Result of FASTA (omim) for
pF1KB3580
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3580, 538 aa
1>>>pF1KB3580 538 - 538 aa - 538 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.9441+/-0.000405; mu= 16.1553+/- 0.025
mean_var=105.3227+/-21.548, 0's: 0 Z-trim(113.6): 69 B-trim: 0 in 0/51
Lambda= 0.124972
statistics sampled from 22972 (23041) to 22972 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.636), E-opt: 0.2 (0.27), width: 16
Scan time: 7.750
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_002255 (OMIM: 600686) importin subunit alpha-5 ( 538) 3521 646.0 8.2e-185
XP_005247494 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 538) 3521 646.0 8.2e-185
XP_011511097 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 477) 3132 575.9 9.8e-164
NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7 ( 536) 2887 531.7 2.1e-150
XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin su ( 566) 2887 531.7 2.2e-150
XP_016866329 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 536) 2879 530.3 5.7e-150
NP_002260 (OMIM: 604545) importin subunit alpha-6 ( 539) 2879 530.3 5.8e-150
XP_016866328 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 539) 2879 530.3 5.8e-150
XP_011534107 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 2879 530.3 5.9e-150
XP_016866327 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 559) 2879 530.3 5.9e-150
XP_016861853 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 2235 414.0 3.6e-115
XP_016861854 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 2235 414.0 3.6e-115
XP_011511099 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 2235 414.0 3.6e-115
XP_016861852 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 2235 414.0 3.6e-115
XP_005247496 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin su ( 337) 2235 414.0 3.6e-115
XP_016866330 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 332) 1896 352.9 9e-97
XP_016866331 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327) 1890 351.8 1.9e-96
XP_016866332 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin su ( 327) 1890 351.8 1.9e-96
NP_001307540 (OMIM: 600685) importin subunit alpha ( 529) 1480 278.0 4.8e-74
NP_002257 (OMIM: 600685) importin subunit alpha-1 ( 529) 1480 278.0 4.8e-74
NP_002259 (OMIM: 602970) importin subunit alpha-3 ( 521) 1420 267.2 8.6e-71
NP_002258 (OMIM: 601892) importin subunit alpha-4 ( 521) 1407 264.9 4.4e-70
XP_016876050 (OMIM: 601892) PREDICTED: importin su ( 497) 1400 263.6 1e-69
NP_001139187 (OMIM: 614107) importin subunit alpha ( 516) 1237 234.2 7.3e-61
XP_011514517 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 543) 1237 234.2 7.6e-61
XP_016867700 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 522) 1207 228.8 3.1e-59
XP_016867701 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1204 228.3 4.6e-59
XP_016867703 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1204 228.3 4.6e-59
XP_016867702 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 521) 1204 228.3 4.6e-59
XP_016867699 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 537) 1204 228.3 4.7e-59
XP_016867697 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 548) 1204 228.3 4.7e-59
XP_016867698 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 544) 1161 220.5 1e-56
XP_016867705 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 425) 1134 215.6 2.5e-55
XP_016867704 (OMIM: 614107) PREDICTED: importin su ( 487) 934 179.6 2e-44
NP_001240783 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484) 288 63.1 2.2e-09
NP_758442 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen ( 458) 281 61.8 5.2e-09
NP_001240784 (OMIM: 605730) sperm-associated antig ( 484) 281 61.8 5.4e-09
XP_005252702 (OMIM: 605730) PREDICTED: sperm-assoc ( 506) 281 61.9 5.6e-09
NP_036575 (OMIM: 605730) sperm-associated antigen ( 509) 281 61.9 5.6e-09
>>NP_002255 (OMIM: 600686) importin subunit alpha-5 [Hom (538 aa)
initn: 3521 init1: 3521 opt: 3521 Z-score: 3438.9 bits: 646.0 E(85289): 8.2e-185
Smith-Waterman score: 3521; 99.8% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDE
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VMSDGGFHEAQISNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 VISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 EFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 RGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 LVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 TISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 ELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB3 IEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_002 IEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
490 500 510 520 530
>>XP_005247494 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin subuni (538 aa)
initn: 3521 init1: 3521 opt: 3521 Z-score: 3438.9 bits: 646.0 E(85289): 8.2e-185
Smith-Waterman score: 3521; 99.8% identity (100.0% similar) in 538 aa overlap (1-538:1-538)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEE
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 VMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDE
::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VMSDGGFHEAQISNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 VISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 EFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLC
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 EFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLC
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 RGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 RGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRR
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACW
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 LVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACW
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 TISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 TISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLV
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 ELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 ELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDK
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530
pF1KB3 IEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_005 IEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
490 500 510 520 530
>>XP_011511097 (OMIM: 600686) PREDICTED: importin subuni (477 aa)
initn: 3132 init1: 3132 opt: 3132 Z-score: 3060.6 bits: 575.9 E(85289): 9.8e-164
Smith-Waterman score: 3132; 99.8% identity (100.0% similar) in 477 aa overlap (62-538:1-477)
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 GLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMI
:::::::::::.::::::::::::::::::
XP_011 MSDGGFHEAQISNMEMAPGGVITSDMIEMI
10 20 30
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 FSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 FSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVL
40 50 60 70 80 90
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 TNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 TNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCN
100 110 120 130 140 150
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 ILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVL
160 170 180 190 200 210
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 ADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQT
220 230 240 250 260 270
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 QVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQT
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 QVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQT
280 290 300 310 320 330
400 410 420 430 440 450
pF1KB3 AEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 AEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENIL
340 350 360 370 380 390
460 470 480 490 500 510
pF1KB3 RLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 RLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDS
400 410 420 430 440 450
520 530
pF1KB3 SIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
:::::::::::::::::::::::::::
XP_011 SIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
460 470
>>NP_036448 (OMIM: 610563) importin subunit alpha-7 [Hom (536 aa)
initn: 2892 init1: 2610 opt: 2887 Z-score: 2821.2 bits: 531.7 E(85289): 2.1e-150
Smith-Waterman score: 2887; 81.0% identity (93.5% similar) in 538 aa overlap (1-538:4-536)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEET
:..:::.:.:.:::::..:::.::::::::::.::::::::.:::::::: : .
NP_036 METMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREEEGIQLRKQKREQQLFKRRNV---ELIN
10 20 30 40 50
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 EEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPP
:: .: :. . .. ... . .::: .:.::.:: . . ::..::::::::::::.::
NP_036 EEAAMFDSLLMDSYVSST--TGESVITREMVEMLFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPP
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 IDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIEL
:::::.:: :: ::::::::.::::::::.::.:::::::.: ::.:::.::::::::::
NP_036 IDEVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWALTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIEL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 LSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWALS
:.:.:::::::::::::::::::..::::::.:.:: ::: :..:..:::::::::::::
NP_036 LNSDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNCSILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALS
180 190 200 210 220 230
240 250 260 270 280 290
pF1KB3 NLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAGV
::::::.:::::::::::: ::: ::: ::.:.::::::::::::::::.:::::::.::
NP_036 NLCRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDLLADACWALSYLSDGPNEKIQAVIDSGV
240 250 260 270 280 290
300 310 320 330 340 350
pF1KB3 CRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKE
:::::::::::::::.::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.::
NP_036 CRRLVELLMHNDYKVASPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKE
300 310 320 330 340 350
360 370 380 390 400 410
pF1KB3 ACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQIK
:::::::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::.
NP_036 ACWTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQIR
360 370 380 390 400 410
420 430 440 450 460 470
pF1KB3 YLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYG
::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:.:.::::.:::::::
NP_036 YLVSLGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYG
420 430 440 450 460 470
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 LDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQ
::::::::::::::::::::::::::::.::.:::.::::: .:::.:::: ::::::::
NP_036 LDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEDDDSSLAPQVDETQQQFIFQQPEAPMEGFQ
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 L
:
NP_036 L
>>XP_005270768 (OMIM: 610563) PREDICTED: importin subuni (566 aa)
initn: 2892 init1: 2610 opt: 2887 Z-score: 2820.9 bits: 531.7 E(85289): 2.2e-150
Smith-Waterman score: 2887; 81.0% identity (93.5% similar) in 538 aa overlap (1-538:34-566)
10 20 30
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREE
:..:::.:.:.:::::..:::.::::::::
XP_005 LPASLSAVLEGEASVQDSPGSVMKSYVSETMASPGKDNYRMKSYKNNALNPEEMRRRREE
10 20 30 40 50 60
40 50 60 70 80 90
pF1KB3 EGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEETEEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGGVITSDMIEM
::.::::::::.:::::::: : .:: .: :. . .. ... . .::: .:.::
XP_005 EGIQLRKQKREQQLFKRRNV---ELINEEAAMFDSLLMDSYVSST--TGESVITREMVEM
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 IFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWV
.:: . . ::..::::::::::::.:::::::.:: :: ::::::::.::::::::.::.
