAETVGTGIMGRMGNK
160 170 180 190 200 210
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pF1KB3 GGVAVRFVFHNTTFCIVNSHLAAHVEDFERRNQDYKDICARMSFVVPNQTLPQLNIMKHE
::::.:: ::::..:.::::::::.:..:::::::::::.::.: :. .:: :.: .:.
CCDS72 GGVAIRFQFHNTSICVVNSHLAAHIEEYERRNQDYKDICSRMQFCQPDPSLPPLTISNHD
220 230 240 250 260 270
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 VVIWLGDLNYRLCMPDANEVKSLINKKDLQRLLKFDQLNIQRTQKKAFVDFNEGEIKFIP
:..::::::::. :...::.::..::.: : .:::.:: . : .: :.:::. : :
CCDS72 VILWLGDLNYRIEELDVEKVKKLIEEKDFQMLYAYDQLKIQVAAKTVFEGFTEGELTFQP
280 290 300 310 320 330
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pF1KB3 TYKYDSKTDRWDSSGKCRVPAWCDRILWRGTNVNQLNYRSHMELKTSDHKPVSALFHIGV
:::::. .: ::.: :::.:::::::::.: :..::.:.::: ::::::::::..: :::
CCDS72 TYKYDTGSDDWDTSEKCRAPAWCDRILWKGKNITQLSYQSHMALKTSDHKPVSSVFDIGV
340 350 360 370 380 390
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pF1KB3 KVVDERRYRKVFEDSVRIMDRMENDFLPSLELSRREFVFENVKFRQLQKEKFQISNNGQV
.::... :::..:. :: .:.::: .::. ::.::: :.:::. ::. :.: : .::::
CCDS72 RVVNDELYRKTLEEIVRSLDKMENANIPSVSLSKREFCFQNVKYMQLKVESFTI-HNGQV
400 410 420 430 440 450
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pF1KB3 PCHFSFIPKLNDSQYCKPWLRAEPFEGYLEPNETVDISLDVYVSKDSVTILNSGEDKIED
:::: :: : .. .::: :: :.: .:.: :. :.:.:...:.: ..: ::::::::::
CCDS72 PCHFEFINKPDEESYCKQWLNANPSRGFLLPDSDVEIDLELFVNKMTATKLNSGEDKIED
460 470 480 490 500 510
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pF1KB3 ILVLHLDRGKDYFLTISGNYLPSCFGTSLEALCRMKRPIREVPVTKLIDLEEDSFLEKEK
::::::::::::::..::::::::::. ...:: :..:: ..:. . .:
CCDS72 ILVLHLDRGKDYFLSVSGNYLPSCFGSPIHTLCYMREPILDLPLETISEL----------
520 530 540 550 560
720 730 740 750 760 770
pF1KB3 SLLQMVPLDEGAS-ERPLQVPKEIWLLVDHLFKYACHQEDLFQTPGMQEELQQIIDCLDT
.:. . :.:.. . :...:::.:..::.:.. : .:::::: ::.. :...: :::::
CCDS72 TLMPVWTGDDGSQLDSPMEIPKELWMMVDYLYRNAVQQEDLFQQPGLRSEFEHIRDCLDT
570 580 590 600 610 620
780 790 800 810 820 830
pF1KB3 SIPETIPGSNHSVAEALLIFLEALPEPVICYELYQRCLDSAYDPRICRQVISQLPRCHRN
.. ... .::::::::::.:::.:::::::: :. ::. . . .:::: :: :.:
CCDS72 GMIDNLSASNHSVAEALLLFLESLPEPVICYSTYHNCLECSGNYTASKQVISTLPIFHKN
630 640 650 660 670 680
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pF1KB3 VFRYLMAFLRELLKFSEYNSVNANMIATLFTSLLLRPPPNLMARQTPSDRQRAIQFLLGF
::.::::::::::: : : .. :..:..: ::::: : . . .....: .:. :
CCDS72 VFHYLMAFLRELLKNSAKNHLDENILASIFGSLLLRNPAG-HQKLDMTEKKKAQEFIHQF
690 700 710 720 730 740
900
pF1KB3 LLGSEED
:
CCDS72 LCNPL
>>CCDS41306.1 INPP5B gene_id:3633|Hs108|chr1 (913 aa)
initn: 2591 init1: 1570 opt: 2078 Z-score: 2178.2 bits: 414.3 E(32554): 5.3e-115
Smith-Waterman score: 2657; 51.1% identity (78.2% similar) in 751 aa overlap (147-896:180-909)
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 KAQSQLLVPEQKDSSSWYQKLDTKDKPSVFSGLLGFEDNFSSMNLDKKINSQNQPTGIHR
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CCDS41 AELELEMPTPRGCNSALVTWPGYATIGGGGSNFDGLRPNGKGVPMDQSSRGQDKPESLQP
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CCDS54 FFDDALIDELLQQFASFGEVILIRFVEDKMWVTFLEGSSALNVLSLNGKELLNRTITIAL
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