Result of FASTA (omim) for
pF1KB3373
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3373, 619 aa
1>>>pF1KB3373 619 - 619 aa - 619 aa
Library: /omim/omim.rfq.tfa
60827320 residues in 85289 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 8.8534+/-0.000553; mu= 4.4586+/- 0.034
mean_var=573.5011+/-126.318, 0's: 0 Z-trim(117.8): 1820 B-trim: 0 in 0/58
Lambda= 0.053556
statistics sampled from 27684 (30224) to 27684 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.701), E-opt: 0.2 (0.354), width: 16
Scan time: 10.880
The best scores are: opt bits E(85289)
NP_006600 (OMIM: 609487) mitogen-activated protein ( 619) 4145 336.4 1.8e-91
NP_002392 (OMIM: 602539) mitogen-activated protein ( 626) 2684 223.5 1.7e-57
NP_976226 (OMIM: 602539) mitogen-activated protein ( 657) 2597 216.8 1.8e-55
NP_001317360 (OMIM: 602539) mitogen-activated prot ( 622) 2401 201.7 6.5e-51
XP_005257433 (OMIM: 602539) PREDICTED: mitogen-act ( 653) 2318 195.3 5.7e-49
XP_005257435 (OMIM: 602539) PREDICTED: mitogen-act ( 532) 1826 157.1 1.4e-37
XP_016864974 (OMIM: 600982,613762) PREDICTED: mito (1349) 682 69.4 9e-11
XP_016864973 (OMIM: 600982,613762) PREDICTED: mito (1375) 682 69.4 9.1e-11
NP_005912 (OMIM: 600982,613762) mitogen-activated (1512) 682 69.5 9.5e-11
NP_001288001 (OMIM: 602425) mitogen-activated prot (1604) 676 69.1 1.3e-10
NP_001278887 (OMIM: 602425) mitogen-activated prot (1061) 670 68.3 1.5e-10
XP_016866358 (OMIM: 602425) PREDICTED: mitogen-act (1517) 670 68.6 1.8e-10
NP_005913 (OMIM: 602425) mitogen-activated protein (1608) 670 68.6 1.9e-10
XP_005267046 (OMIM: 602425) PREDICTED: mitogen-act (1554) 642 66.4 8.2e-10
NP_006715 (OMIM: 602425) mitogen-activated protein (1558) 642 66.4 8.2e-10
XP_011543813 (OMIM: 300820) PREDICTED: mitogen-act ( 748) 583 61.3 1.4e-08
XP_011543812 (OMIM: 300820) PREDICTED: mitogen-act ( 871) 583 61.4 1.5e-08
XP_011543810 (OMIM: 300820) PREDICTED: mitogen-act (1295) 583 61.7 1.8e-08
NP_001001671 (OMIM: 300820) mitogen-activated prot (1313) 583 61.8 1.8e-08
XP_011543809 (OMIM: 300820) PREDICTED: mitogen-act (1324) 583 61.8 1.8e-08
XP_016866366 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1181) 567 60.4 4e-08
XP_016866365 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1191) 567 60.4 4e-08
XP_016858260 (OMIM: 604468) PREDICTED: mitogen-act ( 869) 564 60.0 4.1e-08
XP_011534141 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1286) 567 60.5 4.2e-08
NP_005914 (OMIM: 602448) mitogen-activated protein (1374) 567 60.5 4.3e-08
XP_016866364 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1447) 567 60.6 4.4e-08
XP_016866363 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1458) 567 60.6 4.4e-08
XP_016866362 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1483) 567 60.6 4.5e-08
XP_016866361 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1484) 567 60.6 4.5e-08
XP_016866360 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1493) 567 60.6 4.5e-08
XP_016866359 (OMIM: 602448) PREDICTED: mitogen-act (1494) 567 60.6 4.5e-08
NP_001284538 (OMIM: 604468) mitogen-activated prot (1280) 564 60.3 4.9e-08
NP_004663 (OMIM: 604468) mitogen-activated protein (1288) 564 60.3 4.9e-08
NP_001257354 (OMIM: 604921) mitogen-activated prot ( 873) 535 57.7 1.9e-07
NP_003609 (OMIM: 604921) mitogen-activated protein ( 894) 535 57.8 1.9e-07
XP_011534679 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 845) 508 55.6 8e-07
XP_006720076 (OMIM: 604923) PREDICTED: mitogen-act ( 846) 508 55.6 8.1e-07
NP_942089 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 508 55.6 8.1e-07
NP_006566 (OMIM: 604923) mitogen-activated protein ( 846) 508 55.6 8.1e-07
NP_001036065 (OMIM: 601983) mitogen-activated prot ( 821) 506 55.4 8.8e-07
NP_009112 (OMIM: 601983) mitogen-activated protein ( 833) 506 55.5 8.9e-07
XP_011524706 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 861) 506 55.5 9e-07
XP_011524705 (OMIM: 601983) PREDICTED: mitogen-act ( 873) 506 55.5 9.1e-07
XP_016873585 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 584) 495 54.3 1.4e-06
NP_079418 (OMIM: 610266) serine/threonine-protein ( 853) 497 54.8 1.5e-06
XP_011543505 (OMIM: 603166) PREDICTED: mitogen-act ( 797) 495 54.6 1.6e-06
