Result of FASTA (omim) for
pF1KB3476
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3476, 723 aa
1>>>pF1KB3476 723 - 723 aa - 723 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 5.7359+/-0.000387; mu= 17.6776+/- 0.024
mean_var=71.1444+/-14.435, 0's: 0 Z-trim(112.1): 25 B-trim: 789 in 1/51
Lambda= 0.152056
statistics sampled from 20878 (20900) to 20878 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.609), E-opt: 0.2 (0.245), width: 16
Scan time: 9.630
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_001245366 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase ( 723) 4949 1095.4 0
NP_689508 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase, c ( 723) 4949 1095.4 0
NP_001245367 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase ( 756) 4209 933.0 0
NP_001258825 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA ( 588) 1416 320.3 1.4e-86
NP_001258824 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA ( 636) 1416 320.3 1.5e-86
XP_006711619 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: thre ( 669) 1416 320.3 1.6e-86
NP_079426 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA li ( 718) 1416 320.3 1.7e-86
XP_016857884 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: thre ( 602) 917 210.8 1.3e-53
XP_016857883 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: thre ( 635) 917 210.8 1.3e-53
XP_006711618 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: thre ( 684) 917 210.8 1.4e-53
NP_059142 (OMIM: 611845) 39S ribosomal protein L39 ( 338) 187 50.6 1.2e-05
XP_006724089 (OMIM: 611845) PREDICTED: 39S ribosom ( 353) 187 50.6 1.3e-05
NP_542984 (OMIM: 611845) 39S ribosomal protein L39 ( 353) 187 50.6 1.3e-05
XP_011527953 (OMIM: 611845) PREDICTED: 39S ribosom ( 296) 180 49.0 3.2e-05
NP_689481 (OMIM: 612036) probable proline--tRNA li ( 475) 156 43.8 0.0019
>>NP_001245366 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase, cy (723 aa)
initn: 4949 init1: 4949 opt: 4949 Z-score: 5862.7 bits: 1095.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4949; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (1-723:1-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 EEF
:::
NP_001 EEF
>>NP_689508 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase, cytop (723 aa)
initn: 4949 init1: 4949 opt: 4949 Z-score: 5862.7 bits: 1095.4 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4949; 100.0% identity (100.0% similar) in 723 aa overlap (1-723:1-723)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIA
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIE
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRIL
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 NEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGI
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 SFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFI
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 RSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMF
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 DHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCL
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 DFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFY
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 GPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERM
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 IAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNK
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_689 KIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAE
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 EEF
:::
NP_689 EEF
>>NP_001245367 (OMIM: 187790) threonine--tRNA ligase, cy (756 aa)
initn: 4209 init1: 4209 opt: 4209 Z-score: 4985.0 bits: 933.0 E(85289): 0
Smith-Waterman score: 4866; 95.6% identity (95.6% similar) in 755 aa overlap (2-723:2-756)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 MFEEKASSPSGKMGGEEKPIGAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEM
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110
pF1KB3 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGIS----------
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 YNILKAEHDSILAEKAEKDSKPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISHTASCKNLSS
70 80 90 100 110 120
120 130 140
pF1KB3 -----------------------QGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDE
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 LASLLASVAIPSSGMPWPPLFFLQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLELLKFEDE
130 140 150 160 170 180
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 EAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 EAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYLEEGGVSSNDFSSLEALCK
190 200 210 220 230 240
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 KIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 KIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLIDLCRGPHVR
250 260 270 280 290 300
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 HTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAKNRDHRKIG
310 320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 RDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFNSRLWMTSG
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 HWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 HWQHYSENMFSFEVEKELFALKPMNCPGHCLMFDHRPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSG
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 ALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 ALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDFLRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLG
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 DIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 DIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGPKIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQL
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610 620
pF1KB3 PIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIAILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVG
610 620 630 640 650 660
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 PTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 PTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKIRNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVN
670 680 690 700 710 720
690 700 710 720
pF1KB3 IRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEEF
::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_001 IRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEEF
730 740 750
>>NP_001258825 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA lig (588 aa)
initn: 2094 init1: 919 opt: 1416 Z-score: 1675.4 bits: 320.3 E(85289): 1.4e-86
Smith-Waterman score: 1782; 42.8% identity (63.8% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-588)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
NP_001 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
NP_001 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
NP_001 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .::
NP_001 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFK----------------------------
180 190 200 210
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
NP_001 ------------------------------------------------------------
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
.:: .:::.:: ::..:.
