Result of FASTA (ccds) for
pF1KB3314
FASTA searches a protein or DNA sequence data bank 36.3.4 Apr, 2011
Please cite:
W.R. Pearson & D.J. Lipman PNAS (1988) 85:2444-2448
Query: pF1KB3314, 709 aa
1>>>pF1KB3314 709 - 709 aa - 709 aa
Library: human.CCDS.faa
18511270 residues in 32554 sequences
Statistics: Expectation_n fit: rho(ln(x))= 9.1663+/-0.00129; mu= 1.7970+/- 0.077
mean_var=182.6468+/-37.219, 0's: 0 Z-trim(106.7): 88 B-trim: 0 in 0/52
Lambda= 0.094900
statistics sampled from 9079 (9162) to 9079 sequences
Algorithm: FASTA (3.7 Nov 2010) [optimized]
Parameters: BL50 matrix (15:-5), open/ext: -10/-2
ktup: 2, E-join: 1 (0.622), E-opt: 0.2 (0.281), width: 16
Scan time: 3.410
The best scores are: opt bits E(32554)
CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 709) 4611 644.4 1.7e-184
CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 769) 4352 609.0 8.5e-174
CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 ( 634) 4078 571.4 1.4e-162
CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 519) 2366 337.0 4.3e-92
CCDS2285.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 545) 2364 336.7 5.4e-92
CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 535) 2363 336.6 5.9e-92
CCDS74612.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 ( 501) 2166 309.6 7.3e-84
CCDS53800.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 516) 1984 284.7 2.4e-76
CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 536) 1978 283.9 4.3e-76
CCDS73477.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 ( 495) 1967 282.4 1.1e-75
CCDS34901.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 456) 583 92.9 1.2e-18
CCDS56538.1 PDE7A gene_id:5150|Hs108|chr8 ( 482) 583 92.9 1.2e-18
CCDS5175.1 PDE7B gene_id:27115|Hs108|chr6 ( 450) 558 89.4 1.2e-17
CCDS56370.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 507) 554 88.9 2e-17
CCDS56369.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 518) 553 88.8 2.3e-17
CCDS54858.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 673) 554 89.0 2.6e-17
CCDS56371.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 679) 554 89.0 2.6e-17
CCDS56372.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 687) 554 89.0 2.6e-17
CCDS56373.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 745) 554 89.0 2.8e-17
CCDS54859.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 748) 554 89.0 2.8e-17
CCDS47213.1 PDE4D gene_id:5144|Hs108|chr5 ( 809) 554 89.0 3e-17
CCDS12238.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 647) 538 86.8 1.1e-16
CCDS45963.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 825) 538 86.8 1.4e-16
CCDS46016.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 606) 535 86.3 1.4e-16
CCDS45962.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 860) 538 86.8 1.5e-16
CCDS58649.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 864) 538 86.8 1.5e-16
CCDS45961.1 PDE4A gene_id:5141|Hs108|chr19 ( 886) 538 86.8 1.5e-16
CCDS42523.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 680) 535 86.4 1.6e-16
CCDS12373.1 PDE4C gene_id:5143|Hs108|chr19 ( 712) 535 86.4 1.6e-16
CCDS30743.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 564) 526 85.1 3.2e-16
CCDS72802.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 503) 517 83.8 6.7e-16
CCDS30742.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 721) 517 83.9 9.2e-16
CCDS632.1 PDE4B gene_id:5142|Hs108|chr1 ( 736) 517 83.9 9.4e-16
CCDS31754.1 PDE3A gene_id:5139|Hs108|chr12 (1141) 514 83.6 1.8e-15
CCDS42947.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 433) 498 81.2 3.6e-15
CCDS42944.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 459) 498 81.2 3.8e-15
CCDS33571.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 465) 498 81.2 3.8e-15
CCDS42946.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 466) 498 81.2 3.8e-15
CCDS33570.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 491) 498 81.2 4e-15
CCDS42943.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 492) 498 81.2 4e-15
CCDS42941.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 507) 498 81.2 4.1e-15
CCDS42945.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 526) 498 81.2 4.2e-15
CCDS33568.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 533) 498 81.2 4.3e-15
CCDS33567.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 540) 498 81.2 4.3e-15
CCDS42942.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 552) 498 81.3 4.4e-15
CCDS33569.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 567) 498 81.3 4.5e-15
CCDS13690.1 PDE9A gene_id:5152|Hs108|chr21 ( 593) 498 81.3 4.7e-15
CCDS7817.1 PDE3B gene_id:5140|Hs108|chr11 (1112) 501 81.8 6.1e-15
CCDS58397.1 PDE8A gene_id:5151|Hs108|chr15 ( 757) 474 78.0 5.7e-14
CCDS10337.1 PDE8A gene_id:5151|Hs108|chr15 ( 783) 474 78.0 5.8e-14
>>CCDS55099.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 (709 aa)