NP_065842 (OMIM: 610266) serine/threonine-protein (1001) 497 54.9 1.6e-06
XP_011523362 (OMIM: 610266) PREDICTED: serine/thre (1001) 497 54.9 1.6e-06
NP_001294919 (OMIM: 603166) mitogen-activated prot ( 812) 495 54.6 1.6e-06
NP_004570 (OMIM: 603166) mitogen-activated protein ( 820) 495 54.6 1.6e-06
>>NP_006600 (OMIM: 609487) mitogen-activated protein kin (619 aa)
initn: 4145 init1: 4145 opt: 4145 Z-score: 1763.3 bits: 336.4 E(85289): 1.8e-91
Smith-Waterman score: 4145; 100.0% identity (100.0% similar) in 619 aa overlap (1-619:1-619)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKSSSPKKQNDVRVKFEHRGEKRILQFP
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKSSSPKKQNDVRVKFEHRGEKRILQFP
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 RPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILLV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 RPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILLV
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 INGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSIIGPTSRDRSSPPPGYIPDELHQVARN
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 INGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSIIGPTSRDRSSPPPGYIPDELHQVARN
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSY
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 GSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSY
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 PDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHHQEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 PDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHHQEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVS
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 FSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 FSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGK
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 LLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQ
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 LLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQ
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 YYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 YYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIV
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 HRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 HRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 KADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
NP_006 KADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVE
550 560 570 580 590 600
610
pF1KB3 AKLRPSADELLRHMFVHYH
:::::::::::::::::::
NP_006 AKLRPSADELLRHMFVHYH
610
>>NP_002392 (OMIM: 602539) mitogen-activated protein kin (626 aa)
initn: 2592 init1: 1618 opt: 2684 Z-score: 1153.2 bits: 223.5 E(85289): 1.7e-57
Smith-Waterman score: 2684; 65.3% identity (82.8% similar) in 632 aa overlap (1-617:1-623)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKSSS-PKKQNDVRVKFEHRGEKRILQF
::.:.::::::.::..:. : . :: : :... ..:.:::.:::: ::.::. :
NP_002 MDEQEALNSIMNDLVALQMNRRHRMPGYETMKNKDTGHSNRQSDVRIKFEHNGERRIIAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 PRPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILL
:::: ::.. :. .::: .:::: :::: : : .:::::::...:::: ::::.:::
NP_002 SRPVKYEDVEHKVTTVFGQPLDLHYMNNELSILLKNQDDLDKAIDILDRSSSMKSLRILL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB3 VI-----------NGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAE--RKKRLSIIGPTSRDRSSPP
. .: .. . .. : :. ::.. :...::. . . :::::
NP_002 LSQDRNHNSSSPHSGVSRQVRIKASQSAGDI-NTIYQPPEPRSRHLSV-SSQNPGRSSPP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 PGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQ-MLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLD
:::.:.. ...::.::.::::::::::::. .: ::::: :: ::: :::: ::: :
NP_002 PGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPETSEQCMLDPL--SSAENSLSGSCQSLDRSAD
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHHQEYNDGRKTFP
. :. :::: ::::.:::.::.:: .. ...: :::::::::::: ::..:.:::.:::
NP_002 SPSFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDKGVKGGTYPRRYHVSVHHKDYSDGRRTFP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISP
: :: ::. . .. :...::::.. . .. .: : : : :..: .: .:.:.. .