NP_001 ------------------------------------------AEYAHRGFSEVKTPTLFS
220
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
NP_001 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
230 240 250 260 270 280
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
NP_001 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
290 300 310 320 330 340
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
NP_001 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
350 360 370 380 390 400
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. : .:::..:::.::::::...
NP_001 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
410 420 430 440 450 460
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
.:.:. :::::.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
NP_001 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
470 480 490 500 510 520
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
NP_001 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 F
:
NP_001 F
>>NP_001258824 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA lig (636 aa)
initn: 2261 init1: 919 opt: 1416 Z-score: 1674.9 bits: 320.3 E(85289): 1.5e-86
Smith-Waterman score: 2076; 46.7% identity (69.6% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-636)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
NP_001 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
NP_001 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
NP_001 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
NP_001 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .::.
NP_001 LCQGPHLRHTGQIGGLKL------------------------------------------
240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
. .:: .:::.:: ::..:.
NP_001 ----------------------------------------LSAEYAHRGFSEVKTPTLFS
260 270
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
NP_001 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
NP_001 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
NP_001 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. : .:::..:::.::::::...
NP_001 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
460 470 480 490 500 510
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
.:.:. :::::.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
NP_001 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
520 530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
NP_001 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 F
:
NP_001 F
>>XP_006711619 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: threonin (669 aa)
initn: 2459 init1: 919 opt: 1416 Z-score: 1674.5 bits: 320.3 E(85289): 1.6e-86
Smith-Waterman score: 2336; 50.7% identity (74.2% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-669)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
XP_006 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
XP_006 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
XP_006 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
XP_006 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .:: .:.:
XP_006 LCQGPHLRHTGQIGGLK------------------------------LLSE---------
240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
:::.::::::::::::::.:. .::::. :::.:: .:::.:: ::..:.
XP_006 ----------QELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYNALVAFIRAEYAHRGFSEVKTPTLFS
260 270 280 290 300
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
XP_006 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
XP_006 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
XP_006 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. : .:::..:::.::::::...
XP_006 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
490 500 510 520 530 540
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
.:.:. :::::.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
XP_006 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
550 560 570 580 590 600
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
XP_006 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 F
:
XP_006 F
>>NP_079426 (OMIM: 612805,615918) threonine--tRNA ligase (718 aa)
initn: 2658 init1: 919 opt: 1416 Z-score: 1674.1 bits: 320.3 E(85289): 1.7e-86
Smith-Waterman score: 2631; 54.1% identity (79.9% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-718)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
NP_079 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
NP_079 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
NP_079 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
NP_079 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .::. .:::. :.... :::::. ::::: ..:. :: ..:::.
NP_079 LCQGPHLRHTGQIGGLKLLSNSSSLWRSSGAPETLQRVSGISFPTTELLRVWEAWREEAE
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
::::.::..:::.::::::::::::::.:. .::::. :::.:: .:::.:: ::..:.
NP_079 LRDHRRIGKEQELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYNALVAFIRAEYAHRGFSEVKTPTLFS
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
NP_079 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
NP_079 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
NP_079 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: : .. : .:::..:::.::::::...