initn: 4611 init1: 4611 opt: 4611 Z-score: 3425.9 bits: 644.4 E(32554): 1.7e-184
Smith-Waterman score: 4611; 100.0% identity (100.0% similar) in 709 aa overlap (1-709:1-709)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QQQNGDFKDGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 QQQNGDFKDGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLR
610 620 630 640 650 660
670 680 690 700
pF1KB3 HFKRPAYASSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 HFKRPAYASSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK
670 680 690 700
>>CCDS55100.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 (769 aa)
initn: 4352 init1: 4352 opt: 4352 Z-score: 3233.7 bits: 609.0 E(32554): 8.5e-174
Smith-Waterman score: 4352; 99.9% identity (99.9% similar) in 671 aa overlap (39-709:99-769)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 EEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYA
::: ::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 PRPTIVHDPRPPEEILADELPQLDSPEVLVKTSFRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYA
70 80 90 100 110 120
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 ATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 ATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFK
130 140 150 160 170 180
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFI
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFI
190 200 210 220 230 240
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 FYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTG
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 FYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTG
250 260 270 280 290 300
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 VANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 VANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRL
310 320 330 340 350 360
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 LQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKAL
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 LQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKAL
370 380 390 400 410 420
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 SLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQV
430 440 450 460 470 480
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 GFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKRSGVKTSGS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 GFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKRSGVKTSGS
490 500 510 520 530 540
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 EGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQK
550 560 570 580 590 600
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK
610 620 630 640 650 660
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 DGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLRHFKRPAYA
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 DGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLRHFKRPAYA
670 680 690 700 710 720
670 680 690 700
pF1KB3 SSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK
:::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS55 SSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK
730 740 750 760
>>CCDS5437.1 PDE1C gene_id:5137|Hs108|chr7 (634 aa)
initn: 4381 init1: 4078 opt: 4078 Z-score: 3032.3 bits: 571.4 E(32554): 1.4e-162
Smith-Waterman score: 4078; 99.4% identity (99.8% similar) in 634 aa overlap (1-634:1-634)
10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
10 20 30 40 50 60
70 80 90 100 110 120
pF1KB3 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRR
70 80 90 100 110 120
130 140 150 160 170 180
pF1KB3 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
130 140 150 160 170 180
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
190 200 210 220 230 240
250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
250 260 270 280 290 300
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
310 320 330 340 350 360
370 380 390 400 410 420
pF1KB3 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
370 380 390 400 410 420
430 440 450 460 470 480
pF1KB3 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 TMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRRSSLNSISSSDAKR
430 440 450 460 470 480
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 SGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKAR
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 SGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKAR
490 500 510 520 530 540
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 LAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGE
::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::::
CCDS54 LAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGE
550 560 570 580 590 600
610 620 630 640 650 660
pF1KB3 QQQNGDFKDGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDGTKQRSHGSPAPSTSSTCRLTLPVIKPPLR
:::::::::::::::::::::::::::::: ...