NP_002 RIRRHQGNLF----TLVPSSRSLSTNGENMGLAVQYLDPRGRLRSADSEN-ALSVQERNV
300 310 320 330 340 350
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 PSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALEC
:..:: :: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
NP_002 PTKSPSAPINWRRGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELASKQVQFDPDSPETSKEVSALEC
360 370 380 390 400 410
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 EIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTR
:::::::: ::::::::::::: ::::.::::::::::.::::::::::::.:::::::
NP_002 EIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQLKAYGALTESVTRKYTR
420 430 440 450 460 470
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 QILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTP
:::::. :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::.::::::
NP_002 QILEGMSYLHSNMIVHRDIKGANILRDSAGNVKLGDFGASKRLQTICMSGTGMRSVTGTP
480 490 500 510 520 530
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 YWMSPEVISGEGYGRKADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPH
::::::::::::::::::.::..:::::::::::::::.::::::::::::::::.:: :
NP_002 YWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSH
540 550 560 570 580 590
590 600 610
pF1KB3 VSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH
.:.. ::::.::::::. ::::.::: : :..
NP_002 ISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLMY
600 610 620
>>NP_976226 (OMIM: 602539) mitogen-activated protein kin (657 aa)
initn: 2592 init1: 1618 opt: 2597 Z-score: 1116.7 bits: 216.8 E(85289): 1.8e-55
Smith-Waterman score: 2601; 65.3% identity (82.2% similar) in 619 aa overlap (18-617:45-654)
10 20 30 40
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKS---SSPKKQ--N
:..: :: . : ..: .: ::. .
NP_976 VALQMNRRHRMPGYETMKNKDTGHSNRQKKHNSSSSALLNSPTVTTSSCAGASEKKKFLS
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DVRVKFEHRGEKRILQFPRPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKA
:::.:::: ::.::. : :::: ::.. :. .::: .:::: :::: : : .:::::::
NP_976 DVRIKFEHNGERRIIAFSRPVKYEDVEHKVTTVFGQPLDLHYMNNELSILLKNQDDLDKA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140
pF1KB3 VELLDRSIHMKSLKILLVI-----------NGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAE--RK
...:::: ::::.:::. .: .. . .. : :. ::.. :.
NP_976 IDILDRSSSMKSLRILLLSQDRNHNSSSPHSGVSRQVRIKASQSAGDI-NTIYQPPEPRS
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 KRLSIIGPTSRDRSSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQ-MLDPLSLSS
..::. . . ::::::::.:.. ...::.::.::::::::::::. .: ::::: ::
NP_976 RHLSV-SSQNPGRSSPPPGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPETSEQCMLDPL--SS
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 PENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRY
::: :::: ::: :. :. :::: ::::.:::.::.:: .. ...: :::::::::
NP_976 AENSLSGSCQSLDRSADSPSFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDKGVKGGTYPRRY
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 HVSYHHQEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRR
::: ::..:.:::.:::: :: ::. . .. :...::::.. . .. .: : : :
NP_976 HVSVHHKDYSDGRRTFPRIRRHQGNLF----TLVPSSRSLSTNGENMGLAVQYLDPRGRL
320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQ
:..: .: .:.:.. . :..:: :: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::
NP_976 RSADSEN-ALSVQERNVPTKSPSAPINWRRGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELASKQVQ
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 FDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQ
::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::: ::::.::::::::::.:::
NP_976 FDPDSPETSKEVSALECEIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQ
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 LKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRL
:::::::::.::::::::::::. :::::::::::::::::::::.::::::::::::::
NP_976 LKAYGALTESVTRKYTRQILEGMSYLHSNMIVHRDIKGANILRDSAGNVKLGDFGASKRL
490 500 510 520 530 540
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 QTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMA
::::.:::::.::::::::::::::::::::::::.::..:::::::::::::::.::::
NP_976 QTICMSGTGMRSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMA
550 560 570 580 590 600
570 580 590 600 610
pF1KB3 AIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH
::::::::::::.:: :.:.. ::::.::::::. ::::.::: : :..