NP_079 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQYKGQAGA-LERPVLIHRAVLGSVERLLG
540 550 560 570 580 590
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
.:.:. :::::.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
NP_079 VLAESCGGKWPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
600 610 620 630 640 650
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
NP_079 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
660 670 680 690 700 710
pF1KB3 F
:
NP_079 F
>>XP_016857884 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: threonin (602 aa)
initn: 2105 init1: 915 opt: 917 Z-score: 1083.7 bits: 210.8 E(85289): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 1866; 44.1% identity (65.3% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-602)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
XP_016 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
XP_016 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
XP_016 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
XP_016 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .::.
XP_016 LCQGPHLRHTGQIGGLKL------------------------------------------
240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
. .:: .:::.:: ::..:.
XP_016 ----------------------------------------LSAEYAHRGFSEVKTPTLFS
260 270
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
XP_016 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
280 290 300 310 320 330
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
XP_016 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
340 350 360 370 380 390
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
XP_016 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
400 410 420 430 440 450
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: :
XP_016 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQY---------------------------
460 470 480
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
: :.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
XP_016 --------KGPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
490 500 510 520 530 540
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
XP_016 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 F
:
XP_016 F
>>XP_016857883 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: threonin (635 aa)
initn: 2299 init1: 915 opt: 917 Z-score: 1083.3 bits: 210.8 E(85289): 1.3e-53
Smith-Waterman score: 2126; 48.0% identity (69.9% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-635)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
XP_016 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
XP_016 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
XP_016 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
XP_016 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .:: .:.:
XP_016 LCQGPHLRHTGQIGGLK------------------------------LLSE---------
240 250
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
:::.::::::::::::::.:. .::::. :::.:: .:::.:: ::..:.
XP_016 ----------QELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYNALVAFIRAEYAHRGFSEVKTPTLFS
260 270 280 290 300
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
XP_016 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
310 320 330 340 350 360
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
XP_016 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
370 380 390 400 410 420
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
XP_016 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
430 440 450 460 470 480
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: :
XP_016 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQY---------------------------
490 500 510 520
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
: :.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
XP_016 --------KGPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
530 540 550 560 570
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
XP_016 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
580 590 600 610 620 630
pF1KB3 F
:
XP_016 F
>>XP_006711618 (OMIM: 612805,615918) PREDICTED: threonin (684 aa)
initn: 2498 init1: 915 opt: 917 Z-score: 1082.8 bits: 210.8 E(85289): 1.4e-53
Smith-Waterman score: 2421; 51.5% identity (75.5% similar) in 691 aa overlap (51-723:29-684)
30 40 50 60 70 80
pF1KB3 GAGEEKQKEGGKKKNKEGSGDGGRAELNPWPEYIYTRLEMYNILKAEHDSILAEKAEKDS
:... :: ... : : . . :: :.:.
XP_006 MALYQRWRCLRLQGLQACRLHTAVVSTPPRWLAERLGLFEELWAAQVKRLASMAQKEP
10 20 30 40 50
90 100 110 120 130 140
pF1KB3 KPIKVTLPDGKQVDAESWKTTPYQIACGISQGLADNTVIAKVNNVVWDLDRPLEEDCTLE
. ::..:: :...:: .:.:::::.: ::. :::..: :.::. .::.:::: : :.
XP_006 RTIKISLPGGQKIDAVAWNTTPYQLARQISSTLADTAVAAQVNGEPYDLERPLETDSDLR
60 70 80 90 100 110
150 160 170 180 190
pF1KB3 LLKFEDEEAQAVYWHSSAHIMGEAMERVYGGCLCYGPPIENGFYYDMYL-EEGGVSSNDF
.: :.. :..::.::::.:..: : :. :. :: :: : :::.:..: .: . ....
