FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3540, 1175 aa
1>>>pF1KB3540 1175 - 1175 aa - 1175 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.4048+/-0.00158; mu= 8.4819+/- 0.094
mean_var=218.7950+/-44.542, 0's: 0 Z-trim(103.7): 86 B-trim: 101 in 1/52
Lambda= 0.086707
statistics sampled from 7483 (7550) to 7483 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.562), E-opt: 0.2 (0.232), width: 16
Scan time: 3.970
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS13105.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1175) 7740 983.1 0
CCDS13104.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1194) 7605 966.2 0
CCDS54447.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1187) 4176 537.2 8.6e-152
CCDS13102.1 PLCB1 gene_id:23236|Hs108|chr20 (1216) 1436 194.5 1.3e-48
CCDS13103.1 PLCB1 gene_id:23236|Hs108|chr20 (1173) 1435 194.4 1.4e-48
CCDS53654.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1167) 1303 177.8 1.3e-43
CCDS8064.1 PLCB3 gene_id:5331|Hs108|chr11 (1234) 1303 177.9 1.4e-43
CCDS61592.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1181) 1111 153.8 2.2e-36
CCDS42020.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1185) 1100 152.4 5.8e-36
CCDS61591.1 PLCB2 gene_id:5330|Hs108|chr15 (1170) 1092 151.4 1.2e-35
CCDS74077.1 PLCD3 gene_id:113026|Hs108|chr17 ( 789) 674 99.0 4.8e-20
CCDS53555.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (1994) 670 98.9 1.3e-19
CCDS41552.1 PLCE1 gene_id:51196|Hs108|chr10 (2302) 670 98.9 1.5e-19
CCDS46516.1 PLCD4 gene_id:84812|Hs108|chr2 ( 762) 659 97.1 1.7e-19
CCDS2326.2 PLCL1 gene_id:5334|Hs108|chr2 (1095) 644 95.4 8.1e-19
CCDS33713.1 PLCL2 gene_id:23228|Hs108|chr3 (1001) 627 93.2 3.3e-18
CCDS74911.1 PLCL2 gene_id:23228|Hs108|chr3 (1127) 627 93.3 3.6e-18
CCDS2671.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 ( 756) 610 91.0 1.2e-17
CCDS46793.1 PLCD1 gene_id:5333|Hs108|chr3 ( 777) 610 91.0 1.2e-17
CCDS59959.1 PLCH2 gene_id:9651|Hs108|chr1 (1416) 613 91.6 1.4e-17
CCDS13314.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1290) 604 90.4 2.9e-17
CCDS13313.1 PLCG1 gene_id:5335|Hs108|chr20 (1291) 604 90.4 2.9e-17
CCDS33881.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1655) 563 85.4 1.2e-15
CCDS46940.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1002) 557 84.5 1.4e-15
CCDS46939.1 PLCH1 gene_id:23007|Hs108|chr3 (1693) 557 84.7 2.1e-15
CCDS81671.1 PLCZ1 gene_id:89869|Hs108|chr12 ( 415) 519 79.4 2e-14
CCDS8680.1 PLCZ1 gene_id:89869|Hs108|chr12 ( 608) 519 79.5 2.7e-14
CCDS42204.1 PLCG2 gene_id:5336|Hs108|chr16 (1265) 452 71.4 1.5e-11
>>CCDS13105.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1175 aa)
initn: 7740 init1: 7740 opt: 7740 Z-score: 5248.2 bits: 983.1 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7740; 99.9% identity (100.0% similar) in 1175 aa overlap (1-1175:1-1175)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAKPYEFNWQKEVPSFLQEGTVFDRYEEESFVFEPNCLFKVDEFGFFLTWRSEGKEGQVL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MAKPYEFNWQKEVPSFLQEGAVFDRYEEESFVFEPNCLFKVDEFGFFLTWRSEGKEGQVL
10 20 30 40 50 60
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pF1KB3 ECSLINSIRSGAIPKDPKILAALEAVGKSENDLEGRIVCVCSGTDLVNISFTYMVAENPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ECSLINSIRSGAIPKDPKILAALEAVGKSENDLEGRIVCVCSGTDLVNISFTYMVAENPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VTKQWVEGLRSIIHNFRANNVSPMTCLKKHWMKLAFMTNTNGKIPVRSITRTFASGKTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VTKQWVEGLRSIIHNFRANNVSPMTCLKKHWMKLAFMTNTNGKIPVRSITRTFASGKTEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 VIFQALKELGLPSGKNDEIEPTAFSYEKFYELTQKICPRTDIEDLFKKINGDKTDYLTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VIFQALKELGLPSGKNDEIEPTAFSYEKFYELTQKICPRTDIEDLFKKINGDKTDYLTVD