NP_976 AIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLMY
610 620 630 640 650
>>NP_001317360 (OMIM: 602539) mitogen-activated protein (622 aa)
initn: 2525 init1: 1618 opt: 2401 Z-score: 1035.0 bits: 201.7 E(85289): 6.5e-51
Smith-Waterman score: 2678; 65.5% identity (82.8% similar) in 632 aa overlap (1-617:1-619)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKSSS-PKKQNDVRVKFEHRGEKRILQF
::.:.::::::.::..:. : . :: : :... ..:.:::.:::: ::.::. :
NP_001 MDEQEALNSIMNDLVALQMNRRHRMPGYETMKNKDTGHSNRQSDVRIKFEHNGERRIIAF
10 20 30 40 50 60
60 70 80 90 100 110
pF1KB3 PRPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILL
:::: ::.. :. .::: .:::: :::: : : .:::::::...:::: ::::.:::
NP_001 SRPVKYEDVEHKVTTVFGQPLDLHYMNNELSILLKNQDDLDKAIDILDRSSSMKSLRILL
70 80 90 100 110 120
120 130 140 150 160
pF1KB3 VI-----------NGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAE--RKKRLSIIGPTSRDRSSPP
. .: .. . .. : :. ::.. :...::. . . :::::
NP_001 LSQDRNHNSSSPHSGVSRQVRIKASQSAGDI-NTIYQPPEPRSRHLSV-SSQNPGRSSPP
130 140 150 160 170
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 PGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQ-MLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLD
:::.:.. ...::.::.::::::::::::. .: ::::: :: ::: :::: :::::
NP_001 PGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPETSEQCMLDPL--SSAENSLSGSCQSLDSP--
180 190 200 210 220 230
230 240 250 260 270 280
pF1KB3 GESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRYHVSYHHQEYNDGRKTFP
:. :::: ::::.:::.::.:: .. ...: :::::::::::: ::..:.:::.:::
NP_001 --SFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDKGVKGGTYPRRYHVSVHHKDYSDGRRTFP
240 250 260 270 280 290
290 300 310 320 330 340
pF1KB3 RARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISP
: :: ::. . .. :...::::.. . .. .: : : : :..: .: .:.:.. .
NP_001 RIRRHQGNLF----TLVPSSRSLSTNGENMGLAVQYLDPRGRLRSADSEN-ALSVQERNV
300 310 320 330 340
350 360 370 380 390 400
pF1KB3 PSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALEC
:..:: :: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::::::::::::::.::::
NP_001 PTKSPSAPINWRRGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELASKQVQFDPDSPETSKEVSALEC
350 360 370 380 390 400
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 EIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTR
:::::::: ::::::::::::: ::::.::::::::::.::::::::::::.:::::::
NP_001 EIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQLKAYGALTESVTRKYTR
410 420 430 440 450 460
470 480 490 500 510 520
pF1KB3 QILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTP
:::::. :::::::::::::::::::::.::::::::::::::::::.:::::.::::::
NP_001 QILEGMSYLHSNMIVHRDIKGANILRDSAGNVKLGDFGASKRLQTICMSGTGMRSVTGTP
470 480 490 500 510 520
530 540 550 560 570 580
pF1KB3 YWMSPEVISGEGYGRKADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPH
::::::::::::::::::.::..:::::::::::::::.::::::::::::::::.:: :
NP_001 YWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEMLTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSH
530 540 550 560 570 580
590 600 610
pF1KB3 VSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHMFVHYH
.:.. ::::.::::::. ::::.::: : :..
NP_001 ISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHHFAQLMY
590 600 610 620
>>XP_005257433 (OMIM: 602539) PREDICTED: mitogen-activat (653 aa)
initn: 2525 init1: 1618 opt: 2318 Z-score: 1000.2 bits: 195.3 E(85289): 5.7e-49
Smith-Waterman score: 2611; 62.8% identity (78.7% similar) in 662 aa overlap (2-617:2-650)
10 20 30 40
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAK----SSSPKKQN--------------
:.:.::::::.::..:. : . :: : : :. ::.:
XP_005 MDEQEALNSIMNDLVALQMNRRHRMPGYETMKNKDTGHSNRQKKHNSSSSALLNSPTVTT
10 20 30 40 50 60
50 60 70 80
pF1KB3 --------------DVRVKFEHRGEKRILQFPRPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNE
:::.:::: ::.::. : :::: ::.. :. .::: .:::: :::
XP_005 SSCAGASEKKKFLSDVRIKFEHNGERRIIAFSRPVKYEDVEHKVTTVFGQPLDLHYMNNE
70 80 90 100 110 120
90 100 110 120 130
pF1KB3 LVIPLTTQDDLDKAVELLDRSIHMKSLKILLVI-----------NGSTQATNLEPLPSLE
: : : .:::::::...:::: ::::.:::. .: .. . .. :
XP_005 LSILLKNQDDLDKAIDILDRSSSMKSLRILLLSQDRNHNSSSPHSGVSRQVRIKASQSAG
130 140 150 160 170 180
140 150 160 170 180 190
pF1KB3 DLDNTVFGAE--RKKRLSIIGPTSRDRSSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPE
:. ::.. :...::. . . ::::::::.:.. ...::.::.::::::::::::
XP_005 DI-NTIYQPPEPRSRHLSV-SSQNPGRSSPPPGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPE
190 200 210 220 230
200 210 220 230 240 250
pF1KB3 SMDQ-MLDPLSLSSPENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPI
. .: :::::: : ::: :::: ::::: :. :::: ::::.:::.::.:: .. .