CCDS54 QQQNGDFKDGKNKTDKKDHSNIGNDSKKTDDSQE
610 620 630
670 680 690 700
pF1KB3 HFKRPAYASSSYAPSVSKKTDEHPARYKMLDQRIKMKKIQNISHNWNRK
>>CCDS58741.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (519 aa)
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20 30 40 50 60 70
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::: ::::::::...:::::::.::::.::
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80 90 100 110 120 130
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:.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: .. .:::.:.::::
CCDS58 EAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVH
50 60 70 80 90 100
140 150 160 170 180 190
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:::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.::::::.:.:::..:::
CCDS58 AVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYEL
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.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::::.. .::. .:
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::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: ::::::::::::::.::::::.:.
CCDS58 LTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQE-
230 240 250 260 270 280
320 330 340 350 360 370
pF1KB3 EEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLML
:::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::.:.. :..::.:
CCDS58 EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLIL
290 300 310 320 330 340
380 390 400 410 420 430
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:.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::::::::::::::::::::::.::::
CCDS58 HAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFID
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480
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:::::::..::: ::::: :::.:.:.. .. :: ..: . .:: .::..: : :
CCDS58 FIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMS
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.:: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . .: ..... :
CCDS58 DGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKCEFIHQ
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pF1KB3 EMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFK
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10 20 30 40 50 60
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: : . ::::.:....::: :: ::.: ::.:. :: ::::::::...:::
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::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: ..
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pF1KB3 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
.:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.:::::
CCDS22 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS
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190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
:.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.:::::::.:::::::::
CCDS22 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV
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250 260 270 280 290 300
pF1KB3 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS22 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH
240 250 260 270 280 290
310 320 330 340 350 360
pF1KB3 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
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CCDS22 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE
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pF1KB3 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
.:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.::::::::::::::::
CCDS22 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS
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pF1KB3 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAE
: .::..: : :.:: . :. .:: :::: . ..... :.:::. . . :. ..
CCDS22 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQGESDLHKNS
480 490 500 510 520 530
540 550 560 570 580 590
pF1KB3 EKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEK
: . :::.. :
CCDS22 EDL-VNAEEKHDETHS
540
>>CCDS33344.1 PDE1A gene_id:5136|Hs108|chr2 (535 aa)
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10 20 30 40 50 60
pF1KB3 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVD
: : . ::::.:....::: :: ::.: ::.:. :: ::::::::...:::
CCDS33 MGSSATEIEELENTTFKYLTGEQTEKMWQRLKGI---------LRCLVKQLERGDVNVVD
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::::.::::.:::.::::::::::::::::::::.:.:::::::::::::::.::: ..
CCDS33 LKKNIEYAASVLEAVYIDETRRLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLASTFTRKMGMTKKK
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pF1KB3 SDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEAS
.:::.:.:::::::::::::::::.: .::::.:: ::: .::::::::::::.:::::
CCDS33 PEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVDKWSFDVFALNEAS
120 130 140 150 160 170
190 200 210 220 230 240