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 QLVSFLNEHQRDPRLNEILFPFYDAKRAMQIIEMYEPDEDLKKKGLISSDGFCRYLMSDE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 QLVSFLNEHQRDPRLNEILFPFYDAKRAMQIIEMYEPDEDLKKKGLISSDGFCRYLMSDE
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NAPVFLDRLELYQEMDHPLAHYFISSSHNTYLTGRQFGGKSSVEMYRQVLLAGCRCVELD
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 CWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHCSKYQQYKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHCSKYQQYKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLKPEVEKKQLEALRSM
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 MEAGESASPANILEDDNEEEIESADQEEEAHPEFKFGNELSADDLGHKEAVANSVKKGLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 MEAGESASPANILEDDNEEEIESADQEEEAHPEFKFGNELSADDLGHKEAVANSVKKGLV
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pF1KB3 TVEDEQAWMASYKYVGATTNIHPYLSTMINYAQPVKFQGFHVAEERNIHYNMSSFNESVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TVEDEQAWMASYKYVGATTNIHPYLSTMINYAQPVKFQGFHVAEERNIHYNMSSFNESVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGYLKTHAIEFVNYNKRQMSRIYPKGGRVDSSNYMPQIFWNAGCQMVSLNYQTPDLAMQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NQGKFEYNGSCGYLLKPDFMRRPDRTFDPFSETPVDGVIAATCSVQVISGQFLSDKKIGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YVEVDMYGLPTDTIRKEFRTRMVMNNGLNPVYNEESFVFRKVILPDLAVLRIAVYDDNNK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIGQRILPLDGLQAGYRHISLRNEGNKPLSLPTIFCNIVLKTYVPDGFGDIVDALSDPKK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FLSITEKRADQMRAMGIETSDIADVPSDTSKNDKKGKANTAKANVTPQSSSELRPTTTAA
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VDKIVAQYDKEKSTHEKILEKAMKKKGGSNCLEMKKETEIKIQTLTSDHKSKVKEIVAQH
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pF1KB3 TKEWSEMINTHSAEEQEIRDLHLSQQCELLKKLLINAHEQQTQQLKLSHDRESKEMRAHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TKEWSEMINTHSAEEQEIRDLHLSQQCELLKKLLINAHEQQTQQLKLSHDRESKEMRAHQ
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pF1KB3 AKISMENSKAISQDKSIKNKAERERRVRELNSSNTKKFLEERKRLAMKQSKEMDQLKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKISMENSKAISQDKSIKNKAERERRVRELNSSNTKKFLEERKRLAMKQSKEMDQLKKVQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
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pF1KB3 LEHLEFLEKQNEQAKEMQQMVKLEAEMDRRPATVV
:::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LEHLEFLEKQNEQAKEMQQMVKLEAEMDRRPATVV
1150 1160 1170
>>CCDS13104.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1194 aa)
initn: 7603 init1: 7603 opt: 7605 Z-score: 5156.8 bits: 966.2 E(32554): 0
Smith-Waterman score: 7605; 98.8% identity (99.3% similar) in 1169 aa overlap (1-1168:1-1169)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAKPYEFNWQKEVPSFLQEGTVFDRYEEESFVFEPNCLFKVDEFGFFLTWRSEGKEGQVL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 ECSLINSIRSGAIPKDPKILAALEAVGKSENDLEGRIVCVCSGTDLVNISFTYMVAENPE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NAPVFLDRLELYQEMDHPLAHYFISSSHNTYLTGRQFGGKSSVEMYRQVLLAGCRCVELD
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pF1KB3 CWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHCSKYQQYKM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 CWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHCSKYQQYKM
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pF1KB3 SKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLKPEVEKKQLEALRSM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 SKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLKPEVEKKQLEALRSM
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CCDS13 MEAGESASPANILEDDNEEEIESADQEEEAHPEFKFGNELSADDLGHKEAVANSVKKGLV