XP_005 TSEQCMLDPLS--SAENSLSGSCQSLDSP----SFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQL
240 250 260 270 280 290
260 270 280 290 300 310
pF1KB3 FEKFGKGGTYPRRYHVSYHHQEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGS
..: :::::::::::: ::..:.:::.:::: :: ::. . .. :...::::.. .
XP_005 YDKGVKGGTYPRRYHVSVHHKDYSDGRRTFPRIRRHQGNLF----TLVPSSRSLSTNGEN
300 310 320 330 340
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 SIFTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCY
.. .: : : : :..: .: .:.:.. . :..:: :: ::: ::::::::::::::::
XP_005 MGLAVQYLDPRGRLRSADSEN-ALSVQERNVPTKSPSAPINWRRGKLLGQGAFGRVYLCY
350 360 370 380 390 400
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 DVDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLS
::::::::: ::::::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::: ::::.
XP_005 DVDTGRELASKQVQFDPDSPETSKEVSALECEIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLT
410 420 430 440 450 460
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 IFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDST
::::::::::.::::::::::::.::::::::::::. :::::::::::::::::::::.
XP_005 IFMEYMPGGSVKDQLKAYGALTESVTRKYTRQILEGMSYLHSNMIVHRDIKGANILRDSA
470 480 490 500 510 520
500 510 520 530 540 550
pF1KB3 GNVKLGDFGASKRLQTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVACTVVEM
::::::::::::::::::.:::::.::::::::::::::::::::::::.::..::::::
XP_005 GNVKLGDFGASKRLQTICMSGTGMRSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADVWSLGCTVVEM
530 540 550 560 570 580
560 570 580 590 600 610
pF1KB3 LTEKPPWAEFEAMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIFVEAKLRPSADELLRHM
:::::::::.::::::::::::::::.:: :.:.. ::::.::::::. ::::.::: :
XP_005 LTEKPPWAEYEAMAAIFKIATQPTNPQLPSHISEHGRDFLRRIFVEARQRPSAEELLTHH
590 600 610 620 630 640
pF1KB3 FVHYH
:..
XP_005 FAQLMY
650
>>XP_005257435 (OMIM: 602539) PREDICTED: mitogen-activat (532 aa)
initn: 1836 init1: 862 opt: 1826 Z-score: 795.5 bits: 157.1 E(85289): 1.4e-37
Smith-Waterman score: 1830; 60.3% identity (78.5% similar) in 489 aa overlap (18-487:45-524)
10 20 30 40
pF1KB3 MDDQQALNSIMQDLAVLHKASRPALSLQETRKAKS---SSPKKQ--N
:..: :: . : ..: .: ::. .
XP_005 VALQMNRRHRMPGYETMKNKDTGHSNRQKKHNSSSSALLNSPTVTTSSCAGASEKKKFLS
20 30 40 50 60 70
50 60 70 80 90 100
pF1KB3 DVRVKFEHRGEKRILQFPRPVKLEDLRSKAKIAFGQSMDLHYTNNELVIPLTTQDDLDKA
:::.:::: ::.::. : :::: ::.. :. .::: .:::: :::: : : .:::::::
XP_005 DVRIKFEHNGERRIIAFSRPVKYEDVEHKVTTVFGQPLDLHYMNNELSILLKNQDDLDKA
80 90 100 110 120 130
110 120 130 140
pF1KB3 VELLDRSIHMKSLKILLVI-----------NGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAE--RK
...:::: ::::.:::. .: .. . .. : :. ::.. :.