XP_005 LFSDDSDLQLATTQKFRKLLSKEPSPPIDEVINTPRVVDRFVEFLKRNENCTLQFEAAWA
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 LTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDC
:::::::.: ::.:::.:::::::::::.:.:::::::::::::::::::..::::::.:
XP_005 LTNIASGTSQQTKIVIEAGAVPIFIELLNSDFEDVQEQAVWALGNIAGDSSVCRDYVLNC
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.:: ::: :..:..:::::::::::::::::::.:::::::::::: ::: ::: ::.:.
XP_005 SILNPLLTLLTKSTRLTMTRNAVWALSNLCRGKNPPPEFAKVSPCLPVLSRLLFSSDSDL
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::::::::::::::::.:::::::.:::::::::::::::::.:::::::::::::::::
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pF1KB3 TQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQ
:::::::::: ::::::::::::.:::::::::::::::::::.::::::::.:: :::
XP_005 TQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTISNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQ
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400 410 420 430 440 450
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::::::::::::::::::::. :::.::: :::::::::::::::::::::::::::::
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460 470 480 490 500 510
pF1KB3 LRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDED
:::::::.::.:.:.::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::.::.:
XP_005 LRLGEQEGKRSGSGVNPYCGLIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEDDD
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520 530
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::.::::: .:::.:::: :::::::::
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:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: .. .:
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: .. ... .:.. : :.:.::..::::.. .:::.::::::::::::::::::
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.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.::.
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:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: :::::::::::
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::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.::::
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::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::.::
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pF1KB3 VELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAYGLD
: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: ::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::::
XP_016 KIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
480 490 500 510 520 530
>>NP_002260 (OMIM: 604545) importin subunit alpha-6 [Hom (539 aa)
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10 20 30 40 50
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:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: ..
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pF1KB3 EEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNP
.: : .. ... .:.. : :.:.::..::::.. .:::.:::::::::::::::
NP_002 -DESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNP
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 PIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIE
:::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.
NP_002 PIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIK
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::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: ::::::::
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:::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.:
NP_002 SNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSG
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pF1KB3 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
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:::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::
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pF1KB3 KYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAY
.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::::::
NP_002 RYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAY
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pF1KB3 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGF
:::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::
NP_002 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
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pF1KB3 QL
::
NP_002 QL
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10 20 30 40 50
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRKQKREEQLFKRRNVATAEEET
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::::::::::::::: ..
XP_016 MDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRKQKREEQLFKRRNVYLPRN--
10 20 30 40 50
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pF1KB3 EEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSPEQQLSATQKFRKLLSKEPNP
.: : .. ... .:.. : :.:.::..::::.. .:::.:::::::::::::::
XP_016 -DESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNADQQLTATQKFRKLLSKEPNP
60 70 80 90 100 110
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pF1KB3 PIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIASGNSLQTRIVIQAGAVPIFIE
:::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.:::::::. :.:..::..:::::::.
XP_016 PIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIASGTFLHTKVVIETGAVPIFIK
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 LLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPLLQLFSKQNRLTMTRNAVWAL
::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.::::::.:....:::: ::::::::
XP_016 LLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPLLELLTNSNRLTTTRNAVWAL
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pF1KB3 SNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACWALSYLSDGPNDKIQAVIDAG
:::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::::::::::::::::::::.:
XP_016 SNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCWALSYLSDGPNDKIQAVIDSG
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pF1KB3 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALQSLLHLLSSPKESIKK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::.:
XP_016 VCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILNCSALPCLLHLLSSPKESIRK
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pF1KB3 EACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRTRKEAAWAITNATSGGSAEQI
:::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: ::::::::::::::::::::. :::
XP_016 EACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRTRKEAAWAITNATSGGTPEQI
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420 430 440 450 460 470
pF1KB3 KYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQEAKRNGTGINPYCALIEEAY
.::: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:.:: :::::::::::::
XP_016 RYLVALGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQESKQNGIGINPYCALIEEAY
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pF1KB3 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQVDLNQQQYIFQQCEAPMEGF
:::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.:::: ::::.:::: ::::.::
XP_016 GLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQVDENQQQFIFQQQEAPMDGF
480 490 500 510 520 530
pF1KB3 QL
::
XP_016 QL
>>XP_011534107 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (559 aa)
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10 20 30
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRK
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::
XP_011 MGRQRSRGRGSRTFPLRTRRRDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
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pF1KB3 QKREEQLFKRRNVATAEEETEEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSP
::::::::::::: .. .: : .. ... .:.. : :.:.::..::::..