pF1KB3 GDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTV
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CCDS33 GEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPYHNLIHAADVTQTV
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pF1KB3 HYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENH
::.. .::. .:::::::.:..:.:::::::::::::::::::::: :::::::::::::
CCDS33 HYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDVAILYNDRSVLENH
240 250 260 270 280 290
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pF1KB3 HLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPE
:.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::::: ....:::::
CCDS33 HVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQQIKNIRNSLQQPE
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pF1KB3 AIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKS
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CCDS33 GIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAELGLPFSPLCDRKS
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CCDS33 TMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVASSSTTIVGLHIAD
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pF1KB3 A-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAE
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CCDS33 ALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKELAAQEARTSSQKC
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pF1KB3 EKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEK
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CCDS33 EFIHQ
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pF1KB3 VKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLA
.. .:::::::::::::.:.::::::::::
CCDS74 INKLFCFNFLVQCFRGKSKPSKCQIRKKVKNHIERLLDTEDELSDIQTDSVPSEVRDWLA
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CCDS74 STFTRKMGMTKKKPEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMYRKTYHMVGLAYPAAVIVTLKDVD
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pF1KB3 KWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPY
:::::::.::::::.:.:::..:::.::::::.:::::.: :..:.:::::::::.::::
CCDS74 KWSFDVFALNEASGEHSLKFMIYELFTRYDLINRFKIPVSCLITFAEALEVGYSKYKNPY
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pF1KB3 HNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANWLTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDP
:::.:::::::::::.. .::. .:::::::.:..:.::::::::::::::::::::::
CCDS74 HNLIHAADVTQTVHYIMLHTGIMHWLTELEILAMVFAAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDV
190 200 210 220 230 240
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pF1KB3 AILYNDRSVLENHHLSAAYRLLQDDEEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQ
::::::::::::::.::::::.:. :::::::::::::::..:.::::::..:::: :::
CCDS74 AILYNDRSVLENHHVSAAYRLMQE-EEMNILINLSKDDWRDLRNLVIEMVLSTDMSGHFQ
250 260 270 280 290 300
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pF1KB3 QIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLMLHTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAE
::: ....:::::.:.. :..::.::.::::::::.: ::.::::.:.:::: :::.:::
CCDS74 QIKNIRNSLQQPEGIDRAKTMSLILHAADISHPAKSWKLHYRWTMALMEEFFLQGDKEAE
310 320 330 340 350 360
410 420 430 440 450 460
pF1KB3 LGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFIDFIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQRR
::::::::::::::::::::.:::::::::::..::: ::::: :::.:.:.. ..
CCDS74 LGLPFSPLCDRKSTMVAQSQIGFIDFIVEPTFSLLTDSTEKIVIPLIEEASKAETSSYVA
370 380 390 400 410 420
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pF1KB3 SSLNSISS---SDA-KRSGVKTSGSEGSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRA
:: ..: . .:: .::..: : :.:: . :. .:: :::: . ..... :.:::.
CCDS74 SSSTTIVGLHIADALRRSNTKGSMSDGSYSPDYSLAAVDLKSFKNNLVDIIQQNKERWKE
430 440 450 460 470 480
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pF1KB3 KVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQKEMEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANK
. .: ..... :
CCDS74 LAAQEARTSSQKCEFIHQ
490 500
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pF1KB3 SNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEASVVDLKKNLEYAATVL
::: .::::: :: .. .:::::::.:..:
CCDS53 MANPVPVQRSHLQGPILRLRYMVKQLENGEINIEELKKNLEYTASLL
10 20 30 40
80 90 100 110 120 130
pF1KB3 ESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGMMLRRSDEKPRFKSIVH
:.:::::::..:::::::....:::::::::::::::::.: ::..:::.:.::::
CCDS53 EAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARAKGRRAEEKPKFRSIVH
50 60 70 80 90 100
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pF1KB3 AVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSLNEASGDHALKFIFYEL
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CCDS53 AVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSLNQAADDHALRTIVFEL
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pF1KB3 LTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADVTQTVHYLLYKTGVANW
:::..:::::::: :.::..:::.::.:.:::::: .:::::::::: .: .::...