XP_005 IDILDRSSSMKSLRILLLSQDRNHNSSSPHSGVSRQVRIKASQSAGDI-NTIYQPPEPRS
140 150 160 170 180 190
150 160 170 180 190 200
pF1KB3 KRLSIIGPTSRDRSSPPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQ-MLDPLSLSS
..::. . . ::::::::.:.. ...::.::.::::::::::::. .: :::::: :
XP_005 RHLSV-SSQNPGRSSPPPGYVPERQQHIARQGSYTSINSEGEFIPETSEQCMLDPLS--S
200 210 220 230 240 250
210 220 230 240 250 260
pF1KB3 PENSGSGSCPSLDSPLDGESYPKSRMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGTYPRRY
::: :::: ::: :. :. :::: ::::.:::.::.:: .. ...: :::::::::
XP_005 AENSLSGSCQSLDRSADSPSFRKSRMSRAQSFPDNRQEYSDRETQLYDKGVKGGTYPRRY
260 270 280 290 300 310
270 280 290 300 310 320
pF1KB3 HVSYHHQEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRR
::: ::..:.:::.:::: :: ::. . .. :...::::.. . .. .: : : :
XP_005 HVSVHHKDYSDGRRTFPRIRRHQGNLF----TLVPSSRSLSTNGENMGLAVQYLDPRGRL
320 330 340 350 360
330 340 350 360 370 380
pF1KB3 RGSDIDNPTLTVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQ
:..: .: .:.:.. . :..:: :: ::: ::::::::::::::::::::::::: ::::
XP_005 RSADSEN-ALSVQERNVPTKSPSAPINWRRGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELASKQVQ
370 380 390 400 410 420
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 FDPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQ
::::::::::::.:::::::::::: ::::::::::::: ::::.::::::::::.:::
XP_005 FDPDSPETSKEVSALECEIQLLKNLQHERIVQYYGCLRDRAEKTLTIFMEYMPGGSVKDQ
430 440 450 460 470 480
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 LKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRL
:::::::::.::::::::::::. :::::::::::::::
XP_005 LKAYGALTESVTRKYTRQILEGMSYLHSNMIVHRDIKGAWAALWWRC
490 500 510 520 530
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 QTICLSGTGMKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFEAMA
>>XP_016864974 (OMIM: 600982,613762) PREDICTED: mitogen- (1349 aa)
initn: 591 init1: 240 opt: 682 Z-score: 314.4 bits: 69.4 E(85289): 9e-11
Smith-Waterman score: 682; 41.4% identity (70.0% similar) in 280 aa overlap (347-613:1070-1342)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 FTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSP-RAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYD
...: : :.: :. .: :::. : :
XP_016 PIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQD
1040 1050 1060 1070 1080 1090
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEV-NALECEIQLLKNLLHERIVQYYG--CLRDPQEKT
: :: .::::: . .. ..:: .::. ::.....: : :... : : ....
XP_016 VGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATC----EKSN
1100 1110 1120 1130 1140 1150
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRD
..:.:.: :::. :. :::. :.:. .::.:.:.:. ::: :.:.:::.::::.: :
XP_016 YNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLID
1160 1170 1180 1190 1200 1210
500 510 520 530 540
pF1KB3 STGN-VKLGDFGASKRLQTICLSGTG----MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSV
:::. ....::::. :: . .::: . .. :: .:.:::. :. :::. :.:::
XP_016 STGQRLRIADFGAAARLAS---KGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSV
1220 1230 1240 1250 1260 1270
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ACTVVEMLTEKPPW-AEFEA--MAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDF-LKRIFVEAKL
.:...:: :::: :: .. .: :::::. : :..: :.: :: :. . .. .
XP_016 GCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQD
1280 1290 1300 1310 1320 1330
610
pF1KB3 RPSADELLRHMFVHYH
:: . :::.:
XP_016 RPPSRELLKHPVFRTTW
1340
>>XP_016864973 (OMIM: 600982,613762) PREDICTED: mitogen- (1375 aa)
initn: 591 init1: 240 opt: 682 Z-score: 314.3 bits: 69.4 E(85289): 9.1e-11
Smith-Waterman score: 682; 41.4% identity (70.0% similar) in 280 aa overlap (347-613:1096-1368)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 FTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSP-RAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYD
...: : :.: :. .: :::. : :
XP_016 PIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQD
1070 1080 1090 1100 1110 1120
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEV-NALECEIQLLKNLLHERIVQYYG--CLRDPQEKT
: :: .::::: . .. ..:: .::. ::.....: : :... : : ....