XP_011 QKREEQLFKRRNVYLPRN---DESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNA
70 80 90 100 110
100 110 120 130 140 150
pF1KB3 EQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIAS
.:::.::::::::::::::::::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.::::::
XP_011 DQQLTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIAS
120 130 140 150 160 170
160 170 180 190 200 210
pF1KB3 GNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPL
:. :.:..::..:::::::.::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.:::::
XP_011 GTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPL
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pF1KB3 LQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACW
:.:....:::: :::::::::::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::
XP_011 LELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCW
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pF1KB3 ALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILN
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_011 ALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILN
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pF1KB3 CSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRT
:::: ::::::::::::.::::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: :::::
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pF1KB3 RKEAAWAITNATSGGSAEQIKYLVELGCIKPLCDLLTVMDSKIVQVALNGLENILRLGEQ
:::::::::::::::. :::.::: :::::::::::::::::::::::::::::::::::
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pF1KB3 EAKRNGTGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGTEDEDSSIAPQ
:.:.:: ::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::.:..: ::.::
XP_011 ESKQNGIGINPYCALIEEAYGLDKIEFLQSHENQEIYQKAFDLIEHYFGVEEDDPSIVPQ
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520 530
pF1KB3 VDLNQQQYIFQQCEAPMEGFQL
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XP_011 VDENQQQFIFQQQEAPMDGFQL
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>>XP_016866327 (OMIM: 604545) PREDICTED: importin subuni (559 aa)
initn: 2882 init1: 2601 opt: 2879 Z-score: 2813.1 bits: 530.3 E(85289): 5.9e-150
Smith-Waterman score: 2879; 80.0% identity (93.1% similar) in 539 aa overlap (1-538:24-559)
10 20 30
pF1KB3 MTTPGKENFRLKSYKNKSLNPDEMRRRREEEGLQLRK
:..:::.:.:.::::::.:::.::::::::::.::::
XP_016 MGRQRSRGRGSRTFPLRTRRRDAMASPGKDNYRMKSYKNKALNPQEMRRRREEEGIQLRK
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 QKREEQLFKRRNVATAEEETEEEVMSDGGFHEAQINNMEMAPGG-VITSDMIEMIFSKSP
::::::::::::: .. .: : .. ... .:.. : :.:.::..::::..
XP_016 QKREEQLFKRRNVYLPRN---DESMLESPIQDPDISSTVPIPEEEVVTTDMVQMIFSNNA
70 80 90 100 110
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pF1KB3 EQQLSATQKFRKLLSKEPNPPIDEVISTPGVVARFVEFLKRKENCTLQFESAWVLTNIAS
.:::.::::::::::::::::::.::. :::: :::.::.:.::::::::.::.::::::
XP_016 DQQLTATQKFRKLLSKEPNPPIDQVIQKPGVVQRFVKFLERNENCTLQFEAAWALTNIAS
120 130 140 150 160 170
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pF1KB3 GNSLQTRIVIQAGAVPIFIELLSSEFEDVQEQAVWALGNIAGDSTMCRDYVLDCNILPPL
:. :.:..::..:::::::.::.:: :::::::::::::::::.. :::.::.:.:::::
XP_016 GTFLHTKVVIETGAVPIFIKLLNSEHEDVQEQAVWALGNIAGDNAECRDFVLNCEILPPL
180 190 200 210 220 230
220 230 240 250 260 270
pF1KB3 LQLFSKQNRLTMTRNAVWALSNLCRGKSPPPEFAKVSPCLNVLSWLLFVSDTDVLADACW
:.:....:::: :::::::::::::::.:::.:.:::::::::: ::: :: :::::.::
XP_016 LELLTNSNRLTTTRNAVWALSNLCRGKNPPPNFSKVSPCLNVLSRLLFSSDPDVLADVCW
240 250 260 270 280 290
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 ALSYLSDGPNDKIQAVIDAGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILN
::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
XP_016 ALSYLSDGPNDKIQAVIDSGVCRRLVELLMHNDYKVVSPALRAVGNIVTGDDIQTQVILN
300 310 320 330 340 350
340 350 360 370 380 390
pF1KB3 CSALQSLLHLLSSPKESIKKEACWTISNITAGNRAQIQTVIDANIFPALISILQTAEFRT
:::: ::::::::::::.::::::.::::::::::::.::::::::.:: ::: :::::
XP_016 CSALPCLLHLLSSPKESIRKEACWTVSNITAGNRAQIQAVIDANIFPVLIEILQKAEFRT
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400 410 420 430 440 450
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