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pF1KB3 TVEDEQAWMASYKYVGATTNIHPYLSTMINYAQPVKFQGFHVAEERNIHYNMSSFNESVG
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CCDS13 TVEDEQAWMASYKYVGATTNIHPYLSTMINYAQPVKFQGFHVAEERNIHYNMSSFNESVG
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LGYLKTHAIEFVNYNKRQMSRIYPKGGRVDSSNYMPQIFWNAGCQMVSLNYQTPDLAMQL
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 NQGKFEYNGSCGYLLKPDFMRRPDRTFDPFSETPVDGVIAATCSVQVISGQFLSDKKIGT
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 YVEVDMYGLPTDTIRKEFRTRMVMNNGLNPVYNEESFVFRKVILPDLAVLRIAVYDDNNK
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LIGQRILPLDGLQAGYRHISLRNEGNKPLSLPTIFCNIVLKTYVPDGFGDIVDALSDPKK
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pF1KB3 FLSITEKRADQMRAMGIETSDIADVPSDTSKNDKKGKANTAKANVTPQSSSELRPTTTAA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 FLSITEKRADQMRAMGIETSDIADVPSDTSKNDKKGKANTAKANVTPQSSSELRPTTTAA
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pF1KB3 LASGVEAKKGIELIPQVRIEDLKQMKAYLKHLKKQQKELNSLKKKHAKEHSTMQKLHCTQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 LASGVEAKKGIELIPQVRIEDLKQMKAYLKHLKKQQKELNSLKKKHAKEHSTMQKLHCTQ
910 920 930 940 950 960
970 980 990 1000 1010 1020
pF1KB3 VDKIVAQYDKEKSTHEKILEKAMKKKGGSNCLEMKKETEIKIQTLTSDHKSKVKEIVAQH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 VDKIVAQYDKEKSTHEKILEKAMKKKGGSNCLEMKKETEIKIQTLTSDHKSKVKEIVAQH
970 980 990 1000 1010 1020
1030 1040 1050 1060 1070 1080
pF1KB3 TKEWSEMINTHSAEEQEIRDLHLSQQCELLKKLLINAHEQQTQQLKLSHDRESKEMRAHQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 TKEWSEMINTHSAEEQEIRDLHLSQQCELLKKLLINAHEQQTQQLKLSHDRESKEMRAHQ
1030 1040 1050 1060 1070 1080
1090 1100 1110 1120 1130 1140
pF1KB3 AKISMENSKAISQDKSIKNKAERERRVRELNSSNTKKFLEERKRLAMKQSKEMDQLKKVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS13 AKISMENSKAISQDKSIKNKAERERRVRELNSSNTKKFLEERKRLAMKQSKEMDQLKKVQ
1090 1100 1110 1120 1130 1140
1150 1160 1170
pF1KB3 LEHLEFLEKQNEQA-KEMQQMVKLEAEMDRRPATVV
::::::::::::: : . . . ..: :
CCDS13 LEHLEFLEKQNEQLLKSCHAVSQTQGEGDAADGEIGSRDGPQTSNSSMKLQNAN
1150 1160 1170 1180 1190
>>CCDS54447.1 PLCB4 gene_id:5332|Hs108|chr20 (1187 aa)
initn: 4158 init1: 4158 opt: 4176 Z-score: 2838.6 bits: 537.2 E(32554): 8.6e-152
Smith-Waterman score: 7706; 98.9% identity (99.0% similar) in 1187 aa overlap (1-1175:1-1187)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MAKPYEFNWQKEVPSFLQEGTVFDRYEEESFVFEPNCLFKVDEFGFFLTWRSEGKEGQVL
::::::::::::::::::::.:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MAKPYEFNWQKEVPSFLQEGAVFDRYEEESFVFEPNCLFKVDEFGFFLTWRSEGKEGQVL
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ECSLINSIRSGAIPKDPKILAALEAVGKSENDLEGRIVCVCSGTDLVNISFTYMVAENPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 ECSLINSIRSGAIPKDPKILAALEAVGKSENDLEGRIVCVCSGTDLVNISFTYMVAENPE
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 VTKQWVEGLRSIIHNFRANNVSPMTCLKKHWMKLAFMTNTNGKIPVRSITRTFASGKTEK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VTKQWVEGLRSIIHNFRANNVSPMTCLKKHWMKLAFMTNTNGKIPVRSITRTFASGKTEK
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 VIFQALKELGLPSGKNDEIEPTAFSYEKFYELTQKICPRTDIEDLFKKINGDKTDYLTVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 VIFQALKELGLPSGKNDEIEPTAFSYEKFYELTQKICPRTDIEDLFKKINGDKTDYLTVD
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250 260 270 280 290 300
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CCDS54 QLVSFLNEHQRDPRLNEILFPFYDAKRAMQIIEMYEPDEDLKKKGLISSDGFCRYLMSDE
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 NAPVFLDRLELYQEMDHPLAHYFISSSHNTYLTGRQFGGKSSVEMYRQVLLAGCRCVELD
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 CWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHCSKYQQYKM
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLKPEVEKKQLEALRSM
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:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
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::::::.::::::::.:::.:: :: :.:. ..:..:::..:: .::.::.:: :: ::
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...::. :. . : . . :: .:: .: ::.:::.:...: ::
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CCDS13 KLTDVAEECQNNQLKKLKEICEKEKKELKKKMDKKRQEKITEAKS-KDKSQMEEEKTEMI
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CCDS13 RSYIQEVVQYIKRLEEAQSKRQEKLVE---KHKEIRQQILDEKPKLQ--VELEQEYQDKF
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CCDS13 KRLPLEILEFVQEAMKGKISEDSNHGSAPLSLSSDPGKVNHKTPSSEELGGDIPGKEFDT
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pF1KB3 FASGKTEKVIFQALKELGLPSGKNDEIEPTAFSYEKFYELTQKICPRTDIEDLFKKINGD
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CCDS13 FSADR--KRVETALEACSLPSSRNDSIPQEDFTPEVYRVFLNNLCPRPEIDNIFSEFGAK
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pF1KB3 GCRCVELDCWDGKGEDQEPIITHGKAMCTDILFKDVIQAIKETAFVTSEYPVILSFENHC
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pF1KB3 ANSVKKGLVTVEDEQAWMASYKYVGATTNIHPYLSTMINYAQPVKFQGFHVAEERNIHYN
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CCDS13 FLSDKKVGTYVEVDMFGLPVDTRRKAFKTKTSQGNAVNPVWEEEPIVFKKVVLPTLACLR
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pF1KB3 IAVYDDNNKLIGQRILPLDGLQAGYRHISLRNEGNKPLSLPTIFCNIVLKTYVPDGFGDI
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CCDS13 IAVYEEGGKFIGHRILPVQAIRPGYHYICLRNERNQPLTLPAVFVYIEVKDYVPDTYADV
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CCDS13 IEALSNPIRYVNLMEQRAKQLAALTLEDEEEVKKEADPGETPSEAPSEARTTPAENGVNH
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CCDS13 TTTLTPKPPSQALHSQPAPGSVKAPAKTE-DLIQSVLTEVEAQTIEELKQQKSFVKLQKK
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CCDS13 HYKEMKDLVKRHHKKTTDLIKEHTTKYNEIQNDYLRRRAALEKSAKKDSKKKSEPSSPDH
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CCDS13 GSST-IE-QDLAALDAEMTQKLIDLKDKQQQQLLNLRQEQYYSEKYQKREHIKL---LIQ
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CCDS53 EAQRRLEHLRQALQRLREVVLDANTTQFKRLKEMNEREKKEL---QKILDRKRHNSISEA
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CCDS80 GAL---GGAADVEDTKEGE--------DEAKRYQEFQNRQVQSLLELREAQVDAEAQRRL
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CCDS80 ECQEQRARLPQEIRRSLLGEMPEGLGDGPLVACASNGHAPGSSGHLSGADSESQEENTQL
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CCDS61 DITSIRDTRFGKFAKMPKSQKLRDVFNMDFPDNSFLLKTLTVVSGPDMVDLTFHNFVSYK
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CCDS61 ENVGKAWAEDVLALVKHPLTANASRSTFLDKILVKLKMQLNSEGKIPVKNFFQMFPADR-
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CCDS61 KEHLTKFINQKQRDSRLNSLLFPPARPDQVQGLIDKYEPSGINAQRGQLSPEGMVWFLCG
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CCDS61 PENSVLAQDKLLLHHDMTQPLNHYFINSSHNTYLTAGQFSGLSSAEMYRQVLLSGCRCVE
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CCDS61 LDCWKGKPPDEEPIITHGFTMTTDIFFKEAIEAIAESAFKTSPYPIILSFENHVDSPRQQ
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pF1KB3 YKMSKYCEDLFGDLLLKQALESHPLEPGRALPSPNDLKRKILIKNKRLKPEVEKKQLEAL
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CCDS61 AKMAEYCRTIFGDMLLTEPLEKFPLKPGVPLPSPEDLRGKILIKNK--KNQFSGPTSSSK
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CCDS61 DTGGEAEGSSPPSAPAVWAGEEGTELEEEEVEEEEEEESGN------LDEEE-----IKK
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:: . .: .. . .:...:: ::.:: .:. . ..: : .:::.:
CCDS61 ---MQSDEGT-------AGLEVTAYEEMSSLVNYIQPTKFVSFEFSAQKNRSYVISSFTE
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