XP_016 VGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATC----EKSN
1130 1140 1150 1160 1170 1180
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRD
..:.:.: :::. :. :::. :.:. .::.:.:.:. ::: :.:.:::.::::.: :
XP_016 YNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLID
1190 1200 1210 1220 1230 1240
500 510 520 530 540
pF1KB3 STGN-VKLGDFGASKRLQTICLSGTG----MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSV
:::. ....::::. :: . .::: . .. :: .:.:::. :. :::. :.:::
XP_016 STGQRLRIADFGAAARLAS---KGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSV
1250 1260 1270 1280 1290
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ACTVVEMLTEKPPW-AEFEA--MAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDF-LKRIFVEAKL
.:...:: :::: :: .. .: :::::. : :..: :.: :: :. . .. .
XP_016 GCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQD
1300 1310 1320 1330 1340 1350
610
pF1KB3 RPSADELLRHMFVHYH
:: . :::.:
XP_016 RPPSRELLKHPVFRTTW
1360 1370
>>NP_005912 (OMIM: 600982,613762) mitogen-activated prot (1512 aa)
initn: 591 init1: 240 opt: 682 Z-score: 313.9 bits: 69.5 E(85289): 9.5e-11
Smith-Waterman score: 682; 41.4% identity (70.0% similar) in 280 aa overlap (347-613:1233-1505)
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 FTPEYDDSRIRRRGSDIDNPTLTVMDISPPSRSP-RAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYD
...: : :.: :. .: :::. : :
NP_005 PIVPQLQVENGEDIIIIQQDTPETLPGHTKAKQPYREDTEWLKGQQIGLGAFSSCYQAQD
1210 1220 1230 1240 1250 1260
380 390 400 410 420 430
pF1KB3 VDTGRELAVKQVQFDPDSPETSKEV-NALECEIQLLKNLLHERIVQYYG--CLRDPQEKT
: :: .::::: . .. ..:: .::. ::.....: : :... : : ....
NP_005 VGTGTLMAVKQVTYVRNTSSEQEEVVEALREEIRMMSHLNHPNIIRMLGATC----EKSN
1270 1280 1290 1300 1310
440 450 460 470 480 490
pF1KB3 LSIFMEYMPGGSIKDQLKAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRD
..:.:.: :::. :. :::. :.:. .::.:.:.:. ::: :.:.:::.::::.: :
NP_005 YNLFIEWMAGGSVAHLLSKYGAFKESVVINYTEQLLRGLSYLHENQIIHRDVKGANLLID
1320 1330 1340 1350 1360 1370
500 510 520 530 540
pF1KB3 STGN-VKLGDFGASKRLQTICLSGTG----MKSVTGTPYWMSPEVISGEGYGRKADIWSV
:::. ....::::. :: . .::: . .. :: .:.:::. :. :::. :.:::
NP_005 STGQRLRIADFGAAARLAS---KGTGAGEFQGQLLGTIAFMAPEVLRGQQYGRSCDVWSV
1380 1390 1400 1410 1420 1430
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 ACTVVEMLTEKPPW-AEFEA--MAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDF-LKRIFVEAKL
.:...:: :::: :: .. .: :::::. : :..: :.: :: :. . .. .
NP_005 GCAIIEMACAKPPWNAEKHSNHLALIFKIASATTAPSIPSHLSPGLRDVALRCLELQPQD
1440 1450 1460 1470 1480 1490
610
pF1KB3 RPSADELLRHMFVHYH
:: . :::.:
NP_005 RPPSRELLKHPVFRTTW
1500 1510
>>NP_001288001 (OMIM: 602425) mitogen-activated protein (1604 aa)
initn: 508 init1: 188 opt: 676 Z-score: 311.2 bits: 69.1 E(85289): 1.3e-10
Smith-Waterman score: 676; 31.3% identity (60.6% similar) in 502 aa overlap (135-616:1117-1597)
110 120 130 140 150 160
pF1KB3 LLDRSIHMKSLKILLVINGSTQATNLEPLPSLEDLDNTVFGAERKKRLSIIGPTSRDRSS
::. : : .: : : . :. :.:
NP_001 TRPRWATQGFDFLQAIEPAFISALPEDDFLSLQALMNECIGHVIGKPHSPV--TAIHRNS
1090 1100 1110 1120 1130 1140
170 180 190 200 210 220
pF1KB3 PPPGYIPDELHQVARNGSFTSINSEGEFIPESMDQMLDPLSLSSPENSGSGSCPSL----
: : .: . :. : . . :: : .:: . : : .:: ..... ..