CCDS53 LTRHNLISRFKIPTVFLMSFLDALETGYGKYKNPYHNQIHAADVTQTVHCFLLRTGMVHC
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pF1KB3 LTELEIFAIIFSAAIHDYEHTGTTNNFHIQTRSDPAILYNDRSVLENHHLSAAYRLLQDD
:.:.:..::::.:::::::::::::.:::::.:. ::.:::::::::::.:...::.:::
CCDS53 LSEIELLAIIFAAAIHDYEHTGTTNSFHIQTKSECAIVYNDRSVLENHHISSVFRLMQDD
230 240 250 260 270 280
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pF1KB3 EEMNILINLSKDDWREFRTLVIEMVMATDMSCHFQQIKAMKTALQQPEAIEKPKALSLML
: :::.:::.::.. :.:.::::::.::::::::::.:.::::::: : :.:::::::.:
CCDS53 E-MNIFINLTKDEFVELRALVIEMVLATDMSCHFQQVKTMKTALQQLERIDKPKALSLLL
290 300 310 320 330 340
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pF1KB3 HTADISHPAKAWDLHHRWTMSLLEEFFRQGDREAELGLPFSPLCDRKSTMVAQSQVGFID
:.::::::.: : .: ::: .:.::::::::.:::::::::::::: ::.:::::.::::
CCDS53 HAADISHPTKQWLVHSRWTKALMEEFFRQGDKEAELGLPFSPLCDRTSTLVAQSQIGFID
350 360 370 380 390 400
440 450 460 470 480
pF1KB3 FIVEPTFTVLTDMTEKIVSPLIDETSQTGGTGQ---RRSSLNSISSSDAKRSGVKTSGSE
:::::::.::::..:: :.:: :: :.. . . :. ::. . .:
CCDS53 FIVEPTFSVLTDVAEKSVQPLADEDSKSKNQPSFQWRQPSLD-VEVGD------------
410 420 430 440 450
490 500 510 520 530 540
pF1KB3 GSAPINNSVISVDYKSFKATWTEVVHINRERWRAKVPKEEKAKKEAEEKARLAAEEQQKE
: : .:.: :..::.. .. :...:. .
CCDS53 ---P-NPDVVS-----FRSTWVKRIQENKQKWKERAASGITNQMSIDELSPCEEEAPPSP
460 470 480 490 500
550 560 570 580 590 600
pF1KB3 MEAKSQAEEGASGKAEKKTSGETKNQVNGTRANKSDNPRGKNSKAEKSSGEQQQNGDFKD
CCDS53 AEDEHNQNGNLD
510
>>CCDS8882.1 PDE1B gene_id:5153|Hs108|chr12 (536 aa)
initn: 2038 init1: 1230 opt: 1978 Z-score: 1479.5 bits: 283.9 E(32554): 4.3e-76
Smith-Waterman score: 2033; 60.6% identity (81.7% similar) in 525 aa overlap (3-524:7-499)
10 20 30 40 50
pF1KB3 MESPTKEIEEFESNSLKYLQPEQIEKIWLRLRGLRKYKKTSQRLRSLVKQLERGEA
:: . .:: . : :. .:.:..::.: :: .::::: ::
CCDS88 MELSPRSPPEMLEESDCPSPLELKSAPSKKMWIKLRSL---------LRYMVKQLENGEI
10 20 30 40 50
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pF1KB3 SVVDLKKNLEYAATVLESVYIDETRRLLDTEDELSDIQSDAVPSEVRDWLASTFTRQMGM
.. .:::::::.:..::.:::::::..:::::::....:::::::::::::::::.:
CCDS88 NIEELKKNLEYTASLLEAVYIDETRQILDTEDELQELRSDAVPSEVRDWLASTFTQQARA
60 70 80 90 100 110
120 130 140 150 160 170
pF1KB3 MLRRSDEKPRFKSIVHAVQAGIFVERMYRRTSNMVGLSYPPAVIEALKDVDKWSFDVFSL
::..:::.:.:::::::::::::::.::: . :: .: ::.. ::..: : ::::::
CCDS88 KGRRAEEKPKFRSIVHAVQAGIFVERMFRRTYTSVGPTYSTAVLNCLKNLDLWCFDVFSL
120 130 140 150 160 170
180 190 200 210 220 230
pF1KB3 NEASGDHALKFIFYELLTRYDLISRFKIPISALVSFVEALEVGYSKHKNPYHNLMHAADV
:.:. ::::. : .:::::..:::::::: :.::..:::.::.:.:::::: .:::::
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