XP_006 FLTFDSPEGKAVFWHSSTHVLGAAAEQFLGAVLCRGPSTEYGFYHDFFLGKERTIRGSEL
120 130 140 150 160 170
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SSLEALCKKIIKEKQAFERLEVKKETLLAMFKYNKFKCRILNEKVNTPTTTVYRCGPLID
:: .:... . :.:::.... : .:: : :: ....:::. ::.::: :: :.:
XP_006 PVLERICQELTAAARPFRRLEASRDQLRQLFKDNPFKLHLIEEKVTGPTATVYGCGTLVD
180 190 200 210 220 230
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 LCRGPHVRHTGKIKALKIHKNSSTYWEGKADMETLQRIYGISFPDPKMLKEWEKFQEEAK
::.:::.::::.: .::. .:::. :.... :::::. ::::: ..:. :: ..:::.
XP_006 LCQGPHLRHTGQIGGLKLLSNSSSLWRSSGAPETLQRVSGISFPTTELLRVWEAWREEAE
240 250 260 270 280 290
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 NRDHRKIGRDQELYFFHELSPGSCFFLPKGAYIYNALIEFIRSEYRKRGFQEVVTPNIFN
::::.::..:::.::::::::::::::.:. .::::. :::.:: .:::.:: ::..:.
XP_006 LRDHRRIGKEQELFFFHELSPGSCFFLPRGTRVYNALVAFIRAEYAHRGFSEVKTPTLFS
300 310 320 330 340 350
380 390 400 410 420
pF1KB3 SRLWMTSGHWQHYSENMFSFEVE-----------------KELFALKPMNCPGHCLMFDH
..:: ::::.::.:.::. . . .::::::::.::::: :
XP_006 TKLWEQSGHWEHYQEDMFAVQPPGSDRPPSSQSDDSTRHITDTLALKPMNCPAHCLMFAH
360 370 380 390 400 410
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 RPRSWRELPLRLADFGVLHRNELSGALTGLTRVRRFQQDDAHIFCAMEQIEDEIKGCLDF
::::::::::::::::.::: : ::.: ::::.: ::::::::::. .:.: ::..::::
XP_006 RPRSWRELPLRLADFGALHRAEASGGLGGLTRLRCFQQDDAHIFCTTDQLEAEIQSCLDF
420 430 440 450 460 470
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 LRTVYSVFGFSFKLNLSTRPEKFLGDIEVWDQAEKQLENSLNEFGEKWELNSGDGAFYGP
::.::.:.::::.: ::::: :::: .:::::. :...:.:::: :.:::::::::::
XP_006 LRSVYAVLGFSFRLALSTRPSGFLGDPCLWDQAEQVLKQALKEFGEPWDLNSGDGAFYGP
480 490 500 510 520 530
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KIDIQIKDAIGRYHQCATIQLDFQLPIRFNLTYVSHDGDDKKRPVIVHRAILGSVERMIA
:::....::.:: :::.:::::::::.::.: :
XP_006 KIDVHLHDALGRPHQCGTIQLDFQLPLRFDLQY---------------------------
540 550 560 570
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 ILTENYGGKWPFWLSPRQVMVVPVGPTCDEYAQKVRQQFHDAKFMADIDLDPGCTLNKKI
: :.:::: ::.:.::: .:::....:... : ...:.: : : ::...:
XP_006 --------KGPLWLSPFQVVVIPVGSEQEEYAKEAQQSLRAAGLVSDLDADSGLTLSRRI
580 590 600 610 620
670 680 690 700 710 720
pF1KB3 RNAQLAQYNFILVVGEKEKISGTVNIRTRDNKVHGERTISETIERLQQLKEFRSKQAEEE
: ::::.::: .:::.::. . :::::::::. :: . :...:: .:.. : .:::
XP_006 RRAQLAHYNFQFVVGQKEQSKRTVNIRTRDNRRLGEWDLPEAVQRLVELQNTRVPNAEEI
630 640 650 660 670 680
pF1KB3 F
:
XP_006 F
723 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 21:00:17 2016 done: Thu Nov 3 21:00:19 2016
Total Scan time: 9.630 Total Display time: 0.170
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]