NP_001 PRPMKVP-RCHSDPPNPHLIIPTPEG-FSTRSMPS--DARSHGSPAAAAAAAAAAVAASR
1150 1160 1170 1180 1190 1200
230 240 250 260 270
pF1KB3 DSPLDGESY-PKS----RMPRAQSYPDNHQEFSDYDNPIFEKFGKGGT-YPRRYHVSYHH
:: :.: ::: . :..: :.: . : . :..... .. .: . .: .
NP_001 PSPSGGDSVLPKSISSAHDTRGSSVPENDRLASIAAELQFRSLSRHSSPTEERDEPAYPR
1210 1220 1230 1240 1250 1260
280 290 300 310 320 330
pF1KB3 QEYNDGRKTFPRARRTQGTSLRSPVSFSPTDHSLSTSSGSSIFTPEYDDSRIRRR---GS
. . . . . : . : . ...: . . ... .: : ..::. :.
NP_001 GDSSGSTRRSWELRTLISQSKDTASKLGPIE---AIQKSVRLFE-EKRYREMRRKNIIGQ
1270 1280 1290 1300 1310
340 350 360 370 380
pF1KB3 DIDNPTL--TVMDISPPSRSPRAPTNWRLGKLLGQGAFGRVYLCYDVDTGRELAVKQVQF
:.: .:: .. : .. .:. :. .:.: .:.:: : .::::. .:.:...:
NP_001 VCDTPKSYDNVMHVG--LR--KVTFKWQRGNKIGEGQYGKVYTCISVDTGELMAMKEIRF
1320 1330 1340 1350 1360 1370
390 400 410 420 430 440
pF1KB3 DPDSPETSKEVNALECEIQLLKNLLHERIVQYYGCLRDPQEKTLSIFMEYMPGGSIKDQL
.:.. .: ::. :....... : .:.:.: . ... . ::::: :.. ...
NP_001 QPNDHKTIKETAD---ELKIFEGIKHPNLVRYFGV--ELHREEMYIFMEYCDEGTL-EEV
1380 1390 1400 1410 1420
450 460 470 480 490 500
pF1KB3 KAYGALTENVTRKYTRQILEGVHYLHSNMIVHRDIKGANILRDSTGNVKLGDFGASKRLQ
. : : :.: : :..:: ... :: . :::::::::::. :.: .:::::: : .:.
NP_001 SRLG-LQEHVIRLYSKQITIAINVLHEHGIVHRDIKGANIFLTSSGLIKLGDFGCSVKLK
1430 1440 1450 1460 1470 1480
510 520 530 540 550 560
pF1KB3 TICLSGTG-MKSVTGTPYWMSPEVIS---GEGYGRKADIWSVACTVVEMLTEKPPWAEFE
. . : ..:. :: .:.::::. :::.:: :::::..:.:.::.: : :: :.:
NP_001 NNAQTMPGEVNSTLGTAAYMAPEVITRAKGEGHGRAADIWSLGCVVIEMVTGKRPWHEYE
1490 1500 1510 1520 1530 1540
570 580 590 600 610
pF1KB3 AMAAIFKIATQPTNPKLPPHVSDYTRDFLKRIF-VEAKLRPSADELLRHMFVHYH
:. . . .: .: ..: .:::.. . . :.: .:..:: : ::
NP_001 HNFQIMYKVGMGHKPPIPERLSPEGKDFLSHCLESDPKMRWTASQLLDHSFVKVCTDEE
1550 1560 1570 1580 1590 1600
619 residues in 1 query sequences
60827320 residues in 85289 library sequences
Tcomplib [36.3.4 Apr, 2011] (8 proc)
start: Thu Nov 3 20:57:23 2016 done: Thu Nov 3 20:57:25 2016
Total Scan time: 10.880 Total Display time: 0.100
Function used was FASTA [36.3.4 Apr, 2011]